Abstract

ALVAREZ GONZALEZ, Ernesto. Adaptación del método del árbol más cercano sobre un cuarteto de dos estados a tripodes tipo Jukes-Cantor. Rev. Mat [online]. 2023, vol.30, n.1, pp.71-87. ISSN 1409-2433.  http://dx.doi.org/10.15517/rmta.v30i1.50357.

Nuestro objetivo es adaptar secuencias de caracteres de ADN con cuatro estados provenientes de tres especies a un árbol filogenético tipo trípode, cuyo modelo evolutivo es Jukes-Cantor. Para ello, adaptamos el método del árbol más cercano utilizado en el ajuste de secuencias de 2 estados provenientes de cuatro especies a un cuarteto, donde los estados son purinas y pirimidinas y el modelo evolutivo es CFN. La adaptación requiere una metodología de múltiples etapas llamada ‘proceso de reducción’. Tomamos las frecuencias de los patrones de caracteres de 2 estados en el cuarteto como parámetros y buscamos soluciones para el ajuste.

Keywords : método del árbol más cercano; conjugación de Hadamard; ajuste de datos observados; reconstrucción filogenética; proceso de reducción; algoritmo Grobner cover..

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