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<article-title xml:lang="es"><![CDATA[Variabilidad genética de aislamientos colombianos del potato mop-top virus (PMTV)]]></article-title>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Genetic variability of colombian isolates of Potato mop-top virus (PMTV)]]></article-title>
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<abstract abstract-type="short" xml:lang="en"><p><![CDATA[The objective of this work was to study the level of variation of PMTV isolates from Colombian potato crops through 2010 and 2011. Genes encoding for the viral coat protein (CP, ARN 2) and the Triple Gene Block (TGB2, ARN 3) were sequenced from PMTV isolates obtained in the provinces of Antioquia, Boyacá, Cundinamarca y Nariño. Additionally, RNA 2 and RNA 3 from two isolates were almost sequenced to completion (>83%). Phylogenetic analysis based on the CP sequence revealed the presences of two clades. The first clade included PMTV reference strains from all over the world and 19 Colombian isolates used in this study. The second class grouped only Colombian isolates and shared less than 76% identity with clade 1, suggesting a new pomovirus species. Complete genome sequencing is required to confirm this hypothesis. Phylogenetic analysis using the TGB2 gene grouped all sequences in a single clade. Sequence analysis of segments 2 and 3 of the viral genomes revealed >94% sequence identity with PMTV isolates from Czech Republic and Sweden. These findings will be helpful in the development of diagnostic tools for PMTV in the Andes in order to support tuber-seed certification and genetic improvement programs.]]></p></abstract>
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</front><body><![CDATA[ <div style="text-align: justify;">     <div style="text-align: center;"><font style="font-weight: bold;"  size="4"><span style="font-family: verdana;">Variabilidad gen&eacute;tica de aislamientos colombianos del <span  style="font-style: italic;">potato mop-top virus</span> (PMTV)    <br> </span></font><font size="2"><span style="font-family: verdana;"><span  style="font-weight: bold;">    <br> </span></span></font><font style="font-weight: bold;" size="4"><span  style="font-family: verdana;">Genetic variability of colombian isolates of Potato mop-top virus</span></font><font  style="font-weight: bold;" size="4"><span style="font-family: verdana;"> (PMTV)</span></font><font size="2"><span style="font-family: verdana;"><span  style="font-weight: bold;"></span></span></font><br  style="font-family: verdana; font-weight: bold;"> </div> <br style="font-family: verdana;">     <div style="text-align: center;"><font size="2"><span  style="font-family: verdana;">In&eacute;s Osorio-Giraldo<sup><a href="#1">2</a><a name="3"></a>*</sup>, Pablo Guti&eacute;rrez-S&aacute;nchez<a href="#2"><sup>2</sup></a>, Mauricio Mar&iacute;n-Montoya<a href="#2"><sup>2</sup></a></span></font><br  style="font-family: verdana;"> </div>     <br> <a name="Correspondencia3"></a><font size="-1"><span  style="font-family: verdana;">*<a href="#Correspondencia1">Direcci&oacute;n para correspondencia:</a></span></font>    <br> <hr style="width: 100%; height: 2px;"><br style="font-family: verdana;"> <font style="font-weight: bold;" size="3"><span  style="font-family: verdana;">Resumen</span></font><br  style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;"><span  style="font-weight: bold;"></span>El&nbsp; objetivo&nbsp; de&nbsp; este trabajo fue evaluar los niveles de variaci&oacute;n de aislamientos de PMTV en cultivos de papa de Colombia durante los a&ntilde;os 2010 y 2011. Se obtuvieron secuencias de los genes&nbsp; de la c&aacute;pside viral (CP, ARN 2) y del Triple&nbsp; Bloque&nbsp; de Genes (TGB2, ARN 3) de cepas de&nbsp; PMTV de los departamentos de Antioquia, Boyac&aacute;, Cundinamarca y Nari&ntilde;o. Adicionalmente, dos de los aislamientos fueron secuenciados en &gt;83% de sus ARN 2 y 3. Los an&aacute;lisis filogen&eacute;ticos basados en CP indicaron la presencia de dos clados. El primero&nbsp; contiene cepas de referencia mundial de PMTV en conjunto con 19 de las cepas de este estudio; mientras que el segundo clado s&oacute;lo agrup&oacute; cepas de Colombia, las que compartieron menos de 76% de identidad con el primer grupo. Esto posiblemente indica la ocurrencia de una nueva especie de&nbsp; pomovirus, aunque se requiere secuenciaci&oacute;n de&nbsp; todo&nbsp; el genoma para confirmar dicha hip&oacute;tesis taxon&oacute;mica. El an&aacute;lisis del TGB2 gener&oacute; un solo&nbsp; clado, agrupando indistintamente las cepas colombianas de PMTV con las de otros pa&iacute;ses. El an&aacute;lisis de los segmentos 2 y 3 del genoma viral, indic&oacute; que los dos aislamientos colombianos&nbsp; secuenciados compart&iacute;an &gt;94% de identidad con las secuencias de cepas de Rep&uacute;blica Checa y Suecia. Estos resultados pueden ser utilizados para el dise&ntilde;o de herramientas de diagn&oacute;stico del PMTV en los Andes, que apoyen los programas de certificaci&oacute;n de tub&eacute;rculo-semilla y mejoramiento gen&eacute;tico de papa.</span></font><br style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;"><span  style="font-weight: bold;">Palabras&nbsp; clave:</span> RT-PCR,&nbsp; secuenciaci&oacute;n, <span style="font-style: italic;">Solanum tuberosum</span>.</span></font><br style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font style="font-weight: bold;" size="3"><span  style="font-family: verdana;">Abstract</span></font><br  style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;"><span  style="font-weight: bold;"></span>The objective of&nbsp; this work was to&nbsp; study&nbsp; the&nbsp; level&nbsp; of&nbsp; variation&nbsp; of&nbsp; PMTV&nbsp; isolates&nbsp; from Colombian&nbsp; potato&nbsp; crops&nbsp; through&nbsp; 2010&nbsp; and&nbsp; 2011.&nbsp; Genes encoding for the&nbsp; viral coat protein (CP, ARN 2) and the Triple&nbsp; Gene Block (TGB2, ARN 3) were sequenced from PMTV&nbsp; isolates&nbsp; obtained&nbsp; in&nbsp; the&nbsp; provinces&nbsp; of&nbsp; Antioquia, Boyac&aacute;,&nbsp; Cundinamarca&nbsp; y&nbsp; Nari&ntilde;o.&nbsp; Additionally,&nbsp; RNA&nbsp; 2 and RNA 3 from two&nbsp; isolates&nbsp; were almost sequenced to completion&nbsp; (&gt;83%).&nbsp; Phylogenetic&nbsp; analysis&nbsp; based&nbsp; on&nbsp; the CP&nbsp; sequence&nbsp; revealed&nbsp; the&nbsp; presences&nbsp; of&nbsp; two&nbsp; clades.&nbsp; The first clade included PMTV reference strains&nbsp; from all over the world and 19 Colombian isolates&nbsp; used in this study. The&nbsp; second&nbsp; class&nbsp; grouped&nbsp; only&nbsp; Colombian&nbsp; isolates&nbsp; and shared less than 76%&nbsp; identity with clade 1, suggesting a new pomovirus&nbsp; species. Complete genome sequencing is required&nbsp; to&nbsp; confirm this hypothesis. Phylogenetic analysis using the TGB2 gene grouped all sequences in a single clade. Sequence analysis of segments 2 and 3 of the viral genomes revealed &gt;94% sequence identity with PMTV isolates from Czech Republic and Sweden. These findings will be helpful in the development of&nbsp; diagnostic tools for PMTV in the Andes in order to support tuber-seed certification and genetic improvement programs.</span></font><br  style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;"><span  style="font-weight: bold;">Key words:</span> RT-PCR, sequencing, <span style="font-style: italic;">Solanum tuberosum</span>.    <br>     <br style="font-family: verdana;">     </span></font>     ]]></body>
<body><![CDATA[<hr style="width: 100%; height: 2px;"><br style="font-family: verdana;">     <font style="font-weight: bold;" size="3"><span      style="font-family: verdana;">Introducci&oacute;n</span></font><br      style="font-family: verdana;">     <br style="font-family: verdana;">     <font size="2"><span style="font-family: verdana;">El <span      style="font-style: italic;">Potato mop-top virus</span>     (PmTV),&nbsp; es la especie tipo del g&eacute;nero <span      style="font-style: italic;">Pomovirus </span>y     recientemente se ha clasificado en la nueva familia <span     ]]></body>
<body><![CDATA[ style="font-style: italic;">Virgaviridae </span>(adams     <span style="font-style: italic;">et al.</span> 2009). Su &aacute;mbito     de hospedantes incluye un n&uacute;mero     limitado de especies de las familias solanaceae y Chenopodiaceae,     siendo la papa (<span style="font-style: italic;">Solanum tuberosum </span>L.)     su principal hospedante desde el     punto de vista econ&oacute;mico (Kirk 2008). PMTV es transmitido por     tub&eacute;rculo semilla infectado y por zoosporas del     plasmodiof&oacute;rido <span style="font-style: italic;">Spongospora     subterranea</span> f. sp. <span style="font-style: italic;">subterranea     ]]></body>
<body><![CDATA[</span>(Wallr.) (Lagerh) (Sss), agente causal de la sarna polvosa de la     papa     (Harrison y Jones 1970). Su presencia se ha registrado principalmente     en regiones con climas h&uacute;medos y fr&iacute;os como el Norte de     Europa, las islas Brit&aacute;nicas, Estados Unidos y Canad&aacute;,     Jap&oacute;n, las zonas monta&ntilde;osas de Costa Rica y los Andes (Xu     <span style="font-style: italic;">et al.</span> 2004, salazar 2006,     montero-ast&uacute;a <span style="font-style: italic;">et al.</span>     2008, Nakayama     <span style="font-style: italic;">et al.</span> 2010, santala&nbsp; <span     ]]></body>
<body><![CDATA[ style="font-style: italic;">et al.</span> 2010). a pesar de que se     considera     que PMTV es originario de los andes, su ocurrencia en colombia solo fue     detectada en el a&ntilde;o 2007 (V&eacute;lez 2007) y reconfirmada por     Gil <span style="font-style: italic;">et al.</span> (2011).</span></font><br      style="font-family: verdana;">     <br style="font-family: verdana;">     <font size="2"><span style="font-family: verdana;">El PMTV puede causar     p&eacute;rdidas de hasta 26% en el rendimiento del cultivo de la papa,     lo que sumado al efecto del da&ntilde;o ocasionado por su vector Sss,     ]]></body>
<body><![CDATA[pudiera ascender a niveles de 50 a 80% (Jones y Harrison 1972, Guerrero     2000). Sin embargo, dichos niveles de p&eacute;rdidas dependen de la     susceptibilidad de las variedades cultivadas (Xu <span      style="font-style: italic;">et al.</span> 2004, santala     <span style="font-style: italic;">et al.</span> 2010), las variantes     del pat&oacute;geno (Harrison y Jones 1970,     nielsen y nicolaisen 2003) y fundamentalmente de las condiciones     ambientales prevalentes durante su infecci&oacute;n (Davey 2009,     Latvala-Kilby <span style="font-style: italic;">et al.</span> 2009).</span></font><br      style="font-family: verdana;">     ]]></body>
<body><![CDATA[<br style="font-family: verdana;">     <font size="2"><span style="font-family: verdana;">El PMTV es un virus     tripartita con     morfolog&iacute;a de varilla r&iacute;gida de 18-20 nm en     di&aacute;metro y longitudes de 290-310 nm, 150-160 nm y 65-80 nm. cada     part&iacute;cula contiene&nbsp; una&nbsp; mol&eacute;cula&nbsp; de     ARN&nbsp; de&nbsp; cadena&nbsp; sencilla con polaridad positiva     (ARNss+). El ARN 1, de 6043 nucle&oacute;tidos (nt) codifica para una     prote&iacute;na que tiene motivos de metiltransferasa y helicasa (ORF     1) y una prote&iacute;na generada por supresi&oacute;n del cod&oacute;n     ]]></body>
<body><![CDATA[de finalizaci&oacute;n del ORF 1 con motivos de ARN polimerasa ARN     dependiente (RdRp) (Savenkov <span style="font-style: italic;">et al.</span>     1999, 2003). el ARN 2 (3134 nt)     contiene un ORF para la prote&iacute;na de la c&aacute;pside (CP) de 20     kDa. Tambi&eacute;n codifica para una prote&iacute;na de 90 kDa     generada por lectura continua (<span style="font-style: italic;">readthrough</span>,     CP-RT), a trav&eacute;s de     un cod&oacute;n &aacute;mbar en el gen de la CP. Diversos estudios han     indicado que esta prote&iacute;na RT est&aacute; involucrada en la     transmisi&oacute;n por sss del PmTV, siendo demostrada mediante     ]]></body>
<body><![CDATA[an&aacute;lisis de inmuno-marcaje, su localizaci&oacute;n en los     extremos de las part&iacute;culas virales (Cowan <span      style="font-style: italic;">et al.</span> 1997).</span></font><br      style="font-family: verdana;">     <br style="font-family: verdana;">     <font size="2"><span style="font-family: verdana;">El ARN 3 (2694 nt)     codifica para     cuatro polip&eacute;ptidos de 51, 21, 13 y 8 kDa, respectivamente. Los     primeros tres presentan secuencias similares a prote&iacute;nas del     Triple Bloque de Genes (TGB) involucradas en el movimiento de     ]]></body>
<body><![CDATA[c&eacute;lula a c&eacute;lula de algunos virus de plantas. Las TGBs de     los <span style="font-style: italic;">pomovirus </span>corresponden a     la clase 1 o grupo <span style="font-style: italic;">hordei</span> de     estas     prote&iacute;nas, en conjunto con las codificadas por otros     g&eacute;neros de la familia <span style="font-style: italic;">Virgaviridae</span>     y del g&eacute;nero     <span style="font-style: italic;">Hordeivirus</span>. Se cree que TGB2     y TGB3 asisten a TGB1 en su     funci&oacute;n de trasportar el genoma viral a trav&eacute;s de los     ]]></body>
<body><![CDATA[plasmodesmos (Lim <span style="font-style: italic;">et al.</span>     2009). La cuarta prote&iacute;na (8 kDa) es     rica en ciste&iacute;na (CRP) y aparentemente est&aacute; involucrada     en el movimiento sist&eacute;mico del PMTV y en la expresi&oacute;n de     s&iacute;ntomas necr&oacute;ticos en hospedantes experimentales     (Savenkov <span style="font-style: italic;">et al.</span> 1999, 2003).</span></font><br      style="font-family: verdana;">     <br style="font-family: verdana;">     <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Los s&iacute;ntomas     que causa PMTV     ]]></body>
<body><![CDATA[en papa se manifiestan por agrietamientos en la superficie de los     tub&eacute;rculos, pudiendo estar acompa&ntilde;ados por la presencia     de anillos necr&oacute;ticos en la corteza e incluso la parte interna     del mismo, s&iacute;ntoma conocido como &uml;Spraing&uml; (Harrison y     Jones 1970). En las hojas de las plantas infectadas se puede observar     un moteado en forma de V tipo &#8220;aucuba&#8221;, adem&aacute;s de la     deformaci&oacute;n del follaje y el acortamiento de los entrenudos     (<span style="font-style: italic;">mop-top</span>) (Xu <span      style="font-style: italic;">et al.</span> 2004). En     la regi&oacute;n Andina, no es frecuente     ]]></body>
<body><![CDATA[observar la sintomatolog&iacute;a en los tub&eacute;rculos ni los     moteados tipo &uml;aucuba&uml;, no siendo posible asociar     s&iacute;ntomas espec&iacute;ficos con la presencia de PMTV,     situaci&oacute;n que explica en buena parte el porqu&eacute; del     desconocimiento de su efecto sobre las variedades sembradas en esta     regi&oacute;n suramericana (Tenorio <span style="font-style: italic;">et     al.</span> 2006, gil <span style="font-style: italic;">et al.</span>     2011). sin     embargo, seg&uacute;n Salazar (2006), el PMTV es uno de los virus     prevalentes en el cultivo de la papa en los Andes.</span></font><br     ]]></body>
<body><![CDATA[ style="font-family: verdana;">     <br style="font-family: verdana;">     <font size="2"><span style="font-family: verdana;">A nivel mundial, se     ha reportado la     presencia de bajos niveles de variaci&oacute;n entre genotipos de PMTV     (mayo <span style="font-style: italic;">et al.</span> 1996, santala <span      style="font-style: italic;">et al.</span> 2010). Latvala-Kilby <span      style="font-style: italic;">et al.</span> (2009),     comparando secuencias de cP de 23 aislamientos de Finlandia y Letonia     con respecto a secuencias disponibles en GenBank para cepas de Escocia,     ]]></body>
<body><![CDATA[Dinamarca, Suecia y Rep&uacute;blica Checa, encontraron identidades     superiores al 98% entre estas, con solo siete diferencias a nivel de     amino&aacute;cidos (aa) entre todas las comparaciones. Las evaluaciones     de secuencias de CP-RT, tambi&eacute;n presentaron altos niveles de     identidad (98 a 100%), aunque en este caso 24 posiciones en las     secuencias de aa fueron variables. resultados similares reportaron mayo     <span style="font-style: italic;">et al.</span> (1996) al comparar las     secuencias de cP de tres aislamientos de     Escocia y ocho de Per&uacute;; mientras que Xu <span      style="font-style: italic;">et al.</span> (2004),     ]]></body>
<body><![CDATA[encontraron que seis de las secuencias de CP de aislamientos de PMTV de     Norteam&eacute;rica presentaron identidades superiores al 97% con     respecto a secuencias de aislamientos de diferentes pa&iacute;ses de     europa. a pesar de estos bajos niveles de variaci&oacute;n, cuando se     realizan an&aacute;lisis filogen&eacute;ticos con dichas secuencias, se     han encontrado dos clados que dividen los aislamientos de PMTV y que     pueden ser identificados por an&aacute;lisis de RFLPs (Nielsen y     Nicolaisen 2003).</span></font><br style="font-family: verdana;">     <br style="font-family: verdana;">     <font size="2"><span style="font-family: verdana;">En Colombia,     ]]></body>
<body><![CDATA[V&eacute;lez (2007),     encontr&oacute; por lo menos dos genotipos de PMTV definidos a partir     de la secuencias del gen CP: un grupo que presentaba altos niveles de     identidad con respecto aislamientos de Europa y Canad&aacute;, y otro     grupo constituido exclusivamente por aislamientos colombianos. Esta     situaci&oacute;n fue confirmada posteriormente por Gil <span      style="font-style: italic;">et al.</span> (2011),     quienes encontraron que las variantes de PMTV tan solo presentaban un     76% y 86% de identidad para cP y TgB2 y con respecto a los aislamientos     mundialmente reportados de PMTV. Sin embargo dichos an&aacute;lisis     ]]></body>
<body><![CDATA[fueron conducidos con un bajo n&uacute;mero de secuencias (cuatro para     CP y tres para TGB2) debido a las dificultades experimentales que     representa el trabajo con este virus (bajo t&iacute;tulo en plantas de     papa, distribuci&oacute;n err&aacute;tica, ausencia de cebadores     espec&iacute;ficos para cepas andinas, etc).</span></font><br      style="font-family: verdana;">     <br style="font-family: verdana;">     <font size="2"><span style="font-family: verdana;">El objetivo de este     trabajo fue     evaluar los niveles de variaci&oacute;n de aislamientos de PMTV en     ]]></body>
<body><![CDATA[cultivos de papa de Colombia durante los a&ntilde;os 2010 y 2011. El     prop&oacute;sito fue ampliar el n&uacute;mero de secuencias     nucle&oacute;tidas para la cP y TgB2 de aislamientos de PmTV obtenidos     en diferentes regiones productoras de papa de Colombia, de manera que     fuera posible determinar si la presencia de las variantes de este virus     corresponde a una situaci&oacute;n generalizada o por el contrario     responde al efecto de muestra dado el bajo n&uacute;mero de cepas     analizadas por V&eacute;lez (2007) y gil <span      style="font-style: italic;">et al.</span> (2011). Adicionalmente,     se realiz&oacute; la secuenciaci&oacute;n de gran parte de los ARN 2 y     ]]></body>
<body><![CDATA[ARN 3 de dos cepas de PMTV obtenidas en los Departamentos de Antioquia     y Boyac&aacute; (Colombia), realiz&aacute;ndose un an&aacute;lisis de     variaci&oacute;n con respecto a las secuencias de referencia de genomas     completos disponibles en las bases de datos moleculares.</span></font><br      style="font-family: verdana;">     <br style="font-family: verdana;">     <font style="font-weight: bold;" size="3"><span      style="font-family: verdana;">Materiales y M&eacute;todos</span></font><br      style="font-family: verdana;">     <br style="font-family: verdana;">     ]]></body>
<body><![CDATA[<font style="font-weight: bold;" size="2"><span      style="font-family: verdana;">Colecci&oacute;n y     preparaci&oacute;n de muestras</span></font><br      style="font-family: verdana;">     <br style="font-family: verdana;">     <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Se&nbsp;     obtuvieron&nbsp;     muestras&nbsp; de&nbsp; ra&iacute;ces&nbsp; y&nbsp; tub&eacute;rculos     de papa con s&iacute;ntomas de sarna polvosa, as&iacute; como de suelos     de lotes con reportes de la presencia de sss, en las zonas colombianas     ]]></body>
<body><![CDATA[productoras de papa de los municipios de la Uni&oacute;n y Santa Rosa     de Osos (Antioquia); Zipaquir&aacute;, Tabio, Subachoque y     Villapinz&oacute;n (Cundinamarca); Tunja, Siachoque, Sorac&aacute; y     Oicat&aacute; (Boyac&aacute;) y Pasto e Ipiales (Nari&ntilde;o) (<a      href="/img/revistas/am/v24n1/a01i1.jpg">Figura     1</a>). Para la separaci&oacute;n de los quistosoros del suelo, se     sigui&oacute; la metodolog&iacute;a de Jaramillo y Botero (2007), en la     cual las muestras de suelo (500g) son pasadas por un juego de tamices     de 100 y 25 &micro;m. Aproximadamente, 1 g de los quistosoros obtenidos     fueron inoculados en <span style="font-style: italic;">Nicotiana     ]]></body>
<body><![CDATA[benthamiana</span> y <span style="font-style: italic;">Solanum phureja</span>,     utilizadas como plantas se&ntilde;uelo para incrementar el     in&oacute;culo de PMTV a partir de la infecci&oacute;n de su vector Sss     (Gil <span style="font-style: italic;">et al.</span>&nbsp;     2011).&nbsp; El&nbsp; material&nbsp; vegetal&nbsp;     fue&nbsp; mantenido&nbsp; en macetas con 250 g de turba como sustrato,     bajo condiciones de casa de malla en el Centro Experimental     Paysand&uacute;, de la Universidad Nacional de Colombia (sede     Medell&iacute;n) ubicada en el corregimiento de Santa Elena, municipio     de Medell&iacute;n. La zona de vida es bhMB (Holdridge 1987), con una     ]]></body>
<body><![CDATA[altitud de 2550 msnm, temperatura media 14&deg;C y precipitaci&oacute;n     promedio anual de 2000 mm. Tres meses despu&eacute;s de la siembra, se     recolectaron las hojas y ra&iacute;ces de las plantas se&ntilde;uelo     para su procesamiento en el laboratorio.</span></font><br      style="font-family: verdana;">     <br style="font-family: verdana;">     <font style="font-weight: bold;" size="2"><span      style="font-family: verdana;">Secuenciaci&oacute;n de CP y TGB2</span></font><br      style="font-family: verdana;">     <br style="font-family: verdana;">     ]]></body>
<body><![CDATA[<font size="2"><span style="font-family: verdana;">Se obtuvo el ARN     total de plantas     de <span style="font-style: italic;">N. benthamiana</span> y <span      style="font-style: italic;">S. phureja</span> mediante el <span      style="font-style: italic;">RNeasy plant mini kit</span>, a     partir de 100 mg de tejido, utilizando 450 &#956;l de buffer RLT para tejido     foliar o RLC para ra&iacute;ces y 4,5 &#956;l&nbsp; de     &#946;-mercaptoetanol,&nbsp; siguiendo las instrucciones del fabricante. Al     finalizar el procedimiento, el ARN obtenido se eluy&oacute; en 40 &#956;l de     agua destilada est&eacute;ril tratada con DEPC.</span></font><br     ]]></body>
<body><![CDATA[ style="font-family: verdana;">     <br style="font-family: verdana;">     <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Las reacciones de     RT-PCR se     realizaron en dos pasos. Para la retrotranscripci&oacute;n (RT) se     utiliz&oacute; un volumen final de 20 &micro;l, incluyendo 0,5 &micro;l     de agua destilada est&eacute;ril, 1,5 &micro;l de PBST (0,5%), 4     &micro;l de buffer RT (5X), 4 &micro;l de MgCl<sub>2</sub> (25 mM), 2     &micro;l de dNTPs (10 mM), 2 &micro;l del cebador reverso     espec&iacute;fico&nbsp; 123_end (10 &micro;M) (Savenkov <span     ]]></body>
<body><![CDATA[ style="font-style: italic;">et al.</span> 1999),     0,5 &micro;l de inhibidor de ARNasas (40U/&micro;l), 0,5 &micro;l de     retrotranscriptasa del virus de la leucemia murina (M-MuLV) (20     U/&micro;l) y 5 &micro;l de ARN o alternativamente una diluci&oacute;n     1:5. El programa de RT fue de 37&deg;C por 60 min, seguido de 70&deg;C     por 10 min, para inactivar la enzima. Las muestras del ADN copia (ADNc)     se almacenaron a 4&deg;C hasta su uso posterior. Como control positivo     de amplificaci&oacute;n de PMTV, se utiliz&oacute; la muestra     prove&iacute;da para este fin por el Kit de ELISA de Bioreba,     realiz&aacute;ndose la extracci&oacute;n de RNA en la misma forma que     ]]></body>
<body><![CDATA[para las dem&aacute;s muestras.</span></font><br      style="font-family: verdana;">     <br style="font-family: verdana;">     <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Para las reacciones     de PCR se     emplearon los cebadores espec&iacute;ficos H360 y C819 (MacKenzie 1996)     para amplificar una regi&oacute;n de 459 pb del gen CP entre las     posiciones 385 y 844 del genoma viral; as&iacute; como los cebadores     PMTVF4 y PMTVR4 para obtener amplicones de 415 pb del TgB2, entre las     posiciones 1726 y 2141 del ARN 2 (Xu <span style="font-style: italic;">et     ]]></body>
<body><![CDATA[al.</span> 2004). Para algunos     aislamientos en los que se dificultaba la amplificaci&oacute;n del     TGB2, se utilizaron los cebadores PMTV5 y PMTV7 (Lambert <span      style="font-style: italic;">et al.</span> 2003)     que amplifican un fragmento de 646 pb y se extienden entre las     posiciones del genoma 1417 a 2063. Las PCR se realizaron en 25 &micro;l     incluyendo 15,8 &micro;l de agua destilada est&eacute;ril, 2,5 &micro;l     del amortiguador para la enzima (10X), 1,8 &micro;l de     MgCl<sub>2</sub> (25 mM), 0,5 &micro;l de dNTPs (10 mM), 0,5 &micro;l     de cada cebador (10 &micro;M), 0,2 &micro;l de alb&uacute;mina de suero     ]]></body>
<body><![CDATA[bovino (20 mg/ml), 0,2 &micro;l de Taq ADN polimerasa (5 U/&micro;l) y     3 &micro;l de ADNc. El programa consisti&oacute; de una     desnaturalizaci&oacute;n inicial a 98&deg;C por 3 min, seguida por 40     ciclos de 94&deg;C por 30 s, 53&deg;C por 45 s, 72&deg;C por 1 min y un     per&iacute;odo final de extensi&oacute;n a 72&deg;C por 10 min. Luego     de la amplificaci&oacute;n, se tomaron 5 &micro;l de los productos de     reacci&oacute;n y se separaron por electroforesis en gel de agarosa al     1,5% suplementado con bromuro de etidio (10 mg/ml) y su tama&ntilde;o     se verific&oacute; por comparaci&oacute;n con el marcador de peso     molecular <span style="font-style: italic;">Generuler 100 pb</span>.</span></font><br     ]]></body>
<body><![CDATA[ style="font-family: verdana;">     <br style="font-family: verdana;">     <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Los amplicones del     tama&ntilde;o     esperado correspondientes al menos a cuatro aislamientos     representativos de cada uno de los cuatro departamentos bajo estudio,     fueron purificados del gel mediante el kit <span      style="font-style: italic;">QIAquick Gel Extraction</span>,     para realizar su secuenciaci&oacute;n directa en ambos sentidos     utilizando los mismos cebadores empleados en la Pcr y el <span     ]]></body>
<body><![CDATA[ style="font-style: italic;">Big Dye     Terminator Cycle Sequencing Ready Reaction</span> kit. Su corrido y     separaci&oacute;n se realiz&oacute; en un secuenciador ABI Prism     3730xl.     <br>     <br>     A partir&nbsp; de&nbsp; las&nbsp; secuencias&nbsp;     obtenidas&nbsp; con&nbsp; cada cebador,&nbsp; se&nbsp;     construyeron&nbsp; las&nbsp; secuencias&nbsp; consenso mediante los     programas bioinform&aacute;ticos BioEdit 6.0.6 (Hall&nbsp; 1999)&nbsp;     ]]></body>
<body><![CDATA[y&nbsp; Chromas&nbsp; Lite&nbsp; (Technelysium&nbsp; 2009).     Posteriormente se confirm&oacute; su origen viral por     comparaci&oacute;n con las bases de datos moleculares con el programa     BLAST (Altschul <span style="font-style: italic;">et al.</span> 1990)     y se obtuvieron secuencias de PMTV del     GenBank de otras regiones del mundo, para realizar un an&aacute;lisis     filogen&eacute;tico. Para esto, se gener&oacute; un alineamiento     mediante Clustal W (Larkin <span style="font-style: italic;">et al.</span>     2007) del programa Bioedit 6.0.6. Los     alineamientos fueron utilizados en una matriz de distancia     ]]></body>
<body><![CDATA[gen&eacute;tica utilizando el m&eacute;todo de M&aacute;xima     Verosimilitud basado en el modelo de Tamura-nei (1993) implementado en     el programa MEGA v4.0 (Tamura <span style="font-style: italic;">et al.</span>     2007). Para evaluar el soporte     estad&iacute;stico de cada agrupaci&oacute;n, se realiz&oacute; un     an&aacute;lisis de Bootstrap con</span></font><font size="2"><span      style="font-family: verdana;"> 1000 remuestreos (Felsenstein 1985).</span></font><br      style="font-family: verdana;">     <br style="font-family: verdana;">     <font style="font-weight: bold;" size="2"><span     ]]></body>
<body><![CDATA[ style="font-family: verdana;">Secuenciaci&oacute;n del ARN 2 y ARN 3     de aislamientos colombianos de PMTV</span></font><br      style="font-family: verdana;">     <br style="font-family: verdana;">     <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Con el fin de     obtener un mayor     nivel de informaci&oacute;n sobre las caracter&iacute;sticas de los     segmentos ARN 2 y ARN 3 del genoma de aislamientos colombianos de PMTV,     se realiz&oacute; un proceso de secuenciaci&oacute;n con minado de     cebadores, previamente reportados para la amplificaci&oacute;n de     ]]></body>
<body><![CDATA[diferentes regiones de dichos segmentos (<a      href="/img/revistas/am/v24n1/a01t1.gif">Cuadro 1</a>) y buscando que     generaran traslape de secuencias&nbsp; para&nbsp; la&nbsp;     construcci&oacute;n&nbsp; de&nbsp; un&nbsp; <span      style="font-style: italic;">contig</span>.&nbsp; Para esto se     utilizaron dos cepas de PMTV de Antioquia (23T) y Boyac&aacute; (BS4T),     seleccionadas gracias a la disponibilidad del material biol&oacute;gico     necesario para su evaluaci&oacute;n. Con cada cepa se realizaron por lo     menos dos amplificaciones con cada cebador, de manera que las     secuencias reportadas correspondieran al consenso para cada     ]]></body>
<body><![CDATA[amplic&oacute;n. Los procedimientos de extracci&oacute;n de ARN, PCR y     secuenciaci&oacute;n fueron similares a los descritos anteriormente,     aunque las RT se realizaron con la enzima Transcriptasa Reversa     M&aacute;xima, que ofrece mayores niveles de estabilidad t&eacute;rmica     (hasta 65&deg;C) y eficiencia que las transcriptasas reversas     convencionales. en este caso las reacciones de rT consistieron de 9,5     &micro;l de agua libre de nucleasas, 4 &micro;l de buffer RT (5X), 1     &micro;l de dNTPs (10 mM), 1 &micro;l de cebador reverso (10 &micro;M),     0,5 &micro;l de inhibidor de ARNasas (40U/&micro;l), 1 &micro;l de     Transcriptasa Reversa (200 U/&micro;l) y 3 &micro;l de ARN, para un     ]]></body>
<body><![CDATA[volumen final de 20 &micro;l. La incubaci&oacute;n se realiz&oacute; a     50&deg;C por 30 min y la enzima se inactiv&oacute; a 85&deg;C por 5 min.</span></font><br      style="font-family: verdana;">     <br style="font-family: verdana;">     <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Las secuencias se     editaron mediante     el programa Chromas Lite, gener&aacute;ndose los consensos con ambos     cebadores con el programa Bioedit 6.0.6 y se procedi&oacute; al     ensamblaje de los <span style="font-style: italic;">contigs</span>     resultantes con el programa CAP3 (Huang y     ]]></body>
<body><![CDATA[Madan 1999). Posteriormente, se verific&oacute; el marco de lectura     correcto utilizando el portal bioinform&aacute;tico Expasy (Artimo <span      style="font-style: italic;">et     al.</span> 2012) y se realiz&oacute; su alineamiento con respecto a las     secuencias de los dos segmentos gen&oacute;micos de aislamientos cuyas     secuencias completas se encontraban disponibles en genBank (DQ102381,     DQ144451, AJ243719, AJ277556) (Sandgren <span      style="font-style: italic;">et al.</span> 2001, Cerovska <span      style="font-style: italic;">et al.</span>     2007).</span></font><br style="font-family: verdana;">     ]]></body>
<body><![CDATA[<br style="font-family: verdana;">     <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Las secuencias de     nucle&oacute;tidos fueron traducidas y se compararon los porcentajes de     identidad y n&uacute;mero de posiciones variables a lo largo de las     regiones bajo estudio y gener&aacute;ndose &aacute;rboles     filogen&eacute;ticos basados en los <span style="font-style: italic;">contigs</span>     obtenidos en la     investigaci&oacute;n, mediante el programa Mega v. 4.0, bajo los     par&aacute;metros antes descritos.</span></font><br      style="font-family: verdana;">     ]]></body>
<body><![CDATA[<br style="font-family: verdana;">     <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Los n&uacute;meros     de     accesi&oacute;n de las secuencias obtenidas en este trabajo     corresponden a las series: JX889608-JX889611 y JX885612-JX885631.</span></font><br      style="font-family: verdana;">     <br style="font-family: verdana;">     <font style="font-weight: bold;" size="3"><span      style="font-family: verdana;">Resultados y Discusi&oacute;n</span></font><br      style="font-family: verdana;">     ]]></body>
<body><![CDATA[<br style="font-family: verdana;">     <font style="font-weight: bold;" size="2"><span      style="font-family: verdana;">Variabilidad gen&eacute;tica de     PMTV en Colombia</span></font><br style="font-family: verdana;">     <br style="font-family: verdana;">     <font size="2"><span style="font-family: verdana;">En&nbsp; total&nbsp;     se&nbsp;     obtuvieron&nbsp; 25&nbsp; secuencias&nbsp; para&nbsp; la     regi&oacute;n&nbsp; amplificada de&nbsp; CP&nbsp; y&nbsp; 38&nbsp;     para&nbsp; TGB2.&nbsp; Estas correspondieron a por lo menos cuatro     ]]></body>
<body><![CDATA[aislamientos por cada departamento bajo an&aacute;lisis (<a      href="/img/revistas/am/v24n1/a01t2.gif">Cuadro 2</a>). De     esta&nbsp; forma&nbsp; se&nbsp; aumentaron&nbsp; las&nbsp;     secuencias&nbsp; parciales de los genes CP y TGB2 de PMTV con respecto     al trabajo&nbsp; reciente&nbsp; realizado&nbsp; por&nbsp; gil <span      style="font-style: italic;">et&nbsp;     al.</span>&nbsp; (2011)&nbsp; en donde&nbsp; solo&nbsp; se&nbsp;     obtuvieron&nbsp; cuatro&nbsp; y&nbsp; tres&nbsp; secuencias, para CP y     TGB2; lo cual implica que las diferentes modificaciones realizadas a     los procedimientos necesarios para el estudio de este virus, desde la     ]]></body>
<body><![CDATA[forma de&nbsp; obtenci&oacute;n&nbsp; de&nbsp; las&nbsp; muestras&nbsp;     hasta&nbsp; la&nbsp; purificaci&oacute;n de&nbsp; los&nbsp;     amplicones,&nbsp; pasando&nbsp; por&nbsp; la&nbsp;     eliminaci&oacute;n&nbsp; de inhibidores de las polimerasas, resultaron     altamente eficientes. Esta situaci&oacute;n abre la posibilidad de     plantear en el futuro un estudio de incidencia de PMTV basado en la     detecci&oacute;n del virus mediante RTPCR, con un muestreo     estratificado en los diferentes pisos t&eacute;rmicos donde se cultiva     la papa en Colombia y realizando comparaciones con respecto a los     niveles de incidencia de Sss, de manera que sea posible     ]]></body>
<body><![CDATA[determinar&nbsp; la&nbsp; dimensi&oacute;n&nbsp; del&nbsp; grado&nbsp;     de&nbsp; dispersi&oacute;n de este virus en Colombia. Un trabajo     similar fue realizado por montero-ast&uacute;a <span      style="font-style: italic;">et al.</span> (2008) en costa     rica&nbsp; pero&nbsp; utilizando&nbsp; pruebas&nbsp; de&nbsp; eLisa     tanto&nbsp; para la detecci&oacute;n de Sss como de PMTV. En este caso     se encontr&oacute; que el virus era m&aacute;s frecuentemente detectado     en las regiones con mayores altitudes, donde las condiciones de alta     humedad y bajas temperaturas aparentemente favorecen su     infecci&oacute;n. Sin embargo, es probable que la utilizaci&oacute;n de     ]]></body>
<body><![CDATA[pruebas de ELISA, haya conducido a una subestimaci&oacute;n de los     niveles de&nbsp; incidencia&nbsp; detectados&nbsp; en&nbsp; dicho&nbsp;     trabajo,&nbsp; pues la distribuci&oacute;n err&aacute;tica del virus,     su capacidad de movimiento c&eacute;lula-c&eacute;lula con ayuda de     prote&iacute;nas de movimiento codificadas por el TGB y la     utilizaci&oacute;n de anticuerpos dise&ntilde;ados a partir de cepas     del norte de Europa, pueden influir negativamente en la     detecci&oacute;n serol&oacute;gica del PMTV; aunque la     problem&aacute;tica de la distribuci&oacute;n del virus, tambi&eacute;n     afecta la detecci&oacute;n de t&eacute;cnicas como el RT-PCR (Gallo     ]]></body>
<body><![CDATA[2012).</span></font><br style="font-family: verdana;">     <br style="font-family: verdana;">     <font size="2"><span style="font-family: verdana;">El an&aacute;lisis     filogen&eacute;tico para CP incluy&oacute; 404 posiciones a partir de     46 secuencias, 15 de las cuales corresponden a aislamientos de     referencia de europa, Asia y Norteam&eacute;rica (Estados Unidos y     Canad&aacute;), cuatro fueron previamente reportadas de aislamientos     colombianos por gil <span style="font-style: italic;">et al.</span>     (2011), 25 fueron obtenidas en este estudio     y las dos restantes corresponden al grupo externo de an&aacute;lisis     ]]></body>
<body><![CDATA[(<span style="font-style: italic;">Beet soil-borne virus</span>) y a     una secuencia utilizada como control     positivo obtenida de un kit comercial de ELISA para PMTV. El     dendrograma present&oacute; dos grupos soportados por valores de     bootstrap del 100% (<a href="/img/revistas/am/v24n1/a01i1.jpg">Figura </a><a      href="/img/revistas/am/v24n1/a01i1.jpg">1</a>). El primer clado     agrup&oacute; todas las     secuencias de referencia con 19 de los aislamientos colombianos     obtenidos en este estudio y presentaron niveles de identidad superiores     al 99% en todos los casos (<a href="/img/revistas/am/v24n1/a01t3.gif">Cuadro     ]]></body>
<body><![CDATA[3</a>). Por otra parte, el segundo clado     present&oacute; exclusivamente secuencias de cepas colombianas,     incluyendo seis de las obtenidas en este estudio y dos de las     reportadas por gil <span style="font-style: italic;">et al.</span>     (2011). al interior de este clado, se     presentaron mayores niveles de variaci&oacute;n (11 a 13%) y su     identidad con respecto a los miembros del primer clado fue de tan solo     76%. De manera interesante, en este clado no se ubic&oacute; ninguno de     los aislamientos de PMTV obtenidos en Antioquia, a pesar de que el     material de siembra de papa utilizado en este departamento,     ]]></body>
<body><![CDATA[generalmente es adquirido en la sabana Cundiboyacense y Nari&ntilde;o,     lugares en donde si se detectaron las variantes de PMTV. Por esto,     dicho hallazgo deber&iacute;a ser considerado en estudios futuros, para     evaluar si se trata de una situaci&oacute;n aleatoria debido al     tama&ntilde;o de muestra o a factores no evaluados en este trabajo,     como las caracter&iacute;sticas de los genotipos del vector Sss     presentes en este departamento o a diferencias en las condiciones     agroclim&aacute;ticas propias de los municipios antioque&ntilde;os     cultivadores de papa, entre otros aspectos.</span></font><br      style="font-family: verdana;">     ]]></body>
<body><![CDATA[<br style="font-family: verdana;">     <font size="2"><span style="font-family: verdana;">La secuencia de <span      style="font-style: italic;">Beet soil-borne     virus</span> de China, utilizada como grupo externo de an&aacute;lisis,     efectivamente se ubic&oacute; en posici&oacute;n externa a los dos     clados y comparti&oacute; niveles de identidad inferiores al 59% con     respecto a los aislamientos de PmTV.</span></font><br      style="font-family: verdana;">     <br style="font-family: verdana;">     <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Estos resultados     ]]></body>
<body><![CDATA[confirman los     hallazgos de V&eacute;lez (2007) y gil <span      style="font-style: italic;">et al.</span> (2011) en referencia a la     presencia de una variante viral de PMTV en Colombia, que incluso bajo     los par&aacute;metros definidos por Adams <span      style="font-style: italic;">et al.</span> (2009), para la     definici&oacute;n de especies al interior de la familia <span      style="font-style: italic;">Virgaviridae</span>     (ej. cepas con identidades superiores a 80 y 90% a nivel de secuencias     de CP y del genoma completo, respectivamente) podr&iacute;a representar     ]]></body>
<body><![CDATA[una nueva especie de pomovirus. Si se considera que seis de las 25     secuencias de cP obtenidas en este trabajo correspondieron a dicha     variante, es evidente que su presencia no es marginal en los cultivos     de papa de Colombia, ya que para la muestra obtenida, aunque     evidentemente sesgada por la colecci&oacute;n de suelos y tejidos con     presencia de estructuras de Sss, su proporci&oacute;n es del 23%.</span></font><br      style="font-family: verdana;">     <br style="font-family: verdana;">     <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Estos resultados     difieren con     ]]></body>
<body><![CDATA[respecto a lo encontrado en los estudios de variabilidad de PMTV con     base en secuencias de CP de diferentes or&iacute;genes     geogr&aacute;ficos, por cuanto indistintamente se hab&iacute;a     encontrado que los niveles de identidad presentes en este gen superaban     el 98% en todas las comparaciones establecidas. as&iacute; por ejemplo,     al comparar 28 secuencias de Finlandia, Letonia, Escocia, Dinamarca,     Rep&uacute;blica Checa y Suecia, casi todas eran id&eacute;nticas,     siendo tan solo detectado un 2% de variaci&oacute;n entre las     m&aacute;s distantes, lo cual representaba cambios en tan solo siete     posiciones a nivel de la secuencia de aa de la prote&iacute;na     ]]></body>
<body><![CDATA[resultante (Latvala-Kirby <span style="font-style: italic;">et al.</span>     2009). similarmente, Xu <span style="font-style: italic;">et al.</span>     (2004)     reportaron que aislamientos de PMTV de Estados Unidos y Canad&aacute;     eran id&eacute;nticos y que estos a su vez tan solo difer&iacute;an en     m&aacute;ximo 3% de sus secuencias de cP con respecto a cepas de     Per&uacute; (mayo <span style="font-style: italic;">et al.</span>     1996), Escocia y Escandinavia (Reavy <span style="font-style: italic;">et     al.</span>     1997). Los mayores niveles de diversidad encontrados en este trabajo     ]]></body>
<body><![CDATA[para aislamientos de PmTV, pueden deberse al hecho que la regi&oacute;n     Andina de Colombia hace parte del centro de origen de la papa, y es     ampliamente aceptado que en estas zonas geogr&aacute;ficas ocurren     mayores niveles de variaci&oacute;n no solo en los hospedantes, sino     tambi&eacute;n en sus pat&oacute;genos, dados los largos periodos de     coevoluci&oacute;n entre estos (Salazar 2006). De esta forma, de gran     inter&eacute;s resultar&aacute; emprender estudios que permitan evaluar     las diferencias biol&oacute;gicas de dichas variantes de PMTV sobre     distintas variedades de papa e incluso sobre hospedantes     experimentales, debido a que s&iacute; existen diferencias de     ]]></body>
<body><![CDATA[patogenicidad entre aislamientos de PMTV que presentan bajos niveles de     variaci&oacute;n (Nielsen y Nicolaisen 2003), es posible que dicho     efecto sea a&uacute;n mayor cuando se eval&uacute;en las variantes     aqu&iacute; reportadas.</span></font><br style="font-family: verdana;">     <br style="font-family: verdana;">     <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Con respecto al     an&aacute;lisis     filogen&eacute;tico basado en las secuencias de TGB2, se incluyeron 330     posiciones de 49 secuencias, siete de las cuales fueron de aislamientos     de referencia de diferentes pa&iacute;ses y tres de colombia     ]]></body>
<body><![CDATA[previamente analizadas (Gil <span style="font-style: italic;">et al.</span>     2011). el dendrograma generado     present&oacute; un solo clado que incluy&oacute; todas las secuencias     (<a href="/img/revistas/am/v24n1/a01i2.jpg">Figura 2</a>), las que     compartieron niveles de identidad superiores a 98%     (<a href="/img/revistas/am/v24n1/a01t4.gif">Cuadro 4</a>).</span></font><br      style="font-family: verdana;">     <br style="font-family: verdana;">     <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Estos resultados son     un indicativo     ]]></body>
<body><![CDATA[de que la variaci&oacute;n encontrada entre aislamientos colombianos     con respecto a CP, no necesariamente se presentan a lo largo de los     diferentes segmentos gen&oacute;micos de PMTV, y espec&iacute;ficamente     no se ven reflejadas en las secuencias de TGB2; que en los pocos     estudios donde se ha secuenciado, presenta niveles de identidad     superiores a 94,8%. Incluso se ha encontrado que aislamientos de     or&iacute;genes geogr&aacute;ficos diferentes pueden compartir hasta el     100% de identidad en la secuencia de aa para este gen (ej. aislamiento     Korneta-Nemilkov de Rep&uacute;blica Checa y aislamientos 54-15 y 54-19     de Dinamarca) (Cerovska <span style="font-style: italic;">et al.</span>     ]]></body>
<body><![CDATA[2003, 2007).</span></font><br style="font-family: verdana;">     <br style="font-family: verdana;">     <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Los&nbsp;     altos&nbsp; niveles&nbsp;     de&nbsp; conservaci&oacute;n&nbsp; de&nbsp; este&nbsp; gen entre     aislamientos de PMTV, posibilitan que los cebadores utilizados para su     amplificaci&oacute;n sean una herramienta&nbsp; &uacute;til&nbsp;     para&nbsp; el&nbsp; diagn&oacute;stico&nbsp; de&nbsp; este&nbsp; virus.     as&iacute; por ejemplo, Lambert <span style="font-style: italic;">et     al.</span> (2003) dise&ntilde;aron los     ]]></body>
<body><![CDATA[cebadores PMTV5 y PMTV7 dirigidos a amplificar una regi&oacute;n de 646     pb comprendida entre TGB1 y TGB2 cuando reportaron por primera vez la     presencia del PMTV en EEUU y posteriormente Xu <span      style="font-style: italic;">et al.</span> (2004),     utilizaron la regi&oacute;n que codifica para TGB2 para el     dise&ntilde;o de los cebadores PMTVF4 y PMTVR4 en su estudio de     evaluaci&oacute;n de distribuci&oacute;n de PMTV en EEUU y     Canad&aacute;.</span></font><br style="font-family: verdana;">     <br style="font-family: verdana;">     <font style="font-weight: bold;" size="2"><span     ]]></body>
<body><![CDATA[ style="font-family: verdana;">Secuenciaci&oacute;n del ARN 2 y ARN 3     de aislamientos colombianos de PMTV</span></font><br      style="font-family: verdana;">     <br style="font-family: verdana;">     <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Para el ARN 2 se     obtuvieron <span style="font-style: italic;">contigs</span>     de 2577 nt y 2584 para los aislamientos de Antioquia y Boyac&aacute;;     mientras que para el ARN 3 los <span style="font-style: italic;">contigs</span>     tuvieron una extensi&oacute;n de     2617 y 2360 nt, respectivamente. Esto implica que para el ARN 2 se     ]]></body>
<body><![CDATA[obtuvo un porcentaje de cobertura del 83% de este segmento     gen&oacute;mico y del 87% para el ARN 3, en comparaci&oacute;n con el     aislamiento Sw de PMTV (AJ243719 y AJ277556) (Sandgren <span      style="font-style: italic;">et al.</span> 2001).</span></font><br      style="font-family: verdana;">     <br style="font-family: verdana;">     <font size="2"><span style="font-family: verdana;">En t&eacute;rminos     de aa los     <span style="font-style: italic;">contigs</span> del arn2 incluyeron     150 de los aa de cP (posiciones 26 a 176) y     ]]></body>
<body><![CDATA[799 de CP-RT (posiciones 26 a 825). Para el ARN 3 se obtuvo la     secuencia completa de aa de TGB1 (463 aa) y TGB2 (119 aa), as&iacute;     como 146 de 190 aa de TGB3 (posiciones</span></font><font size="2"><span      style="font-family: verdana;"></span></font><font size="2"><span      style="font-family: verdana;"> 1 a 146) para el aislamiento de     Boyac&aacute; y la totalidad de dicha prote&iacute;na para la cepa de     Antioquia. Las dem&aacute;s secuencias obtenidas corresponden a     regiones UTR de los extremos 3&acute; para el ARN 2 y 5&acute; para el     ARN 3.</span></font><br style="font-family: verdana;">     <br style="font-family: verdana;">     ]]></body>
<body><![CDATA[<font size="2"><span style="font-family: verdana;">Con el fin de     realizar un     an&aacute;lisis de variaci&oacute;n de las secuencias de las dos cepas     obtenidas con respecto al genoma de la de PMTV de Suecia &#8211; Sw (Savenkov     <span style="font-style: italic;">et al.</span> 1999, Sandgren <span      style="font-style: italic;">et al.</span> 2001), se incluyeron 1956 nt     (651 aa) para     CP-RT,&nbsp; 531 nt (176 aa) para CP&nbsp; y 1392&nbsp; (463&nbsp;     aa)&nbsp; para&nbsp; las&nbsp; tres&nbsp; regiones&nbsp; del TGB.&nbsp;     En t&eacute;rminos generales se encontraron muy altos niveles de     ]]></body>
<body><![CDATA[identidad en las tres regiones analizadas, siendo la cP la m&aacute;s     uniforme con 99% en la secuencia de nt y 100% en aa para las tres     cepas. CP-RT present&oacute; un nivel de identidad para nt de 99,4%     entre las cepas de Antioquia y Boyac&aacute; y del 97,5 - 97,6% con     respecto a la secuencia de referencia; mientras que estos valores     fueron superiores al 98,2% cuando se compar&oacute; la secuencia de aa.     Para TGB se encontr&oacute; que todos los aislamientos compartieron un     99,9% de identidad en nt y aa (<a      href="/img/revistas/am/v24n1/a01i3.jpg">Figura 3</a>). Las     pocas diferencias a nivel     ]]></body>
<body><![CDATA[de aa encontradas en este estudio, correspondieron a cambios en quince     posiciones para el producto del ARN 2, siendo la m&aacute;s relevante     una inserci&oacute;n de 4 aa (PEVR) a partir de la posici&oacute;n 81     de CP. Para el caso de TGB se encontraron diez cambios a lo largo de     las tres prote&iacute;nas analizadas, con la presencia de una     deleci&oacute;n en la posici&oacute;n 361 en la cepa de Boyac&aacute;.    <br>     <br> </span></font><font size="2"><span style="font-family: verdana;">Por&nbsp; otra&nbsp; parte,&nbsp; el&nbsp; an&aacute;lisis&nbsp; filogen&eacute;tico realizado con base en 2569 nt para el ARN 2 con secuencias de&nbsp; referencia&nbsp; de&nbsp; los&nbsp; aislamientos Corneta-Nemilkov de Rep&uacute;blica Checa (DQ102381) y Sw&nbsp; (AJ243719) de Suecia (<a href="/img/revistas/am/v24n1/a01i4.jpg">Figura 4</a>), arroj&oacute; un dendrograma con dos clados soportados por 100% de <span style="font-style: italic;">bootstrap</span>, separ&aacute;ndose los aislamientos de colombia&nbsp; de los de europa;&nbsp; sin embargo, los niveles de identidad entre ambos grupos fueron muy altos (&gt;97,5%). Al calcular los niveles de diversidad&nbsp; (promedio del n&uacute;mero de sustituciones de nucle&oacute;tidos por cada sitio), para sitios sin&oacute;nimos (dS) y no sin&oacute;nimos (dNS), se encontr&oacute; una diversidad muy baja, con tan solo 0,017 (se= 0,003) para dns y 0,009 (SE=0,002) para dS. La relaci&oacute;n promedia entre dNS/ dS fue de 1,8, lo cual indica que las cepas de PMTV se encuentran bajo selecci&oacute;n positiva para este componente del genoma. Para las cepas colombianas el valor de dNS/dS fue de 3, mientras que para las europeas fue de 1,2. La distancia gen&eacute;tica basada en el m&eacute;todo de Ki-mura-2 par&aacute;metros, para toda la poblaci&oacute;n fue de 0,015.</span></font><br  style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">El an&aacute;lisis filogen&eacute;tico realizado con base en 2008 nt para arn 3, con secuencias de referencia de los aislamientos Korneta-Nemilkov (DQ144451), 54-19 (AY353719) y 54-10 (AY426745) de Dinamarca, Sw (AJ277556) de Suecia y Todd (D30753) de Escocia (<a  href="/img/revistas/am/v24n1/a01i5.jpg">Figura 5</a>) gener&oacute; un dendrograma con dos clados principales de aislamientos europeos, mientras que los colombianos se presentaron en posici&oacute;n intermedia entre estos, en ramas soportadas por 100% de <span style="font-style: italic;">bootstrap</span>. A pesar de dichas agrupaciones, los niveles de identidad entre todos los aislamientos fueron superiores a 96,7%. Al calcular los niveles de diversidad para sitios sin&oacute;nimos (dS) y no sin&oacute;nimos (dNS), se encontr&oacute; una diversidad muy baja para todos los aislamientos, con tan solo 0,011 (se= 0,002) para dns y 0,044 (SE=0,006) para dS. La relaci&oacute;n media entre dNS/dS fue de 0,25, lo cual indica que las cepas de PMTV se encuentran bajo selecci&oacute;n negativa en dicho segmento de ARN. Para las cepas colombianas el valor de dNS/ dS fue de 0,19, mientras que para los aislamientos europeos fue de 0,39. La distancia gen&eacute;tica basada en el m&eacute;todo de Kimura -2 par&aacute;metros, para toda la poblaci&oacute;n fue de 0,020 (SE 0,002).    <br> </span></font>    <br> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Los&nbsp; bajos&nbsp; niveles&nbsp; de&nbsp; variaci&oacute;n&nbsp; encontrados&nbsp; en los an&aacute;lisis de genomas de PMTV (Savenkov <span  style="font-style: italic;">et al.</span> 1999, Sandgren <span  style="font-style: italic;">et al.</span> 2001, Cerovska <span style="font-style: italic;">et al.</span> 2007) y que nuevamente fueron inferidos en el presente estudio para las cepas del clado que representa PMTV <span style="font-style: italic;">sensu&nbsp; stricto</span>,&nbsp; indican&nbsp; que&nbsp; este&nbsp; virus&nbsp; se&nbsp; encuentra bajo fuertes presiones de selecci&oacute;n determinadas presumiblemente&nbsp; por&nbsp; las&nbsp; propias&nbsp; caracter&iacute;sticas&nbsp; de su genoma, el estrecho &aacute;mbito de hospedantes y su transmisi&oacute;n persistente y espec&iacute;fica por parte de su vector Sss (Kirk 2008, Santala <span  style="font-style: italic;">et al.</span> 2010). Para el primer caso, la restricci&oacute;n selectiva se manifiesta por los bajos valores de dNS/dS calculados para dicho segmento y ocurre fundamentalmente al presentarse el ARN 2, dicha relaci&oacute;n fue &gt;1, lo cual sugiere una selecci&oacute;n positiva, al presentarse menos restricciones para la fijaci&oacute;n de mutaciones en los genes que codifican para CP y CP-RT. De otra parte, la presencia de un estrecho &aacute;mbito de hospedantes para el virus, que se restringe a algunas especies de las familias Solanaceae y Chenopodiaceae (Kirk 2008), sumada a su transmisi&oacute;n por Sss supone fuertes restricciones sobre los cambios en las diferentes prote&iacute;nas del virus que interact&uacute;an con sus hospedantes y vectores, lo cual impide altas tasas de variaci&oacute;n, tales como las que presentan otros virus de ARNss(+) como los potyvirus, que en general tienen amplios &aacute;mbitos de hospedantes y cuya transmisi&oacute;n por &aacute;fidos pol&iacute;fagos es del tipo no persistente (Hu <span style="font-style: italic;">et al.</span> 2011).</span></font><br  style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">De forma interesante, estudios recientes realizados por osorio <span style="font-style: italic;">et al.</span> (2012), han encontrado que en Colombia se presenta un mayor nivel de variaci&oacute;n con respecto a otros pa&iacute;ses, entre las poblaciones de sss, vector de PMTV, al registrarse adem&aacute;s de los Tipos mundialmente reportados de este pat&oacute;geno (I y II), un tercer Tipo (III), que presenta porcentajes de divergencia entre 2% y 5%, con respecto a los anteriores.</span></font><br  style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">El resultado de las inserciones y diferentes sustituciones encontradas en este trabajo en los segmentos de ARN 2 y 3, requiere un tratamiento futuro detallado a partir de an&aacute;lisis de mutantes y de sus consecuencias sobre el ciclo infectivo viral. Igualmente, es imperativo estudiar el efecto de los dos genotipos virales detectados en este estudio sobre la producci&oacute;n y calidad del tub&eacute;rculo semilla de papa en Colombia, de manera que los organismos de sanidad vegetal estatal, gremios de productores y agroindustrias, puedan valorar la necesidad de incluir la detecci&oacute;n del PMTV en los programas de certificaci&oacute;n de semilla y de mejoramiento gen&eacute;tico de papa.</span></font><br style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana; font-weight: bold;"> <font style="font-weight: bold;" size="3"><span  style="font-family: verdana;">Agradecimientos</span></font><br  style="font-family: verdana; font-weight: bold;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Esta investigaci&oacute;n se realiz&oacute; gracias al apoyo econ&oacute;mico y t&eacute;cnico del Ministerio de Agricultura y Desarrollo Rural (proyecto 090-2007S4527-87-08), de la Universidad Nacional de Colombia, sede Medell&iacute;n, Fedepapa y Fritolay. Se agradece a la Prof. Luz Estela Lagos, de la Universidad de Nari&ntilde;o por su apoyo con la colecci&oacute;n de muestras en el Departamento de Nari&ntilde;o.    ]]></body>
<body><![CDATA[<br> <br style="font-family: verdana;"> </span></font> <hr style="width: 100%; height: 2px;">    <!-- ref --><br> <br style="font-family: verdana;"> <font style="font-weight: bold;" size="3"><span  style="font-family: verdana;">Literatura citada</span></font><br  style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Adams, MJ; Antoniw, JF; Kreuze, J. 2009. <span style="font-style: italic;">Virgaviridae</span>: a new family of rod-shaped plant&nbsp; viruses. Archives of Virology 154:1967-1972.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319258&pid=S1659-1321201300010000100001&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --></span></font><br  style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Altschul, SF; Gish, W; Miller, W; Myers, EW; Lipman, DJ. 1990.&nbsp; Basic local alignment search tool.&nbsp; Journal&nbsp; of Molecular Biology 215:403-410.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319259&pid=S1659-1321201300010000100002&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --></span></font><br  style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Artimo, P; Jonnalagedda, M; Arnold, K; Baratin, D; Csardi, G; de Castro, E; Duvaud, S; Flegel,&nbsp; V;&nbsp; Portier, A; Gasteiger, E; Grosdidier, A; Hernandez, C; Loannidis, V; Kuznetsov, D;&nbsp; Liechti, R; Moretti, S; Mostaguir, K; Redaschi, N; Dossier, G; Xenarios, I; Stockinger, H. 2012. ExPASy: SIB bioinformatics resource portal, Nucleic Acids Research 40:597-603.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319260&pid=S1659-1321201300010000100003&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --></span></font><br  style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Cerovska,&nbsp; N;&nbsp; Moravec,&nbsp; T;&nbsp; Rosecka,&nbsp; P;&nbsp;&nbsp; Filigarova,&nbsp;&nbsp; M; Pecenkova,&nbsp; T.&nbsp; 2003.&nbsp; Nucleotide&nbsp; sequences&nbsp; of&nbsp; coat protein coding&nbsp; regions of six potato mop-top<span style="font-style: italic;"> </span>virus isolates. Acta Virologica 47:37-40.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319261&pid=S1659-1321201300010000100004&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --></span></font><br  style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Cerovska, N; Pecenkova, M; Foligarova, M; Dedic, P. 2007. Sequence analysis of the Czech <span  style="font-style: italic;">Potato mop-top virus</span> (PMTV) isolate Korneta-Nemilkov. Folia Microbiologica 52:61-64.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319262&pid=S1659-1321201300010000100005&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --></span></font><br style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Cowan, GH; Torrance, L; Reavy, B.1997. Detection of <span style="font-style: italic;">Potato mop-top virus</span> capsid readthrough protein in virus particles. Journal of General Virology 78:1779-1783.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319263&pid=S1659-1321201300010000100006&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --></span></font><br  style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Davey, T. 2009. The importance of <span style="font-style: italic;">Potato mop-top virus</span> (PMTV) in Scottish seed potatoes (PhD Thesis). Heriot Watt University &amp; Science and Advice for Scottish Agriculture. Scotland. 178 p.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319264&pid=S1659-1321201300010000100007&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --></span></font><br  style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Felsenstein J. 1985. Confidence limits on&nbsp; phylogenies: an approach using the bootstrap. Evolution 39:783-791.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319265&pid=S1659-1321201300010000100008&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --></span></font><br style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Gallo, Y. 2012. Generaci&oacute;n de ant&iacute;genos derivados&nbsp; de la prote&iacute;na de la c&aacute;pside de PVY, TaLMV y PMTV, para la producci&oacute;n de anticuerpos &uacute;tiles en el desarrollo de pruebas serol&oacute;gicas. Tesis de Maestr&iacute;a en Bioqu&iacute;mica. Facultad de Medicina,&nbsp; Universidad Nacional de Colombia, sede Bogot&aacute;. Colombia. 148 p.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319266&pid=S1659-1321201300010000100009&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --></span></font><br  style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Gil,&nbsp; JF;&nbsp; Guti&eacute;rrez,&nbsp; P;&nbsp; Cotes,&nbsp; JM;&nbsp; Gonz&aacute;lez,&nbsp; EP;&nbsp; Mar&iacute;n, M. 2011. Caracterizaci&oacute;n genot&iacute;pica de&nbsp; aislamientos colombianos del <span style="font-style: italic;">Potato mop-top virus</span> (PmTV, Pomovirus). Actualidades Biol&oacute;gicas 33:69-84.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319267&pid=S1659-1321201300010000100010&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --></span></font><br  style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Guerrero, O. 2000. La ro&ntilde;a o sarna polvosa en el&nbsp; Departamento de Nari&ntilde;o. Papas colombianas&nbsp; con el mejor entorno ambiental. 2 ed. Bogot&aacute;, Fedepapa, Colombia. p. 127-129.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319268&pid=S1659-1321201300010000100011&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --></span></font><br  style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Hall, TA. 1999. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis&nbsp; program&nbsp; for Windows 95/98/NT.&nbsp;&nbsp; Nucleic Acids Symposium Series&nbsp; 41:95-98.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319269&pid=S1659-1321201300010000100012&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --></span></font><br style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Harrison,&nbsp; BD;&nbsp; Jones,&nbsp; RAC.&nbsp; 1970.&nbsp; Host&nbsp; range&nbsp; and&nbsp; some properties of <span style="font-style: italic;">Potato mop-top virus</span>. Annals Applied Biology 65:393-402.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319270&pid=S1659-1321201300010000100013&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --></span></font><br style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Holdridge,&nbsp; LR. 1987. Ecolog&iacute;a basada en zonas de&nbsp; vida. Trad. Humberto Jim&eacute;nez Saa. IICA. San Jos&eacute;, Costa Rica. 216 p.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319271&pid=S1659-1321201300010000100014&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --></span></font><br  style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;"></span></font><br  style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Hu, X; Karasev, AV; Brown, CJ; Lorenzen, JH.&nbsp; 2009. Sequence characteristics of potato virus Y recombinants. Journal of General Virology 90:3033-3041.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319272&pid=S1659-1321201300010000100015&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --></span></font><br  style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Huang, X; Madan, A. 1999. CAP3: A DNA sequence assem-bly program. Genome Research 9:868-877.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319273&pid=S1659-1321201300010000100016&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --></span></font><br  style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Jaramillo,&nbsp; S;&nbsp; Botero,&nbsp; JM.&nbsp; 2007.&nbsp; Respuesta&nbsp; de&nbsp; diferentes poblaciones&nbsp; de&nbsp; <span style="font-style: italic;">Spongospora&nbsp;&nbsp; subterranea</span>&nbsp; f.&nbsp; sp. <span style="font-style: italic;">subterranea </span>a la rotaci&oacute;n entre dos variedades de papa (<span style="font-style: italic;">Solanum tuberosum</span> ssp. <span  style="font-style: italic;">andigena</span>). Revista Facultad Nacional de Agronom&iacute;a Medell&iacute;n 60:3859-3876.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319274&pid=S1659-1321201300010000100017&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --></span></font><br  style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Jones,&nbsp; RAC;&nbsp; Harrison,&nbsp; BD.&nbsp; 1972.&nbsp; Ecological&nbsp; studies&nbsp; on <span style="font-style: italic;">Potato&nbsp; mop-top&nbsp; virus</span>&nbsp; in&nbsp; Scotland.&nbsp; Annals Applied Biology 71:47-57.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319275&pid=S1659-1321201300010000100018&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --></span></font><br style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Kirk, HG. 2008. <span  style="font-style: italic;">Mop-top virus</span>, relationship to its&nbsp; vector. American Journal of Potato Research 85:261-265.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319276&pid=S1659-1321201300010000100019&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><br>     <!-- ref --><br> Lambert,&nbsp; DH;&nbsp; Levy,&nbsp; L;&nbsp; Mavrodieva,&nbsp; VA;&nbsp; Johnson,&nbsp; SB; </span></font><font  size="2"><span style="font-family: verdana;">Babcock, MJ; Vayda, ME. 2003. First report of <span style="font-style: italic;">Potato mop-top virus</span> on potato from the United States. Plant Disease 87:872.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319278&pid=S1659-1321201300010000100020&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --></span></font><br style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Larkin, M; Blackshields, G; Brown, NP; Chenna, R; McGettigan, PA; McWilliam, H; Valentin, F;&nbsp; Wallace, IM; Wilm, A; L&oacute;pez, R; Thompson, JD; Gibson, TJ; Higgins, DG. 2007.&nbsp; Clustal W and Clustal X version 2.0. Bioinformatics 23:2947-2948.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319279&pid=S1659-1321201300010000100021&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --></span></font><br  style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Latvala-Kilby, S; Aura, JM; Pupola, N; Hannukkala, A; Valkonen, JPT. 2009. Detection of <span  style="font-style: italic;">Potato mop-top virus</span> in potato tubers and sprouts: combinations of rna2 and&nbsp; RNA3&nbsp; variants&nbsp; and&nbsp; incidence&nbsp; of&nbsp; symptomless infections. Phytopathology 99:519-531.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319280&pid=S1659-1321201300010000100022&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --></span></font><br  style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Lim, HS; Bragg, JN; Ganesan, U; Ruzin, S; Schichnes, D; Lee, MY; Vaira, AM; Ryu, KH; Hammond, J; Jackson, AO.&nbsp; 2009.&nbsp; Subcellular&nbsp;&nbsp; localization&nbsp; of&nbsp; the&nbsp; <span style="font-style: italic;">Barley stripe mosaic virus</span> triple gene block proteins. Journal Virology 83:9432-9448.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319281&pid=S1659-1321201300010000100023&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --></span></font><br  style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">MacKenzie, DJ. 1996. Detection of <span style="font-style: italic;">Potato Mop-top virus</span> in leaf or tuber tissue by reverse transcription-polymerase chain reaction.&nbsp; Document CPHBT96K03, Centre for Plant Health, Agriculture and Agri-Food Canada. Sidney, B.C., Canad&aacute;. 7 p.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319282&pid=S1659-1321201300010000100024&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --></span></font><br style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Mayo, MA; Torrance, L; Cowan, G; Jolly, CA; Macintosh, SM; Orrego, R; Barrera, C; Salazar, LF. 1996. Conservation of coat protein sequence among isolates of <span  style="font-style: italic;">Potato mop-top virus</span> from Scotland and Peru. Archives of Virology 141:1115-1121.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319283&pid=S1659-1321201300010000100025&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --></span></font><br  style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Montero-Ast&uacute;a, M; Vasqu&eacute;z, V; Turechek, WW;&nbsp; Merz,&nbsp; U; Rivera, C. 2008. Incidence, distribution, and association of <span  style="font-style: italic;">Spongospora subterranea</span> and <span style="font-style: italic;">Potato mop-top virus</span> in Costa Rica. Plant Disease 92:1171-1176.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319284&pid=S1659-1321201300010000100026&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --></span></font><br  style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Mumford,&nbsp; RA; Walsh, K; Barker, I; Boonham, N.&nbsp; 2000. Detection of <span  style="font-style: italic;">Potato mop top virus</span> and <span style="font-style: italic;">Tobacco rattle virus</span> using a multiplex real-time&nbsp; fluorescent reverse transcription polymerase chain reaction assay. Phytopathology 90:448-453.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319285&pid=S1659-1321201300010000100027&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --></span></font><br style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Nakayama, T; Maoka, T; Hataya, T; Shimizu, M; Fuwa, H; Tsuda, S; Motoyuki, M. 2010.&nbsp; Diagnosis of <span style="font-style: italic;">Potato mop-top virus</span> in soil&nbsp; using bait plant bioassay and RT-PCR-microplate hybridization. American&nbsp; Journal of Potato Research 87:218-225.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319286&pid=S1659-1321201300010000100028&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --></span></font><br style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Nielsen, SL; Nicolaisen, M. 2003. Identification of two nucleotide sequence sub-groups within&nbsp; <span style="font-style: italic;">Potato mop-top virus</span>. Archives of Virology 148:381-388.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319287&pid=S1659-1321201300010000100029&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --></span></font><br style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Osorio, I; Orozco, M; Guti&eacute;rrez, P; Gonz&aacute;lez, E; Mar&iacute;n, M. 2012. Variabilidad gen&eacute;tica de <span style="font-style: italic;">Spongospora&nbsp; subterranea</span> f.sp. <span style="font-style: italic;">subterranea </span>en&nbsp; Colombia. Bioagro 24:151-162.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319288&pid=S1659-1321201300010000100030&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --> </span></font><br  style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Reavy, B; Sandgren, M; Barker, H;&nbsp; Heino, P; Oxelfelt, P. 1997. A coat protein transgene from a Scottish isolate of <span style="font-style: italic;">Potato mop-top virus</span> mediates&nbsp; strong resistance against Scandinavian isolates which have similar coat protein genes.&nbsp; European&nbsp; Journal of Plant Pathology 103:829-834.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319289&pid=S1659-1321201300010000100031&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --></span></font><br style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Salazar, LF. 2006. Emerging and re-emerging potato diseases in the Andes. Potato Research 49:43-47.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319290&pid=S1659-1321201300010000100032&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --></span></font><br  style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Sandgren,&nbsp; M;&nbsp; Savenkov,&nbsp; E;&nbsp; Valkonen,&nbsp; JP.&nbsp; 2001.&nbsp;&nbsp; The readthrough region of <span style="font-style: italic;">Potato mop-top virus</span> (PmTV) coat protein enconding RNA, the second largest RNA of PMTV genome, undergoes structural changes in naturally infected and experimentally inoculated plants. Archives of Virology 146:467-477.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319291&pid=S1659-1321201300010000100033&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --></span></font><br  style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Santala, J; Samuilova, O; Hannukkala, A; Latvala, S; Kortemaa, H; Beuch, U; Kvarnheden, A; Persson, P; Topp, K; &Oslash;rstad, K; Spetz, C; Nielsen, SL; Kirk, HG; Budziszewska, M; Wieczorek, P; Obr&#281;palska-St&#281;plowska, A; Pospieszny, H; Kryszczuk, A; Sztangret-Wi&#347;niewska, J; Yin, Z; Chrzanowska,&nbsp; M; Zimnoch-Guzowska, E; Jackeviciene, E; Taluntyt&#279;, L; P&#363;pola, N; Mihailova, J; Lielmane, I; J&auml;rvek&uuml;lg, L; Kotkas, K; Rogozina, E; Sozonov, A; Tikhonovich, I; Horn, P; Broer, I; Kuusiene, S; Staniulis, J; Uth, JG; Adam, G; Valkonen, JPT. 2010.&nbsp; Detection, distribution and control of&nbsp; <span style="font-style: italic;">Potato mop-top virus</span>, a soil-borne virus, in northern Europe. Annals of Applied Biology 157:163-178.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319292&pid=S1659-1321201300010000100034&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --></span></font><br  style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Savenkov, EI; Sandgren, MY; Valkonen, JPT. 1999. Complete sequence of RNA 1 and the presence of tRNA-like structures in all rnas of <span style="font-style: italic;">Potato mop-top virus</span>, genus <span style="font-style: italic;">Pomovirus</span>.&nbsp; Journal&nbsp; of&nbsp; General&nbsp; Virology&nbsp; 80:2779-2784.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319293&pid=S1659-1321201300010000100035&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --></span></font><br style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Savenkov, EI; Germundsson, A; Zamyathin, AA; Sandgren, M; Valkonen, JPT. 2003. <span  style="font-style: italic;">Potato mop-top virus</span>: The coat protein-encoding RNA and the gene for cysteinerich protein are dispensable for systemic virus movement in&nbsp; <span  style="font-style: italic;">Nicotiana benthamiana</span>. Journal of General Virology 84:1001-1005.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319294&pid=S1659-1321201300010000100036&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --></span></font><br  style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Tamura,&nbsp; K;&nbsp; Nei,&nbsp; M.&nbsp; 1993.&nbsp; Estimation&nbsp; of&nbsp; the&nbsp; number&nbsp; of nucleotide substitutions in the control region of mitochondrial DNA in humans and chimpanzees. Molecular Biology and Evolution 10:512-526.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319295&pid=S1659-1321201300010000100037&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --></span></font><br  style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Tamura, K; Dudley, J; Nei, M; Kumar, S. 2007.&nbsp; MEGA4: Molecular Evolutionary Genetics&nbsp; Analysis (MEGA) software version 4.0.&nbsp; Molecular Biology and Evolution 24:1596-1599.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319296&pid=S1659-1321201300010000100038&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --></span></font><br style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Technelysium. 2009. Chromas. 2.0 (en l&iacute;nea). Consultado 15 febrero de 2009. Disponible en&nbsp; http://www.technelysium.com.au/chromas_lite.html.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319297&pid=S1659-1321201300010000100039&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --></span></font><br  style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Tenorio, J; Franco, Y; Chuquillanqui, C; Owens, RA; Salazar, LF. 2006. Reaction of potato varieties to <span style="font-style: italic;">Potato mop-top virus</span> infection in the Andes. American Journal of Potato Research 83:423-31.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319298&pid=S1659-1321201300010000100040&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --></span></font><br  style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Torrance, L; Cowan, G. H; Sokmen, MA; Reavy, B. 1999. A naturally occurring deleted form of RNA 2 of <span style="font-style: italic;">Potato mop-top virus</span>. Journal of General Virology 80:2211-2215.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319299&pid=S1659-1321201300010000100041&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --></span></font><br  style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">V&eacute;lez, PB. 2007. Detecci&oacute;n e identificaci&oacute;n del <span  style="font-style: italic;">Potato moptop&nbsp; virus</span>&nbsp; (PMTV)&nbsp; en&nbsp; &aacute;reas&nbsp; de&nbsp; producci&oacute;n&nbsp; de&nbsp; papa donde se encuentra&nbsp; <span style="font-style: italic;">Spongospora subterranea</span> en dos departamentos&nbsp; de&nbsp; colombia.&nbsp; Tesis&nbsp; de&nbsp; Maestr&iacute;a&nbsp; en Ciencias Agrarias. Facultad de Agronom&iacute;a, Universidad Nacional de Colombia, sede Bogot&aacute;. Colombia. 115 p.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319300&pid=S1659-1321201300010000100042&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --></span></font><br  style="font-family: verdana;"> <br style="font-family: verdana;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;">Xu,&nbsp; H;&nbsp; Dehaan, TL; De&nbsp; Boer,&nbsp; SH. 2004.&nbsp; Detection&nbsp; and confirmation of <span style="font-style: italic;">Potato mop-top virus</span> in potatoes produced in the United States and Canada. Plant Disease 88:363-367.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=319301&pid=S1659-1321201300010000100043&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></span></font><br  style="font-family: verdana;"> &nbsp; <font size="2"><span style="font-family: verdana;">    <br> </span></font>     <div style="text-align: justify;"><font size="2"><span  style="font-family: verdana;"><a name="Correspondencia1"></a><a  href="#Correspondencia3">*</a>Correspondencia para:</span></font>    <br> <font size="2"><span style="font-family: verdana;"></span></font><font  size="-1"><span style="font-family: verdana;">In&eacute;s Osorio-Giraldo</span></font><font size="-1"><span  style="font-family: verdana;">. Laboratorio&nbsp; de Biolog&iacute;a Celular y Molecular y Laboratorio de Microbiolog&iacute;a Industrial, Facultad de&nbsp; Ciencias, Universidad Nacional de Colombia - Sede Medell&iacute;n, Colombia. Calle 59A No 63 - 20,&nbsp; Medell&iacute;n, Colombia. inesosorio@gmail.com.</span></font>    <br> <font size="-1"><span style="font-family: verdana;"></span></font><font  size="-1"><span style="font-family: verdana;">Pablo Guti&eacute;rrez-S&aacute;nchez</span></font><font size="-1"><span  style="font-family: verdana;">. Laboratorio&nbsp; de Biolog&iacute;a Celular y Molecular y Laboratorio de Microbiolog&iacute;a Industrial, Facultad de&nbsp; Ciencias, Universidad Nacional de Colombia - Sede Medell&iacute;n, Colombia. Calle 59A No 63 - 20,&nbsp; Medell&iacute;n, Colombia. paguties@unal.edu.co.</span></font>    ]]></body>
<body><![CDATA[<br> <font size="-1"><span style="font-family: verdana;"></span></font><font  size="-1"><span style="font-family: verdana;">Mauricio Mar&iacute;n-Montoya</span></font><font size="-1"><span  style="font-family: verdana;">. Laboratorio&nbsp; de Biolog&iacute;a Celular y Molecular y Laboratorio de Microbiolog&iacute;a Industrial, Facultad de&nbsp; Ciencias, Universidad Nacional de Colombia - Sede Medell&iacute;n, Colombia. Calle 59A No 63 - 20,&nbsp; Medell&iacute;n, Colombia. mamarinm@unal.edu.co.    <br> </span></font><font size="2"><span style="font-family: verdana;"><a  name="1"></a>1. Parte de la tesis de maestr&iacute;a de la primera autora, desarrollada en el marco del </span></font><font  size="2"><span style="font-family: verdana;">proyecto 090-2007S4527-87-08, financiado por Ministerio de Agricultura y Desarrollo Rural, Colombia.</span></font>    <br>     <div style="text-align: justify;"> <font size="2"><span style="font-family: verdana;"></span></font></div> <font size="2"><span style="font-family: verdana;"><a name="2"></a><a  href="#3">2</a>. Laboratorio&nbsp; de Biolog&iacute;a Celular y Molecular y Laboratorio de Microbiolog&iacute;a Industrial, Facultad de&nbsp; Ciencias, Universidad Nacional de Colombia - Sede Medell&iacute;n, Colombia. Calle 59A No 63 - 20,&nbsp; Medell&iacute;n, Colombia. inesosorio@gmail.com, paguties@unal.edu.co, mamarinm@unal.edu.co (autor para correspondencia).</span></font>    <br> </div> <hr style="width: 100%; height: 2px;">     <div style="text-align: center;"><font style="font-weight: bold;"  size="2"><span style="font-family: verdana;">Recibido: 28 de febrero, 2012. Aceptado: 1 de abril, 2013.</span></font>    <br> </div> </div> <font size="2"> </font>      ]]></body><back>
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