Cuadernos de Investigación UNED

Efecto de las aves y la temperatura sobre la germinación y viabilidad de las semillas de Rubus ulmifolius (Rosaceae)

ABSTRACT ''Effect of birds and temperature on the germination and viability of Rubus ulmifolius (Rosaceae) seeds'' Introduction: Invasive species are causing serious modifications around the world, affecting deserts and tropical forests. In Córdoba, Argentina, the distribution and abundance of blackberry (Rubus ulmifolius) has increased in rural and wild environments. Seed dispersion by birds, and the high temperatures generated by forest fires, have been mentioned as the main cause of this increase. However, there are no studies about these hypotheses. Objectives: To know if the birds disperse the blackberry seeds and if they affect their germination, and to study the effect of high and low temperatures on germination and viability. Methods: Blackberry fruits and fresh feces from birds were collected in the field and the seeds kept at constant temperature during 20 months to measure germination; 27 samples of seeds (50 fruits per sdample) were kept at several temperatures and durations, ranging from room temperature to -11ºC, and from a few minutes to several days. Afterwards, they were germinated at constant temperature for 20 months. Additionally, 33 similar samples were treated for a viability test. Results: Neither seeds from the fruits, nor seeds from feces, germinate after 20 months. Most (75%) seeds from feces remained viable after 20 months. Viability was affected by temperature (H: 21,50; p = 0,0054). Conclusion: These blackberry seeds have a low germination power since they did not germinate under any treatment after 20 months. On the other hand, these seeds are highly resistant to high and low temperatures, although surface fires could destroy them.

RESUMEN Introducción: Las especies invasoras están causando serias modificaciones por todo el mundo, afectando desiertos y bosques tropicales. En Córdoba, Argentina, la distribución y abundancia de la mora o zarzamora (Rubus ulmifolius) se ha incrementado en ambientes rurales y silvestres. Se ha sugerido que las causas principales del incremento son la dispersión de semillas por aves, y las altas temperaturas generadas por los incendios forestales. Sin embargo, no existen estudios sobre estas hipótesis. Objetivos: Conocer si las aves dispersan las semillas de zarzamora y si afectan a su germinación, y estudiar el efecto de las altas y bajas temperaturas sobre la germinación y viabilidad. Métodos: Se recolectaron en campo frutos de zarzamora y heces frescas de aves; y las semillas se mantuvieron a temperatura constante durante 20 meses para medir la germinación. Se mantuvieron 27 muestras de semillas (50 frutos por muestra) a varias temperaturas y duraciones, desde temperatura ambiente hasta -11ºC, y desde unos pocos minutos hasta varios días. Posteriormente, se germinaron a temperatura constante durante 20 meses. Además, 33 muestras similares fueron tratadas para una prueba de viabilidad. Resultados: Ni las semillas de los frutos, ni las semillas de las heces, germinaron en 20 meses. La mayoría de las semillas de las heces (75%) permanecían viables a los 20 meses. La viabilidad se vio afectada por la temperatura (H: 21,50; p = 0,0054). Conclusión: Estas semillas de mora tienen un bajo poder germinativo ya que no germinaron en ningún tratamiento después de 20 meses. Por otro lado, estas semillas son muy resistentes a las altas y bajas temperaturas, aunque los incendios superficiales podrían destruirlas.

Residuos de acaricidas en leche entera bovina de Costa Rica

RESUMEN Introducción: En Costa Rica se procesan anualmente 681 millones de litros de leche, debido al alto consumo per cápita que es de 216 kilogramos, por lo que es particularmente importante evitar los efectos tóxicos de la leche contaminada, asociados a vómitos, parálisis y calambres, y, a largo plazo, cáncer, trastornos endocrinos, diabetes y alteraciones cromosómicas, entre otros. Objetivo: Determinar los niveles de residuos de cinco acaricidas usados en Costa Rica: Amitraz, Coumafós, Clorpirifós, Ciflutrina y Cipermetrina, en muestras de leche entera bovina de Costa Rica. Métodos: De enero a setiembre del 2018 tomamos muestras en 200 sistemas de producción de seis provincias y aplicamos técnicas de cromatografía de gases y de líquidos, acopladas a espectrometría de masas. Resultados: no hallamos residuos de Coumafós y la Ciflutrina, pero en 19 fincas detectamos Amitraz, Cipermetrina y Clorpirifós (este último, 0,01mg/kg). Pocos encargados conocen alternativas al control químico, y la mayoría ni respeta el periodo de retiro del garrapaticida, ni hace la rotación del ingrediente activo. Conclusión: Se debe mejorar la educación y el monitoreo sobre el uso de garrapaticidas en los sistemas de producción de leche.

ABSTRACT ''Acaricide residues in whole bovine milk from Costa Rica''. Introduction: Because of the high per capita consumption of 216 kilograms, in Costa Rica, 681 million liters of milk are processed annually, and it is particularly important to avoid the toxic effects of contaminated milk, associated with vomiting, paralysis and cramps, and, in the long term, cancer, endocrine disorders, diabetes and chromosomal alterations, among others. Objective: To determine the residue levels of five acaricides used in Costa Rica: Amitraz, Coumafos, Chlorpyrifos, Cyfluthrin and Cypermethrin, in samples of whole bovine milk. Methods: From January to September 2018, we collected samples from 200 production systems in six provinces and applied gas and liquid chromatography techniques coupled with mass spectrometry. Results: We did not find residues of Coumafos and Cyfluthrin, but in 19 farms we detected Amitraz, Cypermethrin and Chlorpyrifos (the latter, 0.01mg/kg). Few managers know alternatives to chemical control, and most do not respect the withdrawal period of the tick, and do not rotate the active ingredient. Conclusion: Education and monitoring on tick control should be improved in dairy farms.

Biochemical and physiological responses of the tree Pterogine nitens (Fabaceae) to simulated glyphosate drift

ABSTRACT Introduction: In the last decades, the natural dispersal area of P. nitens has been subjected to a change in land use. The agricultural frontier has expanded, at the expense of native forest, with the incorporation of productive systems that use high doses of the herbicide glyphosate. The degree of tolerance of the species to the herbicide and its physiological responses are unknown. Objective: To evaluate the biochemical and physiological responses of Pterogine nitens to simulated glyphosate drift. Methods: Greenhouse trials were conducted with one-year-old plants grown in pots. Glyphosate drift was simulated at doses of 0,65 and 130g a.e. ha-1. We measured concentrations of shikimate, photosynthetic pigments, and mineral composition, 20 days after application. Results: Glyphosate increased concentrations of shikimate and decreased concentrations of photosynthetic pigments. It also reduced concentrations of potassium, magnesium, calcium, zinc, manganese, and iron. Conclusions: Glyphosate alters the photochemical stage of photosynthesis by decreasing the concentration of photosynthetic pigments. It also interferes with macro- and micronutrient homeostasis.

RESUMEN ''Respuestas bioquímicas y fisiológicas del árbol Pterogine nitens (Fabaceae) a la deriva simulada de glifosato''. Introducción: En las últimas décadas, el área de dispersión natural de P. nitens, estuvo sometida a un cambio en el uso de la tierra. Se expandió la frontera agropecuaria, a expensas del bosque nativo, con la incorporación de sistemas productivos que utilizan altas dosis del herbicida glifosato. Se desconoce el el grado de tolerancia de la especie al herbicida, y su respuestas fisiológicas. Objetivo: Evaluar las respuestas bioquímicas y fisiológicas de Pterogine nitens a la deriva simulada de glifosato. Métodos: Hicimos ensayos en invernáculo, con plantas de un año de edad, en macetas. Simulamos la deriva de glifosato, en dosis de 0,65 y 130g e.a. ha-1. Veinte días después de la aplicación, medimos las concentraciones de shikimato, pigmentos fotosíntéticos, y la composición mineral. Resultados: El glifosato incrementó las concentraciones de shikimato, y disminuyó las concentración de pigmentos fotosintéticos. También redujo las cocentraciones de potasio, magnesio, calcio, zinc, manganeso y hierro. Conclusiones: El glifosato altera la etapa fotoquímica de la fotosíntesis, al diminuir la concentración de pigmentos fotosintéticos. También interfiere con la homeostasis de macro y micronutrientes.

Factores asociados con discapacidad en actividades básicas e instrumentales de la vida diaria en residentes de Costa Rica de 60 años y más

RESUMEN Introducción: La discapacidad se ha considerado como una dificultad para realizar actividades necesarias para la vida. Objetivo: Identificar los factores asociados a la discapacidad en actividades básicas e instrumentales de la vida diaria en personas de 60 años y más residentes en Costa Rica. Métodos: El estudio incluyó 2238 personas participantes en el proyecto Costa Rica: Estudio de Longevidad y Envejecimiento Saludable (CRELES). Se estimaron modelos de regresión logística y se calcularon odds ratios con el fin de identificar los factores asociados a la discapacidad. Resultados: Los factores que influyen en la discapacidad en actividades de la vida diaria combinadas están la presencia de dolor, la no realización de actividad física y la proteína C reactiva. Los factores de mayor impacto en las actividades básicas fueron la presencia de dolor, la no realización de actividad física y la presencia de enfermedad crónica. En el caso de las actividades instrumentales la actividad física, la salud autoevaluada negativa y el dolor tuvieron el mayor impacto. Además, padecimientos como la diabetes afectan tanto las actividades básicas como las instrumentales. Conclusiones: El dolor, la no realización de actividad física, la salud autoevaluada y otros factores sociodemográficos provocan dificultades funcionales que afectan la calidad de vida de las personas de 60 y más.

ABSTRACT ''Factors associated with disability in basic and instrumental activities of daily living in Costa Rican residents aged 60 and over''. Introduction: Disability has been considered as a difficulty in carrying out activities necessary for life. Objective: To identify factors associated with disability in basic and instrumental activities of daily living in people aged 60 and over residing in Costa Rica. Methods: The study included 2238 people participating in the Costa Rica project: Longevity and Healthy Aging Study. Logistic regression models were estimated and odds ratios were calculated in order to identify factors associated with disability. Results: Factors that influence disability in combined activities are the presence of pain, the lack of physical activity and C-reactive protein. The factors with the greatest impact on basic activities were the presence of pain, the lack of physical activity and the presence of chronic disease. For instrumental activities, negative self-rated health and pain had the greatest impact, after physical activity. In addition, conditions such as diabetes affect activities of daily living. Conclusion: Pain, not performing physical activity, self-rated health and other sociodemographic factors cause functional difficulties that affect the quality of life of people aged 60 and over.

Validación de un método analítico con ácidos de menor pureza, y matrices de hierro, para la evaluación de metales pesados (Cd, Pb, Cr y As) en fertilizantes

RESUMEN Introducción: El uso frecuente de fertilizantes en el sector agrícola costarricense provoca contaminación ambiental; y los metales pesados se encuentran entre los principales contaminantes debido a su alta toxicidad, lo que fortalece la necesidad de métodos locales asequibles y confiables para evaluar los niveles de contaminación. Objetivo: Validar una adaptación de un método que utiliza pureza de ácido modificada y matrices de hierro para medir metales pesados (Cd, Pb, Cr y As) en fertilizantes. Método: Probamos cuatro análisis por duplicado de una muestra de concentración conocida con ácidos de grado reactivo y ácidos ultrapuros. Para la prueba de interferencia de hierro, usamos ocho repeticiones. También hicimos pruebas de sesgo, precisión, límites de detección, límite de cuantificación, especificidad, recuperación, falsos positivos y falsos negativos. Resultados: El nuevo método demostró ser satisfactorio y su eficacia se confirmó con los parámetros de rendimiento analítico. Conclusiones: El método es resistente a cambios en la pureza del ácido y tolera matrices con concentraciones de hierro menores al 5% m/m.

ABSTRACT ''Validation of an analytical method with modified acid purity and iron matrices to measure heavy metals (Cd, Pb, Cr and As) in fertilizers''. Introduction: The frequent use of fertilizers in the Costa Rican agricultural sector causes environmental pollution; and heavy metals are among the main pollutants because of their high toxicity, strengthening the need for affordable and reliable local methods to assess pollution levels. Objective: To validate an adaptation of a method that uses modified acid purity and iron matrices to measure heavy metals (Cd, Pb, Cr and As) in fertilizers. Method: We tested four duplicate analyzes of a sample of known concentration with reactive grade acids and ultra-pure acids. For the iron interference test, we used eight replicates. We also did tests for bias, precision, detection limits, quantification limit, specificity, recovery, false positives and false negatives. Results: The new method proved satisfactory and its efficiency held by analytical performance parameters. Conclusions: The method is resistant to changes in acid purity, and tolerates matrices with iron concentrations under 5% m/m.

Abundancia relativa de mamíferos silvestres en Cinchona, Costa Rica, antes del terremoto del 2009: estimación con ''cámaras trampa''

RESUMEN Introducción: El 8 de enero del 2009 sufrió el terremoto de Cinchona, en Alajuela, Costa Rica. Desde dos años antes del terremoto, operaba en la zona una red de cámaras automáticas en el bosque pluvial premontano, lo que permitió conocer la abundancia relativa de mamíferos en ese periodo. Objetivo: Cuantificar la abundancia relativa de ciertos mamíferos silvestres en la zona de Cinchona, antes del terremoto, y servir como punto de comparación para estudios futuros. Métodos: Con cámaras automáticas funcionando un total de 1555 ''noches-cámara''. Resultados: obtuve 150 fotografías correspondientes a 10 especies, siendo las más abundantes el saíno, Pecari tajacu, con 150 registros; la guatuza, Dasyprocta punctata, con 31; y el tepezcuintle, Cuniculus paca, con 29 registros. También registré al puma, Puma concolor, (un macho y una hembra, 0,02 pumas/km2); y al ocelote, Leopardus pardalis (un macho, dos hembras y una cría, 0,43ind/km2). Conclusión: Aunque la abundancia de mamíferos silvestres en Cinchona era relativamente baja antes del terremoto, incluía grandes felinos declarados en peligro de extinción en Costa Rica.

ABSTRACT ''Relative abundance of wild mammals in Cinchona, Costa Rica, before the 2009 earthquake: estimation with camera traps''. Introduction: On January 8, 2009, Costa Rica was hit by the Cinchona earthquake in Alajuela Province. When the earthquake hit, a network of automatic cameras had been operating in the premontane rain forest for two years, recording the relative abundance of mammals. Objective: To quantify the relative abundance of wild mammals in the Cinchona area, before the earthquake, and to serve as a point of comparison for future studies. Methods: With automatic cameras running a total of 1555 "camera-nights". Results: I obtained 150 photographs corresponding to 10 species. The most abundant were the peccary, Pecari tajacu, with 150 records; the guatuza, Dasyprocta punctata, with 31; and the tepezcuintle, Cuniculus paca, with 29 records. I also recorded the puma, Puma concolor (one male and one female, 0,02 pumas/km2); and the ocelot, Leopardus pardalis (one male, two females and one calf, 0,43ind/km2). Conclusion: The abundance of wild mammals in Cinchona was relatively low before the earthquake, but it included large cats declared endangered in Costa Rica.

Distribución y estado de conservación del cocodrilo americano (Crocodylidae: Crocodylus acutus) en El Salvador

RESUMEN Introducción: El cocodrilo americano (Crocodylus acutus) es un depredador de alto nivel y puede ser considerado una especie clave en sus ecosistemas. Aunque la especie se ha estudiado a menudo en otros lugares, hay poca información sobre su distribución actual y estado poblacional en El Salvador. Objetivo: Actualizar la distribución geográfica y evaluar su estado de conservación en El Salvador. Métodos: Definimos un modelo de distribución potencial para nueve factores climáticos con DOMAIN, un programa de modelado bioclimático. La ubicación se recopiló a partir de la literatura; observaciones y fotografías de biólogos y guardabosques; y registros estatales. Definimos el estado con las directrices de la Unión Internacional para la Conservación de la Naturaleza. Resultados: El cocodrilo fue reportado en 40 localidades, incluyendo todos los departamentos de la zona costera y en embalses artificiales del centro del país. Existe una estrecha relación entre los registros y los sistemas hidrológicos de los ríos Lempa, Grande San Miguel y Goascorán. Los sitios con mayor número de registros son Bahía de La Unión, desembocadura del río Lempa y Barra de Santiago. La distribución potencial cubre el 29% del país, con solo el 8% en áreas protegidas. La especie se considera extinta en el lago Güija. Muchos ejemplares son trasladados para evitar accidentes con humanos. Conclusión: El cocodrilo se encuentra ampliamente distribuido en los sistemas fluviales de El Salvador, pero el manejo aún es necesario y debe mejorarse, abarcando la investigación, la educación y la protección

ABSTRACT ''Distribution and conservation status of the American Crocodile (Crocodylidae: Crocodylus acutus) in El Salvador'' Introduction: The American Crocodile (Crocodylus acutus) is a top predator and can be considered a keystone species is its ecosystems. Even though the species has often been studied elsewhere, there is little information about its current distribution and status in El Salvador. Objective: To update the geographic distribution, and to assess its conservation status, in El Salvador. Methods: We defined a potential distribution model for nine climatic factors with DOMAIN, a bioclimatic modeling program. Location was compiled from the literature; observations and photographs by biologists and rangers; and state records. We defined status with International Union for Conservation of Nature guidelines. Results: The crocodile was reported from 40 localities, including all departments of the coastal zone and in artificial reservoirs in the center of the country. There is a close relationship between the records and the hydrological systems of the Lempa, Grande San Miguel and Goascorán rivers. The sites with the highest numbers of records are Bahía de La Unión, the mouth of the Lempa River and Barra de Santiago. The potential distribution covers 29% of the country, with only 8 % in protected areas. The species is considered extirpated from Lake Güija. Many specimens are translocated to avoid accidents with humans. Conclusion: The crocodile is widely distributed in El Salvador river systems, but management is still needed and should be improved, covering research, education, and protection.

APIR: metodología para la evaluación y priorización del riesgo en planes HACCP

RESUMEN Introducción: Se propone una metodología de priorización basada en riesgos de tipo ascendente para diferentes peligros y matrices alimentarios, denominada ''APIR''. Las variables del modelo se encuentran subdivididas en dos categorías: a) las características del peligro, donde se cuantifica la probabilidad de ocurrencia y severidad. b) las propiedades de la matriz alimentaria que estiman su riesgo epidemiológico, presencia en el alimento y vulnerabilidad de su manufactura. Se establece un Índice de Riesgo (IR) como parámetro para facilitar que los gestores de inocuidad alimentaria discriminen y prioricen los Peligros Significativos durante la identificación de peligros de los planes HACCP. Objetivo: El objetivo de este trabajo fue establecer una metodología flexible y dinámica de priorización basada en riesgo para empresas procesadoras y transformadoras de productos de origen animal destinados al consumo humano e integrarla con los planes HACCP, permitiendo establecer controles específicos en el proceso productivo. Resultados: Los valores de la significancia entre los nodos Nrp y Nrm fueron de p<0,05. Se estimó el Coeficiente de Correlación de Spearman (rho) para determinar la proporción de variación entre los mismo predictores. Los resultados obtenidos fueron Or-Nrp (rho= 0,719, p= <0,001), Se-Nrp (rho= 0,888, p-valor= <0,001), Re-Nrm (rho= 0,560, p-valor= <0,001), Pm-Nrm (rho= 0,696, p-valor= <0,001) y Vd (rho= 0,687, p-valor= <0,001), respectivamente. Se incluye un estudio de caso para simular el modelo y demostrar su operatividad. Discusión: Los resultados obtenidos demuestran la replicabilidad y validez del presente modelo. Se propone el nombre de APIR (Análisis de Priorización basada en el Índice de Riesgo) para esta metodología.

ABSTRACT ''APIR: methodology for risk assessment and prioritization in HACCP plans''. Introduction: A prioritization methodology based on bottom-up risks is proposed for different hazards and food matrices. The variables of the model are subdivided into two categories: a) the characteristics of the hazard, where the probability of occurrence and severity are quantified. (b) the properties of the food matrix which estimate its epidemiological risk, presence in the food and vulnerability of its manufacture. A Risk Index (IR) is established as a parameter to facilitate food safety managers to discriminate and prioritize Significant Hazards during the hazard identification of HACCP plans. Objective: The aim of this work was to establish a flexible and dynamic methodology of prioritization based on risk for processing and processing companies of animal products intended for human consumption and integrate it with HACCP plans, allowing specific controls to be established in the production process. Results: The significance values between the clusters Nrp and Nrm were p<0,05. The Spearman Correlation Coefficient (rho) was estimated to determine the proportion of variation between the same predictors. The results obtained were Or-Nrp (rho= 0,719, p= <0,001), Se-Nrp (rho= 0,888, p-valor= <0,001), Re-Nrm (rho= 0,560, p-valor= <0,001), Pm-Nrm (rho= 0,696, p-valor= <0,001) y Vd (rho= 0,687, p-valor= <0,001), respectively. A case study is included to simulate the model and demonstrate its operability. Discussion: The results obtained demonstrate the replicability and validity of this model. The name APIR (Prioritization analysis based on Risk Index) is proposed for this methodology.

Macrocytic-normochromic anaemia in the African catfish Clarias gariepinus (Siluriform: Clariidae) exposed to Paraquat under laboratory conditions

ABSTRACT Introduction: Agricultural pesticides are among the main causes of pollution in aquatic ecosystems, and they can lead to physiological changes in fish. For example, blood alteration and damage to haemopoietic tissue can be associated with pathological conditions related to water. Objective: To describe the effects of certain levels of pesticide on a Nigerian fish species. Methods: Macrocytic-normochromic anaemia was induced in C. gariepinus at intervals of 1,7 and 14 days (sub-lethal concentrations of Paraquat: 0; 0,03; 0,05; 0,07 and 0,09mg/l). Results: Blood dyscrasias was observed with a significant (p<0,05) decrease in haemoglobin, haematocrit, red blood cells, white blood cells, lymphocytes and monocytes. Mean corpuscular volume (MCV), Mean corpuscular haemoglobin (MCH), Neutrophils, Eosinophil and Basophil increased significantly (p<0,05) with increasing concentrations of the toxicant while Mean corpuscular haemoglobin concentration (MCHC) remained normal. Conclusion: Sublethal concentrations of paraquat induced macrocytic-normochromic anaemia in the catfish C. gariepinus.

RESUMEN ''Anemia macrocítico-normocrómica en el bagre africano Clarias gariepinus (Siluriform: Clariidae) expuesto a Paraquat en laboratorio'' Introducción: Los plaguicidas agrícolas se encuentran entre las principales causas de contaminación en los ecosistemas acuáticos y pueden provocar cambios fisiológicos en los peces. Por ejemplo, la alteración de la sangre y el daño al tejido hematopoyético pueden estar asociados con condiciones patológicas relacionadas con el agua. Objetivo: Describir los efectos de ciertos niveles de plaguicidas en una especie de pez de Nigeria. Métodos: Se indujo anemia macrocítico-normocrómica en C. gariepinus a intervalos de 1, 7 y 14 días (concentraciones subletales de Paraquat: 0; 0,03; 0,05; 0,07 and 0,09mg/l). Resultados: Hubo discrasias sanguíneas con una disminución significativa (p <0,05) de hemoglobina, hematocrito, glóbulos rojos, glóbulos blancos, linfocitos y monocitos, el volumen corpuscular medio (MCV), la hemoglobina corpuscular media (MCH), los neutrófilos, eosinófilos y basófilos aumentaron significativamente (p <0,05) con concentraciones crecientes del tóxico, mientras que la concentración de hemoglobina corpuscular media (MCHC) se mantuvo normal. Conclusión: Las concentraciones subletales de paraquat generaron anemia macrocítico-normocrómica en el bagre C. gariepinus.

Impacto económico de los conflictos humano-fauna silvestre en la zona de amortiguamiento de la Reserva Biológica Alberto Manuel Brenes, Costa Rica

RESUMEN Introducción: El tamaño de las áreas protegidas a menudo es insuficiente para mantener poblaciones viables de depredadores, lo que provoca una superposición de hábitats con los humanos. Los conflictos resultantes, por ejemplo, la depredación de animales domésticos, afectan negativamente tanto a la vida silvestre como al bienestar humano. Objetivo: Estimar el impacto económico de los conflictos entre humanos y vida silvestre en la Reserva Biológica Alberto Brenes, Alajuela, Costa Rica. Métodos: Entre octubre de 2017 y abril de 2018, entrevistamos a 59 administradores de propiedades en y cerca de la zona de amortiguamiento de la reserva. Fueron elegidos por informes de conflictos y referencias de "bola de nieve". Resultados: Los animales silvestres mataron 1 846 animales domésticos del 2000 al 2018, con una pérdida económica de $48 000. El coyote, Canis latrans, mató 1 074 animales, con un valor de $4 000; datos equivalentes: felinos 261 animales, $21 000; serpientes 33 animales (terciopelo, Bothrops asper: $18 000). El tratamiento veterinario para 28 animales sobrevivientes costó $3 000. Conclusión: Aunque el coyote mató más animales, los felinos y las serpientes produjeron el mayor costo económico. Una adecuada intervención institucional reduciría el problema.

ABSTRACT ''Economic impact of wildlife predation on domestic animals in the Alberto Brenes Biological Reserve buffer zone, Costa Rica''. Introduction: The size of protected areas is often insufficient for viable predator populations, which causes habitats overlap with humans. The resulting conflicts, for example, predation on domestic animals, negatively affect both wildlife and human well-being. Objective: To estimate the economic impact of human-wildlife conflicts in the Alberto Brenes Biological Reserve, Alajuela, Costa Rica. Methods: Between October 2017 and April 2018, we interviewed 59 property managers in and near the reserve’s buffer zone. They were chosen from conflict reports and ''snowball'' references. Results: Wild animals killed 1 846 domestic animals from 2000 to 2018, with an economic loss of $48 000. The Coyote, Canis latrans, killed 1 074 animals, worth $4 000; equivalent data: felines 261 animals, $21 000; snakes 33 animals (Fer-the-lance, Bothrops asper: $18 000). Veterinary treatment for 28 surviving animals cost $3 000. Conclusion: While the Coyote killed more animals, felines and snakes produced the highest economic cost. Appropriate institutional intervention would reduce the problem.

Influencia de la altitud sobre la estructura, composición florística y carbono de bosques del Chocó

RESUMEN Introducción: A pesar de la amplia biodiversidad que se presenta en el Chocó, es poco lo que se ha documentado sobre la influencia de la altitud en la composición florística, estructura, diversidad, biomasa y carbono arbóreo. Objetivo: Evaluar la influencia de la altitud sobre la composición florística, estructura y carbono almacenado en bosques del gradiente altitudinal Quibdó (QDO)-Carmen de Atrato (CA) en el Chocó biogeográfico. Métodos: Establecimos 18 parcelas (20×20m) distribuidas en un gradiente de 100-1700m de altitud comprendida entre QDO y CA, Chocó. La composición florística fue analizada mediante el método de Ward y se realizó una regresión lineal simple para observar la relación entre la altitud y las variables estructurales y de biomasa. La diversidad fue estimada a través de los índices de Shannon y Simpson. Se calculó la biomasa empleando una ecuación alométrica desarrollada para este tipo de bosque. El carbono fue estimado con una fracción de carbono de 0,5. Resultados: Encontramos un total de 773 individuos, comprendido en 90 especies y 33 familias botánicas. Los sitios de menor altitud presentaron mayor riqueza. Las familias con mayor número de especies arbóreas fueron: Fabaceae, Malvaceae, Lauraceae y Clusiaceae. El análisis de Ward permitió separar los sitios en dos grupos diferentes estadísticamente (p ˂ 0,05), el primero de menor altitud dominado por las especies Iryanthera tricornis Ducke, Brosimum utile (Kunth) Pittier. y Pithecellobium sp. y el segundo de mayor altitud dominado por Aniba puchury-minor (Mart.) Mez. A nivel de densidad se observaron pocas diferencias entre los sitios, mientras que el área basal se reduce conforme aumenta la altitud. Para las variables riqueza de especie, área basal, diversidad y biomasa se obtuvieron relaciones y correlaciones negativas con la altitud, mientras que para la densidad esta fue positiva. En promedio se obtuvo un carbono almacenado en la biomasa aérea de 68,28Mg h-1 para el gradiente altitudinal QDO- CA (100-1700msnm), el cual disminuye conforme aumenta la altitud y difiere estadísticamente entre los sitios muestreados (p ˂ 0,05). Conclusión: La altitud ejerce una fuerte influencia negativa en la composición florística (riqueza de especie y recambio florístico), la estructura (área basal e Índice de Valor de Importancia) biomasa y carbono de los ecosistemas estudiados.

ABSTRACT ''Influence of altitude on the structure, floristic composition and carbon of Choco forests''. Introduction: Despite the wide biodiversity found in the Chocó, little has been documented on the influence of altitude on floristic composition, structure, diversity, biomass and tree carbon. Objective: To evaluate the influence of altitude on the floristic composition, structure and carbon stored in forests of the Quibdó (QDO)-Carmen de Atrato (CA) altitudinal gradient in the biogeographic Choco. Methods: Eighteen plots (20×20m) were established in a gradient of 100-1700m altitude between QDO and CA, Choco. The floristic composition was analyzed using Ward's method and a simple linear regression was performed to observe the relationship between altitude and structural and biomass variables. Diversity was estimated using Shannon's and Simpson's indices. Biomass was calculated using an allometric equation developed for this forest type. Carbon was estimated with a carbon fraction of 0,5. Results: A total of 773 individuals were found, comprising 90 species and 33 botanical families. The sites at lower altitudes presented greater richness. The families with the highest number of tree species were: Fabaceae, Malvaceae, Lauraceae and Clusiaceae. Ward's analysis allowed separating the sites into two statistically different groups (p ˂ 0,05), the first of lower altitude dominated by the species Iryanthera tricornis Ducke, Brosimum utile (Kunth) Pittier. and Pithecellobium sp. and the second of higher altitude dominated by Aniba puchury-minor (Mart.) Mez. At the density level, few differences were observed between sites, while the basal area decreased with increasing altitude. For the variables species richness, basal area, diversity and biomass, negative relationships and correlations were obtained with altitude, while for density this was positive. On average, carbon stored in aboveground biomass was 68.28Mg h-1 for the QDO- CA altitudinal gradient (100-1700masl), which decreases as altitude increases and differs statistically among the sites sampled (p ˂ 0,05). Conclusion: Altitude exerts a strong negative influence on the floristic composition (species richness and floristic turnover), structure (basal area and Importance Value Index), biomass and carbon of the ecosystems studied.

Efecto de un biol sobre las características del suelo y la producción de brotes en pitahaya (Hylocereus sp.)

RESUMEN Introducción: Los bioles son fertilizantes líquidos fermentados. Objetivo: Evaluar el efecto de un biol sobre las características del suelo y la producción de brotes, en el cultivo de pitahaya (Hylocereus sp.). Métodos: Los tratamientos evaluados fueron Fertibiol 45L y Testigo (agua destilada), ambos aplicados al suelo. Se realizó un análisis físico, químico y microbiológico del suelo, antes y hacia el final del ensayo. Se evaluó la producción de brotes nuevos (vegetativos y reproductivos), en forma quincenal. Resultados: En comparación con el Testigo, el Fertibiol provocó un aumento en el contenido de P (+112%), S (+1200%) y Zn (+18%) en el suelo, y una supresión de los hongos Penicillium sp. y Fusarium sp.; además, no provocó cambios en la producción de brotes vegetativos, pero sí causó una disminución (-56%) en la producción de brotes reproductivos en el cultivo de pitahaya. Conclusión: El Fertibiol provocó un mejoramiento en la disponibilidad de P, S y Zn en el suelo, y suprimió a los hongos Penicillium sp. y Fusarium sp.; sin embargo, la producción de brotes reproductivos en el cultivo de pitahaya fue afectada negativamente, mientras que la producción de brotes vegetativos no fue afectada.

ABSTRACT ''Effect of a biol on soil characteristics and sprout production in pitahaya (Hylocereus sp.)''. Introduction: Bioles are fermented liquid fertilizers. Objective: to evaluate the effect of a biol on soil characteristics and sprout production in pitahaya (Hylocereus sp.) cultivation. Methods: The evaluated treatments were Fertibiol 45L and Control (distilled water), both applied to the soil. A physical, chemical and microbiological analysis of the soil was carried out before and towards the end of the trial. The production of new sprouts (vegetative and reproductive) was biweekly evaluated. Results: Compared to the Control, Fertibiol caused an increase in the content of P (+112%), S (+1200%) and Zn (+18%) in the soil, and a suppression of the fungi Penicillium sp. and Fusarium sp. Furthermore, it did not cause changes in the production of vegetative sprouts, but it did cause a decrease (-56%) in the production of reproductive sprouts of pitahaya. Conclusion: Fertibiol caused an improvement in the availability of P, S and Zn in the soil, and suppressed the fungi Penicillium sp. and Fusarium sp.; however, the production of reproductive sprouts was negatively affected in pitahaya cultivation, while the production of vegetative sprouts was not affected.

Optimización de técnicas de PCR para la detección de Salmonella enterica (serotipo Gallinarum) en aves de corral de Costa Rica

RESUMEN Introducción: La tifosis aviar y la pulorosis, enfermedades ocasionadas por Salmonella enterica subsp. enterica (serotipo Gallinarum, biotipos Gallinarum y Pullorum), son responsables de una elevada mortalidad en aves de corral y generan grandes pérdidas económicas. Objetivo: Optimizar técnicas moleculares, como la PCR punto final y la PCR de tiempo real (qPCR), para detectar tifosis aviar y pulorosis. Métodos: Se emplearon cepas bacterianas control, aislamientos y tejidos de aves de infectadas con Salmonella Gallinarum para estandarizar la detección con ambas técnicas. Resultados: Para la PCR de punto final se obtuvo una repetibilidad, especificidad y sensibilidad del 100%, y un valor Kappa de 0,98 para la reproducibilidad; para qPCR una eficiencia del 103% y variación menor al 6% en repetibilidad y reproducibilidad. El límite de detección de ADN genómico fue de 6,4 pg/μL y el del número de células viables de 3x102 UFC/mL para la PCR punto final, y de 10 copias de ADN por reacción para la qPCR. Confirmamos la identidad de S. Gallinarum. Y se redujo el tiempo de detección a unas 48 horas, Conclusión: Logramos optimizar una técnica molecular para detección rápida, confiable y sensible de Salmonella Gallinarum/Pullorum, la cual reduce el tiempo de espera para tomar acción en casos de sospecha clínica y posibles brotes.

ABSTRACT "Optimization of PCR techniques optimization for detection of Salmonella enterica (serotype: Gallinarum) in Costa Rican poultry". Introduction: Avian typhoid and pullorosis, diseases caused by Salmonella enterica subsp. enterica (Gallinarum serotype, Gallinarum and Pullorum biotypes), cause high mortality in poultry and generate large economic losses. Objective: To optimize molecular techniques, such as endpoint PCR and real-time PCR (qPCR), to detect avian typhoid and pullorosis. Methods: We used control bacterial strains, isolates and tissues from birds infected with Salmonella Gallinarum to standardize detection with both techniques. Results: For the endpoint PCR, we obtained 100% repeatability, specificity and sensitivity, and a Kappa value of 0.98 for reproducibility; for qPCR, 103% efficiency with a variation under 6% in repeatability and reproducibility. The detection limit for genomic DNA was 6.4 pg/μL and the limit for the number of viable cells was 3x102 CFU/mL for endpoint PCR, and 10 DNA copies per reaction for qPCR. We also confirmed the identity of S. Gallinarum, and was reduced. We reduced the detection time to about 48 hours. Conclusion: We optimized a molecular technique for rapid, reliable and sensitive detection of Salmonella Gallinarum/Pullorum, which reduces the waiting time to take action in cases of clinical suspicion and possible outbreaks.

Phylogenetic relationships of a rabies virus isolate in Costa Rica

ABSTRACT Introduction: The sylvatic cycle of rabies is a significant sanitary burden in Central America. The Costa Rican government monitors cases since 1985 and infections from bats are still reported for wild animals, livestock, and humans, generating a need of further pathogen characterization in the region. Objective: To compare rabies phylogenetic analyses from complete genomes with nucleoprotein gene studies. Methods: For the phylogenetic analyses we used four rabies tissue samples collected in 2018, and generated complete genomes by Next-Generation sequencing (NGS). We also extracted RNA from tissues of confirmed cases and generated ssDNA using several primers. Double-stranded DNA was generated and used to generate genomic libraries. Results: We describe, for the first-time, the complete genome of four sequences of the rabies virus isolated in Costa Rica in 2018. Complete genome trees resembled the topology of nucleoprotein gene trees. All isolates were related to Desmodus rotundus. One sample group into Lineage (L)2, and the remaining samples group in L1, matched previous reports from regional rabies viruses. Conclusion: Our method produces valid viral assemblies from clinical specimens without target enrichment or viral isolation.

RESUMEN ''Relaciones filogenéticas de un virus de la rabia aislado en Costa Rica''. Introducción: En Centroamérica, el ciclo selvático de la rabia es una carga sanitaria importante. El gobierno de Costa Rica monitorea los casos desde 1985 y aún se reportan infecciones por murciélagos en animales silvestres, ganado y humanos, lo que genera la necesidad de una mayor caracterización de estos patógenos en la región. Objetivo: Comparar análisis filogenéticos de rabia de genomas completos con estudios de genes de nucleoproteínas. Métodos: Para los análisis filogenéticos, utilizamos cuatro muestras de tejido antirrábico recolectadas en 2018 y generamos genomas completos mediante secuenciación de próxima generación (NGS). También extrajimos ARN de tejidos de casos confirmados y generamos ADNss utilizando varios cebadores. Se generó ADN de doble hebra y se utilizó para generar bibliotecas genómicas. Resultados: Describimos, por primera vez, el genoma completo de cuatro secuencias del virus de la rabia aisladas en Costa Rica en 2018. Los árboles del genoma completo se asemejaban a la topología de los árboles de genes de nucleoproteínas. Todos los aislamientos estaban relacionados con Desmodus rotundus. Un grupo de muestra en Lineage (L) 2, y el grupo de muestras restante en L1, coincidió con informes anteriores de virus de rabia regionales. Conclusión: Nuestro método produce ''ensamblajes'' virales válidos a partir de muestras clínicas sin enriquecimiento previo y sin aislamiento viral.

The snowflake soft coral Carijoa riisei (Cnidaria: Octocorallia) in Costa Rica

RESUMEN ''El coral blando copo de nieve Carijoa riisei (Cnidaria: Octocorallia) en Costa Rica'' Introducción: Carijoa riisei (Clavulariidae) se encuentra alrededor del mundo en aguas tropicales. Es considerado como una especie invasora en algunas localidades. Un ejemplar fue colectado entre mareas en la región superior del estuario del Golfo de Nicoya, costa Pacífica de Costa Rica. La colección del Museo de Zoología de la Universidad de Costa Rica (MZUCR) incluye otros especímenes identificados como C. riisei. Objetivo: Identificar el ejemplar y elaborar una lista de registros del MZUCR. Métodos: El coral fue mantenido en agua de mar para permitir la observación de los pólipos abiertos. Las escleritas fueron estudiadas bajo el microscopio electrónico de barrido. Se preparó una lista de los registros del MZUCR. Resultados: Las morfologías de la colonia y de las escleritas son similares a las descritas para C. riisei. El MZUCR incluye 50 registros de C. riisei a lo largo de la costa del Pacífico y en la Isla del Coco. Conclusiones: Pendiente de corroboración genética, identificamos el espécimen como Carijoa riisei con base en su morfología. La mayoría de los registros del MZUCR son de hace una década o más. Una evaluación de la presencia de este coral en las costas del Pacifico y Caribe es necesario para establecer mejor su papel ecológico actual en Costa Rica.

ABSTRACT Introduction: Carijoa riisei (Clavulariidae) is found throughout the world in tropical waters and is considered an invasive species at certain locations. A specimen was collected intertidally in the upper Gulf of Nicoya estuary, Pacific coast of Costa Rica. The collection of the Museum of Zoology of the University of Costa Rica (MZUCR) includes additional specimens identified as C. riisei. Objective: To identify the specimen and list the MZUCR records for the Pacific coast. Methods: The coral was kept in sea water to allow observation of open polyps. The sclerites were studied under a scanning electron microscope. A list of MZUCR records was assembled. Results: The morphologies of the colony and sclerites are similar to those described for C. riisei. The MZUCR includes 50 records of C. riisei along the Pacific coast and at Coco Island. Conclusions: Based on morphology, the specimen is identified as Carijoa riisei, but genetic studies are desirable. Most of the UCRMZ records are from a decade or more ago. An evaluation of the presence of this coral in both the Pacific and Caribbean coasts is needed to better establish its present ecological role in Costa Rica.

El grisón, Galictis vitatta (Carnivora: Mustelidae) en agroecosistemas de café, Costa Rica

RESUMEN Introducción: El grisón, Gallictis vittata, es una especie de menor preocupación según la UICN. Sin embargo, hay poca información correspondiente a los países mesoamericanos, donde es escasamente visto y probablemente esté en peligro. Objetivo: Agregar un nuevo hábitat a la especie. Métodos: Colocamos cuatro cámaras trampa en lugares estratégicos, como fuentes de alimento, madrigueras, agua y ecotono forestal, en Alajuela, Costa Rica. Resultados: Obtuvimos dos registros de G. vittata en la transición entre cafetal y bosque secundario. Conclusión: Estos registros amplían el ámbito conocido de G. vittata y brindan información para su conservación.

ABSTRACT ''The grison, Galictis vitatta (Carnivora: Mustelidae) in coffee agroecosystems, Costa Rica''. Introduction: The grison, Gallictis vittata, is a IUCN species of least concern. However, in Mesoamerican countries it is rare and probably endangered, and studies are scarce. Objective: To report G. vitatta in a new habitat. Methods: We placed four camera traps in strategic places such as food sources, burrows, water bodies forest ecotone in Alajuela, Costa Rica. Results: We obtained two records of G. vittata in the transition between coffee plantation and secondary forest. Conclusion: These records expand the known range of G. vittata and provide information for its conservation.

Comportamiento alimentario comparado del ave Numenius phaeopus (Charadriiformes: Scolopacidae) en Panamá durante sus migraciones al norte y al sur

RESUMEN Introducción: Los manglares y las zonas costeras son de vital importancia para la conservación de muchas aves migratorias a las que brindan alimento y refugio, entre ellas el zarapito trinador, Numenius phaeopus, que se detiene en Panamá en una migración hacia el sur y, unos meses después, en una migración hacia el norte. Objetivo: Evaluar la hipótesis de que el ave utiliza diferentes comportamientos de alimentación en la migración hacia el sur y hacia el norte. Métodos: En 2018, medimos el tiempo que las aves dedicaron a picotear exploratoriamente, pararse, caminar, correr y comer, en abril-junio y octubre-noviembre (3-5 días cada mes, N=56 aves). Resultados: En ambas paradas, las aves dedican el mismo tiempo promedio a esas las actividades, en las que predomina la caminata (50% del tiempo relacionado con la alimentación). Conclusión: Esta especie distribuye su tiempo de alimentación de manera similar en ambas paradas en Panamá.

ABSTRACT ''Compared feeding behavior of the bird Numenius phaeopus (Charadriiformes: Scolopacidae) in its northbound and southbound migrations through Panama''. Introduction: Mangroves and coastal areas are of vital importance for the conservation of many migratory birds for which they provide food and refuge, including the Eurasian whimbrel, Numenius phaeopus, which stops in Panama in a southbound, and, a few months later, in a northbound migration. Objective: To evaluate the hypothesis that the bird uses different feeding behaviors in the southbound and the northbound migration. Methods: In 2018 we measured the time that the birds spent in exploratory pecking, standing, walking, running, and eating, in April-June, and October-November (3-5 days each month, N=56 birds). Results: In both stops, the birds spend the same mean time in all activities, which are dominated by walking (50% of food-related time). Conclusion: This species allocates its feeding time similarly in both stops at Panama.