Revista de Biología Tropical

Size does matter! Incidence of bait size on the capture of dung beetles in the tropical dry forest

Resumen Introducción: Tradicionalmente, los estudios de escarabajos coprófagos en los bosques secos tropicales (BST) del Caribe colombiano han aplicado metodologías diseñadas para zonas húmedas y andinas del país, lo cual podría estar incidiendo en el rendimiento y la eficiencia del muestreo. Objetivo: Con el fin de aportar a esta discusión, se analizó cómo la cantidad de cebo y el tiempo de operación de la trampa de caída inciden en la efectividad de captura de escarabajos coprófagos en un fragmento de BST en La Reserva Campesina la Flecha, San Jacinto, Colombia. Métodos: Para la captura de los escarabajos, se utilizó trampas de caída, cebadas con tres cantidades diferentes de atrayente: pequeño (34.6 g), mediano (53.8 g) y grande (114.9 g), las cuales permanecieron activas en campo durante 48 h. Cuatro muestreos fueron realizados entre marzo y septiembre de 2015, abarcando por igual la época seca y de lluvia. Resultados: Se registró un total de 4 563 individuos, agrupados en 10 géneros y 27 especies de escarabajos coprófagos. Los mayores valores de riqueza, abundancia y biomasa se presentaron en el cebo grande, a las 48 h, durante la época de lluvias. Sin embargo, el tiempo de operación de la trampa no tuvo efecto en la estimación de la riqueza, abundancia y biomasa de escarabajos independientemente de los tamaños de cebo. Los tres órdenes de la diversidad ( 0 D, 1 D y 2 D), presentaron valores similares entre las cantidades de cebo durante la época de lluvia, pero en la época seca, los cebos de mayor tamaño presentaron los valores de diversidad más altos. Por su parte con el cebo de mayor tamaño se capturó significativamente más riqueza, abundancia y biomasa de escarabajos de cuerpo pequeño y grande siendo esta situación más notaria durante la época seca. Conclusiones: Los resultados de este trabajo evidencian que para el estudio de los ensamblajes de escarabajos en el BST la utilización de un cebo de mayor tamaño contribuye a una mejor estimación de riqueza, abundancia, diversidad y biomasa, sobre todo durante la época seca, cuando las condiciones ambientales propician que los cebos pierdan su atractividad con mayor rapidez.

Abstract Introduction: Typically, research on dung beetles in the Tropical Dry Forests (TDF) of Colombian Caribbean region, have applied methodologies designed for wet or Andean areas of the country, which could be influencing the performance and efficiency of sampling. Objective: In order to contribute to this discussion, we analyzed how the bait amount and pitfall trap operating time influence the collection effectiveness of dung beetles in a TDF fragment at Reserva Campesina La Flecha, San Jacinto, Colombia. Methods: For the collection of beetles, we utilized pitfall traps baited with three different amounts of attractants: small (34.6 g), medium (53.8 g), and large (114.9 g), which remained active in the field for 48 h., 4 samplings between March and September 2015 were carried out, covering both, dry and rainy seasons. Results: A total of 4 563 individuals were recorded, grouped into 10 genera and 27 species of dung beetles. The highest values of richness, abundance and biomass were registered in the large bait, at 48 h, during the rainy season. However, the trap operating time had no effect on the estimation of beetles’ richness, abundance, and biomass, regardless of bait sizes. The three diversity orders ( 0 D, 1 D y 2 D) showed similar values between the bait amounts during rainy season, but in the dry season, the largest baits displayed the highest diversity values. On the other hand, with the largest bait, significantly more richness, abundance, and biomass of small and large body beetles were registered, especially during the dry season. Conclusions: The results of this research show that, for the study of beetles’ assemblages in the BST, the use of a larger bait contributes to a better estimate of richness, abundance, diversity and biomass, especially during the dry season, when environmental conditions promote a more rapidly loss of baits attractiveness.

Bioactivity and identification of fatty acids of the marine sponge Tetilla rodriguesi (Tetractinellida: Tetillidae) in the Colombian Caribbean

Resumen Introducción: Durante millones de años, los organismos marinos han venido desarrollando estrategias para adaptarse a los cambios ambientales y con esto, sintetizando una gran variedad de metabolitos secundarios con actividades biológicas. Objetivo: Evaluar las actividades antimicrobiana y antioxidante e identificar los ácidos grasos del extracto metanólico de la esponja marina Tetilla rodriguesi recolectada en la bahía de Cispatá. Métodos: Los especímenes de T. rodriguesi se sometieron a extracción para obtener el extracto metanólico, del cual se obtuvieron los ácidos grasos que fueron esterificados e identificados haciendo uso de técnicas cromatográficas. Con el extracto metanólico se realizó la actividad antioxidante frente a los radicales ABTS+• y DPPH• y la actividad antimicrobiana por el método de microdilución frente a cepas de referencia de Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Enterococcus faecalis y Candida albicans; además de aislados clínicos de Candida albicans (obtenida en sangre) y Candida krusei (obtenida en catéter). Resultados: Los resultados arrojaron la identificación de 19 ácidos grasos de diferente naturaleza. En el análisis de la actividad antioxidante se pudo encontrar, que la inhibición de los radicales evaluados fue moderada (296.98 ppm para ABTS+• y 3 523.62 ppm para DPPH•). La evaluación de la actividad antimicrobiana mostró, que el extracto metanólico de T. rodriguesi logró reducir en gran medida el crecimiento de todos los microorganismos evaluados. Conclusión: A pesar de que los poríferos tienden a poseer ácidos grasos de gran tamaño, en este trabajó no se encontró la presencia de ácidos grasos de cadena carbonada mayor a 20 miembros. Los resultados de la actividad antioxidante, se asemejan en gran medida al encontrado en otras especies del mismo phylum. En esta investigación, se pudo establecer que el extracto metanólico de T. rodriguesi logró disminuir en gran medida el crecimiento de todas las cepas bacterianas y fúngicas utilizadas.

Abstract Introduction: For millions of years, organisms that inhabit the marine environment have been developing strategies to adapt to environmental changes and with this, synthesizing a great variety of secondary metabolites with biological activities. Objective: Evaluate the antimicrobial and antioxidant activities and identify the fatty acids of the methanolic extract of the marine sponge Tetilla rodriguesi collected in Cispatá bay, Colombian Caribbean. Methods: T. rodriguesi specimens were subjected to extraction to obtain the methanolic extract, of which the fatty acids were obtained, esterified and identified it using chromatographic techniques. With the methanolic extract, the antioxidant activity was carried out against the radicals ABTS+• and DPPH•, and the antimicrobial activity by the microdilution method against reference strains of Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Enterococcus faecalis and Candida albicans; in addition to clinical isolates of Candida albicans (obtained in blood) and Candida krusei (obtained in catheter). Result: The results yielded the identification of 19 fatty acids of different nature. In the analysis of the antioxidant activity could be found that inhibition of radical evaluated was moderate (296.98 ppm for ABTS+• and 3 523.62 ppm for DPPH•). The evaluation of antimicrobial activity showed that the methanol extract of T. rodriguesi managed to greatly reduce the growth of all microorganisms tested. Conclusions: Despite the fact that porifers tend to have large fatty acids, in this study the presence of fatty acids with a carbon chain greater than 20 members was not found. The result of antioxidant activity is largely resembled that found in other species of the same phylum. In this research, it was established that the methanolic extract of T. rodriguesi managed to greatly reduce the growth of all the bacterial and fungal strains used.

Bibliometrics of Sudanese scientific publications: Subjects, institutions, collaboration, citation and recommendations

Abstract Introduction: Sudan is the third largest country in Africa and has rich reserves of petroleum and other ground resources, but its per capita Gross Domestic Product is only $808 and researchers work in insufficient institutional facilities and with little funding. Previous studies about its scientific productivity have been limited to specific subjects and relatively short periods, with no large analyses until now. Objective: To analyze the scientific output of Sudan in depth, considering all research areas and several decades of scientific activity. Methods: We retrieved the documents with “Sudan” in field country in the Science Citation Index Expanded for the period 1900-2019. Results: We retrieved over 9 000 publications and found that most were articles; that citation was higher for review articles and book chapters, and that this index mostly covered articles in English. Beginning in 1972, the number of publications in this database has increased rapidly. The citation lifespan indicates slow growth in the Sudanese scientific literature, and collaboration is frequent both nationally and internationally, possibly because the scarce resources make collaboration almost compulsory. Most external collaboration is done with Saudi Arabia but citation is higher for articles resulting from international megaprojects, led by Europe and the USA, in which Sudanese researchers play secondary roles. Research focusses on applied technological subjects with little innovation value. Women play a smaller role in Sudanese science. Conclusions: Our recommendations for Sudanese science include increasing the number of women in leading research positions; providing funding directly to researchers (i.e., bypassing bureaucratic bodies); increasing basic research to avoid stagnation; training Sudanese researchers for leading positions; and identifying specific research areas where Sudan can lead in its region.

Resumen Introducción: Sudán es el tercer país más grande de África y tiene ricas reservas de petróleo y otros recursos terrestres, pero su Producto Interno Bruto per cápita es de solo $ 808 y los investigadores trabajan en instalaciones institucionales deficientes y con poca financiación. Los estudios previos sobre su productividad científica se han limitado a temas específicos y períodos relativamente cortos. Objetivo: Analizar la producción científica de Sudán en profundidad, considerando todas las áreas de investigación y varias décadas. Métodos: Recuperamos los documentos con “Sudán” como país de origen en el Science Citation Index Expanded para el período 1900-2019. Resultados: Hallamos más de 9 000 publicaciones y encontramos que la mayoría eran artículos; que fueron más citados los artículos de revisión y capítulos de libros, y que esta base de datos cubría principalmente artículos en inglés; desde 1972, el número de publicaciones en ella ha aumentado rápidamente. La vida útil de las citas indica un crecimiento lento en la literatura científica sudanesa, y la colaboración es frecuente tanto a nivel nacional como internacional, posiblemente porque los escasos recursos hacen que la colaboración sea casi obligatoria. La mayor parte de la colaboración externa se realiza con Arabia Saudita, pero hay más citas para los artículos resultantes de megaproyectos internacionales, dirigidos por Europa y Estados Unidos, en los cuales los investigadores sudaneses desempeñan papeles secundarios. La investigación se centra en temas de tecnología aplicada con poco valor de innovación. Conclusiones: Nuestras recomendaciones para la ciencia sudanesa incluyen aumentar el número de mujeres en altos puestos; proporcionar financiación directamente a los investigadores (sin pasar por organismos burocráticos); ir más allá de la investigación aplicada para evitar el estancamiento; capacitar al personal sudanés para puestos de liderazgo; e identificar áreas de investigación específicas donde Sudán puede liderar en su región.

Half a century of Sri Lanka research: Subjects, researchers, institutions, journals and impact (1973-2019)

Abstract Introduction: Bibliometric analyses of research in Sri Lanka, a lower-middle income island nation in South Asia, has focused mainly on medical research, concluding that there is a need for increased research productivity and impact, and for local solutions to health concerns. There has been no general bibliometric analysis across scientific disciplines in the nation, or any study that covers a long period of time to identify general time trends. Objective: To measure and analyse Sri Lanka research by focusing on subjects, authors, institutions, journals and citation for half a century. Methods: We used an advanced search method to extract publications with the word “Sri Lanka” in the SCI-EXPANDED, and calculated indicators such as total citations from Web of Science Core Collection since publication year to the end of 2019, citations in 2019, and mean citations per publication. Journal data were taken from 2019 Journal Citation Report. Affiliation re-classification was done to ensure consistency regarding the origin of all publications. Publications were further analysed based on collaboration, and first and corresponding authorship. Results: We retrieved 16 069 publications in 19 document types (77 % articles). Corrections had the highest number of authors per publication (616) followed by articles (116). Four articles had more than 5 000 authors and 593 articles had more than 1 000 authors. The highest citations in this database were for international megaprojects where Sri Lanka authors played minor roles. The UK had the most collaborative articles with Sri Lanka (19 %). The articles were published in 3 051 journals across 177 Web of Science categories. The category of Public, environmental and occupational health, with 193 journals, had 6.7 % of all articles, followed by environmental sciences (6.6 %). Conclusion: Sri Lanka has an unusually strong pattern of participating as small role players in international megaprojects about health and physics. Sri Lanka authors should be encouraged to expand their horizons by researching non-applied fields that are the basis of all innovation; to strengthen their own journals so that they have better visibility and impact, and to improve their positions in international projects that are published in larger journals.

Resumen Introducción: Los análisis bibliométricos de la investigación en Sri Lanka, una nación insular de ingresos mediano-bajos en el sur de Asia, se han centrado principalmente en la investigación médica, concluyendo que existe la necesidad de aumentar la productividad y el impacto de la investigación, y de soluciones locales a los problemas de salud. No ha habido un análisis bibliométrico general de disciplinas científicas o algún estudio que cubra un período largo de tiempo para identificar tendencias generales. Objetivo: Medir y analizar la investigación de Sri Lanka centrándose en temas, autores, instituciones, revistas y citas, durante medio siglo. Métodos: Utilizamos un método de búsqueda avanzada para extraer publicaciones con las palabras “Sri Lanka” en el SCI-EXPANDED, y calculamos indicadores como el total de citas de Web of Science Core Collection desde el año de publicación hasta finales de 2019, citas solo en 2019, y media de citas por publicación. Los datos de revistas son del Journal Citation Report 2019. Revisamos manualmente las afiliaciones para garantizar su coherencia, y, de todos los tipos de publicación, analizamos en detalle los artículos en función de la colaboración y la autoría. Resultados: Hallamos 16 069 publicaciones en 19 tipos de documentos (77 % artículos). Las correcciones tuvieron el mayor número de autores por publicación (616), seguidas de los artículos (116 autores en promedio); cuatro artículos tenían más de 5 000 autores y 593 artículos tenían más de 1 000 autores. Las citas más altas en esta base de datos fueron para megaproyectos internacionales en los que los autores de Sri Lanka desempeñaron papeles menores. El Reino Unido tuvo más artículos colaborativos con Sri Lanka (19 %). Los artículos se publicaron en 3 051 revistas de 177 categorías del Web of Science. La categoría d Salud pública, ambiental y ocupacional, con 193 revistas, tuvo el 6.7 % del total de artículos, seguida de Ciencias ambientales (6.6 %). Conclusión: En Sri Lanka hay una tendencia inusual a participar como pequeños actores en megaproyectos internacionales sobre salud y física. Debería alentarse a quienes hacen ciencia en Sri Lanka a ampliar sus horizontes investigando campos no aplicados, que son la base de la innovación; a fortalecer sus propias revistas para lograr mayor visibilidad e impacto, y a mejorar su ubicación en proyectos internacionales que se publican en revistas más grandes.

Effect of vegetation cover on dung beetles (Coleoptera: Scarabaeinae) and their ecological functions in an Andean forest of Colombia

Resumen Introducción: Los escarabajos coprófagos cumplen funciones importantes en los ecosistemas terrestres, pero las presiones antrópicas los afectan negativamente. Estos efectos están bien documentados en los bosques neotropicales de tierras bajas, pero se han estudiado poco en los bosques andinos. Objetivo: Evaluar cómo los atributos de los ensambles de escarabajos coprófagos y tres de sus funciones ecológicas difieren en tres tipos de cobertura vegetal, y determinar las relaciones entre atributos y funciones, y entre funciones. Métodos: Los escarabajos coprófagos se capturaron con trampas pitfall y se midieron las funciones ecológicas a través de un experimento de campo en la hacienda “El Ocaso” (Colombia), en tres tipos de cobertura vegetal: bosque secundario, bosque mixto y pastos para ganado (tres sitios independientes por cobertura). Los atributos del ensamble que se evaluaron fueron: abundancia, número de especies, biomasa y longitud corporal media ponderada; las funciones medidas fueron: remoción de estiércol, excavación del suelo y dispersión secundaria de semillas. Resultados: Se encontró que tanto los atributos del ensamble como las funciones ecológicas se vieron afectados negativamente en las coberturas vegetales más alteradas, particularmente en los pastos ganaderos. La mayoría de los atributos de ensamblaje se correlacionaron positivamente con las funciones; la excavación del suelo y la dispersión secundaria de semillas tuvieron una fuerte correlación positiva con la remoción de estiércol. Conclusiones: Los ensambles de escarabajos coprófagos juegan importantes funciones ecológicas y son sensibles a las alteraciones del ecosistema. Este estudio muestra cómo los escarabajos coprófagos y sus funciones se ven afectados negativamente cuando el bosque se transforma en pastizales para ganado en los ecosistemas forestales andinos poco estudiados y altamente fragmentados.

Abstract Introduction: Dung beetles perform important functions in terrestrial ecosystems, but anthropic pressures affect them negatively. These effects are well documented in neotropical lowland forests but have been studied little in Andean forests. Objective: To evaluate how the attributes of the dung beetle assemblages and three of their ecological functions differ in three types of vegetation cover, and to determine the relationships between attributes and functions, and among functions. Methods: Dung beetles were captured with pitfall traps, and ecological functions were measured through a field experiment in the farm “El Ocaso” (Colombia), in three types of vegetation cover: secondary forest, mixed forest and cattle pasture (three independent sites per cover). The assemblage attributes that were evaluated were abundance, number of species, biomass, and weighted mean body length; functions measured were dung removal, soil excavation, and secondary seed dispersal. Results: It was found that both the assemblage attributes and the ecological functions were negatively affected in the more disturbed vegetation covers, particularly in cattle pastures. Most of the assemblage attributes correlated positively with functions; soil excavation and secondary seed dispersal had a strong positive correlation with dung removal. Conclusions: Dung beetle assemblages play important ecological functions and they are sensitive to ecosystem disturbances. This study shows how dung beetles and their functions are affected negatively when forest is transformed to cattle pasture in the understudied and highly fragmented Andean forest ecosystems.

Population genetics and molecular identification of Crocodylus acutus and C. moreletii (Crocodilia: Crocodylidae) in captive and wildlife populations

Abstract Introduction: There is low evidence of genetic diversity and hybridization processes within Crocodylus acutus and C. moreletii populations. Objetive: To evaluate genetic diversity and some phylogenetic relationships in wild and captive populations of C. acutus and C. moreletii using the Barcode of Life Data System (COX1, cytochrome C oxidase subunit 1 gene). Methods: 28 individuals phenotypically like C. acutus located in the state of Guerrero, Oaxaca and Quintana Roo were sampled, as well as animals belonging to C. moreletii located in the states of Tabasco, Campeche, and Quintana Roo. 641 base pairs of nucleotide sequence from COX1 were used to obtain the haplotype and nucleotide diversity per population, and a phylogenetic and network analysis was performed. Results: Evidence of hybridization was found by observing C. moreletti haplotypes in animals phenotypically determined as C. acutus, as well as C. acutus haplotypes in animals classified as C. moreletti. Low haplotypic diversity was observed for C. acutus (0.455 ± 0.123) and for C. moreletii (0.505 ± 0.158). A phylogenetic tree was obtained in which the sequences of C. acutus and C. moreletii were grouped into two well-defined clades. Organisms identified phenotypically as C. acutus but with C. moreletii genes were separated into a different clade within the clade of C. moreletii. Conclusions: There are reproductive individuals with haplotypes different from those of the species. This study provides a small but significant advance in the genetic knowledge of both crocodile species and the use of mitochondrial markers, which in this case, the COX1 gene allowed the detection of hybrid organisms in wild and captive populations. Conservation efforts for both species of crocodiles should prevent the crossing of both threatened species and should require the genetic identification of pure populations, to design effective conservation strategies considering the possibility of natural hybridization in areas of sympatry.

Resumen Introducción: Existe poca evidencia de la diversidad genética y los procesos de hibridación dentro de las poblaciones de Crocodylus acutus y C. moreletii. Objetivo: Evaluar la diversidad genética y algunas relaciones filogenéticas en poblaciones silvestres y cautivas de C. acutus y C. moreletii utilizando el Sistema de Código de Barras de la vida (COX1, subunidad I del gen del citocromo C oxidasa). Métodos: Se muestrearon 28 individuos fenotípicamente similares a C. acutus ubicados en los estados de Guerrero, Oaxaca y Quintana Roo, así como animales pertenecientes a C. moreletii ubicados en los estados de Tabasco, Campeche y Quintana Roo. Se utilizaron 641 pares de bases de la secuencia de nucleótidos de la subunidad I del gen del citocromo C oxidasa para obtener el haplotipo y la diversidad de nucleótidos por población, y se realizó un análisis filogenético y de redes. Resultados: Se encontró evidencia de hibridación al observar haplotipos de C. moreletti en animales determinados fenotípicamente como C. acutus, así como haplotipos de C. acutus en animales clasificados como C. moreletti. Se observó una baja diversidad haplotípica para C. acutus (0.455 ± 0.123) y para C. moreletii (0.505 ± 0.158). Se obtuvo un árbol filogenético en el que las secuencias propias de C. acutus y C. moreletii se agruparon en dos grandes y bien definidos clados. Los organismos identificados fenotípicamente como C. acutus pero con genes de C. moreletii se separaron en un clado diferente dentro del clado de C. moreletii. Conclusiones: Existen individuos reproductores con haplotipos diferentes a los de la especie. Este estudio aporta un pequeño pero significativo avance en el conocimiento genético tanto de las especies de cocodrilos como del uso de marcadores mitocondriales, que, en este caso, el gen COX1 permitió la detección de organismos híbridos en poblaciones silvestres y cautivas. Los esfuerzos de conservación para ambas especies de cocodrilos deben evitar el cruce de ambas especies amenazadas y deben requerir la identificación genética de poblaciones puras, para diseñar estrategias de conservación efectivas considerando la posibilidad de hibridación natural en áreas de simpatría.

Altitudinal distribution of the functional feeding groups of aquatic macroinvertebrates using an ecological network in Andean streams

Abstract Introduction: Analysis of functional feeding groups (FFG) in aquatic macroinvertebrates is important in understanding the structure, function, and dynamics of ecological processes in ecosystems. Modularity refers to the degree of compartmentalization of food webs and varies between -1 and 1. A network with a modularity value close to 1 is resilient to disturbances and can be interpreted as an indicating factor for the stability of communities. Objective: In this study, we analyzed the trophic structure of benthic macroinvertebrates in La Nitrera stream, the San Juan River, and the Cauca River in the Colombian Andes. Methods: The study was supported by ecological networking techniques using Gephi software. We studied nine sites in dry, rainy, and transition seasons in 2017 and 2018, monitoring changes in the altitude gradient. At each of the sites, the organisms were captured and determined, and physicochemical and hydraulic information was obtained. Results: The variance component analysis allowed to explain the variability of the data by relating the following environmental variables: FFG, diversity, richness, modularity, season, and time. Simple multifactorial ANOVA indicated that significant changes in FFG were associated with altitude, and modularity to time. The allocation of the FFG was done by stomach analysis and secondary information. Conclusion: The transition season had the highest modularity, possibly due to the recolonization of some biotopes caused by the decrease in the velocity of water currents. La Nitrera and San Juan presented higher values than the Cauca, which may indicate that the altitudinal change and velocity of water currents affects the compartmentalization of the network.

Resumen Introducción: El análisis de grupos funcionales de alimentación (GFA) en macroinvertebrados acuáticos es importante para comprender la estructura, función y dinámica de los ecosistemas de procesos ecológicos. La modularidad se refiere al grado de compartimentación de las redes alimentarias y varía entre -1 y 1. Una red con un valor de modularidad cercano a 1 es resistente a las alteraciones y puede interpretarse como un factor indicativo para la estabilidad de las comunidades. Objetivo: En este estudio se analizó la estructura trófica de los macroinvertebrados bentónicos, un elemento importante en la calidad ambiental, en el arroyo La Nitrera, el río San Juan y el río Cauca. Métodos: El estudio contó con el apoyo de técnicas de redes ecológicas utilizando el software Gephi. En 2017 y 2018, estudiamos nueve sitios en estaciones secas, lluviosas y de transición, monitoreando cambios en el gradiente de altitud. En cada uno de los sitios se capturaron y determinaron los organismos y se recogió información fisicoquímica e hidráulica. Resultados: El análisis de componentes de varianza permitió explicar la variabilidad de los datos relacionando las siguientes variables ambientales: GFA, diversidad, riqueza, modularidad, estación y tiempo. La ANOVA simple multifactorial indicó que existen cambios significativos en los GFA en relación con la altitud, y la modularidad con el tiempo. La asignación de los GFA se realizó mediante análisis estomacal e información secundaria. Conclusión: La temporada de transición tuvo la mayor modularidad, posiblemente debido a la recolonización de algunos biotopos provocada por la disminución de la velocidad del cauce. La Nitrera y San Juan presentaron valores superiores a los del Cauca, lo que puede indicar que el cambio altitudinal y la velocidad de las corrientes de agua influyen en la compartimentación de la red.

Risk areas for marine mammals in Colombia

Resumen Introducción: Los mamíferos marinos se ven afectados por diversas amenazas que deben identificarse para los esfuerzos de mitigación. Objetivo: Cuantificar visualmente las amenazas a los mamíferos marinos en Colombia e identificar acciones de mitigación. Métodos: Georreferenciamos las amenazas con base en la literatura, cubriendo 35 especies en el período 1991-2020, y las superpusimos en mapas de distribución de especies. Resultados: 22 especies presentaron al menos una amenaza. La captura incidental y las interacciones con los artes de pesca afectaron a 16 especies, seguidas de la captura directa (8 especies), el tráfico/tránsito de embarcaciones (6 especies) y la alteración de la física oceánica (6 especies). Las especies más afectadas, en cuanto a mayor diversidad de amenazas, son: ballena jorobada (Megaptera novaeangliae), manatí antillano del Caribe (Trichechus manatus), el tucuxi marino (Sotalia guianensis) y el delfín nariz de botella (Tursiops truncatus). Casi todo el territorio marino de Colombia presenta algún grado de riesgo para los mamíferos marinos. Las áreas de alto riesgo son Buenaventura, Guapi, Golfo de Cupica y Tumaco en el Pacífico; y Golfo de Urabá, Golfo de Darién, Golfo de Morrosquillo, frente a Barranquilla, Ciénaga Grande de Santa Marta y Golfo de Coquivacoa en el Caribe. Conclusión: Los mamíferos marinos en Colombia se encuentran actualmente en riesgo debido a varias amenazas, especialmente relacionadas con actividades de pesca, caza/captura y transporte marítimo, principalmente en las zonas costeras. Se necesitan acciones urgentes de evaluación y gestión en las diez áreas de alto riesgo identificadas en este estudio.

Abstract Introduction: Marine mammals are affected by diverse threats that must be identified for mitigation efforts. Objective: To visually quantify threats to marine mammals in Colombia, and to identify mitigation actions. Methods: We georeferenced threats based on the literature, covering 35 species in the period 1991-2020, and superimposed them on species range maps. Results: 22 species had at least one threat. Bycatch and interactions with fishing gear affected 16 species, followed by direct capture (8 species), vessel traffic/transit (6 species) and alteration of ocean physics (6 species). The most affected species, in terms of the greatest diversity of threats, are: humpback whale (Megaptera novaeangliae), Caribbean West Indian manatee (Trichechus manatus), marine tucuxi (Sotalia guianensis) and bottlenose dolphin (Tursiops truncatus). Nearly all of Colombia’s marine territory presents some degree of risk for marine mammals. High-risk areas are Buenaventura, Guapi, Cupica Gulf and Tumaco in the Pacific; and Urabá Gulf, Darién Gulf, Morrosquillo Gulf, off Barranquilla, Ciénaga Grande de Santa Marta and Coquivacoa Gulf in the Caribbean. Conclusion: Marine mammals in Colombia are currently at risk due to several threats, especially related to fishing, hunting/capture and shipping activities, mainly in coastal areas. Urgent evaluation and management actions are needed in the ten high-risk areas identified in this study.

Diversity of birds along an elevation gradient in the Sierra de Manantlán Biosphere Reserve, Mexico

Resumen Introducción: México concentra alrededor del 11 % de las especies de aves del mundo, de las cuales el 20 % son endémicas del país, concentrándose el mayor número en la región occidental. Objetivo: Analizar la composición, diversidad y distribución de la avifauna a lo largo de un gradiente altitudinal en el occidente de México. Métodos: La investigación se realizó en la Reserva de la Biosfera Sierra de Manantlán. Registramos especies de aves vistas o escuchadas en 28 puntos de conteo fijos a lo largo de un gradiente de elevación de 1 000 m. La comparación de la riqueza y la completitud del muestreo se determinaron con curvas de interpolación y extrapolación. Las franjas se compararon con un Procedimiento no Paramétrico de Permutación Multirespuesta. Se usaron correlaciones y ordenaciones indirectas para analizar cambios en la riqueza y abundancia. Resultados: Registramos 129 especies (estimado: 96 % de completitud): 19 endémicas de México, 13 en alguna categoría de riesgo y 21 consideradas indicadoras. La elevación determinó la distribución y abundancia de las especies, y las franjas altitudinales más bajas, tuvieron los valores más altos de riqueza y abundancia. Conclusión: La mayor riqueza y abundancia de especies se registró a menor altitud, con un cambio significativo en la composición y tipo de especies indicadoras por franja.

Abstract Introduction: Mexico concentrates around 11 % of the world’s bird species, of which 20 % are endemic to the country, with the highest number concentrated in the Western region. Objective: To analyze composition, diversity and avifaunal distribution along an elevation gradient in Western Mexico. Methods: The research was done in the Sierra de Manantlán Biosphere Reserve. We recorded seen or heard bird species in 28 fixed count points along a 1 000 m elevation gradient. Comparative richness and sampling completeness were determined with interpolation and extrapolation curves. Belts were compared with Non-Parametric Multi-Response Permutation. Correlations and indirect ordinations were used to analyze changes in richness and abundance. Results: We recorded 129 species (estimate: 96 % completeness): 19 endemics to Mexico, 13 in some risk category, and 21 considered indicators. Elevation determined the distribution and abundance of species, and the lower elevational bands, had the highest richness and abundance values. Conclusion: The highest species richness and abundance were recorded at lower elevations, with a significant change in composition and type of indicator species by belt. The numbers of endemic and at-risk species remained constant with elevation.

Seasonal droughts during the Miocene drove the evolution of Capparaceae towards Neotropical seasonally dry forests

Abstract Introduction: Neotropical seasonally dry forest (NSDF) climatic constraints increased endemism, and phylogenetic niche conservatism in species that are restricted to this biome. NSDF have a large number of endemic Capparaceae taxa, but it is unknown if phylogenetic niche conservatism has played a role in this pattern. Objective: We carried out an evolutionary analysis of the climatic niche of neotropical species of Capparaceae to identify whether the climatic constraints of NSDF have played a major role throughout the family’s evolutionary history. Methods: Using three chloroplastic (ndhF, matK, rbcL) and one ribosomal (rsp3) DNA sequences, we proposed a date phylogeny to reconstruct the evolutionary climatic niche dynamics of 24 Neotropical species of Capparaceae. We tested the relationship between niche dissimilarity and phylogenetic distance between species using the Mantel test. Likewise, we used a set of phylogenetic comparative methods (PGLS) on the phylogeny of Capparaceae to reconstruct the main evolutionary historic events in their niche. Results: Capparaceae originated in humid regions and subsequently, convergent evolution occurred towards humid and dry forest during the aridification phases of the Middle Miocene (16-11 Mya). However, adaptation towards drought stress was reflected only during the precipitation of the coldest quarter, where we found phylogenetic signal (Pagel λ) for gradual evolution and, therefore, evidence of phylogenetic niche conservatism. We found convergent species-specific adaptations to both drought stress and rainfall during the Miocene, suggesting a non-phylogenetic structure in most climatic variables. Conclusions: Our study shows how the Miocene climate may have influenced the Capparaceae speciation toward driest environments. Further, highlights the complexity of climatic niche dynamics in this family, and therefore more detailed analyses are necessary in order to better understand the NSDF climatic constrictions affected the evolution of Capparaceae.

Resumen Introducción: Las limitaciones climáticas del bosque neotropical estacionalmente seco (NSDF) produjeron endemismo y conservadurismo filogenético del nicho en especies restringidas a este bosque. En las Caparáceas neotropicales se ha encontrado endemismo en los NSDF, pero se desconoce si el conservadurismo de nicho filogenético ha influido en su evolución. Objetivos: Se llevó a cabo un análisis evolutivo del nicho climático de las especies neotropicales de Capparaceae para evaluar si las limitaciones climáticas del bosque neotropical estacionalmente seco (NSDF) han jugado un papel importante a lo largo de la historia evolutiva de la familia. Métodos: Usando tres secuencias de ADN cloroplastico (ndhF, matK, rbcL) y una ribosomal (rsp3) se propuso una filogenia datada para reconstruir la dinámica evolutiva del nicho climático de 24 especies Neotropicales de Capparaceae. Utilizando la prueba de Mantel, se realizaron análisis para establecer si hay diferencia de nicho y la distancia filogenética entre especies. Asimismo, se emplearon un conjunto de métodos comparativos filogenéticos sobre la filogenia de la familia para reconstruir los principales eventos históricos evolutivos en su nicho. Resultados: Capparaceae se originó en regiones húmedas y posteriormente se dio una evolución convergente hacia bosque húmedo y seco durante las fases de aridificación del Mioceno Medio (16-11 Ma). Sin embargo, la adaptación al estrés por sequía se reflejó solo en la precipitación del cuarto más frío del año, donde se evidencio señal filogenética, evolución gradual y, por lo tanto, evidencia de conservadurismo de nicho filogenético. También se hallaron especies con adaptaciones convergentes específicas tanto al estrés por sequía como a las lluvias durante el Mioceno, sugiriendo la carencia de estructura filogenética en la mayoría de las variables climáticas. Conclusiones: Este estudio muestra cómo el clima del Mioceno pudo haber influenciado la especiación de Capparaceae hacia ambientes mas secos. Además, la compleja dinámica del nicho climático en esta familia y, por lo tanto, la necesidad de realizar análisis más detallados para comprender mejor como las constricciones climáticas del NSDF afectaron la evolución de Capparaceae.

Wasting disease in Thalassia testudinum (Hydrocharitaceae) meadows and its relationship with metabolic profile

Resumen Introducción: Los protistas del género Labyrinthula causan la denominada “Enfermedad del desgaste” en el pasto marino, Thalassia testudinum. Desde el 2008 los monitoreos en el Caribe colombiano han mostrado variación espacial y temporal en la incidencia de la enfermedad, pero sin la alta mortalidad observada en otras regiones del mundo. Objetivo: Analizar algunos parámetros epidemiológicos en T. testudinum y comparar metabolitos entre plantas sanas e infectadas. Métodos: Registramos la severidad, incidencia y prevalencia de esta enfermedad en el Parque Nacional Natural Tayrona e Isla de Providencia, y analizamos muestras de agua y sedimentos. Además, aplicamos cromatografía líquida y de gases, junto con espectrometría de masas, a extractos metanólicos de muestras de hojas y rizomas de brotes sanos e infectados. Resultados: Las praderas se encontraban en buen estado, a pesar de la escasez de brotes de fanerógamas marinas en Tayrona y una alta incidencia (15 %) y severidad (355 %) de la enfermedad en Providencia. Las plantas infectadas tenían niveles más bajos de fenoles, flavonoides y azúcares. Las flavonas sulfatadas con aglicona luteolina y diosmetina, los esteroles (sitosterol y estigmasterol) y las oxilipinas volátiles se acumularon en las hojas (3-hidroxi-2-isopentanona) y los ácidos isopentanoico y octadecatrienoico en los rizomas. Conclusiones: Estos pastos marinos colombianos tienen producción diferencial de metabolitos. Probablemente como una defensa exitosa, aún a niveles bajos de severidad (0.1 %) e incidencia (1 %) de la enfermedad.

Abstract Introduction: Protists of the genus Labyrinthula cause the so-called “Wasting Disease” in seagrass, Thalassia testudinum. Monitoring in the Colombian Caribbean since 2008 has shown spatial and temporal variation in the disease’s incidence, but without the high mortality observed in other regions of the world. Objective: To analyze some epidemiological parameters in T. testudinum and to compare metabolites between healthy and infected plants. Methods: We recorded severity, incidence and prevalence of this disease in Tayrona National Natural Park and Providencia Island, and we analyze water and sediment samples. Additionally, we applied gas and liquid chromatography, coupled with mass spectrometry, to methanolic extracts from leaf and rhizome samples of healthy and infected shoots. Results: The meadows were in good condition, despite the scarce seagrass shoots in Tayrona and a high incidence (15 %) and severity (35.5 %) of the disease in Providencia. Infected plants had lower levels of phenols, flavonoids and sugars. Sulphated flavones with aglycone luteolin and diosmetin, sterols (sitosterol and stigmasterol) and volatile oxylipins are accumulated in leaves (3-hydroxy-2-isopentanone) and isopentaenoic and octadecatrienoic acids in rhizomes. Conclusions: These Colombian seagrasses have differential production of metabolites. Probably as a successful defense, even at low levels of severity (0.1 %) and incidence (1 %) of the disease.

Reverse-Transcription Loop-Mediated Isothermal Amplification and alternative protocols for lower cost, large-scale COVID-19 testing: lessons from an emerging economy

Abstract Introduction: Most successful cases of COVID-19 pandemic mitigation and handling have relied on extensive reverse-transcription quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR). However, many emerging economies have struggled with current molecular testing demands due to economic, technical and technological constraints. Objective: To define a potential diagnostic protocol to increase testing capacity in current and post-pandemic conditions. Methods: We reviewed the literature, patents and commercial applications, for alternatives. Results: We found a good potential in saliva samples, viral inactivation and quick RNA extraction by heating; the use of an isothermal technology such as loop mediated isothermal amplification (LAMP) and naked eye test-result visualization by in-tube colorimetry or turbidity. Conclusions: Saliva samples with quick RNA extraction by heating and colorimetric LAMP are promising options for countries with economic and infrastructure limitations.

Resumen Introducción: La mayoría de los casos exitosos de mitigación y manejo de la pandemia de COVID-19 se han dado mediante pruebas basadas en la reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa (RT-qPCR por sus siglas en inglés). Sin embargo, muchas economías emergentes han tenido problemas con las demandas actuales de pruebas moleculares debido a limitaciones económicas, técnicas y tecnológicas. Objetivo: Definir un protocolo de diagnóstico potencial para aumentar la capacidad de prueba en las condiciones actuales y posteriores a la pandemia. Métodos: Revisamos la literatura, las patentes y las aplicaciones comerciales, en busca de alternativas. Resultados: Encontramos un buen potencial en muestras de saliva, inactivación viral y extracción rápida de ARN por calentamiento; el uso de una tecnología isotérmica como la amplificación isotérmica mediada por horquillas (LAMP, por sus siglas en inglés) y la visualización del resultado de la prueba a simple vista mediante colorimetría o turbidez en el tubo. Conclusiones: Las muestras de saliva con extracción rápida de ARN por calentamiento y LAMP colorimétrico son opciones prometedoras para países con limitaciones económicas y de infraestructura.

Geographic distribution of the land snail family Spiraxidae (Gastropoda: Pulmonata) in Mexico

Resumen Introducción: Spiraxidae es la familia de gasterópodos terrestres más diversa de México con una distribución principalmente neotropical. Sin embargo, la influencia de las condiciones ambientales de esta región en su distribución aún es poco conocida. Objetivo: Determinar las afinidades zoogeográficas y la influencia de factores ambientales en la distribución de Spiraxidae en México. Métodos: Compilamos registros de distribución de museos y usamos modelos para establecer áreas con composición de especies, concentración de especies, afinidades y relaciones con variables ambientales similares. Resultados: Encontramos 231 especies y subespecies, 96 en el estado de Veracruz y 74 en la Sierra Madre Oriental. La principal afinidad zoogeográfica fue neotropical. El bosque mesófilo de montaña tuvo la mayor cantidad de especies y subespecies (93). Tres de los grupos zonales tienen una composición particular de especies y el 67 % de las especies son especialistas de hábitat. La presencia de especies sigue un gradiente ambiental, con la cubierta de árboles de hoja perenne de hoja ancha y la precipitación media anual como variables determinantes. Las especies del norte tuvieron mayor tolerancia a la aridez y menor cobertura de hojas. Conclusiones: Spiraxidae tiene su mayor diversidad en los estados del Sur de México; sin embargo, la zona nororiental tiene más registros de especies. Estos caracoles se encuentran principalmente en bosques mesófilos de montaña y bosques tropicales siempre verdes. Las especies del norte de México tuvieron una mayor tolerancia a los sitios con poca lluvia y menos cobertura de árboles de hoja perenne de hoja ancha que las especies del sur.

Abstract Introduction: Spiraxidae is the most diverse family of terrestrial gastropods in Mexico with a mainly neotropical distribution. However, the influence of environmental conditions in this region on its distribution is still poorly known. Objective: To determine zoogeographic affinities and the influence of environmental factors on the distribution of Spiraxidae in Mexico. Methods: We compiled museum distribution records and used models to establish areas with similar species composition, species concentration, affinities and relationship with environmental variables. Results: We found 231 species and subspecies, 96 in Veracruz state and 74 in Sierra Madre Oriental. The main zoogeographic affinity was neotropical. Mountain mesophyll forest had the most species and subspecies (93). Three of zone groups have a particular species composition and 67 % of the species are habitat specialists. Species presence follows an environmental gradient, with broadleaf evergreen tree cover and average annual precipitation as determining variables. Northern species had greater tolerance to aridity and reduced leaf cover. Conclusions: Spiraxidae has its greatest diversity in the Southern states of Mexico; however, the Northeastern zone has more species records. These snails mostly occur in mesophyll mountain forest and tropical evergreen forest. Species from Northern Mexico had greater tolerance to sites with low rainfall and less broadleaf evergreen tree cover than Southern species.

Diversity and genetic structure of natural populations of the palm tree Euterpe precatoria (Arecaceae)

Abstract Introduction: The natural ecosystems of northern Mato Grosso, Brazil, are in process of fragmentation, mainly due to population growth and the expansion of agriculture. This endangers the palm Euterpe precatoria (locally known as açaí), used for construction, palm hearts, juices and ice cream. Objective: To evaluate the local diversity and genetic structure in native populations of E. precatoria. Methods: We collected leaves from 106 fruiting palms from five populations in Mato Grosso State, for analysis of microsatellite markers with Polymerase Chain Reaction. Results: The five SSR loci revealed a total of 30 alleles, ranging from 5 (EE23 and EE43) to 7 (EE2 and EE15), with an average of 6 alleles per locus. The mean PIC was 0.74 and confirmed low heterozygosity and inbreeding. The UPGMA dendrogram produced two groups and molecular variance revealed greater genetic differentiation within populations. The high levels of homozygous microsatellite loci indicate low genetic diversity. Conclusions: These populations have low gene diversity, high average number of alleles per locus, and rare and exclusive alleles. We recommend the establishment of permanent conservation units with corridors among them.

Resumen Introducción: Los ecosistemas naturales del norte de Mato Grosso, Brasil, están en proceso de fragmentación, principalmente debido al crecimiento de la población y la expansión de la agricultura. Esto pone en peligro la palma Euterpe precatoria (localmente conocida como açaí), utilizada para la construcción, extracción de palmito, preparación de jugos y helados. Objetivo: Evaluar la diversidad local y estructura genética en poblaciones nativas de E. precatoria. Métodos: Recolectamos hojas de 106 palmas fructíferas de cinco poblaciones en el estado de Mato Grosso, para análisis de marcadores microsatélites con el método de Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR). Resultados: Los cinco loci SSR revelaron un total de 30 alelos, que van desde 5 (EE23 y EE43) hasta 7 (EE2 y EE15), con un promedio de 6 alelos por locus. El PIC medio fue de 0.74 y confirmó baja heterocigosidad y endogamia en las poblaciones. El dendrograma UPGMA produjo dos grupos y la varianza molecular reveló una mayor diferenciación genética dentro de las poblaciones. Los loci de microsatélites presentaron un alto nivel de homocigotos lo que indica una baja diversidad genética. Conclusiones: Estas poblaciones tienen baja diversidad genética, alto promedio de alelos por locus y alelos raros y únicos. Recomendamos el establecimiento de unidades de conservación permanentes con corredores entre ellas.

Internal ultrastructure of the planktonic larva of the coral Porites panamensis (Anthozoa: Scleractinia)

Abstract Introduction: The scleractinian coral life cycle includes planktonic larvae that settle on the benthos, allowing the primary polyp to clone and build a sexually reproducing adult colony. The larval physiology and ecology of Eastern Tropical Pacific scleractinians needs the exploration of basic aspects such as the internal morphology of planulae. Objective: To describe histological and cytological characteristics of Porites panamensis larvae. Methods: During August-July 2019, at Islas Marias Biosphere Reserve, Central Mexican Pacific, we made 14 collections of coral larvae and identified the species with cytochrome oxidase subunit 1 gene. We used a scanning electron microscope and other techniques. Results: The ectoderm was composed by heterogeneous, mono-ciliated, columnar epithelial cells. Nematocysts were clustered at the oral pole of the ectoderm, and cells were evident in the aboral pole of the ectoderm gland. The endoderm had secretory cells, lipids and symbionts. Conclusions: The abundance of secretory cells and nematocysts in the aboral pole suggests their importance in substrate exploration and larval settlement. Our results support previous descriptions of larval ultrastructure in other coral species.

Resumen Introducción: El ciclo de vida del coral escleractinio incluye larvas planctónicas que se asientan en el bentos, lo que permite que el pólipo primario se clone y construya una colonia de adultos con reproducción sexual. La fisiología y ecología larvaria de los escleractinios del Pacífico Tropical Oriental necesita la exploración de aspectos básicos como la morfología interna de las plánulas. Objetivo: Describir las características histológicas y citológicas de las larvas de Porites panamensis. Métodos: Durante agosto-julio 2019, en la Reserva de la Biosfera Islas Marías, Pacífico Central Mexicano, realizamos 14 recolectas de larvas de coral e identificamos las especies con el gen citocromo oxidasa subunidad 1. Utilizamos un microscopio electrónico de barrido y otras técnicas. Resultados: El ectodermo está compuesto por células epiteliales columnares heterogéneas, monociliadas. Los nematocistos se agrupan en el polo oral del ectodermo, mientras que en el polo aboral son visibles células glandulares. El endodermo presentó células secretoras, lípidos y simbiontes. Conclusiones: La abundancia de células secretoras y nematocistos en el polo aboral sugiere su importancia en la exploración del sustrato y asentamiento larvario. Nuestros resultados respaldan las descripciones previas de la ultraestructura de las larvas en otras especies de coral.

Comparison of four methods to count fish in a tropical bay: the case of the Santa Elena Bay Marine Management Area in the Pacific of Costa Rica

Resumen Introducción: La naturaleza tropical está experimentando una amenaza sin precedentes que incluye comunidades de peces costeros que requieren un constante seguimiento de la presencia de especies. El uso simultáneo de varios métodos de monitoreo debería reducir el sesgo causado por la selectividad de cada método. Objetivo: Este estudio uso cuatro diferentes métodos de muestreo a lo largo de dos años para evaluar y comparar los ensamblajes de peces en el Área Marina de Manejo Bahía Santa Elena, Pacífico de Costa Rica. Métodos: Examinamos los cambios en la riqueza y composición de especies entre épocas de afloramiento y no afloramiento entre julio de 2019 y febrero de 2020. Aplicamos censos visuales, cámaras remotas submarinas; líneas de fondo; y pesca deportiva. Resultados: Identificamos 140 especies de peces (54 familias); las cámaras submarinas remotas detectaron el 83 %, seguido por los censos visuales submarinos (65 %), la pesca deportiva (16 %) y las líneas de fondo (14 %). Solo el método de pesca deportiva detectó diferencias en la riqueza y composición de especies entre temporadas. Conclusión: Las cámaras remotas parecen ser el mejor método para el conteo de especies y la pesca deportiva para detectar diferencias estacionales en las costas tropicales similares a la aquí estudiada.

Abstract Introduction: Tropical nature is experiencing an unprecedented threat that includes coastal fish communities that requires a close monitoring of species presence. The simultaneous use of several monitoring methods should reduce the bias caused by the selectivity of each method. Objective: This study used four different sampling methods over two years to assess and compare fish assemblages in the Santa Elena Bay Marine Management Area (AMM-BSE), North Pacific of Costa Rica. Methods: We examined changes in species richness and composition between upwelling and non-upwelling seasons from July 2019 and February 2020. We applied visual censuses, underwater remote cameras; bottom lines; and sport fishing. Results: We identified 140 species of fish (54 families); remote underwater cameras detected 83 %, followed by underwater visual censuses (65 %), sport-fishing (16 %) and bottom lines (14 %). Only the sport-fishing method detected differences in species richness and composition between seasons. Conclusion: Remote cameras appear to be the best method for species counts, and sport-fishing to detect seasonal differences in tropical coasts similar to the one studied here.

Spatio-temporal distribution of planktonic cyanobacteria and environmental factors associated with their proliferation in the Cerrón Grande reservoir, El Salvador

Resumen Introducción: El embalse Cerrón Grande de 135 km2 es el humedal más grande de El Salvador, reconocido como “Humedal de Importancia Internacional” por la Convención Ramsar. Además, es uno de los ecosistemas más contaminados a nivel nacional, enfrentando serios problemas, entre ellos, las proliferaciones de cianobacterias. Objetivo: Evaluar las relaciones entre los factores ambientales y la distribución espacial y temporal de las cianobacterias en el embalse a lo largo de un año hidrológico. Métodos: Extrajimos agua con cianobacterias de seis sitios fijos, desde octubre 2018 hasta septiembre 2019. Resultados: Identificamos 16 géneros, el más abundante Microcystis sp. Además, Dolichospermum sp.; Microcistis sp. alcanzaron 1.5 x 106 células/ml en junio 2019, principalmente en el sector noroeste, que es poco profundo y cercano a las zonas de confluencia de afluentes altamente contaminados que llegan al embalse. El sector sureste más profundo tenía bajas concentraciones de estos organismos. Los factores ambientales mayormente relacionados con dicho comportamiento fueron: fósforo, la conductividad eléctrica y el valor de Secchi, como se esperaba de un cuerpo eutrófico. Conclusiones: La variación en la concentración celular de cianobacterias en este embalse está altamente influenciada por la lluvia, la mezcla de agua y el contenido de nutrientes.

Abstract Introduction: The 135 km2 Cerrón Grande reservoir is the largest wetland in El Salvador, recognized as “Wetland of International Importance” by the Ramsar Convention. It is also one of the most polluted ecosystems nationwide, facing serious problems, among them, a proliferation of cyanobacteria. Objective: To assess the relationships among environmental factors and the spatial and temporary distribution of cyanobacteria in the reservoir throughout a hydrological year. Methods: We extracted water with cyanobacteria from six fixed sites, from October 2018 through September 2019. Results: We identified 16 genera, the most abundant Microcystis sp. And Dolichospermum sp.; Microcystis sp. reached 1.5 x 106 cells/ml in June 2019, mainly in the north-west sector, which is shallow and close to the confluence zones where highly polluted tributaries reach the reservoir. The deeper south-east sector had low concentrations of these organisms. The environmental factors mostly related to this behavior were: phosphorus, electrical conductivity and Secchi value, as expected from a eutrophic body. Conclusions: Variation in the cellular concentration of cyanobacteria in this reservoir is highly influenced by rain, water mixing and nutrient content.

Which variables influence the herbivory amount on Montrichardia spp. (Araceae) in aquatic ecosystems?

Abstract Introduction: The study of herbivory is fundamental in ecology and includes how plants invest in strategies and mechanisms to reduce herbivore damage. However, there is still a lack of information about how the environment, plant density, and functional traits influence herbivory in aquatic ecosystems. Objective: To assess if there is a relationship between herbivory, environmental variables, and plant traits two species of Montrichardia, a neotropical aquatic plant. Methods: In September 2018, we studied 78 specimens of Montrichardia arborescens and 18 of Montrichardia linifera, in 18 sites in Melgaço, Pará, Brazil. On each site, we measured water depth, distance to the margin, and plant density. From plants, we measured plant height and leaf thickness, and photographed the leaves to calculate the specific leaf area and percentage herbivory. To identify anatomical structures, we collected fully expanded leaves from three individuals per quadrat. Results: For M. arborescens, plants with thicker leaves and higher specific leaf area have less herbivore damage. For M. linifera, plants from deeper sites and with thicker leaves had more herbivore damage, while plants that grew farther from the margin had less damage. We found anatomical structures related to defense, such as idioblast cells with phenolic compounds, and cells with solid inclusions that can contribute to avoiding severe damage. Conclusions: Herbivory in these Montrichardia species can be explained by a combination of plant and environmental traits (patch isolation and water depth). The main plant traits are leaf thickness and area, but chemical compounds and solid inclusions also help Montrichardia to sustain less damage than other macrophytes.

Resumen Introducción: La herbivoría es fundamental para comprender cómo las plantas invierten en diferentes estrategias para evitar la depredación, lo que implica diferentes mecanismos de defensa. Factores relacionados con el medio ambiente, la densidad de plantas y/o los rasgos funcionales de las plantas pueden influir en la herbivoría en los ecosistemas acuáticos. Sin embargo, todavía falta información sobre cómo esos factores influyen en la herbivoría en los ecosistemas acuáticos y pueden contribuir a la carga de herbivoría. Objetivo: Evaluar si existe una relación entre la herbivoría y las variables ambientales (p. ej., profundidad del agua y distancia al margen), los factores ecológicos (densidad de plantas) y los rasgos estructurales de las plantas (altura, grosor de la hoja y área foliar) e indicar estructuras anatómicas que actúen junto con los rasgos estructurales en el sistema de defensa de especies de Montrichardia. Métodos: Se evaluaron 96 individuos de Montrichardia spp. (78 de M. arborescens y 18 de M. linifera, en 18 sitios) recolectados en septiembre de 2018. En cada sitio, se midió la profundidad del agua, la distancia al margen y la densidad de plantas. De los individuos, medimos la altura de la planta, el grosor de la hoja y fotografiamos las hojas para calcular el área foliar específica y la cantidad de herbivoría (en porcentaje). Para identificar las estructuras anatómicas relacionadas con la defensa de las plantas, se recogió hojas completamente expandidas de tres individuos por cuadrante. Resultados: Para M. arborescens, las plantas con hojas más gruesas y mayor área foliar específica tienen menos daño por herbivoría. Para M. linifera, las plantas con hojas más gruesas y que habitan en sitios más profundos tienen más daño por herbívoros, mientras que las plantas más alejadas del margen tienen menos daño por herbívoros. Se encontró estructuras anatómicas relacionadas con la defensa, como células idioblásticas con compuestos fenólicos y células con inclusiones sólidas que pueden contribuir a evitar daños severos en las características de las hojas. Conclusiones: Nuestros resultados indican que la herbivoría en las especies de Montrichardia podría explicarse por una combinación de características ambientales (aislamiento del parche y profundidad del agua) y de la planta. Descubrimos que los rasgos de las hojas eran factores importantes que impulsaban los cambios en la carga de herbivoría, especialmente el grosor de las hojas y el área foliar específica. Además, las especies de Montrichardia invierten en compuestos químicos e inclusiones sólidas para evitar daños graves en las hojas y, por lo tanto, pueden sufrir menos daños que otras especies de macrófitos.

Remoción de semillas por Dorymyrmex insanus (Hymenoptera: Formicidae) en una reserva ecológica en la Ciudad de México, México

Abstract Introduction: Seed removal by ants is an interaction that may greatly affect the dynamic and structure of the vegetation. This aspect is well known for granivorous ants; however, there is little information on the effect of omnivorous ants. Objective: To assess the potential impact of the omnivorous ant Dorymyrmex insanus on vegetation. Methods: In the Pedregal Reserve, Mexico City, we identified the items in the refuse piles of ten ant colonies, for one year, covering the rainy and dry seasons. For each season we calculated seed diversity and analyzed the possible relationship between seed size and their abundance in the refuse piles, with regression models. We also did germination tests with seeds of Tagetes micrantha, comparing seeds from piles and from plants. Results: D. insanus removed seeds of 19 plant species as well as plant remains (such as leaves, twigs, roots), and remains of insects. Seed diversity was higher in the rainy season but the greatest abundance was in the dry season. When analyzing the relationship between seed length and abundance in the refuse piles, we found that the ants preferred seeds of around 10 mm. We also found that more seeds of T. micrantha germinated when they were previously handled by ants. Conclusions: The ant D. insanus actively participates in the removal of seeds from several species, favoring germination, and seasonality affects the selectivity of resources.

Resumen Introducción: La remoción de semillas por parte de las hormigas es una interacción que puede afectar en gran medida la dinámica y estructura de la vegetación. Este aspecto es bien conocido para las hormigas granívoras; sin embargo, hay poca información sobre el efecto de las omnívoras. Objetivo: Evaluar el impacto potencial de la hormiga omnívora Dorymyrmex insanus sobre la vegetación. Métodos: En la Reserva Pedregal, Ciudad de México, se identificaron los ítems en el área del basurero para diez colonias de hormigas, durante un año, cubriendo la época de lluvia y sequía. Para cada temporada calculamos la diversidad de semillas y analizamos la posible relación entre el tamaño de las semillas y su abundancia en los basureros, con modelos de regresión. También hicimos pruebas de germinación con semillas de Tagetes micrantha, comparando las encontradas en los basureros con las provenientes de las plantas. Resultados: D. insanus eliminó semillas de 19 especies de plantas, así como restos de plantas (hojas, ramitas, raíces) y restos de insectos. La diversidad de semillas fue mayor en la estación lluviosa pero la mayor abundancia lo fue en la estación seca. Al analizar la relación entre la longitud de las semillas y la abundancia en el área del basurero, encontramos que las hormigas preferían semillas de alrededor de 10 mm. También encontramos que germinaron más semillas de T. micrantha cuando fueron manipuladas previamente por hormigas. Conclusiones: La hormiga D. insanus participa activamente en la remoción de semillas de varias especies, favoreciendo la germinación, y la estacionalidad afecta la selectividad de recursos.

Specific and taxonomic diversity of the ichthyofauna of the Amacuzac River, Morelos, Mexico

Resumen Introducción: La diversidad de una comunidad biológica es el resultado de procesos ecológicos e históricos, los cuales, analizados en conjunto, producen una mejor comprensión de las causas que la generan. Objetivo: Actualizamos y analizamos la diversidad específica y taxonómica de la ictiofauna del río Amacuzac, México. Métodos: Durante cinco temporadas de muestreo (2019-2020), recolectamos peces de diez sitios en el río y aplicamos un análisis de conglomerados a las variables del hábitat. Resultados: Recolectamos 7 638 individuos, siete de especies nativas y nueve no nativas, incluyendo Copadichromis borleyi, un nuevo registro para el Amacuzac. La riqueza por sitio osciló entre ocho y 13 especies. Las variables del hábitat definieron cuatro grupos. Las especies más abundantes fueron: Poeciliopsis gracilis, Poecilia maylandi y Amatitlania nigrofasciata. Las especies menos abundantes fueron: Pterygoplichtys pardalis, Ilyodon whitei, Copadichromis borleyi e Ictalurus punctatus. Las especies más relevantes fueron: A. nigrofasciata, Amphilophus istlanus, Andinoacara rivulatus, Notropis boucardi, Oreochormis sp., P. maylandi, P. gracilis y Thorichthys maculipinis. Las especies más restringidas fueron: Atherinella balsana, C. borleyi e I. punctatus. Conclusiones: Las especies en peligro de extinción, A. istlanus y N. boucardi, aun prevalecen en el río. Además, se muestra un aumento en el número de especies no nativas. Analizar la diversidad desde dos perspectivas, aporta una visión más completa de los cambios que se dan en el Río Amacuzac como consecuencia del establecimiento de especies, información que es importante para futuras estrategias de conservación.

Abstract Introduction: The diversity of a biological community is the result of ecological and historical processes, which, when analyzed jointly, produce a better understanding of the causes that generate it. Objective: We update and analyze the specific and taxonomic diversity of the ichthyofauna of the Amacuzac River, Mexico. Methods: During five sampling seasons (2019-2020) we collected fishes from ten sites in the river and applied a cluster analysis to habitat variables. Results: We collected 7 638 individuals; seven were native species and nine were non-native, including Copadichromis borleyi, a new record for the Amacuzac. Richness per site ranged from eight to 13 species. Habitat variables defined four groups. The most abundant species were Poeciliopsis gracilis, Poecilia maylandi and Amatitlania nigrofasciata. The least abundant species were: Pterygoplichtys pardalis, Ilyodon whitei, Copadichromis borleyi and Ictalurus punctatus. The most prevalent species were: A. nigrofasciata, Amphilophus istlanus, Andinoacara rivulatus, Notropis boucardi, Oreochormis sp., P. maylandi, P., gracilis and Thorichthys maculipinis. The most restricted species were: Atherinella balsana, C. borleyi and I. punctatus. Conclusions: Endangered species such as A. istlanus and N. boucardi are still prevalent in the river, but non-native species continue to increase. Analyzing the diversity from two perspectives provides a more complete view of the changes taking place in the Amacuzac River as a consequence of species establishment, information that is important for future conservation strategies.

Anatomy and histology of the digestive tract and immunolocalization of Npy in the fish Cichlasoma dimerus (Cichliformes: Cichlidae)

Abstract Introduction: The digestive tract of Neotropical cichlids has not been deeply studied, and it is a fundamental topic for understanding fish physiology, nutrition, trophic associations, and evolution. Objective: To describe anatomically and histologically the digestive tract of the Neotropical cichlid fish Cichlasoma dimerus and to immunolocalize the orexigenic peptide (Npy) along the intestine. Methods: We euthanized 14 adult individuals and fixed the organs in Bouins solution; we stained 7 μm thick paraffin sections for general description and with Alcian Blue (pH = 2.5, AB) and Periodic acid-Schiff (PAS) to identify acid or neutral glycoconjugates, respectively. Additionally, we performed immunohistochemistry for Npy in 3 adult individuals. We manually counted PAS- and AB-positive cells, and Npy-immunoreactive cells per fold. Results: There is a short oesophagus, a sac-like stomach, and a tubular intestine with two loops. The oesophagus has a stratified epithelium with a high density of PAS- and AB-positive goblet cells and striated muscle fibers in the tunica muscularis. The stomach mucosa is formed by simple columnar epithelium. The intestine has a simple columnar epithelium, with brush border and interspersed PAS- and AB-positive goblet cells, and Npy-immunoreactive cells. There is an ileorectal valve in the transition between the posterior intestine and the rectum. This last gut portion has goblet cells and a thicker tunica muscularis. Conclusions: C. dimerus shares features with other Neotropical cichlids, but the goblet cells and gastric glands distribution seems to be unique for the species. To our understanding, this is the first work to describe Npy-immunoreactive cells distribution in the intestine of a Neotropical cichlid fish.

Resumen Introducción: El tracto digestivo de los cíclidos neotropicales no ha sido profundamente estudiado y es un tema fundamental para entender la fisiología, nutrición, asociaciones tróficas y evolución de los peces. Objetivo: Describir anatómica e histológicamente el tracto digestivo del pez cíclido neotropical Cichlasoma dimerus e inmunolocalizar el péptido orexigénico (Npy) a lo largo del intestino. Métodos: Sacrificamos 14 individuos adultos y fijamos los órganos en solución de Bouin; teñimos secciones de parafina de 7 μm de espesor para una descripción general y con azul alcián (pH = 2.5, AB) y ácido periódico-Schiff (PAS) para identificar glicoconjugados ácidos o neutros, respectivamente. Además, en 3 individuos adultos se realizaron inmunohistoquímicas contra Npy. Contamos manualmente las células PAS y AB positivas, y las células inmunorreactivas a Npy por pliegue. Resultados: Hay un esófago corto, un estómago en forma de saco y un intestino con dos vueltas. El esófago tiene un epitelio estratificado con una alta densidad de células caliciformes PAS- y AB- positivas y fibras esqueléticas estriadas en las capas musculares. La mucosa del estómago está revestida por epitelio simple cilíndrico. El epitelio intestinal es simple cilíndrico con chapa estriada y células caliciformes PAS- y AB- positivas intercaladas, y células inmunorreactivas a Npy. Hay una válvula ileorrectal en la transición entre el intestino posterior y el recto. Esta última porción intestinal tiene células caliciformes y una túnica muscular más gruesa. Conclusiones: C. dimerus comparte características con otros cíclidos neotropicales, pero la distribución de las células caliciformes y las glándulas gástricas, serían rasgos propios de esta especie. A nuestro entender, este es el primer trabajo que describe la distribución de células inmunorreactivas a Npy en el intestino de un pez cíclido neotropical.

Amoebicidal and trichomonicidal capacity of polymeric nanoparticles loaded with extracts of the plants Curcuma longa (Zingiberaceae) and Berberis vulgaris (Berberidaceae)

Abstract Introduction: Pathogenic protozoans, like Entamoeba histolytica and Trichomonas vaginalis, represent a major health problem in tropical countries; and polymeric nanoparticles could be used to apply plant extracts against those parasites. Objective: To test Curcuma longa ethanolic extract and Berberis vulgaris methanolic extracts, and their main constituents, against two species of protozoans. Methods: We tested the extracts, as well as their main constituents, curcumin (Cur) and berberine (Ber), both non-encapsulated and encapsulated in polymeric nanoparticles (NPs), in vitro. We also determined nanoparticle characteristics by photon correlation spectroscopy and scanning electron microscopy, and hemolytic capacity by hemolysis in healthy erythrocytes. Results: C. longa consisted mainly of tannins, phenols, and flavonoids; and B. vulgaris in alkaloids. Encapsulated particles were more effective (P < 0.001); however, curcumin and berberine nanoparticles were the most effective treatments. CurNPs had IC50 values (µg/mL) of 9.48 and 4.25, against E. histolytica and T. vaginalis, respectively, and BerNPs 0.24 and 0.71. The particle size and encapsulation percentage for CurNPs and BerNPs were 66.5 and 73.4 nm, and 83.59 and 76.48 %, respectively. The NPs were spherical and significantly reduced hemolysis when compared to non-encapsulated extracts. Conclusions: NPs represent a useful and novel bioactive compound delivery system for therapy in diseases caused by protozoans.

Resumen Introducción: Los protozoos patógenos, como Entamoeba histolytica y Trichomonas vaginalis, representan un importante problema de salud en los países tropicales; y se podrían usar nanopartículas poliméricas para aplicar extractos de plantas contra esos parásitos. Objetivo: Probar los extractos etanólicos de Curcuma longa y Berberis vulgaris, y sus principales constituyentes, contra dos especies de protozoos. Métodos: Probamos los extractos, así como sus principales constituyentes, curcumina (Cur) y berberina (Ber), tanto no encapsulados como encapsulados en nanopartículas poliméricas (NPs), in vitro. También determinamos las características de las nanopartículas por espectroscopía de correlación de fotones y microscopía electrónica de barrido, y la capacidad hemolítica por hemólisis en eritrocitos sanos. Resultados: C. longa tenía principalmente: taninos, fenoles y flavonoides; y B. vulgaris, alcaloides. Las partículas encapsuladas fueron más efectivas (P < 0.001); sin embargo, las nanopartículas de curcumina y berberina fueron los tratamientos más efectivos. CurNPs tenía valores IC50 (µg/mL) de 9.48 y 4.25, contra E. histolytica y T. vaginalis, respectivamente, y BerNPs 0.24 y 0.71. El tamaño de partícula y el porcentaje de encapsulación para CurNPs y BerNPs fueron: 66.5 y 73.4 nm, y 83.59 y 76.48 %, respectivamente. Los NP son esféricos y redujeron significativamente la hemólisis en comparación con los extractos no encapsulados. Conclusiones: Las NP representan un sistema de administración de compuestos bioactivos útil y novedoso para la terapia enfermedades causadas por protozoos.

First use of baited remote underwater video stations to assess fish diversity in the Metropolitan Region of Recife, Northeastern Brazil

Abstract Introduction: Video techniques are used worldwide to study marine communities. As elsewhere, the use of remote underwater videos has recently increased in Brazil and there is a need for information about their advantages, disadvantages, and reliability in tropical habitats. Objective: To evaluate the use of baited remote underwater video stations (BRUVS) in fish diversity research in a tropical habitat. Methods: We used baited video stations to record the fishes and their relationship with habitat type, underwater visibility and depth, in 79 random sites in the Metropolitan Region of Recife, Northeastern Brazil (11 days in November 2017). Results: We recorded 3 286 individuals (65 taxa, 29 families) along a 25 km section of the shoreline, 10.2 to 28.6 m depth. The Clupeidae dominated numerically, followed by Haemulidae, Carangidae, and Lutjanidae; by species, Haemulon aurolineatum, Opisthonema oglinum, Haemulon steindachneri, Lutjanus synagris and Caranx crysos. The highest mean number of species was detected over sediment close to shipwrecks, but we found no differences among the mean number of individuals between habitat types. More species and individuals were observed at a depth of 20-25 m depth. The highest mean number of species was in 2-3 m of visibility, and the highest number of individuals within 4-5 m. Conclusions: Video recording seemed to be a valid method, and indicated that -besides being relatively diverse- the local fish community is dominated by a few species of small and medium-sized mesopredators, and a few top predators.

Resumen Introducción: Las técnicas de video se utilizan en todo el mundo para estudiar las comunidades marinas. Como en otros lugares, el uso de videos submarinos remotos ha aumentado recientemente en Brasil y existe la necesidad de información sobre sus ventajas, desventajas y confiabilidad en los hábitats tropicales. Objetivo: Evaluar el uso de estaciones de video subacuáticas remotas cebadas en la investigación de la diversidad de peces en un hábitat tropical. Métodos: Utilizamos estaciones de video cebadas para registrar los peces y su relación con el tipo de hábitat, la visibilidad submarina y la profundidad, en 79 sitios aleatorios en la Región Metropolitana de Recife, noreste de Brasil (11 días en noviembre de 2017). Resultados: Registramos 3 286 individuos (65 taxones, 29 familias) a lo largo de una sección de 25 km de la costa, de 10.2 a 28.6 m de profundidad. Los Clupeidae dominaron numéricamente, seguidos de Haemulidae, Carangidae y Lutjanidae; por especies, Haemulon aurolineatum, Opisthonema oglinum, Haemulon steindachneri, Lutjanus synagris y Caranx crysos. El mayor número medio de especies se detectó sobre sedimentos cerca de naufragios, pero no encontramos diferencias entre el número medio de individuos entre tipos de hábitat. Se observaron más especies e individuos a una profundidad de 20-25 m. El mayor número medio de especies se registró en 2-3 m de visibilidad, y el mayor número de individuos en 4-5 m. Conclusiones: La grabación en video pareció ser un método válido e indicó que, además de ser relativamente diversa, la comunidad local de peces está dominada por unas pocas especies de mesodepredadores de tamaño pequeño y mediano, y pocos depredadores superiores.

Effect of fires on vegetation cover, carbon storage and plant biomass in a coastal wetland

Resumen Introducción: Los humedales se encuentran entre los ecosistemas más productivos, pero actualmente están siendo degradados o eliminados a un ritmo acelerado por múltiples actividades antrópicas. En la costa central de Perú, los humedales sufren incendios recurrentes, y los efectos poco estudiados incluyen el nivel de emisiones y el secuestro de carbono por quema. Objetivo: Estimar el carbono en la biomasa aérea afectada por el fuego y el carbono recuperado por la vegetación al cabo de un año. Métodos: Trabajamos en el humedal costero Los Pantanos de Villa (Lima, Perú) y comparamos áreas quemadas (32 cuadrantes, 1 m2) y no afectadas (33 cuadrantes). Resultados: La vegetación afectada fue predominantemente herbácea y dominada por Phragmites australis, Schoenoplectus americanus, Typha dominguensis y Cladium jamaicense. El incendio afectó 1 147.0 t de biomasa vegetal que almacenó 381.8 t de carbono, generando la emisión de 1 397.1 t de CO2 a la atmósfera. Al cabo de un año se había recuperado el 79 % de la cobertura vegetal, pero solo el 26 % de la biomasa vegetal viva y el 12.8 % del carbono contenido en la vegetación. Conclusiones: Los indicadores apropiados de la resiliencia de los humedales al fuego deben considerar que los humedales afectados por el fuego recuperan rápidamente la cobertura vegetal, pero no el almacenamiento de carbono y la biomasa vegetal.

Abstract Introduction: Wetlands are among the most productive ecosystems, but currently are being degraded or eliminated at accelerated rates by multiple anthropic activities. In the central coast of Peru, wetlands suffer recurring fires, and the little-studied effects include the level of emissions and carbon sequestration by burning. Objective: To estimate carbon in aerial biomass affected by fire, and carbon recovered by the vegetation after one year. Methods: We worked in Los Pantanos de Villa (Lima, Peru) coastal wetland and compared burnt (32 quadrants, 1 m2) and unaffected areas (33 quadrants). Results: The vegetation affected was predominantly herbaceous and dominated by Phragmites australis, Schoenoplectus americanus, Typha dominguensis and Cladium jamaicense. Fire affected 1 147.0 t of plant biomass that stored 381.8 t of carbon, generating the emission of 1 397.1 t of CO2 into the atmosphere. After one year, 79 % of the vegetation cover had recovered, but only 26 % of the plant biomass and 12.8 % of vegetation carbon. Conclusions: Appropriate indicators of wetland fire resilience should consider that fire-impacted wetland rapidly recovers plant cover, but not carbon storage and plant biomass.

Distribution, diversity, endemism, and ecology of Nymphalid butterflies (Lepidoptera: Nymphalidae) in the Loxicha Region, Oaxaca, Mexico

Abstract Introduction: The Loxicha Region of Oaxaca, Mexico, has been historically important for the study of Nymphalidae, second in the Papilionoidea for species richness. Describing the diversity patterns of this butterfly clade in Loxicha can improve our understanding of the evolutionary history of the Sierra Madre del Sur, the Mexican Pacific slope, and Mexico in general. Objective: To describe the temporal and spatial patterns of Nymphalidae diversity along an elevational gradient (80-2 600 m), and to compare Loxicha's fauna with other regions in Mexico. Methods: We obtained 28 756 records from 21 sites in the Loxicha Region, representing seven years of sampling. We estimate and analyze the diversity, endemism, and distributional patterns for three elevational levels and five vegetation types. We estimated species composition and similarity with other regions of the Pacific and Atlantic slopes. Results: We identified 189 taxa, including species and subspecies, from 85 genera and ten subfamilies of Nymphalidae. Loxicha contains 46 % of the species in the family recognized for Mexico, including ten endemic species and 56 endemic subspecies. Cloud forest and low elevations were the most diverse habitats for this family. There is a clear divergence between the Atlantic and Pacific faunas, and the Sierra Madre del Sur has two faunal components. High-elevation sites in Oaxaca, and in the neighboring state of Guerrero, have a distinctive fauna, apparently isolated from low-elevation sites, revealing an archipelagic distribution for cloud forest Nymphalidae. Conclusions: The Loxicha Region is one of the richest areas for Nymphalidae in Mexico. Distribution on the Pacific slope is determined by geographical history and ecological conditions, including elevation. Nymphalidae can be used to test hypotheses of biogeographic regionalization in Mexico.

Resumen Introducción: La Región Loxicha de Oaxaca, México, ha sido históricamente importante para el estudio de Nymphalidae, segunda en riqueza de especies en Papilionoidea. Describir los patrones de diversidad de este taxón de mariposas en Loxicha puede mejorar nuestra comprensión de la historia evolutiva de la Sierra Madre del Sur, la vertiente del Pacífico mexicano y México en general. Objetivo: Describir los patrones temporales y espaciales de la diversidad de Nymphalidae a lo largo de un gradiente altitudinal (80-2 600 m), y comparar la fauna de Loxicha con otras regiones de México. Métodos: Obtuvimos 28 756 registros de 21 sitios de la Región Loxicha, que representan siete años de muestreo. Estimamos y analizamos la diversidad, el endemismo y los patrones de distribución para tres niveles altitudinales y cinco tipos de vegetación. Estimamos la composición de especies y la similitud con otras regiones de las vertientes del Pacífico y Atlántico de México. Resultados: Identificamos 189 taxones, incluyendo especies y subespecies, de 85 géneros y diez subfamilias de Nymphalidae. Loxicha contiene 46 % de las especies de la familia reconocidas para México, incluidas diez especies endémicas y 56 subespecies endémicas. El bosque mesófilo y las elevaciones bajas fueron los hábitats más diversos para esta familia. Existe una clara divergencia entre las faunas del Atlántico y del Pacífico, y la Sierra Madre del Sur tiene dos componentes faunísticos. Los sitios de elevaciones altas en Oaxaca, y en el estado vecino de Guerrero, tienen una fauna distintiva, aparentemente aislada de los sitios de elevaciones bajas, lo que revela una distribución archipelágica para los Nymphalidae del bosque mesófilo. Conclusiones: La Región Loxicha es una de las zonas más diversas para Nymphalidae en México. La distribución en la vertiente del Pacífico está determinada por la historia geográfica y las condiciones ecológicas, incluida la elevación. Nymphalidae puede usarse para probar hipótesis de regionalización biogeográfica en México.

Reproduction and recommended fishing limitations for the marine snail Hexaplex princeps (Neogastropoda: Muricidae) in Guerrero, Mexico

Abstract Introduction: The snail Hexaplex princeps is the most important gastropod in the fishery of Guerrero, but capture is not legally regulated for lack of enough studies about its reproduction, growth and other fishing aspects. Objective: To assess fishery data for H. princeps in Guerrero. Methods: From October 2016 to December 2017, we analyzed histological samples of the gonads from 6 to 13 individuals per month. We also collected data on pre-reproductive organisms captured in Costa Chica (2013 and 2014), Costa Grande (2017) and Acapulco (2019 and 2020). Results: Both sexes have five stages of gonadal development; most reproductive activity was from December to July, related to sea surface temperatures of 26 to 28 °C. The LC M in females was 94.1 mm (males: 86.1 mm). There was a high percentage of juvenile organisms in the catches (88.6 %). Conclusions: To let these snails reproduce at least once, we recommend a fishing ban from December to July, and that the minimum size of commercial capture be set at 94.1 mm.

Resumen Introducción: El caracol Hexaplex princeps es el gasterópodo más importante en la pesquería de Guerrero, pero su captura no está regulada legalmente por falta de suficientes estudios sobre su reproducción, crecimiento y otros aspectos de la pesca. Objetivo: Evaluar los datos de pesca de H. princeps en Guerrero. Métodos: De octubre 2016 a diciembre 2017, analizamos muestras histológicas de las gónadas de 6 a 13 individuos por mes. También recolectamos datos sobre organismos pre-reproductivos capturados en Costa Chica (2013 y 2014), Costa Grande (2017) y Acapulco (2019 y 2020). Resultados: Ambos sexos tienen cinco etapas de desarrollo gonadal; la mayor actividad reproductiva fue de diciembre a julio, relacionada con las temperaturas superficiales del mar, que se encuentran entre 26 y 28 °C. El LC M en hembras fue de 94.1 mm (machos: 86.1 mm). Hubo un alto porcentaje de organismos juveniles en las capturas (88.6 %). Conclusiones: Para que estos caracoles se reproduzcan al menos una vez, se recomienda una veda de diciembre a julio y que la talla mínima de captura comercial se fije en 94.1 mm.

Diversity and ecology of Tephritoidea (Insecta: Diptera) on the north of the Colombian Orinoquía

Resumen Introducción: Los Tephritoidea, como grupo, tienen un impacto ecológico porque se alimentan de hongos, insectos, flores, frutas en descomposición, excrementos, sudor, nódulos de raíces, carroña (incluidos cadáveres humanos) y otros materiales en descomposición. Las moscas de la fruta son insectos de gran importancia en la agricultura y la investigación genética. En Colombia existen 58 géneros y 224 especies, pero no existe un estudio general del grupo en la Orinoquía colombiana. Objetivo: Caracterizar las comunidades de Tephritoidea (aspectos taxonómicos y ecológicos) y aportar información básica de las especies de importancia económica en la Orinoquía colombiana. Métodos: Semanalmente desde agosto 2017 hasta febrero 2018 recolectamos moscas de la fruta en trampas McPhail cebadas con proteína de maíz, en un huerto doméstico y un fragmento de bosque en Arauca, y también en Saravena, Orinoquía, Colombia. Resultados: Identificamos 27 especies (12 Tephritidae, 11 Richardiidae y 4 Lonchaeidae), nueve de ellas plagas agrícolas. Euarestopsis paupera, Hemixantha lutea, Melanoloma affinis, Melanoloma cyanogaster, Melanoloma varians y Sepsisoma anale se reportan por primera vez para Colombia. Se calcularon los índices de diversidad para las comunidades estudiadas, encontrando diferencias entre las localidades y ambiente. Se discute la influencia de las condiciones ambientales sobre la variabilidad encontrada. Se encontraron nueve especies de moscas consideradas como plagas de producciones agrícolas y para estas especies se estudió su relación con plantas hospederas y la dinámica poblacional. Conclusiones: Seis meses de muestreo produjeron varios primeros registros, lo que sugiere que la fauna de Tephritoidea está submuestreada en la región. La temporada de lluvias y las actividades humanas se correlacionan con la diversidad y abundancia de especies en la Orinoquía colombiana.

Abstract Introduction: The Tephritoidea as a group, have an ecological impact because they feed on fungi, insects, flowers, decaying fruit, excrement, sweat, root nodules, carrion (including human corpses), and other decomposing materials. The fruit-flies are insects of great importance in agriculture and genetic research. In Colombia, there are 58 genera and 224 species, but there is no general study of the group in the savannas of Orinoquía. Objective: To characterize the Tephritoidea communities (taxonomic and ecological aspects) and to provide basic information about the economically important species in the Colombian Orinoquía. Methods: Weekly from August 2017 to February 2018 we collected flies from fruits and McPhail traps baited with corn protein, in a domestic orchard and a forest fragment in Arauca, and also in Saravena, Orinoquía, Colombia. Results: We identified 27 species (12 Tephritidae, 11 Richardiidae and 4 Lonchaeidae), nine of them agricultural pests. Euarestopsis paupera, Hemixantha lutea, Melanoloma affinis, Melanoloma cyanogaster, Melanoloma varians and Sepsisoma anale are reported for the first time from Colombia. A diversity index was calculated for studied communities, being differences between localities and sites. Influence of climatic conditions over variability was found and is discussed. Nine species of fruit flies, which are considered agricultural pests, were identified. For these species their relationship with host plants and population dynamics were studied. Conclusions: Six months of sampling produced several first reports, suggesting that the fauna of Tephritoidea is undersampled in the region. The rainy season, and human activities, correlate with species diversity and abundance in the Colombian Orinoquía.

Impact of plot size on tropical forest structure and diversity estimation

Abstract Introduction: Inventories are essential for forest management, but, in the Amazon region, the absence of standardization produces information loss, low accuracy, and inconsistent measurements. This prevents valid comparisons and compromises the use of information in networks and software. Sampling unit size is of key importance in the inventory of native forests, particularly regarding accuracy and costs. Objective: To identify a plot size that provides adequate precision for dendrometric parameters in the Amazon. Methods: In Cotriguaçu, Mato Grosso, Brazil, we tested four plot sizes with six repetitions each: 2 500, 5 000, 7 500, and 10 000 m². We measured diameter at breast height, population density, basal area, and biomass. We applied Shannon and Jaccard indexes; Weibull 2P and Gamma functions to fit the diametric distribution; and the Akaike Information Criterion for the best model. Results: There was a directly proportional relationship between plot area and population similarity, but diversity did not indicate significant alterations. Plot size did not affect dendrometric attributes and diametric distribution. Larger plot areas led to lower coefficients of variation and smaller confidence intervals. The Gamma function was the best model to represent the distributions of different plot sizes. Conclusions: For similar forests, we recommend the 2 500 m² plot to evaluate diameter at breast height, population density, basal area, and biomass.

Resumen Introducción: Los inventarios son fundamentales para la gestión forestal, pero en la Amazonía la ausencia de estandarización produce pérdida de información, baja precisión y mediciones inconsistentes. Esto impide comparaciones válidas y compromete el uso de información en redes y programas. El tamaño de la unidad de muestreo es de importancia clave en el inventario de bosques nativos, particularmente en lo que respecta a la precisión y los costos. Objetivo: Identificar un tamaño de parcela que proporcione una precisión adecuada para los parámetros dendrométricos en la Amazonía. Métodos: En Cotriguaçu, Mato Grosso, Brasil, probamos cuatro tamaños de parcela con seis repeticiones cada una: 2 500, 5 000, 7 500 y 10 000 m². Medimos diámetro a la altura del pecho, densidad de población, área basal y biomasa. Se aplicaron los índices de Shannon y Jaccard; Funciones Weibull 2P y Gamma para adaptarse a la distribución diametral; y el Criterio de Información de Akaike para el mejor modelo. Resultados: Hubo una relación directamente proporcional entre el área de parcela y la similitud poblacional, pero la diversidad no indicó alteraciones significativas. El tamaño de la parcela no afectó los atributos dendrológicos y la distribución diametral. Las áreas de parcela más grandes dieron lugar a coeficientes de variación más bajos e intervalos de confianza más pequeños. La función Gamma fue el mejor modelo para representar las distribuciones de diferentes tamaños de parcela. Conclusiones: Para bosques similares, recomendamos la parcela de 2 500 m² para evaluar diámetro a la altura del pecho, densidad de población, área basal y biomasa.

Availability and use of polliniferous resources by Apis mellifera (Hymenoptera: Apidae) in the Eastern Yungas of Jujuy (Argentina)

Resumen Introducción: El conocimiento de la riqueza vegetal y la estacionalidad alrededor de los apiarios de Apis mellifera es una herramienta de planificación indispensable para los apicultores. Debe incluir la disponibilidad de recursos, las preferencias alimenticias y el comportamiento de búsqueda de alimento. Dicha información no está disponible para las Yungas argentinas, uno de los ecosistemas forestales más estacionales de América del Sur. Objetivo: Evaluar la disponibilidad de recursos tróficos a través de un calendario de floración y su relación con las cargas de polen de A. mellifera en las Yungas. Métodos: En El Fuerte, Jujuy, recolectamos muestras mensuales de septiembre a marzo (2014-2015 y 2015-2016) utilizando trampas de polen. Utilizamos técnicas estandarizadas para los análisis palinológicos e índices de asociación para el uso de recursos. Las fenofases fueron Inicio de floración, Plena floración y Fin de floración. Resultados: Se identificaron 47 especímenes botánicos a nivel de especie y 9 a nivel de género. En ambos períodos hubo una oferta moderada de flores al inicio de la primavera, representada igualmente por plantas arbustivas y herbáceas, con un pico de floración en noviembre. Posteriormente, hubo una caída en la disponibilidad, con un pico de floración nuevamente al final de la temporada. En cinco especies de plantas hubo una asociación de media a alta entre la especie vegetal disponible y la presencia de ésta en el espectro polínico de la muestra de polen corbicular recolectada (Vachellia aroma, Blepharocalyx salicifolius, Cantinoa sp., Vernonanthura sp. y Zanthoxylum coco). Conclusión: En esta región hay una oferta moderada de flores de plantas arbustivas y herbáceas a principios de la primavera, con un pico de floración en noviembre y al final de la temporada. Solo cinco, de casi 50 especies de plantas, muestran una asociación de disponibilidad y uso por parte de las abejas.

Abstract Introduction: Knowledge of vegetation richness and seasonality around Apis mellifera apiaries is an indispensable planning tool for beekeepers. It must include resource availability, food preferences and foraging behaviour. Such information is unavailable for the Argentinian Yungas, one of the most seasonal forest ecosystems in South America. Objective: To assess the availability of trophic resources through a flowering calendar and its relationship with A. mellifera pollen loads in the Yungas. Methods: In El Fuerte, Jujuy, we collected monthly samples from September to March (2014-2015 and 2015-2016) using pollen traps. We used standardized techniques for palynological analyses, and association indices for resource use. The phenophases were Beginning of flowering, Full flowering, and End of flowering. Results: We identified 47 botanical specimens to species level and 9 only to genus. In both periods there was a moderate supply of flowers at the beginning of spring, represented equally by shrub and herbaceous plants, with peak flowering in November. Subsequently, there was a drop in availability, with peak flowering again at the end of the season. In five plant species, there was a medium to high association between the plant species available and their presence in the pollen spectrum of the corbicular pollen samples collected (Vachellia aroma, Blepharocalyx salicifolius, Cantinoa sp., Vernonanthura sp. And Zanthoxylum coco). Conclusion: In this region, there is a moderate supply of shrub and herbaceous plant flowers at the beginning of spring, with peak flowering in November and at the end of the season. Only five, out of nearly 50 plant species, show an association of availability and use by bees.

Differences in body size and abundance of high Andean fishes, above and below the Neusa dam, Colombia

Resumen Introducción: Los ríos tropicales se ven cada vez más afectados por la fragmentación y la regulación; y, en Colombia, se sabe que las represas ponen en peligro a los peces endémicos debido, entre otros, a la migración limitada y la disponibilidad reducida de redes alimenticias basadas en el detrito. Sin embargo, el conocimiento de la ictiofauna nativa afectada por represas en ríos altoandinos es aún incipiente. Objetivo: Evaluar los efectos de la represa del Neusa sobre la ictiofauna. Métodos: Comparamos dos secciones del río, una aguas arriba y otra aguas abajo de la represa con el Sistema Richter IHA, muestreamos tres transectos de 100 m de largo en cada sección, cada dos meses, entre 2017 y 2019. Los peces fueron devueltos al río después de efectuadas las mediciones corporales. Resultados: Recolectamos 729 individuos de cinco familias; los Trichomycterus bogotense eran más pequeños aguas abajo de la represa; Oncorhynchus mykiss fue más pequeño y menos abundante; y no hubo diferencias para Grundulus bogotensis y Eremophilus mutisii. Independientemente de los factores climáticos, O. mykiss y G. bogotensis fueron más abundantes aguas arriba, y E. mutisii y T. bogotense aguas abajo de la represa. Conclusión: Las cinco especies de peces diferían en cómo las poblaciones se diferencian aguas arriba y aguas abajo de la represa, lo que sugiere que algunas se benefician de la represa, mientras que otras se vuelven más pequeñas y menos abundantes.

Abstract Introduction: Tropical rivers are increasingly being affected by fragmentation and regulation; and, in Colombia, dams are known to endanger endemic fishes through, among others, limited migration and reduced availability of sediment-based feeding networks. However, knowledge of native ichthyofauna affected by dams in high Andean rivers is still incipient. Objective: To assess the effects of the Neusa dam on the ichthyofauna. Methods: We compared two rivers' sections, one above and one below the dam with the Richter IHA System, we sampled three 100 m long transects in each section, every two months, between 2017 and 2019. The fishes were returned to the river after body measurements. Results: We collected 729 individuals from five families; Trichomycterus bogotense were smaller under the dam; Oncorhynchus mykiss was smaller and less abundant; and there were no differences for Grundulus bogotensis and Eremophilus mutisii. Independently of climatic factors, O. mykiss and G. bogotensis were more abundant above the dam, and E. mutisii and T. bogotense under the dam. Conclusion: The five fish species differed in how the populations differed above and under the dam, suggesting that some are benefited by the dam, while others become smaller and less abundant.

Effects of nutrient (N, P, K) fertilization on the dynamics of fine roots in tropical rain forests with different soil texture in the Colombian Pacific region

Abstract Introduction: Fine root dynamics include production, turnover and decomposition; they are crucial to forest health, affect the entire biogeochemical complex of the ecosystem, and consequently, they substantially affect carbon balance. However, the influence of environmental factors and soil nutrient limitation on fine roots presents considerable uncertainties and has not been studied in tropical forests with more than 7 000 mm annual rainfall. Objective: To measure the effect of fertilization on fine roots in the high precipitation Chocó forest. Methods: We worked in two sites of the Chocó region, Colombia (August 2014-May 2015), where rainfall exceeds 10 000 mm per year. We applied five fertilization treatments (N, P, K, NPK and Control) to two soil type plots. Soil cylinders were removed at pre-established intervals to measure roots. Results: Phosphorus applications increased fined roots; and more fine roots were produced in sandy than in loam soil. The effects of fertilization were related, but not clearly determined by edaphic conditions. Conclusions: In this Chocó forest, the production of fine roots was higher in sandy and nutrient-rich soils but belowground net primary productivity was limited by the content of edaphic Phosphorus.

Resumen Introducción: La dinámica de las raíces finas incluye producción, rotación y descomposición; son cruciales para la salud de los bosques, afectan todo el complejo biogeoquímico del ecosistema y, en consecuencia, afectan sustancialmente el balance de carbono. Sin embargo, la influencia de los factores ambientales y la limitación de nutrientes del suelo en las raíces finas presenta incertidumbres considerables y no se ha estudiado en bosques tropicales con más de 7 000 mm de precipitación anual. Objetivo: Medir el efecto de la fertilización en las raíces finas en el bosque chocoano de alta precipitación. Métodos: Se trabajó en dos sitios de la región del Chocó, Colombia (agosto 2014-mayo 2015), donde las precipitaciones superan los 10 000 mm anuales. Se aplicaron cinco tratamientos de fertilización (N, P, K, NPK y Control) a dos parcelas por tipo de suelo. Los cilindros de suelo se retiraron a intervalos preestablecidos para medir las raíces. Resultados: Las aplicaciones de fósforo aumentaron las raíces finas; y se produjeron más raíces finas en suelos arenosos que en francos. Los efectos de la fertilización estuvieron relacionados, pero no claramente determinados por las condiciones edáficas. Conclusiones: En este bosque chocoano, la producción de raíces finas fue mayor en suelos arenosos y ricos en nutrientes, pero la productividad primaria neta subterránea estuvo limitada por el contenido de fósforo edáfico.

Hematological reference values for Alouatta palliata (Primates: Atelidae) and Cebus imitator (Primates: Cebidae) from the Pacific Coast of Costa Rica

Abstract Introduction: Wildlife hematological patterns are fundamental for health monitoring, and allows elucidating variations both within and between populations. Among these, hematological parameters are particularly valuable to evaluate the health status of neotropical primate species in the wild. Objective: To define hematological reference values for two species of monkeys in Costa Rica. Methods: During 2014, we collected blood samples from free-ranging mantled howler monkeys, Alouatta palliata (17 females, 18 males) and white-faced capuchin monkeys, Cebus imitator (5 females, 7 males) in seven localities of the Costa Rican Pacific coast. Results: For both species, the hematological values were higher in males, and howler monkey populations differed significantly except for platelets. Conclusions: These hematological values, which differ by sex and locality, will help evaluate the health status of these neotropical primate populations.

Resumen Introducción: Los patrones hematológicos de la vida silvestre son fundamentales para el monitoreo de la salud y permiten dilucidar las variaciones tanto dentro como entre poblaciones. Entre estos, los parámetros hematológicos son particularmente valiosos para evaluar el estado de salud de las especies de primates neotropicales en la naturaleza. Objetivo: Definir valores de referencia hematológicos para dos especies de monos en Costa Rica. Métodos: Durante el 2014 recolectamos muestras de sangre de monos aulladores de manto, Alouatta palliata (17 hembras, 18 machos) y monos capuchinos cariblancos, Cebus imitador (5 hembras, 7 machos) en siete localidades de la costa Pacífica de Costa Rica. Resultados: Para ambas especies, los valores hematológicos fueron mayores en los machos, y las poblaciones de monos aulladores difirieron significativamente con excepción de las plaquetas. Conclusiones: Estos valores hematológicos, que difieren según el sexo y la localidad, ayudarán a evaluar el estado de salud de estas poblaciones de primates neotropicales.

Effects of habitat loss on three insect assemblages in modified ecosystems of foothills of the Colombian Orinoquia

Abstract Introduction: The effects of habitat transformation have been widely studied and the effects are well-known at different levels of biological organization. However, few studies have focused on responses to this process at the level of multiple taxa in diverse taxonomic and functional groups. Objective: Determine the variations in taxonomic and functional diversity of ants, butterflies, and dung beetles, at a spatial and temporal level in a landscape mosaic of the ecoregion of the Colombian foothills. Methods: We assessed amount of natural habitat and landscape composition in four types of vegetation, during the highest and lowest rain periods. We collected butterflies with hand nets and used baited pitfall traps for dung beetles and ants. Results: Habitat loss positively affected ant and butterfly species richness, and negatively affected dung beetles. The abundance of ants and butterflies had a positive effect on the dominance of species in the transformed vegetation, for dung beetles the abundance was negatively affected by the absence of canopy cover. Habitat loss had no negative effect on functional diversity as there is no difference between natural and transformed vegetation. Conclusions: The amount of habitat, habitat connectivity and different types of vegetation cover were important factors in the maintenance of insect diversity in the modified ecosystems of foothills of the Colombian Orinoquia. The lack of a common spatial and temporal pattern shows that studies of multiple insect taxa should be carried out for biodiversity monitoring and conservation processes.

Resumen Introducción: Los efectos de la transformación del hábitat han sido ampliamente estudiados y son bien conocidos los efectos a diferentes niveles de organización biológica. Sin embargo, pocos estudios se han centrado en las respuestas a este proceso a nivel de múltiples taxones en diversos grupos taxonómicos y funcionales. Objetivo: Determinar las variaciones en la diversidad taxonómica y funcional de hormigas, mariposas y escarabajos coprófagos, a nivel espacial y temporal en un mosaico paisajístico de la ecorregión del piedemonte colombiano. Métodos: Evaluamos la cantidad de hábitat natural y la composición del paisaje en cuatro tipos de vegetación, durante los períodos de mayor y menor lluvia. Recolectamos mariposas con redes de mano y usamos trampas de caída con cebo para escarabajos coprófagos y hormigas. Resultados: La pérdida de hábitat afectó positivamente la riqueza de especies de hormigas y mariposas y afectó negativamente a los escarabajos peloteros. La abundancia de hormigas y mariposas tuvo un efecto positivo sobre la dominancia de especies en la vegetación transformada, para los escarabajos coprófagos la abundancia se vio afectada negativamente por la ausencia de cobertura de dosel. La pérdida de hábitat no tuvo un efecto negativo sobre la diversidad funcional ya que no hay diferencia entre la vegetación natural y la transformada. Conclusiones: La cantidad de hábitat, la conectividad del hábitat y los diferentes tipos de cobertura vegetal fueron factores importantes en el mantenimiento de la diversidad de insectos en los ecosistemas modificados del piedemonte de la Orinoquia colombiana. La falta de un patrón espacial y temporal común muestra que se deben realizar estudios de múltiples taxones de insectos para los procesos de monitoreo y conservación de la biodiversidad.

Basic ecology of ant gardens in a dry-premontane transitional forest

Abstract Introduction: “Ant gardens'' are ant nests located at different heights on trees on which vascular epiphytic plants that have been transported and sown by ants have germinated. Although this mutualistic relationship has been studied in humid tropical ecosystems, information on other tropical and Colombian ecosystems is scarce. Objective: To characterize the distribution, building, diversity, demography and phenology of ant gardens in dry tropical forest. Methods: In January and February, 2018, we identified 170 ant gardens on a 100x5 m transect on the banks of the Quesada River, Colombia, and in adjacent secondary dry premontane transitional forest; we monitored changes, for gardens and plants, in 28 of them, every two weeks (March 2018-February 2019). Results: The gardens, built by Azteca ulei, were aggregated near water bodies; had 10 species of epiphytes and were on 13 tree species. Larger gardens had more epiphyte species. Some epiphytes had a bimodal phenological pattern. Less seedlings become established in the dry season, and less adults remain in the gardens. Garden characteristics benefit both epiphytes and ants. Conclusions: The gardens built by A. ulei have ecological characteristics that favor the germination, establishment, and reproduction of diverse epiphytes in this dry tropical ecosystem, including aggregation near water flows.

Resumen Introducción: Los “jardines de hormigas'' son nidos de hormigas en árboles, que se localizan a diferentes alturas, sobre los que germinan plantas epífitas vasculares que han sido transportadas y sembradas previamente por hormigas. Aunque esta relación mutualista ha sido estudiada en ecosistemas húmedos tropicales, la información en otros ecosistemas tropicales y en Colombia, es escasa. Objetivo: Caracterizar la distribución, construcción, diversidad, demografía y fenología de los hormigueros en bosque tropical seco. Métodos: En enero y febrero de 2018, identificamos 170 hormigueros en un transecto de 100x5 m a orillas del río Quesada, Colombia, y en el bosque secundario premontano seco de transición adyacente; monitoreamos cambios, para jardines y plantas, en 28 de ellos, cada dos semanas (marzo 2018-febrero 2019). Resultados: Los jardines, construidos por Azteca ulei, se agregaron cerca de cuerpos de agua; tenían 10 especies de epífitas y estaban sobre 13 especies arbóreas. Los jardines más grandes tenían más especies epífitas. Algunas epífitas tuvieron un patrón fenológico bimodal. Se establecen menos plántulas en la estación seca y quedan menos adultos en los jardines. Las características del jardín benefician tanto a las epífitas como a las hormigas. Conclusiones: Los jardines construidos por A. ulei tienen características ecológicas que favorecen la germinación, establecimiento y reproducción de diversas epífitas en este ecosistema tropical seco, incluyendo la agregación cerca de cursos de agua.

Comparison of fish assemblages recorded by visual census and video census

Abstract Introduction: Underwater visual censuses are the basis of many studies on fish ecology, however, a series of limitations and errors influence the traditional visual estimation of fish richness and abundance. Video techniques have been proposed to mitigate such errors, but there are few studies that compare the effectiveness of both methods. Objective: To compare the estimates obtained through the traditional census and the video census of the fish community of two localities in the central Mexican Pacific. Methods: We studied the fish community of two bays of Huatulco, Oaxaca, Mexico. We established sampling points in each bay and applied a traditional census and a diver-operated video census. We used comparison tests and analysis of similarity tests to compare richness, abundance and diversity by locality; and permutation tests for the same parameters at each sampling point. Results: Both censuses provide similar estimates regarding the richness, abundance, and diversity by locality and by sampling points. There were no statistically significant differences between traditional census and a diver-operated video census in terms of richness, abundance, and diversity. Conclusions: Video census using the diver-operated video technique can be used as a complement or as an alternative to traditional census. Its use can provide a more complete assessment, increase data acquisition, and implement long-term monitoring programs in areas where there are economic limitations for its operation.

Resumen Introducción: Los censos visuales submarinos son la base de muchos estudios sobre ecología de peces, sin embargo, una serie de limitaciones y errores influyen en la estimación visual tradicional de la riqueza y abundancia de peces. Se han propuesto las técnicas de video para mitigar tales errores, pero existen pocos estudios que comparen la efectividad de ambos métodos. Objetivo: Comparar las estimaciones obtenidas mediante el censo tradicional y el video censo de la comunidad de peces de dos localidades del Pacífico central mexicano. Métodos: Se estudió la comunidad de peces de dos bahías de Huatulco, Oaxaca, México. Se establecieron puntos de muestreo en cada bahía y se aplicó el censo tradicional y video censo operado por buzo. Se emplearon pruebas de comparación y análisis de pruebas de similitud para comparar riqueza, abundancia y diversidad por localidad; y pruebas de permutación para los mismos parámetros en cada punto de muestreo. Resultados: Ambos censos proporcionan estimaciones similares en cuanto a la riqueza, abundancia y diversidad por localidad y por punto de muestreo. No existieron diferencias estadísticamente significativas entre el censo tradicional y video censo operado por buzo respecto a riqueza, abundancia y diversidad. Conclusiones: El video censo mediante la técnica de video operado por buzo puede utilizarse como complemento o como alternativa al censo tradicional. Su uso puede proporcionar una evaluación más completa, aumentar la adquisición de datos e implementar programas de monitoreo a largo plazo en áreas donde existen limitaciones económicas para su operación.

Spatio-temporal dynamics of the artisanal fishery of the Gulf of Santa Elena, North Pacific of Costa Rica (2010-2019)

Resumen Introducción: El Pacífico Norte de Costa Rica es una región diversa y productiva; sin embargo, tenemos un escaso conocimiento sobre el estado de los recursos marinos y la dinámica pesquera, particularmente de la pesca artesanal en el Golfo de Santa Elena, uno de los principales caladeros de la zona. Objetivo: Caracterizar la dinámica de esta pesquería. Métodos: Se analizaron los datos recopilados por el Instituto Costarricense de Pesca y Acuicultura y las facturas pesqueras de los sitios de desembarque para el período 2010-2019. Resultados: Hubo una alta variación en la biomasa desembarcada, sin embargo, la captura total por unidad de esfuerzo (CPUE; kg/día) y de las principales especies objetivo no disminuyó significativamente. En general, hubo una CPUE más baja en los meses de surgencia (diciembre-abril). De las 42 especies comerciales reportadas, la mayor biomasa provino del pargo mancha (Lutjanus guttatus; 22 % de la biomasa), el pargo seda (L. peru; 18 %), las cabrillas (Epinephelus spp.; 15 %) y el pulpo (Octopus spp., 13 %). Conclusiones: La CPUE en Santa Elena no ha disminuido significativamente de 2010 a 2019, pero disminuye en la época de surgencia.

Abstract Introduction: The North Pacific of Costa Rica is a diverse and productive region; however, we have a poor understanding of the status of marine resources and fisheries dynamics, particularly for the artisanal fishery in the Gulf of Santa Elena, one of the main fishing grounds of the area. Objective: To characterize the dynamics of this fishery. Methods: We analyzed data collected by the Instituto Costarricense de Pesca y Acuicultura, and sales invoices from landing sites for the period 2010-2019. Results: There was high variation in the landed biomass, however, total catch per unit effort (CPUE; kg/day) and of the main targeted species did not decrease significantly. Overall, there was a lower CPUE in upwelling months (December-April). For the 42 commercial species reported, most biomass was from the spotted rose snapper (Lutjanus guttatus; 22 % of biomass), the Pacific red snapper (L. peru; 18 %), groupers (Epinephelus spp.; 15 %) and octopuses (Octopus spp., 13 %). Conclusions: CPUE at Santa Elena has not declined significantly from 2010 to 2019, but it falls in the upwelling season.

Satellite and historical data, and statistical modeling to predict potential fishing zones for dolphinfish, Coryphaena hippurus (Perciformes: Coryphaenidae) in Colombian Pacific

Abstract Introduction: The prediction of potential fishing areas is considered one of the most immediate and practical approaches in fisheries and is an essential technique for decision-making in managing fishery resources. It helps fishermen reduce their fuel costs and the uncertainty of their fish catches; this technique allows to contribute to national and international food security. In this study, we build different combinations of predictive statistical models such as Generalized Linear Models and Generalized Additive Models. Objective: To predict the spatial distribution of PFZs of the dolphinfish (Coryphaena hippurus L.) in the Colombian Pacific Ocean. Methods: We built different combinations of Generalized Linear Models and Generalized Additive Models to predict the Catch Per Unit Effort of C. hippurus captured from 2002 to 2015 as a function of sea surface temperature, chlorophyll-a concentration, sea level anomaly, and bathymetry. Results: A Generalized Additive Model with Gaussian error distribution obtained the best performance for predicting PFZs for C. hipurus. Model validation was performed by calculating the Root Mean Square Error through a cross-validation approach. The R2 of this model was 50 %, which was considered suitable for the type of data used. January and March were the months with the highest Catch per Unit Effort values, while November and December showed the lower values. Conclusion: The predicted PFZs of C. hippurus with Generalized Additive Models satisfactorily with the results of previous research, suggesting that our model can be explored as a tool for the assessment, decision making, and sustainable use of this species in the Colombian Pacific Ocean.

Resumen Introducción: La predicción de zonas potenciales de pesca se considera uno de los enfoques más inmediatos y efectivos en las pesquerías, es una técnica importante para la toma de decisiones en el manejo de los recursos pesqueros. Ayuda a los pescadores a reducir su costo de combustible y también a disminuir la incertidumbre de sus capturas, esta técnica permite contribuir a la seguridad alimentaria nacional e internacional. En este estudio, se construyeron diferentes combinaciones de modelos estadísticos predictivos como modelos lineales generalizados y modelos aditivos generalizados. Objetivo: predecir la distribución espacial de las zonas potenciales de pesca del pez dorado (Coryphaena hippurus L.) en el Pacífico colombiano. Métodos: La variable de respuesta se expresó en escala de captura por unidad de esfuerzo, es decir, el número de individuos de C. hippurus capturados por un número total de anzuelos disponibles entre 2002 y 2015. Temperatura de la superficie del mar, concentración de clorofila, anomalía del nivel del mar y batimetría, se utilizaron como variables explicativas para los meses de estacionalidad de C. hippurus (noviembre - marzo). Resultados: El modelo con mejor rendimiento para la predicción de zonas potenciales de pesca fue un modelo aditivo generalizado con distribución de error gaussiana y función de enlace de registro, que se seleccionó en función del criterio de información de Akaike, el R2 y la desviación explicada. La validación del modelo se realizó calculando el error cuadrático medio a través de un enfoque de validación cruzada. El ajuste de este modelo fue del 50 %, lo que puede considerarse adecuado para el tipo de datos utilizados. Enero y marzo fueron los meses con mayor captura por unidad de esfuerzo y noviembre-diciembre los meses con menor. Conclusión: Las zonas potenciales de pesca previstas coincidieron satisfactoriamente con investigaciones anteriores, lo que sugiere que nuestro modelo es una herramienta poderosa para la evaluación, toma de decisiones y uso sostenible de los recursos pesqueros de C. hippurus en el Pacífico colombiano.

Effect of abiotic variables on the hyporheic fauna of Dagua River, Colombia

Resumen Introducción: La fauna de sedimentos del subsuelo, donde se da el intercambio entre aguas subterráneas y superficiales, llamada “fauna hiporreica”, cumple funciones ecológicas importantes en los ríos; sin embargo, no ha sido estudiada suficientemente en Colombia. Objetivo: Identificar las relaciones entre los invertebrados hiporreicos y variables fisicoquímicas en el río Dagua, Colombia. Métodos: En tres giras a campo (entre octubre 2017 y diciembre 2018) en cinco estaciones de muestreo a lo largo de la cuenca del río, realizamos perforaciones implementando el método de Karaman-Chappuis (sedimento, agua e invertebrados), y registramos la granulometría y materia orgánica en los sedimentos; además, medimos nutrientes, iones y metales en el agua. Resultados: Las estaciones en la zona de cabecera tuvieron sustratos con sedimentos gruesos (grava y piedra), mayores niveles de oxígeno, y menor temperatura del agua. La riqueza y diversidad de especies fueron mayores en estaciones en la zona cabecera, donde predominaron Copepoda e Insecta, mientras que en sitios de cuenca baja predominaron Arachnida (Hydrachnidiae), Clitellata (Oligochaeta) y Nematoda. Conclusiones: La distribución y abundancia de la fauna hiporreica fueron principalmente influenciadas por cambios en la granulometría del sustrato hiporreico y sus contenidos de materia orgánica.

Abstract Introduction: The fauna from the subsurface sediments where groundwaters and surface waters are exchanged, called “hyporheic fauna”, fulfills important ecological functions in rivers, but has not been sufficiently studied in Colombia. Objective: To identify relationships between hyporheic invertebrates and physicochemical variables in the Dagua River, Colombia. Methods: In three field trips (between October 2017 and December 2018) to five sites along the river basin, we drilled with the Karaman-Chappuis method (sediment, water, and invertebrates), and recorded granulometry and organic matter in sediments; and nutrients, ions, and metals in water. Results: The headwater stations had substrates with coarser sediments (gravel and stone), higher oxygen levels, and lower water temperature. Both richness and species diversity were higher at the headwater stations, dominated by Copepoda and Insecta, while the lower basin was dominated by Arachnida (Hydrachnidiae), Clitellata (Oligochaeta), and Nematoda. Conclusions: The distribution and abundance of the hyporheic fauna were principally influenced by changes in the granulometry of the hyporheic substrate and its content of organic matter.

Effect of riparian deforestation on coarse particulate organic matter in streams with livestock influence in the Andean region of Colombia

Resumen Introducción: La materia orgánica particulada gruesa originada en la vegetación ribereña es la fuente principal de energía en muchas cuencas de cabecera. Sin embargo, la transferencia de dicha materia es alterada por la destrucción de los bosques. Objetivo: Evaluar diferencias en la materia orgánica en quebradas con bosques y con pastizales. Métodos: Comparar las entradas, el almacenamiento y la exportación de esta materia orgánica en el cauce de quebradas con bosques y con pastizales, en la región central de los Andes de Colombia. En cada quebrada, se midieron los aportes verticales y laterales de hojarasca con canastas; hojarasca del lecho de las quebradas con cuadrantes, y la exportación de material con redes de deriva, con un alcance de 100 m. Resultados: Las quebradas con bosques ribereños recibieron un promedio anual de 915 g m-2 de materia orgánica particulada gruesa, exportando un total de 334 g m-3 y almacenando 732 g m-2, valores que fueron significativamente más altos que en quebradas con pastizales, donde los valores correspondientes fueron: 125.4 g m-2; 128 g m-3 y 205.5 g m-2. Conclusiones: La remoción de cobertura boscosa de la zona ribereña reduce la materia orgánica en estas cuencas de cabecera en Colombia.

Abstract Introduction: Coarse particulate organic matter originated in riparian vegetation is the main source of energy in many headwater streams. However, the transfer of such material is altered by the destruction of forests. Objective: To assess flow differences of this organic matter in streams with forests and grasslands. Methods: We compared input, storage and export of this organic matter in the riparian belts of streams with forests, and streams with grasslands, in the central Andean region of Colombia. For each stream, we measured vertical and lateral litter with baskets; stream bed litter with a quadrant, and matter export with drift nets, in a 100 m reach. Results: The streams with riparian forest received an average of 915 g m-2 of coarse particulate organic matter annually, exported a total of 334 g m-3 and stored 732 g m-2, values that were significantly higher than in grassland streams, where the corresponding values were: 125.4 g m-2; 128 g m-3 and 205.5 g m-2. Conclusions: The removal of tree cover from the riparian zone reduced the organic matter in these headwater streams of Colombia.

Predation, reproduction, and development of the lady beetle Hippodamia convergens (Coleoptera: Coccinellidae)

Resumen Introducción: Mantener poblaciones de insectos depredadores en el agroecosistema ofreciéndoles presas y recursos alimenticios provenientes de las plantas es importante para mejorar el control biológico y contribuir con la conservación. Objetivo: Determinar si el consumo de presas y recursos alimenticios florales potencia los atributos biológicos del depredado Hippodamia convergens. Métodos: Las larvas de Hippodamia convergens fueron alimentadas con dos especies de áfidos, mientras que los adultos fueron alimentados con áfidos, espigas de maíz y dos especies de plantas no cultivadas. La presencia de azúcar en el intestino del depredador se comprobó mediante la prueba de antronas frías, y la presencia de polen mediante el método de acetólisis. Los experimentos demográficos se realizaron durante los primeros 40 días después de la emergencia de la hembra bajo condiciones controladas (25 °C ± 0.5; 75 % ± 1.75 HR; L12:D12). Resultados: H. convergens no consumió fructosa de Sorghum halepense, Parthenium hysterophorus o Zea mays, sino únicamente polen. En condiciones controladas (25 °C ± 0.5, 75 % ± 1.75 HR), el tiempo de desarrollo (huevo-adulto) del depredador fue más corto (21.36 días) cuando consumió Rhopalosiphum maidis en lugar de Uroleucon nigrotibium (24.6 días), mientras que la supervivencia (L1- adulto) y la proporción sexual no cambió. La fecundidad promedio fue mayor (55.5 huevos / 40 días) al consumir U. nigrotibium con polen de P. hysterophorus, que solo U. nigrotibium (22.5 huevos / 40 días), o R. maidis con polen de Zea mays (11 huevos / 40 días). La tasa intrínseca de crecimiento natural fue mayor al consumir U. nigrotibium con polen de P. hysterophorus (0.055), que U. nigrotibium (0.034) o R. maidis con polen de Z. mays (0.019). La tasa de depredación (L1-L5) fue mayor al consumir R. maidis (0.65) que U. nigrotibium (0.51). Conclusiones: Las especies de áfidos y su combinación con polen de plantas no cultivadas afectan de manera diferente el tiempo de desarrollo, reproducción y tasa de depredación de H. convergens.

Abstract Introduction: Keeping populations of predatory insects in the agroecosystem by offering them prey, as well as food resources from plants, is important for enhancing conservation biological control. Objective: To determine if the consumption of prey and floral food resources enhances the biological attributes of the predator Hippodamia convergens. Methods: We fed the beetle larvae two species of aphids; and the adults were fed aphids, maize tassels, and two non-cultivated plant species. We checked gut sugar in the predator by the cold anthrone test and pollen presence by the acetolysis method. Demographic experiments were done in the first 40 days after female emergence, under controlled conditions (25 °C ± 0.5; 75 % ± 1.75 Relative Humidity; Light 12 h: Darkness 12 h). Results: H. convergens did not consume fructose, but only pollen from Sorghum halepense, Parthenium hysterophorus or Zea mays. Developmental time (egg-adult) of the predator was shorter (21.4 days) when it consumed Rhopalosiphum maidis than Uroleucon nigrotibium (24.6 days); survival (L1-adult) and sex ratio did not change. Average fecundity was higher (55.5 eggs / 40 days) when consuming U. nigrotibium with pollen from P. hysterophorus, than U. nigrotibium (22.5 eggs / 40 days) or R. maidis with pollen from Zea mays (11 eggs / 40 days). The intrinsic rate of natural growth was higher when consuming U. nigrotibium with pollen from P. hysterophorus (0.055), than U. nigrotibium (0.034) or R. maidis with pollen from Z. mays (0.019). Predation rate (L1-L5) was higher when consuming R. maidis (0.65) than U. nigrotibium (0.51). Conclusions: Aphid prey species and its combination with pollen from maize and non-cultivated plants affected development time, reproduction, and predation rate of H. convergens.

Antifungal potential of biosurfactants produced by strains of Bacillus spp. (Bacillales: Bacillaceae) selected by molecular screening

Abstract Introduction: Bacillus species are used as biological controllers for phytopathogenic fungi, and the mechanisms to produce controllers include biosynthesis of lipopeptide biosurfactants with antifungal activity. Objective: To evaluate the antifungal potential of the biosurfactants produced by Bacillus strains, selected by molecular screening, on Fusarium oxysporum. Methods: We selected four molecular markers, related to the biosynthesis of surfactin, fengicin, and lichenysin (srfA, spf, fenB, LichAA) in nine Bacillus strains. We used two mineral media with several culture conditions, for biosurfactant production, and a well diffusion test for antifungal potential. Results: Only the biosurfactant produced by UFAB25 inhibits the mycelial growth of F. oxysporum (44 % ± 13): this biosurfactant was positive for srfA, spf, and fenB genes involved in the synthesis of surfactin and fengicine. Antifungal activity depends on culture conditions and the strain. Conclusions: Genetic markers are useful to detect strains with antifungal potential, facilitating the selection of bio-controllers. The biosurfactant profile is influenced by the strain and by culture conditions.

Resumen Introducción: Especies de Bacillus han sido empleadas como controladores biológicos contra hongos fitopatógenos. Entre los mecanismos utilizados se destaca la biosíntesis de biosurfactantes lipopeptídicos con actividad antifúngica. Objetivo: Evaluar el potencial antifúngico de los biosurfactantes producidos por cepas Bacillus nativas, previamente seleccionadas mediante tamizaje molecular, sobre Fusarium oxysporum. Métodos: Se utilizaron cuatro marcadores moleculares, relacionados con la biosíntesis de surfactina, fengicina y liquenisina (srfA, spf, fenB, LichAA) sobre nueve cepas de Bacillus. Se utilizaron dos medios minerales con diferentes condiciones de cultivo para la producción del biosurfactante. Se evaluó el potencial antifúngico de los biosurfactantes mediante la prueba de difusión en pozos. Resultados: Se determinó que solo el biosurfactante producido por UFAB25 actúa como inhibidor del crecimiento micelial de Fusarium oxysporum (43.6 % ± 13), esta cepa es positiva para los genes srfA, spf y fenB, involucrados en la síntesis de surfactina y fengicina. La actividad antifúngica depende de las condiciones de cultivo y la cepa. Conclusiones: Los marcadores genéticos ayudan a detectar cepas con potencial antifúngico, facilitando la selección de biocontroladores. El perfil del biosurfactante está influenciado no solo por la cepa, sino también por las condiciones del cultivo.

In vitro culture of hairy roots of the shrub, Phyllanthus acuminatus (Phyllanthaceae)

Resumen Introducción: En condiciones naturales, las raíces del arbusto, Phyllanthus acuminatus, producen bajas concentraciones de metabolitos secundarios de interés medicinal. Esto abre una oportunidad para el cultivo in vitro, para aumentar la concentración de metabolitos. Objetivo: Determinar las condiciones óptimas de cultivo líquido para raíces pilosas de P. acuminatus. Métodos: Se utilizó la evaluación del crecimiento de la biomasa según porcentaje de inóculo inicial (0.50 y 0.10 %), porcentaje de nutrientes de los medios (100, 50 y 25 %) y tasa de agitación (90, 100 y 110 min-1) (N= 15 repeticiones). Resultados: Las mejores condiciones de cultivo líquido fueron: 0.10 % de inóculo inicial, nutrientes al 25 % y 90 min-1 para la tasa de agitación. Hay diferencias entre las raíces pilosas y las raíces no transformadas. Conclusiones: es factible producir raíces pilosas de P. acuminatus a gran escala, aplicando e implementando las condiciones evaluadas de porcentaje de inóculo, nutrientes en el medio y tasas de agitación utilizadas en este estudio.

Abstract Introduction: Under natural conditions, the roots of the shrub, Phyllanthus acuminatus, produce low concentrations of secondary metabolites of medicinal interest. This opens an opportunity for in vitro culture, to increase metabolite concentration. Objective: To determine the optimal liquid culture conditions for hairy roots of P. acuminatus. Methods: We used biomass growth evaluation according to initial inoculum percentage (0.50 and 0.10 %), percentage of medium nutrients (100, 50 and 25 %) and agitation rate (90, 100 and 110 min-1) (N=15 replications). Results: The best liquid culture conditions were: 0.10 % of initial inoculum, nutrients at 25 % and 90 min-1 for the agitation rate. There are differences among hairy roots and non-transformed roots. Conclusions: It is feasible to produce P. acuminatus hairy roots at a large scale, applying and implementing the evaluated conditions of inoculum percentage, nutrients in the medium and agitation rates.

El mejillón Semimytilus patagonicus (Mytilida: Mytilidae) y el gusano Pseudonereis gallapagensis (Phyllodocida: Nereididae) como herramientas ecotoxicológica para la contaminación por detergentes en ambientes marinos

Abstract Introduction: The bivalve Semimytilus patagonicus is a potentially useful bioindicator because of its feeding mechanism, and the worm Pseudonereis gallapagensis is also interesting as a bioindicator because it is benthonic, abundant, and a food source for the squid Doryteuthis gahi. However, their sensitivity to contaminants has not been sufficiently studied. Objective: To test the usefulness of the mussel Semimytilus patagonicus and the polychaete Pseudonereis gallapagensis as ecotoxicological tools for detergents in the marine environment. Methods: We used 120 individuals of S. patagonicus from Miraflores and 120 of P. gallapagensis from Barranco (both near the city of Lima, Peru). For the bioassays, we used two anionic detergents (active ingredient, ai, Sodium Dodecylbenzene Sulfonate). For S. patagonicus, with an average valve length of 32.3 ± 6.4 mm, we tested “Double power Ariel®” (90 %) at concentrations of 17.5, 35, 70 and 140 mg ai l-1, evaluated after 48 and 72 h of exposure; and for P. gallapagensis, with a total body length of 20.4 ± 8.8 mm, we tested “Caricia®” at 62.5, 125, 250, 500 and 1 000 mg of ai l-1 at 24, 48 and 72 h of exposure. Results: The LC50 values (Mean Lethal Concentration) were 34.95 mg ia l-1 for S. patagonicus and 102.48 mg ia l-1 for P. gallapagensis at 72 h of exposure. The detergents were toxic for S. patagonicus and slightly toxic for P. gallapagensis. The risk classification for S. patagonicus is “harmful” and for P. gallapagensis “not classifiable”. Conclusions: These two bioindicators allow evaluating the acute toxicity of SDBS-based commercial detergents in the marine aquatic environment.

Resumen Introducción: El bivalvo Semimytilus patagonicus es un bioindicador potencialmente útil por su mecanismo de alimentación, y el gusano Pseudonereis gallapagensis también es interesante como bioindicador por ser bentónico, abundante y fuente de alimento para el calamar Doryteuthis gahi. Sin embargo, su sensibilidad a los contaminantes no ha sido suficientemente estudiada. Objetivo: Probar la utilidad del mejillón S. patagonicus y el poliqueto P. gallapagensis como herramientas ecotoxicológicas para detergentes en el medio marino. Métodos: Se utilizaron 120 individuos de S. patagonicus de Miraflores y 120 de P. gallapagensis de Barranco (ambos cerca de la ciudad de Lima, Perú). Para los bioensayos se utilizaron dos detergentes aniónicos (ingrediente activo, ia, dodecilbenceno sulfonato de sodio). Para S. patagonicus, con una longitud valver promedio de 32.3 ± 6.4 mm, probamos Ariel Doble Poder® (90 %) a concentraciones de 17.5, 35, 70 y 140 mg·ia·l-1, evaluadas a las 48 y 72 h de exposición; y para P. gallapagensis, con una longitud corporal total de 20.4 ± 8.8 mm, probamos Caricia® a 62.5, 125, 250, 500 y 1 000 mg·ia·l-1 a las 24, 48 y 72 h de exposición. Resultados: Los valores de CL50 (Concentración Letal Media) fueron de 34.95 mg·ia·l-1 para S. patagonicus y 102.48 mg·ia·l-1 para P. gallapagensis a las 72 h de exposición. Los detergentes fueron tóxicos para S. patagonicus y levemente tóxicos para P. gallapagensis. La clasificación de riesgo para S. patagonicus es “nocivo” y para P. gallapagensis “no clasificable”. Conclusiones: Estos dos bioindicadores permiten evaluar la toxicidad aguda del detergente comercial a base de SDBS en el ambiente acuático marino.

Patterns of vertebrate biodiversity in a tropical dry and mangrove forest matrix

Abstract Introduction: Tropical dry forests and mangroves, two of the world’s most endangered ecosystems, each host a different set of environmental conditions which may support unique assemblages of species. However, few studies have looked at the unique vertebrate biodiversity in regions where both habitats occur side-by-side. Objective: To assess the vertebrate diversity and patterns of habitat usage in a mangrove and tropical dry forest matrix in an unprotected region of Northwestern Costa Rica. Methods: The study was conducted in a 7 km2 matrix of mangrove and tropical dry forests between Cabuyal and Zapotillal bays in Northwestern Costa Rica, south of Santa Rosa National Park. From September 2017 to March 2018, we used 13 automatic camera traps over 1 498 trap days to capture species utilizing the region and assess their patterns of habitat usage both spatially and temporally. Results: Seventy vertebrate species from 42 families in 27 orders were detected, including several globally threatened species. Over half of all species were detected in only one habitat, particularly amongst avian (78 %) and mammalian (42 %) species. Tropical dry forests hosted the greatest number of unique species and supported a greater percentage of herbivores than mangrove or edge habitats, which were dominated by carnivorous and omnivorous species. Mean detections per camera trap of all species increased significantly from the coldest and wettest month (Oct) to the hottest and driest months (Jan & Feb) in tropical dry forests. Sample-based rarefaction analysis revealed that survey length was sufficient to sample the tropical dry forest and edge habitats, though mangroves require further sampling. Conclusions: Taxa found to utilize different forest types may utilize each for different stages of their life cycle, moving between areas as environmental conditions change throughout the year. General patterns of global biodiversity favoring carnivore and omnivore usage of mangrove forests was confirmed in our study.

Resumen Introducción: Los bosques secos tropicales y los manglares, dos de los ecosistemas más amenazados del mundo, albergan cada uno un grupo de condiciones ambientales que pueden albergar conjuntos únicos de especies. Sin embargo, pocos estudios han analizado la biodiversidad única de vertebrados en regiones donde ambos hábitats se encuentran uno al lado del otro. Objetivo: Evaluar la diversidad de vertebrados y los patrones de uso del hábitat en una matriz de manglar y bosque seco tropical en una región no protegida del noroeste de Costa Rica. Métodos: El estudio se realizó en una matriz de 7 km2 de manglares y bosques secos tropicales en las bahías de Cabuyal y Zapotillal en el noroeste de Costa Rica, al sur del Parque Nacional Santa Rosa. De septiembre 2017 a marzo 2018, utilizamos 13 cámaras trampa automáticas durante 1 498 días trampa para capturar especies que utilizan la región y evaluar sus patrones de uso espacial y temporal del hábitat. Resultados: Se detectaron 70 especies de vertebrados de 42 familias y 27 órdenes, incluidas varias especies amenazadas a nivel mundial. Más de la mitad de todas las especies se encontraron en un solo hábitat, particularmente aves (78 %) y mamíferos (42 %). Los bosques secos tropicales albergan el mayor número de especies únicas y sustentan un mayor porcentaje de herbívoros que los hábitats de borde de manglares, que estaban dominados u hospedados por especies carnívoras y omnívoras. Las detecciones promedio por cámara trampa de todas las especies aumentaron significativamente desde el mes más frío y húmedo (octubre) hasta los meses más cálidos y secos (enero y febrero) en los bosques secos tropicales. El análisis de rarefacción basado en muestras reveló que la duración del estudio fue suficiente para muestrear los hábitats de bosque seco tropical y de borde, aunque los manglares requieren más muestreo. Conclusiones: Se encontró que los taxones pueden usar varios tipos de bosque en las diferentes etapas de su ciclo de vida, moviéndose entre áreas a medida que las condiciones ambientales cambian a lo largo del año. En nuestro estudio se confirmaron patrones generales de la biodiversidad global que favorecen el uso de los bosques de manglar por parte de carnívoros y omnívoros.

Seagrass density correlates with burrow abundance and size in the Zebra Mantis Shrimp (Stomatopoda: Lysiosquillidae)

Abstract Introduction: Mantis shrimps are ecologically and economically important organisms in marine ecosystems. However, there is still a lack of information about their habitat, in particular, their burrows. Objective: To analyze how dense and sparse mantis shrimp burrows differ in abundance, size, sediment grain size, and water quality. Methods: We counted burrows in 10 x 10 m2 random plots in sparse and dense seagrass (ten plots per density), around Barrang Lompo Island, South Sulawesi, Indonesia. Sampling took place at spring low tide from August to September 2017. Results: Two mantis shrimp species were observed: Lysiosquillina maculate and L. sulcata. Dense and sparse seagrass burrows did not differ in wall grain size or water parameters, both inside and outside of the burrows (P > 0.05). Similarly, there was no correlation between burrow depth and diameter in either dense (P > 0.05; r= 0.27) or sparse (P > 0.05; r= 0.33) seagrass. However, larger burrows tend to occur in denser beds, but there were more burrows in denser seagrass (t-test, P < 0.05). Conclusions: There seems to be a preference for dense seagrass beds, especially by larger mantis shrimps. The correlation between shrimp burrow abundance and seagrass density highlights the importance of conserving the quality as well as the extent of seagrass habitat.

Resumen Introducción: Los camarones mantis son organismos ecológica y económicamente importantes en los ecosistemas marinos. Sin embargo, aún falta información sobre su hábitat, en particular sobre sus madrigueras. Objetivo: Analizar cómo difieren las madrigueras de los camarones mantis en su abundancia, tamaño, tamaño de grano de los sedimentos y calidad del agua. Métodos: Contamos las madrigueras en parcelas de 10 x 10 m2 al azar (diez parcelas por densidad) en pastos marinos densos y poco densos, alrededor de la isla de Barrang Lompo, Sulawesi del Sur, Indonesia. Resultados: Se observaron dos especies de camarones mantis: Lysiosquillina maculata y L. sulcata. El tamaño de grano de las paredes de las madrigueras y los parámetros de agua, tanto dentro y fuera de la madriguera no variaron (P > 0.05). Tampoco hubo correlación entre la profundidad y el diámetro de las madrigueras, tanto en praderas densas (P > 0.05; r= 0.27), como no densas (P > 0.05; r= 0.33). Sin embargo, las madrigueras más grandes tienden a aparecer en las praderas densas, además había más madrigueras en pastos densos (t-test, P < 0.05). Conclusiones: Parece haber una preferencia por las praderas marinas densas, especialmente en los camarones mantis de mayor tamaño. La correlación entre la abundancia de madrigueras de camarones y la densidad de pastos marinos pone de manifiesto la importancia de conservar la calidad del hábitat de los pastos, así como su extensión.

Mating behavior of the lemon shark, Negaprion brevirostris (Carcharhiniformes: Carcharhinidae), as revealed by citizen science in the Equatorial Atlantic Ocean

Abstract Introduction: Knowledge on the mating behavior and habitat requirements of large sharks, including the lemon shark, Negaprion brevirostris, is scarce, hampering conservation efforts. Objective: To describe an area in the Equatorial Atlantic used as a mating ground by N. brevirostris, as well as part of the species pre-copulatory behaviors based on citizen reports. Methods: Between 2004 and 2019, recreational divers, dive guides and rangers from the Marine Protected Area (MPA) in Fernando de Noronha Archipelago (FEN) recorded courtship behaviour, females with mating scars, pregnant females, and adult males. Results: N. brevirostris was recorded mating in shallow waters (0.5-2 m deep) during the austral summer (December to March). A specific location in the MPA, Buraco da Raquel lagoon, was the main aggregation and mating site for adult N. brevirostris in FEN. Conclusions: Citizen science records allowed the identification of shallow waters as key sites for the reproduction of this shark in FEN. Results highlight the potential of citizen science contributions to knowledge of sharks in nature and show MPAs as essential for habitat conservation of sharks with decreasing populations along the Brazilian coast, such as N. brevirostris. We present management recommendations to protect N. brevirostris there and elsewhere.

Resumen Introducción: El conocimiento sobre el comportamiento reproductivo y requisitos de hábitat de apareamiento de los tiburones grandes, incluido el tiburón limón, Negaprion brevirostris, es escaso, lo que dificulta los esfuerzos de conservación. Objetivo: Describir un área en el Océano Atlántico ecuatorial utilizada como zona de apareamiento y las interacciones precopulatorias del tiburón limón con base en informes proporcionados por ciencia ciudadana. Métodos: Buzos recreativos, guías de buceo y guardaparques del Área Marina Protegida (AMP) en el archipiélago Fernando de Noronha (FEN) llevaron registros de comportamientos de cortejo, hembras con cicatrices de apareamiento, hembras preñadas y machos adultos, entre 2004 y 2019. Resultados: Las aguas poco profundas entre 0.5 y 2 m de profundidad son utilizadas como áreas de apareamiento por N. brevirostris durante el verano austral (diciembre a marzo). Un lugar específico, dentro del AMP (laguna de Buraco da Raquel), fue identificado como el principal sitio de agregación y apareamiento de adultos de N. brevirostris en FEN. Conclusiones: Registros de ciencia ciudadana permitieron identificar aguas poco profundas como sitios clave para la reproducción de este tiburón en FEN. Los resultados resaltan el potencial de las contribuciones de la ciencia ciudadana al conocimiento de los tiburones en la naturaleza y muestran que las AMP son esenciales para la conservación del hábitat de tiburones con poblaciones decrecientes a lo largo de la costa brasileña, como N. brevirostris. Presentamos recomendaciones de gestión para proteger a N. Brevirostri, allí y en otros lugares.

Sexual proportion and hermaphroditism of the mollusc, Anadara tuberculosa (Bivalvia: Arcidae) in Panama

Resumen Introducción: El bivalvo Anadara tuberculosa es un recurso pesquero y económico importante en el Pacífico Este Tropical. La proporción sexual varia a lo largo de su área de distribución, con casos de aparición de hermafroditismo, ocasional para algunas poblaciones, normal en otras. Estas características podrían ser una respuesta a presiones antropogénicas y ambientales. Objetivo: Evaluar la proporción sexual y el hermafroditismo en la especie en el Pacífico de Panamá. Métodos: Se analizó información reproductiva de A. tuberculosa generada entre 1994 y 2020 para el Golfo de Montijo, así como datos de 2017 para el manglar de David. Se aplicaron procedimientos macroscópicos, contrastados con histológicos y se generó un factor de corrección para ajustar la proporción sexual macroscópica, debido al efecto, sobre la proporción sexual, que ocasiona los organismos indeterminados. Resultados: Para el Golfo de Montijo, la histología indicó una proporción sexual hembra a macho de 1:1 hasta 3.2:1, entre 1994 y 2017, mientras que la macroscopía varió de 1.9:1 a 5.1:1 entre 2004 y 2020. Para el manglar de David, la histología indicó una proporción sexual de 3.7:1, y de 7.9:1 por macroscopía en el 2017. En ambas localidades, especímenes más grandes mostraron mayor variación en la proporción sexual, pese a la técnica implementada, así como hermafroditismo protándrico no casual en el 2017. Conclusiones: La aparición del hermafroditismo protándrico y los cambios en la proporción sexual indican que la población de A. tuberculosa, en ambas localidades, está respondiendo a presiones antropogénicas y ambientales.

Abstract Introduction: The bivalve Anadara tuberculosa is an important fishery in the Eastern Tropical Pacific. The sex ratio varies along its geographic range and there are cases of hermaphroditism, occasional in some populations, normal in others. These characteristics may be a response to anthropogenic and environmental pressure. Objective: To evaluate sex ratio and hermaphroditism of the species in the Panamanian Pacific. Methods: Data on reproductive features of A. tuberculosa generated between 1994 and 2020 for Gulf of Montijo, as well as 2017 data from mangroves of David was analyzed. Macroscopic diagnosis of individual sex is sensitive to the problem of indeterminate individuals, which in turn can skew the sex ratio analysis; therefore, the macroscopic method was compared with histological sections to generate a correction factor to adjust the macroscopically determined sex ratio. Results: For Montijo, histology indicated that the female to male sex ratio ranged from 1:1 to 3.2:1 between 1994 and 2017, while macroscopy indicated 1.9:1 to 5.1:1 between 2004 and 2020. For David, histology indicated a ratio of 3.7:1, and macroscopy 7.9:1. At both localities, larger specimens had more sex ratio variation, independently of the technique, and there was non-casual protandric hermaphroditism in 2017. Conclusion: The occurrence of protandric hermaphroditism and sex ratio changes suggest anthropogenic and environmental pressure in all populations.

Immunological mechanisms in Cnidaria: A highly complex basal immune system with bioprospective interest

Resumen Introducción: La protección ante agentes biológicos propios y externos de los cnidarios dependen de la inmunidad innata, la cual consta de tres procesos inmunológicos principales: 1) reconocimiento inmunológico, 2) señalización intracelular, y 3) respuesta efectora. Objetivo: Revisar críticamente el conocimiento actual del repertorio molecular involucrado en la respuesta inmune en cnidarios, así como, su papel en el establecimiento de la simbiosis, y las posibles aplicaciones biotecnológicas de las moléculas involucradas en el proceso de inmunidad. Métodos: Se realizó una revisión de artículos científicos encontrados a través de las bases de datos del NCBI, Google Scholar y Scielo, con palabras claves como inmunidad y/o reconocimiento inmunológico en cnidarios, en una ventana de tiempo de la última década, sin descartar literatura clásica más antigua. Resultados: El reconocimiento inmunológico consiste en receptores inmunológicos que reconocen patrones moleculares e inducen respuestas efectoras como la movilización de moléculas al sitio de la infección, la ingestión microbiana y la formación de moléculas que activan cascadas de señalización. La fase de señalización involucra mediadores de la traducción de señales que activan genes de trascripción, y cascadas de señalización intracelular que inician respuestas de defensa adecuadas. Las respuestas efectoras incluyen la capa superficial del mucus, péptidos antimicrobianos, especies reactivas de oxígeno y la respuesta celular mediada por fagocitosis. Por último, se presenta un esquema y una tabla integral de las vías de respuesta inmune en los cnidario. Conclusiones: La inmunidad en Cnidaria está mediada por mecanismos de defensa complejos integrados por receptores de reconocimiento de patógenos, vías de señalización intracelular, células y moléculas efectoras encargadas de la eliminación del patógeno, y reconocimiento-aceptación de simbiontes. El estudio de compuestos activos del sistema inmune en Cnidaria ha sido poco explorado, sin embargo, el trabajo realizado con otros compuestos presentes en las toxinas de este filo, los sitúa como una fuente importante de moléculas antimicrobianas dignas de un análisis de bioprospección.

Abstract Introduction: Cnidarians depend on innate immunity for protection against both their own and external biological agents. It consists of three main immunological processes: 1) immune recognition, 2) intracellular signaling, and 3) effector response. Objective: To critically review current knowledge of the molecular repertoire involved in the immune response in cnidarians, its role in symbiosis, and possible biotechnological applications. Methods: We used keywords such as immunity, and immunological recognition in cnidarians, in the NCBI, Scielo and Google Scholar databases, for the last decade. Results: Cnidarian immune recognition consists of molecular pattern receptors and responses such as the mobilization of molecules to the site of infection, microbial ingestion, and the formation of molecules that activate signaling cascades. The signaling phase involves translation mediators that activate transcriptional genes and intracellular signaling cascades that initiate defenses. Effector responses include surface layer mucus, antimicrobial peptides, reactive oxygen species, and the cellular response mediated by phagocytosis. Conclusions: Immunity in Cnidaria is mediated by complex defense mechanisms composed of pathogen recognition receptors, intracellular signaling pathways, effector cells and molecules responsible for pathogen elimination, and recognition of symbionts. There is a potential for toxin compounds useful as antimicrobial molecules.

Natural revegetation of areas impacted by gold mining in the tropical rain forest of Chocó, Colombia

Resumen Introducción: La minería de oro a cielo abierto ocasiona impactos drásticos sobre los bosques naturales en regiones tropicales de alta biodiversidad, y la eficiencia de “revegetación”, un proceso de resembrar y reconstruir el suelo, continúa siendo poco estudiado. Objetivo: Evaluar el efecto del tiempo sucesional y la distancia al bosque de referencia sobre la estructura biológica y composición de especies en minas de oro revegetadas. Métodos: Realizamos inventarios de vegetación en minas abandonadas en el bosque tropical lluvioso de Chocó, Colombia. Las minas contaban con 6, 10, 15, 19 y 24 años de sucesión natural. En cada escenario, establecimos cuatro parcelas de 2×50 m: a 50 m y 100 m de distancia desde el borde bosque-mina (ecotono). Resultados: Se identificaron 300 especies (193 géneros y 75 familias). La riqueza, diversidad y equitatividad cambian poco con el tiempo sucesional en las minas, pero alcanzan valores superiores en el bosque de referencia. La composición de especies es similar entre las minas con distinto tiempo sucesional, pero difiere ampliamente del bosque de referencia (solo 7 % de semejanza). La calidad del sustrato y las estrategias reproductivas de plantas herbáceas (principalmente Cyperaceae y Melastomataceae) y arbóreas (Cespedesia spathulata y Miconia reducens) que crecen espontáneamente en las minas, juegan un papel importante en la revegetación natural temprana. Conclusiones: 24 años de sucesión natural es poco tiempo para apreciar una recuperación sustancial de la vegetación en las minas si se compara con el bosque, y la distancia desde el ecotono parece no tener efecto significativo; sin embargo, la calidad de sustrato y estrategias reproductivas de plantas herbáceas son importantes en la etapa temprana de recuperación de las áreas impactadas por la minería de oro en Chocó.

Abstract Introduction: Open pit gold mining causes drastic impacts on natural forests in tropical regions of high biodiversity, and the efficacy of “revegetation”, a process of replanting and rebuilding the soil, is still poorly studied. Objective: To evaluate the effect of successional time, and distance to the reference forest, on the biological structure and species composition of revegetated gold mines. Methods: We inventoried the adjacent forest and abandoned gold mines in the tropical rain forest of Chocó, Colombia. The mines had 6, 10, 15, 19 and 24 years of natural succession. In each scenario, we set four 2 × 50 m plots: two 50 m and two 100 m from the forest-mine edge (ecotone). Results: We identified 300 plant species (193 genera, 75 families). The richness, diversity and evenness changed little with successional time in the mines but reached higher values in the forest. The species composition was similar between the mines with different successional times but differed widely from the forest (only 7 % similarity). The substrate quality and reproductive strategies of herbaceous plants (mainly Cyperaceae and Melastomataceae) and trees (Cespedesia spathulata and Miconia reducens) that grow spontaneously in the mines, play an important role on the early natural revegetation. Conclusions: The 24 years of natural succession have been insufficient to reach a community of a complexity similar to that of the forest, and distance from the ecotone has no significant effect; however, the substrate quality and reproductive strategies of herbaceous plants are important in the early stages of mine recovery in the Chocó.

Fruit-feeding butterflies (Lepidoptera: Nymphalidae) in eucalyptus plantations and gallery forests in the Colombian Orinoquia

Resumen Introducción: Una actividad económica que ha tenido auge en la última década en la altillanura es la forestación de sabanas con alteraciones antrópicas, pero se desconoce su papel en la conservación de las mariposas frugívoras de los bosques de galería dentro de los núcleos forestales. Objetivo: Comparar la diversidad de mariposas frugívoras en plantaciones de eucalipto y bosques de galería, y el papel de las variables ambientales. Métodos: Utilizamos trampas Van Someren-Rydon, dos réplicas de cuatro trampas, en cada uno de los cuatro hábitats muestreados simultáneamente desde diciembre 2020 hasta julio 2021: plantación de eucaliptos de cuatro años; plantación de eucaliptos de seis años; bosque de galería de suelo seco y bosque de galería anegado. También registramos diez variables abióticas, estructurales, alimentarias y de hábitat. Resultados: Recolectamos 227 especímenes de mariposas frugívoras (30 especies, 23 géneros y 5 subfamilias de la familia Nymphalidae). Había más especies en los bosques. Las especies de mariposas variaron más del 50 % entre los hábitats; Satyrinae fue más diversa en las plantaciones. Conclusión: La forestación en esta área proporciona hábitats para algunas especies de mariposas frugívoras de los remanentes de bosques naturales adyacentes. Las forestaciones representan un escenario de alteración intermedia entre las dos unidades de paisaje dominantes en la región.

Abstract Introduction: An economic activity that has boomed in the last decade in Colombian highlands is the afforestation of anthropized savannas, but its role in the conservation of fruit-feeding butterflies of gallery forests within forest cores is unknown. Objective: To compare the diversity of fruit-feeding butterflies in eucalyptus plantations and gallery forests, and the role of environmental variables. Methods: We used Van Someren-Rydon traps, two replicates of four traps, on each of four habitats sampled simultaneously from December 2020 to July 2021: four-years-old eucalyptus plantation; six-years-old eucalyptus plantation; dry soil gallery forest and waterlogged gallery forest. We also recorded ten abiotic, structural, food and habitat variables. Results: We collected 227 specimens of fruit-feeding butterflies (30 species, 23 genera, and 5 subfamilies within the family Nymphalidae). There were more species in the forests. The butterfly species varied over 50 % between the habitats; Satyrinae were more diverse in plantations. Conclusion: Afforestation in this area provides habitats for some species of fruit-feeding butterflies from adjacent natural forest remnants. Afforestations represent an intermediate disturbance scenario between the two dominant landscape units in the region.

The role of spine length in crustacean and fish associations with echinoids at Los Cabos, Baja California Sur, Mexico

Abstract Introduction: Echinoids (sea urchins) provide shelter for a variety of facultative or obligatory ectosymbionts. Objective: To evaluate the hypothesis that decapods and fishes prefer to associate with echinoid individuals and species that have longer spines. Methods: We visually studied the frequency of decapod crustaceans and fishes associated with echinoids in shallow water (< 4 m) and deeper water (5-20 m) at Los Cabos, Baja California Sur, Mexico, during 1-6 January 2019. Results: We inspected 1 058 echinoids of six species. Five decapod species associated with three species of echinoids. When compared with other echinoid species, in shallow water, decapods associated 5.1 times more often with the longest-spined echinoid Diadema mexicanum (7.0 times more decapods per individual D. mexicanum); in deeper water, association frequency was similar for all echinoid species. Fourteen fish species associated with four echinoid species. In shallow water, fishes associated 2.6 times more with D. mexicanum (4.5 times more fishes per individual). There was no preferred echinoid species in deeper water. Longer-spined D. mexicanum had more decapods and fishes. Associations were more frequent in shallow water. Multiple individuals and species of decapods and fish often associated together with a single D. mexicanum. The decapod that presumably is Tuleariocaris holthuisi showed a possible obligatory association with one of the equinoids (D. mexicanum); the other decapods and all fish species are facultative associates. Conclusion: Our results support the hypothesis that decapods and fishes associate most frequently with echinoids with the longest spines, presumably to reduce the risk of predation.

Resumen Introducción: Los equinoideos (erizos de mar) brindan refugio a una variedad de ectosimbiontes facultativos u obligatorios. Objetivo: Evaluar la hipótesis de que los decápodos y los peces prefieren asociarse con individuos y especies de equinoideos con espinas más largas. Métodos: Estudiamos visualmente la frecuencia de crustáceos decápodos y peces asociados con equinoideos en aguas poco profundas (< 4 m) y aguas más profundas (5-20 m) en Los Cabos, Baja California Sur, México, del 1-6 de enero 2019. Resultados: Examinamos 1 058 equinoideos de seis especies. Cinco especies de decápodos se asociaron con tres especies de equinoideos. Al comparar con otras especies de equinoideos, en aguas poco profundas, los decápodos se asociaron 5.1 veces más frecuentemente con la especie de equinoideo de espinas más largas, Diadema mexicanum (7.0 veces más decápodos por individuo en D. mexicanum); en aguas más profundas, la frecuencia fue similar para todas las especies de equinoideos. Catorce especies de peces se asociaron con 4 especies de equinoideos. En aguas poco profundas, los peces se asociaron 2.6 veces más con D. mexicanum (4.5 veces más peces por individuo). No hubo preferencia por una especie de equinoideo en aguas más profundas. Individuos de D. mexicanum con espinas largas tuvieron más asociación con decápodos y peces. Las asociaciones se dieron con mayor frecuencia en aguas poco profundas. Múltiples individuos y especies de decápodos y peces a menudo se asociaron con un solo D. mexicanum. Un decápodo que presumiblemente es Tuleariocaris holthuisi mostró una posible asociación obligatoria con uno de los equinoideos (D. mexicanum); las otras especies de decápodos y todas las especies de peces presentaron asociaciones facultativas. Conclusión: Nuestros resultados apoyan la hipótesis de que los decápodos y los peces se asociaron con mayor frecuencia con los equinoideos con las espinas más largas, presumiblemente para reducir el riesgo de depredación.

Pheno-morphology of two paramo species of Miconia (Melastomataceae): optimization of flowering and fructification to enhance dispersal

Resumen Introducción: El Páramo es uno de los ecosistemas más afectados por actividades humanas, lo que aumenta la necesidad de estudios fenológicos como base para el manejo y la conservación. Objetivo: Describir la feno-morfología de Miconia ligustrina y Miconia elaeoides. Métodos: De septiembre 2019 a febrero 2020, y de abril 2021 hasta agosto del mismo año, se monitoreó la fenología de 12 individuos de cada especie. Adicionalmente, se vincularon datos fenológicos de ejemplares de herbario, para corroborar los resultados obtenidos. En los dos conjuntos de datos, se describió su distribución usando estadística circular, además, se obtuvieron registros de precipitación y temperatura del área. Adicionalmente, se describió la morfometría de cada especie. Resultados: El pico de floración de M. lingustrina es en abril, y la fructificación se concentra entre junio y julio; M. elaoides, florece de forma masiva en enero, con la máxima producción de frutos en mayo. Hubo correlación entre fenología y lluvias: la floración se da en época seca y la fructificación en la época lluviosa. Las especies difieren en morfología, pero, como en otras especies de Miconia, las flores y frutos son pequeños (aprox. 5 mm). Conclusión: La floración se presenta en la época seca y la fructificación en la época lluviosa, cuando las tasas de fotosíntesis son bajas y la frugivoría incrementa. Este patrón fenológico favorece la dispersión óptima de semillas.

Abstract Introduction: Paramos are among the ecosystems that are most affected by anthropic activities, increasing the need for phenological studies as a basis for management and conservation. Objective: To describe the pheno-morphology of Miconia ligustrina and Miconia elaeoides. Methods: From September 2019 to February 2020, and from April 2021 to August of the same year, the phenology of 12 individuals of each species was monitored. Additionally, phenological data of herbariums were linked to corroborate obtained results. In the two data sets, distribution of data was described using circular statistics; in addition, we recorded the precipitation and temperature in the area. Additionally, we described the morphometry of each species. Results: The flowering peak of M. ligustrina is in April, and fruiting concentrates between June and July; in M. elaeoides, flowering is massive in January, and the highest fruit production in May. The phenology was correlated with rainfall: flowering takes place in the dry season and fruiting in the rainy season. The species differ morphologically, but, as in other Miconia species, the flowers and fruits are small (approx. 5 mm). Conclusions: Flowering occurs in the dry season and fructification in the rainy season, when the photosynthetic rate is low and frugivory increases. This phenological pattern favors optimal seed dispersal.

Adaptation to the undergrowth of a community of Andean palms (Arecaceae) from the vital rates perspective

Resumen Introducción: Las palmas tienen adaptaciones para prosperar en el entorno limitante del sotobosque, que se pueden examinar a partir del estudio de las tasas de supervivencia, crecimiento y fecundidad. Sin embargo, los estudios que abordan las estrategias de tasas vitales desarrolladas por una comunidad de palmas para habitar el sotobosque del bosque son escasos. Objetivo: Determinar y comparar las tasas vitales de supervivencia, crecimiento y fertilidad en una comunidad de palmas de sotobosque andino. Métodos: El estudio se realizó en el Parque Natural Chicaque, Colombia. En un área de 0.07 ha, donde se estudiaron las especies Chamaedorea linearis, C. pinnatifrons, Geonoma orbignyana y G. undata. Durante 2018 a 2019 se recolectaron datos correspondientes a supervivencia, crecimiento y fecundidad. Las tasas vitales se estimaron a partir de su relación con el tamaño de los individuos. Resultados: Se registraron un total de 597, 687, 453 y 690 individuos en 0.1 ha de C. linearis, C. pinnatifrons, G. orbignyana y G. undata, respectivamente. Las cuatro especies tuvieron una alta supervivencia de plántulas, bajas tasas de crecimiento en individuos sin tallo, baja producción de hojas, pocas hojas totales, una alta longevidad de las hojas, e inicio de la reproducción con un tallo de baja altura. No obstante, hubo diferencias entre las especies en las que G. orbignyana y C. pinnatifrons presentaron patrones comúnmente vistos en las palmas del sotobosque. Por el contrario, C. linearis y G. undata tienen estrategias de crecimiento mixtas para hacer frente a los espacios abiertos y las condiciones del sotobosque, ya que sus hojas y copas son más grandes, tienen mayores tasas de crecimiento del tallo y la reproducción comienza a mayor altura. En cuanto a los géneros, las Chamaedoreas tuvieron unas tasas de crecimiento y reproducción altas, pasando la mayor parte de su vida como adultos. Por su parte, las Geonomas priorizan la permanencia de los individuos, con sus ciclos de vida largos, tasas de crecimiento más bajas. Conclusiones: Las Chamaedoreas priorizan crecimiento y reproducción, mientras que las Geonomas priorizan la permanencia. Las condiciones limitantes del sotobosque parecen favorecer estas dos estrategias de crecimiento típicas de las especies estudiadas. Estos resultados pueden considerarse como un paso hacia el conocimiento de las estrategias de la coexistencia de las comunidades de palmeras en los bosques.

Abstract Introduction: Palms have adaptations to thrive in the limiting environment of the understory, which can be examined from studying their survival, growth and fecundity rates. However, studies that address the vital rates strategies developed by a community of palms to successfully inhabit the forest understory are scarce. Objective: To determine and compare the vital rates of survival, growth and fecundity in a community of Andean understory palms. Methods: The study was carried out in the Chicaque Natural Park, Colombia in an area occupying 0.07 ha, focused on the species Chamaedorea linearis, C. pinnatifrons, Geonoma orbignyana and G. undata. During 2018 and 2019, data corresponding to survival, growth and fecundity of these species were collected. The vital rates were estimated from their relationship with the size of the individuals. Results: A total of 597, 687, 453 and 690 individuals were registered in 0.1 ha of C. linearis, C. pinnatifrons, G. orbignyana and G. undata, respectively. The four species had high survival of seedlings, low growth rates in stemless individuals, low leaf production, few total leaves, a high longevity of the leaves and start of reproduction with low-height aerial stem. However, we found differences among species in which G. orbignyana and C. pinnatifrons demonstrated patterns commonly seen in understory palms. By contrast, C. linearis and G. undata had mixed growth strategies to cope with open spaces and understory conditions, as their leaves are larger, have larger stem growth rates and reproduction begins at a higher height. In terms of the genera, Chamaedoreas had fast growth and reproduction rates, spending most of their lives as adults. Meanwhile, Geonomas prioritizes the stasis of individuals, with its long-life cycles and lower growth rates. Conclusions: Chamaedoreas prioritizes growth and reproduction, while Geonomas prioritizes stasis. The limiting conditions of the understory seem to favor these two growth strategies in the species. These results can be considered as a step towards better understanding the strategies of a community of palms in the understory.

Effect of environmental characteristics on the diversity of aquatic macroinvertebrates in Andean rivers regulated for hydroelectric generation

Abstract Introduction: The Andes are characterized by an abundance of water resources and flows are frequently regulated by reservoirs for the generation of energy. The effects of regulation on aquatic macroinvertebrate communities are not well known in Colombia. Objective: To test the hypothesis that regulated currents have less macroinvertebrate diversity. Methods: We collected water and organism samples before, and after, the regulation of the Tafetanes, Calderas and Arenosa rivers, in Antioquia, Colombia, during various hydrological cycles (rain, transition and drought) and climatic phenomena (ENSO/El Niño Phenomenon) between 2016 and 2018. Results: We collected 53 214 individuals, from 165 taxa, mostly from the orders Ephemeroptera, Plecoptera, Trichoptera and Diptera (90 % of captures). Changes in diversity responded to spatial differences rather than to physicochemical variables: diversity was higher in non-regulated sites, regardless of the hydrological period or associated ENSO. Most species were found in all sampling sites, but abundance was higher in the site with the best habitat conservation status. Conclusion: The results support the hypothesis that physical barriers have effects on macroinvertebrate diversity at the local scale, however, the condition of adjacent habitats also seems to play an important role in preserving richness and abundance. The conservation of forest adjacent to the riverbed could mitigate the impacts of regulation.

Resumen Introducción: Los Andes se caracterizan por tener gran abundancia de recursos hídricos y las corrientes son frecuentemente reguladas por embalses para la generación de energía. Los efectos de la regulación en las comunidades de macroinvertebrados acuáticos no se conocen bien en Colombia. Objetivo: Probar la hipótesis de que las corrientes reguladas presentan menor diversidad de macroinvertebrados. Métodos: Recolectamos muestras de agua y organismos, antes y después de la regulación de los ríos Tafetanes, Calderas y La Arenosa, en Antioquia, Colombia, durante varios ciclos hidrológicos (lluvia, transición y sequía) y fenómenos climáticos (ENSO/Fenómeno de El Niño) entre 2016 y 2018. Resultados: Recolectamos 53 214 individuos, de 165 táxones, en su mayoría de los órdenes Ephemeroptera, Plecoptera, Trichoptera y Diptera (90 % de las capturas). Los cambios en la diversidad respondieron a las diferencias espaciales más que a las variables fisicoquímicas: la diversidad fue mayor en sitios no regulados, independientemente del periodo hidrológico o del ENSO. La mayoría de las especies se encontraron en todos los sitios de muestreo, pero su abundancia fue mayor en el sitio de mejor estado de conservación del hábitat. Conclusiones: Los resultados apoyan la hipótesis de que las barreras físicas tienen efectos sobre la diversidad de macroinvertebrados a escala local, sin embargo, el estado de los hábitats adyacentes también parece jugar un papel importante en la preservación de la riqueza y abundancia. La conservación del bosque adyacente podría mitigar los impactos generados por la regulación.