Scielo RSS <![CDATA[Revista de Biología Tropical]]> http://www.scielo.sa.cr/rss.php?pid=0034-774420190004&lang=en vol. 67 num. 4 lang. en <![CDATA[SciELO Logo]]> http://www.scielo.sa.cr/img/en/fbpelogp.gif http://www.scielo.sa.cr <![CDATA[Bamboos ecological functions on environmental services and productive ecosystems restoration]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442019000400679&lng=en&nrm=iso&tlng=en RESUMEN Este artículo es una revisión bibliográfica sobre las funciones ecológicas que caracterizan a los bambúes, por las cuales merecen un mayor reconocimiento e inclusión en los programas de restauración ecológica. Los bambúes son un grupo de plantas muy diverso, de amplia distribución geográfica y económicamente importante. Aunque son más reconocidos por los usos comerciales, su potencial de uso en programas de restauración ecológica es prometedor, ya que pueden ser eficientes en la prestación de varios servicios ambientales relacionados con el suelo, el agua y el secuestro de carbono. Su rápido crecimiento, junto con su capacidad para controlar la erosión y mantener el agua a nivel del suelo, así como para proporcionar nutrientes mediante la descomposición de la hojarasca, convierte a los bambúes en un grupo valioso para la recuperación de áreas degradadas y para la restauración productiva de ecosistemas, en particular a través de sistemas agroforestales. Los enfoques agroforestales pueden combinar diferentes especies de bambú con otros cultivos, para satisfacer las necesidades humanas y generar a la vez beneficios para los ecosistemas. De manera similar, los bosques o plantaciones de bambúes, junto con sistemas agroforestales mixtos, pueden actuar como áreas de conexión y corredores biológicos, en paisajes muy fragmentados, proporcionando refugio y alimento para una amplia diversidad de organismos. A pesar de las percepciones de que los bambúes pueden ser invasivos, las pruebas para apoyar esto son limitadas. Recomendamos una evaluación cuidadosa de las características biológicas de las especies de bambúes seleccionadas, antes de su implementación en proyectos de restauración productiva y de recuperación de los servicios ambientales.<hr/>ABSTRACT This article is a bibliographic review on the ecological functions that distinguish bamboos, for which they deserve greater recognition and inclusion in ecological restoration programs. Bamboos are a highly diverse, geographically widespread and economically important plant group. Although they are more recognized by commercial uses, their potential for use in ecological restoration programs is promising, as they can be effective in delivery of several environmental services related to soil, water and carbon sequestration. Their rapid growth, along with their abilities to control erosion and maintain water at soil level, as well as provide nutrients by litterfall decomposition, make them a valuable group for recovery of degraded areas and in productive restoration of ecosystems, in particular via agroforestry systems. Agroforestry approaches can combine different bamboo species with other crops, to meet human needs while generating benefits for ecosystems. Similarly, bamboo forests or plantations together with mixed agroforestry systems can act as stepping-stones and biological corridors, in very fragmented landscapes by providing shelter and food for a wide diversity of organisms. Despite perceptions that bamboos can be invasive, evidence to support this is limited. We recommend careful evaluation of the biological characteristics of bamboo species selected, prior to deployment in productive restoration projects and for the recovery of environmental services. <![CDATA[Tree density, species richness, and composition drive vegetation patches identified from remotely-sensed data in a semi evergreen tropical forest]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442019000400692&lng=en&nrm=iso&tlng=en RESUMEN Recientemente se ha abordado la delimitación de parches de vegetación a través de clasificaciones orientadas a objetos con datos multiespectrales. En esta investigación se presenta una propuesta de caracterización de selvas secundarias basada en matrices de semejanza de composición específica, estructura de la vegetación arbórea e índices de diversidad, partiendo de una clasificación orientada a objetos de imágenes multiespectrales. El área de estudio corresponde a una selva mediana subperennifolia con antecedente de aprovechamiento agrícola bajo el sistema de roza tumba y quema (Ac: hace 8-23 años), aprovechamiento forestal selectivo (Fs: hace 43-53 años), y aprovechamiento forestal selectivo e incendio forestal (Fc: hace 21-28 años). Se delinearon tres parches de vegetación de acuerdo al historial de uso, y se analizaron las diferencias entre las medias de las métricas de campo de cada parche con un análisis de varianza multivariado permutacional (P &lt; 0.001). Con un modelo logístico multinomial se identificaron, de entre más de 20 covariables, la riqueza de especies, densidad de tallos por hectárea, y el primer eje de variación del ordenamiento NMDS de la composición específica, como los atributos de la vegetación más distintivos. El parche Fc, presenta los mayores valores en diversidad de Shannon-Wiener, riqueza de especies, y densidad de tallos mayores a 7.5 cm de diámetro. El Fs tiene los mayores promedios de biomasa, área basal y altura individual, y el Ac tiene los menores valores de todas las métricas anteriores. Las especies de mayor Índice de Valor de Importancia fueron: Ac; Bursera simaruba y Psidia psipula, Fs: Gymnanthes lucida y Manilkara zapota, Fc: G. lucida y B. simaruba.<hr/>ABSTRACT A proposal for characterizing habitat of forests, obtained from an object-oriented classification of RapidEye multiespectral imagery, based on dissimilarity matrices of vegetation structure, species diversity and composition is presented. The study area is a forested landscape mosaic after slash and burn agriculture (Ac: 8-23 years ago), selective logging (Fs: 43-53 years ago), and selective logging and forest fire (Fc: 21-28 years ago). The site is located in the central part of Quintana Roo, México, where three vegetation patches were delineated according to remotely sensed multiespectral imagery. Mean differences between vegetation structure properties of each vegetation patch were obtained through a permutational multivariate analysis of variance (P &lt; 0.001). Species richness, stem density per hectare, and the axis-1 scores of the non-metric multidimensional scaling ordination of specific composition were identified as the vegetation attributes more relevant to differentiate the vegetation patches by a multinomial logistic model. Fc vegetation patch is characterized by the greatest mean values on Shannon-Wiener index, species richness, and stem density. The Fs has the greatest mean values of canopy height, basal area, and biomass at 80 percentile, and the Ac vegetation patch has the lowest values of all mentioned metrics. The species with the greatest relative importance value were: Ac: Bursera simaruba and Psidia psipula, Fs: Gymnanthes lucida and Manilkara zapota, Fc: G. lucida and B. simaruba. The uncertainty associated with the metrics assessed by vegetation patch was smaller than the uncertainty of the whole area, because of the efficient variability aggregation of the field data. We conclude that multiespectral information is a reliable tool for distinguishing vegetation patches with specific features, as stem density, specific composition, and species richness. <![CDATA[Quantification of 17β - estradiol and progesterone hormones in the pink snail Lobatus gigas (Mollusca, Gastropoda)]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442019000400708&lng=en&nrm=iso&tlng=en RESUMEN La cuantificación de las hormonas esteroides en moluscos se lleva a cabo con diferentes técnicas utilizando la hemolinfa o gónadas. Lobatus gigas es un gasterópodo de interés comercial en el Caribe, indexado en CITES como una especie protegida. Los estudios hormonales de esta especie aún no están disponibles. Por lo tanto, el objetivo de este estudio fue determinar la presencia de las hormonas esteroides 17ß - estradiol y progesterona en L. gigas a través de un método no invasivo y comparar dos técnicas para su cuantificación. Cada dos meses en un período de un año, se recolectaron las heces de diez organismos en Xel-Há, Quintana Roo, México. Las muestras se analizaron con cromatografía líquida de alta resolución y EIA. Los valores más altos de ambas hormonas se presentaron de marzo a septiembre y disminuyeron en noviembre y enero. La comparación de las concentraciones obtenidas con HPLC y EIA, mostró que los resultados son similares para el 17β-estradiol (Passing - Bablock r = 0.673; -0.17 ng / ml). En contraste, los resultados de la progesterona con ambas técnicas no mostraron ajuste (Passing - Bablock r = 0.389; -1.43 ng / ml). Nuestros resultados sugieren que la técnica de EIA es adecuada para el estudio de hormonas en esta especie. El conocimiento generado permitirá monitorear y seleccionar organismos reproductores que se encuentren acondicionados en laboratorios y de esta manera no incidir en la recolecta de masas ovígeras silvestres.<hr/>ABSTRACT Quantification of steroid hormones in molluscs is performed with different techniques, using the hemolymph or gonads. Lobatus gigas is a Caribbean gastropod of commercial interest indexed in CITES as a protected species. Hormonal studies of this species are as yet unavailable. The objective of this study is to determine the presence of the steroid hormones 17ß - estradiol and progesterone in L. gigas using a non-invasive method, and to compare two techniques for their quantification. Every two months over the course of one year, the feces of ten organisms were collected in Xel-Ha park Quintana Roo, México. The samples were analyzed with High resolution liquid chromatography and Enzyme-linked immunosorbent assays. The values of both hormones were highest during the months of March to September then decreased during November and January. Comparison of the concentrations obtained with HPLC and EIA, presented similar results for 17β-estradiol (Passing - Bablock r = 0.673; mean differences -0.17 ng / ml). In contrast, the progesterone results with both techniques showed no adjustment (Passing - Bablock r = 0.389; mean differences -1.43 ng / ml). Our results suggest that the enzyme-linked immunosorbent assay is suitable for the study of hormones in L. gigas. The knowledge generated will allow the monitoring and selection of breeding organisms that are conditioned in laboratories and thus will not affect the collection of wild egg masses. <![CDATA[Relationship between floristic composition and soil nutrients in palm communities at the Chocó region of Colombia and Ecuador]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442019000400716&lng=en&nrm=iso&tlng=en Resumen En ecología una de las preguntas más importantes es: ¿cuáles son los factores ambientales que explican la alta diversidad de especies de plantas en los bosques tropicales? En este trabajo, se estudiaron las comunidades de palmas y su relación con los nutrientes del suelo en dos localidades del Chocó biogeográfico. Específicamente, se investigó: (1) cómo varían los nutrientes del suelo entre las dos localidades; (2) cuál es la relación entre los nutrientes del suelo y la composición florística de palmas; (3) cuáles son los nutrientes más importantes que explican la variación en la composición florística de las comunidades de palmas; y (4) cómo varía la abundancia de las especies dominantes de sotobosque y de dosel a lo largo del gradiente de concentración de los nutrientes más importantes. Se realizaron 20 transectos de 500 x 5 m (5 ha), en los cuales se identificaron y contaron todos los individuos de palmas en sus diferentes estadios de crecimiento. Las muestras de suelo se tomaron en cada uno de los transectos a los 0 , 250 y 500 m. Los cationes (Al, Ca, Mg, K, P) se extrajeron con la técnica Mehlich-III y las concentraciones se analizaron con espectrometría de emisión con plasma de acoplamiento inductivo (ICP-OES). La concentración de macronutrientes se relacionó con la composición florística mediante el test de Mantel, el test parcial de Mantel, regresiones lineales y escalamiento multidimensional no métrico (NMDS). Se encontraron 9 158 individuos y 33 especies de palmas en las 5 ha cubiertas por los transectos. La composición florística presentó una correlación positiva y significativa con los nutrientes del suelo (rM = 0.63-0.69) y con la distancia geográfica entre los transectos (rM = 0.71-0.75), mientras que las variables edáficas mostraron una alta correlación con la distancia geográfica (rM = 0.72). Asimismo, se encontró una débil relación significativa entre la fertilidad del suelo y la abundancia de palmas de sotobosque, pero ninguna con las palmas del dosel. Nuestros resultados demuestran que los suelos juegan un papel importante en la composición de las comunidades de palmas a escalas locales en la región del Chocó, y que los suelos más pobres y ricos en fósforo presentan la mayor diversidad de palmas.<hr/>Abstract One of the most important questions in ecology is: which are the environmental factors that explain the high plant diversity of tropical forests? We studied the floristic composition of palm communities and their relationship to soil nutrients in two localities of the Chocó region to understand (1) how soil nutrients vary between the two localities; (2) what is the relationship between soil nutrients and palm floristic composition; (3) what are the most important nutrients that explain the variation in floristic composition of palm communities; and (4) how does the abundance of the most exuberant understory and canopy palm species vary along the concentration gradient of the most important nutrients? We established 20 transects (5 x 500 m) and identified all palm individuals of all growth stages. Soil samples were taken at each transect at the beginning, middle, and end. Macronutrients (Al, Ca, Mg, K, P) were extracted with the Mehlich-III technique and their concentrations were analyzed by inductively coupled plasma emission spectrometry (ICP-OES). We used Mantel test, partial Mantel tests, linear regressions, and non-metric multidimensional scaling to determine if the concentration of nutrients was related to the floristic composition. We found a total of 9 158 individuals and 33 species of palms in the 5 ha covered by our transects. Floristic composition had a positive and significant correlation with soil nutrients (rM = 0.63-0.69) and with geographical distance between transects (rM= 0.71-0.75), whereas the soil nutrients were highly correlated with geographical distance (rM = 0.72). We also found a small, yet significant, relationship between soil fertility and the abundance of understory palms, but no relationship with canopy palms. Our results demonstrate for the first time that soils play an important role in the composition of palm communities at local scales in the Chocó region, and that infertile and phosphorus-rich soils have the highest palm diversity. <![CDATA[Population genetic structure of <em>Brycon henni</em> fish (Characiformes: Characidae) in the Andean region of Colombia using microsatellite molecular markers]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442019000400733&lng=en&nrm=iso&tlng=en Resumen Las especies de peces en Colombia están sujetas a procesos de sobrepesca, introducción de especies exóticas, deterioro de hábitat y fragmentación de ecosistemas, con la consecuente pérdida de conectividad que limita el flujo genético y pudiera llevar a las poblaciones a la extinción. En el presente trabajo se analizó la estructura genética poblacional de Brycon henni, un pez de importancia económica y ecológica, en cuatro cuencas de la región Andina colombiana, mediante el uso de diez marcadores microsatélites en 60 muestras de los ríos Risaralda (RR), Campoalegre (RC), Riofrío (RRf) y Chinchiná (RCh). Se encontró un total de 136 alelos. Con excepción del marcador BoM12, todos fueron altamente informativos y polimórficos y en todos se presentó desviación significativa (P &lt; 0.05) del equilibrio Hardy Weinberg. En RC se observó el mayor número de alelos (81), Número promedio de alelos (8) y alelos privados (34), además una HE de 0.689 ± 0.05. En general, hubo un marcado déficit de heterocigotos con respecto a la población total (FIT = 0.562), dentro de las subpoblaciones (FIS = 0.526) y moderada, pero altamente significativa estructura genética (FST = 0.07). Según la distancia estándar de Nei, la población más divergente fue la del RC con un k = 4, se encontró tendencia a cuatro poblaciones ancestrales. Los resultados sugieren que el flujo genético entre poblaciones naturales de B. henni es limitado, lo cual puede tener efectos negativos sobre su conservación. Los resultados sugieren que las poblaciones pueden estar alcanzando valores críticos de baja densidad, lo cual pone en riesgo su conservación.<hr/>Abstract Fish species in Colombian Andes are subject to processes of overfishing, exotic species invasions, habitat loss, ecosystems fragmentation and low connectivity that limits the genetic flow and leads populations to loss genetic variability and extinction. Genetic variation of B. henni from four basins of the Colombian Andean region (Risaralda, Campoalegre, Riofrío and Chinchiná) was analyzed using ten microsatellites in 60 samples. A total of 136 alleles were found. Except BoM12, all markers were highly informative and polymorphic and presented a significant deviation (P &lt; 0.05) from Hardy Weinberg Equilibrium. There was a marked deficiency of heterozygotes (FIS = 0.526). In Campoalegre river basin, the largest allele number, average allele number and private alleles were observed (81, eight and 34 alleles, respectively) and HE 0.689 ± 0.05. Moderate and highly significant genetic structure was evidenced (FST = 0.07). According to the standard distance of Nei (1972), population from Campoalegre River basin was the most divergent. This results suggest that genetic variability of the B. henni in the studied basins may be affected by critical low population density, river pollution and overfishing. <![CDATA[Genotoxic effects of mercury chloride on the Neotropical fish <em>Andinoacara rivulatus</em> (Cichlidae: Cichlasomatini)]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442019000400745&lng=en&nrm=iso&tlng=en Abstract Understanding the effects of heavy metals in aquatic ecosystems is of significant importance due to their potential to bioaccumulate at various trophic levels and induce damage in DNA. Mercury is considered one of the most dangerous heavy metals, causing chromosomal breakage (clastogenic event) or spindle dysfunction (aneugenic event), that can lead to the formation of encapsulated chromatin into a separate smaller nucleus, generally referred to as a micronucleus. We evaluated the sensitivity of the micronucleus test in the neotropical cichlid Andinoacara rivulatus (Günther 1860). The fish were divided into four groups of 16 individuals, and each group was placed in separate aquaria (140 L) provided with filtered water and constant aeration. Fish were exposed to mercury chloride (HgCl2) at doses 0.1, 0.25, and 0.50 mg/kg body weight, administered by intraperitoneal (IP) injection. Fish from the control group were injected with a physiologic solution. The following erythrocyte anomalies were identified: erythrocytes with micronuclei varying to some extent in size and position in the cytoplasm, blebbed nucleus, binucleated cell, nuclei showing a deep invagination toward the center (notched nuclei). Examination of blood smears demonstrated a higher level of micronucleus and notched erythrocytes in fish injected with HgCl2 than in the controls. There were significant differences in the frequency of micronucleated and notched erythrocytes among the groups exposed to mercury. Linear regression analysis revealed a positive relationship between the frequency of micronucleated and notched erythrocytes (P&lt; 0.0001), with a moderately strong correlation coefficient (R= 0.737). We propose that, in addition to the two so far known mechanisms of micronucleus formation (spindle apparatus damage and chromosomal ruptures), chromatin fragmentation in notched nuclei resulting from a combination of the cytotoxic effects of mercury and mechanical stress, may be a third mechanism of micronuclei genesis.<hr/>RESUMEN Comprender los efectos de los metales pesados en los ecosistemas acuáticos es de gran importancia debido a su potencial de bioacumulación en los diversos niveles tróficos y de inducir daños en el ADN. El mercurio, considerado uno de los metales pesados más peligrosos, causa fracturas cromosómicas (evento clastogénico) o disfunción del huso mitótico (evento aneugénico), y puede conducir a la formación de fragmentos de cromatina encapsulada en un núcleo separado más pequeño, generalmente denominado micronúcleo. En este trabajo se evalúa la sensibilidad del test de micronúcleos en el cíclido neotropical Andinoacara rivulatus (Günther 1860). Los peces fueron divididos en cuatro grupos de 16 individuos, y cada grupo se colocó en acuarios separados (140 L) provistos de agua filtrada y aireación constante. Los peces fueron expuestos al cloruro de mercurio (HgCl2) en dosis de 0.1, 0.25 y 0.50 mg/kg de peso corporal, administrada por inyección intraperitoneal (IP). Los peces del grupo control fueron inyectados con solución fisiológica. Se identificaron las siguientes anomalías en los eritrocitos: micronúcleos que varían en tamaño y posición en el citoplasma, núcleo con evaginaciones, células binucleadas núcleos con muesca (núcleos con una profunda invaginación hacia el centro). El examen de los frotis de sangre demostró un mayor nivel de eritrocitos micronucleados y con muesca en peces inyectados con HgCl2 que en los controles. Fueron detectadas diferencias significativas en la frecuencia de eritrocitos micronucleados y células con núcleos con muescas entre los grupos expuestos al mercurio. El análisis de regresión lineal reveló una relación positiva entre la frecuencia de eritrocitos micronucleados y con muescas (P&lt; 0.0001), con un coeficiente de correlación moderadamente fuerte (R= 0.737). Se propone que, además de los dos mecanismos hasta ahora conocidos de formación de micronúcleos (daño del huso mitótico y rupturas cromosómicas), la fragmentación de la cromatina en núcleos con muesca probablemente a causa de la combinación de los efectos citotóxicos del mercurio y el estrés mecánico, podría ser un tercer mecanismo de génesis de micronúcleos. <![CDATA[Composition and structure of the forest-páramo transition in the Guantiva-La Rusia corridor (Colombia)]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442019000400755&lng=en&nrm=iso&tlng=en RESUMEN La franja de transición altitudinal bosque-páramo, en su límite inferior se caracteriza por la transición de bosque altoandino a arbustales de portes alto y bajo, y en su límite superior de arbustales de bajo porte a herbazales. En tres localidades del flanco occidental del complejo de páramos Guantiva - La Rusia se realizaron muestreos, en parcelas de 100 m2 para la cobertura de bosque y 50 m2 para la arbustal y herbazal, con una diferencia altitudinal de 100 m aproximadamente entre las estaciones. Se encontraron 70 familias, distribuidas en 157 géneros y 302 especies, siendo Asteraceae la familia más diversa con 16 géneros y 39 especies, a su vez, Miconia el género más diverso con 14 especies. Los índices de diversidad revelaron que las estaciones de herbazales, para las tres localidades fueron las más dominantes en composición de especies; en cuanto a la diversidad el bosque de Onzaga-Susacón registra 1.9 y 1.3 veces, más diversidad que Belén y Duitama, respectivamente. El presente estudio permitió identificar la franja de transición a partir del cambio en la fisionomía y diversidad de la flora vascular en el gradiente altitudinal del flanco occidental del complejo, dicha franja se ubica en Duitama entre los 3 394 y 3 516 m de altitud, en Belén entre los 3 411 y 3 649 m y en Onzaga-Susacón entre los 3 300 y 3 390 m.<hr/>Abstract The altitudinal forest - paramo transition area, in its lower limit is characterized by the transition through the high Andean forest to high and low forest bushes, and is upper limit to the turnover between the low shrubs to herbaceous. Samplings were carried out in three localities of the Guantiva - La Rusia complex in the Western flank, through a 100 m2 parcels for the forest coverage and 50 m2 for the shrub and the herbaceous coverages, with an altitudinal difference of 100 m between altitudinal areas. We recorded 70 families, distributed in 157 genera and 302 species. The Asteraceae family were the most diverse with 16 genera and 39 species; likewise, Miconia was the most diverse with 14 species. Diversity indexes revealed that the most dominant in species composition were the herbaceous areas; regarding to diversity, the Onzaga-Susacon forest is 1.9 and 1.3 times more diverse than Belen and Duitama respectively. This research allowed identifying the transitional area through the transformation of the vascular flora physiognomy and diversity in the altitudinal gradient Western flank complex, that transition area is in Duitama between 3 394 - 3 516 m, in Belen 3 411 - 3 649 m and in Onzaga-Susacon 3 300 - 3 390 m. <![CDATA[Carbon stocks of <em>Cenchrus clandestinus</em> grass (Poaceae) in traditional and silvopastoral systems, in different reliefs]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442019000400769&lng=en&nrm=iso&tlng=en RESUMEN El aumento de las emisiones de Gases de Efecto Invernadero (GEI) derivadas de las actividades humanas, son consideradas el principal responsable del cambio climático actual y el sector ganadero es responsable del 18 % de las emisiones de GEI en CO2 equivalente. El pasto kikuyo puede optimizar tanto la captura como la fijación del carbono. El objetivo del trabajo fue identificar las existencias de carbono en el pasto kikuyo en sus diferentes compartimentos, biomasa aérea (BA) y biomasa radicular (BR), a 20 y 40 cm de profundidad del suelo, bajo los sistemas tradicional y silvopastoril en diferentes relieves. Se realizaron seis muestreos (M) sucesivos de acuerdo al sistema de pastoreo (tradicional y silvopastoril), la geoforma del terreno (flanco cóncavo (FCC), flanco convexo (FCX), flanco rectilíneo (FR) y relieve plano (RP)). Se muestrearon la biomasa aérea (BA) y de raíces (BR). El método estadístico utilizado fue un diseño en bloques incompletos aleatorizados, se evaluaron dos tratamientos (T) (T1: tradicional y T2: silvopastoril) con cuatro bloques (B) en cada uno (B1: FCC, B2: FCX, B3: FR, B4: RP). El trabajo se realizó entre junio 2016 y junio 2017 en San Pedro de los Milagros, Antioquia Colombia. Los resultados permitieron determinar que las raíces a 20 cm de profundidad, el colchón muerto y las hojas, fueron los compartimentos con mayores existencias de carbono (4.52, 3.58 y 1.9 ton de C ha-1 respectivamente). Se encontraron diferencias (P &lt; 0.05) entre relieve plano y el relieve rectilíneo para la biomasa de hojas, y entre el relieve plano con los demás relieves evaluados para la variable raíces gruesas a 20 cm de profundidad. La biomasa producida por la planta es directamente proporcional al carbono incorporado. La biomasa radicular, tanto para raíces finas como gruesas, contribuye a capturar en promedio 2 820 y 655 kg ha-1 de carbono a 20 y 40 cm de profundidad respectivamente. El pasto kikuyo contribuye a mantener reservas de carbono en las praderas. Por la alta producción de biomasa radicular, de colchón y la alta capacidad de rebrote en condiciones adversas, se concluye que este pasto juega un papel importante en la disminución de GEI y la conservación de los suelos del trópico alto bajo sistemas de lechería especializada.<hr/>Abstract The increase of Greenhouse Gases (GHG) emissions derived from human activities are considered the main cause of current climate change and the livestock sector is responsible for 18 % of the GHG emissions in CO2 equivalent. Kikuyu grass can optimize both carbon capture and carbon fixation. The aim of this paper was to identify carbon stocks in the kikuyu grass in its different compartments, above-ground biomass (AB) and below-ground biomass (BB) at 20 and 40 cm soil depth, under the traditional and silvopastoral systems in different reliefs. Six successive samplings (M) were taken according to the grazing system (traditional and silvopastoral system), and the geoform of the terrain (concave flank (CCF), convex flank (CXF), rectilinear flank (RF) and flat relief (FR)). The above-ground biomass and below-ground biomass were sampled. The statistical method used was a design in incomplete randomized blocks, two treatments were evaluated (T) (T1: traditional system and T2: silvopastoral system) with four blocks (B) in each one (B1: CCF, B2: CXF, B3: RF, B4: FR). This experiment was done from June 2016 to June 2017 in San Pedro de los Milagros, Antioquia, Colombia. The results allowed to determine that the roots at 20 cm depth, the dead creeping stems, and the leaves were the compartments with the highest carbon stocks (4.52, 3.58 and 1.9 ton of C ha-1, respectively). Differences were found (P &lt; 0.05) between flat and rectilinear relief for the biomass of leaves, and between the flat relief with the other reliefs evaluated for the variable thick roots at 20 cm depth. The biomass produced by the plant is directly proportional to the incorporated carbon. The root biomass, both fine and thick roots, contributes to capture on average 2 820 kg and 655 kg of carbon per hectare at of 20 and 40 cm depth respectively. Kikuyu grass contributes to keep carbon reserves in the grasslands. Due to the high production of below-ground biomass and creeping stems, and its high capacity of regrowth under adverse conditions, this grass plays an important role in the reduction of GHG and the conservation of high tropical soils under specialized dairy systems. <![CDATA[Modeling the effect of colonial breeding in <em>Bubulcus ibis</em> (Aves: Ardeidae) on biomass and energy flows of coastal mangrove]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442019000400784&lng=en&nrm=iso&tlng=en RESUMEN Introducción: Las colonias de aves zancudas alcanzan miles de nidos densamente agrupados, que influyen marcadamente sobre las características del suelo o el agua que las rodea por un efecto de hiperfertilización. Esto provoca la acumulación nociva de compuestos nitrogenados, alterando la química del sustrato y produciendo defoliación y muerte de la vegetación. El impacto de estas colonias en los manglares de Cuba no se ha evaluado, por las dificultades logísticas que implica y la complejidad de sus procesos. Objetivo: En el presente trabajo se realizó la estimación de las cantidades de biomasa, energía y nutrientes movilizados en una colonia de Bubulcus ibis, durante una etapa de cría, a través de un modelo bioenergético de dinámica de sistemas. Métodos: Se emplearon 29 variables primarias, 3 ecuaciones bioenergéticas y la ecuación de crecimiento postnatal de esta especie, implementadas en el programa STELLA 9.1.3. De la interacción de estas variables se obtuvieron: la energía requerida por ciclo de reproducción, la biomasa consumida y los nutrientes depositados en la colonia. Se realizó un análisis de sensibilidad y un análisis de incertidumbre para explorar las variables que más influencia tienen sobre los resultados. El modelo fue validado mediante la consistencia en las unidades, la prueba de valores extremos y la comparación con valores registrados en la literatura. Finalmente, se simularon escenarios de disturbios que pueden afectar a una colonia real. Resultados: Según el modelo, para el crecimiento cada pichón requiere de 10 219.2 kcal totales. La colonia debe invertir en total 6.71x106 kcal, lo que representa un consumo cercano a 2.2 toneladas de presas en una etapa de cría. Debido a este consumo, los nutrientes depositados en la colonia mediante las excretas estuvieron compuestos de 49 kg de nitrógeno, 7 kg de fósforo y 56 kg de calcio. Según el análisis de sensibilidad, las variables que producen cambios más fuertes en el resultado son el número de adultos de la colonia y el tamaño medio de puesta. El análisis de incertidumbre mostró poca influencia de las variables seleccionadas sobre las variables respuesta. Los disturbios simulados más dañinos para la colonia fueron las afectaciones al reclutamiento y el aumento de la mortalidad de los pichones.<hr/>Abstract Introduction: The colonies of wading birds reach thousands of highly grouped nests, which have a marked influence on the characteristics of the soil or the water that surrounds them due to a hyperfertilization effect. This causes the harmful accumulation of nitrogen compounds altering the chemistry of the substrate and causing defoliation and death of vegetation. The impact of these colonies on the mangroves in Cuba has not been evaluated, due to the logistical difficulties involved and the complexity of their processes. Objective: Mathematical modeling is a useful tool in these situations, so in this work the estimation of the quantities of biomass, energy and nutrients mobilized in a colony of herons was carried out, through a bioenergetic model of system dynamics. Methods: We used 29 primary variables, 3 bioenergetic equations and the postnatal growth equation of this species, implemented in the STELLA 9.1.3 program. From the interaction of these variables, the energy required by the reproduction cycle, the biomass consumed and the nutrients deposited in the colony were obtained. A sensitivity analysis and an uncertainty analysis were carried out to explore the variables that have the most influence on the results. The model was validated by the consistency in the units, the test of extreme values and the comparison with values recorded in the literature. Finally, disturbances scenarios that can affect a real colony were simulated. Results: According to the model, each nestling require 10 219.2 kcal to growth. The colony must totally invest 6.71x106 kcal, which represents consumption close to 2.2 tons of dams. Due to this consumption, the nutrients deposited in the colony by the excreta were 49 kg of nitrogen, 7 kg of phosphorus and 56 kg of calcium. According to the sensitivity analysis, the variables that produce the strongest changes in the result are the number of adults in the colony and the average clutch size. The uncertainty analysis showed little influence of the variables selected on the response variables. The most harmful simulated disturbances for the colony were the affectations to the recruitment and the increase of the mortality of the nestlings. <![CDATA[Natural and anthrophic deteminants of distribution, structure and floristic composition of mangroves in the Natural Sanguaré Reserve, Colombia]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442019000400810&lng=en&nrm=iso&tlng=en RESUMEN Los manglares presentan diferentes grados de interacción entre las condiciones oceanográficas, climáticas, geomorfológicas y edáficas. Estas interacciones tienen repercusiones fuertes sobre la condiciones locales de salinidad y disponibilidad de agua y nutrientes a nivel local, y sobre la estructura y composición de los manglares. Con base en el análisis de fotografías aéreas, muestreo en campo y análisis de componentes principales, se analizaron la composición florística y la estructura de los manglares presentes en la Reserva Natural Sanguaré. Se identificaron tres tipos de bosques según la clasificación fisiográfica de manglares. Un manglar de borde dominado por Rhizophora mangle L. en estado juvenil, con bajo desarrollo estructural, y dos tipos de manglar de interior o cuenca dominados por Avicennia germinans (L.) L. El primero de ellos, localizado detrás del manglar de borde, presentó alta salinidad en el suelo y en el agua intersticial, predominancia de sedimentos arenosos, y bajos valores de altura y diámetro a la altura de pecho (DAP) promedio de los árboles. El segundo, con un bajo número de árboles adultos en todas las categorías de diámetro, mayor área basal, bajo potencial de regeneración natural, y altas concentraciones de Fe y Cu en el suelo, probablemente asociado a la contaminación por vertimientos domésticos. La ubicación del primer manglar de interior detrás del manglar de borde revela la zonación típica descrita para muchos manglares del mundo. La composición florística, la estructura y la distribución de los manglares en la Reserva Sanguaré son el resultado de la interacción de variables ambientales locales como la salinidad y la textura del suelo, además de la intervención antrópica previa al establecimiento de la reserva y la actual presencia humana muy cerca de los manglares.<hr/>Abstract Mangroves have different degrees of interaction between oceanographic, climatic, geomorphological and soil conditions. Those interactions have strong impacts on local salinity conditions and availability of water and nutrients at local level, and on mangrove structure and composition. Based on the analysis of aerial photographs, field sampling and statistical multivariate analysis, floristic composition and structure of the mangroves present in the Sanguaré Natural Reserve were analyzed. Three types of forests were identified according to the physiographic classification of mangroves. A fridge mangrove dominated by Rhizophora mangle L. in a juvenile state, with low structural development, and two types of inland or basin mangroves dominated by Avicennia germinans (L.) L. The first of them, located behind the fridge mangrove, showed high salinity in the soil and in the interstitial water, predominance of sandy sediments, and low values of height and diameter at breast height (DBH) average of the trees. The second, with a low number of adult trees in all diameter categories, high basal area, low natural regeneration potential, and high concentrations of Fe and Cu in the soil, probably associated with contamination by domestic spills. The location of the first inner mangrove behind the fridge mangrove reveals the typical zonation of many mangroves in the world. The floristic composition, structure and distribution of the mangroves in the Sanguaré Reserve are the result of the interaction of local environmental variables such as salinity and soil texture, as well as the anthropic intervention prior to the establishment of the reserve and the current human presence being very close to the mangroves. <![CDATA[Plant growth promoting rhizobacteria and their potential as bioinoculants on <em>Pennisetum clandestinum</em> (Poaceae)]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442019000400825&lng=en&nrm=iso&tlng=en ABSTRACT Introduction: The sustainable production of pastures has become a fundamental challenge for the livestock sector where research with plant growth-promoting rhizobacteria as a viable solution, has nearly not been reported. Objective: In this study, we aimed to examine the potential to stimulate growth in Pennisetum clandestinum grass using four isolated bacterial strains from soils obtained from a Colombian tropical silvopastoral system. Methods: We previously identified genetically the strains and characterized two plant growth promoting activities. In addition, we evaluated the growth-promoting effect of the strains in Kikuyo grass under greenhouse conditions. Results: We found that the four bacterial strains were phylogenetically associated with Klebsiella sp. (strains 28P and 35P), Beijerinka sp. (37L) and Achromobacter xylosoxidans (E37), based on partial 16S rRNA gene sequencing. Moreover, the in vitro biochemical assays demonstrated that the strains exhibited some plant growth promoting mechanisms such as 1-aminocyclopropane-1-carboxylic acid deaminase activity and indole compound synthesis. Notably, bacterial inoculation under greenhouse conditions showed a positive influence on P. clandestinum growth. We found a significant (P &lt; 0.05) effect on root and shoot length and shoot dry weight. Shoot length increased by 52 % and 30 % with 37L and 35P compared to those without inoculation treatment. Similarly, the use of 37L and 28P raised shoot dry weight values by 170 % and 131 %, respectively. In root development, inoculation with strains 37L and E37 increased root length by 134 % and 100 %, respectively. Conclusion: Beijerinckia sp. 37L was the most effective of the four strains at increasing P. clandestinum biomass and length.<hr/>RESUMEN Introducción: La producción sostenible de pastos se ha convertido en un desafío fundamental para el sector ganadero, donde investigaciones con bacterias promotoras de crecimiento vegetal, como una solución viable, han sido poco reportadas. Objetivo: El objetivo de este estudio fue examinar el potencial para estimular el crecimiento del pasto Pennisetum clandestinum utilizando cuatro cepas bacterianas aisladas de suelos obtenidos de un sistema silvopastoril tropical colombiano. Métodos: Anteriormente identificamos genéticamente las cepas y caracterizamos dos actividades que promueven el crecimiento de las plantas. Además, evaluamos el efecto promotor del crecimiento de las cepas en el pasto Kikuyo en condiciones de invernadero. Resultados: Encontramos que las cuatro cepas bacterianas se asociaron filogenéticamente con Klebsiella sp. (cepas 28P y 35P), Beijerinka sp. (37L) y Achromobacter xylosoxidans (E37), basados en la secuenciación parcial del gen 16S rRNA. Además, los ensayos bioquímicos in vitro demostraron que las cepas exhibían algunos mecanismos que promueven el crecimiento de las plantas tales como la actividad de la enzima desaminasa del ácido 1-aminociclopropano-1- carboxílico, y la síntesis del compuesto indol. En particular, la inoculación bacteriana bajo condiciones de invernadero mostró una influencia positiva en el crecimiento de P. clandestinum. Encontramos un efecto significativo (P &lt; 0.05) en la longitud de la raíz y el tallo, y el peso seco del tallo. La longitud del tallo aumentó en un 52 % y 30 % con 37L y 35P, respectivamente, en comparación con aquellos sin tratamiento de inoculación. Igualmente, el uso de las cepas 37L y 28P aumentó los valores de peso seco del tallo en un 170 y un 131 %, respectivamente. En el desarrollo de la raíz, la inoculación con las cepas 37L y E37 aumentó la longitud de la raíz en 134 y 100 %, respectivamente. Conclusión: Beijerinckia sp. 37L fue la más efectiva de las cuatro cepas al aumentar la biomasa y la longitud de P. clandestinum. <![CDATA[Review of California sea lion (<em>Zalophus californianus</em>) abundance, and population dynamics in the Gulf of California]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442019000400833&lng=en&nrm=iso&tlng=en ABSTRACT Introduction: The life history of the California sea lion (Zalophus californianus) in the Gulf of California is marked by a series of important events influencing and modifying its population growth, distribution, and evolution. Despite the fact that this population has been studied since the 1950s, research has been rather punctual and fragmentary. Before 2010, there are only a few surveys conducted simultaneously in all rookeries, thus there is no reliable information on key aspects of life cycle, population trend and potential threats. In the present work we conducted a review of California sea lion life history and environmental changes in the Gulf of California thorough a collation survey data encompassing the last 37 years. Objective: Our aim was focused on identifying short- and long-term processes potentially acting on the population, and hopefully improve knowledge about the population trend and status using different points of view. Methods: We collected and analyzed population survey data from different sources since the 1970s to 2018: published papers, master’s and doctoral thesis, in addition to technical reports. The survey data are organized in sections corresponding with crucial population life history events. Results: Considering a long-time period the population size appears to be stable with zero growth. Cyclic interannual fluctuation seem to denote a certain dependence with climatic factors, not directly with El Niño, but with sea surface temperature anomalies that determine prey availability. However, many doubts persist about the incidence of different local environmental factors on gender and age, particularly related with juvenile recruitment and female survival rate. Conclusions: In conclusion, more information is required based on seasonal surveys, life cycle, regional environmental variation. Statistical errors need to be assessed and monitoring methods should be standardized and must be considered to ascertain short- and long-term population and colony spatial-temporal patterns.<hr/>RESUMEN Introducción: El lobo marino de California (Zalophus californianus) en el Golfo de California se caracteriza por una serie de eventos que influyen en el crecimiento, evolución y distribución de la población. Los estudios poblacionales iniciaron en 1950, aunque las investigaciones fueron puntuales y fragmentadas. Antes de 2010 existen pocos censos simultáneos de las 13 colonias de lobos marinos, con los cuales se obtuvo información sobre el ciclo de vida, la tendencia poblacional y las potenciales amenazas de estos organismos. Objetivo: En esta investigación se presenta un resumen de 37 años de historia de investigaciones del lobo marino de California y del ecosistema del Golfo de California. Métodos: Se realizó un análisis de los procesos de corto y largo plazo que actúan sobre la población, revelando aspectos poco conocidos. Se recolectaron y analizaron datos para el periodo de 1970 al 2018: artículos, tesis de posgrado y reportes técnicos, que fueron organizados en secciones relacionadas con eventos ambientales cruciales para la población. Resultados: A largo plazo, la población parece estar estable y presenta fluctuaciones interanuales cíclicas que evidencian dependencia con factores climáticos como anomalías de temperatura superficial del mar regional que determinan un cambio en la disponibilidad de presas para los lobos marinos. No es claro el posible efecto que factores ambientales locales puedan ocasionar en las diferentes clases de edad y por sexos, en particular sobre el reclutamiento de juveniles y la tasa de supervivencia de las hembras. Conclusiones: El presente trabajo identifica las prioridades de información para esta población y ofrece recomendaciones como el monitoreo estandarizado y la consideración de variaciones espacio-temporales locales. <![CDATA[Does Formicidae reflect the impact of riparian forest degradation in the Eastern Amazon?]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442019000400850&lng=en&nrm=iso&tlng=en RESUMEN La creciente presión antropogénica sobre la Amazonia Oriental hace imperativo el diagnóstico de la degradación forestal y, particularmente, su efecto sobre las comunidades clave dentro de los ecosistemas ribereños, unos de los últimos bosques amazónicos remantes en el estado de Maranhão. La familia de hormigas Formicidae juega un papel fundamental en el suelo, refleja los cambios en el uso de la tierra y es un grupo abundante en los bosques estudiados. Este trabajo tuvo como objetivo determinar el efecto del gradiente sucesional en la riqueza, frecuencia y composición de esta familia. El muestreo fue realizado durante los periodos seco y lluvioso con el método TSBF. Los organismos recolectados se identificaron a nivel de morfoespecies y se crearon curvas de acumulación de especies. Fueron utilizados modelos lineales mixtos para evaluar los efectos del periodo de recolecta local y estado de sucesión en la riqueza y la frecuencia de las hormigas. Por otro lado, se utilizaron regresiones polinómicas para investigar la relación entre la riqueza y la frecuencia de los formícidos según la cobertura del dosel y la altura de la vegetación. La composición de especies fue representada a través del índice de similitud de Jaccard. En total, 1 940 individuos fueron separados en 86 morfoespecies. Se obtuvo más del 80 % de la riqueza de especies probables. La frecuencia y riqueza de hormigas aumentó significativamente siguiendo la sucesión con valores bajos en las áreas abiertas durante la estación seca. Asimismo, durante esta estación, la cobertura del dosel y la altura de la vegetación tuvieron un efecto parcial en la riqueza y frecuencia de Formicidae. Por su parte, las áreas de sucesión intermedia y avanzada presentaron una composición similar con 50 especies compartidas, seguidas de las áreas de sucesión temprana con 43 y el uso antrópico con 34. Concluimos que la eliminación de los bosques ribereños tiene un efecto considerable sobre la riqueza y frecuencia de Formicidae, con valores mínimos en áreas degradadas durante la estación seca. Por otro lado, las áreas de bosques transformadas en sistemas agrícolas sufrieron pérdidas de 41 y 56% en la riqueza y frecuencia respectivamente. Con la sucesión, se restauran la estructura y las funciones del bosque favoreciendo la recolonización de las especies de hormigas. Finalmente, estos himenópteros son un grupo clave en los programas de monitoreo para la conservación/restauración de los bosques ribereños locales.<hr/>Abstract The increasing anthropogenic pressure on Eastern Amazon makes imperative the diagnosis of forest degradation, particularly the effect on key communities within the riparian ecosystems, one of the last remaining Amazonian forests in Maranhão State. The ant family Formicidae is an abundant group in these types of forests plays a fundamental role on the soil and also reflects the land use changes. Therefore, this study aimed to determine the impact of riparian forest successional stages on the Formicidae richness, frequency, and composition. Sampling was performed during both dry and wet seasons using the TSBF method. Collected organisms were identified as morphospecies. Also, species-accumulation curves were created. Linear mixed models were used to evaluate the effects of seasonal, local, and successional stage on ant richness and frequency. Polynomial regression models were applied to investigate the relationship between ant richness and frequency with canopy cover and vegetation height. Lastly, the species composition was represented by the Jaccard similarity index. In total, we observed 1 940 individuals grouped into 86 morphospecies. We obtained more than 80 % of the probable species richness. Ant frequency and richness increased significantly, following the successional stage, with low values in the open areas, especially during the dry season. Canopy cover and vegetation height seemed to affect partially both Formicidae richness and frequency during the dry season. Intermediate and advanced successional areas presented similar composition (50) shared species, followed by the areas of early succession (43) and anthropic use (34). We concluded that the elimination of riparian forests produces a considerable effect on the richness and frequency of the Formicidae family, minimally affecting them in open areas during the dry season, but resulting in losses of 41 % in richness and 56 % in frequency in forest areas when they are transformed into agricultural systems. Nevertheless, succession restores forest structure and functions, thus favoring re-colonization of ant species. Formicidae reflects forest degradation and is a key group in monitoring programs for the conservation/restoration of local riparian forests. <![CDATA[Diversity of aquatic macroinvertebrates along creeks with different riparian cover in Murocomba Protector Forest, Ecuador]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442019000400861&lng=en&nrm=iso&tlng=en RESUMEN El cambio de uso de la tierra con áreas de bosques nativos convertidas a la agricultura, la ganadería y las plantaciones de bosques exóticos, es el factor principal que afecta la vegetación ribereña y las comunidades acuáticas. El objetivo del estudio fue evaluar las respuestas del ensamblaje de macroinvertebrados acuáticos al cambio en la cobertura ribereña en el bosque protector Murocomba, Valencia, Ecuador. Se realizaron muestreos en las temporadas seca (de junio a diciembre 2014) y de lluvias (diciembre hasta abril 2015) en tres quebradas con diferentes coberturas riparias: bosques nativos Q1-CBN, pastos para agricultura y ganadería Q2-CAG y plantaciones forestales Q3-CPF, en las que se recolectaron muestras de macroinvertebrados acuáticos y se midieron diferentes variables fisicoquímicas in situ. Según el IBF y el BMWP/Col, la mejor condición ecológica se presentó en la quebrada Q1-CBN, y el EPT disminuyó en la quebrada Q2-CAG en la estación lluviosa. El índice de Shannon-Weaver mostró valores más altos en Q1-CBN y Q3-CPF en el período seco, y la dominancia aumentó en Q3-CPF en la temporada de lluvias. Un total de 6 583 macroinvertebrados fueron recolectados. El orden Coleoptera mostró una mayor abundancia en Q1-CBN y Diptera en Q2-CAG, mientras que Hemiptera mostró la menor abundancia en Q3-CPF. Los taxones Psephenidae, Chironomidae, Leptophlebiidae, Veliidae, Simuliidae, Baetidae y Leptohyphidae se asociaron con los valores más altos de sólidos disueltos y pH, así como valores más altos de IBF y valores más bajos de los índices EPT, BMWP y profundidad del canal en Q2-CAG, mientras que Leptoceridae, Elmidae, Ptilodactylidae y Philopotamidae, se asociaron con valores más altos de EPT y BMWP y con mayor profundidad en Q1-CBN y Q3-CPF. Se evidenció una influencia negativa de las actividades antrópicas en las variables fisicoquímicas y la estructura del ensamblaje de macroinvertebrados. Esto indica que la vegetación ribereña es un factor determinante para el establecimiento y la estructura de las comunidades acuáticas.<hr/>Abstract Land-use change from native forests to agriculture, livestock and exotic forest plantations is a main factor affecting riparian vegetation and aquatic communities. The aim of this study was to assess responses of aquatic macroinvertebrate assemblages to riparian cover change in Murocomba protective forest, Valencia, Ecuador. Aquatic macroinvertebrates were collected and physicochemical variables were measured during dry (June-October 2014) and rainy (December-April 2015) seasons along three creeks with different riparian cover: native forests Q1-CBN, pasture for agricultural and livestock activities Q2-CAG, and exotic forest plantations Q3-CPF. According to the Macroinvertebrate Family Biotic Index (FBI) and the Biological Monitoring Working Party Index (BMWP/Col) the best conditions existed in the creek Q1-CBN, while the Ephemeroptera, Plecoptera and Trichoptera Index (EPT) decreased in the creek Q2-CAG during the rainy season. The Shannon-Weaver index showed higher values in Q1-CBN and Q3-CPF in the dry period, and the dominance increased in the Q3-CPF in rainy season. A total of 6 583 macroinvertebrates were collected. Trichoptera was the most abundant order and Hidropsychidae the most abundant family. The Coleoptera order showed greater abundance in Q1-CBN and Diptera in Q2-CAG, while Hemiptera showed the lowest abundance in Q3-CPF. Psephenidae, Chironomidae, Leptophlebiidae, Veliidae, Simuliidae, Baetidae and Leptohyphidae were associated with the highest values of total dissolved solids and pH, as well as higher values of IBF and lower values of EPT, BMWP, and depth of the channel in Q2-CAG, whereas Leptoceridae, Elmidae, Ptilodactylidae and Philopotamidae were associated with higher values of EPT, BMWP and depth of the channel in Q1-CBN and Q3-CPF. A negative influence of anthropic activities on the physicochemical variables and structure of the macroinvertebrate assemblages was evidenced. This indicates that the riparian vegetation is a factor that determines the establishment and structure of aquatic communities. <![CDATA[Long-term monitoring of crab <em>Cardisoma guanhumi</em> (Decapoda: Gecarcinidae) captures in Jobos Bay Estuary, Puerto Rico]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442019000400879&lng=en&nrm=iso&tlng=en Abstract The densities of the land crab Cardisoma guanhumi has been declining due to overfishing, habitat degradation and loss, and continued capture in Natural Protected Areas (NPA). Numerous management strategies and regulations have been developed to monitor and reduce population declines. In Puerto Rico, an administrative order of 1999, regulates a closed season, prohibited the capture of crabs through the year from NPA’s and below a minimum size for capture (64 mm). The goal of this research was to monitor spatial-temporal dynamics of crab captures after the implementation of the administrative order. Crabs captured in the Jobos Bay Estuary (JBE) were studied over a 15-year period. The size (carapace width) (CW), sex, and color were documented for 1 531 crabs from 31 crab hunters. Significant temporal difference in crab size was observed (Kruskal Wallis = 46.82, P &lt; 6.187e-9), the smallest crabs were captured in 2004 and the largest crabs were captured in 2013. Crab size varied by color (Kruskal Wallis = 86.54, P &lt; 2.2e-16), larger crabs were blue, medium sized crabs were brown and smallest crabs were orange. Since color is related to development stage and market value, color can be used as an educational and enforcement tool. There was significant spatial difference in the size of crabs captured (Kruskal Wallis = 252.54, P &lt; 2.2 e-16), smaller crabs were captured in smaller hunting areas. Only three percent of crabs captured from 2009 to 2018 were below the legal-size limit. Temperature had a weak significant positive relationship with crab size and in years when rainfall was lower smaller crabs were captured. Increases in crab size from 2004 to 2013 coincided with mangrove recovery and the current decrease of crab size coincides with droughts of 2015. Management plans in the Caribbean must include local actions to reduce hunting and climate variability impacts on crab habitat and food availability.<hr/>RESUMEN Las densidades del cangrejo terrestre Cardisoma guanhumi ha disminuido debido a la sobrepesca, la degradación y pérdida de hábitat y la captura continua en áreas naturales protegidas (ANP). Se han desarrollado numerosas estrategias y regulaciones de gestión para monitorear y reducir el declive de la población. En Puerto Rico, una orden administrativa de 1999 regula una temporada cerrada, prohibió la captura de cangrejos durante todo el año en las ANP y por debajo de un tamaño mínimo para la captura (64 mm). El objetivo de esta investigación fue monitorear la dinámica espacio-temporal de las capturas de cangrejo después de la implementación de la orden administrativa. Los cangrejos capturados en el estuario de la Bahía de Jobos (JBE) se estudiaron durante un período de 15 años. El tamaño (ancho del caparazón) (CW), el sexo y el color se documentaron para 1 531 cangrejos de 31 cazadores de cangrejos. Se observó una diferencia temporal significativa en el tamaño del cangrejo (Kruskal Wallis = 46.82, P &lt; 6.187e-9), los cangrejos más pequeños se capturaron en 2004 y los cangrejos más grandes en 2013. El tamaño del cangrejo varió según el color (Kruskal Wallis = 86.54, P &lt; 2.2e-16), los cangrejos más grandes eran azules, los cangrejos medianos eran marrones y los cangrejos más pequeños eran anaranjados. Dado que el color está relacionado con la etapa de desarrollo y el valor de mercado, el color se puede utilizar como herramienta educativa y de cumplimiento. Hubo una diferencia espacial en el tamaño de los cangrejos capturados (Kruskal Wallis = 252.54, P &lt; 2.2e-16), se capturaron cangrejos más pequeños en áreas de caza pequeñas. Solo el tres por ciento de los cangrejos capturados de 2009 a 2018 estaban por debajo del límite de tamaño legal. La temperatura tuvo una relación positiva significativa con el tamaño del cangrejo, cuando la lluvia fue menor, se capturaron cangrejos pequeños. Los aumentos en el tamaño de los cangrejos de 2004 a 2013 coincidieron con la recuperación de los manglares y la disminución actual del tamaño de los cangrejos coincide con las sequías de 2015. Los planes de manejo en el Caribe deben incluir acciones locales para reducir la caza y los impactos de la variabilidad del clima en el hábitat del cangrejo y la disponibilidad de alimentos. <![CDATA[Systematics and phylogeny of <em>Oecopetalum</em> (Metteniusaceae), a genus of trees endemic to North and Central America]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442019000400888&lng=en&nrm=iso&tlng=en RESUMEN El género Oecopetalum Greenm. &amp; C.H. Thomps. (Metteniusaceae) se distribuye en el sureste de México y en América Central (Guatemala, Nicaragua y Costa Rica). Tres especies han sido descritas. Estudiamos especímenes de herbario de Oecopetalum y realizamos un análisis filogenético basado en los genes de los cloroplastos matK y ndhF para responder a las preguntas principales: ¿Cuántas especies hay en el género Oecopetalum? ¿Es Oecopetalum monofilético? ¿Cuáles son las relaciones genéricas con otros miembros de la familia? Oecopetalum es un género monofilético con solo dos especies y Pittosporosis es el grupo hermano. La relación transatlántica de Oecopetalum y Pittosporosis es un patrón geográfico recurrente en la familia Mettenuisaceae, así como en Icacinaceae. Nuestros resultados, en concordancia con la evidencia fósil y las relaciones de otros grupos, apoyan el modelo boreotropical de migraciones terrestres de táxones tropicales desde latitudes altas durante el Paleoceno-Eoceno, globalmente cálido.<hr/>Abstract Oecopetalum Greenm. &amp; C.H. Thomps. (Metteniusaceae) is distributed in the southeastern portion of Mexico to Central America (Guatemala, Nicaragua, and Costa Rica). Three species have been described. We studied herbarium specimens of the genus Oecopetalum and performed a phylogenetic analysis based on the plastid genes matK and ndhF to answer several major questions: How many species are in the genus Oecopetalum? Is Oecopetalum monophyletic, and how is the genus related to other members of the family? Our results indicate that Oecopetalum is monophyletic, with only two species, and sister to the Asian genus Pittosporopsis. The Trans-Atlantic relationship of Oecopetalum and Pittosporosis is a recurrent geographic pattern in the families Mettenuisaceae and Icacinaceae. Our results, in agreement the fossil record and previous phylogenetic studies, support the boreotropical model of high-latitude terrestrial migrations of tropical taxa during the globally warm Paleocene-Eocene. <![CDATA[Reunion overseas: introduced wild boars and cultivated orange trees interact in the Brazilian Atlantic Forest]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442019000400901&lng=en&nrm=iso&tlng=en ABSTRACT Introduction: Little is known concerning novel interactions between species that typically interact in their native range but, as a consequence of human activity, are also interacting out of their original distribution under new ecological conditions. Objective: We investigate the interaction between the orange tree and wild boar, both of which share Asian origins and have been introduced to the Americas (i.e. the overseas). Methods: Specifically, we assessed whether i) wild boars consume orange (Citrus sinensis) fruits and seeds in orchards adjacent to a remnant of the Atlantic Forest of Brazil, ii) the orange seeds are viable after passing through boar’s digestive tract and iii) whether the orange tree may naturalise in the forest remnant assisted by wild boars. Results: Our camera surveys indicated that wild boar was by far the most frequent consumer of orange fruits (40.5 % of camera trap-days). A considerable proportion of sown orange seeds extracted from fresh boar feces emerged seedlings (27.8 %, N = 386) under controlled greenhouse conditions. Further, 37.6 % of sown seeds (N = 500) in the forest remnant emerged seedlings in July 2015; however, after ~4 years (March 2019) only 9 seedlings survived (i.e. 4.8 %, N = 188). Finally, 52 sweet orange seedlings were found during surveys within the forest remnant which is intensively used by wild boars. This study indicates a high potential of boars to act as effective seed dispersers of the sweet orange. However, harsh competition with native vegetation and the incidence of lethal diseases, which quickly kill sweet orange trees under non-agricultural conditions, could seriously limit orange tree establishment in the forest. Conclusions: Our results have important implications not only because the wild boar could be a vector of potential invasive species, but also because they disperse seeds of some native species (e.g. the queen palm, Syagrus romanzofiana) in defaunated forests, where large native seed dispersers are missing; thus, wild boars could exert critical ecological functions lost due to human activity.<hr/>RESUMEN Introducción: Se conoce relativamente poco sobre las llamadas 'interacciones noveles' entre especies que típicamente interactúan en su área de distribución nativa pero que, como consecuencia de la actividad humana, también interactúan fuera de su distribución original bajo nuevas condiciones ecológicas. Objetivo: Investigamos la interacción entre el naranjo y el jabalí, ambos con origen asiático e introducidos en las Américas (es decir, del extranjero). Métodos: Específicamente, evaluamos si i) los jabalíes consumen frutas y semillas del naranjo (Citrus sinensis) en naranjales adyacentes a un parche remanente del bosque atlántico de Brasil, ii) las semillas de naranja son viables tras pasar por el tracto digestivo del jabalí, y iii) si el naranjo puede llegar a naturalizarse en el parche de bosque gracias a los jabalíes. Resultados: Los resultados de nuestro fototrampeo indicaron que el jabalí fue, con mucho, el consumidor más frecuente de las naranjas (40.5 % cámaras trampa-días). Una proporción considerable de semillas de naranjo extraídas de heces de jabalí frescas y sembradas emergieron plántulas bajo condiciones de invernadero controladas (27.8 %, N = 386). Además, del 37.6 % de las semillas sembradas (N = 500) en el parche remanente de bosque emergieron plántulas en julio 2015; sin embargo, después de ~ 4 años (marzo 2019) solo sobrevivieron 9 plántulas (es decir, 4.8 %, N = 188). Finalmente, se encontraron 52 plántulas de naranja dulce durante varias prospecciones dentro del parche de bosque que es utilizado intensivamente por los jabalíes. Este estudio indica un alto potencial de los jabalíes para actuar como dispersores de semillas eficaces del naranjo dulce. Sin embargo, la severa competencia con la abundante vegetación nativa y la incidencia de enfermedades letales, que matan rápidamente los naranjos dulces en condiciones no agrícolas, podrían limitar seriamente el establecimiento de naranjos en el bosque. Conclusiones: Nuestros resultados tienen implicaciones importantes no solo porque el jabalí podría ser un vector de posibles especies de plantas invasoras, sino también porque dispersan semillas de algunas especies nativas (p.e., la palmera reina, Syagrus romanzofiana) en estos bosques defaunados, donde faltan dispersores nativos de semillas de gran tamaño. Por ello, los jabalíes podrían ejercer funciones ecológicas críticas que se han perdido debido a la actividad humana. <![CDATA[Fishes from the Gulf of Nicoya, Pacific, Costa Rica: an update of the lists of the Skimmer and Victor Hensen research vessels]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442019000400913&lng=en&nrm=iso&tlng=en RESUMEN Introducción: Desde mediados del siglo XX el estuario del Golfo de Nicoya (10o N &amp; 85o W) ha sido la fuente principal de numerosos recursos pesqueros, como los moluscos, crustáceos y peces. El estuario está actualmente bajo impactos crecientes locales, regionales y globales. Las expediciones a bordo de los buques científicos Skimmer (1979-1980) y Víctor Hensen (1993-1994) aportaron datos multidisciplinarios en apoyo de políticas de manejo. Sin embargo, actualmente se necesita información actualizada. Objetivos: Actualizar las listas publicadas de peces recolectados en ambas expediciones y sugerir nuevas áreas de investigación para una futura evaluación del estado del ecosistema. Métodos: En el buque Skimmer las capturas de peces cubrieron un ámbito de profundidad de 10 a 50 m, con una red tipo otter. En el buque V. Hensen las capturas se hicieron entre 10 y 240 m de profundidad, con redes tipo otter y beam. En ambos cruceros se hizo a bordo la identificación de las especies y la medición de sus longitudes totales. Para actualizar las listas de especies se procedió a la verificación de los nombres vigentes con base en literatura reciente y la página World Register of Marine Species (WORMS). Agregamos a la lista los nombres de las especies identificadas en años recientes para el estuario y catalogados en la Colección Ictiológica del Museo de Zoología, Universidad de Costa Rica. Resultados: El total de especies identificadas es de 268 para ambos buques. Una especie de Syacium está pendiente de identificación. Del total, 19 especies corresponden a peces cartilaginosos y 249 a peces óseos. Los Scianeidae (corvinas) y los lenguados estuvieron representados por 31 y 32 especies, respectivamente. El género Symphurus (lenguados) fue el más diverso, con 11 especies. Dieciocho especies fueron identificadas después de la publicación de las listas originales. Ocho especies fueron descritas con base en ejemplares recolectados por ambos buques: Gymnothorax phalarus, Notarius biffi, N. cookei, Ophicthus mecoptera, O. melope, Sphoeroides rosenblatti, Trinectes xanthurus y Urotrygon cimar. Las especies presentes en más del 50 % de las 20 estaciones del Skimmer, fueron: Prionotus horrens (16), Sphoeroides trichocephalus (14), Syacium ovale (13) y Synodus scituliceps (13). En las 12 estaciones del V. Hensen, fueron: Porichthys margaritatus (9), S. scituliceps (8), Bollmannia chlamydes (6), Symphurus callopterus (6), S. elongatus (6) y Synodus evermanni (6). Los cinco peces de mayor longitud capturados por ambos buques, fueron: la raya látigo Hypanus longus (117 cm), el congrio Cynoponticus coniceps (103 cm), el bagre Sciades dowii (87 cm), la raya Narcine brancroftii (80 cm) y la corvina reina Cynoscion albus (75 cm). La longitud total máxima promedio de 137 especies medidas en el Skimmer fue de 26 cm y de 29 cm para las 164 medidas en el V. Hensen. Conclusiones: En vista del incremento del número de usuarios de los recursos estuarinos, es urgente una evaluación multidisciplinaria del ecosistema en apoyo a la propuesta de nuevas políticas de manejo. Los resultados facilitarían actualizar el Modelo Trófico del Golfo de Nicoya, una herramienta de manejo disponible desde 1998 y basada principalmente en datos obtenidos durante los cruceros del Skimmer y V. Hensen. Tensores del ecosistema, como la extracción de recursos, el ingreso de contaminantes y su posible relación con la disrupción endocrina, así como la presencia de barreras naturales como la hipoxia en la boca del estuario, deben ser incluidos en esa futura evaluación.<hr/>Abstract Introduction: Since the middle of the XXth century the Gulf of Nicoya estuary (10o N &amp; 85o W) has been the main source of numerous fishing resources, such as mollusks, crustaceans, and fish. The estuary is presently under the increasing impact of local, regional and global stressors. The expeditions on board the R.V. Skimmer (1979-1980) and R.V. Hensen (1993-1994) research vessels provided multidisciplinary data on the estuary in support of management policies. However, updated information is still needed. Objectives: To update the published lists of fish species from both expeditions and make suggestions for new research areas for future evaluations of the ecosystem. Methods: The fish collections by the Skimmer covered a depth range of 10 to 50 m using an otter trawl net, and those aboard the Victor Hensen were made between 10 and 228 m depth using otter and beam trawl nets. The identification of the fish species and the measurement of its lenghts were made on board of both vessels. The species names were updated based on recent literature and the web page World Register of Marine Species (WORMS). The list of species identified in recent years based on voucher specimens from the estuary and deposited in the Ichthyology Collection of the Museum of Zoology, University of Costa Rica, was also included. Results: The total number of identified species from both vessels is 268. A species of Syacium is yet undescribed. Of the total, 19 are cartilaginous fishes and 249 are bony fishes. The Sciaenidae and the flatfishes were represented by 31 and 32 species, respectivley. The flatfish genus Symphurus was the most diverse, with 11 species. Eighteen species were identified after the publication of the original lists. Eight species were described based on specimens collected during the expeditions: Gymnothorax phalarus, Notarius biffi, N. cookei, Ophicthus mecoptera, O. melope, Sphoeroides rosenblatti, Trinectes xanthurus and Urotrygon cimar. The species present in more than 50% of the 20 Skimmer stations, were: Prionotus horrens (16 stations), Sphoeroides trichocephalus (14), Syacium ovale (13) and Synodus scituliceps (13). In the 12 stations of the V. Hensen there were: Porichthys margaritatus (9), S. scituliceps (8), Bollmannia chlamydes (6), Symphurus callopterus (6), S. elongatus (6), and Synodus evermanni (6). The five longer specimens collected by both vessels, were: the longtail sting ray Hypanus longus (117 cm), the pike conger Cynoponticus coniceps (103 cm), the brown sea catfish Sciades dowii (87 cm), the electric ray Narcine brancroftii (80 cm), and the queen corvina Cynoscion albus (75 cm). The average total length for 137 species measured during the Skimmer cruises was 26 cm, and 29 cm for the 164 measured during the V. Hensen survey. Conclusions: In view of the increasing number of users of the estuarine resources, it is urgent a multidisciplinary evaluation of the ecosystem in support of new management policies. The expected results may facilitate updating the Gulf of Nicoya Trophic Model, a management tool available for the estuary since 1998 and based mainly on information gathered during both expeditions. Ecosystem stressors, such as the extraction of resources, the input of pollutants and its possible link to endocrine disruption, as well as the presence of natural barriers such as hypoxia at deeper waters at the mouth of the estuary must be taken into account in a future evaluation. <![CDATA[New polymorphism in the sodium channel gene of <em>Rhipicephalus microplus</em> tick (Ixodida: Ixodidae) resistant to pyrethroids]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442019000400935&lng=en&nrm=iso&tlng=en RESUMEN Para el control de Rhipicephalus microplus, garrapata común de los bovinos, se usan compuestos piretroides entre otros. El estudio de los mecanismos de resistencia hacia piretroides en esta garrapata ha demostrado la presencia de mutaciones en el gen del canal del sodio, sitio blanco del acaricida. El presente estudio tuvo como objetivo principal detectar el polimorfismo T2134A en el gen del canal del sodio que ha sido relacionado con resistencia a piretroides en individuos portadores. Para ello se recolectaron 182 garrapatas R. microplus en dos fincas con historial de resistencia a este tipo de acaricidas y se sometieron a una prueba de inmersión de hembras en una solución de cipermetrina preparada a la dosis recomendada para uso en campo, obteniendo seis individuos susceptibles, 92 resistentes y 84 medianamente resistentes. Se extrajo el ADN de todos los especímenes utilizando QIAamp DNA Mini Kit® y se procesó por PCR convencional empleando cebadores alelo específicos para amplificar un segmento del dominio IIIS6 del gen del canal del sodio. Los amplicones resultantes se detectaron por electroforesis en geles de agarosa al 2 % teñidos con GelRed® y se visualizaron con luz ultravioleta. De igual manera se efectuó el secuenciamiento de 20 muestras obtenidas en los tres fenotipos susceptible, medianamente resistente y resistente y las secuencias resultantes fueron alineadas mediante el programa Mega 7 y comparadas con secuencias almacenadas en el GenBank®. Los análisis mostraron que la población de R. microplus estudiada no presentaba la mutación esperada sino una mutación diferente en el sitio 2 134. Se observó la sustitución de una timina pero por una citosina, T2134C, que a la traducción genera el cambio de una fenilalanina por una leucina, a diferencia de la mutación previamente identificada, que genera el cambio de una fenilalanina por una isoleucina. Esto demuestra la presencia de un polimorfismo que no ha sido reportado en esta especie de garrapata y que generaría un nuevo marcador molecular de resistencia a piretroides para poblaciones de este ácaro.<hr/>Abstract For the control of Rhipicephalus microplus, cattle tick, pyrethroid compounds are used among others. The study of the mechanisms of resistance to pyrethroids in this tick has shown the presence of mutations in the sodium channel gen, the target site of acaricide. The main objective of the present study was to detect the T2134A polymorphism in the sodium channel gene that has been related to pyrethroid resistance in carriers. To do so, 182 ticks R. microplus were collected in two farms with a history of resistance to this type of acaricide and were subjected to a dip test of females in a cypermethrin solution prepared at the recommended dose for field use, obtaining six susceptible, 92 resistants and 84 moderately resistants. DNA is extracted from all specimens using QIAamp DNA Mini Kit® and processed by conventional PCR using allele-specific primers to amplify a segment of domain IIIS6 of the sodium channel gene. The resulting amplicons were detected by electrophoresis in 2 % agarose gels stained with GelRed® and visualized with ultraviolet light. In the same way, 20 samples were sequenced of the three susceptible phenotypes, moderately resistant and resistant and the resulting sequences were aligned through the Mega 7 program and compared with the sequences stored in the GenBank®. The information of the population of R. Microplus studied did not show the expected mutation but a different mutation in the site 2134. We also observed the substitution of a thymine but by a cytosine, T2134C, which changes to a phenylalanine by a leucine, a difference from the previously identified mutation, that the change from phenylalanine to isoleucine. This shows the presence of a polymorphism that has not been reported in this species of tick and that would generate a new molecular marker of pyrethroid resistance for populations of this mite. <![CDATA[Effects of seasonal upwelling on hydrography and mesozooplankton communities in a Pacific tropical cove off Colombia]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442019000400945&lng=en&nrm=iso&tlng=en Abstract Introduction: The effects of seasonal upwelling on the conditions of the water column and mesozooplankton communities are poorly understood in the coastal zones of the Eastern Tropical Pacific (ETP), despite the important role of upwelling events in the modulation of productivity in these zones.Objective:To evaluate the influence of seasonal upwelling over the Panama Bight on the structure of the water column and mesozooplankton communities in a tropical cove of the ETP. Methods:Hydrographic data and mesozooplankton samples were collected during four field campaigns in Ensenada de Utría (December 2011, February 2012, October 2013, and February 2013), an estuary located in the Northern Pacific coast of Colombia. Non-parametric and multivariate analyses were used to evaluate seasonal differences in the environmental and biotic variables. Results:Surface waters were warm (&gt; 25 °C) and presented low salinities (&lt; 30) throughout the study period. In contrast, subsurface waters were colder (&lt; 20 °C), saltier (&gt; 33), and presented low dissolved oxygen concentrations (&lt; 2.0 ml l-1) during the dry season (January - March), whereas the water column was homogeneous during the rainy season (April - December). Despite the seasonal changes in the environmental conditions, the expected enhancement in the productivity of the system during the dry season (i.e., higher biomass and abundance of the mesozooplankton) only occurred in February 2012. Contrary to expectations, ichthyoplankton abundance was higher during the rainy season, when the assemblage was dominated by the larvae of anchovy (Cetengraulis mysticetus) and an unidentified Gobiidae.Conclusions: The entrance of upwelled waters into Ensenada de Utría is an important factor modulating the seasonal changes observed in the water column. However, there is high interannual variability in the response of mesozooplankton communities to the upwelling events. Because upwelled waters are oxygen-depleted and more acidic, the entrance of upwelled waters into Ensenada de Utría could be causing physiological stress to the benthic and pelagic organisms inhabiting the deepest zones of the cove. This condition may worsen in the future given the predicted increase of deoxygenation and ocean acidification due to climate change.<hr/>RESUMEN Introducción: Los efectos de surgencias estacionales sobre la estructura de la columna de agua y las comunidades del mesozooplancton son pobremente entendidos en zonas costeras del Pacífico Oriental Tropical (POT), a pesar de la importancia que tienen los eventos de surgencia en modular la productividad en estas zonas. Objetivo: Evaluar los efectos de la surgencia estacional que ocurre en la Ensenada de Panamá sobre la columna de agua y las comunidades del mesozooplancton en una ensenada tropical del POT. Métodos: Los datos hidrográficos y las muestras de mesozooplankton fueron recolectados durante cuatro campañas de muestreo en la Ensenada de Utría (diciembre 2011, febrero 2012, febrero 2013, octubre 2013), un estuario ubicado en la costa norte del Pacífico colombiano. Las diferencias estacionales en las variables ambientales y bióticas se evaluaron mediante análisis no paramétricos y multivariados. Resultados: Las aguas superficiales fueron cálidas (&gt; 25 °C) y presentaron bajas salinidades (&lt; 30) a lo largo de todo el periodo de estudio. En contraste, las aguas subsuperficiales fueron más frías (&lt; 20 °C), más salinas (&gt; 33) y presentaron menores concentraciones de oxígeno disuelto (&lt; 2.0 ml l-1) durante la época seca (enero - marzo), mientras que la columna de agua fue homogénea durante la época de lluvias (abril - diciembre). A pesar de los cambios estacionales en las condiciones ambientales, el incremento esperado en la productividad del sistema durante la época seca (i.e., mayor biomasa y abundancia del mesozooplancton) sólo se observó durante febrero 2012. Contrario a lo esperado, la abundancia del ictioplancton fue mayor durante la época de lluvias, periodo en el que el ensamblaje estuvo dominado por un Gobiidae sin identificar y la carduma (Cetengraulis mysticetus). Conclusión: La entrada de aguas de surgencia a la Ensenada de Utría es un factor importante que modula los cambios estacionales observados en la columna de agua. Sin embargo, la respuesta de las comunidades del mesozooplancton ante los eventos de surgencia presentó alta variabilidad interanual. Considerando que las aguas de surgencia son reducidas en oxígeno y más acídicas, la entrada de aguas de surgencia a la Ensenada de Utría podría estar causando estrés fisiológico a los organismos bentónicos y pelágicos que habitan las zonas más profundas de la ensenada. Esta condición podría volverse más severa en el futuro considerando las predicciones que sugieren un incremento de la desoxigenación y acidificación del océano debido al cambio climático. <![CDATA[Foraging plasticity of <em>Atta cephalotes</em> (Hymenoptera: Formicidae) in response to temperature differences between forest and pasture]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442019000400963&lng=en&nrm=iso&tlng=en Abstract Introduction: Changes in microclimatic conditions due to land cover transformations influence variations in population life histories and the developmental patterns of organisms. These variations can have a genetic basis, an environmental basis, or both. Objective:To determine the differences between habitats in the foraging activity of Atta cephalotes in response to changes in temperature and the extent to which any such differences are due to phenotypic plasticity, genetic variability, or both.Methods:We performed foraging experiments; each colony (4 colonies sourced from pasture and 3 colonies sourced from forest) underwent eight temperature treatments from 10 to 45 ºC (± 1 ºC) at 5 ºC intervals, using common garden and reciprocal transplant experiments. Results:We found high plasticity in the foraging activity of Atta cephalotes in response to temperature, with the foraging activity gradually increasing from 15 to 35 ºC. Additionally, we found no significant differences in the foraging activity between the colonies sourced from the pasture and forest. Conclusions:The foraging activity of A. cephalotes was directly proportional to temperature, with ants exhibiting thermophilic behaviors and high plasticity, and there were no differences in the foraging activity between colonies sourced from both habitats.<hr/>RESUMEN Introducción: Los cambios en las condiciones microclimáticas debidos a la transformación de las coberturas vegetales genera variaciones en las historias de vida de las poblaciones y en los patrones de desarrollo de los organismos. Estas variaciones pueden tener bases genéticas, ambientales o ser el resultado de una interacción entre ambas. Objetivo: determinar las diferencias en la actividad de “forrajeo” de Atta cephalotes en respuesta a los cambios de temperatura en dos hábitats adyacentes y hasta qué grado estas diferencias son dadas por la plasticidad fenotípica, la variabilidad genética o la interacción de las dos. Métodología: se realizaron experimentos de “forrajeo”; cada colonia (4 colonias originarias de pasturas y 3 colonias originarias de bosque) se sometió a 8 tratamientos de temperatura de 10 a 45 ºC (± 1 ºC) a intervalos de 5 ºC usando experimentos de crianza común y transferencia recíproca. Resultados: se observó una alta plasticidad en la actividad de “forrajeo” de Atta cephalotes en respuesta a la temperatura, con un incremento gradual del “forrajeo” desde los hasta los 35 ºC. Adicionalmente no se encontraron diferencias significativas en la actividad de “forrajeo” entre las colonias originarias de la pastura y las del bosque. Conclusiones: la actividad de “forrajeo” de A. cephalotes, fue directamente proporcional a la temperatura, las hormigas mostraron un comportamiento termofílico y una alta plasticidad, y no hubo diferencias en la actividad de “forrajeo” entre colonias de los dos hábitats. <![CDATA[Testicular biometry and seminal traits in neotropical cats (Carnivora: Felidae) by uretral catheterization]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442019000400975&lng=en&nrm=iso&tlng=en RESUMEN Introducción: La administración de un fármaco agonista de un alfa- 2-adrenérgicos asociado con la técnica del cateterismo uretral, es un método de desarrollo reciente en la recolección seminal en felinos, ofreciendo las ventajas sobre la recolecta por electroeyaculación y la recolecta epididimaria. La técnica se ha probado en Panthera onca y felinos de pequeño porte. Objetivos: Realizar la recolección seminal en felinos neotropicales utilizando la técnica de cateterización uretral. Determinar los parámetros testiculares y seminales de muestras recolectadas por la técnica de cateterización uretral. Metodología: En este estudio se utilizó un individuo por especie de Panthera onca, Puma yagouaroundi yLeopardus wedii localizados en el parque Zoobotánico Getúlio Vargas, Salvador, Bahia, Brasil. El semen fue recolectado por medio del cateterismo uretral y se utilizaron los farmácos: clorhidrato de medetomidina (0.1 mg /kg) y ketamina (5.0 mg /kg). Durante el desarrollo del procedimiento, se realizó la recolecta de los datos biométricos corporales y testiculares, así como la ultrasonografía de los testículos. Mediante microscopia óptica, en las muestras seminales se determinó: el vigor espermático, motilidad total, motilidad progresiva, la integridad estructural y funcional de la membrana plasmática y la morfología espermática. Las muestras se sometieron al proceso de congelación - descongelación utilizando tres diferentes crioprotectores. Las muestras descongeladas fueron evaluadas por microscopía convencional, análisis seminal computarizado y citometría de flujo. Resultados: En este estudio fue realizado con éxito la técnica de recolección seminal en las tres especies, siendo el primer estudio que informa de los parámetros seminales deP. yagouaroundiy el primero que reporta la recolección seminal uretral en L. wiedii. Los datos presentados describen de forma pionera la morfocinética espermática de las especies incluidas. No hubo diferencias (P &gt; 0.05) en la calidad seminal evaluando por grupo de crioprotector, ni diferencias en la integridad de las membranas pré e post-congelamento. Fue posible solamente la comparación con otras técnicas de recolección seminal o con resultados de calidad seminal obtenidos de muestras de gato doméstico. Conclusión: La cateterización uretral asociada al fármaco alfa- 2-adrenérgicos es una técnica eficiente para la recolección seminal en felinos neotropicales. El establecimiento de una potencial asociación de las características físicas del animal y la calidad seminal, es información de suma importancia en la aplicabilidad para la elección de reproductores en los programas de reproducción asistida.<hr/>Abstract Introduction: The urethral catheterization associated with the application of alfa- 2 adrenergic agonist drug is a recent development and application technique for the collection of feline semen, with advantages over electro-ejaculation harvesting and epididymal harvesting. Objetives: Seminal collection in neotropical felines using the urethral catheterization technique. Determine the testicular and seminal parameters of samples collected by the urethral cataterization technique. Methods: The technique has been tested on Panthera onca and others small cats. In this study, individuals of Panthera onca, Puma yagouaroundi and Leopardus wiedii were used in captivity at Getulio Vargas Zoobotanical Park, Salvador, Bahia, Brazil. Medetomidine hydrochloride (0.1 mg/kg) and ketamine (5.0 mg/kg) were used as sedatives, the semen was collected by urethral catheterization. In the process were checked the testicular biometry was performed with percutaner and ultrasonography technique. The fresh samples were evaluated for conventional microscopy in the parameters of volume, sperm vigor, total motility, progressive motility, structural and functional integrity of the plasmatic membrane and sperm morphology. The samples were subjected to a freeze - thaw process using three different extenders. The thawed samples were tested using conventional microscopy, automated system analysis and flow cytometry. Results: In this study, the urethral harvest technique was successfully used in the three species. In the literature used don’t have report about seminal parameters in P. yagouaroundi and urethral seminal collection in L. wiedii. The data presented describe the spermatic morphocinetics of the included species in a pioneer study. There were no differences (P &gt; 0.05) in the seminal quality evaluating the extender, nor differences in the integrity of pre and post-freeze membranes of the samples. Conclusion: The urethral catheterization associated with the application of alfa- 2 adrenergic agonist drug it’s an efficient technique for semen collection in neotropical cats. The establishment of a potential association of physical characteristics with seminal quality is extremely important information on the applicability of reproductive traits in assisted reproduction programs. <![CDATA[Subandean forest vegetation in Bolívar, Santander-Colombia]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442019000400989&lng=en&nrm=iso&tlng=en RESUMEN En este estudio se calculó la composición y estructura de un fragmento de bosque subandino en el municipio de Bolívar; área afectada por deforestación, pérdida de hábitat y expansión de la agricultura siendo factores que han limitado el desarrollo de estos fragmentos. Dicho bosque se encuentra entre los 1 400-1 800 m altitudinales, a 24 °C y 2 000-3 000 mm/año. Se realizaron 10 transectos (100x5 m), en ellos se registraron las siguientes formas de crecimiento: arbórea, arbustiva, herbácea, palmoide, bejuco, epífita, hemiepífita, parásita y helecho arborescente, además de la recopilación de datos morfológicos. La composición de familias y géneros se evaluó a través de índices de diversidad, dominancia, equidad y similitud; para la estructura se calcularon IVI, IPF, IVF e intervalos de clase (altura, cobertura y DAP). Se registraron 102 familias, 257 géneros y 483 especies, con 73 dicotiledóneas (72 %), 13 monocotiledóneas (13 %) y 15 pteridófitas (15 %). Las familias con mayor número de géneros y especies fueron: Rubiaceae (15 géneros/29 especies), Piperaceae (2/25), Gesneriaceae (11/19), Melastomataceae (8/19), Solanaceae (4/16), Araceae y Urticaceae (7/15). Los géneros más ricos en especies fueron: Piper (16 especies), Miconia (10), Ficus, Peperomia y Solanum (9), Anthurium y Clusia (7) Passiflora, Siparuna, Pilea y Zanthoxylum (6). La dominancia y diversidad evidenció uniformidad en las especies, apoyado en la equitatividad del bosque. La similitud entre transectos es del 24 % indicando un alto recambio de especies. El crecimiento herbáceo fue el mejor representado con 56 familias y 166 especies. Este estudio mostro una alta diversidad, así como se identifican nuevos registros para Santander, como: Passiflora engleriana Harms Endangered En Peligro (EN), Aiphanes concinna H.E. Moore (casi amenazada, NT), Miconia neomicrantha Judd &amp; Skean y Guarea kunthiana A. Juss. (Preocupación Menor, LC).<hr/>Abstract We made a compositional and structural analysis in a subandean forest fragment in the municipality of Bolivar; area affected by deforestation, habitat loss and expansion of agriculture being stressors that have limited the development of these fragments. Forest is located between 1 400 and 1 800 m, at 24 °C and 2 000-3 000 mm/year. We made 10 transects (100*5 m), we recorded types of growth such as trees, shrubs, herbaceous, palmoid, liana, epiphyte, hemiepiphyte, parasite, tree fern and morphological data. We assessed families and genera composition using diversity, dominance, equitability and similarity indexes; IVI, IPF, IVF and frequency distribution (altitude, coverage, DAP). We recorded 102 families, 257 genera and 483 species, with 73 dicotyledons (72 %), 13 monocotyledons (13 %) and 15 pteridophytes (15 %). Families with the highest genera and species number were: Rubiaceae (15 genera/29 species), Piperacae (2/25), Gesneriaceae (11/19), Melastomataceae (8/19), Solanaceae (4/16) Araceae and Urticaeceae (7/15 each one). Genera with the highest species number were: Piper (16 species), Miconia (10), Ficus, Peperonia and Solanum (9) Anthurium and Passiflora, Siparuna, Pilea and Zanthoxylum (6). Dominance and diversity indicated species uniformity, supported in the forest equitability. The similitude between transects is 24 % denoting a high species turnover. The herbaceous growth was the better represented with 56 families and 166 species. This research showed a high diversity and new records for Santander, with Passiflora engleriana Harms Endangered (EN), Aiphanes concinna H.E. Moore (Near threatened, NT), Miconia neomicrantha Judd &amp; Skean and Guarea kunthiana A. Juss. (Low Concern, LC). <![CDATA[Inhibition by essential oils of <em>Mentha viridis</em> and <em>Mentha pulegium</em> (Lamiaceae) in proteolysis, fibrinogenolysis and coagulation caused by venomous snakes]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442019000400999&lng=en&nrm=iso&tlng=en Abstract Snake venoms are widely used as laboratory tools for studies of physiological, pharmacological and toxicological mechanisms. Venoms used here are rich sources of several classes of proteases that act on factors of the coagulation cascade, fibrinogenolysis and fibrinolysis, altering the hemostatic processes, and phospholipases A2 which are involved mainly in inflammatory and clotting processes. Natural products such as essential oils are made up of active ingredients with wide application in the food, pharmaceutical and cosmetic industries. Thus, this study evaluates the essential oils from Mentha viridis and Mentha pulegium on coagulation, fibrinogenolysis and degradation of azocasein, induced by Bothrops sp and Lachesis muta muta venoms. These oils were achieved by hydrodistillation and presented, respectively, as the main constituents linalool (40.70 %), carvone (13.52 %) and α-terpinene (8.56 %); pulegone (50.01 %), menthol (31.90 %) and menthone (16.56 %). The essential oils were previously incubated with Bothrops alternatus venom, for two different times, then plasma was added and time was recorded. The M. viridis oil presented greater anticlotting potential. Meanwhile, the M. pulegium oil presented anticlotting or proclotting activity dependent on the dose tested. The incubation time also influenced the effect of the oils on the coagulation time. At azocaseinolytic assay, the oil from M. pulegium reduced the activity for all evaluated venoms. The highest inhibition was of 39.99 %; on activity induced by B. jararacussu, M. viridis reduced the activity in 57.72 %. On B. moojeni, the major inhibition observed was of 74.67 %. The fibrinogenolysis induced by B. moojeni venom was totally inhibited by both oils in the evaluated proportions. The results show the presence in oils of protease inhibitors, considering serine and metalloproteases (acting on clotting factors or with hemorrhagic activity), as well as phospholipase A2 (enzymes involved in inflammation and clotting processes) inhibitors of wide application in medical and biotechnology areas.<hr/>RESUMEN Los venenos de serpientes son ampliamente utilizados como herramientas de laboratorio para estudios de mecanismos fisiológicos, farmacéuticos y toxicológicos. Los venenos son recursos ricos en diferentes clases de proteasas que actúan sobre los factores de la cascada de coagulación, fibrinogenólisis y fibrinólisis, alterando los procesos homeostáticos y las fosfolipasas A2, los cuales están involucrados en procesos inflamatorios y de coagulación. Los productos naturales como los aceites esenciales se componen de ingredientes activos de amplia aplicación en las industrias alimentaria, farmacéutica y cosmética. El presente estudio evalúa los aceites esenciales de Mentha viridis y Mentha pulegium sobre la coagulación, fibrinogenólisis y degradación de azocaseína, inducida por los venenos de Bothrops sp. y Lachesis muta muta. Los aceites esenciales fueron obtenidos por hidrodestilación y sus componentes principales fueron identificados respectivamente como el linalool (40.70 %), carvona (13.52 %) y α-terpineno (8.56 %); pulegone (50.01 %), mentol (31.9 %) y mentona (15.56 %). Los aceites esenciales fueron previamente incubados con veneno de Bothrops alternatus, durante dos tiempos diferentes, luego se agregó el plasma y fue registrado el tiempo. El aceite de M. viridis presentó el más grande potencial anticoagulante. Mientras tanto, el aceite de M. pulegium presentó actividad anticoagulante o procoagulante dependiendo de la dosis evaluada. El tiempo de incubación también influyó en el efecto de los aceites sobre el tiempo de coagulación. En el ensayo azocaseínolitico, el aceite de M. pulegium redujo la actividad para todos los venenos evaluados. La inhibición más alta inducida para el veneno de B. jararacussu fue de 39.99 %, para M. viridis la actividad fue reducida en 57.72 %, mientras que para B. moojeni, la mayor inhibición observada fue de 74.67 %. La fibrinogenólisis inducida por el veneno de B. moojeni fue totalmente inhibida por ambos aceites en las proporciones evaluadas. Los resultados muestran la presencia de inhibidores de proteasas en los aceites, como las serinas y metaloproteasas (actuando sobre los factores de coagulación o sobre la actividad hemorrágica), como también fosfolipasas A2 (enzimas involucradas en los procesos de inflamación y coagulación), los cuales son inhibidores de amplia aplicación en áreas médicas y biotecnológicas. <![CDATA[Bacterial extracts for the control of <em>Atta cephalotes</em> (Hymenoptera: Formicidae) and its symbiotic fungus <em>Leucoagaricus gongylophorus</em> (Agaricales: Agaricaceae)]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442019000401010&lng=en&nrm=iso&tlng=en Abstract Introduction: Leaf-cutting ants Atta cephalotes (Linnaeus) are one of the main insect pests in Latin America; these ants (along with Acromyrmex spp.) present a unique characteristic amongst ants, - the cultivation of the Leucoagaricus gongylophorus Möller (Singer) fungus as a food source. They belong to tribe Attini and build nests in underground chambers which are interconnected by pathways. These voracious ants have attacked over 45 crop fields in Colombia. The main control method has been the use of synthetic chemical products; however, alternative control measures must be established. One alternative that has a great potential are bacteria and their secondary metabolites. Objective: The aim of this study was to evaluate the insecticidal and antifungal effect of bacterial extracts on major worker A. cephalotes ants and the L. gongylophorus fungus. Methods: A total of 118 extracts produced by the same number of bacteria were evaluated. Among the strains that produced the active extracts were: Serratia sp., Xenorhabdus nematophila, Photorhabdus sp., and Bacillus thuringiensis. From each bacterium, extracts were prepared to test both insecticidal and repellent activity on worker ants, also to evaluate growth inhibition assays on L. gongylophorus. Results: Seventeen extracts showed insecticidal activity upon contact, 13 by ingestion, while 8 showed antifungal activity that was statistically significant. In total, 23 bacterial extracts exhibited some type of activity to control Atta cephalotes. Conclusions: The results show 23 bacterial extracts with some type of activity to control A. cephalotes, which exposes the potential there is to explore bacteria, especially entomopathogenic bacteria, which may contain interesting genes for the biological control of insects.<hr/>RESUMEN Introducción: Las hormigas cortadoras de hojas (Atta cephalotes) son una de las mayores plagas en América Tropical, estas hormigas (junto con Acromyrmex spp.) presentan una característica única entre las hormigas - el cultivo de un hongo como fuente de alimento (Leucoagaricus gongylophorus). Pertenecen a la tribu Attini y construyen sus nidos en cámaras subterráneas interconectadas por caminos. En el campo son muy voraces atacando más de 45 cultivos en Colombia. La metodología de control usada para el manejo de esta plaga ha sido principalmente el uso de productos químicos sintéticos, sin embargo, es importante establecer alternativas de control. Una fuente con gran potencial son las bacterias y sus metabolitos secundarios. Objetivo: El objetivo de la presente investigación fue evaluar la acción insecticida y antifúngica de los extractos bacterianos en obreras de A. cephalotes y el hongo L. gongylophorus. Métodos: Un total de 118 extractos, producidos por el mismo tipo de bacterias fueron evaluados. Resultados: Entre las cepas productoras se encontraban: Serratia sp., Xenorhabdus nematophila, Photorhabdus sp. y Bacillus thuringiensis. Diecisiete extractos mostraron actividad insecticida por contacto, 13 actividad por ingestión y 8 con actividad antifúngica estadísticamente significativa. En total 23 extractos bacterianos exhibieron algún tipo de actividad para el control de Atta cephalotes. Conclusiones: Los resultados muestran 23 extractos bacterianos con algún tipo de actividad hacia el control de A. cephalotes, los cuales exponen el potencial que hay para explorar bacterias, en especial las entomopatógenas. Estas bacterias pueden contener genes importantes para el control biológico de insectos. <![CDATA[Biogeography of tomato <em>Solanum lycopersicum</em> var. <em>cerasiform</em> (Solanaceae) in its center of origin (South America) and domestication (Mexico)]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442019000401023&lng=en&nrm=iso&tlng=en RESUMEN El tomate (Solanum lycopersicum) es una de las principales hortalizas en el mundo debido a las importantes ganancias económicas que genera su comercialización; sin embargo, a pesar de que la especie es ampliamente cultivada en el mundo, su diversidad genética se considera restringida. Esto hace que su resistencia a plagas y enfermedades en las variedades actualmente cultivadas sea baja. Existe la forma silvestre S. l. var ceraciforme que se distribuye desde Suramérica (centro de origen) hasta México (área de domesticación), específicamente en la vertiente del Golfo de México en Veracruz. Como objetivo, se quiso identificar patrones de diversificación ambiental con los que se pudiesen inferir procesos de adaptación de las poblaciones en el área de domesticación con respecto a su centro de origen. Asimismo, se planteó proponer medidas de conservación y rescate del tomate S. l. var. cerasiforme. Se realizaron modelos de nicho ecológico (MNE) con Maxent versión 3.4.1 (evaluados con AUC y ROC-parcial) para determinar la idoneidad de las condiciones ambientales, incluyendo proyecciones del centro de domesticación al área de origen y viceversa. Esto se realizó con base en ocho variables de temperatura y precipitación. Los registros de tomate fueron tomados de fuentes bibliográficas y trabajo de campo. Seguidamente, se realizó la prueba de comparación de nichos (equivalencia y similitud), propuesta por Broennimann et al. (2012), para evaluar la similitud de condiciones ambientales en ambas regiones. Posteriormente, se realizó un análisis de varianza seguido de una prueba de comparación de medias (Tukey, P ≤ 0.05) con las ocho variables ambientales utilizadas. Los valores de AUC (0.93 y 0.80) y ROC-parcial obtenidos (1.86 y 1.71; P = 0.0001) de los MNE muestran que fueron buenos modelos predictores. Se observó que en el centro de México existen condiciones ambientales similares a las del centro de origen, a diferencia de la vertiente del Golfo de México donde son diferentes. La prueba de equivalencia mostró que la comparación ambiental entre ambas regiones es menos equivalente que lo esperado por azar (P = 0.003). Mientras tanto, la otra prueba indica que la similitud que existe entre ambas regiones también se puede obtener por azar (P = 0.683). También, se encontraron diferencias significativas en tres variables de temperatura y precipitación. En conclusión, el centro de origen y de domesticación de S. l. var. cerasiforme tienen características ambientales en común a pesar de la distancia geográfica, pero existen zonas geográficas (vertiente del Golfo de México en Veracruz) en el área de domesticación con condiciones ambientales diferentes a las de su centro de origen y con un potencial importante como bancos de germoplasma.<hr/>Abstract The tomato (Solanum lycopersicum) is one of the main horticultural crops in the world because of the important economic benefits that its commercialization generates. Even though the species is widely cultivated in the world, it is susceptible to pests, diseases, and environmental stresses due to the loss of its genetic diversity. There is a wild form called S. l. var ceraciforme that is distributed from South America (its center of origin) to Mexico (its area of domestication), specifically on the slope of the Gulf of Mexico in Veracruz. Due to the large genetic diversity of these wild tomatoes, it is important to improve its crop. The objective of this investigation was to identify patterns of environmental diversification of the tomato, infer the processes of adaptation of the populations in the area of domestication with respect to their center of origin and propose measures of conservation and variation of S. l. var. cerasiforme. We generated two ecological niche models (MNE) with Maxent version 3.4.1 (evaluated with AUC and partial-ROC) to determine the suitability of environmental conditions including their respective projections from the domestication center to the area of origin and vice versa. We used eight variables of temperature and precipitation. Additionally, we included tomato records from bibliographical sources and fieldwork. We also used the niche comparison test (equivalency and similarity) proposed by Broennimann et al. (2012) to evaluate the similarity of environmental conditions in both regions. Subsequently, we carried out an analysis of variance followed by a mean comparison test (Tukey, P ≤ 0.05) with all environmental variables measured. The values of AUC (0.93 and 0.80) and partial-ROC (1.86 and 1.71, P = 0.0001) of the MNE showed that they were good predictive models. We observed that, in the center of Mexico, there are environmental conditions similar to those of the center of origin, unlike the slope of the Gulf of Mexico where they are different. The equivalency test showed that the environmental comparison between both regions is less similar than expected by chance (P = 0.003). The similarity test indicated that the existing similarity between both regions can also be obtained by chance (P = 0.683). We also found significant differences in three temperature and precipitation variables. In conclusion, we determined that the center of origin and domestication of S. l. var. cerasiforme has similar environmental characteristics despite the geographic distance; nevertheless, there are geographical zones (the Gulf of Mexico in Veracruz) in the area of domestication with different environmental conditions. Those places have the potential to contain valuable germplasms. <![CDATA[Tropical freshwater ostracodes as environmental indicators across an altitude gradient in Guatemala and Mexico]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442019000401037&lng=en&nrm=iso&tlng=en Abstract Detailed knowledge of species ecological preferences and robust taxonomy of paleobioindicators are prerequisites for accurate paleoclimate and paleoenvironmental studies. This study aims to expand the knowledge of modern, Neotropical freshwater ostracode fauna, across an altitudinal gradient from the karst lakes in the lowlands of El Petén, Guatemala (100-500 m.a.s.l.), to the mid-elevation lakes of the Lacandón forest (500-1 000 m.a.s.l.), to the higher-altitude lakes of Montebello, Chiapas, Mexico (1 000-1 500 m.a.s.l.). Eighteen ostracode species were identified in 24 lakes. Ostracodes were absent in Lakes Amarillo and Lacandón (mid-altitude), and San Diego (lowlands); probably explained by a structural difference of habitats and species interactions. Statistical analysis indicated that the most abundant species, Cypridopsis vidua (O.F. Müller, 1776), Cytheridella ilosvayi (Daday, 1905), Pseudocandona antillana (Broodbakker, 1983), and Darwinula stevensoni (Brady &amp; Robertson, 1870) have a continuous distribution along the entire altitudinal gradient. Some species display more restricted distributions, determined by temperature, precipitation and conductivity. For example, Eucypris sp. is restricted to the lowlands, Vestalenula sp. and Cypria sp. were found only at middle elevations. Species diversity is slightly greater in lakes at middle altitudes (Haverage = 1.09) than in water bodies in the lowlands (Haverage = 0.94) and in cooler lakes in the highlands (Haverage = 0.94), suggesting that mid-elevation lakes have a high potential for harboring microrefugia. Locally weighted scatterplot smoothing (LOESS regressions) provided ecological preference information for the four most frequent and widely distributed species, with respect to temperature, conductivity, bicarbonate (HCO3 -) concentration, precipitation, and pH. Darwinula stevensoni suggest an association more to cooler temperatures and lower conductivities proving its high tolerance range. Cypridopsis vidua is associated with warm and low-rainfall environments, such as recorded in the lowlands of Guatemala, and can be used as a paleobioindicator of vegetated littoral zones, because we found it always associated to this section of lakes. Cytheridella ilosvayi show preferences for warm and humid conditions, whereas P. antillana prefer colder and humid environments. Such quantitative-ecological information will improve ostracode-based paleoenvironmental reconstructions in Southern Mexico and Northern Guatemala. In addition, our approach serves as a model for future paleoecological studies that employ other aquatic bioindicators, such as testate amoebae, cladocerans, and chironomids.<hr/>RESUMEN Los ostrácodos son microcrustáceos acuáticos, que poseen un caparazón bivalvo de carbonato de calcio que se puede preservar en los sedimentos de los ambientes lacustres. Debido a su alta sensibilidad a cambios ambientales y su alta potencialidad de fosilización, los ostrácodos son una herramienta útil para el estudio paleoclimático y paleoambiental, abarcando una temporalidad de décadas hasta millones de años. El conocimiento ecológico de las especies, así como su taxonomía son prerrequisitos para estos estudios. Sin embargo, esta información es aún escasa en diferentes regiones del mundo, incluyendo los Neotrópicos. Hasta el momento, se han realizado únicamente estudios en los lagos kársticos de las tierras bajas de la Península de Yucatán, en el norte del Neotrópico. Sin embargo, los lagos en altitudes medias y altas permanecen poco conocidos. El objetivo de este trabajo es aportar conocimiento de ostrácodos no-marinos neotropicales a lo largo de un gradiente altitudinal que va desde las tierras bajas de El Petén, Guatemala (100-500 m s.n.m.), incluyendo los lagos de tierras medias de la Selva Lacandona (500-1 000 m s.n.m.), hasta las tierras altas de Montebello, Chiapas, México (1 000-1 500 m s.n.m.). Dieciocho especies de ostrácodos se identificaron en 24 lagos, pero estuvieron ausentes en los lagos Amarillo y Lacandón (tierras medias) y San Diego (tierras bajas). La ausencia de ostrácodos podría explicarse por la falta de un muestreo estacional o por variables que no se consideraron en este estudio como sustrato, cobertura vegetal acuática e interacciones interespecíficas. Los análisis estadísticos indicaron que las especies más abundantes son: Cypridopsis vidua (O.F. Müller, 1776), Cytheridella ilosvayi (Daday, 1905), Pseudocandona antillana (Broodbakker, 1983) y Darwinula stevensoni (Brady &amp; Robertson, 1870), con una distribución continua a lo largo del gradiente altitudinal. Algunas especies presentan una distribución más restringida, determinada por la temperatura, precipitación y conductividad. Por ejemplo, Eucypris sp. está restringida a las tierras bajas; mientras que Vestalenula sp. y Cypria sp. se encontraron únicamente en elevaciones medias. La diversidad de especies es ligeramente mayor en lagos cálidos a altitudes medias (Haverage = 1.09) que en las tierras bajas (Haverage = 0.94) y que en lagos de agua más fría en las tierras altas (Haverage = 0.94), sugiriendo que los lagos de tierras medias tienen un alto potencial para albergar micro-refugios. Las regresiones LOESS muestran las preferencias ecológicas de las cuatro especies más frecuentes y altamente distribuidas con respecto a la temperatura, conductividad, HCO3 -, precipitación y pH. Darwinula stevensoni se asocia a temperaturas frías y conductividades bajas, lo que evidencia su alto rango de tolerancia. Cypridopsis vidua se asocia con ambientes cálidos y de baja precipitación, como los registrados en las tierras bajas de Guatemala, y puede usarse como paleobioindicador de zonas de vegetación litoral. Cytheridella ilosvayi es un indicador de condiciones cálidas y húmedas, mientras que P. antillana de frías y húmedas. Esta información ecológica-cuantitativa se podrá utilizar como una herramienta para las reconstrucciones paleoambientales basadas en ostrácodos en el sur de México y norte de Guatemala. Además, este enfoque sirve como modelo para futuros estudios paleoecológicos que emplean otros bioindicadores acuáticos, como las amebas testadas, los cladóceros y los quironómidos. <![CDATA[Spatial distribution, social structure and conservation threats of a small community of bottlenose dolphins, <em>Tursiops truncates</em> (Odontoceti: Delphinidae) in Ecuador]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442019000401059&lng=en&nrm=iso&tlng=en RESUMEN Una comunidad residente de bufeos costeros Tursiops truncatus ha sido estudiada de manera intermitente entre 2005 y 2018 en la punta de la península de Santa Elena, Ecuador (2°11’ S &amp; 81°0.7’ W). Avistamientos oportunistas y dirigidos desde la playa y abordo de un bote con motor fuera de borda se realizaron a lo largo de 40 km de costa, contabilizándose un esfuerzo de 917.2 km de seguimiento en automóvil desde tierra y 707.4 km en bote por mar. El tamaño grupal promedio fue 5.31 delfines/grupo (SD = 1.97, rango 1-10), sin cambios significativos a lo largo del estudio. Desde tierra el tamaño grupal fue subestimado en promedio en 32 %. Esta comunidad de bufeos tiene actualmente solo nueve individuos, incluyendo seis adultos, un inmaduro y dos crías, siendo la comunidad más pequeña encontrada en el golfo de Guayaquil. La tasa de encuentro varió entre 0.03 delfines/km en la parte noroeste y 0.31 delfines/km en la parte sur, donde los delfines concentran sus actividades, posiblemente porque las actividades humanas ahí son menos intensas. Los delfines se distribuyeron generalmente entre los primeros 200 m de la orilla llegando hasta 1 200 m en la parte norte donde la profundidad es menor y las actividades portuaria y turística más intensas. La velocidad de los delfines fue significativamente más alta cuando fueron seguidos desde un bote a corta distancia (5.87 km/h) que cuando fueron monitoreados desde tierra (2.9 km/h) (P &lt; 0.01), lo cual sugiere que el seguimiento en bote tuvo un impacto sobre el movimiento de los delfines. Un análisis clúster jerárquico mostró que los delfines tienen altos índices de asociación entre ellos (promedio 0.67, rango 0.01-1.0), indicando que es una comunidad altamente cohesionada. Adicionalmente muestran un alto nivel de residencia (índice de ocurrencia promedio de 0.62). Durante el estudio se identificaron dos amenazas principales, una pesquería con redes agalleras en la parte suroeste y un intenso tráfico de botes pesqueros en la parte noroeste. La mayoría del área de estudio actualmente es parte de un área costero-marina protegida creada en 2008, lo cual ofrece una oportunidad para la recuperación de esta comunidad de delfines. Debido a su fragilidad, se recomienda a las autoridades ambientales, entre otras cosas, eliminar potenciales fuentes de amenaza para los delfines como las redes de pesca, implementar un área de exclusión para artes de pesca y tráfico de botes pesqueros de 1 km de ancho desde la orilla y limitar la velocidad de todo tipo de embarcación a 10 nudos dentro del área protegida.<hr/>Abstract A resident community of bottlenose dolphins (Tursiops truncatus) has been studied irregularly between 2005 and 2018 around the tip of the Santa Elena Peninsula, Ecuador (2°11' S &amp; 81°0.7' W). Opportunistic sightings and systematic surveys from the beach and at sea were carried out along 40 km of coast, accounting for 917.2 km of tracking by car from land and 707.4 km of boat tracking by sea. Average group size was 5.31 dolphins/group (SD = 1.97, range 1-10), with no significant changes throughout the study period. From land, however, the group size was underestimated 32 % on the average. This small bottlenose dolphin community currently has only nine individuals, including six adults, one immature and two calves, and is the smallest community within the Gulf of Guayaquil. The encounter rate ranged between 0.03 dolphins/km in the northwestern part and 0.32 dolphins/km in the South, where dolphins concentrate their activities, possibly because human activities are less intense there. Dolphins were generally distributed in the first 200 m from the shore, reaching up to 1 200 m in the Northern shallower part and where port and tourist activities concentrate. The dolphins’ speed was significantly higher when they were followed from a boat at close range (5.87 km/h) than when they were monitored from the beach (2.9 km/h) (P &lt; 0.01), which suggests that boat tracking had an effect on dolphin´s movements. Pairwise cluster analysis showed that animals from this community show high rates of association among each other (average 0.67, range 0.01-1.0), indicating that is a highly cohesive community. Dolphins also showed high level of residence (average occurrence index = 0.62). During the study, two main threats were identified, a gillnet fishery in the Southwestern part and an intense fishing boat traffic in the Northwestern. Most of the study area is currently part of a coastal-marine protected area created in 2008, which offers an opportunity for the recovery and conservation of this dolphin community. Given its fragility, we recommend the environmental authorities to address potential threats for this dolphin community by eliminating gillnets, implementing an exclusion zone for fishing gear and boat traffic of 1 km width from the shore and limit the speed of any type of vessel to 10 knots within the reserve. <![CDATA[Abundance, spatial, and temporal distribution of shorebirds (Order: Charadriiformes) at Marismas Nacionales, Mexico]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442019000401077&lng=en&nrm=iso&tlng=en RESUMEN El noroeste de México alberga las mayores abundancias de aves playeras del país. Sin embargo, para muchos de estos humedales, información sobre comunidades de aves playeras, como abundancia, tendencias poblacionales y riqueza es limitada. Actualmente, los sitios de descanso son críticos para la conservación porque las poblaciones de aves playeras han decaído en las últimas décadas. Marismas Nacionales (MN) es un humedal tropical importante con un ecosistema dinámico donde los estudios de aves playeras están limitados a unos pocos censos aéreos y terrestres. Así el objetivo del trabajo fue describir la abundancia y distribución espacial y temporal de las aves playeras en MN (temporada 2010-2011). Se seleccionaron ocho unidades de muestreo en las que se llevaron a cabo censos mensuales (noviembre 2010 a junio 2011). Se determinaron las riquezas y abundancias por sitio-mes, además se realizó un análisis espacial y temporal de las especies dominantes. Se registraron 27 especies de aves playeras y un género, con un estimado mínimo de 136 236 individuos. Este número hace a MN uno de los humedales prioritarios para la conservación en México, pues alberga al 10 % de la abundancia general del noroeste. Las especies dominantes fueron el Playerito occidental (Calidris mauri, 33 % del total), la Avoceta americana (Recurvirostra americana, 31 %) y los Costureros (Limnodromus spp., 17 %). Espacialmente las lagunas de mayor importancia fueron: Chumbeño (37 % del total registrado), Las Garzas-Chahuin (24 %) y La Polca (24 %). Este trabajo actualiza la información sobre aves playeras que utilizan MN y podría permitir el establecimiento de un programa de monitoreo, lo cual es prioritario sobre todo porque el área es un Sitio de Importancia Internacional por parte de la Red Hemisférica de Reserva para las Aves Playeras.<hr/>Abstract Northwest Mexico is an important region for shorebirds associated with an extensive series of wetlands. However, for many of these wetlands, basic information about shorebirds communities like abundance, population trends, and richness are limited. Currently, wintering and stopover sites are critical for conservation because many populations of shorebirds have declined in the last decades. Marismas Nacionales (MN) is an important tropical wetland with a dynamic ecosystem and where shorebirds studies are limited to few wintering aerial and ground surveys. Our goals were analyzing shorebirds abundance and spatial and temporal distribution patterns in 2010-2011 season. We selected eight monitoring sites from two prospective visits to the study area. We observed shorebirds monthly between November 2010 and June 2011 to analyze richness and abundance patterns by site and month. Additionally, we describe specific spatial and temporal distribution for dominant species. A total of 27 shorebirds species and one genus, with a minimum global abundance of 136 236 individuals were found. Shorebird abundance at MN is among the most important in the region with around 10 % of total abundance in northwest Mexico; therefore, MN is a priority conservation site for this group of birds. Additionally, MN presents a suitable habitat for breeding of some shorebirds species such as Snowy and Wilson’ Plover, Killdeer, Northern Jacana, Black-necked Stilt and Pacific American Oystercatcher. Dominant species were: Western Sandpiper (33.5 % of total in MN), American Avocet (31 %) and Dowitchers (17 %). These taxa are very common in others wetlands in Northwest Mexico region. Spatially, shorebirds were distributed in three sites: Chumbeño lagoon (37 % of abundance total), Las Garzas-Chihuin lagoons (24.2 %) and La Polca lagoon (24 %). The less used sites by shorebirds are located in the southern part of MN. Our results update MN information and can help to establish monitoring programs in the area. <![CDATA[Camera traps as a sampling method for Paraguayan Dry Chaco birds: a comparison with auditory and visual methods]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442019000401089&lng=en&nrm=iso&tlng=en RESUMEN Las cámaras trampa constituyen una herramienta de gran utilidad para el estudio de vertebrados terrestres. Con el objetivo de evaluar la utilidad del fototrampeo para el estudio de la avifauna, se analizaron los registros obtenidos, entre julio 2015 y julio 2016, por cámaras trampa instaladas en 12 puntos con aguadas artificiales de la Estancia Montania, departamento de Boquerón, Paraguay. Se determinó la riqueza, composición y tasa de captura registrada en bosques xerofíticos y pasturas exóticas. Se comparó la riqueza y composición de aves detectada mediante cámaras trampa con la obtenida a través de listas Mackinnon. Mediante fototrampeo, fueron registradas 74 especies, pertenecientes a 30 familias y 16 órdenes. El bosque xerofítico y la pastura exótica poseen un 52.7 % de similitud en cuanto a la composición de las especies. Las especies registradas con mayor frecuencia fueron: Leptotila verreauxi (16.14 %), Ortalis canicollis (14.28 %) y Furnarius cristatus (11.39 %). Las cámaras trampa resultaron efectivas para el registro del 33 % de las especies identificadas a través de listas Mackinnon, y adicionaron dos especies. Por ello, resultan apropiadas para complementar métodos basados en la observación directa, particularmente para el registro de especies cinegéticas del ecosistema chaqueño pertenecientes a los órdenes Tinamiformes y Columbiformes.<hr/>Abstract Camera trap as a sampling method for Paraguayan Dry Chaco birds: a comparison with auditory and visual methods. Camera trap techniques are widely used for the study of mammals, but also enable investigation of other groups, such as birds. In order to evaluate the usefulness of camera trapping for the study of avifauna, we analyzed the records obtained from 12 camera traps installed between July 2015 and July 2016, near artificial water sources in Estancia Montania, Boquerón Department, Paraguay. Four of these sites were associated with xerophytic forests and eight with exotic pastures. The richness, composition and capture rate recorded in both ecosystems were determined. We compared the richness and composition of birds detected by camera traps with those obtained through auditory and visual methods. Through camera trapping, 74 species of birds were recorded, belonging to 30 families and 16 orders. The xerophytic forest and the exotic pasture have a 52.7 % similarity in species composition. With regard to capture rates, the most frequently recorded species were: Leptotila verreauxi (16.14 %), Ortalis canicollis (14.28 %) and Furnarius cristatus (11.39 %). The camera traps were effective in detecting 33% of the species identified in the area based on direct and auditory observation sampling techniques, and added two species not detected by direct methods. For this reason, camera trapping is appropriate to complement methods based on direct observation, particularly for monitoring hunted species of the Chaco ecosystem belonging to Tinamiform and Columbiform species. Due to the non-invasive nature of the technique, it constitutes an efficient method for addressing ethological studies of terrestrial species.