Scielo RSS <![CDATA[Revista de Biología Tropical]]> http://www.scielo.sa.cr/rss.php?pid=0034-774420180001&lang=pt vol. 66 num. 1 lang. pt <![CDATA[SciELO Logo]]> http://www.scielo.sa.cr/img/en/fbpelogp.gif http://www.scielo.sa.cr <![CDATA[“Please pay $800 to read this article”: An open letter to paywall companies]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442018000100001&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Abstract Significant amounts of economic resources are spent by poor countries for access to scientific information that is blocked by pay-walls, and when fees are corrected for local economies, they can be the equivalent of hundreds of dollars per article. Pay-walls, is controlled by a small group of companies in rich countries, block knowledge from the societies that need it most. These companies should adjust their fees according to local economies: this would be fairer and would benefit everyone, including the same companies.<hr/>Resumen Los países pobres gastan cantidades significativas de recursos económicos en acceso a la información científica bloqueada por los llamados “muros de pago” o paywalls, y si se ajustan los precios según las economías locales, pueden ser equivalentes a cientos de dólares por artículo. Estos paywalls, controlados por un pequeño grupo de empresas de los países ricos, bloquean el conocimiento a las sociedades que más lo necesitan. Estas empresas deberían ajustar sus tarifas de acuerdo con las economías locales: eso sería más justo y beneficiaría a todos, incluidas las mismas empresas. <![CDATA[Podonominae pupae (Diptera: Chironomidae) from the tropical high Andean rivers]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442018000100006&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Resumen Podonominae es una subfamilia de Chironomidae cuyos estados inmaduros habitan ríos y arroyos fríos. En América del Sur, la mayoría de las especies han sido reportadas solamente para la subregión Andina/Patagónica. Sin embargo, el conocimiento de su diversidad en áreas tropicales es aún escaso. Estudiamos la riqueza de géneros y morfotipos de pupas y exuvias pupales Podonominae (Diptera: Chironomidae) en los ríos altoandinos de Colombia, Ecuador y Perú y se discutió su distribución geográfica en el área de estudio. Los especímenes fueron recolectados entre 2004 - 2011 en 197 puntos de muestreo, 17 cuencas hidrográficas por encima de los 2 000 msnm. Durante la estación seca, muestras bentónicas y de deriva fueron tomadas en diferentes sustratos. Reconocimos tres géneros:Podonomopsis,ParochlusyPodonomus,con uno, nueve y 14 morfotipos respectivamente. Sólo seis de ellos fueron claramente determinados como especies previamente descritas.Podonomopsisestuvo representado sólo por una especie,P. illiesi, encontrado únicamente en ríos altos de Perú (más de 3 500 msnm). La abundancia y riqueza de morfotipos deParochlusfueron las altas en ríos de Ecuador y Colombia (P.incaicus,Parochlussp. 1 yParochlussp. 2 fueron las especies más comunes). Por el contrario,Podonomusfue más diverso y abundante en ríos de Perú (P. caranqui,P. fittkauiyP. fastigiansfueron las especies más comunes).Encontramos un claro patrón de distribución de morfotipos en el gradiente latitudinal. Primero, se confirmó una evidente disminución en la riqueza de morfotipos en relación a los Andes del Sur. Segundo, se encontraron especies comoPodomopsisilliesi,PodonomusfittkauiyPodomusfastigiansque solamente estuvieron presentes en Perú, pero no en Ecuador y Colombia. Para estas especies, la Depresión de Huancabamba (6°S Latitud, Norte de Perú), pudo representar una importante barrera en su dispersión hacia latitudes más bajas. También se presenta una clave taxonómica para la determinación de géneros y morfotipos.<hr/>Abstract The Podonominae is a subfamily of Chironomidae which immature stages inhabit cold streams and brooks. In South America, most of the species have been reported only from the Andean/Patagonian subregion. However, the knowledge of its diversity from high tropical areas is still scarce. We studied the richness of genera and morphotypes of pupae and pupal exuviae of Podonominae (Diptera: Chironomidae) in the high Andean rivers from Colombia, Ecuador and Peru, and discussed its geographical distribution in the studied area. The specimens were collected between 2004 and 2011 in 197 sampling points, from 17 basins over 2 000 masl. During the dry season, benthic and drift samples were taken in different substrates. We recognized three genera:Podonomopsis,ParochlusandPodonomus,with one, nine and 14 morphotypes, respectively. Only six of them were clearly determined as species previously described.Podonomopsiswas represented only by one species,P.illiesi, only found in high altitude rivers in Perú (above 3 500 masl). Morphotypes richness and abundance ofParochluswere higher in rivers from Ecuador and Colombia (P.incaicus,Parochlussp. 1 andParochlussp. 2 were the most common species). Conversely,Podonomuswas more diverse and abundant in rivers from Perú (P. caranqui,P. fittkauiandP. fastigianswere the most common species). We found a clear pattern of distribution of morphotypes in the latitudinal gradient. First, we confirmed an evident decrease in the morphotypes richness in relation to the South Andes. Second, we found species such asPodomopsisilliesi,PodonomusfittkauiandPodomusfastigiansthat only were present in Perú, but not in Ecuador and Colombia. For these species, the Huancabamba Depression (6°S Latitude, North of Perú), could represent an important barrier in their dispersion toward lower latitudes. A taxonomic key to genera and morphotypes determination was also provided. Rev. Biol. Trop. 66(1): 6-27. Epub 2018 March 01. <![CDATA[Relevance of the plasminogen activation system in the pathogenesis and progression of gastric cancer]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442018000100028&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Abstract Gastric cancer is ranked as the third death-causing cancer and one of the most incident malignancies worldwide. AlthoughHelicobacter pyloriis the most well-established risk factor for the development of this neoplasm, most of the infected individuals do not develop gastric cancer. Two of the main challenges faced by the world’s scientific community in the combat against gastric cancer are the unraveling of its pathogenesis and the identification of novel ways to bring down the mortality. Malignant cell invasion of the non-neoplastic adjacent tissue and metastasis are pivotal events during cancer development and progression. Both processes are facilitated by proteases capable of degrading components of the extracellular matrix, some of which have been associated to clinic-pathological aspects of the disease. Recent studies have suggested the possible connection betweenH. pyloriand the expression of some of these proteases in gastric mucosa. This review summarizes the current knowledge about epidemiological, clinical and biological aspects of gastric cancer; it also discusses the main findings about the involvement of the plasminogen activation system in the development and progression of this disease, as well as its potential repercussions in the clinical setting. Rev. Biol. Trop. 66(1): 28-47. Epub 2018 March 01.<hr/>Resumen El cáncer gástrico es la tercera causa de muerte por cáncer a nivel mundial y uno de los más incidentes. A pesar de que la infección porHelicobacter pylories el factor de riesgo más reconocido para el desarrollo de esta neoplasia, la mayoría de personas infectadas con la bacteria no desarrolla la enfermedad. Dos de los principales desafíos a los que actualmente se enfrenta la comunidad científica mundial en la lucha contra el cáncer gástrico son el esclarecimiento de la patogénesis y la identificación de nuevos parámetros que contribuyan a disminuir la mortalidad. La invasión de las células malignas al tejido no neoplásico adyacente y la metástasis son eventos claves durante el desarrollo y progresión del cáncer. Lo anterior es facilitado por proteasas capaces de degradar los componentes de la matriz extracelular, algunas de las cuales han sido asociadas con aspectos clínico-patológicos de la enfermedad. Estudios recientes han sugerido la posible relación entre la bacteriaH. pyloriy la inducción en mucosa gástrica de algunas de estas proteasas. Esta revisión resume conocimientos actuales sobre aspectos epidemiológicos, clínicos y biológicos del cáncer gástrico; también discute los principales hallazgos en torno a la participación del sistema activador de plasminógeno en el desarrollo y progresión del mismo, así como sus potenciales repercusiones en la práctica clínica. <![CDATA[Guilds and diversity of ants in three land uses from a coffee landscape at Cauca -Colombia]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442018000100048&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Resumen En los últimos 50 años, la producción cafetera colombiana ha sufrido una gran transformación de los cultivos tradicionales crecidos a la sombra de los bosques, para derivarlos en vastas extensiones de cafetales de libre exposición al sol. Estos sistemas reducen la biodiversidad nativa y sus servicios ecosistémicos asociados. A su vez, los cafetales de sombrío operan como potenciales refugios de dicha biodiversidad, favoreciendo su dispersión en el paisaje dado que ofrecen hábitat de alta calidad para que los organismos silvestres se muevan a través de los relictos de vegetación natural, es por tanto importante documentar su valor biológico. En Colombia, el departamento del Cauca es el cuarto productor de café y aunque sus cosechas estaban principalmente basadas en el modelo de uso de sombra de árboles sobre cafetos, en los últimos 10 años los cafetales de sol han doblado su extensión en este departamento y casi han equiparado la extensión de los cafetales de sombra. Por lo tanto, es necesario documentar si estos cambios de uso de suelo a escala de paisaje pueden derivar en consecuencias para la biota silvestre que habita estos sistemas productivos. Dadas las anteriores consideraciones, y para probar la importancia biológica de las plantaciones de café, el presente estudio compara el efecto de tres usos del suelo (cafetales de sol, cafetales de sombra y parches de vegetación natural) en términos de la riqueza de especies de hormigas y la abundancia de sus gremios tróficos en el municipio de Caldono entre agosto de 2015 y enero de 2016. Las capturas fueron realizadas con trampas de caída, sacos mini-Winkler y colecta directa. Encontramos que la riqueza de hormigas fue mayor en parches de vegetación natural, seguidos de cafetales de sombra y cafetales de sol. En estos últimos, las hormigas omnívoras generalistas fueron más abundantes, y las hormigas arbóreas que forrajean en el suelo fueron menos abundantes. Por su parte, los cafetales de sombra, pese a pertenecer a un uso del suelo transformado, guardan similitud con algunos parches de vegetación natural. Usando sólo hormigas del estrato más bajo (suelo y sotobosque), nuestros hallazgos confirman que los cafetales de sombra mantienen una parte importante de la diversidad de hormigas de la localidad, mientras que los cafetales de sol ofrecen menor calidad de hábitat para la misma. Por otro lado, pese a que los parches de vegetación natural son tan pequeños y degradados, su conservación representa un valioso patrimonio para la protección de la fauna de hormigas local, albergando una gran cantidad de especies exclusivas.<hr/>Abstract In the last 50 years, Colombian coffee production has undergone a great transformation from traditional plantations grown below the forest’s shade, to vast extensions of coffee plantations consisting of free exposition to sun. These systems reduce native biodiversity and its associated ecosystem services. Simultaneously, shaded coffee plantations operate as potential shelter of such biodiversity, favoring its dispersal in the landscape, because they offer high-quality habitat for the movement of wild organisms through natural vegetation relicts. Therefore, it is important to document its biological value. In Colombia, Cauca department is the fourth coffee producer and although its cultures were mainly based on the model of using trees’ shade on coffee shrubs, in last 10 years, sun coffee plantations have doubled their extension in this department and have almost equated the shaded coffee extension. Thus, it is necessary to document if these land use changes at landscape scale may derivate in consequences for the wild biota dwelling these productive systems. Given the above considerations, and in order to test for the biological importance of coffee plantations, the present study compares the effect of three land uses (sun coffee, shaded coffee and natural vegetation patches; eight of each one) in terms of ants’ species richness and the abundance of their trophic guilds at Caldono municipality, between August 2015 and January 2016. Captures were carried out with pitfall traps, mini-Winkler sacs and direct capture. We found that ants’ richness was higher in natural vegetation patches, followed by shaded coffee plantations and sun coffee plantations, in these last ones, the omnivore-generalist ants were more abundant, and ground-foraging arboreal ants were less abundant. We found that shaded coffee plantations, despite belonging to a transformed land use, have greater similarity with some natural vegetation patches. Using only ants from the lowest stratum (soil and understory), our findings confirm that shaded coffee plantations maintain an important part of the ant diversity of the locality, while sun coffee plantations offer less habitat quality to it. On the other hand, although natural vegetation patches are so small and degraded, their conservation represent a valuable heritage for the protection of local ants’ fauna, harboring a largenumber of exclusive species. Rev. Biol. Trop. 66(1): 48-57. Epub 2018 March 01. <![CDATA[Phagodeterrence of extracts of<em>Brugmansia candida</em>(Solanaceae) on<em>Hypsipyla grandella</em>(Lepidoptera: Pyralidae) larvae]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442018000100058&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Resumen Hypsipyla grandellaes una plaga forestal clave en América Latina y el Caribe, donde ha impedido todo intento de establecer plantaciones comerciales de caobas (Swieteniaspp.) y cedros (Cedrelaspp.). En la búsqueda de métodos de manejo de sus larvas, que sean preventivos y rentables, así como basados en recursos de la flora tropical, fue evaluada la actividad fagodisuasiva del extracto crudo y de cuatro particiones fitoquímicas (agua, hexano, diclorometano y acetato de etilo) de la flor de reina de la noche,Brugmansia candida(Solanaceae). Se efectuaron bioensayos de laboratorio con concentraciones crecientes del extracto crudo (0.1; 0.3; 1.0; 3.2 y 10.0 % m/v) y con cada una de las particiones (según el rendimiento del proceso de particionamiento). Se utilizó un diseño de bloques completos al azar, con cuatro repeticiones, y se expusieron larvas de instar III de H. grandellaa discos de cedro amargo (Cedrela odorata) impregnados con el respectivo tratamiento, por 24 h. Se midió el porcentaje de consumo de cada disco. El extracto crudo y la partición de hexano, mostraron un evidente efecto fagodisuasivo a partir de concentraciones de 1.0 % y 0.122 % m/v, respectivamente. También se realizó un bioensayo para comparar una sola concentración (0.38 % m/v) del alcaloide escopolamina, el cual redujo en 90% el consumo con respecto a los testigos. Asimismo, se evaluó la mortalidad y los efectos subletales en larvas expuestas al extracto crudo, la partición de hexano y la escopolamina, pero no hubo evidencias de ellos, lo que confirmó su acción fagodisuasiva. Además, se realizó un tamizaje fitoquímico del extracto crudo, y mediante pruebas cualitativas se determinó que los alcaloides, taninos, triterpenos y cumarinas fueron los metabolitos secundarios más importantes. Finalmente, se confirmó la presencia de la escopolamina tanto en el extracto crudo como en la partición de hexano, mediante el método de cromatografía de gases acoplado a un espectrómetro de masas (GC-MS). Se recomienda preparar una formulación de escopolamina más algunos coadyuvantes, y evaluar su eficacia en condiciones de invernadero, como un primer paso para avanzar en el desarrollo de un fagodisuasivo comercial.<hr/>Abstract Hypsipyla grandella is a key forest pest in Latin America and the Caribbean, where it has precluded attempts to establish commercial plantations of mahoganies (Swieteniaspp.) and cedars (Cedrelaspp.). In the search for methods to manage its larvae, being both preventative and cost-effective, as well as based upon resources from tropical flora, the crude flower extract of angel’s trumpet, Brugmansia candida, as well as four partitions thereof (water, hexane, dichlorometane, and ethyl acetate), were tested for phagodeterrence. Laboratory bioassays involved increasing concentrations of the crude extract (0.1, 0.3, 1.0, 3.2 and 10.0 % w/v) as well as each one of the partitions (in accordance to the yield obtained from the partitioning process). A randomized complete block design, with four replicates, was used. H. grandellainstar III larvae were exposed for 24 h to Spanish cedar (Cedrela odorata) leaf discs dipped into the respective treatment, after which disc consumption was measured. Strong phagodeterrence was detected at concentrations as low as 1.0 % y 0.122 % w/v for the crude extract and the hexane partitions, respectively. In addition, a single bioassay was performed to compare a single concentration (0.38 % w/v) of the alkaloid scopolamine, which reduced consumption in 90 % with respect to the controls. Also, mortality and sublethal effects were assessed in larvae exposed to the crude extract, the hexane partition and scopolamine, with no evidence for them, which confirmed their phagodeterrence. Moreover, the crude extract was submitted to a phytochemical screening by means of a number of qualitative tests, which showed that alkaloids, tannins, triterpenes and cumarins were the most important secondary metabolites. Finally, the presence of scopolamine was confirmed in both the crude extract and the hexane partition, by means of the gas chromatography-spectrometry (GC-MS) analytical method. It is recommended to prepare a formulation of scopolamine plus some adjuvants, in order to test its effectiveness under greenhouse conditions, as a first step to advance in the development of a commercial phagodeterrent. Rev. Biol. Trop. 66(1): 58-69. Epub 2018 March 01. <![CDATA[Feeding habits of the jaguar <em>Panthera onca</em> (Carnivora: Felidae) in Tortuguero National Park, Costa Rica]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442018000100070&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Abstract Although dietary studies are considered an important conservation tool, few studies have assessed jaguar (Panthera onca) diet in Costa Rica. Therefore, this study describes the diet composition of the jaguar in Tortuguero National Park, Costa Rica, carried out by analyzing and comparing carcass (n = 1 374), scat (n = 75) and camera trap (n = 3) data, collected between 2012 and 2016. Our results indicated that jaguar diet in this area consisted of at least 20 prey species. The green sea turtle (Chelonia mydas) was the most frequent item based on carcass data, while the white-lipped peccary (Tayassu pecari) was the major prey species according to the scat analysis. Our results highlight the importance of combining different methods to describe the jaguar feeding habits. Further research should focus on calculating jaguar and terrestrial prey species abundance in the study area, information that would help to complement our findings. Rev. Biol. Trop. 66(1): 70-77. Epub 2018 March 01.<hr/>Resumen Aunque los estudios de dieta son una herramienta importante en la conservación de las especies, pocas investigaciones han evaluado la dieta del jaguar (Panthera onca) en Costa Rica. Por lo tanto, este estudio describe la dieta del jaguar en el Parque Nacional Tortuguero, Costa Rica, mediante el análisis y comparación de los registros de cadáveres (n = 1 374), excretas (n = 75) y cámaras trampa (n = 3) colectados entre el 2012 y el 2016. Nuestros resultados indican que la dieta del jaguar consiste de al menos 20 especies; la tortuga verde (Chelonia mydas) fue la especie más importante según los datos de cadáveres, mientras que el chancho de monte (Tayassu pecari) fue la principal especie presa según el análisis de excretas. Nuestros resultados destacan la importancia de combinar diferentes métodos con el fin de obtener una descripción precisa de los hábitos alimenticios del jaguar. Se recomienda que futuros estudios estimen la abundancia del jaguar y sus especies presa terrestres, lo cual permitirá complementar nuestros resultados. <![CDATA[Ecology of <em>Puma concolor</em> (Carnivora: Felidae) in a Mexican tropical forest: adaptation to environmental disturbances]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442018000100078&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Abstract Worldwide big cats are at risk of extinction, and anthropogenic factors and natural habitat disturbances represent the biggest threats for their survival. It is essential to know the natural resources use by these predators and the way these big felids can adapt to changes. It is unknown how the puma (Puma concolor) selects and uses resources, what environmental factors determine its presence and how this species is affected by natural disturbances in Mexican tropical forests. This study was performed in the Eden ecological reserve and surroundings, in the North of Quintana Roo, Mexico, an area dominated by tropical semideciduous (medium forest) and secondary forest (acahual). Camera samplings were carried out during 2008, and from 2010 to 2012. Habitat variables, activity patterns and species associations were also spatially and temporally analyzed using achi-squared test and overlapping coefficients. General Linear Models (GLM) were used in order to determine which variables influence the presence of cougars in the study area. Cougars used vegetation and paths in different proportions as the availability of these resources. The years with more changes (P &lt; 0.05) were 2008 and 2011. This predator was active throughout the day, but changed its activity patterns over the years. The cougar was spatio-temporally associated with six mammals and two big terrestrial birds: Pecari tajacu (∆ = 0.52), Meleagris ocellata (∆ = 0.55), Crax rubra (∆ = 0.58), Didelphis sp. (∆ = 0.64), Mazama temama (∆ = 0.66), Leopardus pardalis (∆ = 0.68), Dasypus novemcinctus (∆ = 0.73) and Panthera onca (∆ = 0.87). After testing 90 GLM models, the model with a lower AIC value described the activity patterns of prey and co-predators. The vegetation and water in the reserve were important variables for the cougar. However the variables that determined and modified the presence of the species were activity patterns of co-predators and the potential preys. The factors that negatively affected the presence of the species were fire, human presence, and habitat displacement to less favorable habitats to avoid jaguar. Rev. Biol. Trop. 66(1): 78-90. Epub 2018 March 01.<hr/>Resumen Los grandes felinos a nivel mundial se encuentran en peligro de extinción. Los factores antropogénicos y las alteraciones naturales representan una gran presión para su sobrevivencia. Es esencial conocer el efecto de estos sobre los depredadores y cómo los felinos se adaptan y usan los recursos naturales. Se desconoce el modo en que el puma (Puma concolor) selecciona y utiliza recursos, cuáles son los factores ambientales que determinan su presencia y cómo esta especie se ve afectada por alteraciones naturales en los bosques tropicales mexicanos. Este estudio se realizó en la reserva ecológica de El Edén y sus alrededores en el norte de Quintana Roo, México, área dominada por selva tropical semidecidua (selva mediana) y bosque secundario (acahual). Se realizaron muestreos con cámaras durante 2008 y 2010-2012. Las variables de hábitat, patrones de actividad y asociaciones de especies también se analizaron espacial y temporalmente mediante una prueba de chi-cuadrado y coeficientes de traslape. Se utilizaron modelos GLM para determinar qué variables influyen en la presencia de pumas en el área de estudio. El puma utiliza la vegetación y caminos en diferente proporción a la de su disponibilidad. Los años con más cambios (P &lt;0.05) fueron 2008 y 2011. Este depredador está activo durante todo el día, pero cambió sus patrones de actividad durante los años. El puma está asociado espacio-temporalmente con siete mamíferos: Pecari tajacu (Δ = 0.52), Meleagris ocelata (Δ = 0.55), Crax rubra (Δ = 0.58), Didelphis sp. (Δ = 0.64), Mazama temama (Δ = 0.66), Leopardus pardalis (Δ = 0.68), Dasypus novemcinctus (Δ = 0.73) y Panthera onca (Δ = 0.87) y dos grandes aves terrestres. Después de probar 90 modelos GLM, el modelo con un valor menor de AIC es el de patrones de actividad de presas y co-depredadores. La vegetación y la disponibilidad de agua en la reserva son variables importantes para el puma. Sin embargo, las variables que determinan y modifican la presencia de la especie son los patrones de actividad de los co-depredadores y las presas potenciales. Los factores que afectan negativamente la presencia de la especie son el fuego, la presencia humana y el desplazamiento a habitas menos favorables para evadir al jaguar. <![CDATA[Abundance and richness of arbuscular mycorrhizal fungi in coffee plantations from Soconusco, Chiapas, Mexico]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442018000100091&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Resumen El cultivo del café, en la economía mexicana y en la región del Soconusco en Chiapas, aporta importantes divisas; sin embargo es susceptible a plagas y enfermedades, por lo que se requiere reforzar su producción a través de un manejo más sustentable. Este estudio analizó la abundancia, riqueza y composición de hongos micorrizógenos arbusculares (HMA) nativos que pudieran emplearse en un futuro como biofertilizantes en el cultivo del café. En 21 muestras de suelo recolectadas en noviembre 2015 de siete sitios en la región del Soconusco, Chiapas, México, cultivados con café “robusta” (Coffea canephora), se cuantificó la abundancia de esporas, la riqueza y composición de morfoespecies de HMA y se exploró su relación con las propiedades del suelo. Se obtuvo un total de 20 morfoespecies y cinco nuevos registros de HMA para Chiapas, las morfoespecies más frecuentes pertenecen a los géneros Acaulospora y Glomus. Los sitios Toluca y Victoria tuvieron mayor riqueza de especies (17 spp. c/u) que San Agustín, 20 de noviembre y San Luis Nexapa (4 - 7 spp. c/u); mientras que Providencia y Platanar registraron una riqueza intermedia y los mayores valores de abundancia de esporas. Los sitios Victoria y Toluca presentaron un 97 % de disimilitud en la composición de especies de HMA con respecto a los demás sitios; la cual fue explicada por la baja concentración de PO4 -3en el suelo de Victoria y Toluca. La disponibilidad de P, ligada a la acidez del suelo, fueron los factores que podrían estar regulando las comunidades de HMA en el suelo de la rizosfera de los cafetos en la región del Soconusco. Se propone que podrían haber consorcios de HMA específicos para los niveles de P y acidez presentes en diferentes sitios con cafetos, o bien consorcios de especies de Acaulospora y Glomusacordes con las condiciones ambientales en las que se desarrolla el café, cuya compatibilidad y funcionalidad debe examinarse antes de emplearlos como biofertilizantes nativos en los cafetos de esta región tropical de México.<hr/>Abstract In the Mexican economy, and especially in the Soconusco region of Chiapas, coffee is economically important, and sustainable management most cover pests and diseases. In this study, we searched for native arbuscular mycorrhizal fungi (AMF) that could be used as biofertilizers in coffee cultivation. We collected 21 soil samples from seven coffee plantations (Coffea canephora) in November 2015. We used wet sieving and decanting to quantify abundance, richness and composition of morphospecies, as well as their relationships with soil properties. A total of 20 morphospecies and five new records of AMF were obtained, and the most frequent genera were Acaulospora and Glomus. The Toluca and Victoria sites had more morphospecies richness (17 spp. each) than San Agustín, November 20 and San Luis Nexapa (4-7 spp. each). Providencia and Platanar were intermediate but had the highest spore abundance. The dissimilarity of Victoria and Toluca may reflect a low concentration of PO4 -3in the soil. P availability, linked to soil acidity, sems to be regulating these mycorrhizae communities at Soconusco. AMF consortia specific for soil P-levels and acidity, i.e. Acaulospora and Glomusconsortia, may occur and be common in the environmental conditions of Mexican coffee plantations, Strains should be tested for compatibility and functionality before using them as native biofertilizers. Rev. Biol. Trop. 66(1): 91-105. Epub 2018 March 01. <![CDATA[Bibliometric analysis of Ghana publications in the Science Citation Index Expanded]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442018000100106&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Abstract Ghana is a West African country for which apparently there are limited scientometric studies. The objective of this study was to analyze the Ghanaian contribution to knowledge captured in the Thomson Reuters Science Citation Index Expanded (SCI-EXPANDED) database from 1936 - 2016. The following data were analyzed: document type, the language of publication, publication trend, Web of Science Subject Categories, Journals, international collaboration, institutions, authors, and highly cited articles. Indicators such as the total number of articles, first author articles, and corresponding author articles were applied to compare publication performance for collaborative countries and institutions. Also, number of single institute articles: number of nationally collaborative articles: number of internationally collaborative articles (S : N : I) were also used to compare publication characteristics of institutions in Ghana. Results showed that publication trend increased from 1998 to 2015, with researches focusing on health and medicine. PLoS One was the top productive journal, and the most collaborative country for Ghana articles was the USA. Contributions from the University of Ghana were ranked the top one institution for Ghana articles, and higher citation papers were found in international collaborations. In conclusion, the contribution to knowledge of Ghanaian authors is massive in the areas of public, environmental and occupational health and tropical medicine but the impact factor is higher for immunology, infectious diseases, and microbiology articles. Therefore, Ghanaian authors are encouraged to publish more articles in high impact factor journals with Thomson Reuters Scientific indexing in order to have their researches recognized by the existing international databases. Rev. Biol. Trop. 66(1): 106-121. Epub 2018 March 01.<hr/>Resumen Ghana es un país del oeste de África para el cual aparentemente hay limitados estudios cienciométricos. El objetivo de este estudio fue analizar la contribución de Ghana al conocimiento capturado en la base de datos del Índice de Citación Expandido de Ciencia Thomson Reuters (SCI-EXPANDED) de 1936-2016. Se analizaron los siguientes datos: tipo de documento, lenguaje de la publicación, tendencia de la publicación, categorías temáticas de Web of Science, revistas, colaboración internacional, instituciones, autores y artículos frecuentemente citados. Los indicadores como el número total de artículos, artículos de primer autor y artículos de autor de correspondencia se aplicaron para comparar el rendimiento de publicación de países e instituciones colaboradoras. También la cantidad de artículos de una institución: la cantidad de artículos de colaboración nacional: la cantidad de artículos de colaboración internacional (S:N:I) se utilizaron para comparar las características de publicación de las instituciones de Ghana. Los resultados muestran que la tendencia de publicación incrementó de 1998 al 2015 con investigaciones enfocadas en salud y medicina. PLoS One fue la revista más productiva y el país más colaborador para los artículos de Ghana fue EE.UU. Las contribuciones de la Universidad de Ghana se clasificaron como los mejores artículos de Ghana y los artículos con mayores citaciones fueron los de colaboración internacional. En conclusión, la distribución del conocimiento de autores Ghaneses es masiva en las áreas público, ambiental y salud ocupacional y medicina tropical pero el factor de impacto es más alto en artículos de inmunología, enfermedades infecciosas y microbiología. Por lo tanto, los autores Ghaneses están alentados a publicar más artículos en revistas de alto factor de impacto con el Índice de Citación Expandido de Ciencia Thomson Reuters para que sus publicaciones sean reconocidas por las bases de datos internacionales existentes. <![CDATA[Genetic variation and genetic structure of <em>Caranx hippos</em> (Teleostei: Carangidae) in the Colombian Caribbean]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442018000100122&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Abstract The crevalle jack Caranx hippos, has a wide distribution in the Western Atlantic, becoming one of the most economically important species in the artisanal fishing industry in Colombia. However, little is known about its biology. The present study aimed to evaluate the variation and genetic structure of C. Hippos in the Colombian Caribbean by analyzing the mitochondrial DNA region control and cytochrome oxidase subunit (COI). We sequenced the DNA of 153 muscle samples collected from specimens obtained from six fishing ports. The results showed 21 haplotypes for COI and 116 haplotypes for the control region, divided into two lineages that do not exhibit a pattern of geographical distribution. For mitochondrial control region, the estimated haplotype diversity (Hd) presented relatively high values (Hd= 0.99 and = 0.1), while for COI results were Hd = 0.68 and = 0.01; the relationship between haplotype and nucleotide diversity and the neutrality test revealed that C. Hippos experienced bottlenecking and a subsequent rapid population expansion. Estimates of genetic structure were low and insignificant, indicating no differentiation between samples collected from geographical isolation. This suggests that for the Colombian Caribbean there is a panmictic population of C. hippos. However, variations were found at population levels, especially in La Guajira, Turbo and San Antero, which, when compared to those included for Brazil and México, demonstrated that unique haplotypes in La Guajira are more aligned to the Brazilian populations, by means of the influence of the Caribbean Current, whilst those from Turbo and San Antero are more frequent in haplotypes originating from Mexico. Future studies should focus the understanding of these processes. Rev. Biol. Trop. 66(1): 122-135. Epub 2018 March 01.<hr/>Resumen El jurelCaranx hipposes considerado una de las principales especies objeto de la pesquería artesanal en aguas colombianas; sin embargo, es poco lo que se conoce respecto a su estructura poblacional. El presente estudio propuso evaluar la variación y estructura genética en el Caribe colombiano a partir del análisis de la región control y la subunidad citocromo oxidasa I (COI) del ADN mitocondrial. Secuenciamos el ADN de 153 muestras de músculo recolectadas de ejemplares desembarcados en seis puertos pesqueros. Los resultados mostraron 21 haplotipos para COI y 116 haplotipos para la región control, distribuidos en dos linajes que no presentan un patrón de distribución geográfica. Para la región control la diversidad genética fue alta (Hd=0.99 y π = 0.1), mientras que para COI los resultados fueron Hd=0.68 y π =0.01, esto mostró que probablemente C. hipos pasó por un evento que provocó la disminución drástica de la población y posteriormente tuvo un crecimiento rápido. Las estimaciones del grado de estructuración genética fueron bajas y poco significativas indicando la ausencia de diferenciación entre las muestras recolectadas a partir de un aislamiento geográfico, esto sugiere que la población de C. hipos es panmictica; sin embargo, se hallaron variaciones a nivel intrapoblacional especialmente en La Guajira, Turbo y San Antero, los cuales al ser comparados con los haplotipos incluidos de Brasil y México se encontró que el único haplotipo hallado en La Guajira está alineado con el de Brasil, facilitado probablemente por la corriente del Caribe, mientras que los de Turbo y San Antero con los de México. <![CDATA[Feeding habits of chironomids (Diptera: Chironomidae) of paramo lakes, Chingaza, Colombia]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442018000100136&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Resumen Los lagos tropicales de alta montaña presentan condiciones ambientales únicas donde los quironómidos tienen un papel importante en el funcionamiento del ecosistema. Las características de estos ambientes podrían favorecer el solapamiento de dietas y por ende una alta competencia interespecífica. En este estudio se describen los hábitos alimentarios de géneros de quironómidos, se identifica si los hábitos alimenticios son especializados o generalistas y se analiza el solapamiento en la dieta de los géneros. Entre abril y mayo de 2016 se colectaron larvas de Chironomidae de cuatro lagos del páramo de Chingaza. Se evaluó la dieta de larvas, mediante el análisis de contenido estomacal. Se ubicó cada género en gremios tróficos (carnívoro, detritívoro y alguívoro) y se estimó el solapamiento de las dietas entre los géneros mediante el índice de Pianka. Se colectó un total de 1 003 individuos y se identificaron nueve géneros. Las larvas consumieron principalmente materia orgánica particulada fina (MOPF), algas, fragmentos de macrófitas, macroinvertebrados y tejido animal. La MOPF fue la fuente principal de alimento de detritívoros. El análisis de dietas mostró una alta afinidad de cada género con un único gremio trófico y la mayor parte de los géneros son generalistas en el uso de recursos. En todos los lagos se observaron valores altos de solapamiento en la dieta entre los géneros y los gremios tróficos, principalmente entre los detritívoros. Los resultados sugieren que las larvas de Chironomidae presentan hábitos tróficos bien diferenciados, ocurriendo un moderado solapamiento de dietas entre géneros de detritívoros y carnívoros.<hr/>Abstract Tropical high mountain lakes show unique environmental conditions where chironomids play an important role in ecosystem functioning. The characteristics of these environments could favor diet overlap and therefore a high interspecific competition. This study described the dietary habits of chironomid genera, identified whether the dietary habits were specialized or generalist, and analyzed the diet overlap in the genera. Chironomidae larvae were collected from four lakes of the Chingaza paramo during the dry season, between April and May of 2 016. The feeding habits of larvae were evaluated by analyzing gut contents following standard methods. Each genus was assigned to trophic guilds (carnivore, detritivore and algivore) and the diet overlap was estimated using the Pianka’s index. A total of 1 003 individuals were collected and nine genera were identified. Larvae consumed mainly fine particulate organic matter (FPOM), algae, macrophyte fragments, macroinvertebrates, and animal tissues. FPOM was the main feeding resource of detritivores. The analysis of diets showed a high affinity of each genus for a single trophic guild and most of the genera were generalist in the use of resources. For all lakes, high levels of diet overlap were observed among genera and trophic guilds, mainly among detritivores. Our results suggested that Chironomidae larvae of these lakes presented well differentiated trophic habits, and showed a moderate diet overlap within detritivores and carnivores. Rev. Biol. Trop. 66(1): 136-148. Epub 2018 March 01. <![CDATA[Gap edge attributes in Neotropical rainforest, Ecuador]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442018000100149&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Abstract The application of gap dynamics theory appears to be a promising option for tropical forest management and conservation. In the present study of a tree species-rich and old-growth Ecuadorian Neotropical forest, we assessed the spatial distribution of gaps and gap size in relation to: i) tree number at the gap edge, ii) number of tree species at the gap edge, iii) number of tree species per stem at the gap edge, iv) species similarity, v) species evenness at the gap edge, vi) size differentiation at the gap edge, vii) gap isolation and viii) species mingling at the gap edge. Our results demonstrated that the spatial distribution of gaps was random. Various gap attributes were strongly associated with gap size. The number of tree species per stem at the gap edge was negatively correlated to the gap size. Gap sizes up to 50 m2were mostly sufficient to generate tree species-rich forest stands. Assuming that our results were representative for an old-growth neotropical rainforest in Ecuador, our study remarks the following management recommendations: 1) Rainforests have a very complex spatial and diversity structure and logging activities should preferably be omitted because of adverse effects. 2) If logging is inevitable, this should mimic a random choice of trees and tree species, to prevent special selection of tree dimension and species; and a random distribution of trees to be logged, to produce gaps smaller than 50 m2and never larger than 400 m2. Additionally, we suggest cutting not more than 5 % of the tree biomass per 10-20 years period, to preclude stronger alterations of ecosystem processes, and the reduction of existing dead wood from the ecosystem. Rev. Biol. Trop. 66(1): 149-163. Epub 2018 March 01.<hr/>Resumen Aplicar la teoría de la dinámica de parches parece ser una opción prometedora para el manejo y conservación de los bosques tropicales. En el presente estudio se analizó la distribución espacial y el tamaño de los parches en relación con: i) el número de árboles en el borde del parche, ii) el número de especies arbóreas en el parche iii) número de especies arbóreas por tronco en el borde del parche, iv) similitud de las especies, v) uniformidad de las especies en el borde del parche, vi) separación del tamaño en el borde del parche, vii) aislamiento del parche y viii) borde del parche. Nuestros resultados demostraron que la distribución espacial de los parches fue aleatoria. Varios atributos de la vegetación se asociaron fuertemente con el tamaño del parche. El número de especies de árboles por fuste en el borde del parche se correlacionó negativamente con el tamaño del parche. Asumiendo que, nuestros resultados fueron representativos de un bosque neotropical en el Ecuador, nuestro estudio respalda las siguientes recomendaciones: 1) Este tipo de bosque húmedo tiene una diversidad espacial y estructural muy compleja; por lo tanto, las actividades de explotación forestal deberían omitirse, ya que afectarán negativamente sus estructuras. 2) Si la tala es inevitable, entonces deberían imitarse las estructuras naturales descritas en este estudio. Es decir, i) una selección aleatoria de especies de árboles a cosechar, con el fin de evitar la selección específica por dimensiones del arbolado o por especies, ii) en la distribución aleatoria de árboles debe tomarse en cuenta que los parches sean menores a 50 m2y jamás mayores a 400 m2. Adicionalmente, se recomienda no cortar más del 5 % de la biomasa arbórea en cada período de corta de entre 10 a 20 años, para evitar alteraciones mayores en los procesos del ecosistema y la reducción de madera muerta existente en estos ecosistemas. <![CDATA[<em>Anacroneuria</em> (Plecoptera: Perlidae) from Caldera River, Chiriquí, Panamá: new distribution records, and comments on altitudinal distribution and seasonal variation]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442018000100164&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Resumen Plecoptera es un grupo basal de insectos acuáticos, también conocidos como “moscas de piedra”. Con el objetivo de contribuir al conocimiento taxonómico y ecológico del género Anacroneuria, se realizaron recolectas de ninfas en la parte alta y media del río Caldera, en la provincia de Chiriquí. Para esto se hicieron giras de campo una vez al mes de enero a diciembre de 2015. En siete estaciones de muestreo, se recolectaron ninfas en rocas y hojarasca sumergida, de forma manual con pinzas entomológicas y con red triangular, para su posterior cría en sistemas de acuarios en el laboratorio. Se recolectaron 485 ninfas, con la emergencia de 138 adultos. Cinco especies de Anacroneuria: Anacroneuria annulipalpis, A. benedettoi, A. planicollis, A. quetzali, A. marca y dos especies no identificadas fueron determinadas a través de la crianza de ninfas en laboratorio. El rango de distribución de A. benedettoi fue extendido a la provincia de Chiriquí. El primer registro de A. quetzalipara Panamá es comentado. Se aporta datos de distribución altitudinal, variabilidad estacional y requerimientos ambientales. Se recomienda ampliar los estudios sobre las asociaciones de ninfas con las formas adultas en otras áreas de Panamá y del Neotrópico, así como incrementar el conocimiento sobre la biología y ecología de este grupo.<hr/>Abstract Plecoptera order is a basal group of aquatic insects, also known as stonefly. In order to contribute to the taxonomic and ecological knowledge of the genus Anacroneuria, nymphs were collected in the upper and low parts of the Caldera River, in the Chiriquí province. For this, field trips were carried out once a month, from January to December of 2015. A total of seven stations were sampled, and nymphs were collected on rocks and submerged leaf litter, manually with entomological tweezers, and with a triangular net; nymphs were later transported and reared in aquarium systems in the laboratory, and their growth was followed. A total of 485 nymphs were collected, with the emergence of 138 adults. Five species of Anacroneuria: Anacroneuriaannulipalpis, A. benedettoi, A. planicollis, A. quetzali, A. marca and two unknown species were obtained after nymphs rearing. The distribution range of A. benedettoi was extended to the Chiriqui province. The first record for A. quetzaliin Panamá is commented. In addition, data of altitudinal distribution, seasonal variability and environment requirements were mentioned. We recommend to expand studies on Plecoptera nymph associations with adult forms in other areas of Panama and the Neotropics, as well as to increase the knowledge about their biology and ecology. Rev. Biol. Trop. 66(1): 164-177. Epub 2018 March 01. <![CDATA[Gametophyte morphology of <em>Acrostichum aureum</em> and <em>A. danaeifolium</em> (Pteridaceae)]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442018000100178&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Abstract Acrostichum is a pantropical genus and has four species, two of which occur in the Neotropics, A. aureum and A. danaeifolium. In Mexico, A. danaeifolium grows further in land wet soils and is much more common than A. aureum, which is typically found in brackish or saline habitats near the coast, and is restricted to coastal saline mangrove communities. The purpose of this paper was to describe and compare the morphogenesis of the sexual phase of A. aureum and A. danaeifolium for systematic purposes. For this, spores of each species were sown in Petri dishes with agar, previously enriched with sterilized Thompson’s medium. To avoid contamination and dehydration, the dishes were kept in transparent plastic bags under laboratory conditions. For the micro-morphological observation with SEM, the gametophyte development phases were fixed in FAA with 0.8 % sucrose for 24 h. Photomicrographs of spores, development stages of gametophytes and young sporophytes were observed with scanning electron microscope. Our results showed that the spores of both species are triletes, globose and positive photoblastic. Germination is Vittaria-type; the germinate filaments are short and uniseriate (5 to 7 cells), and prothallial development is Ceratopteris-type. The adult gametophytes of both species have asymmetrical wings. Adult gametophytes in culture are cordiform-spatulate. Antheridia have a broad basal cell, an annular cell, and an asymmetric opercular cell. Archegonia have short necks and four triangular cells at the mouth of the neck. The first leaf of the sporophyte is lobed, with dichotomous veins and anomocytic stomata. The gemmae are formed in adult gametophytes in both species. The development of the gametophyte of A. aureum, A. danaeifolium and A. speciosum share many similarities such as the development of a lateral meristem, asymmetric nature of the mature prothallus, lack of hairs on the prothallus, and undivided asymmetrical opercular antheridia morphology. The genus Acrostichum is the sister group of Ceratopteris, another genus of aquatic ferns; they differ in the antheridium morphology, Acrostichum has an asymmetric opercular cell and Ceratopteris shows an undivided cap cell, but the notable difference is the sporophyte morphology. Rev. Biol. Trop. 66(1): 178-188. Epub 2018 March 01.<hr/>Resumen Acrostichum es pantropical y tiene cuatro especies dos de las cuáles ocurren en el Neotrópico, A. aureum y A. danaeifolium. El género se encuentra típicamente en hábitats salobres o salinos cerca de la costa. También puede crecer más lejos en tierra en suelos húmedos. Acrostichum aureum está restringido a las comunidades de manglares salinos costeros. A. danaeifolium es mucho más común que A. aureum en México. El propósito de este trabajo es describir y comparar la morfogénesis de la fase sexual de A. aureum y A. danaeifolium. Las esporas de cada especie fueron sembradas en cajas de Petri, en agar previamente enriquecido con medio de Thompson esterilizado. Para evitar la contaminación y la deshidratación, las cajas se mantuvieron dentro de bolsas de plástico transparentes en condiciones de laboratorio. Para la observación micro-morfológica con el MEB, las fases de desarrollo del gametofito se fijaron en FAA con sacarosa al 0.8 % durante 24 h. Se observaron las esporas, fases de desarrollo de gametofitos y esporofitos jóvenes con un microscopio electrónico de barrido. Las esporas de ambas especies son triletes, globosas y fotoblásticas positivas. La germinación es tipo-Vittaria, los filamentos germinativos son cortos y uniseriados (5 a 7 células) y el desarrollo protálico es de tipo-Ceratopteris. Los gametofitos de ambas especies tienen alas asimétricas. Los gametofitos adultos en cultivo son cordiforme-espatulados. Los anteridios tienen una célula basal amplia, una célula anular y una célula opercular asimétrica. Los arquegonios tienen cuellos cortos y cuatro células triangulares en la boca del cuello. La primera hoja del esporofito es lobulada, con venación dicotómica y estomas anomocíticos. Las yemas se forman en gametofitos adultos en ambas especies. El desarrollo del gametofito de A. aureum, A. danaeifolium y A. speciosum comparten características tales como el desarrollo de un meristemo lateral, el protalo maduro de naturaleza asimétrica, ausencia de pelos en el protalo y anteridio con célula opercular asimétrica no dividida. Acrostichum es el grupo hermano de Ceratopteris, otro género de helecho acuático, que difieren en la morfología del anteridio, Acrostichum tiene una célula opercular asimétrica y Ceratopteris muestran una célula opercular no dividida. <![CDATA[Diversity of native reef fish communities in two protected areas in the Caribbean Sea and its relationship to the invasive lionfish]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442018000100189&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Resumen El pez león (Pterois volitans) invadió la región del Caribe y tiene el potencial de alterar la composición y estructura de las comunidades de peces en los arrecifes coralinos. El objetivo de este estudio fue analizar los índices de diversidad en las comunidades de peces nativos en sitios invadidos por el pez león en dos áreas marinas protegidas (AMP) del Caribe y compararlos con datos previos a la invasión. En ambas AMP, Parque Nacional Guanahacabibes (PNG) en el occidente de Cuba y Parque Nacional Arrecifes de Xcalak (PNAX) en el S de Quintana Roo, se realizaron censos visuales de las especies de peces en hábitats durante las épocas de seca y lluvia del 2013-2015. Se evaluaron nueve sitios, mediante conteos estacionarios. Se registró mayor riqueza de especies en el PNG (43.47±5.14) que en el PNAX (40.22±4.96). No se observaron diferencias entre épocas en ninguna de las AMP. El pez león se ubicó entre las especies más abundantes del PNG. La abundancia media en el PNG (0.76 ± 1.25) fue mayor a la registrada en el PNAX (0.19±0.46). La diversidad disminuyó después de la llegada del pez león en un solo sitio del PNG y en dos sitios del PNAX, pero al parecer estos resultados están más asociados al efecto de la pesca que a la presencia del pez león. A partir de los resultados y asumiendo que los cambios en las comunidades de peces por el pez león podrían no detectarse aún, recomendamos seguir los monitoreos de los descriptores comunitarios para detectar cambios futuros en las comunidades de peces.<hr/>Abstract Lionfish (Pterois volitans) invaded the Caribbean region with the potential to alter the composition and structure of native coral reef fish communities. The objective of this study was to analyze the diversity indices of these fish communities potentially affected by lionfish predation and to compare with pre-invasion data. The study was undertaken in two Caribbean marine protected areas (MPAs): Guanahacabibes National Park (PNG) in W Cuba and Xcalak Reefs National Park (PNAX) in S Quintana Roo. We carried out visual censuses of fish species in reef habitats during the dry and rainy seasons of the period 2013-2015. For this, nine sites were defined and evaluated using stationary counts. Our results showed higher species richness (43.47 ± 5.14) and mean abundance (0.76 ± 1.25) in PNG than in PNAX (40.22 ± 4.96, 0.19 ± 0.46, respectively). Diversity decreased after the arrival of lionfish in a single site of PNG and in two sites of the PNAX, but apparently, these results are more related to the fishing activity effect than to the lionfish presence. Based on the results and assuming that changes in the native fish communities by lionfish may not yet be detected, we recommend to continue the monitoring community descriptions in order to detect future changes in native fish communities. Rev. Biol. Trop. 66(1): 189-203. Epub 2018 March 01. <![CDATA[Efficiency of pitfall traps and taxonomic sufficiency for epigeal spider communities (Araneae) in three ecoregions of northwestern Argentina]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442018000100204&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Resumen El incremento de la degradación de los hábitats naturales ha fortalecido la necesidad de conocer y evaluar los patrones de biodiversidad; siendo los inventarios biológicos y la suficiencia taxonómica herramientas que permiten describir y monitorear la diversidad en cortos períodos de tiempo. El estudio de la araneofauna en el norte Argentino es escaso en particular en ecorregiones donde se considera prioritario conservar sus ambientes. Las arañas son utilizadas como taxón indicador para comparar patrones de biodiversidad, donde el estudio de las familias y de los gremios puede potencialmente servir como sustitutos ecológicos de las especies dando indicación del uso del hábitat y de las estrategias de forrajeo. En este estudio, analizamos la diversidad alfa y beta de las comunidades de arañas epigeas en diferentes ecorregiones de la provincia de Salta (Chaco Serrano, Monte de Sierras y Bolsones, y Puna) utilizando trampas de caída y muestreos en las cuatro estaciones del año; y testeamos si el nivel taxonómico familia, en el caso de las arañas, puede actuar como potencial sustituto del nivel especie en las evaluaciones rápidas de biodiversidad. Para ello, en cada ecorregión seleccionamos tres sitios ampliamente separados que fueron muestreados durante el otoño, invierno, primavera y verano del 2005-2007. En cada sitio se colocaron 10 trampas de caída separadas por 10 m a lo largo de una transecta lineal y con una actividad de 7 días por estación. Se recolectaron 886 arañas de 100 especies/morfoespecies correspondientes a 19 familias. La ecorregión Chaco (S = 56, N = 495) reportó la mayor riqueza de especies y abundancia comparada con el Monte (S = 44, N = 262) y la Puna (S = 23, N = 129). La completitud del inventario obtenido para cada ecorregión fue completa, superando el 70 %. La diversidad alfa y beta evidenciaron que las comunidades ecorregionales de arañas fueron diferentes. Las estaciones más frías (otoño e invierno) demostraron ser claves a la hora de evaluar la diversidad de arañas en las ecorregiones, aportando a la diversidad regional conjuntamente con la diversidad de las estaciones cálidas (primavera y verano). Además, el nivel taxonómico de familia evidenció reflejar, de igual manera que el nivel especie, los cambios en la diversidad alfa y beta. El uso de trampas de caída en todas las estaciones del año y el reconocimiento de las familias de arañas para la fauna epigea son de gran utilidad para realizar futuras evaluaciones rápidas de biodiversidad en el área en estudio; permitiendo así incorporar este grupo taxonómico en los estudios de monitoreo de biodiversidad que se lleven a cabo en estas ecorregiones.<hr/>Abstract The increased degradation of natural habitats has strengthened the need to know and assess biodiversity patterns. Particularly, the study of the spider fauna in the North of Argentina is scarce in ecoregions with priority interests of conservation. Generally, spiders are used as indicators to compare biodiversity patterns, and here we tested whether the spider family-level can act as a substitute of the species-level in biodiversity rapid assessments. For this, we analyzed the alpha and beta diversity of the epigeal spider communities in three separate sites of three ecoregions of Salta province (Chaco Serrano, Monte de Sierras and Bolsones, and Puna), during the fall, winter, spring and summer of 2005-2007. In each site, 10 pitfall traps, located along a linear transect and 10 meters apart, were placed for seven days per season of continuous activity. A total of 886 spiders were collected from 100 species/morphospecies of 19 families. The completeness of the inventory obtained for each ecoregion surpassed 70 %. The Chaco ecoregion (S = 56, N = 495) reported the highest species richness and abundance compared to Monte (S = 44, N = 262) and Puna (S = 23, N = 129). Alpha and beta diversity showed that ecoregional spider communities were different, sharing few species (0.7 %). The Chaco reported a high dissimilarity of its assemblage with respect to the other ecoregions. The colder seasons (autumn and winter) are important in assessing the diversity of spiders, contributing to regional diversity in conjunction with the diversity of warm seasons (spring and summer). Four guilds were reported (ground hunters, specialists, other hunters and ambush hunters), but the latter was absent in Monte, and the specialists dominated Chaco. Zodariidae was dominant in Chaco Serrano, where Leprolochus birabeni is an indicator of native environments. On the other hand, Lycosidae, Philodromidae, Anyphaenidae and Oonopidae were important for Monte and Puna. Year-round pitfall traps and identification of epigeal spider families are useful for biodiversity rapid assessments in this area. Like the species-level, the taxonomic family-level evidenced changes in alpha and beta diversity. This allows the inclusion of this taxonomic group for future biodiversity monitoring. Rev. Biol. Trop. 66(1): 204-217. Epub 2018 March 01. <![CDATA[The effects of fragmentation on the genetic structure of <em>Theobroma speciosum</em> (Malvaceae) populations in Mato Grosso, Brazil]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442018000100218&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Abstract Native Theobroma species, such as cacauhy, are losing their habitat due to the intense forest fragmentation in the Amazon region, and preserving their genetic diversity has been the focus of many conservation programs. The aim of the present study is to assess whether fragmentation and habitat reduction affect its genetic structure and lead to genetic diversity losses in natural Theobroma speciosum populations. The study was conducted in two Mato Grosso State (Brazil) locations: Apiacás and Alta Floresta counties. Juruena National Park (JNP) in Apiacás County holds a natural T. speciosum population that has not suffered anthropic influences. A population composed of individuals from three anthropized urban forest parks (UF) in Alta Floresta County was analyzed for comparison. The leaves of 75 T. speciosum individuals distributed in the urban forest fragments and of 100 individuals found in the Juruena National Park were sampled. All nine microsatellite loci showed high polymorphism levels between categories (adults and sub-adults), in both populations. The sub-adult individuals of the fragmented area had a higher value (0.71), and the preserved population, the same value (0.69). The analysis of molecular variance showed 83 % genetic diversity within categories; 16 %, between populations; and only 1 %, between categories. Although the effects were small, a persistent fragmentation process can increase inbreeding and facilitate genetic drift, leading T. speciosum populations to inbreeding depression and loss of diversity. Rev. Biol. Trop. 66(1): 218-226. Epub 2018 March 01.<hr/>Resumen Las especies nativas de Theobroma, como cacauhy, están perdiendo su hábitat debido a la intensa fragmentación forestal en la región amazónica. Por lo tanto, preservar la diversidad genética ha sido el objetivo principal de la mayoría de los programas de conservación. El objetivo de este estudio fue evaluar si la fragmentación y la reducción del hábitat afectan la estructura genética y causan la pérdida de diversidad genética en poblaciones naturales de Theobroma speciosum. El estudio se realizó en dos localidades del estado de Mato Grosso, Mato Grosso, Brasil, en el municipio de Apiacás, se consideró una población natural de T. speciosum sin influencia antrópica, ubicada en el Parque Nacional Juruena (JNP) y en el municipio De Alta Floresta se analizó una población compuesta por individuos de tres parques forestales urbanos antropizados (UF). Fueron muestreadas las hojas de 75 individuos de T. speciosum de los fragmentos de bosque urbano y 100 individuos del Parque Nacional de Juruena. Los nueve loci microsatélites mostraron altos niveles de polimorfismo entre las categorías (adultos y sub-adultos) en ambas poblaciones. En la población media, los individuos sub-adultos fragmentados de la población (UF) mostraron un mayor valor de f (0.71), mientras que la categoría de población preservada (JNP) presentó valores iguales entre sí (0.69). El análisis de la varianza molecular mostró que la mayoría de la diversidad genética está dentro de las categorías (83 %), mientras que el 16 % se encuentra entre la población y sólo el 1 % entre las categorías. Aunque los efectos fueron pequeños, si el proceso de fragmentación persistente puede aumentar los niveles de endogamia y facilitar la acción de la deriva genética. En el curso de varias generaciones, estos efectos pueden conducir a la depresión endogámica, la pérdida de diversidad y la alteración de la estructura genética de poblaciones de T. speciosum. <![CDATA[Total richness of vascular plant species in an Andean forest of the Central Cordillera, Colombia]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442018000100227&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Resumen Los reportes sobre diversidad de plantas en los bosques tropicales suelen estar restringidos a árboles u otros grupos de plantas leñosas por encima de cierto diámetro del tallo. Sin embargo, otros estudios que incluyen todas las formas de vida sin restricciones de tamaño de los individuos, indican claramente que las plantas no leñosas son igual de importantes. En este estudio se reporta la Riqueza total de especies de plantas vasculares (RTE) en una parcela de una hectárea en un bosque andino del noroccidente de Colombia (6º12’48”N &amp; 75º29’32”O); adicionalmente evaluamos la contribución de los diferentes hábitos de crecimiento a la RTE y el efecto del tamaño de las plantas. Se censaron todos los individuos con diámetro del tronco (D) ≥ 5 cm en 1 ha, y todas las plantas vasculares de todos los tamaños, incluyendo epífitas, en una muestra de 0.25 hectáreas. Se registró un total de 14 545 individuos distribuidos en 318 especies, 72 familias (considerando Pteridophyta como un solo grupo) y 171 géneros. El 99.7 % de las especies son menores de 10 cm de (D) y el 94.4 % son menores a 2.5 cm de (D). Las especies no arbóreas (hierbas terrestres, epífitas y escandentes) representan el 54.3% del total de especies registradas en la parcela, lo que indica que son un componente clave de la estructura, composición y riqueza de este bosque montano neotropical. Estos resultados confirman reportes similares para otros bosques tropicales. Concluimos que para conocer con más detalle la diversidad de florística de un sitio es recomendable: 1) ampliar el rango de tamaño de las plantas considerado comúnmente en los inventarios florísticos y 2) incluir las especies no leñosas; esta información es crucial para tomar mejores decisiones en los esfuerzos de conservación a escala local y global.<hr/>Abstract Studies of plant diversity in tropical forests are usually restricted to trees or other groups of woody plants above a certain stem diameter. However, surveys that include all forms of live plants with no restrictions on their sizes, clearly indicate that non-woody plants are equally important. In this study, we reported the total species richness of vascular plants species (TSR) in one hectare plot in an Andean forest in Northwestern Colombia (6º12’48”N &amp; 75º29 32”W). We evaluated the relative contribution of the different growth habits and the effect of the plant size, to TSR. We measured all individuals with diameter (D) ≥ 5 cm in the hectare and all the vascular plants of all sizes, including epiphytes, in a subsample of 0.25 ha. A total of 14 545 individuals distributed in 318 species, 72 families (considering Pteridophyta as one group) and 171 genera were registered. Most of the species showed a (D) &lt; 10 cm (99.7 %) and &lt; 2.5 cm (94.4 %). The no-arboreal species (ground herbs, epiphytes and vines) represented 54.3 % of the total species reported in the plot, indicating that they are important in the structure, composition and species richness of this montane forest. Our results coincide with similar studies in other tropical forests. We concluded that to get a more detailed knowledge of the floristic diversity of a site, it is advisable to: 1) amplify the size range of the plants generally considered in the floristic inventories and 2) to include non-woody species. This information is crucial for making better decisions in local and global conservation efforts. Rev. Biol. Trop. 66(1): 227-236. Epub 2018 March 01. <![CDATA[Cellulolytic and lipolytic fungi isolated from soil and leaf litter samples from the Cerrado (Brazilian Savanna)]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442018000100237&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Abstract The Brazilian savanna, known as the Cerrado, is a biome with a high degree of endemism, with the potential to house many microorganisms suitable for biotechnological exploitation, especially fungi. The Cerrado soil, which is usually acidic, is a favorable environment for the growth of fungi capable of degrading lignocellulosic materials. The aim of the present study was to isolate cellulolytic filamentous fungi native to the Cerrado. Samples of soil and leaf litter were collected in three points of Cerrado State Park, located in the South of Brazil, during the rainy season in September 2014. Samples were stored in sterile plastic bags, transported at room temperature and kept at 4 ºC for three days. Filamentous fungi were isolated by successive inoculations in PDA (maintained at 30 ºC). Cellulase activity was tested in CMC (carboxymethyl cellulose) medium and lipase activity was assessed in medium containing phenol red and tween 20 (incubated at 37 °C), and in medium supplemented with Rhodamine B (kept at 30 °C). We isolated a total of 28 strains, 25 produced cellulase, detected with lugol in strains grown in CMC medium. The isolates were identified morphologically (color, form of growth) and by sequencing of the 18S rRNA region, with both techniques producing congruent results. One strain of Colletotrichum boninense and one strain of Trichoderma sp., both isolated from soil samples, presented the highest cellulolytic activity. All strains exhibited lipolytic activity, with enzyme production and activity influenced by temperature. The present study revealed new strains of known filamentous fungi that can be applied in biomass degradation. These strains are suitable for optimization of culture conditions, which could lead to the economic feasibility of the process. Rev. Biol. Trop. 66(1): 237-245. Epub 2018 March 01.<hr/>Resumen La sabana brasileña conocida como Cerrado, es un bioma con alto grado de endemismo con el potencial de albergar muchos microorganismos de alto interés biotecnológico. Los hongos producen muchas enzimas que se aplican ampliamente en procesos industriales. El suelo del Cerrado, que suele ser ácido, es un ambiente favorable para el crecimiento de hongos capaces de degradar materiales lignocelulósicos. El objetivo del presente estudio fue aislar los hongos celulolíticos filamentosos nativos del Cerrado. Muestras de suelo y de hojarasca fueron recolectadas en el Parque Estatal del Cerrado, ubicado en el sur de Brasil. De 28 cepas aisladas, 25 produjeron celulasa que fue detectada con lugol. Las cepas fueron cultivadas en medio CMC (carboximetilcelulosa). Los aislados fueron identificados morfológicamente (color, forma de crecimiento) y por secuenciación de la región 18S rRNA, produciendo resultados congruentes. Una cepa de Colletotrichum boninense y una cepa de Trichoderma sp., ambas aisladas de muestras de suelo, presentaron la mayor actividad celulolítica. Todas las cepas mostraron actividad lipolítica, la producción y la actividad se vieron influidos por la temperatura. El presente estudio revela nuevas cepas de hongos filamentosos conocidos con potencial de aplicación en la degradación de la biomasa, sin embargo, la optimización de las condiciones de cultivo es necesaria para lograr la viabilidad económica. <![CDATA[Environmental factors influencing the ichthyofauna of the La Mancha lagoon, Ramsar site, Gulf of Mexico]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442018000100246&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Resumen La laguna La Mancha en el Golfo de México, es un sistema costero con categoría Ramsar por su alta biodiversidad, numerosas especies de peces dependen de el para realizar sus ciclos de vida. Fue analizada la variación espacial y temporal de la diversidad, abundancia y asociaciones de peces y su relación con los factores fisicoquímicos. Entre abril de 2005 y enero de 2008, se realizaron 95 muestreos diurnos en siete sitios donde se registraron las características del agua y la composición de la comunidad de peces. El sistema presentó variaciones espacio temporales de los parámetros físicoquímicos, definiendo ambientes contrastantes de acuerdo con los gradientes locales. Se recolectaron 5 974 individuos, pertenecientes a 50 especies, 39 géneros y 25 familias, cuatro especies son registros nuevos para el sistema. La diversidad y riqueza de especies fueron altas en el ambiente salobre y bajos en zonas dulceacuícolas. En septiembre (lluvias) y noviembre (nortes) la diversidad (H’ = 1.52) y riqueza (D = 1.99) fue más alta. La abundancia de los peces fue mayor hacia la boca de conexión con el mar. La densidad y biomasa (1.17 indiv./m2, 4.33 g/m2) fue mayor en abril (secas) y el peso promedio (30.82 g/ind) en julio (lluvias). El Índice de Valor de Importancia (IVI) definió cuatro especies dominantes que representan el 75 % de la abundancia numérica y el 46 % de la captura total en peso. El Análisis de Correspondencia Canónica (ACC) mostró que la relación peces-hábitat fue explicada en un 57 % de la varianza total para los primeros dos ejes, donde las variaciones de temperatura, salinidad, oxígeno disuelto y profundidad fueron los factores ambientales que determinaron la composición, distribución, componentes comunitarios y categorías tróficas de los peces en la comunidad. Este estudio aporta información sobre la relación del ambiente con la estructura de la comunidad íctica de La Mancha, y representa una base para realizar monitoreo ecológico que permita incrementar el conocimiento necesario sobre el ecosistema y sus poblaciones de peces, con la finalidad de proponer estrategias de manejo para la conservación de los recursos pesqueros de Veracruz.<hr/>Abstract La Mancha lagoon in the Gulf of Mexico, is a coastal system with Ramsar category because of its high biodiversity, many species of fish depend on it to complete their life cycles. In this study we analyzed the spatial and temporal variation of fish diversity, abundance and associations, and its relationship with physicochemical factors. Between April 2005 and January 2008, 95 daytime samplings were carried out at seven sites, where water characteristics and the composition of fish community were recorded. The system presented spatial-temporal variations of the physicochemical parameters, defining contrasting environments according to the local gradients. A total of 5 974 fish individuals, belonging to 50 species, 39 genera and 25 families were collected; four species were new records for the system. The diversity and richness of species were high in the brackish environment and low in freshwaters areas. In September (rainy season) and November (“nortes” season), diversity (H’ = 1.52) and richness (D = 1.99) were highest. Fish abundance was greater towards the mouth connecting with the sea. The density and biomass (1.17 ind/m2, 4.33 g/m2) was higher in April (dry season) and the average weight (30.82 g/ind) in July (rainy season). The Importance Value Index (IVI) defined four dominant species representing 75 % of the numerical abundance and 46 % of the total catch in weight. The Canonical Correspondence Analysis (CCA) showed that the fish-habitat relationship was explained in 57 % of the total variance for the first two axes, where the variations in temperature, salinity, dissolved oxygen and depth were the environmental factors that determined the composition, distribution, community components and trophic categories of the fish community. This study provides information on the relationship between the environment and the structure of the fish community in La Mancha, and represents a basis for ecological monitoring to increase the knowledge needed about the ecosystem and fish populations, in order to boost management strategies for the fishery resources conservation in Veracruz. Rev. Biol. Trop. 66(1): 246-265. Epub 2018 March 01. <![CDATA[Traditional uses and seed chemical composition of <em>Jatropha</em> spp<em>.</em> (Euphorbiaceae) in Tehuacán-Cuicatlán, México]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442018000100266&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Abstract The Tehuacán-Cuicatlán Biosphere Reserve in México holds genetic richness and endemism for the genus Jatropha, but the specific use of the plants and the seed chemical profiles are still unknown. We recorded the traditional forms of use of Jatropha species, and analyzed the chemical composition of Jatropha spp. seeds. For this, a semi-structured survey was conducted in 15 towns, and 20 interviews were applied in each one between May and August 2012 to estimate the Significant Use Level and Relative Use Value per species. Besides, seeds from J. neopauciflora, J. rufescens, and J. rzedowskii were collected between August and October 2013, and to seed flour samples we determined total lipids by the Soxhlet method, crude protein by the Kjendahl method, and ashes according to AOAC methods; fatty acid profile and phorbol esters were determined by gas chromatography and by HPLC, respectively. The species J. neopauciflora, J. oaxacana, J. rufescens, J. ciliata, and J. rzedowskii, are used as traditional medicine, food, and ornaments, except for J. ciliata, for which none use was recorded. The Significant Use Level as food was found not significant, but for medicinal purposes, J. neopauciflora obtained the highest Relative Use Value (9.0 %). The latex is used to treat 13 disorders, including dental problems and oral diseases with a Significant Use Level of 32.9 %; it is also used as a hemostatic. The protein content among species varied from 23.37 to 26.06 %, and total lipids from 34.79 to 36.60 %. The principal unsaturated fatty acids were oleic (25.08 to 30.09 %) and linoleic (44.55 to 48.46 %), and the saturated fatty acids were palmitic (10.11 to 16.50 %) and stearic (9.47 to 11.15 %). Phorbol esters, the main cause of seed’s toxicity, were absent in J. neopauciflora, J. rufescens, and J. rzedowskii. In conclusion, the Significant Use Level of Jatropha species studied was low, with little cultural acceptance and sporadic utilization. The Relative Use Value was important for medicinal purposes, especially for J. neopauciflora. The dehulled seeds of J. neopauciflora, J. rufescens, and J. rzedowskii are potentially useful as food, having high protein contents, and unsaturated oleic and linoleic fatty acids. With this study we report three non-toxic Jatropha species and recommend to scientifically validate the antimycotic use of J. neopauciflora latex. Rev. Biol. Trop. 66(1): 266-279. Epub 2018 March 01.<hr/>Resumen La Reserva de la Biosfera Tehuacán-Cuicatlán, México contiene riqueza genética y endemismo para el género Jatropha, pero se desconoce el uso específico de las plantas y la composición química de la semilla. Documentamos las formas tradicionales de uso de las especies de Jatropha y, analizamos la composición química de las semillas de las especies de Jatropha. En 15 comunidades se aplicaron 20 entrevistas semiestructuradas entre mayo y agosto de 2012 para estimar el Nivel de Uso Significativo y el Valor de Uso Relativo por especie. Se colectó semilla solo de J. neopauciflora, J. rufescens, y J. rzedowskii entre agosto y octubre de 2013 para determinar mediante los métodos de la AOAC, el contenido total de lípidos en una muestra de 3 g de harina mediante el método de Soxhlet, proteína cruda en una muestra de harina de 0.4 g por el método Kjendahl y ceniza en una muestra de 5 g de harina. El perfil de ácidos grasos se determinó por cromatografía de gases y el contenido de ésteres de forbol mediante HPLC. Las especies registradas fueron J. neopauciflora, J. oaxacana, J. rufescens, J. rzedowskii y J. ciliata, que se usan en medicina tradicional, alimento y como ornamental, excepto J. ciliata, para la cual no se reportó ningún uso. El Nivel de Uso Significativo como alimento no fue importante, pero para propósitos medicinales J. neopauciflora tuvo el mayor Valor de Uso Relativo (9.0 %). El látex es usado para tratar 13 trastornos, incluyendo problemas dentales y enfermedades bucales con un Nivel Significativo de Uso de 32.9 %; y también es usada como hemostático. El contenido de proteína entre especies varió de 23.37 a 26.06 % y los lípidos totales variaron de 34.79 a 36.60 %. Los principales ácidos grasos insaturados fueron oleico (25.08 a 30.09 %) y linoleico (44.55 a 48.46 %); los ácidos grasos saturados fueron palmítico (10.11 a 16.50 %) y esteárico (9.47 a 11.15 %). No se detectó la presencia de ésteres de forbol (la causa principal de la toxicidad de la semilla) en J. neopauciflora, J. rufescens, y J. rzedowskii. En conclusión, el Nivel de Uso Significativo de las especies de Jatropha fue bajo, con poca aceptación cultural y utilización esporádica. El Valor de Uso Relativo fue importante para propósitos medicinales, especialmente para J. neopauciflora. Las semillas sin testa de J. neopauciflora, J. rufescens, y J. rzedowskii son potencialmente útiles como alimento por su alto contenido de proteínas, ácidos grasos insaturados oleico y linoleico. Se identificaron tres especies no toxicas de Jatropha. Se recomienda validar científicamente el uso antimicótico del látex de J. neopauciflora. <![CDATA[Blood parameters and reproductive hormone profile of female <em>Choloepus hoffmanni</em> in captivity]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442018000100280&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Resumen El uso de técnicas no invasivas ni estresantes para determinar perfiles hormonales, como la medición de esteroides fecales, ha incrementado la comprensión de la fisiología reproductiva en animales silvestres. Debido a la escasa información con respecto a perfiles hormonales reproductivos del perezoso de dos dedos, Choloepus hoffmani, se realizó un estudio en hembras en cautiverio en el centro de rescate “Sloth Sanctuary” (Cahuita, Limón, Costa Rica) con el fin de determinar (i) la confiabilidad de la extracción de progesterona y estradiol en heces, y su cuantificación en el analizador AIA-360®, (ii) evaluar los parámetros sanguíneos en esta especie y (iii) establecer si existe una correlación entre los esteroides plasmáticos y fecales. El estudio se realizó en un periodo de tres meses, durante noviembre de 2013 a enero de 2014, con un total de 208 muestras de heces provenientes de cinco hembras sexualmente maduras, con peso promedio de 6.32 kg. El promedio de las concentraciones medianas en las heces de las cinco hembras fue 124.21 ng/g para progesterona y 1 708.95 pg/g de estradiol. En plasma, los valores de mediana fueron 1.26 ng/mL con un mínimo de 0.32 ng/mL y 12.84 ng/mL como valor máximo; los valores plasmáticos de estrógeno se encontraron por debajo del límite de detección del equipo (25 pg/mL). Aunque no se encontró una correlación estadísticamente significativa entre la progesterona plasmática y la fecal, nuestros datos sugieren que los eventos plasmáticos se reflejan en heces durante los dos días posteriores. Asimismo, los niveles de progesterona se mantuvieron elevados durante la primera mitad de noviembre, y posteriormente mostraron una reducción importante en todas las hembras. Nuestros resultados demuestran que las extracciones en heces y su medición en el AIA-360® permiten la detección y el seguimiento de variaciones hormonales en C. hoffmani, aunque no remplaza las mediciones plasmáticas para determinar valores absolutos.<hr/>Abstract In wild animal species, the use of non-invasive and non-stressful procedures to determine hormone profiles, such as fecal steroid measurements, has considerably increased the comprehension of their reproductive physiology. Since there is limited information related to the reproductive hormone profiles of the two-toed sloth, Choloepus hoffmani, a study was conducted in captive specimens at the “Sloth Sanctuary” (Cahuita, Limón, Costa Rica), in order to determine: (i) the reliability of the fecal progesterone and estrogen extraction and its quantification with an AIA-360® analyzer, (ii) assess blood parameters in this species and (iii) evaluate if there is a correlation between fecal and plasmatic steroids. The study was performed over a three-month period, from November, 2013 to January, 2014, with a total amount of 208 fecal samples collected from five sexually mature females weighing 6.32 kg in average. The average of the median concentrations of progesterone in feces of the five females was 124.21 ng/g, and 1 708.95 pg/g for estrogen. The average minimal and maximal values were 50.96 ng/g and 1 057.46 ng/g for progesterone and, 1 191.77 pg/g and 2 159.24 pg/g for estradiol. In plasma, progesterone median values were 1.26 ng/mL, showing a minimum of 0.32 ng/mL and 12.84 ng/mL as maximum values. The plasmatic estrogen levels were below the detection limit of the equipment (25 pg/mL). Although there was no strong statistical correlation between the fecal and plasmatic progesterone fluctuations, our data suggests that the plasmatic events are mostly reflected in feces two days afterwards. Also, the levels of progesterone were elevated during the first half of November and, subsequently, showed a successive and important reduction in all the females tested. Finally, our results demonstrated that fecal steroid extractions and their measurement in a AIA-360®, allowed the successful detection and represents an alternative non-invasive determination of hormone profiles in C. hoffmani. Rev. Biol. Trop. 66(1): 280-292. Epub 2018 March 01. <![CDATA[Variation in the coloration pattern of <em>Anablepsoides hartii</em> (Cyprinodontiformes: Cynolebiidae) in coastal streams of Venezuela]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442018000100293&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Resumen Anablepsoides hartii es un pez no anual de la familia Cynolebiidae. Históricamente, incongruencias en la identificación de dicha especie han surgido debido a su variación en el patrón de coloración. Por tal motivo, se describe e ilustra los diferentes tipos de patrones de coloración de esta especie. Se revisaron 336 ejemplares de 19 lotes preservados en alcohol al 70 %, depositado en las colecciones ictiológicas del Museo de Biología de la Universidad Central de Venezuela y el Museo de Ciencias Naturales en Guanare. Los ejemplares fueron separados por características distintivas de tamaño, sexo y localidad. Adicionalmente, se tomaron fotografías de cada individuo que fueron vectorizadas a un máximo nivel de detalle, separando claros y oscuros que delimitan los patrones con un mismo tono de coloración con el programa Corel Draw versión x7 en español. Anablepsoides hartii presenta cuatro (4) patrones de coloración. Los cromotipos son: 1.- masculino, 2.- femenino, 3.- intermedio y 4.- montano. Los dos primeros cromotipos son separados por caracteres sexuales, a su vez el cromotipo intermedio presenta caracteres tanto de machos como de hembras en un mismo individuo. Finalmente, el cromotipo montano se diferencia del resto por presentar la serie de hileras laterales incompleta seguido por un reticulado de medio cuerpo hasta la cola. Esta contribución permite aclarar las diferencias que existen en una especie morfológicamente variable.<hr/>Abstract Anablepsoides hartii is a non-annual fish of the family Cynolebiidae. Historically, this species has presented some inconsistencies for proper identification, due to a variation in the color pattern. The aim of this study was to describe and illustrate the different types of color patterns found in this species. We examined a total of 336 preserved specimens (19 lots) deposited in the ichthyological collections of the Museo de Biologia de la Universidad Central de Venezuela and the Museo de Ciencias Naturales in Guanare, Venezuela. The specimens were sorted by distinctive characteristics of size, sex and locality. Besides, we took photographs of each individual, vectorized them with detail, separating light and dark colorations and delimited color patterns of the same tone with the program Corel Draw version x7 (Spanish). My analysis showed that A. hartii presented four colors patterns. The color morphs were classified as: 1 male, 2 female, 3 intermediate and 4 montane. The first two color morphs were separated by sexual characters (sexual dimorphism); in turn, the intermediate color morph presented characters of both males and females in the same individual. Finally, the montane color morph differed from the previous ones by presenting a series of incomplete lateral rows, followed by a half-body reticulation to the tail. This analysis allowed the identification of the differences in this morphologically variable species. Rev. Biol. Trop. 66(1): 293-302. Epub 2018 March 01. <![CDATA[Identification and evaluation of (3<em>Z</em>, 6<em>Z</em>, 8<em>E</em>)-dodeca-3, 6, 8-trien-1-ol as the trail following pheromone on <em>Microcerotermes exiguous</em> (Isoptera:Termitidae)]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442018000100303&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Abstract Trail-following pheromone is one of the most important semiochemical in termites. This pheromone is responsible for the recruitment of individuals from the colony to perform different tasks. The aim of this work was to isolate and identify the trail-following pheromone of Microcerotermes exiguus (Isoptera: Termitidae), a typical termite from the Neotropic, that is considered pest in some crops. Subterranean nest of M. exiguus were collected with a shovel in Caracas, Venezuela in 2010. Different chemical micro-reactions combined with chromatographic analysis of solvent extracts, as well as solid phase microextraction analyses (SPME) were applied to termite sternal glands; besides, some behavioral biossays were undertaken. A peak in the chromatograms from extracts (retention index: 1 483), presented a fragmentation pattern with m/z ions: 41; 55; 67; 79; 91; 105; 119; 135; 142; 180, this result alongside behavioral assays allowed us to conclude that (3Z,6Z,8E)-dodeca-3, 6, 8-trien-1-ol (DTOH) acts as the main component of the trail following pheromone. The estimated optimum concentration for termite recruitment and orientation was around 1 pg/cm, being statistically comparable to the value on trails marked with whole body extracts at concentration of 1 worker/cm. The period of time that this compound takes to recruit other colony members is 13.67 ± 5.76 s and lasts up to two hours. Both analytical and behavioral results provided better understanding on the chemical communication of M. exiguus. This information could be used for the future development of newer pest control methods. Rev. Biol. Trop. 66(1): 303-311. Epub 2018 March 01.<hr/>Resumen La feromona de camino es uno de los semioquímicos más importantes en las termitas. Esta feromona es responsable del reclutamiento de individuos de la colonia para realizar diversas tareas. El objetivo de este trabajo fue aislar e identificar la feromona de camino de Microcerotermes exiguus (Isoptera: Termitidae), que es una termita típica del Neotrópico, considerada como plaga en algunos cultivos. Nidos subterráneos de M. exiguus fueron recolectados en Caracas, Venezuela en el 2010. Se realizaron diferentes micro-reacciones químicas combinadas con el análisis cromatográfico de los extractos en solventes, así como el de la microextracción en fase sólida (SPME) de las glándulas esternales de las termitas; además de algunos bioensayos de comportamiento. Un pico en los cromatogramas de los extractos (índice de retención:1 483), presentó un patrón de fragmentación con los iones m/z: 41; 55; 67; 79; 91; 105; 119; 135; 142; 180, este resultado junto con los ensayos comportamentales, nos permitieron concluir que el (3Z,6Z,8E)-dodeca-3, 6, 8-trien-1-ol (DTOH) es el compuesto principal de la feromona de camino. La concentración óptima estimada para el reclutamiento y la orientación se encuentra alrededor de 1 pg/cm, siendo estadísticamente comparable al valor en los caminos trazados con extractos de cuerpo entero de 1 obrera /cm. El tiempo que toma este compuesto para reclutar a otros miembros de la colonia es de aproximadamente 13.67 ± 5.76 s y se mantiene hasta por dos horas. Los resultados analíticos y de comportamiento proporcionan una mejor comprensión de la comunicación química de M. exiguus, y dicha información podría ser utilizada para el desarrollo de nuevos métodos de control de plagas. <![CDATA[Guatemala articles in the Science Citation Index Expanded: bibliometry of subjects, collaboration, institutions and authors]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442018000100312&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Resumen Guatemala, con 16 millones de habitantes, es la mayor economía de Centroamérica y, por tanto, podría tener la mayor producción científica de la región. Para evaluar su productividad y su impacto, en junio 2017 analizamos los 3 380 artículos de Guatemala incluidos en el SCI-ampliado. La mayoría de los documentos de Guatemala son artículos en inglés, tratan problemas de nutrición y salud y tienen una media de 7.4 autores por artículo. También en esta base de datos en particular, los artículos siguen siendo citados durante 40 años, y se citan más los artículos en inglés (dos veces más que en español), las revisiones (media: 24 citas por artículo de revisión) y los estudios resultantes de colaboración internacional, dominada por Estados Unidos y México. Las instituciones más productivas son el Centro de Estudios de Deterioro Sensorial CESSIAM, las universidades de San Carlos y del Valle, y el Instituto Centroamericano de Nutrición INCAP (pero el último ha disminuido la productividad en los últimos años). Los investigadores más productivos son N.W. Solomons, R. Bressani, L.G. Elías, C. Rolz y A. Cáceres. Guatemala representa un caso particular en Centroamérica, porque su investigación de alta calidad depende en gran medida de investigadores particulares, no tanto de las instituciones, y porque la producción total está muy por debajo de las expectativas para un país con esa población. La productividad y el impacto de la ciencia guatemalteca en las 18 revistas publicadas en el país, y en otras revistas que tampoco están cubiertas en el SCI-ampliado, siguen siendo desconocidos. Sin embargo, la tendencia histórica es positiva, con un claro crecimiento de la colaboración internacional, la productividad y el impacto.<hr/>Abstract Guatemala, with 16 million inhabitants, is the largest economy of Central America and should have the largest scientific output of the region. To assess its productivity and impact, we analyzed the 3380 Guatemala articles included in the SCI-expanded in June, 2017. Most Guatemala documents are articles in English, deal with nutrition and health problems, and have a mean of 7.4 authors per article. Also in this particular database, citation lifespan is 40 years, and citations are higher for articles in English (twice more than those in Spanish), for reviews (mean 24 citations per review) and for studies resulting from international collaboration, which is done mostly with the USA and Mexico. The most productive institutions are the Center for Studies of Sensory Impairment (CESSIAM), the universities of San Carlos and El Valle, and the Central American Nutrition Institute (INCAP, but it has decreased productivity in recent years). The most productive researchers are N.W. Solomons, R. Bressani, L.G. Elías, C. Rolz and A. Cáceres. Guatemala represents a particular case in Central America because its high quality research is dependent on particular researchers rather than on institutions, and because the total output is well under the expectation. The productivity and citation of Guatemalan science in the 18 journals published in the country, and in other journals which are also not covered in the SCI-expanded, remain unknown. Nevertheless, the historical trend is positive, with a clear growth of international collaboration, productivity and citation. Rev. Biol. Trop. 66(1): 312-320. Epub 2018 March 01. <![CDATA[Present and potential distribution of two <em>Mimosa</em> (Leguminosae) taxa endemic to Mexico]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442018000100321&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Resumen Mimosa aculeaticarpa var. aculeaticarpa y M. luisana son endémicas de México y consideradas plantas multipropósito, ya que ofrecen diversos servicios a los ecosistemas y pobladores en donde se establecen. Además, son valoradas por su potencial como restauradoras de ambientes tropicales, por lo que el objetivo de este estudio fue modelar su distribución conocida y potencial. En el año 2014, se obtuvieron registros de dos bases de datos (CONABIO y MEXU); cada resgistro fue validado taxonómica, geográfica y estadísticamente, una vez validados, se obtuvo la distribución conocida y potencial para M. aculeaticarpa var. aculeaticarpa (basada en 99 registros) y M. luisana (basada en 50 registros), utilizando el algoritmo MAXENT. La distribución conocida de ambos taxa se sobreposicionó en las capas de: elevación, clima, suelo, provincias biogeográficas y cuencas hidrológicas. Mimosa aculeaticarpa var. aculeaticarpa presenta amplia distribución en México (16 estados); mientras que M. luisana se encuentra restringida a los estados de Puebla y Oaxaca. M. aculeaticarpa var. aculeaticarpa se establece entre 1 900 y 2 700 msnm y M. luisana entre 500 y 1 760 msnm. Ambas se encuentran en climas áridos y semiáridos; sin embargo, M. aculeaticarpa var. aculeaticarpa también se puede encontrar en climas templados y mésicos. Asimismo, ambos taxa se distribuyen en suelos de tipo regosol calcárico; aunque, M. aculeaticarpa var. aculeaticarpatambién está en regosol éutrico, vertisol crómico y feozem háplico. La distribución de M. aculeaticarpa var. aculeaticarpa abarca ocho provincias biogeográficas y tres cuencas hidrológicas; mientras que M. luisana se localiza en tres provincias y dos cuencas; ambas coinciden en las provincias del Eje Volcánico y la Sierra Madre del Sur. Los modelos de distribución potencial se consideran excelentes, ya que poseen un AUC de 0.91 y 0.97, respectivamente. Los modelos indican que las condiciones de temperatura y precipitación son propicias para que ambos taxa pudieran ampliar su distribución. Igualmente, los modelos generados pueden considerarse como una aproximación al conocimiento de la distribución potencial de las mimosas mexicanas. Aunque, es importante considerar que los modelos son estáticos y no consideran a las interacciones bióticas, por lo que su relación con la realidad puede variar; por lo que se recomienda analizar los modelos mediante diferentes escenarios de cambio climático y de uso de suelo.<hr/>Abstract Mimosa aculeaticarpa var. aculeaticarpa and M. luisana are endemic to Mexico, and are considered as multipurpose plants, due to the diverse services they offer to ecosystems and to local people. Additionally, they are appreciated for their potential to restore tropical environments; hence, the objective of this study was to model the present and potential distribution of these taxa. In 2014, species registers were obtained from two databases (CONABIO and MEXU); each register was taxonomically, geographically and statistically validated. Once validated, the present and potential distribution of M. aculeaticarpa var. aculeaticarpa (based on 99 registers) and M. luisana (based on 50 registers) were obtained using the MAXENT algorithm. For both taxa, the present distribution was overlapped using the layers of: elevation, climate, soil, biogeographic provinces, and hydrologic basins. Mimosa aculeaticarpa var. aculeaticarpa showed a wide distribution in Mexico (16 states); whilst M. luisana was restricted to the states of Puebla and Oaxaca. M. aculeaticarpa var. aculeaticarpa establishes between 1 900 and 2 700 masl, and M. luisana between 500 and 1 760 masl. Both species were established in arid and semiarid climates; however, M. aculeaticarpa var. aculeaticarpa can also be found in temperate and mesic climates. Moreover, both taxa are distributed in calcareous regosol soils; although, M. aculeaticarpa var. aculeaticarpa is also found in eutric regosol, chromic vertisol and haplic phaeozem. The distribution of M. aculeaticarpa var. aculeaticarpa includes eight biogeographic provinces and three hydrologic basins; whilst M. luisana was only located in three provinces and two hydrologic basins; both are present in the Eje Volcánico and Sierra Madre del Sur provinces. The potential distribution models are considered as excellent ones due to an AUC of 0.91 and 0.97, respectively; these models indicated that the temperature and precipitation conditions would be suitable for the enlargement of their distribution. Likewise, these models can be considered an approach to the potential distribution knowlegment of the Mexican mimosas. Nevertheless, it is important to note that the models are static and do not take into account any biotic interaction; therefore, their relationship with reality can vary. Thus, it is recommended to analyze the models through different climate change and land use scenarios. Rev. Biol. Trop. 66(1): 321-335. Epub 2018 March 01. <![CDATA[Composition and structure of the fish community structure in the Anchique River sub-basin, Tolima, Colombia]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442018000100336&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Resumen La microcuenca del río Anchique se ubica en el municipio de Natagaima (Tolima) y drena directamente al río Magdalena, la distribución y abundancia de los peces está influenciada por múltiples factores a escalas temporales y espaciales, el objetivo del estudio es describir la estructura y composición de la comunidad íctica a lo largo del río y probar la hipótesis de que estas comunidades varían a nivel temporal y espacial. Se realizaron dos muestreos en altas y bajas lluvias, y se establecieron cuatro estaciones, colectándose 625 ejemplares y 36 especies. No se encontraron diferencias estadísticamente significativas entre algunas variables ambientales del río a nivel temporal, según la prueba Kruskal-wallis. Los valores de los índices de complejidad estructural y composición del sustrato, muestran que la estación E4 presentó los valores más altos, además fue la estación con mayor riqueza y diversidad según los números de Hill. El análisis de correspondencia canónica evidenció que el sustrato, complejidad y ancho del cauce influyeron de forma significativa en la composición y distribución de los peces. La comunidad íctica del río no presentó variación de la diversidad y riqueza temporalmente, pero si espacialmente, lo cual podría deberse a que cada estación presentó características estructurales diferentes.<hr/>Abstract The distribution and abundance of fish is influenced by multiple factors at temporal and spatial scales, and their community composition represent good river integrity indicators. The main objective of this study was to describe the composition and structure of fish assemblages along the Anchique river sub-basin (that drains to Magdalena river), and to test the hypothesis that these communities vary temporally and spatially. For this, four sites (E1, E2, E3 and E4) were sampled along the river (from river birthplace to Magdalena river), during the periods of high and low waters, in 2014. In each site, longitudinal transects (100 m long x 2 m wide, 60 min) were established and fishing was made with both electrofishing and trawl (10 m x 1 m, 0.05 m) nets. Fish samples were fixed and transported to the laboratory for posterior taxonomic identification with the use of keys; fish diversity and structure composition were calculated with the use of standard models. Besides, substrate composition and environmental variables were also considered. A total of 652 fish belonging to 36 species were recorded; high water showed higher values (325 fish with 32 species) than low water period (300 fish with 31 species). Siluriformes was dominant (51 %), followed by Characiformes (32 %), Gymnotiformes (5 %), Cyprinidontiformes and Cichliformes (6 %). Most abundant families were Characidae (28.3 %; 9 spp.), Loricariidae (23.4 %; 8 spp.) and Trichomycteridae (15.0 %; 2 spp.). Kruskal-Wallis test indicated that there is no significant difference among some environmental variables at the temporal level. The values of structural complexity and substrate composition indices showed that E4 had the highest values (0.8), followed by E1 (0.6), and E2 and E3 (0.4). Moreover, E4 had the highest richness and diversity, according to Hill’s number. The canonical correspondence analysis showed that the substrate, and the complexity and width of the river channel, had a significant influence on fish composition and distribution. The fish community richness and diversity did not change temporarily, but did spatially, which could be related to the different structural features of sampling sites. Rev. Biol. Trop. 66(1): 336-351. Epub 2018 March 01. <![CDATA[Space-time transformations of vegetation coverage in Corcovado National Park, 1960-2014]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442018000100352&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Resumen Los estudios a nivel regional que evalúan las dinámicas espacio-temporales de la vegetación en Costa Rica, especialmente, dentro de los Parques Nacionales son escasos. Así, considerando aportar en este vacío de conocimiento, este artículo analiza la distribución espacio-temporal de la vegetación dentro del periodo 1960-1976, 1992, 1997 y 2012 en Parque Nacional Corcovado, localizado en la Península de Osa y catalogado como el bosque tropical lluvioso más septentrional en la costa pacífica de América. Además, esta área contiene una riqueza de biodiversidad, fundamentada en su antigüedad geológica, el aislamiento que presentó durante largos periodos; así como las condiciones climáticas particulares que generan ecosistemas únicos como bosques nubosos relacionados con brisa marina a alturas de más de 500 msnm. Este estudio evalúa la distribución espacial de la vegetación a partir de mapas resultantes del proceso de fotointerpretación de imágenes del 1960, 1976, 1997 y 2012, así como del análisis del índice de paisaje. Se concluye que las transformaciones espacio-temporales de la vegetación durante el periodo de estudio han sido mínimas, y el hecho de que hayan sido escasas las áreas impactadas por la actividad antrópica, generó una restauración ecológica importante durante las últimas décadas. Se encontró una relación de expansión y contracción entre el bosque nuboso y bosque, así como este último y el bosque inundado, en función de la recuperación de la cobertura boscosa dentro del Parque Nacional y de la Península de Osa, y el volumen y distribución de la precipitación. Asimismo, este estudio propone la necesidad de establecer el monitoreo permanente de la vegetación para esclarecer las relaciones que se establecen entre estos tipos de vegetación.<hr/>Abstract Regional studies evaluating spatial-temporal transformations of vegetation in Costa Rica, especially within National Parks, are scarce. Therefore, this paper analyses the vegetation distribution during 1960, 1976, 1997 and 2014 in Corcovado National Park. This protected area is located in the Osa Peninsula, Costa Rica, and represents the Northern most tropical rain forest on the Pacific coast of America. This area offers a great wealth of biodiversity due to its geological formation, isolation for long time periods, and its particular climatic conditions that generate unique ecosystems such as cloud forests associated with ocean situated close to hill breezes located over 500 masl, as well as dense tropical forest. This study evaluates the spatial distribution of vegetation based on maps that resulted from the process of photo-interpretation of 1960, 1976, 1997 and 2012, as well as from the landscape index analysis. It concludes that during the study period, the vegetation changes have been minimal. Instead, in the few areas impacted by human activity (small-scale agriculture and pasture lands) an ecological restoration has occurred during recent decades. In addition, this research suggests that the recovering forest cover within the park and even within the Osa Peninsula has been expanding the cloud forest. An increase and contraction relationship between the different categories (Cloud forest and forests as well of flooded forest and forest in flat zones) was found. Furthermore, this study suggests the need of permanent plots in order to monitor vegetation and identify the factors that explain this previous process. Rev. Biol. Trop. 66(1): 352-367. Epub 2018 March 01. <![CDATA[Detection, ultrastructure and phylogeny of <em>Sclerorhabditis neotropicalis</em> (Nematoda: Rhabditidae) nematodes associated with the <em>Azteca</em> ant-<em>Cecropia</em> tree symbiosis]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442018000100368&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Abstract The nematodes involved in ant-plant symbioses have been poorly studied, creating an area of research that is now receiving increasing attention. One example is Sclerorhabditis neotropicalis that inhabit the nests of Azteca ants in Cecropia trees. The goal of the present study is to increase our knowledge about these organisms and their possible symbiotic relationship with the ants and their host plant. The samples were collected during 2011-2013 in different locations in Costa Rica: Parque Nacional Carara (Puntarenas province), San Pedro de Montes de Oca and Highway 27 (San Jose) and La Selva Biological Station (Sarapiquí, Heredia). We examined 576 internodes from 23 plants, comprising four species of Cecropia (including one non-myrmecophyte) and five Azteca species. S. neotropicalis was found in all but one of the Azteca/Cecropia combinations examined. Queen and worker ants were placed in water in order to dislodge nematodes and the results were largely positive, suggesting that alate queens carry S. neotropicalis between trees and that workers carry them between internodes. In addition to transport, preliminary observations suggest that the ants provide masses of scraped parenchyma (possibly fertilized with feces) as a substrate for bacteria upon which the nematodes presumably feed. We also found S. neotropicalis associated with Azteca in another myrmecophyte, Cordia alliodora, suggesting that this ant/nematode association is not restricted to Cecropia. SEM photographs of S. neotropicalis were provided to supplement the original description of this species, and molecular phylogenetic analyses employing three different markers suggest that Sclerorhabditis forms a well-supported clade of bacteria-feeding nematodes associated with Azteca. Indirect evidence suggests that this is a mutualistic association, but the benefits to the ants remain unknown. Rev. Biol. Trop. 66(1): 368-380. Epub 2018 March 01.<hr/>Resumen Cecropia. Los nemátodos asociados a la simbiosis entre plantas y hormigas han sido poco estudiados, creando un área de investigación que está recibiendo cada vez más atención. Un ejemplo de esto es Sclerorhabditis neotropicalis, que habita en los nidos de las hormigas Azteca asociadas a árboles de Cecropia. El objetivo de este trabajo es incrementar el conocimiento sobre esta especie de nemátodo y su relación con Azteca-Cecropia. Las muestras fueron recolectadas durante 2011-2013 en diferentes localidades de Costa Rica: Parque Nacional Carara (Puntarenas), San Pedro de Montes de Oca y Ruta 27 (San José) y la Estación Biológica La Selva (Sarapiquí, Heredia). Se examinaron 576 entrenudos de 23 plantas, comprendiendo cuatro especies de Cecropia (incluyendo una especie no mirmecófita) y cinco especies de Azteca. Se encontraron individuos de S. neotropicalis en todas las combinaciones de Azteca/Cecropia examinadas. Las hormigas reinas y trabajadoras fueron colocadas en agua para observar los nematodos y los resultados fueron en gran medida positivos, lo cual sugiere que las reinas aladas transportan S. neotropicalis hacia nuevos árboles y que las trabajadoras los transportan entre los entrenudos. Además del transporte, las observaciones preliminares insinúan que las hormigas proporcionan una masa de parénquima raspado (posiblemente fertilizado con heces) como sustrato para bacterias que luego servirán de alimento a los nematodos. Adicionalmente, encontramos S. neotropicalis asociado con Azteca en otro tipo de árbol, Cordia alliodora, sugiriendo que esta asociación de hormigas/nematodos no se limita a Cecropia. Las fotografías de microscopía electrónica de S. neotropicalis obtenidas en este trabajo complementan la descripción original de esta especie. Por otra parte, los análisis filogenéticos moleculares sugieren que Sclerorhabditis forma un clado bien definido de nematodos bacteriófagos asociados con Azteca. La evidencia indirecta apunta a que se trata de una asociación mutualista, pero los beneficios para las hormigas siguen siendo desconocidos. <![CDATA[Genetic tracing of farmed shrimp (Decapoda: Penaeidae) in wild populations from a main aquaculture region in Mexico]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442018000100381&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Abstract Release or escapes of aquaculture organisms may impact the genetic composition and variability of wild populations, leading to diverse issues that may compromise long-term wild stock fitness. Therefore, it is relevant to determine if farmed stocks are currently interacting with wild populations. Shrimp farming is an aquaculture activity taking place along the tropical Pacific coast of the Americas, and represents the most important culture business of Northwestern Mexico. In this study, wild and farmed whiteleg shrimp Litopenaeus vannamei from the State of Sinaloa were genetically evaluated to determine admixture levels. A newly developed set of 14 microsatellite markers (mean number of alleles per locus 11.8, and 0.836 expected heterozygosity) was obtained by Next Generation Sequencing to characterize samples. Sampling consisted of 32 wild shrimps collected during three years (2002, 2012, and 2013) and three different sites, and two hatchery stocks from 2007. No significant differences were observed among years in the wild samples, but cluster analyses showed that hatchery-produced individuals were different from wild specimens. Deviations from Hardy-Weinberg Equilibrium and genotype assignment tests indicated that a fraction from each sample could contain individuals from hatchery origin. Even though the estimated fraction of escaped farmed individuals in the most recent samples (2012-2013; mean = 7.1 %) is considered of low genetic risk, management recommendations for hatcheries and farms were provided. Besides, the reasons that explain the intended and unintended farmed shrimp release into the wild were discussed. Rev. Biol. Trop. 66(1): 381-393. Epub 2018 March 01.<hr/>Resumen La liberación o escape de lotes de cultivo pueden impactar la composición y variabilidad genética de las poblaciones silvestres, dando lugar a diversos problemas que pueden comprometer la eficacia biológica a largo plazo. Por lo tanto, es relevante determinar si las poblaciones de cultivo se encuentran actualmente interactuando con las poblaciones silvestres. El cultivo de camarón es una actividad de acuicultura que tiene lugar a lo largo de la costa del Pacífico tropical de América, y es la más importante en el noroeste de México. En este estudio, el camarón blanco Litopenaeus vannameisilvestre y de cultivo proveniente del Estado de Sinaloa, México, fueron evaluados genéticamente para determinar los niveles de mezcla. Se desarrolló un lote de 14 marcadores microsatélites nuevos (número de alelos promedio por locus de 11.8 y heterocigosidad esperada promedio de 0.836), mediante secuenciación de nueva generación, para la caracterización de las muestras. El muestreo consistió en camarón silvestre recolectado durante tres años (2002, 2012 y 2013) y dos lotes de unidades productoras de larva del 2007. No se observaron diferencias significativas entre años en las muestras silvestres, pero el análisis de agrupamiento indicó que los lotes de las unidades productoras de larva fueron distintos a los ejemplares silvestres. Desviaciones del equilibrio de Hardy-Weinberg y los análisis de asignación de genotipos indicaron que una fracción de cada una de las muestras silvestres podría contener individuos originados del larvicultivo. Se discuten las razones que explican la liberación de camarón de cultivo intencional y no intencional al medio silvestre. Aun cuando la fracción estimada de individuos de origen de cultivo en las muestras silvestres más recientes (2012-2013; promedio = 7.1 %) se considera de bajo riesgo, se dan recomendaciones de manejo para unidades de larvicultura y granjas de cultivo. <![CDATA[Modern coffee agroecosystems and their relationship with butterflies conservation in fragmented landscapes]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442018000100394&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Resumen El cambio de uso del suelo por la intensificación de la agricultura contribuye a la fragmentación de los bosques tropicales y la pérdida de la biodiversidad. En este sentido, a diferencia de los sistemas agroforestales (SAF) tradicionales, los SAF modernos son considerados de poca importancia para la conservación de la biodiversidad de los fragmentos de bosque. Sin embargo, existe una tendencia al establecimiento de SAF modernos. Debido a la sensibilidad a los cambios ambientales, se evaluó la diversidad de mariposas en SAF modernos de Coffea arabica y Erythrina poeppigiana (CP) y en combinación con Musa spp. (CPM) o Cordia alliodora (la única especie nativa de los SAF) (CPL), además de fragmentos de bosque muy húmedo premontano (FR) en el Corredor Biológico Volcánica Central-Talamanca, Costa Rica. En seis sitios representativos de cada sistema se establecieron tres transectos paralelos de 80 m cada uno y distanciados a 25 m entre los mismos. Cada cafetal y fragmento de bosque fue muestreado durante 1.5 horas en total para el registro de mariposas. Durante tres fechas de muestreo, se obtuvo un esfuerzo de muestreo de 4.5 horas/sitio y 27 horas en cada SAF y en FR. CP y CPM juntos tuvieron una composición de especies de mariposas diferente a la de CPL y FR. CP y CPM juntos resultaron con las especies de áreas abiertas Hermeuptychia hermes y Anartia jatrophae como indicadoras. CPL resultó con las especies de bosques secundarios Heliconus erato petiverana y Pareuptychia ocirrhoe como indicadoras. Por el contrario, FR resultó con diversas especies indicadoras típicas de bosques continuos tales como Pierella helvina incanescens, Caligo eurilochus y Morpho peleides limpida. Además, la riqueza de especies en FR fue mayor en relación a los SAF. Sin embargo, entre los SAF, CPL resultó con la mayor diversidad (Exp(H’)) de especies de áreas cerradas que CP. Así mismo, CPM tuvo una mayor abundancia de mariposas frugívoras que CP y CPL. En bosques fragmentados, los cafetales con sombras exóticas pueden ser mejores hábitats para mariposas de bosques si se combinan con árboles nativos y/o frutales.<hr/>Abstract Land use change by the intensification of agriculture contributes to tropical forest fragmentation and biodiversity loss. In this sense, in comparison with traditional agroforestry systems (AFS), modern AFS are considered irrelevant for the conservation of biodiversity of tropical forest fragments. However, there is an increasing trend toward the establishment of different types of modern AFS. Owing to the sensitivity to environmental changes, we evaluated the biodiversity of butterflies in AFS with Coffea arabica and Erythrina poeppigiana (CP), and intermixed with Musa spp. (CPM) or Cordia alliodora (the only native species of AFS) (CPL), as well as premontane very humid forest fragments in the Volcánica Central-Talamanca Biological Corridor, Costa Rica. In six representative sites of each system we set up three parallel 80 m line-transects, separated by a distance of 25 m. Each coffee farm and forest fragment (FR) was surveyed during 1.5 hours to record butterflies. All sites were sampled once a month from May to July 2007. We obtained 4.5 hours of sampling/site, and 27 hours of sampling/habitat. Both CP and CPM together had a butterflies’ species composition which differed from CPL and FR. The indicator species of both CP and CPM together were Hermeuptychia hermes and Anartia jatrophae which are typical of open areas. CPL resulted with the species of secondary forests Heliconius erato petiverana and Pareuptychia ocirrhoe as indicators. In contrast, FR resulted with several indicator species typical of closed canopy forests such as Pierella helvina incanescens, Caligo eurilochus, and Morpho peleides limpida. Moreover, the richness of species was similar among coffee AFS. Furthermore, the richness of species of each coffee AFS was lower in comparison with FR. However, among coffee AFS, CPL harbored higher diversity (Exp(H’)) of forest butterflies than CP. Also, CPM was higher in abundance of frugivorous butterflies in relation with CP and CPL. In fragmented forests, coffee farms with exotic shade species combined at least with a native tree or fruit species, can be a better habitat for forest butterflies than those dominated by an exotic monospecific shade. Rev. Biol. Trop. 66(1): 394-402. Epub 2018 March 01. <![CDATA[Population fluctuation of <em>Schistocerca piceifrons piceifrons</em> (Orthoptera: Acrididae) in the Yucatán Península and its relation with the environmental conditions]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442018000100403&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Abstract The Central American Locust Schistocerca piceifrons piceifrons is one of the most damaging plant pest in Mexico and Central America. The present work was carried out to evaluate the seasonal population fluctuation of S. p. piceifrons and vegetation diversity and their association with weather factors and edaphic conditions in the gregarious zone of the Yucatán Península. The study was performed in seven sites during three seasons: North-wind (December 2013), rainy (June 2014) and dry (April 2014). The locust density was sampled in transect of 100 m2, as well as the vegetation in 16 m2: plant species richness (PSR) and relative species density (RSD), and analyzed by generalized linear models. Additionally, soil samples were obtained at 10 cm depth into a 4 × 6 m quadrat, land use in the sites was classified and temperature, precipitation and evaporation of each site were obtained from the database and they were analyzed with multiple factor analysis. The population density of S. p. piceifrons was higher in the sites Panaba, Tizimin, Tunkas and Cenotillo (F= 74.3, P &lt; 0.0001). Characterization of vegetation showed that PSR and RSD were higher during the rainy season relative to those in the dry season (F= 50.4, P &lt; 0.0001). RSD was identified as the most important group associated with locust density (0.86), followed by isotherm/isohyets (0.63), maximum precipitation and temperature (0.60), as well as the land use (0.65); no correlation between locust density and soil characteristics was found. Locust density was positively correlated with the abundance of the grass Panicum maximum (Sr2= 0.85, PC5= 0.87). This work shows that the population of S. p. piceifrons is high in the rainy season and influenced primarily by the abundance of the grass P. maximum and the precipitation. The results indicate that surveys for early detection and control of the locust on the Yucatán Península can focus on areas with the grass P. maximum to predict risk areas and target survey efforts. Rev. Biol. Trop. 66(1): 403-414. Epub 2018 March 01.<hr/>Resumen La langosta Centroamericana Schistocerca piceifrons piceifrons es una de las plagas más dañinas en México y Centroamérica. El presente trabajo se realizó para evaluar la fluctuación estacional de poblaciones de S. p. piceifrons y su asociación con la diversidad de vegetación, factores climáticos y edáficos en la zona gregarígena de la Península de Yucatán. Se seleccionaron siete sitios y se muestrearon a lo largo de tres estaciones: nortes (diciembre 2013), lluvias (junio 2014) y sequías (abril 2014). La densidad poblacional de la langosta fue muestreada en transectos de 100 m2, así como la vegetación en 16 m2 obteniendo la riqueza de especies vegetales (REV) y la densidad relativa de especies (DRE), y fueron analizadas por modelos lineales generalizados. Adicionalmente se obtuvieron muestras de suelo de 10 cm de profundidad en un área de 4 × 6 m, se clasificó el uso del suelo de cada sitio y se obtuvieron en una base de datos las condiciones de temperatura, precipitación y evaporación para cada sitio, estos datos se analizaron con análisis de factores múltiples. La densidad poblacional de S. p. piceifrons fue mayor en los sitios de Panaba, Tizimin, Tunkas y Cenotillo (F= 74.3, P &lt; 0.0001). La caracterización de la vegetación mostró que la REV y la DRE fueron mayores en la estación de lluvias que en la de sequías (F= 50.4, P &lt; 0.0001). La DRE fue el grupo más importante asociado a la densidad de la langosta (0.86), seguido por las isotermas/isoyetas (0.63) y la precipitación-temperatura máxima (0.60), así como el uso del suelo (0.65); no hubo correlación con las características del suelo. La densidad de la langosta fue correlacionada positivamente con la abundancia del pasto Panicum maximum (Sr2= 0.85, PC5= 0.87). El estudio mostró que las poblaciones de S. p. piceifrons fueron mayores en la estación lluviosa e influenciadas principalmente por la abundancia del pasto P. maximum y la precipitación. Los resultados indican que las exploraciones, la detección temprana y el control de la langosta en la Península de Yucatán puede enfocarse sobre áreas cultivadas con P. maximum para predecir áreas con riesgo y eficientar los recursos. <![CDATA[Comparative reservoir limnology in Juramento (Salta) and Salí-Dulce (Tucumán) Basins in Argentina]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442018000100415&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Abstract The reservoirs of the upper Juramento basin (Cabra Corral and El Tunal) and the Salí-Dulce basin (El Cadillal, Río Hondo, and Escaba) show certain peculiarities due to their geographical location, basin morphology and limnological features. Such peculiarities were compared during significant algal bloom periods between 2002 and 2008, by analyzing the main physicochemical parameters and ecological attributes of the phytoplankton assemblages using standard methods. Tucumán reservoirs were different in most variables showing higher values of conductivity, nutrients and algal biomass. Regarding the hydrological cycle, El Cadillal exhibited the lowest biomass average (2.74 mg Chl.m-3) during maximum water flows, whereas the Cabra Corral lacustrine zone exhibited the highest biomass average (63.36 mg Chl.m-3) during minimum water flows. For the same period, the Cabra Corral lacustrine zone exhibited lower phytoplankton diversity and richness (1.37 and 9, respectively), in accordance with dinophyte blooms of Ceratium sp. In all reservoirs, the following biological variables showed a significant contrast in the hydrological cycle: highest phytoplankton biomass during minimum water flows (35.68 mg Chl-a m-3) vs. waterfloods (13.68 mg Chl-a m-3) (T = 3.42, P = 0.001). During minimum water flows, richness (14.30 sp.) and equitability (0.51) were lower vs. waterfloods (20.23, 0.59, respectively) (T = 2.36; P = 0.0196), as a result of the allochthonous nutrients provided by the main tributaries. Management of the reservoirs’ hydrometric levels during dry season determines the deterioration of the water quality with increased algal blooms. In order to ensure the systems’ sustainability, eutrophication must be controlled with programs to reduce diffuse nutrient loads and to treat residential and agroindustrial effluents, particularly in Sali-Dulce basin. Rev. Biol. Trop. 66(1): 415-427. Epub 2018 March 01.<hr/>Resumen Los embalses de la Alta Cuenca del Juramento (Cabra Corral y El Tunal) y del Salí-Dulce (El Cadillal, Río Hondo y Escaba) por su ubicación geográfica, morfología y características limnológicas muestran ciertas peculiaridades que son comparadas en el período relevante de proliferaciones algales acaecidas entre 2002 y 2008, mediante análisis de los principales parámetros fisicoquímicos y atributos ecológicos de los ensambles del fitoplancton por empleo de técnicas estandarizadas. Los embalses de Tucumán se diferenciaron en la mayoría de las variables con valores más elevados de conductividad, nutrientes y biomasa de algas. En función del ciclo hidrológico, El Cadillal en aguas altas presentó el promedio más bajo de biomasa (2.74 mg Cl.m-3) y en contraste Cabra Corral el más elevado (63.36 mgCl.m-3) durante los caudales mínimos de agua. En éste último, en el mismo período, también la diversidad y riqueza de especies del fitoplancton fueron menores (1.37 y 9 respectivamente), en concordancia con las proliferaciones de dinófitos (Ceratium sp.). Las siguientes variables biológicas en el conjunto de embalses presentaron un contraste significativo en el ciclo hidrológico: biomasa del fitoplancton más elevada en estiaje (35.68 mg Cl a. m-3) versus crecidas (13.68 mg Cl a. m-3) (T = 3.42; P = 0.001). En estiaje, la riqueza (14.30 sp) y equitatividad (0.51) fueron menores versus crecidas (20.23, 0.59, respectivamente) (T = 2.36; P = 0.0196), debido al aporte alóctono de nutrientes por los tributarios principales. El manejo de los niveles hidrométricos de los embalses durante el estiaje determina el deterioro de la calidad de sus aguas con incremento de proliferaciones algales. Para asegurar la sustentabilidad de los sistemas, es indispensable el control de la eutrofización mediante programas de reducción de cargas difusas de nutrientes y tratamiento de efluentes domiciliarios y agroindustriales, particularmente en la cuenca del Sali-Dulce. <![CDATA[Detection of <em>Borrelia burgdorferi sensu lato</em> in dogs and its ticks in rural communities of Yucatán, Mexico]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442018000100428&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Resumen Actualmente, el estudio de la borreliosis canina adquiere mayor relevancia, ya que el perro es considerado como un importante centinela del complejo Borrelia burgdorferi sensu lato, el cual podría desempeñar un papel clave en la dispersión de garrapatas de las áreas selváticas al ambiente doméstico. En México, la distribución y presencia de genoespecies patógenas de B. burgdorferi en perros y sus garrapatas aún no ha sido investigada. Por tal motivo, la presente investigación tiene como objetivo detectar y estimar la prevalencia de B burgdorferi s.l. en perros y sus garrapatas en dos comunidades rurales de Yucatán, México. En cada comunidad se visitaron 50 viviendas donde se estudiaron 144 muestras de sangre de perros por punción de la vena safena, así como la colecta de sus garrapatas. Se colectaron un total de 846 garrapatas de las especies Ixodes affinis (33 / 846), Rhipicephalus sanguineus sensu lato (786 / 846) y Amblyomma mixtum (27 / 846). Para detectar la presencia de B. burgdorferi s.l. en dichas muestras, se amplificó el gen conservado flaB y las lipoproteínas de membrana externa, ospC y p66, mediante el uso de la reacción en cadena de la polimerasa. La prevalencia obtenida en sangre de perros fue de 17.3 % (25 / 144) para flaB, 12.50 % (18 / 144) para el gen p66 y 1.38 % (2 / 144) para el gen ospC. De las garrapatas analizadas, R. sanguineus s.l. tuvo una prevalencia de infección de 0.89 %, A. mixtum de 5.88 % e I. affinis de 15.15 %, siendo esta última especie la que presentó mayor prevalencia. Dos perros y sus garrapatas I. affinis fueron positivos al gen flaB. Solamente una garrapata R. sanguineus s.l. fue positiva al gen p66 y ninguna especie de garrapata fue positiva al gen ospC. Este estudio confirma la existencia de B. burgdorferi s.l. en perros y sus garrapatas en comunidades rurales de Yucatán, México. La detección de Borrelia en perros podría ser un criterio importante para la evaluación del riesgo de borreliosis en humanos, ya que el perro puede emplearse como indicador epidemiológico para la identificación de nuevos focos de esta enfermedad.<hr/>Abstract In Mexico, the distribution and the presence of pathogenic genospecies of B. burgdorferi in dogs and their ticks has not been extensively investigated. The study of canine borreliosis is acquiring greater relevance, since the dog is considered to be an important sentinel for pathogens pertaining to the complex Borrelia burgdorferi sensu lato; in addition, dogs could be playing a key role in the spread of ticks from forested areas into the domestic environment. This study aimed to detect and estimate the prevalence of B. burgdorferi s.l. in dogs and their ticks in two rural communities of Yucatán, Mexico. In each community, 50 houses were visited, where 144 blood samples from dogs were studied by puncture of the saphenous vein, as well as the collection of their ticks. To detect the presence of B. burgdorferi s.l. in these samples, the conserved gene flaB, p66 and ospC were PCR amplified. A total of 144 dog blood samples, and 846 of ticks were obtained from the examined animals. Considering tick species, Rhipicephalus sanguineus sensu lato (786 / 846) was common, while Ixodes affinis (33 / 846), and Amblyomma mixtum (27 / 846) resulted less frequent. As per gene conservation, the prevalence of B. burgdorferi in canine blood was 17.3 % (25 / 144) to flaB, 12.50 % (18 / 144) for p66 and 1.38 % (2 / 144) for the ospC gene. Within the analyzed ticks, R. sanguineus s.l. had a prevalence of 0.89 %, A. mixtum 5.88 % and I. affinis 15.15 %, being this last species the one that presented higher prevalence. Two dogs and their ticks I. affinis were positive to the flaB gene. Only a tick R. sanguineus s.l. was positive to the gene p66 and no tick species was positive the ospC gene. This study confirmed the existence of B. burgdorferi s.l. in dogs and their ticks in rural communities of Yucatán, Mexico. The detection of Borrelia in dogs may be an important criterion for the evaluation of the risk of borreliosis in humans, since the dog can be used as an epidemiological indicator for the identification of new outbreaks of this disease. Rev. Biol. Trop. 66(1): 428-437. Epub 2018 March 01. <![CDATA[Fish diversity, distribution and their relationship with environmental variables in Southern Gulf of Mexico]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442018000100438&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Resumen La sonda de Campeche posee gran diversidad de especies, heterogeneidad de hábitats y fuerte incidencia de las industrias petrolera y pesquera. El objetivo de este trabajo fue obtener la distribución espacial de la ictiofauna y su relación con elementos del ambiente, así como implementar una línea base que sirva como referente para futuras contingencias que puedan ocasionar estas industrias. Se empleó una base de datos obtenida en 2010, con 54 localidades en la Sonda de Campeche que fueron muestreadas mediante arrastres camaroneros. Se colectaron 2 502 438 kg de material biológico y 33 315 peces de 2 clases (Chondrichthyes y Actinopterygii) con un total de 193 especies. De ellas, 17 fueron dominantes, asociadas a fondos arenosos y lodosos, aunque también hubo especies de ambientes estuarinos, de arrecife y de hábitos pelágicos. La diversidad (H’) promedio fue de 3.2 bits/individuos. Las familias más comunes fueron los Perciformes (84 species), Pleuronectiformes (23), Scorpaeniformes (15) and Tetraodontiformes (14); las riquezas de especies más altas fueron: Sciaenidae (15 especies), Paralichthyidae (12), Carangidae (10), y Triglidae y Synodontidae (7). Los géneros más comunes fueron: Prionotus (6 especies), Citharichthys and Sphoeroides (4 cada uno). Por cada localidad, la riqueza fluctuó entre 3 y 6 especies con un promedio de 46 kg. La composición de especies fue diferente entre hábitats y áreas. La ordenación comunitaria presenta una concordancia al identificar espacialmente cada zona. El análisis paisajístico define nódulos de alta densidad y diversidad que corresponden con áreas de desembocaduras de ríos, lagunas y de zonas arrecifales. De las relaciones entre las variables y los descriptores comunitarios, sólo el Carbono Orgánico fue significativo, tanto para la abundancia como para la biomasa, el REDOX para la riqueza de especies y las otras variables no fueron importantes.<hr/>Abstract: The Campeche Sound has a high heterogeneity of habitats, great fish species diversity, and a strong presence of oil and fishing industries. Our objective was to obtain updated information on a complete local fish species spatial distribution and their relationship with environmental elements, this will improve the baseline to evaluate the potential impact of future oil and fishing developments. For this, our approach used a database obtained in 2010, with a capture made in 54 sites with standard shrimp fishing trawls in the Campeche Sound. We collected a total of 33 315 fish, of 80 families, 138 genera and 193 species, that corresponded to 2 502 438 kg. The fish classes Chondrichthyes and Actinopterygii predominated. A total of 17 were dominant, associated to sandy and muddy bottoms, although were species of estuarine environments, reef and pelagic habitats. Averaged diversity (H’) was of 3.2 bits/individuals. In decreasing diversity order, the common fish belong to Perciformes (84 species), Pleuronectiformes (23), Scorpaeniformes (15) and Tetraodontiformes (14); in the same way, the higher richness families were Sciaenidae (15 species), Paralichthyidae (12), Carangidae (10), and Triglidae and Synodontidae (7). Most common genuses were Prionotus (6 species), Citharichthys and Sphoeroides (4 each). Per each station, richness varied between 3 and 56 species, with an average weight of 46 kg. Fish assemblage composition was different among habitats and areas, with divergent management strategies. Landscape analysis defines nodules of high density and diversity that corresponded to river mouths, lagoons and reef areas fish assemblages. Of the relation between variables and community descriptors, only the organic carbon was significant for both abundance and biomass, the REDOX for the species richness and the other variables were not important. Rev. Biol. Trop. 66(1): 438-456. Epub 2018 March 01. <![CDATA[The effect of macroinvertebrate exclusion on leaf breakdown rates in two upland Colombian streams]]> http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77442018000100457&lng=pt&nrm=iso&tlng=pt Abstract Macroinvertebrate shredders have been widely recognized as an important functional feeding group that contributes to leaf decomposition in temperate streams, but little is known about their role in upland Neotropical streams. In this study, we investigated the effect of macroinvertebrate exclusion on leaf breakdown rates in two upland streams in Colombia. The study was carried out between January and April of 2009, including the dry season and the beginning of the wet season. We measured leaf mass loss using coarse- (15 mm; accessible to macroinvertebrates) and fine- (200 µm; macroinvertebrates excluded) mesh litter bags that were anchored with wood stakes to the bottom of each stream and recovered after 7, 14, 21, 28, and 56 days. We selected leaves from two dominant plant species and used three leaf treatments: two single species (Palicourea cuatrecasasii and Critoniopsis ursicola) and mixed-species (P. cuatrecasasii and C. ursicola). We compared leaf breakdown rates between the Peña Bonita and Marianela stream, mesh-sizes, and leaf treatments. Macroinvertebrates that colonized the litter bags were measured for density and biomass and categorized in functional feeding groups. In general, there were no significant differences in breakdown rates between the streams and the mesh-sizes. In contrast, leaf breakdown rates had significant differences between all leaf species, where C. ursicola had higher breakdown rates than mixed-species, and P. cuatrecasasii. Macroinvertebrate exclusion did not affect leaf breakdown rates and their assemblages were composed by high densities of collectors (mainly Chironomidae) and few shredders with a large body size. The similar macroinvertebrate colonization between leaf species, the relatively slow breakdown rates, and the shredder scarcity, suggest that leaves were a refractory substrate. Further studies should include leaf species with different nutritional qualities and larger spatial-temporal scales to test the hypothesis of shredder presence and its role on leaf decomposition in upland Colombian streams. Rev. Biol. Trop. 66(1): 457-467. Epub 2018 March 01.<hr/>Resumen Los macroinvertebrados fragmentadores han sido ampliamente reconocidos como un importante grupo funcional alimenticio que contribuye a la descomposición de la hojarasca en quebradas del hemisferio norte, pero poco se sabe sobre su papel en quebradas de montaña neotropicales. En el presente estudio investigamos el efecto de la exclusión de los macroinvertebrados sobre las tasas de fragmentación de la hojarasca en dos quebradas de montaña en Colombia. Nuestra hipótesis es que la fragmentación de la hojarasca es mediada principalmente por macroinvertebrados fragmentadores en quebradas de montaña en Colombia. Este estudio fue llevado a cabo entre enero y abril 2009, incluyendo la época seca y el comienzo de la época de lluvias. Se midieron las pérdidas de masa de hojarasca usando bolsas de malla gruesa (15 mm; accesible a macroinvertebrados) y fina (200 µm; macroinvertebrados excluidos); estas fueron atadas con estacas de madera al fondo de cada quebrada y recuperadas transcurridos 7, 14, 21, 28 y 56 días. Se seleccionó hojarasca de dos especies dominantes en los sitios de estudio y se usaron tres tratamientos para las bolsas de hojarasca: Critoniopsis ursicola, Palicourea cuatrecasasii y una mezcla de estas dos especies. Se compararon las tasas de fragmentación de la hojarasca entre las dos quebradas, los dos tipos de malla y las especies de hojarasca. Los macroinvertebrados que colonizaron las bolsas de hojarasca fueron medidos en términos de densidad, biomasa y categorizados en grupos funcionales alimenticios. En general, nuestros resultados no mostraron diferencias significativas en las tasas de fragmentación de la hojarasca entre las quebradas y entre los tipos de malla. En contraste, las tasas de fragmentación presentaron diferencias significativas entre las especies de hojarasca; específicamente, C. ursicola tuvo tasas más altas de fragmentación que las especies mezcladas y que P. cuatrecasasii. Con respecto a los macroinvertebrados, el presente estudio encontró que su exclusión no tuvo un efecto sobre las tasas de fragmentación y los ensamblajes estuvieron compuestos por una alta densidad de recolectores (principalmente de la familia Chironomidae) y pocos fragmentadores con gran tamaño corporal. La colonización similar de macroinvertebrados entre las especies de hojarasca, las relativamente lentas tasas de fragmentación, sugieren que las hojas fueron un sustrato refractario. Futuros estudios deberían incluir especies de hojarasca con diferentes calidades nutricionales y una mayor escala espacio-temporal para estudiar la hipótesis de la presencia de fragmentadores en quebradas de montaña en Colombia.