Revista de Biología Tropical

Spatio-temporal variation of the ichthyofauna in Xel-Ha, Mexican Caribbean Marine Park and its relationship to physico-chemical parameters

Resumen:Xel-Há es un parque ecoturístico marino donde no se permite ningún tipo de extracción de flora o fauna. Una de las principales atracciones turísticas en este parque son los peces de arrecife, no existiendo trabajos publicados sobre la comunidad íctica para este sitio. En este estudio se analizó la variación espacio-temporal de la comunidad íctica en diferentes zonas del parque marino Xel-Há. Para ello, se realizaron censos visuales durante un año en 21 transectos fijos de 100x5 m, distribuidos en cinco zonas del parque: “Bocana”, “Centro”, “Brazo Norte”, “Cueva” y “Río”, que incluyen la bocana del mar, canales de manglares y un sitio con aportes de agua dulce. Para caracterizar la comunidad de peces, se estimaron los descriptores ecológicos: riqueza de especies, diversidad, abundancia y densidad a partir del promedio de los censos y se compararon entre zonas y tres temporadas (lluvias, “nortes” y secas). El grado de similitud entre zonas y temporadas se evaluó mediante un análisis de escalamiento multidimensional no métrico. El reemplazo en la composición de especies entre temporadas fue determinado con la presencia-ausencia de peces. Además, se aplicó un análisis de componentes principales para evaluar si las variables fisicoquímicas como temperatura, salinidad y concentración de oxígeno disuelto influyen en la variación de las comunidades de peces. Se registró un total de 22 641 individuos que correspondieron a 63 especies, siendo “nortes”, la temporada donde se presentó la mayor abundancia (7 991 organismos). Las especies mejor representadas basados en su abundancia total y frecuencia de aparición fueron: Haemulon sciurus, H. flavolineatum, Lutjanus griseus, Acanthurus coeruleus, Abudefduf saxatilis y Gerres cinereus. La diversidad incrementó de lluvias a secas y comparando entre zonas la riqueza de especies y diversidad fue menor en “Río”. Entre temporadas, el 54 % de las especies fueron residentes durante todo el año; se observaron cuatro especies exclusivas para lluvias y tres para secas. La diversidad fue el único descriptor que permitió observar variación entre temporadas. El oxígeno disuelto fue la variable que más influyó en la variación de la comunidad de peces entre zonas. El parque Xel-Há, alberga cerca del 20 % de la biodiversidad de peces reportada para el Caribe mexicano y la predominancia de juveniles de varias especies confirma su importancia como sitio de crianza.

Abstract:Xel-Ha is a private marine park where the extraction of flora and fauna is not allowed. Here, reef fish are one of the main touristic attractions, but there are no published surveys focused on fish community in this site. In this study we analyzed the spatio-temporal variation of the fish community in different areas of the marine park Xel-Há. Abundance and richness were estimated during one-year period (2012-2013); visual censuses using fixed transects of 100x5 m each distributed in 21 transects along five sites were established in different zones: “Bocana”, “Center”, “North branch”, “Cave” and “River”, including the inlet mouth to the sea, brackish mangrove channels and a zone with freshwater influence. To characterize the fish community, we used species richness, abundance, diversity, and density compared among zones and climatic seasons (rain, “norths” and dry). The similarity among zones and seasons was estimated using a multidimensional scaling analysis. The replacement on the species composition among seasons and sites was realized based on the presence-absence of fish. The influence of physicochemical variables such as temperature, salinity and dissolve oxygen concentration in the fish community was estimated by a principal component analysis. A total of 22 641 individuals were recorded corresponding to sixty-three species over the year. Abundance was higher during the windy season (locally named “norths”) with 7 991 organisms. The most representative species according with abundance and frequency of occurrence were: Haemulon sciurus, H. flavolineatum, Lutjanus griseus, Acanthurus coeruleus, Abudefduf saxatilis, and Gerres cinereus. Diversity increased from the rainy to the dry season; species richness and diversity was lower in “River” than other sites in Xel-Ha. Most species (54 %) species were residents through the year. Four non-shared species were observed during the rainy season and three in dry season. Dissolved oxygen was the most influential variable on the fish community composition among zones. Xel-Ha houses nearly 20 % of fish biodiversity reported for the mexican Caribbean, and the predominance of juveniles of several species confirms its role as a nursery area. Rev. Biol. Trop. 64 (4): 1353-1367. Epub 2016 December 01.

Population structure and reproduction of a migratory fish Leporinus piau (Characiformes: Anostomidae) in a semiarid tropical reservoir, Brazil

Abstract:Migratory fishes have been seriously impacted by the building of reservoirs and because of the negative effects of these projects such as the interruption of migratory routes, reduction or elimination of spawning/ feeding areas, and initial development can influence the population structure the migratory fishes, resulting in reduction in abundance. Leporinus piau is migratory fish widely distributed in the watersheds of the Brazilian semiarid and it is of importance for artisanal and sport fishing. The goal of the study was to evaluate the population structure and reproductive dynamics of the migratory species Leporinus piau in the Pau dos Ferros Reservoir, which is located in the semiarid region of Brazil. The CPUE, length structure, length-weight relation-ship, length at first maturity, sex ratio, gonad development and IGS were analyzed. Collections were performed quarterly between February 2011 and November 2012 using gillnets. The captured fish were counted; the standard length (cm) and total weight (g) were measured, and dissected to determine the sex and gonad maturity stage. The rainfall and reservoir water levels were recorded, and their correlations with the reproductive period and CPUE were analyzed. A total 549 individuals were captured. The average CPUE varied between 0.0259 individuals/m2*h (May/2011) and 0.0008 individuals/m2*h (August/2012), and significant differences were observed; however, significant correlations were not observed between rainfall and reservoir levels. The standard length varied between 5.9 cm and 20.7 cm, and the weight varied between 4.16 g and 271.5 g. A histogram analysis revealed that the 5-10 cm standard length class was the most abundant for juveniles and that the 10-15 cm class was the most abundant for adult females and males. The weight-length relationship was best fit by the equation log10Wt = -1.57711 + 3.00707 Log10 Ls, and the species presented isometric growth. The estimated length at first maturity was 12.76 cm. A total of 148 males and 82 females were collected (1.81:1, M:F), and these values were significantly different. The highest GSI was observed in February 2011 for both females (10.69) and males (5.72), and the GSI was significantly and positively correlated with rainfall. We concluded that the L. piau population is established in the reservoir and found that its reproduction period occurred during the rainy season between February and May. Rev. Biol. Trop. 64 (4): 1369-1381. Epub 2016 December 01.

Resumen:Los peces migratorios se han visto gravemente afectados por la construcción de embalses y los efectos negativos de estos proyectos, tales como la interrupción de rutas migratorias, reducción o eliminación de desove / áreas de alimentación. El desarrollo inicial puede influir en la estructura de la población de los peces migratorios, lo que resulta en la reducción en la abundancia de los mismos. El Leporinus piau es un pez migratorio que se encuentra ampliamente distribuido en las cuencas del semiárido brasileño y es de importancia para la pesca deportiva y artesanal. El objetivo del estudio fue evaluar la estructura de la población y la dinámica de reproducción de la especie migratoria Leporinus piau en el embalse Pau dos Ferros, región semiárida de Brasil. La relación estructura de tallas y talla-peso de la CPU la talla de la primera la madurez, proporción de sexos, el desarrollo gonadal y el IGS se analizaron. Con redes de enmalle se llevaron a cabo recolecciones trimestralmente entre febrero 2011 y noviembre 2012. Se contaron los peces capturados; se midieron la longitud estándar (cm) y peso total (g), y se disectaron para determinar el estadio del sexo y la madurez de las gónadas. Los niveles de agua de lluvia y los embalses se registraron y se analizaron sus correlaciones con el período reproductivo y la CPUE. Un total de 549 individuos fueron capturados. La CPUE promedio varió entre 0.0259 individuos/m2 * h (mayo/ 2011) y 0.0008 individuos/m2 * h (Agosto/2012), y se observaron diferencias significativas; sin embargo, ninguna correlación significativa se observo entre los niveles de lluvia y el nivel de la represa. La longitud estándar varió entre 5.9 y 20.7 cm, y el peso entre 4.16 y 271.5 g. Un análisis de histogramas, reveló que la clase estándar de 5-10 cm de longitud fue la más abundante de los jóvenes y que la clase 10-15 cm fue la más abundante de las hembras y machos adultos. La relación peso-talla se ajusta más adecuadamente a la ecuación log10Wt = -1.57711 + 3.00707 Log10 Ls, donde la especie presenta un crecimiento isométrico. La medida estimada de la primera madurez fue 12.76 cm. Se recogieron un total de 148 machos y 82 hembras (1.81: 1, M: F), y estos valores fueron significativamente diferentes. El más alto GSI se observó en febrero 2011, tanto para las mujeres (10.69) como para hombres (5.72), y el GSI fue significativa y positivamente correlacionado con la precipitación. Se llegó a la conclusión de que la población L. piau está establecida en la represa y encontramos que su periodo de reproducción se produjo durante la época de lluvias entre febrero y mayo.

Effect of a major highway on the spatial and temporal variation in the structure and diversity of the avifauna of a tropical premontane rain forest

Abstract:Roads immersed in conservation areas will increase in number, size, and traffic over the next decade, and thus, understanding their effects on forest-dependent wildlife is crucial for improving current management practices and reducing the negative impacts of roads on sensitive species. We examined the influence of route 32 (a.k.a. Guápiles Highway) on temporal and spatial changes in the structure of the avifauna of Braulio Carrillo National Park, Costa Rica, a site crossed by this road along 25 km. The highway connects the capital city of San José with the Harbor of Limón in the Caribbean Sea (142 km). Although the road is narrow (12 m in width and comprised by two lanes along most of the route) it services over 1.5 million motor vehicles per year, 12 % are heavy trucks and trailers. We expected the highway to divide the avifauna, and thus to observe significant differences in species structure on opposite sides of the road. We described changes in bird diversity between wet and dry seasons at Las Palmas and Ceibo trails located on opposite sides of the highway (14 point counts per trail), and evaluated how abundance and diversity varied with road distance. Censuses took place during wet and dry seasons from 2002 to 2005. We listed 245 species and 6 035 observations during the 4-yr survey. Rare species dominated the avifauna (65 % of species < 5 observations), and species overlap between trails was high (Sorensen= 71 %; Morisita= 0.96). Species accumulation curves varied little among trails, yielding 190 species. Resident species represented 70 % of observations, followed by elevational (15 %) and long-distance migrants (1-2 %). Understory species were the most abundant (60 %) followed by canopy birds (30 %). Species turnover rate was 55 % between seasons, but species composition between trails remained homogeneous. Overall, birds were avoiding the road (abundance increased away from the road) although other diversity parameters (richness, dominance, Shannon index, and equitability) were not influenced by road proximity. Although the avifauna remained homogeneous on both sides of the road, which did not support the fragmentation hypothesis, the highway reduced the abundance and diversity of specialized understory insectivores associated with primary forests near the road. This highway will expand outside the National Park (from 2 to 4 lanes along 107 km from Río Frío to Limón) in the next years, which will increase traffic volume and road impacts within the Park. Roads are increasing across highly diverse tropical areas justifying the need for management practices based on the identification of sensitive groups. Rev. Biol. Trop. 64 (4): 1383-1399. Epub 2016 December 01.

Resumen:Las carreteras inmersas en áreas de conservación van a aumentar en número, tamaño, y volumen de tráfico en la próxima década, por lo que comprender los efectos de las mismas sobre la fauna dependiente de bosque es crucial para mejorar las prácticas de manejo y reducir los impactos negativos de los caminos sobre las especies más frágiles. Examinamos la influencia de la ruta 32 (conocida como la carretera a Guápiles) sobre los cambios temporales y espaciales en la estructura de la avifauna del Parque Nacional Braulio Carrillo, Costa Rica, el cual es atravesado por esta carretera a lo largo de 25 km. La carretera conecta la ciudad capital de San José con el puerto de Limón en el Caribe (142 km). Aunque la calle es estrecha (12 m de ancho en dos carriles en la mayor parte de la ruta) da servicio a más de 1.5 millones de vehículos por año, 12 % de los cuales es transporte pesado. Esperábamos que la carretera fragmentara a la avifauna, y por lo tanto que hubieran diferencias significativas en la estructura de las especies en lados opuestos de la ruta. Describimos los cambios en la diversidad de aves entre las estaciones secas y húmedas en los senderos Las Palmas y Ceibo situados en lados opuestos de la carretera (14 puntos de conteo por sendero), y evaluamos cómo la abundancia y la diversidad variaron con la distancia hacia la carretera. Los censos se realizaron durante las estaciones húmedas y secas desde el 2002 al 2005. Encontramos 245 especies y 6 035 observaciones durante el período de 4 años. Las especies raras dominaron la avifauna (65 % de las especies < 5 observaciones), y mostraron un alto traslape entre senderos (Sorensen= 71 %; Morisita= 0.96). Las curvas de acumulación de especies variaron poco entre senderos, generando 190 especies. Las especies residentes representaron el 70 % de las observaciones, seguidas migrantes de elevación (15 %) y especies migratorias latitudinales (1-2 %). Las especies de sotobos que fueron las más abundantes (60 %), seguidas por las aves de dosel (30 %). La tasa de recambio de especies fue del 55 % entre estaciones, pero la composición de especies entre senderos permaneció homogénea. El patrón general consistió en que las aves evitaron la carretera (la abundancia aumentó lejos de la carretera), aunque otros parámetros de diversidad (riqueza, dominancia, el índice de Shannon y la equidad) no fueron influenciados por la proximidad de la calle. Si bien los resultados no apoyaron la hipótesis de la fragmentación, la carretera redujo la abundancia y diversidad de insectívoros especializados de sotobosque asociados a bosque primario. Esta carretera se expandirá fuera del Parque Nacional (de 2 a 4 carriles a lo largo de 107 km de Río Frío a Limón) en los próximos años, lo que aumentará el impacto del volumen de tráfico dentro del parque. Las carreteras cercanas a zonas protegidas están aumentando en los trópicos, por lo que es crucial desarrollar alternativas de manejo basadas en la respuesta de los grupos sensibles a estos impactos.

The geographic distribution of Costa Rican velvet worms (Onychophora: Peripatidae)

Abstract:Velvet worms, “peripatus” or onychophorans, are “living fossils” that were geographically widespread in Cambrian seas but now occur exclusively on terrestrial habitats. The only extant species studied in some detail are those from Costa Rica, but their real geographic distribution was in urgent need of revision. To solve this problem we visited the localities mentioned in all the original taxonomic descriptions and redescriptions. These visits covered a 25 year period (1988-2014) and included interviews with local residents. We also examined all Costa Rican collections, and checked the information in old maps and books. Here we critically review geographic data, correct errors, assign neotype localities, report on the survival of populations after heavy volcanic eruptions or urbanization, and present the correct geographical distribution for the seven currently described Costa Rican species. Rev. Biol. Trop. 64 (4): 1401-1414. Epub 2016 December 01.

Resumen:Los gusanos aterciopelados, también llamados onicóforos o peripatos son “fósiles vivientes” de amplia distribución en los mares cámbricos pero que actualmente sólo viven en hábitats terrestres. Las únicas especies estudiadas en algún detalle son las de Costa Rica, pero su distribución geográfica real necesitaba una revisión urgente. Para resolver este problema visitamos las localidades mencionadas en las descripciones taxonómicas originales y en las redescripciones. Estas visitas cubren un periodo de 25 años (1988-2014) e incluyen entrevistas a residentes. También examinamos todas las colecciones costarricenses (INBio, UNA y UCR); la información recopilada en mapas y libros viejos en las bibliotecas universitarias, y consultamos a expertos. Aquí revisamos críticamente la información geográfica, corregimos errores, designamos localidades de neotipo, y ubicamos poblaciones sobrevivientes después de fuertes erupciones volcánicas y procesos de urbanización de sus hábitats naturales, ofreciendo a futuros investigadores la distribución correcta geográfica de las siete especies de onicóforos descritas en Costa Rica.

Population ecology of Heteromys pictus (Rodentia: Heteromyidae), in a tropical deciduous forest with human disturbance, in Oaxaca coast, Mexico.

Resumen:Los ratones espinosos de abazones Liomys y Heteromys son roedores granívoros que se distribuyen en bosques tropicales secos y en matorral espinoso a lo largo de tierras bajas del Pacífico y en regiones xerófilas en la meseta de México. Analizamos la dinámica poblacional del ratón espinoso de abazones Heteromys pictus en la costa de Oaxaca, México, en dos sitios de bosque tropical caducifolio con diferente grado de perturbación humana: ZPP = zona poco perturbada, y ZMP = zona con mayor perturbación. Se establecieron dos cuadros en cada área con 66 estaciones de trampeo; se utilizó el método de captura-recaptura durante 12 periodos de muestreo. La densidad poblacional se estimó utilizando el método del Número Mínimo de Individuos Conocidos Vivos (NMIV). Se capturaron 706 individuos, 290 para la ZPP y 416 para la ZMP. La densidad poblacional fluctuó entre 28 y 142 ind./ha para ambas zonas; sin embargo esta fue mayor para la ZMP (54 a 142 ind./ha). La densidad poblacional de ambas zonas aumentó durante la temporada de lluvia y coincidió con el mayor reclutamiento. Se registró actividad reproductiva a lo largo de todo el estudio en ambas zonas, pero fue mayor para la ZMP. La proporción de sexos fue de 1:1 en la ZPP, mientras que en la ZMP fue de 1: 0.75. En la ZMP encontramos una mayor densidad poblacional y actividad reproductiva en las hembras. Estos resultados sugieren que H. pictus prefiere la ZMP, lo que indica que en este lugar la especie no es afectada significativamente por la perturbación humana.

Abstract:Spiny pocket mice Liomys and Heteromys are forest-dwelling granivorous rodents distributed in seasonally dry forest or thorn scrub along the Pacific low- lands or xeric regions in the Mexican Plateau. We analyzed the population dynamics of the spiny pocket mouse Heteromys pictus, in the coast of Oaxaca, Mexico, in two sites of tropical deciduous forest with different degrees of disturbance: ZPP = less disturbed site, and ZMP = more disturbed site. Two plots were established in each area with 66 trap stations; we used the capture-recapture method and trapping for 12 periods for one year. Population density was estimated using the method of Minimum Number of Individuals Known Alive (MNKA). We captured 706 individuals, 290 for the ZPP and 416 for the ZMP. The population density ranged from 28 to 142 ind./ ha for both zones, but it was higher for the ZMP (54 against 142 ind./ha). The population density for both areas increased during the rainy season and coincided with the increased recruitment of adults. Reproductive activity occurred throughout the study period in both areas, but it was higher for the ZMP. The sex ratio in the ZPP was 1:1 while in the ZMP was 1:0.75. In the ZMP we found a higher population density and reproductive activity in females, compared to the ZPP. These results suggest that H. pictus prefers the ZMP, indicating that the species is not significantly affected by human disturbance in the studied location. Rev. Biol. Trop. 64 (4): 1415-1429. Epub 2016 December 01.

In vitro antioxidant activity and qualitative phytochemical analysis of two Vismia (Hypericaceae) species collected in Los Andes, Venezuela

Abstract:Vismia genus is distributed mainly in tropical and subtropical regions of Central, South America and some areas of Africa. According to previous investigations, antioxidant potential of Vismia species might be related to anthrones, anthraquinones, flavonoids and phenol derivatives biosynthesized by these plants. In this investigation, phytochemical screening of Vismia baccifera (VB) from Mérida-Venezuela and Vismia macrophylla (VM) from Táchira-Venezuela methanolic extracts, carried out using various chemical assays, revealed an abundant presence of anthraquinones in both species analyzed. Glycosides were also present while flavones and dehydroflavones were observed abundantly in VB but moderated in VM. Triterpenes were also detected and steroids showed to be abundant in VM but moderate in VB. On the other hand, antioxidant capacity measured by the DPPH assay showed that VM possesses a stronger antioxidant activity than VB with IC50 5.50 µg mL-1. Phenol and flavonoid assays carried out by Folin-Ciocalteu and colorimetric test also revealed that methanol extracts of both species contain high concentrations of these metabolites. A relationship between the antioxidant activity, total phenol and flavonoids content of the extracts analyzed was demonstrated in this investigation since those samples with higher phenolic concentrations showed likewise higher antioxidant activity. Rev. Biol. Trop. 64 (4): 1431-1439. Epub 2016 December 01.

Resumen:El género Vismia esta distribuido principalmente en las regiones tropicales y subtropicales de Centro, Sur América y algunas zonas de África. De acuerdo a reportes previos, el potencial antioxidante de las especies de Vismia puede estar relacionado con antronas, antraquinonas, flavonoides y derivados fenólicos biosintetizados por estas plantas. En la presente investigación, el tamizaje fitoquímico de los extractos metanólicos de Vismia baccifera (VB) de Mérida-Venezuela y Vismia macrophylla (VM) de Táchira-Venezuela realizado con diferentes ensayos químicos reveló abundante presencia de antraquinonas en ambas especies analizadas. Glucósidos también estuvieron presentes mientras que flavonas y dehidroflavonas fueron observados abundantemente en VB pero con presencia moderada en VM. Triterpenos y esteroides también fueron detectados mostrando ser abundantes en VM y moderados en VB. Por otro lado, la actividad antioxidante determinada por el método DPPH reveló que VM posee actividad antioxidante más fuerte que VB con un IC50 de 5.50 µg mL-1. El ensayo del contenido de fenoles y flavonoides realizado con los métodos de Folin-Ciocalteu y test colorimétrico también demostró que los extractos metanólicos de ambas especies contienen altas concentraciones de estos metabolitos. En este estudio se observó una relación entre la actividad antioxidante, el contenido de fenoles y de flavonoides en los extractos analizados ya que las muestras que presentaron concentraciones más altas de fenoles y flavonoides también mostraron una mayor actividad antioxidante.

Does Plan B work? Home range estimations from stored on board and transmitted data sets produced by GPS-telemetry in the Colombian Amazon

Abstract:Telemetry based on Global Positioning Systems (GPS) makes possible to gather large quantities of information in a very fine scale and work with species that were impossible to study in the past. When working with GPS telemetry, the option of storing data on board could be more desirable than the sole satellite transmitted data, due to the increase in the amount of locations available for analysis. Nonetheless, the uncertainty in the retrieving of the collar unit makes satellite-transmitted technologies something to take into account. Therefore, differences between store-on-board (SoB) and satellite-transmitted (IT) data sets need to be considered. Differences between SoB and IT data collected from two lowland tapirs (Tapirus terrestris), were explored by means of the calculation of home range areas by three different methods: the Minimum Convex Polygon (MCP), the Fixed Kernel Density Estimator (KDE) and the Brownian Bridges (BB). Results showed that SoB and IT data sets for the same individual were similar, with fix ranging from 63 % to 85 % respectively, and 16 m to 17 m horizontal errors. Depending on the total number of locations available for each individual, the home ranges estimated showed differences between 2.7 % and 79.3 %, for the 50 % probability contour and between 9.9 % and 61.8 % for the 95 % probability contour. These differences imply variations in the spatial coincidence of the estimated home ranges. We concluded that the use of IT data is not a good option for the estimation of home range areas if the collar settings have not been designed specifically for this use. Nonetheless, geographical representations of the IT based estimators could be of great help to identify areas of use, besides its assistance to locate the collar for its retrieval at the end of the field season and as a proximate backup when collars disappear. Rev. Biol. Trop. 64 (4): 1441-1450. Epub 2016 December 01.

Resumen:La telemetría basada en los sistemas de geopocisionamiento global (GPS) hace posible recopilar gran cantidad de información a escalas muy finas, y trabajar con especies imposibles de estudiar en el pasado. Al trabajar con telemetría de GPS, la opción de guardar información en la memoria interna del instrumento puede ser más deseable que sólo tener acceso a la información enviada vía satélite, debido a la mayor cantidad de localizaciones disponibles para analizar. No obstante, la incertidumbre de recuperar el collar hace que las tecnología de trasmisión vía satélite deba ser tenida en cuenta. Diferencias entre las bases de datos almacenadas en el collar (SoB) y las trasmitidas vía satélite (IT), recolectadas de dos individuos de Tapir de tierras bajas (Tapirus terrestris), son consideradas, en términos de las áreas de los rangos de hogar calculados con cada uno y mediante el uso de tres metodologías diferentes: Mínimo Polígono Convexo (MCP), Estimador de Densidad de Kernel Fijo (KDE) y los Puentes Brownianos (BB). Las bases de datos SoB e IT son similares, con tasas de acierto de localizaciones que oscilan entre 63 % to 85 % y errores horizontales de 16 m y 17 m respectivamente. Dependiendo del número total de localizaciones disponibles para cada individuo, los rangos de hogar estimados muestran diferencias entre 2.7 % y 79.3 %, para el contorno del 50 % de probabilidades, y entre 9.9 % y 61.8 % para el contorno del 95 % de probabilidades. Estas diferencias implican variaciones en la coincidencia espacial de los rangos de hogar estimados. Concluimos que el uso de la información trasmitida vía satélite no es una buena opción para la estimación de rangos de hogar, si la programción de los collares no ha sido diseñada específicamente para tal fin. Sin embargo, las representaciones geográficas de los estimados a partir de las bases de datos IT pueden ser de gran ayuda para la identificación de áreas de uso, además de su utilidad para la localización y recuperación de collares tras su liberación de los individuos monitoreados y como una base de datos de soporte en caso de pérdida del collar.

The jaguar Panthera onca (Carnivora: Felidae) in “El Cielo” Biosphere Reserve, Tamaulipas, Mexico.

Resumen:Existe poca información acerca de la ecología del jaguar (Panthera onca) para la Reserva de la Biosfera El Cielo, en el Estado de Tamaulipas, México. Los trabajos con los que se cuenta se limitan a experiencias anecdóticas y pocas publicaciones. Los objetivos de la presente investigación fueron: a) determinar la estructura y densidad poblacional del jaguar, b) analizar sus patrones de actividad y su traslape temporal con el puma (Puma concolor), c) determinar las abundancias de presas potenciales, y d) evaluar los daños por depredación en animales domésticos en el Municipio de Gómez Farías. Entre abril 2013 y abril 2014 se colocaron cámaras trampa con un esfuerzo de muestreo de 8 580 días cámaras trampa. Adicionalmente, se aplicaron 136 encuestas semi-estructuradas entre residentes de las comunidades del municipio de Gómez Farías y Llera con el objeto de recabar información sobre daños en animales domésticos por ataques de jaguar y otros carnívoros silvestres. Se identificaron ocho individuos de jaguar; cuatro hembras adultas, una hembra juvenil, dos machos adultos y un macho juvenil. La densidad estimada fue de 5.9 ± 1.3 ind/100 km². Con respecto a los patrones de actividad del jaguar y el puma, se encontró que existe un traslape en el que ambas especies mostraron un comportamiento nocturno-crepuscular. Las especies presa más abundantes fueron: Crax rubra, Cuniculus paca, Mazama temama, Odocoileus virginianus y Didelphis virginiana, mientras que las menos abundantes fueron Mephitis macroura y Procyon lotor. Los resultados de las encuestas mostraron que después de las aves de corral, los perros, los gatos y los cerdos fueron los animales de traspatio más depredados por los jaguares (n = 107). Este estudio representa el primer esfuerzo que aporta información sobre la ecología de la especie para la reserva, sin embargo, es evidente que se necesita incrementar el monitorio para determinar la situación actual de la población, generando estrategias adecuadas para su conservación. Finalmente, consideramos que la Reserva de la Biosfera “El Cielo” representa una unidad ecológicamente importante para las poblaciones de jaguares de la Sierra Madre Oriental, por la Vertiente del Golfo de México, ya que puede funcionar como un corredor biológico entre las poblaciones de San Luis Potosí y Nuevo León, México.

Abstract:Information on the ecology of jaguars (Panthera onca) in “El Cielo” Biosphere Reserve in Tamaulipas, Mexico is scant and limited to anecdotic records in a handful of publications. The objectives of our study were to: a) determine population density and structure of jaguars, b) compare their activity patterns with that of pumas (Puma concolor), c) ascertain potential prey relative abundance, and d) evaluate local resident’s perception on loss of domestic animals due to jaguar predation. Between April 2013 and April 2014 we conducted camera trapping in Gomez Farias Township with a total sampling effort of 8 580 camera trap days. Besides, we completed 136 semi-structured interviews among local residents of Gomez Farias and Llera Townships to gather information on domestic animal losses attributed to jaguars and other carnivores. We identified eight different jaguar individuals during a complete year of camera-trapping, composed of four adult females, one juvenile female, two adult males and one juvenile male. We estimated a jaguar density of 5.9 ± 1.3 jaguars/100 km². Activity patterns for jaguars and pumas were similar as both were nocturnal and crepuscular in nature. The most abundant potential prey species for jaguars in the study site were Crax rubra, Cuniculus paca, Mazama temama, Odocoileus virginianus and Didelphis virginiana; while the rarest were Mephitis macroura and Procyon lotor. Interview results suggested that chickens, dogs, and house cats were the most consumed domestic animals from all reported losses by local residents (n= 107). This study represents the first attempt to describe jaguar ecology in “El Cielo” Biosphere Reserve; however, there is a need of additional monitoring efforts to determine the current status of jaguars in a larger area in order to establish conservation strategies. Finally, this jaguar population may have an important role in maintaining the species in the Sierra Madre Oriental biological corridor connecting populations in Nuevo Leon and San Luis states in Northeastern Mexico. Rev. Biol. Trop. 64 (4): 1451-1468. Epub 2016 December 01.

Diversity and biogeographic affinities of sharks, rays and chimaeras (Chondrichthyes: Elasmobranchii, Holocephali) of Mexico.

Resumen:A pesar de la gran importancia ecológica, evolutiva y económica de los condrictios, su diversidad ha sido escasamente estudiada en México. En este estudio se describe la diversidad de especies de condrictios que se han registrado hasta el momento para México, la cual se compone de 214 especies (111 tiburones, 95 rayas y 8 quimeras) y representa el 17.3 % de las registradas a nivel mundial. Las familias con mayor diversidad de especies son Rajidae (14.5 %), Carcharhinidae (12.1 %), Pentanchidae, Triakidae y Urotrygonidae (5.1 %). En términos de su distribución geográfica, la diversidad del litoral del Pacífico mexicano contiene el 56.1 % del total de aquellas que habitan en las aguas marinas y salobres de México (120 spp., 62 géneros, 37 familias y 14 órdenes); porcentaje muy similar a las que habitan en el litoral del Atlántico con el 55.1 % de las especies (118 especies, 59 géneros, 35 familias y 13 órdenes). Las afinidades biogeográficas de la fauna de condrictios mexicanos son complejas, pues 19.7 % de las especies son circunglobales, 9.9 % trasatlánticas, 1.9 % transpacíficas y 9.4 % son endémicas de la zona económica exclusiva. Además, el 36.6 % de las especies son endémicas del Pacífico oriental, presentan mayor afinidad a la provincia de Cortés (27.7 %), seguida de la de California (20.7 %), Panamá (19.3 %), Galápagos (5.6 %) y Peruano-Chilena (8.9 %). Así mismo, el 33.3 % de las especies son endémicas del Atlántico occidental donde tienen mayor afinidad con la provincia Caribeña (31.9 %), seguido por la Caroliniana (24.4 %) y Brasileña (6.6 %).

Abstract:The diversity of chondrychthyans in Mexico is described. The fauna is composed by 214 species (111 sharks, 95 rays and 8 chimaeras) and represents 17.3 % of the total number of species recorded worldwide. The families with the highest diversity comprise: Rajidae (14.5 %), Carcharhinidae (12.1 %), Pentanchidae, Triakidae, and Urotrygonidae (5.1 %). In terms of geographical distribution, the diversity on the Mexican Pacific slope reaches up to 56.1 % of those species inhabiting Mexican marine and brackish waters (120 species, 62 genera, 37 families and 14 orders); the diversity in the Atlantic slope resulted similar to that on the Mexican Pacific with 55.1 % of the species (118 species, 59 genera, 35 families and 13 orders). The biogeographical affinities of the Mexican chondrychthyan fauna are complex with 19.7 % of the species being circumglobal, 9.9 % transatlantic, 1.9 % transpacific, and 9.4 % endemic to the exclusive economic zone. Additionally, 36.6 % of the species recorded so far are endemic to the Eastern Pacific coast where the species are similar to those found in the Cortez biogeographic province (27.7 %), followed by the Californian (20.7 %), Panamanian (19.3 %), Galapagos (5.6 %) and Peruvian-Chilean (8.9 %). Likewise, 33.3 % are endemic of the Atlantic coast, where species are similar to those found in the Caribbean province (31.9 %), followed by the Carolinean (24.4 %) and the Brazilian (6.6 %). Rev. Biol. Trop. 64 (4): 1469-1486. Epub 2016 December 01.

Updating the larval habitats of Aedes aegypti (Diptera: Culicidae) in Camagüey, Cuba.

Resumen:Actualmente varias enfermedades de origen vectorial tienen una gran relevancia médico-veterinaria, debido a las adaptaciones que han desarrollado las especies involucradas en su transmisión. Se llevó a cabo una encuesta entomológica durante 2013 con el objetivo de actualizar los conocimientos ecológicos de las poblaciones de Aedes aegypti presentes en tres Áreas de Salud de Camagüey, Cuba. Se cuantificó en cada depósito o receptáculo positivo las larvas y pupas según ubicación en las viviendas, determinando el porcentaje de representatividad. Se calculó el Índice Pupal por Depósitos específicos (ÍPDe). Los totales de viviendas así como los depósito permanentes y útiles positivos fueron comparados entre estaciones climáticas, utilizando la prueba no paramétrica de Chi2 en tablas de contingencia de 2 X 2, mientras que la relación existente entre el total de viviendas positivas y los depósitos positivos permanentes y útiles, fue explorada a través del test de proporciones de hipótesis, con un nivel de significación de P ≤ 0.05. A. aegypti colonizó 73 tipos de depósitos siendo permanentes y útiles el 23.2 %. Este número incluyó el 76 % de los depósitos positivos. Hubo mayor colecta en el exterior en tanques bajos y toneles con importante producción pupal (ÍPDe = 3.04 y 1.75, respectivamente), así como diferencias significativas durante la estación lluviosa al comparar el número de viviendas positivas (PUIA: Chi2 = 32.89; P = 0.00; PUE: Chi2 = 127.44; P = 0.00 and PUJAM: Chi2 = 127.44; P = 0.00), y depósitos permanentes y útiles (PUIA: Chi2 = 30.37; P = 0.00; PUE: Chi2 = 37.26; P = 0.00 and PUJAM: Chi2 = 81.82; P = 0.00). Estos datos refuerzan la prioridad que tienen en las acciones de vigilancia y control, por la comunidad en sus respectivas viviendas.

Abstract:Several illnesses of vectorial origin have a great medical and veterinary relevance, due to the adaptations developed by the species involved in their transmission. To support preventive programs with updated ecological information of A. aegypti populations, an entomological survey was carried out in three Health Areas of Camagüey, Cuba, during low and high rain seasons of 2013. For this, we assessed the type and number of positive containers, quantified larvae and pupae in positive containers, according to the container location in or outside the house. Both the container representativeness percentage and the pupal index by specific containers were calculated (PIsC). The total of houses as well as the positive habitual-use and non-disposable containers were compared among weather seasons, using the non parametric Chi2 test. The existent relationship between the total of positive houses and the habitual-use and non-disposable container was explored through the test of proportions hypothesis, with a level of significance of P ≤ 0.05. A. aegypti colonized 73 different types of containers, being habitual-use and non-disposable a 23.2 %. This number included 76 % of the positive containers. The greatest larvae collections were obtained in exterior water tanks and barrels, with important pupal production (PIsC = 3.04 and 1.75, respectively), and as well as significant differences towards the rainy season respect to positive houses (PUIA: Chi2 = 32.89; P = 0.00; PUE: Chi2 = 127.44; P = 0.00 and PUJAM: Chi2 = 127.44; P = 0.00), and the habitual-use and non-disposable container (PUIA: Chi2 = 30.37; P = 0.00; PUE: Chi2 = 37.26; P = 0.00 and PUJAM: Chi2 = 81.82; P = 0.00). These data reinforce the priority given to the control and surveillance actions conducted by the community in their respective houses. Rev. Biol. Trop. 64 (4): 1487-1493. Epub 2016 December 01.

Population size and behavior pattern of Grus canadensis (Aves: Gruidae) in two localities of Cuba.

Resumen:La disponibilidad de información sobre abundancia de especies en el Neotrópico es insuficiente. Esto impide la realización de análisis precisos y definición de estrategias de conservación adecuadas para especies endémicas y amenazadas. A través de un censo simultáneo durante dos días consecutivos en 24 estaciones de conteo en Isla de la Juventud (IJ) y 32 estaciones en Ciego de Ávila (CA), Cuba, se obtuvo el tamaño poblacional de la subespecie endémica y amenazada Grus canadensis nesiotes durante 2008-2010. Se analizó la abundancia y patrón conductual (método instantáneo) por hábitat, para ayudar a entender cómo las grullas modifican su patrón conductual cuando el hábitat natural se modifica. Los bandos de grullas tuvieron tres individuos en IJ y entre 1.9 ± 1.5 y 2.8 ± 1.5 en CA.El tamaño poblacional en IJ fue de 164 individuos y en CA fueron 137, 141 y 168 individuos para 2008-2010. La eficacia del conteo fue alta (IJ: 91 %; CA: 81-87 %) y la concordancia numérica fue intermedia (IJ: 45.4 %; CA: 72 %). La abundancia fue mayor en sabanas naturales (83), seguido de marismas (59), pinares (23) y pastizales (7) en IJ. En CA los herbazales de ciénaga albergaron la mayor abundancia en los tres años (130; 120; 112), seguido del herbazal con palmas (2; 17; 51) y los pastizales (5; 4; 5). Las grullas se alimentaron más en los pastizales y estuvieron más alerta en la sabana natural y el herbazal de ciénaga. La frecuencia de las conductas alimentación y alerta fueron diferentes entre las combinaciones sabana natural/marisma y sabana natural/pastizal en IJ. Para CA las diferencias fueron entre herbazal/herbazal con palmas. El tamaño poblacional aumentó en CA por estrategias de manejo adoptadas, pero en IJ puede afectarse por la pérdida de hábitat asociado a la invasión de plantas exóticas. Se propone como estrategia de manejo a largo plazo el mantenimiento de las quemas controladas en herbazales de ciénaga bajo régimen de protección para contribuir al aumento poblacional.

Abstract:The availability of information on species abundance in the Neotropic is insufficient, and this prevents the execution of precise analysis and the definition of adequate conservation strategies for endemic and threatened species. This study aimed to analyze the population size of the endemic and threatened subspecies Grus canadensis nesiotes. For this, a simultaneous census was undertaken in 24 count stations in Isla de la Juventud (IJ) and 32 stations in Ciego de Ávila (CA), Cuba, during two consecutive days between 2008 and 2010. Abundance and behavior pattern (instantaneous method) were analyzed by habitat type, to help understand how cranes modify their behavioral pattern when the natural habitat is changed. Flocks in IJ had three individuals, and between 1.9 ± 1.5 and 2.8 ± 1.5 in CA. Population size in IJ was 164 individuals, and in CA of 137, 141 and 168 individuals for the 2008-2010 period, respectively. The counting efficacy was high (IJ: 91 %; CA: 81-87 %) and the numerical concordance was intermediate (IJ: 45.4 %; CA: 72 %). When comparing the habitat type, the abundance was higher in natural savannahs (83), followed by coastal flats (59), pines (23) and cattle pastures (7) in IJ; while in CA, marsh grasslands hosted the greatest abundance for the three years period (130; 120; 112), followed by grassland with palms (2; 17; 51) and cattle pastures (5; 4; 5). The cranes were fed more in cattle pastures and were more alert in natural savannas and marsh grasslands. The frequency of feeding and alert behaviors was different from the natural savannah/coastal flats and natural savannah/cattle pastures combinations in IJ. For CA, differences were found between marsh grasslands and marsh grasslands with palms. The population size increased by management strategies adopted in CA; nevertheless, might be affected by habitat loss associated with invasive alien plants in IJ. We propose the maintenance of prescribed fire in marsh grasslands under protection regime, as a strategy for long-term management to contribute with population growth. Rev. Biol. Trop. 64 (4): 1495-1504. Epub 2016 December 01.

Molecular diagnosis and intraspecific genetic variability of root pathogens of arid legumes in Western Rajasthan, India

Abstract:The productivity of arid legumes, such as Clusterbean (Cyamopsis tetragonoloba), Cowpea (Vigna unguiculata), Moth bean (Vigna aconitifolia) and Horse gram (Macrotyloma uniflorum), may remain stagnant over decades because of their high susceptibility to root diseases. Besides, there is a limitation on the information about molecular diagnosis and intraspecific genetic variability of root pathogens in arid legumes. To contribute in this field, we assessed a total of 52 isolates from 88 root samples that were found infected with fungal pathogens in Jodhpur, Jaipur and Bikaner Districts of Rajasthan. Diseased roots samples were analyzed following standard microbiological methods for fungus extraction and purification, and for genetic studies. Irrespective of the geographical location from where the diseased samples were collected, all pathogen isolates were clustered in RAPD dendrograms as per their respective genera. Phylogram, based on multiple sequence alignment, revealed that different genera (i.e. Fusarium, Neocosmospora and Syncephalastrum), separated from each other, and species within the same genera, clustered together with their reference sequences with apreciable bootstrap values. Out of 20 representative isolates representing each cluster and all outgroups sequenced, eight were molecularly identified as Neocosmospora vasinfecta, five as Fusarium solani, two as Neocosmospora striata, two as Fusarium acutatum, one as Syncephalastrum monosporum, one as Fusarium oxysporum and one as Fusarium species. The root pathogens of the arid legumes were found neither restricted to a geographical location nor were host specific in nature. Fusarium solani wilt in cowpea and seedling rot in moth bean, F. oxysporum wilt in moth bean, F. acutatum damping off in cowpea and Clusterbean, Fusarium sp. seedling rot in Clusterbean, Neocosmospora striata root rot in cowpea and wilt in Clusterbean and Syncephalastrum monosporum root rot in Clusterbean were molecularly identified as new fungal records as pathogens causing root diseases in arid legumes. Rev. Biol. Trop. 64 (4): 1505-1518. Epub 2016 December 01.

Resumen:La producción de leguminosas resistentes a sequías como Cyamopsis tetragonoloba, Vigna unguiculata, Vigna aconitifolia y Macrotyloma uniflorum, puede permanecer inactiva durante décadas debido a su alta susceptibilidad a enfermedades en las raíces. Además, hay información limitada relacionada con el diagnóstico molecular y la variabilidad genética intraespecífica de patógenos de raíces en estas leguminosas resistentes a sequías. Para contribuir en esta área, evaluamos un total de 52 extractos de 88 raíces infectadas con patógenos fúngicos en los distritos de Jodhpur, Jaipur y Bikaner de Rajastán. Las muestras de raíces infectadas se analizaron siguiendo los métodos estándar de microbiología para extracción y purificación de hongos y para estudios genéticos. Independientemente del sitio donde se recolectaron las muestras contaminadas, todos los extractos patógenicos se agruparon en dendrogramas RAPD en cada uno de sus respectivos géneros. El filograma, basado en alineamiento de secuencias múltiples reveló que distintos géneros (Fusarium, Neocosmospora y Syncephalastrum) separados entre ellos y especies del mismo género se agrupan con sus secuencias de referencia con valores de bootstrap significativos. De cada 20 extractos representantes de cada agrupamiento y todos los grupos externos secuenciados, ocho fueron identificados molecularmente como Neocosmospora vasinfecta, dos como Fusarium acutatum, una como Syncephalastrum monosporum, una como Fusarium oxysporum y una como Fusarium. Los patógenos de estas leguminosas resistentes a sequías no están restringidos por la localidad ni por un hospedero específico. Fusarium solani que marchita el frijol de vaca y pudre la semilla de Vigna aconitifolia, F. oxysporum que marchita a Vigna aconitifolia, F. acutatum que marchita a Vigna unguiculata y Cyamopsis tetragonoloba, Fusarium sp. que pudre la semilla de Cyamopsis tetragonoloba, Neocosmospora striata que pudre la raíz de Vigna unguiculata y marchita a Cyamopsis tetragonoloba y, Syncephalastrum monosporum que pudre la raíz en Cyamopsis tetragonoloba, fueron identificados molecularmente como nuevos registros de patógenos fúngicos que causan daños en las raíces de leguminosas resistentes a sequías.

Profile of plasmatic progesterone on pregnancy, and the postpartum estrus of Dasyprocta prymnolopha (Rodentia: Dasyproctidae)

Abstract:The agouti (Dasyprocta sp.) is a hystricomorph rodent found in some regions of the Americas. It is an important cynegetic species, which indicates that the overhunting is a threat to their conservation. Very little is known about this wildlife in relation to what already has been studied in domestic animals. Thus, the knowledge on reproduction of wildlife becomes necessary and essential for the management and conservation of these natural resources. Specifically, studies regarding hormonal monitoring are important as a basic tool for research in modern reproductive biotechnology, and currently, there is no information on the progesterone changes during pregnancy of Dasyprocta sp., compared to other hystricomorphs. The aim of this study was to describe the profile of plasmatic progesterone during pregnancy, and report the restart of ovarian cycle in agouti after parturition. For this purpose, 18 black-rumped agoutis (Dasyprocta prymnolopha) born in captivity were used, and one or more consecutive pregnancies were observed. Copulation was confirmed by the presence of spermatozoa observed in the colpocytological examination. Blood samples were collected two times per week, and concentrations of progesterone, assessed in ten agoutis, were determined by radioimmunoassay. The onset of ovarian activity in six females was observed daily by colpocytological examination, starting on the seventh day postpartum. The gestational period observed in this study was 104.04 days (SD = 1.31) (101-106 days) (Number of cases, N = 26), and the interval between births was 126.03 days (SD = 18.40) (109-184 days). The plasmatic profile of progesterone during pregnancy showed a progressive increase from the 1st to the 5th week. The higher progesterone levels over this period (6.88 ng / mL, SD = 3.01) were detected in the 5th week. This value was similar (One-Way ANOVA, p > 0.05) to that observed in the 4th and 6th weeks, but was statistically different (One-Way ANOVA, p < 0.05) when compared to the other weeks. After the 6th week there was a progressive decrease in plasmatic progesterone levels. The animals showed a postpartum estrus of 12.04 days (SD= 4.29) (7-24 days) (N= 23). It was observed that 80.95 % (N= 19) of copulations during this period were fertile. This work contributed to understanding the dynamic changes in the progesterone levels during the pregnancy in agouti. Nevertheless, more studies are needed for a better appreciation of other endocrine and biological changes, in the mother and feto-placental unit of the agouti. Rev. Biol. Trop. 64 (4): 1519-1526. Epub 2016 December 01.

Resumen:El agouti (Dasyprocta sp.) es un roedor histricomorfo encontrado en algunas regiones de América. Es una especie cinegética importante, lo que indica que la caza excesiva es una amenaza para su conservación. Muy poco es lo que se conoce acerca de la biología de los animales silvestres, en relación al conocimiento acumulado sobre los domésticos. Por lo tanto, el estudio sobre la reproducción de los animales silvestres se hace necesario e imprescindible para el manejo y conservación de la especie como recurso natural. En concreto, los estudios relativos a la monitorización hormonal son una herramienta básica para la investigación en biotecnología reproductiva moderna. No hay información sobre los cambios de progesterona durante la preñez de Dasyprocta sp. en comparación con otros histricomorfos. El objetivo de este estudio fue describir el perfil de la progesterona plasmática durante la preñez, y reportar el reinicio del ciclo ovárico después del parto. Para ello, se utilizaron 18 agoutis de rabo negro (Dasyprocta prymnolopha) nacidos en cautiverio. Fueron estudiadas una o más preñeces consecutivas. La copulación fue confirmada por la presencia de espermatozoides observados en examen colpocitológico. Las muestras de sangre se recogieron dos veces por semana, y las concentraciones de progesterona se determinaron en 10 individuos mediante radioinmunoensayo. Se observó el inicio de la actividad ovárica diaria por examen colpocitológico, comenzando en el día séptimo posparto. El período gestacional observado en este estudio fue de 104.04 días (SD= 1.31, rango entre 101-106 días, N= 26), y el intervalo entre los nacimientos fue 126.03 días (SD= 18.40, rango entre 109-184 días). El perfil plasmático de la progesterona durante el embarazo mostró un aumento progresivo de la 1ª a la 5ª semana. Los mayores niveles de progesterona durante este período (6.88 ng / mL, SD= 3.01) se detectaron en la quinta semana. Este valor fue similar (ANOVA de um factor, p > 0.05) al observado en las semanas cuatro y seis, pero fue estadísticamente diferente (ANOVA de um factor, p<0.05) en comparación con las otras semanas. Después de la sexta semana hubo una disminución progresiva en los niveles plasmáticos de progesterona. Los animales mostraron un estro posparto de 12.04 días (SD= 4.29, rango entre 7-24 días, N= 23). Se observó que el 80.95 % (N= 19) de cópulas durante este período fueron fértiles. Este trabajo contribuyó a la comprensión de los cambios dinámicos en los niveles de progesterona durante la preñez del agouti. Sin embargo, se necesitan más estudios para una mejor comprensión de otros cambios biológicos y endocrinos, y en la unidad materna y feto-placentaria del agouti.

Seasonal behavior of Thalassia testudinum (Hydrocharitaceae) metabolites

Abstract:The marine angiosperm Thalassia testudinum, commonly known as turtle grass, is a dominant sea- grass that grows in the Caribbean Sea shelf associated to Syringodium filiforme. The hydroalcoholic extract of T. testudinum is rich in polyphenols; the most abundant metabolite in this extract is thalassiolin B, a glycosilated flavonoid with skin damage repairing properties, and antioxidant capacity among others. The present study aimed at generating information about the seasonal behavior of secondary metabolites, as well as to study the antioxidant capacity of the T. testudinum leaves extract, collected monthly during 2012 from the Northeast coastline of Havana, Cuba. For this study, spectrophotometric methods were used to determine the concentrations of polyphenols, flavonoids, anthocyanins, soluble carbohydrates and proteins, chlorophylls a and b, and antioxidant activity of the extracts. In general, results demonstrated seasonal variations of the analyzed parameters. Extracts prepared from the vegetal material collected in October and November showed the highest values of polyphenols (58.81 ± 1.53 and 52.39 ± 0.63 mg/g bs, respectivally) and flavonoids (44.12 ± 1.30 and 51.30 ± 0.67 mg/g dw, respectively). On the contrary, the lowest values of polyphenols were found in extracts of leaves collected in July and August (15.51 ± 0.84 and 13.86 ± 0.48 mg/g, respectively). In accordance with these results, the lower value of Inhibitory Concentration (IC50) was obtained to get a 50 % of maximal effect on free radical scavenging activity with the extracts prepared from leaves collected in October and November, and less significant IC50 was obtained from the extract prepared from leaves collected in August (5.63 mg/mL). A negative correlation (r= -0.694) was observed in this study between the content of polyphenols and the IC50 necessary to get the half of its antioxidant maximal effect. The high correspondence between the maximum values of polyphenols, flavonoids, carbohydrates and proteins in October and November, revealed a close relationship between these metabolites found in the extract of T. testudinum. Our hypothesis about the annual variation in the concentration of these metabolites was validated; and these results will support the correct harvesting of T. testudinum leaves for biotechnology and industrial purposes. Rev. Biol. Trop. 64 (4): 1527-1535. Epub 2016 December 01.

Resumen:La angiosperma marina Thalassia testudinum, comúnmente conocida como “hierba tortuga”, es un pasto marino dominante que crece en el Mar Caribe asociada a Syringodium filiforme. El extracto hidroalcohólico de T. testudinum es rico en polifenoles; el metabolito más abundante en este extracto es thalassiolina B, un flavonoide glicosilado con propiedades para la reparación de daños en la piel y la capacidad antioxidante, entre otros. El objetivo del presente estudio fue conocer el comportamiento estacional de los metabolitos secundarios, así como la capacidad antioxidante del extracto de hojas de T. testudinum recolectadas mensualmente durante el 2012, en la costa noreste de La Habana, Cuba. Para este estudio fueron empleados métodos espectrofotométricos para la determinación de la concentración de polifenoles, flavonoides, carbohidratos y proteínas solubles, clorofilas a y b y la actividad antioxidante del extracto. En sentido general, los resultados demostraron las variaciones estacionales de los parámetros analizados; los extractos preparados a partir de material vegetal recolectado en octubre y noviembre mostraron los mayores valores de polifenoles y flavonoides (44.12 ± 1.30 y 51.30 ± 0.67 mg/g bs respectivamente) y se encontraron los valores más bajos en los extractos de hojas recolectadas en julio y agosto. (15.51 ± 0.84 y 13.86 ± 0.48 mg/g respectivamente). De acuerdo con los resultados, se obtuvo el valor más bajo de la concentración inhibitoria (CI50 ) necesaria para obtener un 50 % de efecto máximo en la actividad de captación de radicales libres con los extractos preparados a partir de las hojas recolectadas en octubre y noviembre y la CI50 menos significativa se obtuvo a partir del extracto preparado a partir de las hojas recolectadas en agosto (5.63 mg/ml). Se observó una correlación negativa (r= -0,694) entre el contenido de polifenoles y la CI50 necesaria para obtener la mitad del efecto antioxidante máximo. La alta correspondencia que existe entre los valores máximos de polifenoles, flavonoides, carbohidratos y proteínas en octubre y noviembre reveló una estrecha relación entre estos metabolitos, encontrados en el extracto de T. testudinum. La hipótesis de la variación anual de la concentración de estos metabolitos fue validada. Estos resultados se tendrán en cuenta con el fin de seleccionar el momento de recolecta de las hojas de T. testudinum para su uso con fines biotecnológicos e industriales.

Altitudinal distribution, richness and composition of bird “assemblages” in a mountainous region in Southern Nayarit, Mexico.

Resumen:Los estudios sobre gradientes altitudinales han permitido examinar cambios en la riqueza y composición de los ensamblajes de aves, lo que hace posible obtener información sobre las variables ambientales que determinan su distribución y factores que definen la estructura. En este trabajo se describe la variación en la riqueza y composición de los ensamblajes de aves a través de un gradiente altitudinal al sur de Nayarit. Para analizar el comportamiento de la riqueza en el gradiente se obtuvo información mediante puntos de conteo en nueve intervalos altitudinales (separados cada 300 m de altitud) desde el nivel del mar hasta los 2 700 msnm. Se estandarizó el esfuerzo de muestreo y se realizaron curvas de rarefacción, y los cambios en la composición de especies se analizaron mediante análisis de clasificación jerárquica utilizando la técnica TWINSPAN. Para identificar las variables asociadas con los cambios en riqueza se analizó el efecto de la precipitación y de la estructura del hábitat mediante árboles de regresión. Para determinar si los cambios en composición responden a cambios en los tipos de vegetación se realizó un análisis de escalamiento multidimensional no métrico (NMDS). La riqueza de especies varió de forma significativa a través del gradiente: fue alta en las partes bajas del gradiente, alcanzó su valor máximo en la parte media y disminuyó monotónicamente con la elevación. Las especies respondieron a cambios en el gradiente y se agruparon en tres pisos altitudinales. Los análisis sugieren que los cambios en la riqueza y composición de las especies están influenciados por la vegetación, su estructura y precipitación, así como por diversos aspectos relacionados con características del hábitat y la perturbación. Estos aspectos deberán ser tomados en cuenta con el fin de diseñar estrategias adecuadas para la conservación de las aves de Nayarit.

Abstract:Elevation gradient studies have strengthened the evaluation of changes in richness and composition of bird assemblages. They also provide information on environmental variables that determine bird distribution, and the variables that define their population structure. Our aim was to describe their variation through an elevational cline in Southern Nayarit, Mexico. To analyze the behavior of richness across the gradient, we gathered information through point counts in nine elevational intervals (300 m from each other) from sea level to 2 700 m of elevation. With a standardized sampling effort, we produced rarefaction curves and analyzed changes in species composition by hierarchical classification using the TWINSPAN technique. In order to identify variables associated with richness changes, we examined the effect of precipitation and habitat structure via regression trees. An analysis of nonmetric multidimensional scaling (NMDS) was implemented with the purpose to determine if the changes in composition correspond to changes in vegetation types. Species richness varied significantly across the gradient: high in the lower parts of the gradient, reached its peak in the middle, and decreased monotonically with elevation. Species responded to changes in the cline and were grouped in three elevational zones. Analyses suggest that changes in richness and species composition are influenced by vegetation, its structure and precipitation regime, as well as various aspects related to habitat features and disturbance. These aspects should be taken into account in order to design appropriate strategies for the conservation of the birds of Nayarit. Rev. Biol. Trop. 64 (4): 1537-1551. Epub 2016 December 01.

Large mammal community composition and density under a disturbance gradient in Northeast Costa Rica

Abstract:Large mammal communities, integral components of Neotropical ecosystems, are increasingly threatened by habitat fragmentation and degradation due to anthropogenic pressures and climate change. Lowland Neotropical palm forests harbor diverse mammal communities, including threatened and endangered species. We monitored three transects in the Barra del Colorado Wildlife Refuge in Northeast Costa Rica from February 2014 until April 2015 documenting large terrestrial mammal and primate detections. Following established large mammal survey methodology, each transect was walked weekly alternating between early morning and late afternoon to maximize detection. The three transects represent three levels of anthropogenic disturbance with highest disturbance at the Cerro, followed by Caño Palma Biological Station (CPBS), and lowest levels in Tortuguero National Park (TNP). Overall we found higher diversity and increased presence of endangered species in TNP and the lowest diversity and lower presence of those species in the Cerro. Overall we detected 25 species; 19 at the Cerro, 22 in TNP and 23 at CPBS. TNP had the highest diversity as calculated by Simpson index (28.3) followed by CBPS (27.9), and the Cerro had the lowest diversity of mammals (2.27). The most influential species driving the differences of communities between the three transects included the white-lipped and collared peccaries, which were both present in higher densities in transects with lower disturbance and higher levels of protection, and domestic dogs which were present in higher densities at the Cerro. This study has documented baseline densities of large mammal communities in the wildlife refuge which can be used as preliminary data for future comparisons. As development is continuing in the region, including construction of a tourist trail at the Cerro, a continued monitoring is recommended to understand the effect of development on mammal communities. Rev. Biol. Trop. 64 (4): 1553-1564. Epub 2016 December 01.

Resumen:Las comunidades de grandes mamíferos, componentes integrales de los ecosistemas neotropicales, se encuentran cada vez más amenazadas debido a la fragmentación del hábitat y a su degradación por presiones antropogénicas y por el cambio climático. Los bosques de palmeras de zonas bajas neotropicales albergan comunidades diversas de mamíferos, incluyendo especies amenazadas y en peligro. Hemos monitoreado tres transectos en el Refugio Nacional de Vida Silvestre Barra del Colorado en el noreste de Costa Rica, desde febrero 2014 hasta abril 2015, registrando grandes mamíferos terrestres y primates. Siguiendo métodos establecidos de muestreos de mamíferos grandes, caminábamos cada transecto una vez por semana alternando entre la maña y la tarde para maximizar la detección. Estos tres transectos representan tres niveles de alteración antropogénica, encontrándose la más fuerte en el Cerro, seguido de la Estación Biológica Caño Palma (CPBS) y, con la menor presión, el Parque Nacional Tortuguero (TNP). En general, hemos encontrado una mayor diversidad y mayor presencia de especies en peligro de extinción en TNP y una menor diversidad y una menor presencia de estas especies en el Cerro. En esta investigación, detectamos 25 especies en total; 19 en el Cerro, 22 en el TNP, y 23 en CPBS. TNP tenía el más alto nivel de diversidad según el índice Simpson (28.3) seguido por CBPS (27.9), y el Cerro tenía el nivel de diversidad más bajo (2.27). Las especies que influyen en mayor medida con la diferenciación de las comunidades entre los tres transectos incluyen los pecarís cariblanco y de collar, ambos encontrados en mayor densidad en los transectos con menores alteraciones y altos niveles de protección, y los perros domésticos, los cuales aparecen en mayor densidad en el Cerro. Este estudio sirve de base para documentar las comunidades de grandes mamíferos en el refugio y puede ser usado para futuras comparaciones. Debido al continuo desarrollo de la región, incluyendo la construcción de un sendero para turistas en el Cerro, el monitoreo continuo es imprescindible para el entendimiento de los efectos del desarrollo en las comunidades de mamíferos.

Seedling growth and survival of five tree species in secondary forests and adjacent pastures in the montane rain forests of Southern Costa Rica

Abstract:Successful forest restoration in tropical environments is limited by the paucity of studies on the initial establishment and early survival requirements of seedlings of most native tropical tree species under disturbed conditions. Here, we evaluated the initial growth responses and the regeneration potential of seedlings of five tree species native to Costa Rica (Hasseltia floribunda, Inga densiflora, Persea americana, Tapirira mexicana and Trichilia pittieri). Seedlings were grown in secondary forests and adjacent open pastures under contrasting conditions of light availability. We quantified seedling growth, survival and herbivory from August 2010 to August 2011 on a monthly basis, and measured differences in leaf mass per area (LMA) at the end of the experiment. We found significant variation in growth responses between the understory of secondary forests and pastures. Growth in height was highest in pastures across all species, with I. densiflora, P. americana and T. mexicana showing the most striking differences. In contrast, H. floribunda and T. pittieri did not show differences in diameter growth between environments. Except for T. mexicana, herbivory increased throughout the experiment in all the species. Herbivory increased faster in pastures for H. floribunda and T. pittieri and showed higher rates in the forest understory for I. densiflora and P. americana. Seedling survival showed significant differences for all species across environments. Survival of H. floribunda and I. densiflora was higher in secondary forests, whereas the other species showed higher survival in pastures. LMA showed higher values in the pastures across all species, showing that individuals exposed to high light conditions had great photosynthetic rate and great leaf construction capacity. Due to their rapid growth and high survival, I. densiflora and T. mexicana showed great potential to restore abandoned pastures and secondary forests. Increasing our knowledge on the response of seedlings under disturbed conditions in tropical ecosystems is critical for improving the restoration of altered environments by matching the ecological amplitude of native species with specific environmental conditions. Rev. Biol. Trop. 64 (4): 1565-1583. Epub 2016 December 01.

Resumen:La restauración exitosa del bosque en ambientes tropicales está limitada por la carencia de estudios sobre los requisitos de hábitat, el establecimiento inicial, y la sobrevivencia de las plántulas de la mayoría de las especies de árboles tropicales nativos. En este estudio, evaluamos las respuestas en el crecimiento inicial y el potencial de regeneración de las plántulas de cinco especies de árboles nativos de Costa Rica (Hasseltia floribunda, Inga densiflora, Persea americana, Tapirira mexicana y Trichilia pittieri). Sembramos las plántulas en bosques secundarios y en pastizales abiertos adyacentes con condiciones de luz contrastantes. Cuantificamos el crecimiento, la supervivencia y el daño por herbivoría de las plántulas de forma mensual entre agosto 2010 y agosto 2011, y medimos las diferencias en el la masa foliar por área de la hoja al final del experimento. Existió una variación significativa en el crecimiento de las plántulas expuestas a la sombra en los bosques secundarios y aquellas que crecieron en pastizales. El crecimiento en altura fue mayor en pastizales en todas las especies; I. densiflora, P. americana y T. mexicana mostraron la mayor diferencia entre ambientes. En con- traste, H. floribunda y T. pittieri no mostraron diferencias en el crecimiento del diámetro entre ambientes. Con la excepción de T. mexicana, todas las especies mostraron un aumento en herbivoría durante el estudio. En los pastizales, el incremento de la herbivoría fue más rápido en H. floribunda y T. pittieri, mientras que para I. densiflora y P. americana fue mayor en el bosque. La sobrevivencia de plántulas fue diferente entre ambientes para todas las especies. La sobrevivencia de H. floribunda e I. densiflora fue mayor en el bosque secundario, mientras que en las demás especies hubo mayor sobrevivencia de plántulas en los pastizales. La masa foliar por área fue mayor en las plántulas que crecieron en los pastizales que en bosque secundario para todas las especies, lo que sugiere que los individuos que crecieron en condiciones de alta incidencia de luz tuvieron mayor tasa fotosintética y mayor capacidad de construcción de la hoja. Debido al rápido crecimiento y alta supervivencia I. densiflora y T. mexicana tienen gran potencial para la restauración de bosques secundarios y pastizales abandonados. Generar información sobre la respuesta de plántulas creciendo en bosques secundarios y pastizales en regeneración es crítico para mejorar los procesos de restauración de ambientes alterados. La restauración de estos bosques depende de la correspondencia entre las condiciones específicas de hábitat y la plasticidad ecológica de las especies nativas.

Shell shape variation of queen conch Strombus gigas (Mesograstropoda: Strombidae) from Southwest Caribbean

Abstract:The endangered species Strombus gigas is a marine gastropod of significant economic importance through the Greater Caribbean region. In contrast to phenotypic plasticity, the role of genetics on shell variations in S. gigas has not been addressed so far, despite its importance in evolution, management and conservation of this species. This work used geometric morphometrics to investigate the phenotypic variation of 219 shells of S. gigas from eight sites of the Colombian Southwest Caribbean. Differences in mean size between sexes and among sites were contrasted by analysis of variance. Allometry was tested by multivariate regression and the hypothesis of common slope was contrasted by covariance multivariate analysis. Differences in the shell shape among sites were analyzed by principal component analysis. Sexual size dimorphism was not significant, whereas sexual shape dimorphism was significant and variable across sites. Differences in the shell shape among sites were concordant with genetic differences based on microsatellite data, supporting its genetic background. Besides, differences in the shell shape between populations genetically similar suggest a role of phenotypic plasticity in the morphometric variation of the shell shape. These outcomes evidence the role of genetic back- ground and phenotypic plasticity in the shell shape of S. gigas. Thus, geometric morphometrics of shell shape may constitute a complementary tool to explore the genetic diversity of this species. Rev. Biol. Trop. 64 (4): 1585-1595. Epub 2016 December 01.

Resumen:La especie en peligro, Strombus gigas, es un gastrópodo marino de importancia económica en la región del Gran Caribe. En contraste con la plasticidad fenotípica, el papel de la genética en la variación de la concha en S. gigas no ha sido abordado hasta ahora, a pesar de su importancia evolutiva, manejo y conservación. Este trabajo utilizó la morfometría geométrica para investigar la variación fenotípica de la concha de S.gigas en ocho sitios del suroeste del Caribe colombiano. Las diferencias en el tamaño promedio entre sexos y sitios se contrastaron mediante análisis de varianza. La alometría se evaluó mediante regresión multivariada y la hipótesis de pendientes similares se contrastó mediante un análisis multivariado de covarianza. Las diferencias en la conformación de las conchas entre sitios se exploraron mediante análisis de componentes principales. El dimorfismo sexual en el tamaño no fue significativo, mientras que el dimorfismo sexual en la conformación fue significativo y variable entre los sitios. Las diferencias en la conformación de la concha entre sitios fueron concordantes con diferencias genéticas basadas en microsatélites, lo cual apoya su base genética. Además, las diferencias en conformación de la concha entre poblaciones genéticamente similares sugieren un papel de la plasticidad fenotípica en la variación morfométrica de la conformación de la concha. Estos resultados evidencian el papel de la genética y la plasticidad fenotípica en la conformación de la concha de S. gigas. Por lo tanto, la morfometría geométrica de la conformación de la concha puede constituir una herramienta complementaria para explorar la diversidad genética de esta especie.

Permanent germinal epithelium and reproductive cycle of Atractosteus tropicus (Lepisosteiformes: Lepisosteidae) males, Tabasco, Mexico

Abstract:The tropical gar A. tropicus plays an important ecological role as it regulates other fish stocks in different water bodies in Southeastern México. Nevertheless, wild populations are declining, and one conservation alternative is the aquaculture production and basic knowledge of reproductive biology; for males, this requires the study of germ and somatic structures of testes, to characterize the reproductive cycle, and to provide basic knowledge for exploitation and conservation models and strategies. With this aim, a total of 24 males with an average sL = 47.2 cm were collected from wild populations from the Laguna Pomposú, municipality of Jalpa de Mendez (18°19’ - 93°01’12” W), Tabasco, Mexico. Fish were collected with a trawl net and were transported live to the Tropical Aquaculture Laboratory, División Académica de Ciencias Biológicas (DACBiol), Universidad Juárez Autónoma de Tabasco (UJAT). Males were killed by prolonged immersion in MS222. Testes samples were collected from each specimen and were processed using the standard histological procedures, that consisted of dehydration in an ascending ethanol series, xylol, embedding in paraffin, sectioning at 7 µm, and staining with hematoxylin-eosin (HE). The diameter of 20 seminiferous tubules (Dst), height of germinal epithelium (Hge), gonadosomatic index (GSI) and gonad volume (gV) were determined monthly. Based on morphometric and morpho-physiological characteristics, the testes consisted of a network of anastomosed tubules with non-restricted cystic spermatogenesis, and a permanent germinal epithelium. This is the first report of a permanent germinal epithelium in A. tropicus. Five reproductive classes were histologically identified: Class I Regressed; Class II Early Maturation; Class III Mid Maturation; Class IV Late Maturation; Class V Regression. Monthly GSI, gV and Dst values were lower in January and February, the testis showed spermatozoa remains and a regenerating discontinuous germinal epithelium. In March spermiogenesis increased and proliferation of spermatogonia decreased. Male tropical gar followed a seasonal reproductive cycle, indicated by the monthly variation of the reproductive classes and the reproductive season processes observed, and for which temperature and rainfall seem to stimulate reproductive activity and spermiation. Rev. Biol. Trop. 64 (4): 1597-1609. Epub 2016 December 01.

Resumen:A. tropicus tiene un papel ecológico importante, como regulador de otras poblaciones de peces, en los cuerpos de agua de México, pero sus poblaciones silvestres se reducen. Una alternativa de conservación es el cultivo, el cual requiere caracterizar el ciclo reproductivo por medio del estudio de estructuras germinales y somáticas de los testículos, conocimientos que son básicos para formar modelos de aprovechamiento y conservación. Se capturaron mensualmente tres machos sexualmente maduros (N = 24), con un promedio de sL = 47.2 cm en Laguna de Pomposú, Jalpa de Méndez (18°19´59” N - 93°01´12” W), Tabasco, México, de octubre 2009 a septiembre 2010. La técnica de captura fue red de arrastre, se transportaron vivos al laboratorio de acuicultura tropical, DACBiol, UJAT. Los machos recolectados se sacrificaron con baños de inmersión en sobredosis de MS222, los testículos se procesaron para análisis histológico. Se determinó mensualmente el diámetro de 20 túbulos seminíferos (Dst), altura de epitelio germinal (Hge), índice gonadosomático (GSI) y volumen de gónada (gV). Características morfo-fisiológicas del testículo muestran que está constituido de una red de túbulos anastomosados con espermatogénesis quística no restringida, y un epitelio germinal permanente, de nuestro conocimiento es la primera vez que se reporta este tipo de epitelio en Holostei (Lepisosteiformes: Lepisosteidae). Se identificaron cinco clases reproductivas: Clase I Recrudescencia, Clase II Madurez temprana, Clase III Madurez intermedia, Clase IV Maduración tardía, Clase V Regresión, que al contrastarlo con el valor mensual de los indicadores sexuales “GSI, gV, Dst” muestra un patrón de variación; durante enero-febrero se presentan valores bajos, se observa un epitelio germinal discontinuo en regeneración; durante marzo se incrementa la proliferación de espermatogonias disminuyendo la espermatogénesis. Los machos de A. tropicus muestran una actividad reproductora estacional anual, explicado por las variaciones mensuales de los indicadores reproductores, donde la temperatura y la precipitación parecen tener un papel importante como factores que estimulan la actividad reproductora y por tanto la espermiación.

Evaluation of PAE and endemicity analysis for identifying generalized tracks using snakes in Hidalgo, Mexico.

Resumen:Uno de los conceptos centrales en la Panbiogeografía es el trazo generalizado, el cual representa una biota ancestral que se ha fragmentado por eventos geológicos y puede recuperarse a través de distintos métodos, que incluyen el análisis de simplicidad de endemismos (PAE) y el análisis de endemicidad (AE). El PAE es un método frecuentemente utilizado para la identificación de trazos generalizados, mientras que el AE fue diseñado para encontrar áreas de endemismo, pero recientemente se ha usado también para identificar trazos generalizados. En este trabajo se evaluaron ambos métodos para la identificación de los trazos generalizados a partir de los datos de 84 serpientes distribuidas en el estado de Hidalgo, México. Con el PAE se obtuvo un trazo generalizado formado por tres trazos individuales (Agkistrodon taylori, Crotalus totonacus y Pliocercus elapoides), que corresponden a sinapomorfías que apoyan al clado principal. La prueba de robustez estadística mostró un soporte del 89 %, mientras que con el AE se identificaron dos áreas de endemismo con valores del índice de endemicidad de 2.71-2.96 y 2.84- 3.09 respectivamente, las cuales fueron transformadas a trazos generalizados; el primero formado por tres trazos individuales (Micrurus bernadi, Rhadinaea marcellae y R. quinquelineata) y el segundo formado por dos trazos individuales (Geophis mutitorques y Thamnophis sumichrasti). Estos trazos generalizados pueden considerarse un solo patrón de distribución, dada la cercanía geográfica y su topología. Al compararse los métodos se observó que ambos son útiles para la identificación de trazos generalizados, y aunque son independientes, se sugiere su uso de manera complementaria. Sin embargo, para una correcta aplicación e interpretación de los resultados, es necesario considerar las bases teóricas de cada método, así como la correcta elección del tamaño de las unidades de estudio. En el caso particular del AE si se utilizan tamaños de celda pequeños éstos pueden resultar ideales para la búsqueda de patrones biogeográficos a través de límites geopolíticos y esta información puede favorecer la realización de pro- puestas de conservación a nivel estatal que consideren a las especies con distribuciones restringidas, pues la pérdida de éstas representaría la extinción de linajes únicos.

Abstract:One of the most important concepts in Panbiogeography is the generalized track, which represents an ancestral biota fragmented by geological events that can be recovered through several methods, including Parsimony analysis of endemicity (PAE) and endemicity analysis (EA). PAE has been frequently used to identify generalized tracks, while EA is primarily designed to find areas of endemicity, but has been recently proposed for identifying generalized tracks as well. In this study we evaluated these methods to find generalized tracks using the distribution of the 84 snake species of Hidalgo. PAE found one generalized track from three individual tracks (Agkistrodon taylori, Crotalus totonacus and Pliocercus elapoides), supported by 89 % of Bootstrap, and EA identified two generalized tracks, with endemicity index values of 2.71-2.96 and 2.84-3.09, respectively. Those areas were transformed to generalized tracks. The first generalized track was retrieved from three individual tracks (Micrurus bernadi, Rhadinaea marcellae and R. quinquelineata), and the second was recovered from two individual tracks (Geophis mutitorques and Thamnophis sumichrasti). These generalized tracks can be considered a unique distribution pattern, because they resembled each other and agreed in shape. When comparing both methods, we noted that both are useful for identifying generalized tracks, and although they can be used independently, we suggest their complementary use. Nevertheless, to obtain accurate results, it is useful to consider theoretical bases of both methods, along with an appropriate choice of the size of the area. Results using small-grid size in EA are ideal for searching biogeographical patterns within geopolitical limits. Furthermore, they can be used for conservation proposals at state level where endemic species become irreplaceable, and where losing them would imply the extinction of unique lineages. Rev. Biol. Trop. 64 (4): 1611-1624. Epub 2016 December 01.

Effects of human disturbance on the population dynamics of Ocypode quadrata (Decapoda: Ocypodidae) in beaches of the Mexican Caribbean.

Resumen:El cangrejo fantasma Ocypode quadrata, tiene una alta relevancia ecológica en las playas del Atlántico occidental y se ha propuesto como un indicador del impacto humano sobre este ecosistema. Sin embargo, no se han evaluado los efectos del disturbio humano sobre su dinámica poblacional. En este trabajo se compara la abundancia, el crecimiento y la mortalidad de O. quadrata en dos playas perturbadas (Aventuras y Majahual) y dos playas conservadas (Xcacel y Puerto Ángel) de las costas del Caribe mexicano. Se realizaron nueve muestreos en cada playa (marzo/2013-noviembre/2014). Durante las primeras horas de la noche se recolectaron cangrejos, de forma manual por tres personas, en un área aproximada de 9 000 m2. Los cangrejos fueron medidos, pesados y separados en tres grupos: jóvenes, hembras y machos. La mayor abundancia de cangrejos se encontró en las playas conservadas pero solo se observaron diferencias significativas entre Puerto Ángel y Majahual (Tukey, p<0.05). La proporción jóvenes- adultos fue 1:1 en Xcacel y Aventuras. En Majahual se recolectó un mayor número de jóvenes que adultos y en Puerto Ángel el número de adultos triplicó el de jóvenes. La talla máxima para Aventuras, Xcacel, Majahual y Puerto Ángel fue de 27, 32, 25 y 30 mm, respectivamente. En las playas se encontraron entre dos y tres grupos de edades diferentes. En las cuatro playas se recolectaron individuos con tallas menores de 10 mm en casi todos los meses de muestreo, indicando que el reclutamiento es continuo durante todo el año. La relación entre la longitud y el peso del cangrejo fantasma fue isométrica en las playas mejor conservadas y alométrica negativa en las playas impactadas. Los cangrejos de Puerto Ángel mostraron mejor condición corporal que en el resto de las playas (Tukey, p<0.05). Los valores de K oscilaron entre 0.6-0.97/año y la L∞ entre 29.0-33.6 mm. Los cangrejos en las dos playas conservadas mostraron mayores parámetros de crecimiento en comparación con las dos playas perturbadas. Los mayores valores de mortalidad se encontraron en Xcacel y Aventuras. En las playas perturbadas, la destrucción de las dunas, la limpieza mecánica y la remoción de materia orgánica, parecen ser las principales causas que conllevan a una baja abundancia de cangrejos, un menor crecimiento y una alta mortalidad. Sin embargo en las playas mejor conservadas, las relaciones biológicas parecen ser más importantes en regular la dinámica poblacional de esta especie. Estos resultados tienen relevancia desde el punto de vista de manejo de las playas arenosas, ya que el cangrejo fantasma es un buen indicador del disturbio humano y sus respuestas poblacionales son medibles y comparables.

Abstract:The ghost crab Ocypode quadrata is a relevant species in the Western Atlantic beaches, and has been proposed as an indicator of human impact in these ecosystems. Eventhough some studies have covered various aspects of its natural history, no evaluations on the effects of human disturbance on its population dynamics have been made. This work compared the abundance, growth, and mortality of O. quadrata in two disturbed beaches (Aventuras and Majahual) and two preserved beaches (Xcacel and Puerto Angel) from the Mexican Caribbean. For this, nine samplings were made on each beach (every two to three months) between March 2013 and November 2014. Crabs were collected manually by three people, during the night first hours and for one hour, and a total area of 9 000 m2 per beach. The crabs were measured, weighed, and separated into three groups: juvenile, male and female; while abundance was estimated by the number of collected crabs, and growth parameters were estimated using length frequencies. A total of 1 047 crabs were sampled in the four beaches; a higher crab abundance was found in the preserved beaches, but significant differences were only found between Puerto Angel and Majahual (Tukey, p<0.05). The adult- juvenile ratio was 1:1 in Xcacel and Aventuras, while in Majahual, more juveniles than adults were collected; and Puerto Angel had more adults than the juveniles. The size structure at Xcacel ranged from 4-32 mm, but in the rest of the beaches the minimum size was 5 mm. The maximum size at Aventuras, Majahual and Puerto Angel were 27 mm, 25 mm and 30 mm, respectively. The modal progression analysis of length’s pooled data, revealed the presence of at least two groups of ages in all beaches. For all beaches, individuals smaller than 10 mm length were collected in almost all sampling months, indicating a continuous recruitment throughout the year. The length-weight relationship of the ghost crab was found isometric in the two preserved beaches, and negative allometric at the two impacted beaches. Crabs from Puerto Angel showed the highest body condition (Tukey, p<0.05). K-values ranged from 0.6-0.97/year and L∞ from 29.0 mm to 33.6 mm with higher values for the two preserved beaches. The highest mortality values were found in Xcacel and Aventuras. In the disturbed beaches, the destruction of the dunes, the mechanical cleaning and the removal of organic matter, seem to be the main causes that lead to a low abundance of crabs, their slower growth and higher mortalities. However, in the best preserved beaches, biological interactions appear to be the most important aspects in regulating the population dynamics of this species. These results supported the information that the ghost crab is a good indicator of human disturbance, and its population changes were clearly measurable and comparable among protected and impacted beaches; these results are also relevant for the management of sandy beaches in the Mexican Caribbean. Rev. Biol. Trop. 64 (4): 1625-1641. Epub 2016 December 01.

Reproductive aspects of Pomacea flagellata (Mollusca: Ampullariidae) at Bacalar lagoon, Quintana Roo, México.

Resumen:Pomacea flagellata es una especie de caracol de agua dulce nativo en el sureste de México. Sobre esta especie existen pocos estudios y en ninguno se han abordado aspectos de su reproducción. Este caracol ha sido explotado durante años en la laguna Bacalar y sus poblaciones han decrecido considerablemente, conllevando a la veda de su captura. Este trabajo se realizó con el objetivo de evaluar las variaciones temporales de la frecuencia de cópulas y la abundancia de masas de huevos de P. flagellata en la laguna de Bacalar, así como sus relaciones con la abundancia de los caracoles y con variables ambientales. Los muestreos fueron realizados durante tres temporadas: Lluvias (julio, agosto y septiembre 2012), Nortes (diciembre 2012, enero y febrero 2013) y Secas (marzo, abril y mayo 2013) en 12 estaciones a lo largo de la laguna de Bacalar. En cada estación, se recorrió un transecto de 100 m paralelo a la orilla y se contó el número de huevas frescas (color rosado) puestas sobre la vegetación, troncos, rocas o estructuras artificiales. En el agua se hicieron tres transectos de 50 x 2 m y en cada uno se contaron los caracoles y se registró el número de cópulas. La densidad de caracoles mostró variaciones significativas entre temporadas, disminuyendo desde la temporada de Lluvias hasta la temporada de Secas. Entre los meses dentro de temporadas no se presentaron diferencias significativas (ANOVA, p>0.05). Durante toda la temporada de Lluvias se registraron cópulas con una frecuencia significativamente mayor que en Nortes, mientras en Secas no se registraron cópulas (Kruskal-Wallis, p˂0.05). La puesta de masas de huevos se extendió de julio a marzo. La densidad de huevas no presentó diferencias entre la temporadas de Lluvias y Nortes (2.72 masas/m y 2.93 masas/m, respectivamente), pero en Secas fue significativamente menor con un valor de 0.1 masas/m (H, p˂0.05). La frecuencia de cópulas se relacionó significativamente con la abundancia de caracoles (rs= 0.26; p<0.05) y con la temperatura del agua (rs= 0.34; p<0.05). La abundancia de masas de huevos se relaciona significativamente con la abundancia de individuos (rs= 0.46; p<0.05). De forma general se observó que la actividad reproductiva de P. flagellata en la laguna de Bacalar, está asociada a los meses más cálidos y con mayor precipitación. Este hallazgo es relevante para apoyar la gestión de este recurso en la región, de tal forma que para implementar alguna medida de manejo para esta especie, es necesario tener en cuenta que al menos se debe mantener una veda temporal durante la etapa reproductiva.

Abstract:The freshwater snail Pomacea flagellata is native from Southeastern Mexico. Studies about this species are scarce and none has treated their reproduction. This snail has been exploited at Bacalar lagoon for many years, leading to a significant decrease in their abundance and currently, a permanent ban was proposed by the government. This work aimed to assess the temporal variations of mating frequency and the abundance of egg clutches of P. flagellata at Bacalar lagoon, as well as their relation with snails density and environmental variables. Sampling was done during the three climatic seasons: Rainy (July, August and September/2012), North or Cold fronts (December/2012 and January and February/2013) and Dry (March, April and May/2013) in 12 sampling stations located along the Bacalar lagoon. On each station a transect of 100 m length was set parallel to the edge, and the number of fresh egg clutches (pink color) laid over vegetation, rocks or manmade structures, were counted. In the water, three 50 x 2 m transects were set and the number of snails were counted as well as the mating frequency. Density of snails varied significantly among seasons, decreasing from the rainy to the dry season. There were no significant differences of snail abundance among months, nested in climatic seasons (ANOVA, p>0.05). During the rainy season the mating frequency was significantly higher than in the Norths, meanwhile in the dry season no mating were registered (Kruskal-Wallis, p˂0.05). Eggs clutches appeared from July to March. Density of egg clutches presented no differences between the Rainy and the North seasons (2.72 and 2.93 clutches/m, respectively), nonetheless during the dry season abundance of egg masses was significantly lower (0.1 clutches/m) (H, p˂0.05). Mating frequency was related with snail abundance (rs= 0.26; p<0.05) and water temperature (rs= 0.34; p<0.05) and the abundance of egg masses is related with snail abundance (rs= 0.46; p<0.05). In general, we observed that reproductive activity of P. flagellata at Bacalar lagoon is related with the warmer months and with higher rainfall. This finding is relevant to support the management of this resource in the region, so that to implement any management arrangement they must be aware that a temporal ban is necessary during the reproductive season at least. Rev. Biol. Trop. 64 (4): 1643-1650. Epub 2016 December 01.

Water absorption and method improvement concerning electrical conductivity testing of Acacia mangium (Fabaceae) seeds

Abstract:Acacia is an important forest species of rapid growth whose seeds have tegument dormancy. In this work it was intended to characterize water absorption pattern after seed dormancy break, and to determine the amount of water, container size and the need of breaking the tegument dormancy, as to perform electrical conductivity test in small and large seeds of Acacia mangium (Fabaceae). The seeds were collected from 10, 8 and 6 years old trees established in poor yielding-capacity soils on savannah areas of Roraima, Brazil; seeds were classified in six lots concerning to seed size and tree age. Germination tests (50 seeds and four replications per lot) were carried out on germitest® paper maintained on gerbox at 25 °C. Imbibition was verified by seed weighing at different times (0, 2, 5, 8, 12, 16, 24, 36, 48, 60, 72, 84, 96 and 120 hours). The electrical conductivity test consisted of three experiments, distinguished by the amount of water used and by the container size in which seeds were immersed. Seeds of A. mangium coming from 10 years old trees presented increased germination percent and germination speed than seeds of six-year old trees. Small seeds presented increased in electrical conductivity and water absorption until 120 hours when compared to large seeds. The immersion of seeds of A. mangium in 40 mL of distilled water into 180 mL plastic containers, after dormancy break, it is indicated for the determination of electrical conductivity test. The ratio of electrolytes by seed mass, after 24 hours of immersion in water, turns electrical conductivity test more accurate concerning A. mangium seeds. Rev. Biol. Trop. 64 (4): 1651-1660. Epub 2016 December 01.

Resumen:Acacia es una importante especie forestal de rápido crecimiento cuyas semillas presentan dormancia del tegumento. En este trabajo se caracterizó el patrón de absorción de agua después de la dormancia y se estableció la cantidad de agua, el tamaño del recipiente y la necesidad de ruptura del tegumento para poder medir la conductividad eléctrica en semillas pequeñas y grandes de Acacia mangium (Fabaceae). Las semillas fueron recolectadas de árboles de 6, 8 y 10 años, clasificadas en grandes o pequeñas y agrupadas en seis grupos. Para la prueba de germinación fueron utilizados cuatro repeticiones de 50 semillas de cada grupo, en papel germitest® a 25 °C. La imbibición se verificó con pesajes en los tiempos 0, 2, 5, 8, 12, 16, 24, 36, 48, 60, 72, 84, 96 y 120 horas con semillas colocadas en papel. La prueba de conductividad eléctrica se realizó en tres experimentos diferenciados por la cantidad de agua utilizada y el tamaño del recipiente de inmersión de las semillas. Las semillas de árboles de 10 años de edad tienen un porcentaje de germinación más alto y mayor velocidad de germinación que semillas de árboles de seis años. Las semillas pequeñas tienen una mayor conductividad eléctrica y mayor porcentaje de absorción de agua en comparación con las semillas grandes, hasta 120 horas. La inmersión de semillas en 40 mL de agua destilada en recipientes plásticos de 180 mL, después de la dormancia, esta indicada para la determinación de la conductividad eléctrica. La lectura de electrolitos en semillas, después de 24 horas de inmersión en agua, hace más precisa la prueba de conductividad eléctrica de semillas de A. mangium.

Using indigenous knowledge to link hyper-temporal land cover mapping with land use in the Venezuelan Amazon: “The Forest Pulse”

Abstract:Remote sensing and traditional ecological knowledge (TEK) can be combined to advance conservation of remote tropical regions, e.g. Amazonia, where intensive in situ surveys are often not possible. Integrating TEK into monitoring and management of these areas allows for community participation, as well as for offering novel insights into sustainable resource use. In this study, we developed a 250 m resolution land-cover map of the Western Guyana Shield (Venezuela) based on remote sensing, and used TEK to validate its relevance for indigenous livelihoods and land uses. We first employed a hyper-temporal remotely sensed vegetation index to derive a land classification system. During a 1 300 km, eight day fluvial expedition in roadless areas in the Amazonas State (Venezuela), we visited six indigenous communities who provided geo-referenced data on hunting, fishing and farming activities. We overlaid these TEK data onto the land classification map, to link land classes with indigenous use. We characterized land classes using patterns of greenness temporal change and topo-hydrological information, and proposed 12 land-cover types, grouped into five main landscapes: 1) water bodies; 2) open lands/forest edges; 3) evergreen forests; 4) submontane semideciduous forests, and 5) cloud forests. Each land cover class was identified with a pulsating profile describing temporal changes in greenness, hence we labelled our map as “The Forest Pulse”. These greenness profiles showed a slightly increasing trend, for the period 2000 to 2009, in the land classes representing grassland and scrubland, and a slightly decreasing trend in the classes representing forests. This finding is consistent with a gain in carbon in grassland as a consequence of climate warming, and also with some loss of vegetation in the forests. Thus, our classification shows potential to assess future effects of climate change on landscape. Several classes were significantly connected with agriculture, fishing, overall hunting, and more specifically the hunting of primates, Mazama americana, Dasyprocta fuliginosa, and Tayassu pecari. Our results showed that TEK-based approaches can serve as a basis for validating the livelihood relevance of landscapes in high-value conservation areas, which can form the basis for furthering the management of natural resources in these regions. Rev. Biol. Trop. 64 (4): 1661-1682. Epub 2016 December 01.

Resumen:La teledetección y el conocimiento ecológico tradicional (CET) se pueden combinar para avanzar en la conservación de regiones tropicales remotas como la Amazonía, donde la toma de datos intensiva in situ a menudo es imposible. Integrar el CET en el seguimiento y el manejo de estas áreas permite la participación de la comunidad, y ofrece nuevos puntos de vista sobre el uso sostenible de los recursos naturales. En este estudio se desarrolla un mapa de cobertura del suelo del Escudo Guayanés (Venezuela), con una resolución espacial de 250 m, basado en datos de teledetección, y se utiliza el CET para validar su relevancia en relación con la subsistencia de los pueblos indígenas y el uso que éstos hacen del territorio. En primer lugar se ha empleado un índice de vegetación basado en teledetección hiper-temporal para realizar una clasificación del territorio. Durante una expedición fluvial de 8 días, a lo largo de 1 300 km por áreas sin carreteras en el Estado Amazonas (Venezuela), se han visitado seis comunidades que han proporcionado datos geo-referenciados sobre sus actividades cinegéticas, pesqueras y agrícolas. Estos datos de CET se han superpuesto al mapa de clasificación, con el fin de relacionar las clases de coberturas con los usos indígenas. Se han caracterizado las clases de cobertura en función de patrones de cambio temporal del verdor y la topo-hidrografía, y se han propuesto 12 tipos de cobertura del suelo, agrupadas en cinco tipos principales de paisaje: 1) masas de agua; 2) campo abierto/ márgenes del bosque; 3) bosques siempre-verdes; 4) bosques semi-caducifolios submontanos; y 5) bosques nublados. Cada clase de cobertura del suelo se ha identificado con un perfil pulsátil que describe cambios temporales en el verdor, de ahí que el mapa haya sido titulado “El Pulso del Bosque”. Estos perfiles de verdor han mostrado una tendencia ligeramente ascendente, durante el periodo 2000 a 2009, en las clases que representan pastizales y zonas de matorral, así como una tendencia ligeramente decreciente en las clases que representan bosques. Este hallazgo es compatible con la ganancia de carbono en los pastizales como consecuencia del calentamiento del clima, y también con una cierta pérdida de vegetación en los bosques. De este modo, nuestra clasificación muestra potencial para la evaluación de efectos futuros del cambio climático sobre el paisaje. Algunas clases han resultado estar significativamente relacionadas con la agricultura, la pesca, la caza como práctica general, y más concretamente con la caza de primates, de Mazama Americana, Dasyprocta fuliginosa, y Tayassu pecari. Los resultados demuestran la utilidad de las aproximaciones basadas en CET como base para validar la importancia del paisaje, en áreas con alto valor de conservación, para la supervivencia de las personas, lo que proporciona una base para avanzar en el manejo de los recursos naturales en estas regiones.

Edge effect on lichen’s distribution and chlorophyll content, in fragments of Polylepis quadrijuga (Rosaceae) in Páramo de la Rusia (Boyacá-Colombia).

Resumen:La fragmentación de los ecosistemas es uno de los fenómenos antrópicos de mayor impacto global, y el efecto borde provoca que solo el interior de los fragmentos conserve sus características bióticas y abióticas originales. Los líquenes son organismos especialmente susceptibles a la variabilidad ambiental, lo que podría ser útil para la bio-indicación del efecto borde. En este trabajo se evaluó el efecto borde en dos fragmentos de Polylepis quadrijuga en el Páramo de la Rusia (Boyacá-Colombia), para determinar si existe un efecto borde sobre la distribución de los líquenes asociados a P. quadrijuga y su contenido de clorofilas. Se utilizaron tres transectos de 70 m a través del gradiente matriz-borde-interior en cada fragmento. Se escogieron nueve forofitos por transecto para medir variables ambientales: radiación fotosintéticamente activa, humedad relativa y temperatura del aire, y variables biológicas: riqueza y cobertura de cada especie. Además, fueron elegidas las especies que estaban presentes en las tres zonas del gradiente para cuantificar el contenido de clorofilas a y b, y determinar si hay cambios en la relación de clorofilas a/b que podrían sugerir plasticidad fisiológica como respuesta al efecto borde. Nuestros resultados mostraron que el fragmento 2 tenía una mayor exposición al borde debido a su alta relación perímetro/área, lo que causa una homogenización ambiental y pérdida de biodiversidad con relación con el fragmento 1. En general, se encontraron 55 especies que se distribuyen diferencialmente en relación con los fragmentos y el gradiente matriz-borde-interior. El interior del fragmento 1 fue la zona más conservada, que alberga una composición diferente en más de un 40 % a la composición de cualquier otra zona. Se clasificaron los líquenes de acuerdo con sus hábitos: gelatinosos, fruticosos, costrosos o foliosos, pero no se encontró ninguna relación entre la distribución por hábito y el efecto borde. Seis especies de amplia distribución mostraron cambios en el contenido de clorofila a lo largo del gradiente matriz-borde-interior, lo que es una evidencia de la plasticidad fisiológica al efecto borde. También fue posible diferenciar entre especies con preferencia por ambientes de alta temperatura y especies con preferencia a lugares más húmedos y suficientemente irradiados. Se concluye que algunas especies podrían tener un importante potencial como bio-indicadores de la fragmentación en ambientes de páramo.

Abstract:The ecosystems fragmentation is one of the anthropic phenomena with highest impact at global level and the edge effect causes that only the interior of fragments conserves their original biotic and abiotic characteristics. Lichens are organisms especially susceptible to environmental variability, what could be useful for bio-indication of edge effect. In this work, we evaluated the edge effect in two fragments of Polylepis quadrijuga in the Páramo de la Rusia (Boyacá-Colombia) to determine if there is an edge effect on distribution of lichens associated to P. quadrijuga and their chlorophyll content. We used three transects of 70 m across the matrix-edge-interior gradient in each fragment. We chose nine phorophytes per transect to measure the environmental variables: photosynthetically active radiation, relative humidity and air temperature, and the biological variables: richness and cover per species. Besides, we employed the species that were present in all the three zones of the gradient to quantify the content of chlorophylls a and b, and determine if there are changes in the ratio of chlorophylls a/b that could suggest physiological plasticity as a response to the edge effect. Our results showed that fragment 2 had a higher edge exposition because of its high relation perimeter/area, allowing to an environmental homogenization and lose of biodiversity in relation with fragment 1. Overall, we found 55 differentially distributed species in relation with the fragments and the matrix-edge-interior gradient. The interior of fragment 1 was the most conserved zone, harboring a composition different in more than 40 % to the composition of any other zone. We classified the lichens according with their habits: gelatinous, fruticose, crusty or foliose, but we did not find any relationship between the habit distribution and the edge effect. Six species of wide distribution showed changes in the chlorophyll content along the matrix- edge-interior gradient, what is an evidence of physiological plasticity to edge effect. It was also possible to distinguish between species with preference to warmer environment and species with preference to more humid and sufficiently irradiated places. We concluded that some species of lichens could have an important potential as bio-indicators of fragmentation in the páramo. Rev. Biol. Trop. 64 (4): 1683-1697. Epub 2016 December 01.

Light environment in the understory of an Andean cloud forest: canopy structure and climatic seasonality.

Resumen:El ambiente lumínico en el sotobosque de las selvas nubladas es muy heterogéneo y está determinado por la composición de especies, la estructura del dosel, las condiciones de sitio y la estacionalidad. Este estudio se realizó en la selva nublada San Eusebio, Venezuela (2 300-2 500 m.s.n.m.). El impacto de las variaciones estructurales del dosel en la disponibilidad de luz del sotobosque fue estimado durante la estación seca (diciembre-febrero) y lluviosa (marzo-noviembre), tanto en claros de diferente tamaño como en bosque no perturbado (BNP). Se tomaron fotografías hemisféricas para estimar el porcentaje de dosel abierto, índice de área foliar, porcentajes de luz directa y luz difusa transmitida, duración y frecuencia de rayos de sol. Se calculó un índice de luz a partir de las proporciones relativas de luz directa y difusa transmitida al sotobosque. Para la mayoría de las variables, hubo diferencias significativas entre las estaciones, así como entre claros y BNP. El índice de luz fue bajo (0.25 a 26 de un máximo = 100), incluso para los claros más grandes, indicando un ambiente de luz muy oscuro en el sotobosque, particularmente, en BNP en la estación lluviosa. Patrones e interacciones entre los factores fueron analizados (BNP vs. claros, tamaño de claro, posición en el claro y estacionalidad) con un diseño ANOVA de efectos mixtos y medidas repetidas. Los resultados mostraron que la cantidad de luz que llega al sotobosque es baja, tanto en BNP como en claros. Sin embargo, existieron diferencias pequeñas pero significativas en la disponibilidad de luz, tanto por efecto de la estacionalidad como por la magnitud de las perturbaciones. Estas diferencias podrían contribuir a explicar la dinámica de la regeneración de especies en estos bosques. El conocimiento de los factores que condicionan la disponibilidad de luz en el sotobosque, donde se inicia la regeneración de los árboles, es crucial en selvas nubladas debido a las limitaciones energéticas de este ecosistema, y podría ser fundamental para futuros planes de restauración y conservación de la diversidad e integridad de estos bosques.

Abstract:The light environment in the understory of cloud forests is highly heterogeneous and determined by species composition, canopy structure, site conditions, and seasonality. This study was carried out at San Eusebio cloud forest, Venezuela (2 300 - 2 500 masl). The impact of canopy structure variations on understory light availability was estimated in the dry (December-February) and rainy (March-November) seasons, in sites under continuous canopy cover and gaps of various sizes. Hemispherical photographs were taken to estimate the percentage of canopy openness, leaf area index, percentages of transmitted direct and diffuse light, and duration and frequency of sunflecks. A light index was calculated from the relative proportions of direct and diffuse light transmitted to the understory. For most variables, there were significant differences between seasons, as well as among different gap sizes and under closed canopy. The light index was low (0.25 to 26 of a maximum = 100), even for the largest gaps, indicating a highly shaded light environment, especially beneath closed canopy in the rainy season. Patterns and interactions among factors were analyzed (gaps vs. continuous canopy, gap sizes, location within the gaps, and seasonality) with a mixed effects repeated measures Anova design. Results showed that the amount of light reaching the understory is low in both gaps and closed canopy. However, small but significant differences in light availability existed for both seasonality and magnitude of the perturbations. These differences could contribute to explain the dynamics of tree species regeneration in this forest. The knowledge of the factors conditioning light availability in the understory where tree regeneration begins is crucial in cloud forests because of energetic limitations in this ecosystem, and might be essential for future restoration and conservation plans concerning the preservation of the diversity and integrity of these forests. Rev. Biol. Trop. 64 (4): 1699-1707. Epub 2016 December 01.

Fine root dynamics and its relationship with soil fertility in tropical rainforests of Chocó

Resumen:Las raíces finas juegan un papel importante en la adquisición de agua y minerales del suelo, el balance global del carbono y la mitigación del cambio climático. La dinámica (productividad-PRF y recambio-RRF) de raíces finas es esencial para el ciclo de nutrientes y balance de carbono de los ecosistemas forestales. La disponibilidad de agua y nutrientes determina de manera significativa la PRF y el RRF. Se ha planteado la hipótesis de que la dinámica de raíces finas aumenta con la disponibilidad de los recursos del suelo en bosques tropicales. Para probar esta hipótesis en las selvas tropicales del Chocó (ecosistemas con las más altas tasas de precipitación en el mundo), se establecieron cinco parcelas permanentes de una hectárea en las localidades de Opogodó y Pacurita, donde la PRF y RRF se midieron a 0-10 cm y 10-20 cm de profundidad. La medición de la PRF se realizó por el método de cilindros de crecimiento. La tasa de RRF se midió como la PRF/ biomasa media anual. Además, se midieron los parámetros de fertilidad del suelo (pH, nutrientes y textura) y se evaluó su asociación con PRF y RRF. Se encontró que ambos sitios presentan suelos pobres en nutrientes. Las localidades difieren en características edáficas; Opogodó tiene suelos arenosos y topografía plana, y Pacurita tiene suelos arcillosos, ricos en aluminio y topografía montañosa. En Opogodó la PRF fue (media ± DE) de 6.50 ± 2.62 t/ha.año. En Pacurita la PRF fue 3.61 ± 0.88 t/ha.año. Igualmente, en Opogodó el RRF fue mayor que en Pacurita (1.17 /año y 0.62 /año, respectivamente). El RRF y la PRF fueron mayores en la superficie del suelo (10 cm de profundidad). La PRF y el RRF mostraron correlación positiva con el pH, MO, N total, K, Mg, y arena; mientras que, las correlaciones fueron negativas con la CICE, Al, limo y arcilla. El porcentaje de arena fue el parámetro que mejor explica la variación en la PRF. La tasa negativa de la RRF fue explicada por la disponibilidad de Al. Los resultados evidenciaron un aumento en la dinámica de las raíces finas con la fertilidad del suelo a escala local, lo que sugiere que en selvas tropicales con suelos oligotróficos, las raíces finas tienden a proliferar rápidamente en pequeños parches de suelo ricos en arena y nutrientes.

Abstract:The fine roots play an important role in the acquisition of water and minerals from the soil, the global carbon balance and mitigation of climate change. The dynamics (productivity and turnover) of fine roots is essential for nutrient cycling and carbon balance of forest ecosystems. The availability of soil water and nutrients has significantly determined the productivity and turnover of fine roots. It has been hypothesized that fine roots dynamics increases with the availability of soil resources in tropical forest ecosystems. To test this hypothesis in tropical rainforests of Chocó (ecosystems with the highest rainfall in the world), five one-ha permanent plots were established in the localities of Opogodó and Pacurita, where the productivity and turnover of fine roots were measured at 0-10 cm and 10-20 cm depth. The measurement of the fine root production was realized by the Ingrowth core method. The fine root turnover was measured like fine roots production divided mean annual biomass. In addition, soil fertility parameters (pH, nutrients, and texture) were measured and their association with productivity and turnover of fine roots was evaluated. It was found that the sites had nutrient-poor soils. The localities also differ in soil; Opogodó has sandy soils and flat topography, and Pacurita has clay soils, rich in aluminum and mountainous topography. In Opogodó fine root production was 6.50 ± 2.62 t/ha.yr (mean ± SD). In Pacurita, fine root production was 3.61 ± 0.88 t/ha.yr. Also in Opogodó, the fine root turnover was higher than in Pacurita (1.17 /y and 0.62 /y, respectively). Fine root turnover and production in the upper soil layers (10 cm upper soil) was considerably higher. Productivity and turnover of fine roots showed positive correlation with pH and contents of organic matter, total N, K, Mg, and sand; whereas correlations were negative with ECEC and contents of Al, silt, and clay. The percentage of sand was the parameter that best explained the variations of fine root production. The fine root turnover was negatively explained by soil Al availability. Results suggested the increase of fine root dynamics with soil fertility at a local scale, which also indicates that under the oligotrophic conditions of soils in tropical rainforests, fine roots tend to proliferate rapidly in small patches of soil rich in sand and nutrients. Rev. Biol. Trop. 64 (4): 1709-1719. Epub 2016 December 01.

A living fossil Tetrapus fig wasp (Hymenoptera: Agaoninae) developing in extant Neotropical fig species (Moraceae: Ficus, section Pharmacosycea )

Abstract:It has been assumed that Tetrapus female wasps (Agaonidae s.s.), the pollinators of the figs of the New World, section Pharmacosycea, are mainly characterized by the presence of one mandibular appendange only, and that it is the most ancestral clade of extant Agaonidae s.s., and the males are tetrapodous. The main objective of this work was to study five Tetrapus morphotypes, whose females have two mandibular appendages and the males are hexapodous, their fig host association and phylogenetic position to the family Agaonidae. The question of which group of fig pollinating wasps and associated figs are the sister to the rest of the pollinating agaonids, and figs respectively remain open. I report a group of New World extant Tetrapus morphotypes (Agaonidae: Agaoninae) provisionally assigned to Hexapus subg. nov. in preparation. Currently, Tetrapus appears as the sister taxon to all other fig pollinating taxa. Howeveer, morphologically, ecologically, geographically and historically Hexapus seems to be the ancestral clade of the extant Agaoninae. Hexapus morphotypes develop in fig species of subsection Petenenses (section Pharmacosycea). In the known extant Tetrapus, the females have one mandibular appendage and the males have reduced one or two short-lobe atrophied non-functional midlegs (tetrapodous). Hexapus females have two free mandibular appendages, and the males have five segmented functional mid-legs (hexapodous). Molecularly Hexapus seems to be the ancestral clade of extant Agaoninae; e.g., a Tetrapus sp. of Ficus crassivenosa was placed by other author as the ancestral clade of 101 wasp species, representing 19 worldwide Agaoninae genera, including four Tetrapus species. In Tetrapus sp. of Ficus crassivenosa, the female has two mandibular appendages and the male is hexapodous. The females of T. apopnus and T. delclosi, preserved in Early to mid-Miocene amber from the Dominican Republic, also have two mandibular appendages and the general morphology of extant Hexapus. I suggest that Hexapus stands up as a living fossil and the sister clade of Tetrapus s.s. The presence of extant Hexapus; as well as extant Tetrapus and their fig host species, especially in South America supports a Southern Gondwanaland origin for both of them, but not a trans-Pacific migrating connection with tropical America for section Pharmacosycea (the host of Tetrapus and Hexapus), a long oceanic dispersal, high levels of stem extinction of Tetrapus or Atlantic land connections, as proposed by other authors. However, lastly it has been assumed that figs and their pollinators arose simultaneously in Eurasia during early Tertiary and spread southwards from it. Most of the morphological and molecular studies of the fig biology of Agaoninae and Ficus, did not include Hexapus morphotypes and their fig hosts, and assumed that Tetrapus is the most ancestral clade of the extant fig pollinating wasps. Rev. Biol. Trop. 64 (4): 1721-1735. Epub 2016 December 01.

Resumen:Se ha asumido que las hembras de las avispas Tetrapus (Agaonidae s.s.), las polinizadoras de los higos de la sección Pharmacosycea del Nuevo Mundo, se caracterizan principalmente por la presencia de un solo apéndice mandibular, que es el clado más ancestral de los Agaonidae s.s. existentes y los machos son tetrápodos. El principal objetivo de este trabajo fue estudiar algunos morfotipos de avispas Tetrapus, cuyas hembras poseen dos apéndices mandibulares y los machos tres pares de patas funcionales (hexápodos); su asociación con sus higos hospederos y la posición filogenética en la familia Agaonidae. Cuestiono cuál grupo de avispas polinizadoras de los higos, constituye el grupo hermano de otras avispas polinizadoras de los higos (Agaonidae). Informo sobre un grupo de avispas (Tetrapus: Agaoninae) existentes, provisionalmente asignado a Hexapus subg. nov. en preparación. Morfológica, ecológica, geográfica e históricamente, Hexapus parece ser el clado ancestral de los polinizadores de higos Agaoninae existentes. Los morfotipos de Hexapus se desarrollan en especies de higos de la subsección Petenenses (sección Pharmacosycea). Las hembras de Tetrapus existentes tienen únicamente un apéndice mandibular y los machos tienen uno o dos lóbulos cortos, en lugar de las patas medias y por lo tanto no son funcionales (tetrápodos). Las hembras de Hexapus tienen dos apéndices mandibulares libres y los machos tienen patas medias funcionales con cinco segmentos (hexápodos). Molecularmente, Hexapus parece ser el clado ancestral de los Agaoninae existentes; por ejemplo, una especie de Tetrapus de Ficus crassivenosa fue colocado por otros autores como el clado ancestral de 101 especies de avispas que representan 19 géneros de Agaoninae mundiales, incluidas cuatro especies de Tetrapus. En Tetrapus sp. de Ficus crassivenosa, la hembra tiene dos apéndices mandibulares y el macho es hexápodo. Las hembras de T. apopnus y T. delclosi, descritas del Mioceno Temprano (Burdigaliense), conservadas en ámbar de la República Dominicana, también tienen dos apéndices mandibulares y la morfología general de Hexapus existente. El autor sugiere que Hexapus representa un fósil viviente y es un clado hermano de Tetrapus s.s. La presencia de Hexapus y Tetrapus actuales, y sus higos hospederos, especialmente en Suramérica, sugieren que tienen un origen en la Gondwana meridional del Cretácico. La presencia de Hexapus y Tetrapus en el Nuevo Mundo, no parece apoyar una conexión migratoria a través del Pacífico con América tropical, para los higos de la sección Pharmacosycea (los hospederos de Tetrapus y Hexapus), una amplia dispersión transoceánica, altos niveles de extinción básica de Tetrapus y conexiones terrestres a través del Atlántico, propuesto por otros autores. Sin embargo, últimamente se ha aceptado que los higos y sus polinizadores se originaron simultáneamente en Eurasia, durante el Terciario Primario y se diseminaron hacia el sur. La mayoría de estudios morfológicos y moleculares de biólogos de los Agaoninae y Ficus, no incluyeron morfotipos de Hexapus, o sus especies hospederas de Ficus y aceptadaron que Tetrapus es el clado más ancestral de las avispas polinizadoras de los higos existentes.

Acute lethal effect of the commercial formulation of the insecticides Imidacloprid, Spinosad y Thiocyclam hidrogenoxalate in Bombus atratus (Hymenoptera: Apidae) workers

Resumen:Los efectos de los insecticidas sobre las abejas han cobrado gran atención a nivel mundial, sin embargo, son pocos los estudios sobre el efecto de estos agroquímicos en abejas Neotropicales. Bombus atratus es una especie neotropical, distribuida ampliamente en los Andes y es considerado un polinizador importante de ecosistemas y agroecosistemas altoandinos. Sin embargo, al igual que muchas especies silvestres, se desconoce el efecto de los insecticidas en B. atratus. Teniendo en cuenta lo anterior, el presente trabajo determinó la dosis letal media aguda (DL50) por exposición tópica y oral de las formulaciones comerciales de los insecticidas con los ingredientes activos Imidacloprid, Spinosad y Thiocyclam hidrogenoxalato, ampliamente utilizados para el control de plagas de cultivos importantes en Colombia. Las pruebas DL50 se realizaron a partir de modificaciones de los lineamientos establecidos por la EPPO y OEDE para estas pruebas en Apis mellifera. Se evaluaron 5 dosis para cada insecticida y exposición. Se evaluaron 25 obreras de tamaño medio en cada dosis por duplicado. La mortalidad se registró a las 24, 48 y 72 horas después del experimento. Los datos fueron analizados con el modelo de regresión Probit. Para el Imidacloprid la DL50 tópica y oral fue de 0.048 µg/abeja y 0.010 µg/abeja respectivamente. Para el Thiocyclam hidrogenoxalato la DL50 tópica y oral fue de 0.244 µg/abeja y de 0.056 µg/abeja respectivamente. Para el Spinosad, la DL50 por exposición oral correspondió a 0.28 µg/abeja. No fue posible establecer la DL50 por exposición tópica. A partir del cálculo del Cociente de Riesgo (HQ) e Índice de Toxicidad Relativa, los tres ingredientes activos son altamente tóxicos. Se analiza y discute el riesgo debido al uso de los productos evaluados a partir de la naturaleza química de los insecticidas.

Abstract:The effect of insecticides on bees has gained great attention, however, there are few studies that explore this issue on Neotropical bees. Bombus atratus is a neotropical species broadly distributed in Colombia and is considered an important pollinator of both Andean ecosystems and agroecosystems. However, as for many wild bees species, the effect of insecticides on B. atratus is unknow. In this study we determined the acute median lethal dose (LD50) of commercial formulations of insecticides Imidacloprid, Spinosad and Thiocyclam hydrogen oxalate, widely used in Colombia to control several pests of important crops. The LD50 was carried out by oral and contact routes, following and modifying the EPPO and OECD guidelines to perform LD50 on A. mellifera. We evaluated five doses for each route and insecticide, in a total of 25 medium-size workers for each dose by duplicate. Mortality was registered at 24, 48 and 72 hours after the experiment; and data were analyzed with the Probit regression model. For Imidacloprid, contacts and oral LD50 were 0.048 µg/bee and 0.010 µg/bee, respectively. For Thiocyclam hydrogen oxalate, topical and oral LD50 were 0.244 µg/bee and 0.056 µg/bee, respectively. For Spinosad, the oral LD50 corresponded to 0.28 µg/bee; it was not possible to establish the LD50 for the contact route. The Hazard Quotient (HQ) and Index of Relative Toxicity indicated that all three active ingredients are highly toxic. We discussed the risk of the insecticides use on B. atratus, considering their chemical nature. Rev. Biol. Trop. 64 (4): 1737-1745. Epub 2016 December 01.

Total protein composition of young and adult Biomphalaria alexandrina snails with different compatibilities to Schistosoma mansoni infection

Abstract:Schistosomiasis remains a disease of major global public health concern since it is a chronic and debilitating illness. The widely distributed Schistosoma mansoni that causes intestinal schistosomiasis represents a great threat. Its world-wide distribution is permitted by the broad geographic range of the susceptible species of its intermediate host, Biomphalaria, which serves as an obligatory host for the larval stage, at which humans get infected. The objectives were to identify the proteins responsible for the snails’ compatibility outcome through differentiation between the total proteins among Biomphalaria alexandrina snails at different ages. The work was conducted on snails that differ in age and genetic backgrounds. Four subgroups (F1) from the progeny of self-reproduced susceptible and resistant snails (F0) were studied. Infection rates of these subgroups (young susceptible, adult susceptible, young resistant and adult resistant) were 90 %, 75 %, 40 % and 0 %, respectively. Using Sodium Dodecyl Sulphate Polyacrylamide Gel electrophoresis (SDS-PAGE), differences in protein expression were evaluated between adult and young snails of different subgroups. Dice similarity coefficient was calculated to determine the percentage of band sharing among the experimental subgroups. The results showed that the combination of similarities between age and compatibility status of the snails, lead to the highest similarity coefficient, followed by the combination of similarities of both genetic origin and age, even though they differ in the compatibility status. On the other hand, the differences in the genetic background, age and compatibility status, lead to the least similarity index. It was also found that the genetic background in young snails plays a major role in the determination of their compatibility, while the internal defense system has the upper hand in determining the level of adult compatibility. In conclusion, the findings of the present work highlight the great impact of the snail age in concomitance with the genetics and the internal defense in the determination of B. alexandrina/S.mansoni compatibility. Future works are recommended, as further characterization of the shared protein bands among the studied subgroups is needed to clarify their role in host-parasite relationship. Rev. Biol. Trop. 64 (4): 1747-1757. Epub 2016 December 01.

Resumen:La esquistosomiasis es una enfermedad crónica y debilitante que constituye una problemática de salud pública a nivel mundial. Debido a que Schistosoma mansoni está ampliamente distribuida y a que es el causante de la esquistosomiasis intestinal representa una gran amenaza. Biomphalaria es el hospedero intermedio y obligatorio para el estado larval, presenta una amplia distribución geográfica e infecta al ser humano. El objetivo fue identificar las proteínas responsables del efecto de compatibilidad en caracoles Biomphalaria alexandrina de distintos estadios a través de la diferenciación del total de proteínas en ellos. La investigación se llevó a cabo con caracoles de diferentes edades y antecedentes genéticos. Se estudiaron cuatro subgrupos (F1) de la progenie de caracoles susceptibles y resistentes reproducidos asexualmente (F0). Las tasas de infección de estos subgrupos (juvenil susceptible, adulto susceptible, juvenil resistente, adulto resistente) fueron 90 %, 75 %, 40 % y 0 %, respectivamente. Con la electroforesis en gel de poliacrilamida en presencia de dodecilsulfato sódico (SDS-PAGE) se evaluaron las diferencias en la expresión proteica entre los caracoles juveniles y adultos de los distintos subgrupos. Se calculó el coeficiente de similitud de Dice para determinar el porcentaje de bandas compartidas entre los subgrupos experimentales. Los resultados mostraron que la combinación de similitudes entre la edad y el estado de compatibilidad de los caracoles genera el mayor coeficiente de similitud seguido por el de la combinación de similitudes tanto de la edad como del origen genético aunque varían en el estado de compatibilidad. Por otra parte, las diferencias en los antecedentes genéticos, la edad y el estado de compatibilidad generan el índice de similitud más bajo. También se encontró que el antecedente genético en caracoles juveniles es importante en la determinación de su compatibilidad, mientras que el sistema de defensa interno es el que determina el nivel de compatibilidad en adultos. En conclusión, los resultados de este trabajo resaltan la importancia de la edad del caracol en conjunto con la genética y la defensa interna para determinar la compatibilidad de B. alexandrina/S.mansoni. Se recomienda realizar futuros trabajos así como una mayor caracterización de las bandas proteicas compartidas entre los subgrupos estudiados para esclarecer su papel en la relación hospedero-parásito.

Anaerobic microbiota: spatial-temporal changes in the sediment of a tropical coastal lagoon with ephemeral inlet in the Gulf of Mexico

Abstract:Sulfate-reducing bacteria (SRB) and methanogenic archaea (MA) share common niches in coastal sediments during the terminal phases of the anaerobic mineralization of organic matter. The purpose of this study was to analyze the spatial - temporal variation of SRB and MA in the sediments of a tropical coastal lagoon with ephemeral inlet (La Mancha, Veracruz, Gulf of Mexico) and its relationship with environmental changes. A total of 24 sediment samples were collected during the dry (April, May), rainy (July, September) and Northern (November, February) seasons in the period 2013-2014. Microbiological analyses included the quantification of the viable SRB and MA with different substrates, as well as mineralization experiments to determine the effect of sulfate on acetate oxidation. The analyzed environmental variables in the sediments included: temperature, pH, Eh, salinity, sulfates, H2S, volatile solids, carbohydrates, and granulometric characteristics. Major changes occurred between the dry and rainy seasons. During the dry season, sulfate-reducing abundance was significantly greater with lactate (8.3x105 - 1.2x107 cells / g) and propionate (1.8x105 - 6.6x106 cells / g) as substrates, while the MA that use methanol were dominant (4.2x105 - 9.1x106 cells / g). In contrast, during the rainy season, hydrogenophylic (2.6x105 - 8.3x106 cells/g) and acetoclastic (5.4x105-6.4x106 cells / g) MA increased significantly and SRB decreased in the analyzed substrates. An apparent competition for acetate was observed, with a greater oxidation in the media with sulfates in the dry season (0.06 mM acetate / g sediment / day), and a greater oxidation in the media without sulfates in the rainy season (0.02 mM acetate / g sediment / day). SRB and MA were present throughout the sediment column, however SRB dominated in the first centimeters of the sediment while MA were abundant in deeper layers. In conclusion, SRB and MA together played a role in the mineralization of organic matter in the sediments of La Mancha lagoon, with sulfate-reduction dominating in the dry season (closed inlet) and methanogenesis during the rainy season (open inlet). Changes in rainfall and river input in this lagoon significantly affect salinity and sulfate content, the main factors that regulate the dynamics of SRB and MA in the sediments. Rev. Biol. Trop. 64 (4): 1759-1770. Epub 2016 December 01.

Resumen:Las bacterias sulfatorreductoras (BSR) y las arqueas metanogénicas (AM) comparten nichos comunes en los sedimentos costeros durante las fases terminales de la mineralización anaerobia de la materia orgánica. El objetivo del presente estudio fue analizar la variación espacio-temporal de las BSR y AM en los sedimentos de una laguna costera tropical con una boca efímera (La Mancha, Veracruz, Golfo de México) y su relación con los cambios ambientales. Un total de 24 muestras de sedimentos fueron recolectadas en las temporadas de secas (abril, mayo), lluvias (julio, septiembre) y nortes (noviembre, febrero) en el periodo 2013 - 2014. Los análisis microbiológicos incluyeron la cuantificación de las BSR y AM viables con diferentes sustratos, así como experimentos de mineralización para determinar el efecto de los sulfatos en la oxidación del acetato. Las variables ambientales analizadas en los sedimentos incluyeron la temperatura, pH, Eh, salinidad, sulfatos, H2S, sólidos volátiles, carbohidratos y las características granulométricas. Los principales cambios se presentaron entre las estaciones de secas y lluvias. En la temporada de secas la abundancia sulfatorreductora fue significativamente superior con lactato (8.3x105 - 1.2x107 células / g) y propionato (1.8x105 - 6.6x106 células / g) como sustratos, mientras que las AM que emplean metanol dominaron (4.2x105 - 9.1x106 células / g). Por el contrario, en la época de lluvias aumentaron significativamente las AM hidrogenofílicas (2.6x105-8.3x106 células / g) y acetoclásticas (5.4x105-6.4x106 células / g), disminuyendo las BSR con los sustratos analizados. Se determinó una competencia aparente por el acetato. Su oxidación fue mayor en los medios con presencia de sulfatos en las temporadas de secas (0.06 mM acetato / g sedimento / día), mientras que aumentó en los medios sin sulfatos en la época de lluvias (0.02 mM acetato / g sedimento / día). Las BSR y las AM estuvieron presentes a lo largo de la columna sedimentaria; sin embargo, las BSR dominaron en los primeros centímetros del sedimento y las AM abundaron a mayor profundidad. En conclusión las BSR y AM participaron de manera conjunta en la mineralización de la materia orgánica en los sedimentos de la laguna de La Mancha, dominando la sulfatorreducción en la temporada de secas (boca cerrada) y la metanogénesis en la época de lluvias (boca abierta). Los cambios en el aporte fluvial y la precipitación en esta laguna afectaron significativamente la salinidad y el contenido de sulfatos, siendo los principales factores que regularon la dinámica de las BSR y AM en los sedimentos.

One year weekly dynamics of limnological conditions and phytoplankton in Lake Bonilla, Costa Rica

Abstract:The detailed response of tropical lake phytoplankton to weather variations has been little studied, but it seems that composition varies in response to rain and wind variability over the course of the year. In order to gather more evidence on this variation, the weekly variability of phytoplankton composition was studied in Lake Bonilla, a low land (380 masl) 30 m deep tropical lake, from April 2010 to May 2011. Temperature variation at several depths was recorded automatically, and measurements of dissolved oxygen, water transparency, and nutrients were performed several times during the study period. The lake showed a warm monomictic pattern, with deep mixing occurring during the hemispherical winter, especially after a heavy rain period in December 2010. Phytoplankton was dominated by a few species: a colonial Cyanobacteria (Aphanocapsa sp., functional group F) and two colonial Chlorococcaceae (Botryococcus braunii and Eutetramorus tetrasporus, both in the functional group K). Their relative dominance shifted throughout the year, following changes in water column conditions in response to weather variations. Although changes in main functional groups indicate a shift in resource availability rather than energy, it was clear that attention should also be given to particular species adaptations beyond those used for establishing functional groups. Rev. Biol. Trop. 64 (4): 1771-1781. Epub 2016 December 01.

Resumen:La respuesta detallada del fitoplancton de lagos tropicales a las variaciones climáticas ha sido poco estudiada, sin embargo al parecer la composición de especies varía en respuesta a la variabilidad de la precipitación y de los vientos a lo largo del año. Con el fin de recabar más evidencia de esta variación, se estudió semanalmente la composición del fitoplancton en el lago Bonilla, un lago tropical de zonas bajas (380 msnm), de 30 m de profundidad, entre abril 2010 y mayo 2011. Se registró la temperatura del agua a varias profundidades, y se realizaron mediciones de oxígeno disuelto en la columna de agua, trasparencia del agua y concentración de nutrientes varias veces a lo largo del año de estudio. El lago es monomíctico cálido, con una mezcla profunda durante el invierno hemisférico, especialmente luego de un periodo de fuertes precipitaciones en diciembre 2010. El fitoplancton estuvo dominado por pocas especies: una Cyanobacteria colonial (Aphanocapsa sp., grupo funcional F), y dos Chlorococcaceae coloniales (Botryococcus braunii y Eutetramorus tetrasporus, ambas del grupo funcional K). Sus abundancias relativas cambiaron a lo largo del año, siguiendo los cambios en las condiciones de la columna de agua que es influenciada por variaciones en el tiempo atmosférico. Aunque los cambios en los grupos funcionales indican que hubo un cambio en la disponibilidad de recursos en vez de energía radiante, fue evidente que se debe prestar también atención a las adaptaciones particulares de las especies más allá de las que se usan normalmente para establecer los grupos funcionales.