Revista de Biología Tropical

Legado imperecedero de un botánico costarricense singular: -Jorge Gómez Laurito (1947-2014)-

The life and professional work of the Costa Rican botanist Jorge Gómez Laurito (1947-2014) are here depicted. His 91 scientific publications and 50 new plant taxa (including a family, a genus, and 48 species) represent a long-lasting legacy. The description and publication of Ticodendraceae was his most notable professional achievement. Rev. Biol. Trop. 62 (4): 1261-1272. Epub 2014 December 01.

Aquí se relata la vida y se analiza la obra profesional del botánico costarricense Jorge Gómez Laurito (1947-2014). Su legado más perdurable son 91 publicaciones científicas y 50 taxa nuevos de plantas (una familia, un género y 48 especies). La descripción y publicación de Ticodendraceae fue su mayor logro profesional.

Historia, aplicaciones, aspectos metodológicos y perspectivas para el uso del ADN ambiental (ADNa) en ecosistemas marinos y de agua dulce

Genetic material (short DNA fragments) left behind by species in nonliving components of the environment (e.g. soil, sediment, or water) is defined as environmental DNA (eDNA). This DNA has been previously described as particulate DNA and has been used to detect and describe microbial communities in marine sediments since the mid-1980s and phytoplankton communities in the water column since the early-1990s. More recently, eDNA has been used to monitor invasive or endangered vertebrate and invertebrate species. While there is a steady increase in the applicability of eDNA as a monitoring tool, a variety of eDNA applications are emerging in fields such as forensics, population and community ecology, and taxonomy. This review provides scientist an understanding of the methods underlying eDNA detection as well as applications, key methodological considerations, and emerging areas of interest for its use in ecology and conservation of freshwater and marine environments. Rev. Biol. Trop. 62 (4): 1273-1284. Epub 2014 December 01.

El material genético que liberan los organismos en los componentes no vivos del ecosistema (aire, suelo, agua y sedimentos) recibe el nombre de ADN ambiental (ADNa) (eDNA, por su nombre en inglés). Este ADN previamente definido como ADN particulado ha sido utilizado desde mediados de la década de los ochenta y principios de los noventas para describir la composición de las comunidades microbianas en sedimentos marinos y de comunidades microbianas y fitoplanctónicas en la columna de agua. Recientemente el ADNa es utilizado principalmente para la detección y monitoreo de especies invasoras y en peligro. No obstante, existen múltiples áreas en las que este método puede ser utilizado como por ejemplo en ciencias forenses, ecología de poblaciones y comunidades, y taxonomía. Esta revisión proporciona información sobre esta nueva herramienta molecular, sus actuales y futuras aplicaciones, historia, principales consideraciones metodológicas y áreas emergentes para su uso en ecología y conservación de ambientes marinos y de agua dulce.

Una familia costarricense afectada por la enfermedad de Charcot-Marie-Tooth, debido a la mutación p.thr124Met en la proteína mielina cero (MPZ) compartida con el haplotipo belga

The p.Thr124Met mutation in the myelin protein zero (MPZ) causes the Charcot-Marie-Tooth disease type 2J, a peripheral neuropathy with additional symptoms as pupillary alterations and deafness. It was observed in several families around the world originating e. g. from Germany, Belgium, Japan, Italy and North America. Here we report Central American patients originating from a family in Costa Rica carrying this mutation. Clinical, electrophysiological and molecular analysis of patients and controls were performed, including gene and linked markers´ sequencing. Carriers share almost the entire haplotype with two non related Belgian CMT patients. As a result of the haplotype analysis, based on ten markers (seven SNPs, two microsatellites and an intronic polyA stretch), the founder effect hypothesis for this allele migration is suggestive. Rev. Biol. Trop. 62 (4): 1285-1293. Epub 2014 December 01.

La mutación p.thr124Met en la proteína mielina cero (MPZ) causa la enfermedad de Charcot-Marie-Tooth tipo 2J, una neuropatía periférica con síntomas adicionales como alteraciones pupilares y sordera. Se ha observado en varias familias alrededor del mundo, originarias de Alemania, Bélgica, Japón, Italia y Norteamérica, entre otras. Aquí reportamos a pacientes centroamericanos provenientes de Costa Rica que acarrean esta mutación. Se realizaron análisis clínico, electrofisiológico y molecular de pacientes y controles, incluyendo secuenciación del gen y de marcadores ligados a éste. Estos pacientes comparten casi por completo el haplotipo con dos pacientes belgas no emparentados. Como resultado del análisis de los haplotipos, basado en diez marcadores (siete SNPs, dos microsatélites y un elemento poli-A intrónico), se sugiere que se ha dado un efecto fundador en la migración de este alelo.

Bacterias epífitas y endófitas que promueven el crecimiento de plantas etnomedicinales en los bosques subtropicales de Meghalaya, India

The present study was aimed to investigate the endophytic and epiphytic bacteria associated with selected ethnomedicinal plants from the pristine subtropical forests of Meghalaya and analyse them for plant growth promotion and antagonistic ability. This study is an attempt to explore plant associated bacteria which are beneficial to host plants, and thus aid in the conservation of ethnomedicinal plants of the studied subtropical forests, which are dwindling due to exploitation. The plant growth promotion parameters like indole acetic acid (IAA) production, mineral phosphate solubilisation, acid phosphatase activity, presence of 1-aminocyclopropane-1-carboxylic acid deaminase (ACC) gene, nitrogen fixation, cellulose digestion, chitin and pectin degradation were screened among the isolates. The study revealed significant differences in bacterial population not only between the epiphytic and endophytic microhabitats, but also amongst the host plants. Out of the 70 isolated plant associated bacteria, Bacillus sp., Serratia sp., Pseudomonas sp., Pantoea sp., and Lysinibacillus sp. showed potent plant growth promotion properties. Bacillus siamensis C53 and B. subtilis cenB showed significant antagonistic activity against the tested pathogens. This study indicated the isolates inhabiting the plants prevalent in the subtropical sacred forests could be explored for use as plant growth promoters while practising the cultivation and conservation of ethnomedicinal plants. Rev. Biol. Trop. 62 (4): 1295-1308. Epub 2014 December 01.

El presente estudio tuvo como objetivo investigar las bacterias endófitas y epífitas asociadas con plantas medicinales seleccionadas de los bosques subtropicales prístinos de Meghalaya, para estimular el crecimiento de plantas y la capacidad antagónica. Este estudio es un intento de explorar las plantas asociadas a bacterias que benefician a la planta hospedera, y así ayudar en la conservación de plantas medicinales de los bosques subtropicales estudiados, los cuales son cada vez más escasos debido a la explotación. Los parámetros de promoción de crecimiento de las plantas, tales como: índice de producción de ácido acético (IAA), solubilización de fosfato mineral, actividad de la fosfatasa ácida, presencia del gen 1-aminociclopropano-1-ácido carboxílico desaminasa (ACC), fijación de nitrógeno, digestión de celulosa, quitina y pectina fueron seleccionados entre los aislamientos. El estudio reveló diferencias significativas en la población bacteriana, no sólo entre los microhábitats epífitos y endófitos, sino también entre las plantas hospederas. De las 70 bacterias aisladas de plantas asociadas, Bacillus sp., Serratia sp., Pseudomonas sp., Pantoea sp. y Lysinibacillus sp. mostraron potentes propiedades estimulantes del crecimiento vegetal. Bacillus C53 siamensis y B. subtilis cenB mostraron actividad antagónica significativa contra los patógenos probados. Este estudio indicó que los aislamientos que habitan en las plantas predominantes en los bosques sagrados subtropicales podrían explorarse para su uso como promotores del crecimiento vegetal, mientras se practica el cultivo y conservación de plantas medicinales.

Variación espacio-temporal de la comunidad de macroinvertebrados epibiontes en las raíces del mangle rojo Rhizophora mangle (Rhizophoraceae) en la laguna costera de La Mancha, Veracruz, México

La Mancha lagoon is connected to the Gulf of Mexico through an estuarine ephemeral inlet, a sand bar, which opens during the rainy season and closes during the late fall and the winter storm season. As the lagoon fills up with the permanent stream flow into its Southern part, the water level increases and the sand bar opens up, releasing huge volumes of water into the ocean and leaving the previously flooded intertidal zone exposed to drying. In this study, we described the spatial and temporal variations of structure and composition of the community living on the surface of red mangrove prop roots, related to the hydrodynamic of the estuarine inlet. Four red mangrove prop roots were collected every three months, over an annual period, at ten sampling stations. Water temperature, salinity, dissolved oxygen, water depth and transparency were also measured at each sampling event. To describe the identity, abundance, biomass, and specific richness of epibiont coverage on the prop roots, measurements were taken at 10cm intervals (herein called horizons). A total of 59 632 specimens and a total biomass of 172g/cm2 were registered, and a maximum of eleven horizons presented at least one species of epibionts. Two species of polychaetes, 12 of mollusks and 14 of crustaceans were identified, with Mytilopsis leucophaeata as the most abundant, Ficopomatus miamiensis as the most common and Crassostrea rhizophorae with the highest contribution in biomass. Sampling effort was assessed using species accumulation curves, resulting that the efficiency was, in general, greater than 90% of the richness predicted by asymptotic models. The hydrodynamics of the estuarine inlet had a great influence on the environmental conditions of the lagoon and on the spatial and temporal variation of the epibiont community: (a) when the inlet is open, there is a North-South gradient in environmental parameters (b) when the inlet is closed and the water level increases, the epibionts especially the pioneer species F. miamiensis, occupied the highest horizons of prop roots, and (c) the abundance, biomass and richness of epibionts increased towards the deeper and less saline Southern part of the lagoon, as well as on permanently submerged horizons, and during the seasonal closure of the inlet. Variations in depth are determined by the hydrodynamic behavior of the estuarine inlet, suggesting that these factors are major biodiversity drivers of the epibiont community at La Mancha. Rev. Biol. Trop. 62 (4): 1309-1330. Epub 2014 December 01.

La laguna de La Mancha está conectada al Golfo de México a través de una boca estuarina efímera, una barra arenosa, la cual se abre durante la época de lluvias y se cierra durante el otoño y la temporada de vientos invernales. Cuando la laguna se llena con la entrada de agua proveniente de un arroyo permanente, ubicado en la parte sur, el nivel del agua se incrementa y la barra arenosa se abre, descargando grandes volúmenes de agua hacia el océano y dejando expuesta a la desecación la zona intermareal previamente inundada. En este estudio, se describen las variaciones espacio-temporales de la estructura y composición de la comunidad de epibiontes que vive en la superficie de las raíces del mangle rojo,y su relación con la dinámica hidrológica de la boca estuarina. Se recolectaron cuatro raíces trimestralmente, durante un año, en diez estaciones de muestreo. También se midió la temperatura del agua, salinidad, oxígeno disuelto, profundidad y transparencia en cada muestreo. Se determinó la abundancia, la biomasa y la riqueza específica, a lo largo de las raíces en segmentos verticales de 10cm llamados horizontes. Se registraron un total de 59 632 especímenes y una biomasa total de 172g/cm2, y un máximo de once horizontes presentaron al menos una especie de epibionte. Se identificaron dos especies de poliquetos, 12 de moluscos y 14 de crustáceos, siendo Mytilopsis leucophaeata la más abundante, Ficopomatus miamiensis la más común y Crassostrea rhizophorae la de mayor contribución a la biomasa. Se evaluó la eficiencia del muestreo mediante curvas de acumulación de especies, resultando que la eficiencia fue, en general, >90% de la riqueza estimada por modelos asintóticos. La hidrodinámica de la boca estuarina tuvo gran influencia en las condiciones ambientales de la laguna y en las variaciones espacio-temporales de la comunidad de epibiontes: (a) cuando la boca estuarina está cerrada son más claros los gradientes ambientales norte-sur, (b) cuando la boca estuarina se cierra y el nivel de inundación se incrementa, los epibiontes, especialmente la especie pionera F. miamiensis, ocupan los horizontes más altos de las raíces, (c) la abundancia, biomasa y riqueza específica de los epibiontes se incrementó hacia las partes más profundas del sur de la laguna, así como en los horizontes permanentemente inundados, y durante el cierre estacional de la boca estuarina. Las variaciones en la profundidad dependen de la dinámica de la boca estuarina, sugiriendo que estos factores son los principales parámetros que estructuran a la comunidad de epibiontes de La Mancha.

Efecto de la astaxantina en la resistencia al estrés físico y químico de los langostinos jóvenes de Macrobrachium nipponense (Decapoda: Palaemonidae)

In recent years, the use of new scientific techniques has effectively improved aquaculture production processes. Astaxanthin has various properties in aquacultureand its antioxidant benefits have been closely related to stress resistance; besides, it is an essential factor for growth in many crustaceans and fish. The objective of this study was to evaluate the resistance of prawn (Macrobrachium nipponense) fed diets containing different amounts of astaxanthin (AX) to the shock and stress of differentphysicochemical environments. A 70-day trial was conducted to evaluate the effect of supplementation of a source of astaxanthin (Carophyll Pink, 10% astaxanthin, w/w, Hoffman-La Roche, Switzerland) at various levels in the diet of M. nipponense juveniles. Four dry diets were prepared: AX0 without astaxanthin, AX50 with 50mg/kg, AX100 with 100mg/kg, and AX150 with 150mg/kg astaxanthin. The feeding trial was conducted in a recirculation water system consisting of 12 fiberglass tanks (1 000L) used for holding prawns. Three replicate aquaria were initially stocked with 36org/m² per tank. During the trial, prawns were maintained on a 12:12-h light:dark photoperiod with an ordinary incandescent lamp, and the water quality parameters were maintained as follows: water temperature, 25-26°C; salinity, 1g/L; pH, 8.5-8.8; dissolved oxygen, 6.0-6.5mg/L; and ammonia-nitrogen, 0.05mg/L. Incorporation of AX, production output, and physiological condition were recorded after 10 weeks of feeding. At the end of the growing period, the prawns were exposed to thermal shock (0°C), ammonia (0.75mg/L), and reduced oxygen (0.5mg/L). The time to lethargyand the time to complete death of the prawns were recorded. The results showed that control prawns had the shortest time to lethargy and death compared with prawns subjected to the other treatments. The results of this study have shown that the amount of muscle tissue and gill carotenoids in prawn fed with an AX150 diet showed greater reduction than those exposed to other treatments. It is possible that higher levels of astaxanthin in the body under oxygen reduction stress can be beneficial forprawns. These results suggest that male prawns showed lethargy earlier than females, and the percentage of carotenoid reduction in muscle and gill tissues was higher inmales. Rev. Biol. Trop. 62 (4): 1331-1341. Epub 2014 December 01.

En años recientes, la utilización de nuevas técnicas científicas ha tenido un efecto importante en mejorar los procesos de producción en acuicultura. La astaxantina tiene varias propiedades en la acuicultura y sus propiedades antioxidantes se encuentran estrechamente relacionadas con la resistencia al estrés. La astaxantina en muchos crustáceos y peces es un factor esencial para el crecimiento. El objetivo de este estudio fue evaluar la resistencia del langostino (Macrobrachium nipponense) alimentado con dietas conteniendo diferentes cantidades de astaxantina (AX), bajo diferentes condiciones de estrés ambiental. Un ensayo de 70 días fue llevado a cabo para evaluar el efecto de la suplementación de fuentes de astaxantina (Carophyll Pink, 10 % astaxanthin) en varios niveles en la dieta de jóvenes de M. nipponense. Cuatro dietas fueron preparadas: AX0 sin astaxantina, AX50 con 50mg/kg, AX100 con 100mg/kg y AX150 con 150mg/kg de astaxantina. Los ensayos de alimentación fueron conducidos en un sistema de recirculación de agua consistente en 12 estanques de fibra de vidrio (1 000L). Tres replicas fueron sembradas con 36org/m2 por tanque. Durante el experimento los langostinos fueron mantenidos con un fotoperiodo de 12:12 luz:oscuridad con lámparas incandescentes y los parámetros de la calidad del agua fueron mantenidos a 25-26°C la temperatura, 1 g/L la salinidad, 8.5-8.8 el pH, 6.0-6.5 mg/L el oxígeno y 0.05mg/L el nitrógeno amoniacal. La incorporación de la astaxantina, producción y condiciones fisicoquímicas fueron registradas después de 10 semanas de alimentación. Al final del periodo de crecimiento, los langostinos fueron expuestos a un shock térmico (0°C), amonio (0.75mg/L) y reducción de oxígeno 0.5 mg/L. El tiempo de letargia y el tiempo de muerte fueron registrados. Se encontró que la dieta con la mayor concentración de astaxantina (150mg/kg) presentó el mayor tiempo de letargia y la mayor concentración en branquias y músculo en el langostino M. nipponense.

Impacto de la talla mínima de captura en la viabilidad de la población de Strombus gigas (Mesogastropoda: Strombidae) en Quintana Roo, Mexico

The queen conch Strombus gigas represents one of the most important fishery resources of the Caribbean but heavy fishing pressure has led to the depletion of stocks throughout the region, causing the inclusion of this species into CITES Appendix II and IUCNs Red-List. In Mexico, the queen conch is managed through a minimum fishing size of 200mm shell length and a fishing quota which usually represents 50% of the adult biomass. The objectives of this study were to determine the intrinsic population growth rate of the queen conch population of Xel-Ha, Quintana Roo, Mexico, and to assess the effects of a regulated fishing impact, simulating the extraction of 50% adult biomass on the population density. We used three different minimum size criteria to demonstrate the effects of minimum catch size on the population density and discuss biological implications. Demographic data was obtained through capture-mark-recapture sampling, collecting all animals encountered during three hours, by three divers, at four different sampling sites of the Xel-Ha inlet. The conch population was sampled each month between 2005 and 2006, and bimonthly between 2006 and 2011, tagging a total of 8 292 animals. Shell length and lip thickness were determined for each individual. The average shell length for conch with formed lip in Xel-Ha was 209.39±14.18mm and the median 210mm. Half of the sampled conch with lip ranged between 200mm and 219mm shell length. Assuming that the presence of the lip is an indicator for sexual maturity, it can be concluded that many animals may form their lip at greater shell lengths than 200mm and ought to be considered immature. Estimation of relative adult abundance and densities varied greatly depending on the criteria employed for adult classification. When using a minimum fishing size of 200mm shell length, between 26.2% and up to 54.8% of the population qualified as adults, which represented a simulated fishing impact of almost one third of the population. When conch extraction was simulated using a classification criteria based on lip thickness, it had a much smaller impact on the population density. We concluded that the best management strategy for S. gigas is a minimum fishing size based on a lip thickness, since it has lower impact on the population density, and given that selective fishing pressure based on size may lead to the appearance of small adult individuals with reduced fecundity. Furthermore, based on the reproductive biology and the results of the simulated fishing, we suggest a minimum lip thickness of ≥15mm, which ensures the protection of reproductive stages, reduces the risk of overfishing, leading to non-viable density reduction. Rev. Biol. Trop. 62 (4): 1343-1352. Epub 2014 December 01.

El caracol rosa Strombus gigas representa una de las especies de mayor importancia pesquera en el Caribe, pero la creciente presión pesquera ha llevado al deterioro de las poblaciones en toda la región, llevando a la inclusión de esta especie en el apéndice II de CITES y la lista roja de UICN. En México, el caracol rosa se maneja con una talla mínima de pesca de 200mm longitud de heliconcha y una cuota pesquera que generalmente representa el 50% de la biomasa adulta. Este estudio tuvo como objetivos determinar la tasa intrínseca de crecimiento poblacional del caracol rosa en Xel-Ha, Quintana Roo, México, y evaluar el efecto de un esfuerzo pesquero regulado, simulando la extracción del 50% de la biomasa adulta. Utilizamos tres diferentes criterios de talla mínima para la pesca, para evaluar el efecto de ésta sobre la densidad de la población y discutimos las implicaciones bilógicas asociadas. Los datos demográficos se obtuvieron mediante un muestreo de marcaje-recaptura, recolectando todos los animales presentes, durante tres horas, con tres buzos, en cuatro sitios diferentes de la caleta. En 2005 los muestreos fueron mensuales, y de 2006 a 2011 bimensuales, marcándose un total de 8 292 caracoles. Se obtuvo la longitud de heliconcha y grosor de labio de cada individuo. La talla media de caracoles con labio formado fue de 209.39±14.18mm y la mediana de 210mm. La mitad de los caracoles con un labio formado presentaban tallas de 200mm a 219mm longitud de heliconcha. Suponiendo que la presencia del labio es un indicador de madurez sexual, se puede concluir que muchos animales alcanzan la madurez sexual a tallas mayores de 200mm longitud de heliconcha y deberían ser considerados inmaduros. La estimación de la abundancia relativa y densidad de adultos varía ampliamente según el criterio de clasificación utilizado. Cuando se aplicó una talla mínima de 200mm longitud, el 26.2% a 54.8% de la población calificó como adulta, correspondiendo a un impacto pesquero simulado de casi un tercio de la población. El impacto fue menor simulando la extracción de adultos, utilizando un criterio de clasificación basado en grosor de labio. Se concluyó que la mejor estrategia de manejo para S. gigas es una talla mínima basada en el grosor de labio, ya que esta medida reduce el impacto sobre la densidad poblacional, y por el otro lado disminuye la presión selectiva sobre la talla, lo cual conduce a la aparición de individuos pequeños con fecundidad inferior. Más allá, basado en la biología reproductiva y los resultados de las simulaciones, recomendamos un grosor de labio mínimo de ≥15mm para la pesca, ya que esta medida asegura la protección de las etapas reproductivas y reduce el riesgo de sobrepesca, el cual llevaría a reducciones no viables de la densidad poblacional.

Cambios morfológicos en gametos del barbo tigre Puntius tetrazona (Cypriniformes: Cyprinidae) e implementación de la fertilización in vitro

The production of ornamental fishes represents an economic activity of a growing number of Mexican families. Nevertheless, the reproduction of fish in captivity is one of the complications faced by farmers. This study was set up to: (i) evaluate the morphological and functional changes induced by hydration in the gametes of fish tiger barb (Puntius tetrazona; 240 samples) at tree times after hydration (10, 20 and 30s) with classic spermograms (volume, sperm concentration, viability, motility, and normal morphology); and (ii) evaluate the implementation of in vitro fertilization based on the ovulation rate, the percentage of fertilization and hatching, and the larval numbers obtained after 72 hours. The average volume of milt was 3.0±0.7μL, and the minimum, maximum and average concentration of sperm was 44.4x10(6) spz/mL, 52.3x10(6)spz/mL, and 48.1±5.9x10(6)spz/mL, respectively. The viability and motility of the sperm was 84.6±3.2% and 81.5±2.2%, respectively. The diameter of the sperm with/without water contact was 2.1±0.6μm and 3.8±1.0μm (p<0.05); the largest diameter was recorded 30 seconds after the contact with water. For oocytes, the smaller and larger diameters were recorded at 10 and 30s, respectively (both with/without water contact); the oocytes diameters after 10 and 30 seconds of contact with water were 1.11 and 1.55mm, respectively. A higher ovulation rate was recorded using the in vitro fertilization: 250±50 oocytes versus 28±09 oocytes (during natural fertilization; p<0.05). Nevertheless, fertilization and hatching rates were higher for the natural fertilization (80 and 60%, respectively). Considering the number of larvae obtained after 72 hours, our results showed a higher value for the in vitro fertilization (75±18 compared to 13.4±12 of the natural fertilization; p<0.05). We propose this fish as a model for other ornamental fishes of commercial interest. Our results demonstrate that the in vitro fertilization is a very high viable option to optimize and maximize resources; besides, the reproduction management optimization under controlled conditions may enhance wild fish stocks preservation. Rev. Biol. Trop. 62 (4): 1353-1363. Epub 2014 December 01.

El objetivo del presente estudio fue conocer las características de los gametos de Puntius tetrazona (n=240), los cambios morfológicos a partir de su activación mediante espermogramas cásicos y por otro lado, se evaluó la implementación de la fertilización in vitro a partir de la tasa ovulatoria, el % de fertilización y eclosión y el número de larvas vivas a las 72h. El volumen promedio de semen fue de 3.0±0.7µL. La concentración espermática mínima, máxima y promedio fue 44.48x10(6)spz/mL, 52.3x10(6)spz/mL y 48.1±5.9x10(6)spz/mL, respectivamente. La viabilidad promedio fue de 84.68±3.27%. La motilidad promedio fue 81.53±2.28%. El diámetro de los espermatozoides fluctuó entre 2.16±0.2 y 2.79±0.3µm; 3.84±0.3 y 4.86±0.31µm sin y con contacto con el agua respectivamente, con diferencias significativas. El diámetro mayor fue a los 30s en contacto con el agua. Los ovocitos de menor y mayor diámetro se registraron a los diez y 30s sin y con contacto con el agua respectivamente. Los diámetros de los ovocitos en diez y 30s en contacto con el agua fluctuaron entre 1.11 y 1.55mm respectivamente. La mayor tasa ovulatoria fue en la fertilización in vitro con 250±50 ovocitos frente a 28±09 de la natural, con diferencias significativas. Los porcentajes de fertilización y eclosión fueron más elevados en la fertilización natural con 80% y 60% respectivamente. Se registraron 75±18 larvas a las 72 horas en el grupo in vitro comparado con 13.4±12 larvas de la fertilización natural. Con lo anterior, la técnica que permitió mayor cantidad de larvas fue la de fertilización in vitro.

Cariotipo de la especie invasora Pterois volitans (Scorpaeniformes: Scorpaenidae) de Isla Margarita Island, Venezuela

The genus Pterois includes nine valid species, native to the Red Sea and Indian Ocean throughout the Western Pacific. P. volitans and P. miles are native to the Indo-Pacific, and were introduced into Florida waters as a result of aquarium releases, and have been recently recognized as invaders of the Western Atlantic and Caribbean Sea (Costa Rica to Venezuela). Thus far, cytogenetic studies of the genus Pterois only cover basic aspects of three species, including P. volitans from Indo-Pacific Ocean. Considering the lack of more detailed information about cytogenetic characteristics of this invasive species, the objective of the present study was to investigate the basic and molecular cytogenetic characteristics of P. volitans in Venezuela, and compare the results with those from the original distribution area. For this, the karyotypic characteristics of four lionfish caught in Margarita Island, Venezuela, were investigated by examining metaphase chromosomes by Giemsa staining, C-banding, Ag-NOR, and two-colour-Fluorescent in situ hybridization (FISH) for mapping of 18S and 5S ribosomal genes. Comparing the sequences of the 16S gene of the specimens analyzed, with sequences already included in the Genbank, we corroborated that our specimens identified as P. volitans are in fact this species, and hence exclude the possibility of a misidentification of P. miles. The diploid number was 2n=48 (2m+10sm+36a) with FN=60. Chromosomes uniformly decreased in size, making it difficult to clearly identify the homologues except for the only metacentric pair, and the pairs number two, the largest of the submetacentric series. C-banding revealed only three pairs of chromosomes negative for C-band, whereas all remaining chromosomes presented telomeric and some interstitial C-positive blocks. Only two chromosomes were C-banding positive at the pericentromeric regions. Sequential staining revealed Ag-NOR on the tips of the short arms of chromosome pair number two and the FISH assay revealed that 18S rDNA and 5S rDNA genes are co-located on this chromosome pair. The co-localization of 5S rDNA and 45S rDNA is discussed. Both constitutive heterochromatin and NOR location detected in samples examined in this study, differ from those reported for P. volitans in previous analysis of specimens collected in Indian Ocean (Java), suggesting the occurrence of chromosome microrearrangements involving heterochromatin during the spread of P. volitans.Rev. Biol. Trop. 62 (4): 1365-1373. Epub 2014 December 01.

El género Pterois contiene nueve especies válidas, nativas del Mar Rojo y el Océano Índico en el Pacífico occidental. P. volitans y P. miles son nativas del Indo-Pacífico, y fueron introducidas en las aguas de Florida como resultado de la liberación de peces confinados en acuario y han sido reconocidas recientemente como invasoras en el Atlántico Occidental y Mar Caribe (Costa Rica hasta Venezuela). Los estudios citogenéticos realizados hasta ahora en el género Pterois cubren solamente aspectos básicos de tres especies que incluyen a P. volitans del océano Indo-Pacífico. Debido a la ausencia de información detallada sobre las características cromosómicas de esta especie invasora, el objetivo del presente estudio fue investigar las características citogenéticas en ejemplares de Venezuela mediante técnicas convencionales y moleculares y comparar los resultados con los reportados para el área de distribución original. Para ello, se investigaron las características cariotípicas mediante tinción con Giemsa, bandeo-C, impregnación con Nitrato de Plata (Ag-NOR) e hibridación fluorescente in situ (FISH) dual para localizar los genes ribosomales 18S rDNA y 5S rDNA en cuatro ejemplares de pez león capturados en la Isla Margarita, Venezuela. La comparación de secuencias del gen 16S de los especímenes analizados con secuencias ya incluidas en el Genbank permitieron corroborar la identificación de P. volitans excluyendo así la posibilidad de una identificación errónea de P. miles. El número diploide fue 2n=48 (2m+10sm+36a) con un FN=60. Los cromosomas presentaron tamaños que disminuyen de manera uniforme dificultando la identificación de homólogos, excepto el único par metacéntrico y el par cromosómico número 2. El bandeo-C reveló tres pares de cromosomas bandas-C negativos, mientras que los restantes presentaron bloques bandas-C positivos en posición telomérica y, en algunos casos, intersticial. Sólo dos cromosomas mostraron bandas-C pericentroméricas. La tinción secuencial reveló las Ag-NOR localizadas en los extremos de los brazos cortos del par número dos y el ensayo FISH demostró que los genes 18S rDNA y 5S rDNA se localizan en ese mismo par. Se discute la co-localización de los genes 5S rDNA y 18S rDNA. La distribución de la heterocromatina constitutiva y localización de las NORs en los peces examinados difirió de la reportada para ejemplares de P. volitans del Océano Índico (Java), sugiriendo que durante la propagación de P. volitans han ocurrido reorganizaciones cromosómicas que involucran la heterocromatina.

New leafhopper species of Jikradia from Mesoamerica with new records, revised key to species, distribution, origin, and checklist (Hemiptera: Cicadellidae: Coelidiinae: Teruliini)

The following four new species of leafhoppers are described and illustrated: Jikradia dentata n. sp. and J. trispinata n. sp. from Guatemala, J. variabilis n. sp. from Belize, and J. exilis n. sp. from Costa Rica. Jikradia basipendula Nielson and J. krameri Nielson are new records for Guatemala. Belize is a new record for the genus. A record of the first introduction of the genus in the Old World is reviewed. A revised key to the known species is provided with a review of its possible origin. A checklist of all known species is also given. Rev. Biol. Trop. 62 (4): 1375-1383. Epub 2014 December 01.

Las siguientes cuatro nuevas especies de chicharritas son descritas e ilustradas: Jikradia dentata n. sp. y J. trispinata n. sp. de Guatemala, J. variabilis n. sp. de Belice, y J. exilis n. sp. de Costa Rica. Jikradia basipendula Nielson y J. krameri Nielson son nuevas especies reportadas para Guatemala. El género Jikradia es un nuevo registro para Belice. Un registro de la primera introducción del género en el Viejo Continente es revisado. Se presenta una clave revisada de las nuevas especies con una revisión de su posible origen. También se presenta una lista revisada de todas las especies conocidas.

Clave para la determinación de exuvias pupales de los quironómidos (Diptera: Chironomidae) de ríos altoandinos tropicales

. The Chironomidae is a cosmopolitan family of Nematoceran flies with more than 20 000 species described. However the diversity of genera and species of the family in the Andean region beyond the 2 000m.a.s.l are scarcely known. We conducted faunal surveys and biomonitoring research in different streams of Colombia, Ecuador and Peru from May 2005 to October 2011. Based on specimens collections, and a taxonomic key was developed to identify pupae and pupal exuviae of 46 genera of midges (Diptera, Chironomidae) collected from streams at high altitude areas on the Andean tropical mountains. We included illustrations and brief taxonomic descriptions for all genera, of which several ones have not yet been formally described; in this latter case we used the nomenclature of Roback & Coffman (1983). For two genera, Cricotopus and Genus 1, keys to the most common morphospecies were provided. Results showed that in this area the chironomid assemblages are dominated by the members of the subfamily Orthocladiinae (22 genera) followed by the Chironominae (13). Six genera of Tanypodinae were identified, while only three and two genera were present from subfamilies Podonominae and Diamesinae. This key may be very useful for both studies about drift in streams, and for biomonitoring purposes. Rev. Biol. Trop. 62 (4): 1385-1406. Epub 2014 December 01.

Chironomidae es una familia cosmopolita de dípteros nematóceros que comprende más de 20 000 especies descritas. Sin embargo, la diversidad de géneros y especies presentes en la región andina del Neotrópico es poco conocida. Por tal motivo se desarrolló una clave taxonómica para identificar las pupas y exuvias pupales de 46 géneros de la familia Chironomidae presentes en ríos de alta montaña ubicados en la cordillera de los Andes por encima de los 2 000msnm. Se utilizó material de colección obtenido de levantamientos faunísticos y estudios de biomonitoreo en diferentes ríos y quebradas de Colombia, Ecuador y Perú. La clave incluye ilustraciones y breves descripciones taxonómicas de todos los géneros incluyendo algunos que aún no han sido descritos formalmente. Para estos últimos se siguió la nomenclatura usada por Roback & Coffman (1983). Para los géneros Cricotopus y Género 1 se incluyen claves para la determinación de las morfoespecies más comunes. En el ensamblaje de quironómidos de la región altoandina domina la subfamilia Orthocladiinae (22 géneros) seguida por Chironominae (13 géneros), patrón que contrasta con la dominancia de Chironominae en las zonas de menor altura de la región Neotropical. Se encontraron seis géneros pertenecientes a la subfamilia Tanypodinae, mientras que para Podonominae y Diamesinae estuvieron presentes tres y dos géneros respectivamente. Esta clave podría llegar a ser muy útil en estudios de la deriva y programas de biomonitoreo de los ríos altoandinos neotropicales.

Abundancia relativa, estructura poblacional, preferencia de hábitat y patrones de actividad del tapir centroamericano Tapirus bairdii (Perissodactyla: Tapiridae), en la Selva de Los Chimalapas, Oaxaca, México

Bairds tapir (Tapirus bairdii) is endangered primarily because of habitat loss and fragmentation, and overhunting throughout its distribution range. One of the priority land areas for the conservation of this species is the Northern part of its range in the Chimalapas forest, Oaxaca. The aim of this research was to determine the relative abundance, population structure, habitat preferences and activity patterns of Baird´s tapir (Tapirus bairdii) in the Chimalapas forest, Oaxaca, Mexico, through the non-invasive technique of camera-trap sampling. A total of five sampling sessions were undertaken among 2009-2013, and used a total of 30 camera-traps in each period. The determinant factor of the sampling design was the hunting between two study areas. A total sampling effort of 9 000 trap-days allowed to estimate an index of relative abundance (IRA) of 6.77 tapir photographs/1 000 trap-days (n=61). IRA varied significantly between sampling stations (Mann-Whitney, p<0.01). The frequency of Baird´s tapir photos was higher in the dry season in tropical rain forest without hunting (x², p<0.5). In the rainy season, the tropical rain forest and secondary vegetation habitats showed higher photo frequency than expected from random (x², p<0.5). Considering population structure, a 95.08% of adult animals was obtained in photographic records (n=58). Three types of activity pattern were observed, with more nocturnal records (88.33%; Kruskal-Wallis, p<0.05). The Chimalapas forest appears to be the second most important terrestrial priority ecoregion, just after the Mayan Forest (Campeche, Chiapas, Quintana Roo), for the conservation of tapir populations, not only for Mexico but also for Central America. Rev. Biol. Trop. 62 (4): 1407-1419. Epub 2014 December 01.

El tapir centroamericano (Tapirus bairdii) está en peligro de extinción debido principalmente a la pérdida y fragmentación de su hábitat, y a la cacería sin control en toda su área de distribución. Una de las regiones terrestres prioritarias para la conservación de esta especie en la zona norte de su distribución se encuentra en la Selva de los Chimalapas, Oaxaca. Por lo que el objetivo de la presente investigación fue determinar la abundancia relativa, estructura poblacional, preferencia de hábitat y patrones de actividad del tapir centroamericano (Tapirus bairdii) en la Selva de los Chimalapas, Oaxaca, México, mediante el uso de cámaras trampa. Se realizaron cinco periodos de muestreo fotográfico entre 2009 y 2013 con un total de 30 cámaras trampa en cada periodo. El factor de diseño fue la intensidad de caza entre dos sitios. Con un esfuerzo total de muestreo de 9 000 días/trampa se estimó un índice de abundancia relativa (IAR) de 6.77/1 000 trampas-noche (n=61), variando significativamente entre estaciones de muestreo (Mann-Whitney, p<0.01). Durante la temporada de secas, los tapires fueron más abundantes y utilizaron con mayor intensidad el bosque tropical perennifolio sin cacería (x², p<0.5). Mientras que en la temporada de lluvia, el bosque tropical perennifolio con cacería y la vegetación secundaria con cacería fueron los hábitat significativamente más utilizados que lo esperado (x², p<0.5). Con respecto a la estructura poblacional se obtuvo un 95.08% de registros fotográficos de animales adultos (n=58). Se registraron tres tipos de patrones de actividad para la especie, siendo el patrón nocturno el que presentó mayor porcentaje de registros; 88.33% (Kruskal-Wallis, p<0.05). Finalmente, con base al número de registros fotográficos y a los resultados obtenidos es posible considerar a la Selva de los Chimalapas como la segunda eco-región terrestre prioritaria en importancia; después de la Selva Maya (Campeche, Chiapas, Quintana Roo), en la conservación de las poblaciones de tapir centroamericano, no sólo de México, sino de Centroamérica.

Densidad, distribución y actividad del ocelote Leopardus pardalis (Carnivora: Felidae) en los bosques húmedos del sureste mexicano

The ocelot Leopardus pardalis is of particular significance in terrestrial communities due to its ecological role within the group of small-sized felids and as a mesopredator. However, despite the reduction of ocelot habitat in Southeast Mexico, there are still very few ecological studies. This research aimed to contribute with some ecological aspects of the species in this region. For this, 29 camera trap stations were established in a rain forest in Los Chimalapas (an area of 22km2) during a two years period (March 2011-June, 2013), in Oaxaca state, Southeast Mexico. Data allowed the estimation of the population density, activity pattern, sex ratio, residence time, and spatial distribution. Population density was calculated using Capture-Recapture Models for demographically open populations; besides, circular techniques were used to determine if nocturnal and diurnal activity varied significantly over the seasons, and Multiple Discriminant Analysis was used to determine which of the selected environmental variables best explained ocelot abundance in the region. A total of 103 ocelot records were obtained, with a total sampling effort of 8 529 trap-days. Density of 22-38individuals/100km2 was estimated. Ocelot population had a high proportion of transient individuals in the zone (55%), and the sex ratio was statistically equal to 1:1. Ocelot activity was more frequent at night (1:00-6:00h), but it also exhibited diurnal activity throughout the study period. Ocelot spatial distribution was positively affected by the proximity to the village as well as by the amount of prey. The ocelot population here appears to be stable, with a density similar to other regions in Central and South America, which could be attributed to the diversity of prey species and a low degree of disturbance in Los Chimalapas. Rev. Biol. Trop. 62 (4): 1421-1432. Epub 2014 December 01.

El ocelote Leopardus pardalis es importante en comunidades terrestres debido a su papel ecológico dentro del grupo de felinos de tallas pequeñas y como mesodepredador. A pesar de la disminución del hábitat del ocelote en el sureste de México, son pocos los estudios ecológicos. El siguiente trabajo presenta una contribución de algunos aspectos ecológicos de la especie en esta región. Se estimó la densidad poblacional, patrón de actividad, proporción de sexos, tiempo de residencia y distribución espacial del ocelote. El estudio se llevó a cabo mediante fototrampeo dentro de Los Chimalapas, en el estado de Oaxaca, sureste de México. Se establecieron 29 estaciones dentro de la selva alta y se cubrió un área de 22km2, durante dos años (marzo 2011-junio 2013). La densidad fue estimada usando Modelos de Captura-Recaptura para poblaciones demográficamente abiertas, las técnicas circulares fueron usadas para determinar si la actividad nocturna y diurna varió significativamente entre épocas y, un análisis discriminante múltiple fue usado para conocer cuáles variables explican mejor la abundancia del ocelote en la región. Se obtuvieron 103 registros de ocelote con un esfuerzo de 8 529 días-trampa. Se estimó una densidad de 22-38 individuos/100km2. La población del ocelote tuvo un porcentaje alto de transeúntes (55%) y la proporción de sexos fue estadísticamente similar de 1:1. El ocelote estuvo más activo en la noche (1:00-6:00am), pero exhibió actividad diurna durante todo el periodo de estudio. La distribución espacial estuvo afectada positivamente por la proximidad a poblados y por la cantidad de presas. La población del ocelote parece estable, con una densidad similar a otras regiones de Centro y Sudamérica, quizá debido a la diversidad de especies presa y al grado bajo de alteración en Los Chimalapas.

Diversidad, abundancia relativa y patrones de actividad de mamíferos medianos y grandes en una selva seca del Istmo de Tehuantepec, Oaxaca, México

The use of camera traps and mammal track search are complementary methods to monitoring species of which is not well documented their natural history, as in the case of medium and large mammals. To ensure its conservation and good management, it is necessary to generate information about the structure of the community and their populations. The objective of the present study was to estimate the diversity, relative abundance and activity patterns of medium and large mammals in a tropical deciduous forest located in the Isthmus of Tehuantepec, Oaxaca, Mexico. Samplings were conducted in three month intervals, from September 2011 to May 2013. We used photographic-sampling and track search, two complementary sampling methods. For photographic-sampling, 12 camera traps were placed covering an area of 60km², while for the tracks search a monthly tour of four line-transect surveys of three kilometers length each was undertaken. We obtained a total of 344 pictures with 5 292 trap-days total sampling effort; in addition, 187 track records in a total of 144km. With both methods we registered 21 species of mammals, in 13 families and seven orders, and five species resulted in new records to the area. The diversity index of Shannon-Wiener obtained with the method of tracks was H´=2.41, while the most abundant species were Urocyon cinereoargenteus (IAR=0.23) and Pecari tajacu (IAR=0.20). By the method of trap the most abundant species were P. tajacu (IAR=2.62) and Nasua narica (IAR=1.28). In terms of patterns of activity P. tajacu, N. narica and Odocoileus virginianus were primarily diurnal species; Canis latrans and Leopardus pardalis did not show preference for any schedule in particular, and Didelphis virginiana and Dasypus novemcinctus preferred to have nocturnal activity. This information can be of help to the creation of programs of management and conservation of mammals of medium and large in the Isthmus of Tehuantepec, Oaxaca, México. Rev. Biol. Trop. 62 (4): 1433-1448. Epub 2014 December 01.

Para asegurar la conservación y buen manejo de mamíferos medianos y grandes, es necesario generar información sobre la estructura de la comunidad y de sus poblaciones. El objetivo del presente estudio fue estimar la diversidad, abundancia relativa y patrones de actividad de mamíferos medianos y grandes en una selva baja caducifolia en el Istmo de Tehuantepec, Oaxaca, México. El muestreo se llevó a cabo a intervalos de tres meses de septiembre 2011 a mayo 2013. Se utilizaron dos métodos complementarios: se colocaron 12 cámaras trampa cubriendo un área de 60km² y se realizó la búsqueda de rastros en transectos lineales de tres kilómetros de longitud. Se obtuvieron un total de 344 fotografías con un esfuerzo de muestreo de 5 292 días-trampa; además, 187 rastros en un total de 144km recorridos. En total se registraron 21 especies de mamíferos, de 13 familias y siete órdenes. El índice de diversidad de Shannon-Wiener fue más alto con el método de rastros (H´=2.41). Las especies más abundantes por medio de rastros fueron: Urocyon cinereoargenteus (IAR=0.23) y Pecari tajacu (IAR=0.20). Por medio del fototrampeo las especies más abundantes fueron: P. tajacu (IAR=2.62) y Nasua narica (IAR=1.28). Los patrones de actividad de P. tajacu, N. narica y Odocoileus virginianus fueron diurnos; Canis latrans y Leopardus pardalis no presentaron preferencia hacia algún horario en particular y Didelphis virginiana y Dasypus novemcinctus tuvieron actividad nocturna. Esta información puede ser de ayuda para la creación de programas de manejo y conservación de mamíferos medianos y grandes en el Istmo de Tehuantepec, Oaxaca, México.

Características del hábitat que influyen en la presencia del jaguar Panthera onca (Carnivora: Felidae) en el Parque Nacional Tortuguero, Costa Rica

Habitat characteristics and human activities are known to play a major role in the occupancy of jaguars Panthera onca across their range, however the key variables influencing jaguar distribution in Tortuguero National Park, Costa Rica, have yet to be identified. This study evaluated jaguar occupancy in Tortuguero National Park and the surrounding area. Jaguar detection/non-detection data was collected using digital camera traps distributed within the boundaries of the protected area. Local community members were also interviewed to determine jaguar occurrence in the Parks buffer zone. Occupancy models were then applied to identify the habitat characteristics that may better explain jaguar distribution across the study area. From June 2012 to June 2013, a total of 4 339 camera trap days were used to identify 18 individual jaguars inside the protected area; 17 of these jaguars were exclusively detected within the coastal habitat, whilst the remaining individual was detected solely within the interior of the Park. Interviewees reported 61 occasions of jaguar presence inside the buffer zone, between 1995 and 2013, with 80% of these described by the communities of Lomas de Sierpe, Barra de Parismina and La Aurora. These communities also reported the highest levels of livestock predation by jaguars (85% of attacks). In the study area, jaguar occurrence was positively correlated with the seasonal presence of nesting green turtles Chelonia mydas, and negatively correlated with distance to the Park boundary. Our findings suggested that the current occupancy of the jaguar in the study area may be a response to: 1) the vast availability of prey (marine turtles) on Tortuguero beach, 2) the decline of its primary prey species as a result of illegal hunting inside the Park, and 3) the increase in anthropogenic pressures in the Park boundaries. Rev. Biol. Trop. 62 (4): 1449-1458. Epub 2014 December 01.

Las características del hábitat y las actividades humanas juegan un papel importante en la presencia del jaguar Panthera onca en toda su área de distribución, sin embargo, las variables clave que influyen en la distribución del jaguar en el Parque Nacional Tortuguero, Costa Rica, aún no se han identificado. Por lo tanto se evaluó la presencia del jaguar Panthera onca en este parque nacional y su área de amortiguamiento. Se recolectaron datos de detección/no detección del jaguar mediante cámaras trampa ubicadas dentro del parque, y se realizaron encuestas en las comunidades del área de amortiguamiento. Posteriormente, se emplearon modelos de ocupación para identificar los atributos del hábitat que mejor explicaban la presencia del felino en el área. Se identificaron 18 jaguares dentro del parque, de los cuales 17 estuvieron exclusivamente en el hábitat costero. En el área de amortiguamiento, las comunidades con una mayor presencia del felino (Lomas de Sierpe, Barra de Parismina y La Aurora) coincidieron con las zonas más conflictivas, en relación a la cacería y la depredación de jaguar sobre el ganado. La probabilidad de ocupación del jaguar se incrementa a medida que aumenta la presencia de la tortuga verde Chelonia mydas, y disminuye conforme la distancia al límite del parque se incrementa. Nuestros resultados indican que la actual presencia del jaguar se debe a: 1) la alta disponibilidad de presas (tortugas marinas) en el hábitat costero, 2) la disminución de las principales especies presa como resultado de la cacería y 3) al incremento de las actividades humanas en el área de amortiguamiento del parque.

¿Se correlacionan los ataques de jaguares Panthera onca y pumas Puma concolor (Carnivora: Felidae) al ganado con la riqueza de especies y la abundancia relativa de presas silvestres?

Attacks by big cats on livestock are one of the major causes of human-felid conflicts and, therefore, an important factor in the conservation of these species. It has been argued that a reduction in natural prey abundance promotes attacks on domestic species, but few studies have tested this statement, and some have delivered contradictory results. We investigated whether the occurrence of attacks to livestock by jaguar and puma relates to the abundance and richness of their natural prey. In the rainy season 2009, we tracked potential prey species counting signs of presence along linear transects in 14 non-attacked cattle farms (control) and in 14 attacked cattle farms in NW Costa Rica. There was a negative relationship between the occurrence of attacks and both species richness (p=0.0014) and abundance (p=0.0012) of natural prey. Our results support the establishment of actions to promote support and recovery of natural prey, in order to diminish attacks on livestock, while maintaining jaguar and puma populations. Rev. Biol. Trop. 62 (4): 1459-1467. Epub 2014 December 01.

Los ataques de grandes felinos al ganado son una de las principales causas de conflicto entre humanos y felinos, siendo por ello un tema prioritario para la conservación de estas especies. Se ha argumentado que la reducción en abundancia de presas naturales incrementa la ocurrencia de ataques a las especies domésticas. Sin embargo son pocos los estudios que han evaluado esta afirmación, algunos con resultados contradictorios. Nosotros investigamos cómo la ocurrencia de ataques al ganado, por parte de puma o jaguar, se relaciona con la abundancia y la riqueza de sus presas naturales. Muestreamos las presas potenciales contando los rastros de presencia a lo largo de transectos lineales en 14 fincas sin ataques (control) y en 14 fincas con ataques en el Noroeste de Costa Rica durante la temporada lluviosa de 2009. Encontramos una relación negativa entre la ocurrencia de ataques al ganado y la riqueza (p=0.0014) y abundancia (p=0.0012) de presas naturales. Nuestros resultados respaldan la aplicación de medidas que promuevan el mantenimiento y recuperación de las presas naturales como medida para reducir los ataques al ganado y conservar las poblaciones de puma y jaguar.

Aplicación de las funciones elípticas de Fourier para la descripción de la forma de los huevos de las aves

Egg shape is difficult to quantify due to the lack of an exact formula to describe its geometry. Here I described a simple algorithm to characterize and compare egg shapes using Fourier functions. These functions can delineate any closed contour and had been previously applied to describe several biological objects. I described, step by step, the process of data acquisition, processing and the use of the SHAPE software to extract function coefficients in a study case. I compared egg shapes in three birds species representing different reproductive strategies: Cuban Parakeet (Aratinga euops), Royal Tern (Thalasseus maximus) and Cuban Blackbird (Dives atroviolaceus). Using 73 digital pictures of eggs kept in Cuban scientific collections, I calculated Fourier descriptors with 4, 6, 8, 16 and 20 harmonics. Descriptors were reduced by a Principal Component Analysis and the scores of the eigenvalues that account for 90% of variance were used in a Lineal Discriminant Function to analyze the possibility to differentiate eggs according to its shapes. Using four harmonics, the first five component accounted for 97% of shape variances; more harmonics diluted the variance increasing to eight the number of components needed to explain most of the variation. Convex polygons in the discriminant space showed a clear separation between species, allowing trustful discrimination (classification errors between 7-15%). Misclassifications were related to specific egg shape variability between species. In the study case, A. euops eggs were perfectly classified, but for the other species, errors ranged from 5 to 29% of misclassifications, in relation to the numbers or harmonics and components used. The proposed algorithm, despite its apparent mathematical complexity, showed many advantages to describe eggs shape allowing a deeper understanding of factors related to this variable. Rev. Biol. Trop. 62 (4): 1469-1480. Epub 2014 December 01.

La forma de los huevos es difícil de cuantificar por la ausencia de fórmulas exactas que describan su geometría. Se describe un algoritmo para la caracterización y comparación de estas formas, basado en la aplicación de las funciones de Fourier. Estas permiten delinear cualquier tipo de contorno cerrado y han sido aplicadas efectivamente al análisis de varias formas biológicas. Se describen los pasos para la toma de datos, su procesamiento y el empleo del programa SHAPE para la obtención de los descriptores, a partir de un estudio de caso. En este se comparan las formas de los huevos de tres especies de aves que representan tres estrategias reproductivas bien diferentes: el Catey (Aratinga euops), la Gaviota Real (Thalasseus maximus) y el Totí (Dives atroviolaceus). A partir de 73 fotografías digitales a huevos depositados en colecciones, se calcularon los coeficientes de las funciones para 4, 6, 8, 16 y 20 armónicos, y se redujeron por medio de un Análisis de Componentes Principales. Los puntajes de los componentes que describen hasta el 90 % de la variabilidad fueron empleados en un Análisis de Función Discriminante Lineal para analizar la posibilidad de separar los huevos según sus formas. Con solo cuatro armónicos los primeros cinco componentes explicaron 97% de la varianza en formas. Más armónicos disminuyen la varianza explicada, requiriéndose hasta ocho componentes para explicar la misma cantidad. Los polígonos convexos en el espacio discriminante muestran una clara distinción entre especies sugiriendo la posible discriminación (errores de clasificación entre 7-15%). Los errores en las clasificaciones estuvieron relacionados a diferencias específicas en la forma entre especies. En el estudio de caso, los huevos de A. euops fueron perfectamente clasificados pero en las otras especies los errores fueron entre 5 y 29%, con este número de armónicos y componentes empleados. El algoritmo propuesto a pesar de su complejidad matemática aparente muestra muchas ventajas para cuantificar las formas de los huevos permitiendo una mayor comprensión de los factores que determinan esta variable en las aves.

Causas y consecuencias de las tasas de cambio en el hábitat del puerco espín tropical amenazado, Sphiggurus mexicanus (Rodentia: Erethizontidae), en Oaxaca, México: implicaciones para su conservación

Land use changes by human activities have been the main causes of habitats and wildlife population degradation. In the Tehuantepec Isthmus in Oaxaca, the tropical habitat of the porcupine Sphiggurus mexicanus has been subject to vegetation and land use changes, causing its reduction and fragmentation. In this study, we estimated vegetation cover and land use (δn) change rates and assessed habitat availability and potential corridors for possible porcupine movements to avoid its isolation. In the study area, the type of vegetation with the most change rate value was the savanna (δn=-2.9), transformed into induced grasslands. Additionally, we have observed the porcupine (since 2011) in semi-deciduous (δn=-0.87) and tropical dry (δn=-0.89) forests that have been transformed in temporal agriculture and mesquite and induced grasslands. The vegetation inhabited by the porcupine resulted in recording a total of 64 plant species (44 trees, nine vines, seven herbs, four shrubs), of which the vine Bunchosia lanceolata showed the highest importance value (41.85) followed by the trees Guazuma ulmifolia (22.71), Dalbergia glabra (18.05), and Enterolobium cyclocarpum (17.02). The habitat evaluation and potential corridor analysis showed that only 1 501.93ha could be considered as suitable habitats with optimum structural conditions (coverage, surface, and distances to transformed areas) to maintain viable populations of S. mexicanus, and 293.6ha as corridors. An increasing destruction of the porcupines habitat has been observed in the study area due to excessive logging, and actions for this species and its habitat conservation and management have to be taken urgently. Rev. Biol. Trop. 62 (4): 1481-1494. Epub 2014 December 01.

Los cambios de uso del suelo por actividades humanas, han sido de las principales causas de la degradación, reducción y fragmentación de los hábitats y poblaciones de fauna silvestre. En el Istmo de Tehuantepec, Oaxaca, el hábitat del puercoespín tropical Sphiggurus mexicanus, se encuentra sometido a cambios de cobertura vegetal y uso del suelo, que están causando la reducción y fragmentación de su hábitat. Debido a ello, estimamos las tasas de cambio de la cobertura vegetal y uso del suelo (δn), y evaluamos la disponibilidad del hábitat y de corredores vegetales potenciales para los posibles movimientos del puercoespín tropical y evitar su aislamiento. En el área de estudio el tipo de vegetación con mayor valor de tasa de cambio fue la sabana (δn=-2.9), transformado en pastizal inducido. Adicionalmente, observamos puercoespínes (desde 2011) en selva mediana subperennifolia (δn=-0.87) y selva baja caducifolia (δn=-0.89), los cuales han sido transformados en áreas de cultivo, selva baja espinosa y pastizal inducido. Caracterizamos la vegetación del hábitat del puercoespín, registrando un total de 64 especies vegetales (44 árboles, nueve bejucos, siete hierbas y cuatro arbustos), de los cuales, el bejuco Bunchosia lanceolata, presentó los valores más altos de importancia (41.85), seguidos por los árboles Guazuma ulmifolia (22.71), Dalbergia glabra (18.05), y Enterolobium cyclocarpum (17.02). El análisis de evaluación de hábitat y corredores potenciales mostró que solo 1 501.93ha pueden considerarse como hábitats adecuados con condiciones estructurales (de cobertura, superficie y distancias a áreas transformadas) para mantener poblaciones viables de S. mexicanus; y 293.6ha como corredores. La destrucción del hábitat del puerco espín en el área de estudio está incrementándose por la tala excesiva, por lo tanto, es prioritario emprender acciones para la conservación y manejo del taxón y su hábitat.

Mitigación de daños provocados por fauna silvestre en cultivos agrícolas en un bosque montano de Bolivia

Wildlife is often blamed for causing damage to human activities, including agricultural practices and the result may be a conflict between human interests and species conservation. A formal assessment of the magnitude of damage is necessary to adequately conduct management practices and an assessment of the efficiency of different management practices is necessary to enable managers to mitigate the conflict with rural people. This study was carried out to evaluate the effectiveness of agricultural management practices and controlled hunting in reducing damage to subsistence annual crops at the Cotapata National Park and Natural Area of Integrated Management. The design included seven fields with modified agricultural practices, four fields subjected to control hunting, and five fields held as controls. We registered cultivar type, density, frequency of visiting species to the field, crops lost to wildlife, species responsible for damage, and crop biomass. Most frequent species in the fields were Dasyprocta punctata and Dasypus novemcinctus. Hunted plots were visited 1.6 times more frequently than agriculturally managed plots. Crop lost to wildlife averaged 7.28% at agriculturally managed plots, 4.59% in plots subjected to hunting, and 27.61% in control plots. Species mainly responsible for damage were Pecari tajacu, D. punctata, and Sapajus apella. We concluded that both management strategies were effective to reduce damage by >50% as compared to unmanaged crop plots. Rev. Biol. Trop. 62 (4): 1495-1507. Epub 2014 December 01.

El daño causado por fauna silvestre en cultivos agrícolas es una de las causas principales de conflicto dentro y fuera de áreas protegidas. Para un adecuado manejo del conflicto se requieren evaluaciones del daño y de la aplicación de distintos métodos de mitigación. El objetivo del trabajo fue evaluar la efectividad de prácticas agroculturales y cacería de control, para reducir daños por vertebrados silvestres en cultivos agrícolas anuales en el PN ANMI Cotapata. Se trabajó en siete parcelas con prácticas agroculturales, cuatro parcelas con cacería de control y cinco parcelas control, registrándose el tipo y densidad de cultivo, frecuencia de visitas de especies dañinas a huelleros, plantación perdida, especies responsables y biomasa de cosecha. Los resultados muestran que las especies más frecuentes fueron: Dasyprocta sp. y Dasypus novemcinctus, siendo estas 1.6 veces más frecuentes en parcelas con prácticas agroculturales. En promedio se perdió 7.3% de la plantación en parcelas agroculturales, 4.6% en parcelas sujetas a cacería de control, y 27.6% en parcelas control. Las principales especies responsables de las pérdidas fueron: P. tajacu, seguido por Dasyprocta sp. y S. apella. A través de estas estrategias de manejo, redujo las pérdidas en >50%, con lo cual se considera que los métodos puestos a prueba son útiles y se recomienda utilizarlos a gran escala con la consideración de que podría ser necesario innovar cada cierto tiempo, pues los animales silvestres tienden a acostumbrarse a los métodos de ahuyentamiento en ejecución.

Caracterización del área de distribución geográfica potencial de las especies de aves psitácidas de la Península de Yucatán, México

Psittacidae family is one of the most endangered groups in Mexico, since many of their habitats are disappearing. In this research, we characterized the land cover of the potential geographical distribution area of eight extant parrot species within the Yucatan Peninsula. We used the Maximum Entropy algorithm (MaxEnt) and species historical records. To externally validate the models, we used presence and absence records from field observations (2010-2012). To characterize the distribution area, we used the vegetation and land use maps of INEGI Series IV (2007-2010). The models showed a good performance, according to the values of the area under the curve (AUC), which ranged between 0.88-0.95 with the training data and between 0.82-0.91 with test data. We located most of the species in sites where the models predicted their presence. In the Peninsula, over 76% of the parrots potential geographical distribution area is forested, except for Amazona oratrix. The subhumid tropical forest is the best represented, and the livestock for land use. The most affected species within the Peninsula are: Amazona farinosa and A. oratrix. The Calakmul Biosphere Reserve is the most important area for parrots protection in the Peninsula. Knowing the characteristics of distribution areas is an essential part in the establishment of parrots conservation strategies. Rev. Biol. Trop. 62 (4): 1509-1522. Epub 2014 December 01.

La familia Psittacidae es una de las más amenazadas en México y los hábitats donde se distribuyen desaparecen. En este estudio se caracterizó la cobertura del suelo del área de distribución geográfica potencial de las ocho especies de psitácidos presentes en la Península de Yucatán. Se utilizó el algoritmo de Máxima Entropía (MaxEnt) y registros históricos de las especies. Para validar externamente los modelos se utilizaron registros de presencia y ausencia tomados en campo (2010-2012). Para caracterizar el área de distribución se utilizó la carta de uso de suelo y vegetación Serie IV de INEGI (2007-2010). Los modelos tuvieron un buen desempeño, de acuerdo a los valores del área bajo la curva (AUC), que oscilaron entre 0.88-0.95 con los datos de entrenamiento y entre 0.82-0.91 con los de prueba. Se localizó a la mayoría de las especies en los sitios donde los modelos predecían presencia. Más del 76% del área de distribución geográfica potencial de los psitácidos en la Península está ocupada por selva, excepto para Amazona oratrix. La selva mediana subperennifolia es la mejor representada en las áreas de distribución y de los usos de suelo el mejor representado es el pecuario. La especies más afectadas dentro de la Península son: Amazona farinosa y A. oratrix. La Reserva de la Biosfera de Calakmul es la más importante para la protección de los psitácidos en la Península. El conocimiento de las características de las áreas de distribución es parte fundamental en el establecimiento de estrategias de conservación de los psitácidos.

Efecto de las lagunas temporales sobre la composición de la avifauna al Sureste del Istmo de Tehuantepec, Oaxaca, México

Oaxaca hosts one of the greatest biodiversity in México, occupying first place in avian diversity compared to other regions of the country. However, the area is undergoing serious problems such as high deforestation rates, soil erosion and over exploitation and extinction of species. These factors have all contributed to the current loss of biodiversity. Also, biological inventories are still incomplete. One of the least explored sites is the semiarid zone of Tehuantepec isthmus, around the locality of Santa Maria del Mar, Oaxaca, México. The area includes floodable grasslands, mangrove areas and dry forest, providing a range of potential habitats for different species. Our objective was to evaluate the effect of temporal lakes on spatial and temporal composition of the avifauna in Santa Maria del Mar, in order to generate information regarding this group within the region and the state, and to understand the importance of flood areas for resident and transitory birds. We conducted 12 avifauna surveys between July 2006 and June 2008, and established two transects of 2km length in each of four habitat types (beach, grassland, dry forest, and mangrove). We found a total of 75 species, corresponding to 16 orders and 30 families. Within an area of 26km², we significantly found 10.1% of the total number of bird species recorded for the entire state, and 6.6% of the total reported in Mexico. The families most represented were: Ardeidae, Laridae and Scolopacidae. Over the entire study period, dry forest was the most diverse habitat; followed by mangrove, grassland and the beach. Of all the species recorded, 38.6% were found at the edge or in the temporal lakes. We found a significant difference in species composition between seasons in the grassland, but no difference in the other habitats. Our results showed a significant effect of temporary lakes on avian diversity during the wet season; it also demonstrated the importance of grassland conservation given its relevance for presence of waterbirds. We suggested a continued and more intense monitoring; and proposed the designation of the area as an important Conservation Bird Area (AiCA).

Oaxaca alberga una biodiversidad de las más grandes en México, ocupando el primer lugar en diversidad de aves si se le compara con otras regiones del país. Sin embargo, el área sufre serios problemas tales como altas tasas de deforestación, erosión de suelo y sobre explotación y extinción de especies. Todos estos factores han contribuido con la actual pérdida de diversidad biológica. Además, los inventarios biológicos aún están incompletos. Una de las zonas menos exploradas es la parte semiárida del istmo de Tehuantepec, en los alrededores de la localidad de Santa María del Mar, Oaxaca, México. El área incluye pastizales inundables, áreas de manglar y de selva seca, y provee de una gama de hábitat potenciales para diversas especies. Nuestro objetivo fue evaluar el efecto de las lagunas temporales en la composición espacial y temporal de la avifauna en Santa María del Mar, con el propósito de generar información relacionada con este grupo dentro de la región y del estado, además de comprender la importancia de las áreas inundables para las aves residentes y migratorias. Entre julio 2006 y junio 2008 realizamos 12 monitoreos de la avifauna, y establecimos dos transectos de 2km de longitud para cada uno de los cuatro tipos de hábitat (playa, pastizal, selva seca y manglar). Encontramos un total de 75 especies, correspondendiendo a 16 órdenes y 30 familias. Dentro de un área de 26km², de manera significativa registramos el 10.1% del total de aves registradas para todo el estado y el 6.6% del total de especies registradas para México. Las familias mejor representadas fueron: Ardeidae, Laridae y Scolopacidae. Para todo el periodo de estudio, la selva seca fue el hábitat más diverso, seguido por el manglar, el pastizal abierto y la playa. Del total de especies registradas, el 38.6% se encontraron en el borde o dentro de lagunas temporales. Encontramos una diferencia significativa en la composición de especies entre temporadas en el pastizal, pero no se encontró diferencia entre el resto de los hábitat. Nuestros resultados muestran un efecto significativo de las lagunas temporales sobre la diversidad de la avifauna durante la temporada lluviosa; también evidencian la importancia de la conservación de los pastizales, dada su relevancia para la presencia de aves acuáticas. Sugerimos realizar un monitoreo continuo e intensivo, y proponemos que la zona sea designada como un área de importancia para la Conservación de las Aves (AiCA).

Respuestas morfológicas y fisiológicas de los pastos marinos (Alismatales) a los herbívoros (Testudines: Cheloniidae) y el papel de estas respuestas como señales de abandono de parches de pastoreo

Green sea turtles, Chelonia mydas, are grazers influencing the distribution of seagrass within shallow coastal ecosystems, yet the drivers behind C. mydas patch use within seagrass beds are largely unknown. Current theories center on food quality (nutrient content) as the plant responds to grazing disturbances; however, no study has monitored these parameters in a natural setting without grazer manipulation. To determine the morphological and physiological responses potentially influencing seagrass recovery from grazing disturbances, seagrasses were monitored for one year under three different grazing scenarios (turtle grazed, fish grazed and ungrazed) in a tropical ecosystem in Akumal Bay, Quintana Roo, Mexico. Significantly less soluble carbohydrates and increased nitrogen and phosphorus content in Thalassia testudinum were indicative of the stresses placed on seagrasses during herbivory. To determine if these physiological responses were the drivers of the heterogeneous grazing behavior by C. mydas recorded in Akumal Bay, patches were mapped and monitored over a six-month interval. The abandoned patches had the lowest standing crop rather than leaf nutrient or rhizome soluble carbohydrate content. This suggests a modified Giving Up Density (GUD) behavior: the critical threshold where cost of continued grazing does not provide minimum nutrients, therefore, new patches must be utilized, explains resource abandonment and mechanism behind C. mydas grazing. This study is the first to apply GUD theory, often applied in terrestrial literature, to explain marine herbivore grazing behavior.

Las tortugas verdes, Chelonia mydas, son herbívoros que influencian la distribución de pastos marinos en sistemas costeros someros, sin embargo los factores que hay detrás del uso de un parche de pastos marinos por C. mydas son desconocidos. Teorías actuales se centran en calidad de alimento (contenido de nutrientes en tejido) conforme la planta responde a la alteración causada por el pastoreo; sin embargo no hay estudios que hayan monitoreado estos parámetros en un diseño natural sin manipulación del herbívoro. Para deter minar las respuestas morfológicas y fisiológicas (productividad, morfología y almacenamiento de nutrientes) que potencialmente influencian la recuperación de los pastos de la alteración por pastoreo, los pastos fueron monitoreados por un año en tres escenarios diferentes de pastoreo (pastoreo por tortuga, pastoreo por peces, sin pastoreo) en el sistema tropical Bahía de Akumal, Quintana Roo, México. Significativamente menos carbohidratos solubles y mayor contenido de nitrógeno y fósforo fueron indicativos del estrés causado por el pastoreo en los pastos. Para determinar si estas respuestas fisiológicas de los pastos son las causantes del heterogéneo comportamiento de pastoreo de C. midas, reportado en Akumal, se mapearon y monitorearon parches de pastos en intervalos de seis meses. Los parches abandonados tuvieron menor biomasa, en vez de bajo contenido de nutrientes en hoja, o de carbohidratos en raíces. Estos resultados sugieren un comportamiento modificado de renunciamiento por densidad: el umbral crítico donde el costo de pastoreo continuo no provee los nutrimentos mínimos, por lo tanto nuevos parches deberán ser utilizados, explicando así el abandono del recurso y mecanismo detrás del comportamiento de pastoreo por C. mydas. Este es el primer estudio en aplicar la teoría de renuncia por densidad, frecuentemente utilizada en la literatura terrestre, para explicar el comportamiento de pastoreo de herbívoros.

Composición de especies leñosas en comunidades invadidas en montañas del centro de Argentina: su relación con factores ambientales locales

Woody species composition in invaded communities from mountains of central Argentina: their relations with local environmental factors. Invasions by exotic woody species are threatening ecosystem functions worldwide. The spread and subsequent replacement of native forest by exotic dominated stands is particularly evident nearby urban centers were exotic propagule pressure is highest. Yet, there is a lack of information on the environmental factors that underlie these replacements. In this study we addressed the following questions: (1) is there a local spatial segregation between the dominant native and exotic woody species? and (2) if this local segregation does exist, is it driven by environmental features?. For this, in 2010 we established 31 plots distributed along 16 sampling sites where we surveyed the composition and abundance of all woody species with a basal diameter ≥ 5cm. To characterize the environment of each plot, we measured the topographic position (slope, exposure) and different properties such as soil physics (bulk density, soil impedance), structure (soil deep, texture) and chemical characteristics (pH, nutrient and water content). Through a cluster analysis we were able to identify five different woody communities in coexistence: (1) Woodlands dominated by the exotic Ligustrum lucidum; (2) Mixed woodlands dominated by the native Lithraea molleoides and the exotic Celtis australis; (3) Scrublands dominated by the native Condalia buxifolia; (4) Scrublands dominated by the exotic Cotoneaster glaucophyllus, and (5) Scrubby grasslands with the exotic Pyracantha angustifolia. These communities were all associated with different local topographic and edaphic features. The environmental segregation among the identified communities suggests that woody invaders have the potential to colonize almost all the environments of the study site (though varying in the identity of the dominant exotic species). The observed patterns, even being restricted to a single well invaded area of mountain Chaco, may posit the spread of woody invaders towards native communities in the region.

En todo el mundo, las invasiones de especies leñosas exóticas están amenazando las funciones ecosistémicas. La dispersión y el subsecuente reemplazo de bosques de especies nativas por comunidades dominadas por exóticas es evidente, particularmente, en proximidad a centros urbanos donde la presión de propágulos de especies exóticas es alta. Sin embargo, existe una falta de información sobre los factores ambientales que subyacen este reemplazo. En este estudio nos propusimos responder las siguientes preguntas: (1) ¿se observa una segregación espacial a escala local entre especies leñosas exóticas y/o nativas dominantes?, y (2) si existe esa segregación, ¿está asociada a variables ambientales? En el 2010 se establecieron 31 parcelas distribuidas en 16 laderas en los bosques Chaqueños de las Sierras de Córdoba, en Argentina central. En cada uno de los sitios de muestreo se relevó la composición y abundancia de todas las especies leñosas con un diámetro a la altura de la base superior a 5cm. Para caracterizar el ambiente en cada una de las parcelas medimos la posición topográfica (pendiente y orientación) y algunas propiedades asociadas con la física (densidad aparente y compactación), estructura (profundidad y textura) y con la química (pH y el contenido de nutrientes y agua) del suelo. A través, de un análisis jerárquico de agrupamiento, se identificaron cinco comunidades de leñosas coexistiendo: (1) Bosques dominados por Ligustrum lucidum, (2) Bosques mixtos dominados por Lithraea molleoides y Celtis australis, (3) Matorrales de Condalia buxifolia, (4) Matorrales de Cotoneaster glaucophyllus, y (5) Pajonales con emergentes de Pyracantha angustifolia. Estas comunidades se asociaron diferencialmente a las variables topográficas y edáficas locales. La segregación ambiental observada sugiere que las especies invasoras tienen una capacidad potencial para colonizar casi todos los ambientes en el área de estudio (variando la identidad de la invasora). En conjunto, los patrones descritos, aunque circunscriptos a un área de Chaco Serrano con un avanzado grado de invasión, plantearían un escenario de posible expansión de las leñosas exóticas sobre las comunidades nativas.

Dinámica espacio-temporal del esfuerzo en una pesquería de buceo artesanal multiespecífica y sus efectos en la variabilidad de las capturas: Implicaciones para el manejo sostenible

Artisanal diving fisheries are a source of income, employment and food security of coastal areas in many countries. Understanding the dynamics of these fisheries, including the spatial and temporal dynamics of fishing effort, gears and species can help to address the challenges involved in fisheries management. We aimed to analyze the differences in fishing strategies under- taken by fishers that use two different diving methods (hookah and free diving), the conditions and their potential impacts on catches when adjustments to those strategies are applied over time. For this, detailed information of fishing operations from artisanal boats in the North Pacific coast of Costa Rica was analyzed in two fishing seasons (2007-2008 and 2011-2012). Data were collected by onboard observers (fishing site, fishing time, species composition, depth and visibility). Additionally, interviews with divers were applied to obtain information of price per species, species volume and fishing operations. From the total number of trips during both seasons, hookah diving was represented by a sample size of 69.3%, while free diving, with a sample of 41.9%. More than 15 species were identified in each fishing season. Nevertheless, three categories had substantial contributions in both seasons with differences in the proportions for each case: green lobster (Panulirus gracilis), octopus (Octopus sp.) and parrotfish (Scarus perrico and S. ghobban). It is worth noting that an important proportion of catch was retained by fishers for personal consumption purposes, including species of high commercial value. Additional night diving activity, increased the number of dives from one season to another. Besides, cooperation processes in free diving fishing operations, and changes in fishing effort between seasons, defined important changes in fishing strategies. Potential causes of changes in fishing strategies and the implications for manage- ment to ensure the sustainability of these fisheries in the long term are discussed.

Las pesquerías artesanales asociadas a métodos de buceo son fuente de ingreso, empleo y seguridad alimentaria de zonas costeras en muchos países. Los altos precios y la poca movilidad de especies bénticas capturadas por buceo enfrentan retos cada vez mayores en su aprovechamiento y manejo, esto demanda un entendimiento integral de estas pesquerías en diferentes contextos, incluyendo la dinámica espacial y temporal del esfuerzo pesquero, las artes y las especies. En el presente estudio se busca elucidar si existen diferencias en las estrategias de pesca desarrolla- das por pescadores que emplean buceo en dos modalidades (hookah y buceo libre). También se busca conocer si se desarrollan adaptaciones de estas estrategias en el tiempo, bajo qué condiciones y el posible efecto de las estrategias sobre las capturas. Para ese fin se analizó información detallada de las operaciones de pesca de embarcaciones artesanales que operan en la costa del océano Pacífico de Costa Rica durante dos temporadas de pesca. Se analizó información obtenida a bordo de embarcaciones como: sitio de pesca, composición de especies, tiempo de pesca, número de inmersiones por viaje, entre otros; y se aplicaron entrevistas a buzos al momento de las descargas para obtener información de precios, el volumen de las especies capturadas y forma de operación de los pescadores. Para el buceo con hookah se obtuvo una muestra del 69.3% del total de viajes en las dos temporadas de pesca y en el caso del buceo libre se obtuvo una muestra del 41.9% del total de viajes en las dos temporadas de pesca estudiadas (2007-2008 y 2011-2012). Se identificaron más de 15 especies en cada temporada de pesca, dominaron tres categorías en ambas temporadas pero con diferencias en las proporciones obtenidas en cada caso: langosta (Panulirus gracilis), pulpo (Octopus sp) y pez loro (Scarus perrico y S. Ghobban). Resalta un componente importante de captura retenida por los pescadores para consumo personal, incluyendo especies de alto valor comercial. Se identificaron cambios en las estrategias de pesca asociadas a cambios en las capturas y cambios en la asignación espacial del esfuerzo pesquero de una temporada de pesca a otra, definidas por la adición de buceo nocturno, aumento en el número de inmersiones de una temporada a otra y procesos de cooperación en las faenas de pesca de buzos que usan buceo libre. Se discute las potenciales causas de los cambios en las estrategias de pesca observadas y se derivan implicaciones para el manejo que permiten la sostenibilidad de estas pesquerías a largo plazo.

La estructura de la comunidad de basidiomicetos macroscópicos (Fungi) en los manglares brasileños influenciada por las variaciones temporales y espaciales

Mangroves are transitional ecosystems between terrestrial and marine environments, and are distinguished by a high abundance of animals, plants, and fungi. Although macrofungi occur in different types of habitat, including mangroves, little is known about their community structure and dynamic. Therefore the aim of this study was to analyze the diversity of macrofungi in a number of Brazilian mangroves, and the relationship between such diversity, precipitation and area of collection. A total of 32 field trips were undertaken from 2009 to 2010, and macrofungi were studied in four 250×40m transects: Timbó and Santa Cruz Channel on the Northern coast, and Maracaípe and Ariquindá on the Southern coast. All basidiomata found along the transects were placed in paper bags, air-dried and identified using existing literature. It was found that Northern areas predominantly featured Avicennia schaueriana mangroves, while Rhizophora mangle dominated in Southern transects. A total of 275 specimens were collected, and 33 species, 28 genera, 14 families and six orders were represented. Overall abundance and species richness did not vary significantly among areas, but varied according to time, being higher during the rainy season. Subtle differences in composition were observed over time and between areas, probably due to variations in plant species occurrence. Further studies with collections during months of greater precipitation in transects dominated by different mangrove species of the same ecosystem are suggested to assess the overall diversity of mycobiota in these ecosystems.

Los manglares son ecosistemas de transición entre los ambientes terrestres y marinos, y se distinguen por la gran abundancia de animales, plantas y hongos. Aunque los macrohongos se encuentran en diferentes tipos de hábitat, incluidos los manglares, poco se sabe acerca de la estructura de su comunidad y dinámica. Por lo tanto, el objetivo de este estudio fue analizar la diversidad de macrohongos en los manglares de Brasil y su relación con la precipitación y área de recolección. Se realizaron un total de 32 salidas de campo entre 2009 y 2010, y los macrohongos fueron estudiados en cuatro transectos de 250×40m: Timbó y Canal de Santa Cruz en la costa norte y Maracaípe y Ariquindá en la costa sur. Todos los basidiomas encontrados a lo largo de los transectos se colocaron deshidratados en bolsas de papel, y se identificaron con ayuda de la literatura preexistente. Se encontró que las zonas del norte predominantemente presentaron Avicennia schaueriana, mientras Rhizophora mangle domina en transectos del sur. Se recolectaron un total de 275 especímenes y 33 especies, 28 géneros, 14 familias y seis órdenes estuvieron representados. Abundancia y riqueza de especies en general no varió significativamente entre las áreas, pero si varió en el tiempo, siendo mayor durante la estación lluviosa. Se observaron diferencias sutiles en la composición a través del tiempo y entre áreas, probablemente debido a las variaciones en la presencia de las especies de plantas. Otros estudios con recolectas durante los meses de mayor precipitación en transectos dominados por diferentes plan- tas de manglar en el mismo ecosistema son deseables para acceder a la diversidad de la micobiota.

Morphological and micromorphological characteristics of Desmodium fruits (Leguminosae: Papilionoideae)

The genus Desmodium is represented in Santa Catarina State, Brazil, by 13 species, all with lomentaceous fruits. Shape, size and isthmus margin of loments vary, while the surface is glabrous, or covered by trichomes of different types. Morphological diversity of trichomes becomes particularly relevant to taxonomic description. The trichome types present on the surface of Desmodium fruits provide data for the identification and classification of species in the State. To assess this, three fruits of each species were collected and deposited at two herbaria, HBR and FLOR, in Santa Catarina, Brazil. Some rehydrated samples were examined using light microscopy (LM); and some sections were exposed to the following histochemical reagents: Sudan III for oils and Thionine for mucilage. The structural aspects of trichomes can be classified into uni- or multicel- lular and may still be simple, i.e., nonglandular or glandular. Using scanning electron microscopy (SEM), five types of trichomes were identified and analyzed among the Desmodium species studied: uncinate, uniseriate, globose multicellular, globose unicellular and subulate. Characteristics, such as loment margin and article form, glabrescent or pillous indument, trichome type, with or without papillous epidermal cells and epicuticular striations, showed relevant diagnostic value. An identification key was developed for Desmodium species from Santa Catarina State, Brazil, based on macro and micromorphological characters of the fruit.

Características morfológicas y micromorfológicos de frutos Desmodium (Leguminosae: Papilionoideae). El género Desmodium está representado en Santa Catarina, Brasil, por 13 especies, todas con frutos lomentaceos. Los lomentos han tenido variación en forma, tamaño y características del margen del istmo, y la superficie es glabra o cubierta por tricomas de diferentes tipos. La diversidad morfológica de los tricomas se vuelve particularmente relevante para la descripción taxonómica. Los tipos de tri- comas presentes en la superficie de los frutos Desmodium, proporcionan datos para la identificación y clasificación de las especies en el Estado de Santa Catarina, Brasil. Tres frutos de cada especie fueron recogidos y depositados en el Herbario (HBR y FLOR, Santa Catarina, Brasil). Algu- nas muestras fueron rehidratadas y examinadas usando microscopía de luz (LM), las secciones fueron expuestas a los siguientes reactivos histoquímicos: Sudan III para los aceites y Tionina para mucílago. Los aspectos estructurales de los tricomas se pueden clasificar en uni o multicelulares y pueden todavía ser simples, es decir, no glandular o glandular. Por medio del uso de la microscopía elec- trónica de barrido (SEM), cinco tipos de tricomas se han identificado y analizado entre las especies de Desmodium estudiadas: uncinado, uniseriado, globoso multicelular, globoso unicelular y subulado. Características como el margen del lomento y la forma del artículo, indumento glabrescente o piloso, tipo de tricomas con o sin células epidérmicas papilosas, y estrías epicuticulares mostraron valor de diagnóstico relevante. La clave de identificación fue desarrollada para especies de Desmodium del Estado de Santa Catarina, Brasil, basado en caracteres macro y micromorfológicos del fruto.

Colonización y estructura de la comunidad de hongos micorrízicos arbusculares en Alsophila firma (Cyatheaceae) en bosque mesófilo de montaña en Veracruz, México

Alsophila firma is a tree fern that is distributed mainly in tropical montane cloud forest (TMCF) and is considered as a threatened species. Arbuscular mycorrrhizal fungi (AMF) have been proposed as an alternative in rescue programs of endangered species. However, our knowledge about diversity of AMF and mycorrhizal status of the species of TMCF is limited. In Mexico TMCF shows different degrees of conservation because of fragmentation and land use change. In this study, we evaluated the level of colonization, richness and abundances of spores of AMF in three fragments with different conservation status: conserved (100 years), secondary vegetation (17 years) and disturbed. For this, soil samples and roots were collected from five individuals of A. firma per site, with at least 100m away from each other; a total of 100cm of roots were analysed per site. Root samples showed AMF and occasionally dark septate fungi (DSF) colonizations. For the overall study, 19 species of AMF were recorded: Gigaspora (7), Acaulospora (4), Glomus (4), Funneliformis (2), Sclerocystis (1) and Scutellospora (1). The dominant species in the three sites were Funneliformis geosporum and Acaulospora scrobiculata. The highest diversity (H’) and evenness (J’) (p<0.05) were found in the conserved site (H’=1.7, J’=0.66), when compared to the secondary vegetation (H’=1.5, J’=0.61), and the disturbed site (H’=0.74, J’=0.41). Statistical analysis showed that the AMF degree of colonization was significantly higher (p<0.05) in the conserved site; although, the disturbed site showed low richness and abundances of AMF, the degree of root colonization did not differ statistically (p<0.05) with the secondary vegetation site. Chao2 (Richness estimation model) showed that the number of analysed samples were sufficient to represent the structure of the AMF communities with values >90%. The present study confirmed that A. firma is a mycorrhizal species that exhibits high levels of colonization even in disturbed sites. We suggest that F. geosporum and A. scrobiculata may have the potential to inoculate the gametophyte and young sporophyte of A. firma, to support restoration programs, because of their abundances and high tolerance to disturbed sites.

Alsophila firma es un helecho arborescente que crece principalmente en bosque mesófilo de montaña (BMM) y se encuentra en la categoría de riesgo. Los hongos mico- rrízicos arbusculares (HMA) se han propuesto como una alternativa para programas de recuperación de especies nativas en peligro. Sin embargo, sabemos poco sobre la diversidad de HMA y del estatus micorrízico de las espe- cies vegetales del BMM. En México el BMM presenta diferentes grados de conservación debido a la fragmentación y el cambio de uso de suelo. Se evaluó el grado de colonización, riqueza y abundancia de esporas de los HMA presentes en fragmentos de BMM con diferente historia de manejo: conservado (100 años), en recuperación (17 años) y alterado. Se estudiaron muestras de suelo y raíces toma- das de 5 individuos de A. firma por cada sitio, con al menos 100m de distancia entre individuos. Se analizaron en total 100cm de raíz por cada sitio. Las muestras de raíz presentaron colonización principalmente de HMA y ocasionalmente por hongos septados oscuros (HSO). Se encontraron 19 especies: Gigaspora (7), Acaulospora (4), Glomus (4), Funneliformis (2), Sclerocystis (1) y Scutellospora (1). Las especies dominantes en los tres sitios fueron Funneliformis geosporum y Acaulospora scrobiculata. La mayor diversidad (H’) y equitatividad (J’) (p<0.05) se presentaron en el sitio conservado (H’=1.7; J’ 0.66) con respecto al sitio en recuperación (H’=1.5, J’ 0.61) y alterado (H’=0.74, J’=0.41). Los niveles de colonización micorrízica total de raíz fueron estadísticamente mayores (p<0.05) en el sitio conservado. Aunque el sitio alterado presenta una baja riqueza y abundancia de HMA la colonización micorrízica total de raíz no fue estadísticamente diferente (p<0.05) respecto al sitio en recuperación. El estimador Chao2 indica que las muestras analizadas reflejan la estructura general de la comunidad de HMA con valores superiores al 93%. El presente estudio confirma que A. firma es una especie micorrízica con altos niveles de colonización incluso en sitios alterados. Se sugiere que las especies F. geosporum y A. scrobiculata por su alta tolerancia a sitios alterados pueden tener potencial para inocular gametofitos y esporofitos de A. firma para incrementar la supervivencia en programas de restauración.

Anatomía de los órganos vegetativos de dos especies de Atriplex (Chenopodiaceae) de Venezuela

In Venezuela, Atriplex is represented by A. cristata and A. oestophora, the latter being endemic; they inhabit coastal areas with high temperatures, high solar radiation and sandy soils with high salt content. This work aimed to provide information to facilitate and clarify these species taxonomic delimitation, throughout the study of the anatomy of their vegetative organs; this may also clarify our understanding of their adaptability to soil and climatic conditions prevailing in areas they inhabit. The plant material was collected from at least three individu- als of each species in Punta Taima Taima and Capatárida, Falcon. Segments of roots, located near the neck and towards the apex, apical, middle and basal internodes of stems, were taken; and of leaves, located in the middle portion of plants. This material was fixed in FAA (formaldehyde, acetic acid, 70% ethanol) until processing. Semipermanent and permanent microscope slides were prepared with transverse or longitudinal sections, made using a razor (free-hand) or a rotation microtome, in this latter case, after paraffin embedding; besides, additional plates were mounted with portions of leaf epidermis, obtained by the maceration technique. The sections were stained with aqueous toluidine blue (1%) or safranin-fast-green, and mounted in water-glycerin or in Canada balsam. In order to calculate the vulnerability index, the vessel diameter in the vascular rings of roots, as well as their density, were quantified. Our results revealed structural features in the different organs, that resulted of taxonomic value and allowed the distinction of the species: in the leaf, the presence of aquifer tissue, the number of vascular bundles and their organization in the midrib, and the collenchyma differentiation in this part of the leaf; in the roots, the xylem and phloem arrangement in the growth rings, the nature of conjunctive tissue, and the presence of included phloem in one species. In addition, the species showed typical anatomical features of halophytes and xerophytes, such as: high density of trichomes on leaves and young stems which act as salt secreting glands, abundant sclerenchyma in stems and roots, water storage tissue and Kranz anatomy in leaves, narrow cortical region in young roots, presence of cambial variants in stems and roots, as well as short and narrow xylem vessels. Vulnerability index calculations indicated that both species tend to assure conduction but not the efficiency of the system. Atriplex species have anatomical characters which facilitate their adaptation to the special conditions prevailing in their habitats and that may be used for taxonomic delimitation.

En Venezuela, Atriplex está representado por A. cristata y A. oestophora, siendo esta última endémica, las mismas habitan zonas costeras con altas temperaturas, alta radiación solar y suelos arenosos con alto contenido de sales. Se caracterizaron anatómicamente sus órganos vegetativos con el fin de aportar rasgos para delimitarlas taxonómicamente y precisar caracteres que contribuyan a su adaptabilidad a las condiciones edafoclimáticas imperantes en su hábitat. El material vegetal fue recolectado en tres individuos de cada especie en Punta Taima Taima y Capatárida (Falcón). Se recolectaron segmentos de raíces próximos al cuello y al ápice; entrenudos basales, medios y apicales, y hojas ubicadas en la porción media de las plan- tas. Este material fue fijado en FAA (formaldehido, ácido acético y etanol 70%) hasta su procesamiento. Se prepara- ron láminas semipermanentes y permanentes con secciones transversales y longitudinales hechas a mano alzada o con micrótomo, en este último caso posterior a la inclusión en parafina. Adicionalmente, se realizaron macerados con el fin de obtener las epidermis foliares. Las secciones fueron teñidas con azul de toluidina acuosa (1%) o con safranina- fastgreen, montándolas en agua/glicerina o en bálsamo de Canadá. Se cuantificó el número de vasos y su densidad en los anillos vasculares de las raíces, para calcular el índice de vulnerabilidad. Se encontraron rasgos estructurales de valor taxonómico: la presencia de tejido acuífero en la lámina foliar, el número de haces vasculares y su organización en el nervio medio, así como la diferenciación de colénquima en el mismo; además, el arreglo del xilema/ floema en los anillos de crecimiento, la naturaleza del tejido conjuntivo, así como la presencia de floema incluso, en las raíces. Se detectaron caracteres anatómicos típicos de halófitas y xerófitas, como son: alta densidad de tricomas en hojas y tallos jóvenes, que actúan como glándulas secretoras de sal, abundancia de esclerénquima en tallos y raíces, tejidos reservantes de agua y anatomía Kranz en hojas, región cortical estrecha en raíces jóvenes, presencia de variantes cambiales en tallos y raíces, así como vasos cortos y estrechos en el xilema. El índice de vulnerabilidad indica que ambas especies tienden a asegurar la conducción, pero no la eficiencia del sistema. Las especies de Atriplex que crecen en Venezuela tienen caracteres que permiten su delimitación taxonómica y que facilitan su adaptación a las condiciones particulares de su hábitat.

Identificación de fragmentos de genes relacionados con la deficiencia de nitrógeno en Eichhornia crassipes (Pontederiaceae)

Eichhornia crassipes is an aquatic plant native to the Amazon River Basin. It has become a serious weed in freshwater habitats in rivers, lakes and reservoirs both in tropical and warm temperate areas worldwide. Some research has stated that it can be used for water phytoremediation, due to its strong assimilation of nitro- gen and phosphorus, and the accumulation of heavy metals, and its growth and spread may play an important role in environmental ecology. In order to explore the molecular mechanism of E. crassipes to responses to nitrogen deficiency, we constructed forward and reversed subtracted cDNA libraries for E. crassipes roots under nitrogen deficient condition using a suppressive subtractive hybridization (SSH) method. The forward subtraction included 2 100 clones, and the reversed included 2 650 clones. One thousand clones were randomly selected from each library for sequencing. About 737 (527 unigenes) clones from the forward library and 757 (483 unigenes) clones from the reversed library were informative. Sequence BlastX analysis showed that there were more transporters and adenosylhomocysteinase-like proteins in E. crassipes cultured in nitrogen deficient medium; while, those cultured in nitrogen replete medium had more proteins such as UBR4-like e3 ubiquitin- protein ligase and fasciclin-like arabinogalactan protein 8-like, as well as more cytoskeletal proteins, including actin and tubulin. Cluster of Orthologous Group (COG) analysis also demonstrated that in the forward library, the most ESTs were involved in coenzyme transportation and metabolism. In the reversed library, cytoskeletal ESTs were the most abundant. Gene Ontology (GO) analysis categories demonstrated that unigenes involved in binding, cellular process and electron carrier were the most differentially expressed unigenes between the forward and reversed libraries. All these results suggest that E. crassipes can respond to different nitrogen status by efficiently regulating and controlling some transporter gene expressions, certain metabolism processes, specific signal transduction pathways and cytoskeletal construction.

Se ha convertido en una maleza importante en hábitats de agua dulce en ríos, lagos y embalses, tanto en zonas tropicales como templadas de todo el mundo. Algunas investigaciones han indicado que se puede utilizar para la fitorremediación de agua, debido a su fuerte asimilación de nitrógeno y fósforo, y la acumulación de metales pesados, su crecimiento y propagación puede desempeñar un papel importante en la ecología ambiental. Con el fin de explorar el mecanismo molecular de respuesta a la deficiencia de nitrógeno en E. crassipes, se construyeron bibliotecas de cDNA mediante síntesis adelantada y retrasada para raíces de E. crassipes en condiciones de deficiencia de nitrógeno mediante el método de hibridación supresiva sustractiva (SSH). Para este estudio se utilizaron 2 100 clones de síntesis adelantada y 2 650 de síntesis retrasada. De la biblioteca se escogieron al azar mil clones, 737 (527 unigenes) de síntesis adelanta- da y 757 (483 unigenes) de síntesis retrasada que fueron informativos. El análisis BLASTX mostró que había más transportadores y proteínas adenosilhomocisteinasa en E. crassipes cultivadas en un medio deficiente de nitrógeno; mientras que las cultivadas en un medio repleto de nitróge- no tenían más proteínas como UBR4 e3 ubiquitina-proteína ligasa y la proteína arabinogalactano 8 tipo fasciclina, así como otras proteínas del citoesqueleto, incluyendo la actina y la tubulina. Clúster del Grupo Ortológico (COG) también demostró que en la biblioteca de síntesis adelan- tada, la mayoría de los marcadores de secuencia expresada (ESTs) estaban involucrados en el transporte de coenzimas y el metabolismo.

Desarrollo de marcadores RAPD-SCAR para Lonicera japonica Thunb. (Caprifolicaceae) para la autenticación de variedades mediante RAPD mejorados y clonación de ADN

Genetic diversity within a species is a common feature, which plays a vital role in its survival and adaptability, and is important for the identification and authentication of a species. Lonicera japonica is a traditionally used medicinal plant, which have been recently genetically characterized by an improved ran- dom ampliﬁed polymorphic DNA (RAPD) analysis. In this study, the molecular markers on the basis of these RAPD fragments have been developed to identify specific L. japonica variety. The DNAs were extracted from fresh young leaves of different samples of L. japonica collected from Shenzhen, Yichang, Leshan, Emei and Loudi, China. The DNA materials were amplified using improved RAPD PCR. Different RAPD bands were excised, cloned and developed for stable sequence-characterized amplified region (SCAR) markers with differ- ent species. Two SCAR markers, JYH3-3 and JYH4-3, have been successfully cloned from improved RAPD fragments. The SCAR marker JYH3-3 was found specific for all of the L. japonica samples collected from the different regions, and another marker JYH 4-3 was strictly specific to the Shenzhen sample from Guangdong province, which is geographically distant from Hubei, Sichuan and Hunan Provinces (source of other L. japonica samples). The marker JYH3-3 was found as specific molecular marker for the identification of L. japonica, while JYH4-3 was found as molecular marker strictly specific for the Shenzhen sample. The developed SCAR mark- ers might serve as more specific molecular markers for L. japonica variety authentication. The combination of improved RAPD analysis and SCAR marker development have resulted useful tools to study the genetic variety of any organism, which we have successfully applied here in L. japonica.

La diversidad genética dentro de una especie es una característica común, que juega un papel vital en su supervivencia y adaptabilidad, y es importante para la identificación y la autenticación de una especie. Lonicera japonica es una planta medicinal utilizada tradicionalmente, que han sido recientemente caracterizada genéticamente por amplificación aleatoria mejorada de ADN polimórfico (RAPD). En este estudio, los marcadores moleculares basados en estos fragmentos de RAPD se han desarrollado para identificar una variedad específica de L. japonica. Los ADN se extrajeron de las hojas jóvenes frescas de diferentes muestras de L. japonica recogidas de Shenzhen, Yichang, Leshan, Emei y Loudi, China. Los materiales de ADN fueron amplificados utilizando el RAPD PCR mejorado. Diferentes bandas RAPD fueron extraídas, clonadas y desarrolladas para las regiones amplificadas de secuencia conocida (SCAR) con marcado- res de diferentes especies. Dos marcadores SCAR, JYH3-3 y JYH4-3, se clonaron con éxito de los RAPD mejorados. El marcador SCAR JYH3-3 se encontró específico para todas las muestras de L. japonica recolectadas en las diferentes regiones, mientras que el otro marcador JYH4-3 era estrictamente específico para la muestra de Shenzhen de la provincia de Guangdong, que está geográficamente distante de Hubei, Sichuan y Provincias Hunan (fuente de otras muestras de L. japonica). Se encontró que JYH3-3 es un marcador molecular específico para la identificación de L. japonica, mientras que JYH4-3 se encontró como marcador molecular estrictamente específico para la muestra de Shenzhen. Los marcadores SCAR desarrollados podrían servir como marcadores moleculares más específicos para la autenticación de la variedad L. japonica. La combi- nación de RAPD mejorado y el desarrollo del marcador SCAR han dado como resultado herramientas útiles para el estudio de la variedad genética de cualquier organismo, que hemos aplicado con éxito en L. japonica.

Antecedentes étnicos y polimorfismo genético del CYP2D6 en los costarricenses

CYP2D6 differences have already been demonstrated within Latin American populations by the CEIBA.FP Consortium of the Ibero-American Network of Pharmacogenetics (RIBEF, as per the acronym in Spanish). However, within the population of Costa Rica, no research has been conducted until now, even though this population has a trihybrid component ancestry that represents an interesting condition. Thus, the present study was aimed to determine the frequency of Ultra-rapid Metabolizers (UMs) and Poor Metabolizers (PMs) in a Costa Rican population, as well as to determine whether there are differences in the CYP2D6-predicted phenotype frequencies among three Costa Rican groups with different ethnic backgrounds. Additionally, these frequencies of PMs and UMs obtained were compared with Ibero-American populations published data. Finally, we also aimed to describe allele frequencies among different Costa Rican ethnic groups. This research has been undertaken within the framework of the RIBEF CEIBA Consortium studies on Latin American populations. A total of 385 individuals were included in the study: 139 mestizos, 197 Amerindians, and 49 Afro-Caribbeans. CYP2D6 genotypes were determined by XL-PCR and Real-Time PCR. The CYP2D6 variant alleles *2, *3, *4, *5, *6, *10, *17, *29, *35 and *41 were also determined. For the entire Costa Rican population, the frequency of PMs and UMs was 6% and 6.5%, respectively. The percentage of UMs in the mestizo population was higher than in the Amerindian population. CYP2D6 UMs vary from 3.6% to 10.1% and PMs from 1.4% to 10.2% among three Costa Rican groups. The highest frequencies of UMs (10.1%) and PMs (10.2%) were found in the mestizo and Amerindian populations, respectively. In conclusion, the frequencies of UMs and PMs for CYP2D6 varied widely across the mestizo, Amerindian and Afro-Caribbean Costa Rican populations. Future research in this population should be oriented to identify new CYP2D6 variants through sequencing methods, as well as to determine CYP2D6 phenotype, in order to establish the phenotype-genotype relation. Finally, further studies involving genetic markers of ancestry are needed in the Costa Rican population.

El Consorcio de la Red Iberoamericana de Farmacogenética CEIBA.FP ha demostrado que existen diferencias en cuanto a CYP2D6 en las poblaciones latinoamericanas. Sin embargo, hasta ahora, se sabe poco de este gen de importancia farmacogenética en la población de Costa Rica, la cual tiene una ancestría trihíbrida. El presente estudio tiene como objetivos: determinar la frecuencia de los fenotipos extrapolados de CYP2D6 en una población costarricense y determinar si existen diferencias en cuanto a las frecuencias de metabolizadores lentos (PMs) y ultra-rápidos (UMs) entre tres grupos con distinto origen étnico. Adicionalmente, las frecuencias de PMs y UMs obtenidas en este estudio fueron comparadas con datos de poblaciones iberoamericanas. Por último, se pretende describir las frecuencias alélicas en los distintos grupos. En el estudio se incluyeron 385 muestras de individuos: 139 mestizos, 197 amerindios y 49 afro-caribeños. Los genotipos CYP2D6 fueron determinados por XL-PCR y PCR tiempo real. Se determinaron las variantes alélicas *2, *3, *4, *5, *6, *10, *17, *29, *35 y *41. Para la población total estudiada las frecuencia de PMs y UMs fueron respectivamente 6% y 6.5%. El porcentaje de individuos UMs fue mayor en la población mestiza que en la amerindia. La frecuencia de UMs varió de 3.6 a 10.1% y la de PMs de 1.4 a 10.1% en los grupos costarricenses. Las frecuencias más altas de UMs (10.1%) y de PMs (10.2%) se encontraron respectivamente en las poblaciones mestiza y amerindia. En conclusión, las frecuencias de UMs y PMs de CYP2D6 varían ampliamente en las poblaciones mestiza, amerindia y afro-caribeña de Costa Rica. Investigaciones futuras en la población de Costa Rica deberían orientarse a identificar nuevas variantes del CYP2D6 mediante métodos de secuenciación, así como a determi- nar el fenotipo de CYP2D6 con el objetivo de establecer la relación fenotipo-genotipo. Finalmente, es necesario realizar estudios adicionales que involucren marcadores genéticos de ancestría en la población costarricense.

Diversidad específica bacteriana en murciélagos de distintos gremios alimenticios en la sierra sur de Oaxaca, México

Specific bacterial diversity in bats of different food guilds in Southern sierra Oaxaca, Mexico. Bats have different ecologic roles in variable ecosystems that have been already described. They have been linked to several zoonoses, however little is known about the relationship between bat microbiota and their diet, and studies on the bacterial ecology of the microbiota in bats are limited. To contribute with the description of this important interaction between microbiota and host, the aim of this work was to characterize the composi- tion and bacterial diversity in the oral and anal regions of 10 species of bats, in relation to food guild. For this, monthly samplings were conducted using four mist nets (19:00-24:00h) from February to October 2012; nets were reviewed every 45 minutes. Each captured organism was sampled in the oral and anal cavities with sterile swabs; these were placed in pre-enrichment media and stored at 4°C. Bacterial samples were studied which through selective media, chromogenic and biochemical tests. We obtained samples from 502 frugivorous, 29 hematophagous and 11 nectivorous bats. We found a total of 26 bacterial species, with the predominant phylum Proteobacteria and the family Enterobacteriaceae. Statistically significant differences were observed between oral and anal microhabitats: frugivorous (t=-3.516, g.l=14.761, p=0.003), hematophagous (t=-3.320, g.l=19.262, p=0.003), and nectivorous (t=-2.497, g.l=11.933, p=0.026), and in some guilds [frugivorous and nectivorous in the anal region (t=2.274, g.l=29.660, p=0.030), hematophagous and nectivorous anal region (t=2.077, g.l=29.904, p=0.049)]. It was also shown that there is bacteria specificity in some guilds such as nectivorous and frugivorous with Bacillus cereus, B. sp. X. sp., as well as, Pseudomonas aeruginosa, Serratia marcescens, Staphylococcus aureus, S. epidermis, Aeromonas hydrophyla in hematophagous. Bacterial presence can be explained by the type of diet and/or by transfer of bacteria from their preys. These bacteria may be indigenous to these bats and play the role of mutual benefit, providing the host with stable growth conditions and supplemental nutrients, while the microbiota contributes to host nutrition, development of the immune system, stabilization of the microbial population and to avoid pathogens colonization. By understanding the importance of the relation- ship between host and its bacterial populations, the conservation efforts being made to protect species such as bats may be improved.

Los estudios sobre ecología bacteriana de la micro- biota en los murciélagos son limitados, dicha información es importante para determinar la importancia de esta interacción entre microbiota y hospedero, por tal motivo el objetivo de este trabajo es caracterizar la composición y diversidad bacteriana en las regiones orales y anales de 10 especies de quirópteros con relación al gremio alimenticio a través de medios selectivos, cromogénicos y pruebas bio- químicas. Se muestrearon 502 murciélagos frugívoros, 29 hematófagos y 11 nectívoros, fueron encontradas un total de 26 especies bacterianas, siendo predominantes el filo proteobacterias y la familia Enterobacteriaceae. Se observaron diferencias estadísticamente significativas entre el microhabitat oral y anal [frugívoros (t=-3.516, g.l=14.761, p=0.003), hematófagos (t=-3.320, g.l=19.262, p=0.003), y nectívoros (t=-2.497, g.l=11.933, p=0.026), así como en algunos gremios (frugívoros e nectívoros en la región anal (t=2.274, g.l=29.660, p=0.030), hematófago y nectívoros en la región anal (t=2.077, g.l=29.904, p=0.049)]. También se mostró que existe especificidad de bacterias en algunos gremios como: Bacillus cereus, B. spp. X. spp. en nectívoros y frugívoros, así como, Pseudomonas aeruginosa, Serratia marcescens, Staphylococcus aureus, S. epidermis, Aeromonas hydrophyla en hematófagos que podría deberse al tipo de dieta que llevan o por transferencia de bacterias al contacto con sus presas. Los murciélagos han sido relacionados con varias zoonosis, sin embargo poco se conoce sobre la relación que existe entre el murciélago, su micro- biota y la dieta que llevan. Estas bacterias pudieran ser autóctonas de los murciélagos y jugar un papel de mutuo beneficio, proveyéndole al hospedero condiciones estables de crecimiento y nutrientes complementarios, mientras que la microbiota contribuye en la nutrición del hospedero, desarrollo del sistema inmune, estabilizando la población microbiana y prohibiendo la colonización de patógenos. Entender la importancia de la relación entre el hospedero y su población bacteriana puede ayudar a mejorar los esfuerzos de conservación que se vienen realizando para proteger especies como los murciélagos.