Revista de Biología Tropical

Relaciones suelo-vegetación en una toposecuencia del Escudo Guayanés, Venezuela

The Guayana Shield is one of the oldest territories in the planet and has millions of years subjected to leaching and erosion processes that produce oligotrophic soils. This scarcity of nutrients has not avoided the development of high, diverse and magnificent forests, where plants have adaptations to survive these difficult conditions. The aim of this work was to characterize the physical and chemical parameters of the soils in different forest communities of the Imataca Forest Reserve (IFR), to establish some interpretations on their origin, and some relationships between the edaphic components and the inhabitant species. Terrestrial journeys were carried out and two path-ways were traced for the interpretation of forest communities. In each community, three plots (100m x 100m) for the ecological survey were established. In each plot, all trees, palms, and lianas were measured (dbh≥10cm; dbh: diameter at breast height); four 10m x 10m understory sub-plots were evaluated, and a census of all the spermatophyta species (dbh<10cm) was made. Soils were evaluated by means of a trial pit in each community, and a bore in each one understory sub-plot. The obtained data were analyzed by both a detrended and a canonical correspondence analysis. Results from a total of 15 plots allowed us to identify three communities: a forest dominated by Mora excelsa located in a narrow valley with high content of silt; a swamp forest dominated by Catostemma commune in a sandy broad valley, and a forest in clay hills dominated by Alexa imperatricis. Most of the soils had a pH between 3.1 and 4.5. Nutrients were in very low concentrations (N: 0-0.2%; P: 0-14ppm; K: 0-0.3Cmol/kg) and Al in toxicity quantities. We observed that Ca/Al relationship greater than 1 meant a neutralization of the toxic effect of Al. Besides, basal area ranged from 20.4 to 32.3m²/ha; the highest level (top local forest development) corresponded with the C. commune community with a Ca/Al value of 2.5. This research found an adequate relationship between soil and vegetation, as it was able to identify three communities into three distinct soil conditions. Nevertheless, edaphic constraints indicated that high forest cover must be maintained as an essential element for the conservation of these communities.

El Escudo Guayanés es uno de los territorios más antiguos del planeta; tiene millones de años sometido a procesos de lixiviación y erosión que dejan suelos oligotróficos. El objetivo de este trabajo fue hacer la caracterización de los parámetros físicos y químicos de los suelos, en diferentes comunidades boscosas de la Reserva Forestal Imataca, e identificar ciertas relaciones entre los componentes edáficos y las especies que allí se presentan. Se realizó un inventario de todos los individuos mayores a 10cm dap (diámetro a la altura del pecho) en 15 parcelas (1ha); en cada una de esas parcelas se evaluaron cuatro sub-parcelas de sotobosque (100m²) para contabilizar todas las espermatofitas; los suelos se evaluaron mediante una calicata por comunidad y un barreno en cada sub-parcela de sotobosque. La mayoría de los suelos tienen un pH muy ácido (3.1-4.5), los nutrientes están en concentraciones muy bajas (N: 0-0.2%; P: 0-14ppm; K: 0-0.3Cmol/kg) y el Al en concentraciones tóxicas. Esto coincide con otros estudios realizados en esta región, pero en este trabajo se encontró que la relación Ca/Al con valores superiores a 1, lo que implica una neutralización del efecto tóxico del Al y permite un mejor desarrollo de las comunidades boscosas.

Distribution patterns of canopy and understory tree species at local scale in a Tierra Firme forest, the Colombian Amazonia

The effect of environmental variation on the structure of tree communities in tropical forests is still under debate. There is evidence that in landscapes like Tierra Firme forest, where the environmental gradient decreases at a local level, the effect of soil on the distribution patterns of plant species is minimal, happens to be random or is due to biological processes. In contrast, in studies with different kinds of plants from tropical forests, a greater effect on floristic composition of varying soil and topography has been reported. To assess this, the current study was carried out in a permanent plot of ten hectares in the Amacayacu National Park, Colombian Amazonia. To run the analysis, floristic and environmental variations were obtained according to tree species abundance categories and growth forms. In order to quantify the role played by both environmental filtering and dispersal limitation, the variation of the spatial configuration was included. We used Detrended Correspondence Analysis and Canonical Correspondence Analysis, followed by a variation partitioning, to analyze the species distribution patterns. The spatial template was evaluated using the Principal Coordinates of Neighbor Matrix method. We recorded 14 074 individuals from 1 053 species and 80 families. The most abundant families were Myristicaceae, Moraceae, Meliaceae, Arecaceae and Lecythidaceae, coinciding with other studies from Northwest Amazonia. Beta diversity was relatively low within the plot. Soils were very poor, had high aluminum concentration and were predominantly clayey. The floristic differences explained along the ten hectares plot were mainly associated to biological processes, such as dispersal limitation. The largest proportion of community variation in our dataset was unexplained by either environmental or spatial data. In conclusion, these results support random processes as the major drivers of the spatial variation of tree species at a local scale on Tierra Firme forests of Amacayacu National Park, and suggest reserve´s size as a key element to ensure the conservation of plant diversity at both regional and local levels.

El efecto de la variación ambiental en la estructura de las comunidades arbóreas en bosques tropicales, aún se debate. En paisajes como los bosques de tierra firme, donde el gradiente ambiental disminuye, el efecto de los suelos sobre los patrones de distribución de especies es mínimo. En contraste, un mayor efecto de la variación edáfica y topográfica sobre la composición florística, se ha reportado en estudios con diferentes tipos de plantas en bosques tropicales. Este estudio se realizó en diez hectáreas de una parcela permanente. Se evaluó el efecto de la variación ambiental y la configuración espacial sobre los patrones florísticos de las especies arbóreas a escala local, según el estado de desarrollo y categorías de abundancia relativa. Se registraron 14 074 individuos de 1 053 especies y 80 familias. Los suelos son ácidos, presentan altas concentraciones de Aluminio y son predominantemente arcillosos. La diversidad beta fue baja. Las diferencias florísticas explicadas fueron asociadas con procesos biológicos espacialmente estructurados, particularmente, con la limitación en dispersión. Aunque, la mayor parte de la variación no fue explicada por las variables consideradas. Estos resultados sugieren que procesos aleatorios son determinantes esenciales de la variación florística en bosques de tierra firme de la amazonia.

On Limnocytherina axalapasco, a new freshwater ostracod (Podocopida: Limnocytheridae) from Mexican crater lakes

Limnocytherina is a genus conformed by 12 species; its distribution in the American continent is known to be exclusively on the North (neartics), but little is reported about its distribution from Mexico (transition zone) and Central America (Neotropics). Different sampling campaigns were undertaken in three crater lakes from the Axalapascos region in east-central Mexico, during 2008, 2009 and 2011. As a product of these campaings, the new species of Limnocytherina axalapasco was found, which displays some intraspecific variability among populations. In this study, we described the taxonomy, the habitat, the ecological preferences and the larval development of this new species. A total of 10 sediment samples (8 littoral, 2 deepest point) were collected from lakes Alchichica, La Preciosa and Quechulac. We found that L. axalapasco is closely related to two North American species: L. posterolimba and L. itasca as well as one Central American species L. royi comb. nov. With the inclusion of L. axalapasco and L. royi to the genus, the distribution of Limnocytherina is extended to Central America. The four most important distinguishing characters of this new species are: 1) valve surface and margins covered with small, spine-like projections; 2) most of the A1 setae with a highly developed setule at distal part, producing a bifurcate appearance; 3) the upper ramus on the hemipenis is elongated, and by far overpasses dorsal/distal margins, distal lobe is triangular and short, while the hook-like process is prominent, outward orientated, and overpassing the tip of the distal lobe; 4) the UR is moderately developed with seta f3 elongated and setae f1 and f2 short. Considering its ecological characteristics and larval development, L. axalapasco was preferably found in alkaline waters dominated by Cl- or HCO3- and Na+ or Mg2+, temperatures ranging between 19.1 to 20.3°C, and dissolved oxygen concentrations from 5 to 6.5mg/L. This species was abundant in deeper (~64m) areas of the saline Alchichica lake, where surface water displayed conductivity values of up to 2 250μS/cm, and the sand with low percentage of silt resulted the preferred substrate. Along with the description of L. axalapasco, we provide additional information on the hemipenis of L. itasca, L. royi and L. sanctipatricii, and we discuss on the Limnocytherina-type of hemipenis.

Limnocytherina es un género conformado por 12 especies; su distribución en el continente Americano se conoce exclusivamente en el norte (zona neártica), pero se sabe poco de su distribución en México (zona de transición) y Centro América (zona neotropical). Luego de diferentes campañas de muestreo en tres lagos cráter de la región de los Axalapascos en la zona centroeste de México, durante 2008, 2009 y 2011, se encontró a Limnocytherina axalapasco, una nueva especie, que mostró variabilidad intraespecífica entre poblaciones. Un total de 10 muestras de sedimentos (8 del litoral, 2 del punto más profundo) fueron recolectadas de los lagos Alchichica, La Preciosa y Quechulac. L. axalapasco esta estrechamente relacionada con dos especies norteamericanas: L. posterolimba y L. itasca, así como con una especie centroamericana Limnocytherina royi comb. nov. Con la inclusión de L. axalapasco y L. royi al género, la distribución de Limnocytherina se extiende hasta Centro América. Los cuatro caracteres distintivos más importantes de esta nueva especie son: 1) superficie y márgenes de valvas cubiertos por pequeñas proyecciones parecidas a espinas; 2) La mayoría de las setas de A1 tienen una setula muy desarrollada en la zona distal, con apariencia de estar bifurcadas; 3) El ramo superior del hemipene es alargado y por mucho sobrepasa los márgenes dorsal/distal; el lóbulo distal es corto y triangular, mientras que el proceso prensil es prominente, orientado externamente y sobrepasa la longitud del lóbulo distal; 4) el UR esta moderadamente desarrollado con la seta f3 alargada y las setas f1 y f2 cortas. Para esta especie se describe también su hábitat, preferencias ecológicas y desarrollo larvario. L. axalapasco prefiere aguas alcalinas dominadas por Cl- o HCO3 - y Na+ o Mg2+, temperaturas entre 19.1 a 20.3°C y concentraciones de oxígeno disuelto de 5 a 6.5 mg/L. Esta especie es más abundante en las zonas profundas (~64m) del lago salino Alchichica, donde la conductividad del agua es de hasta 2 250μS/cm. Arenas con bajos porcentajes de limo parecen ser el sustrato preferido. Aunado a la descripción de L. axalapasco, proveemos información adicional para los hemipenes de L. itasca, L. royi y L. sanctipatricii, y discutimos el tipo de hemipene en Limnocytherina.

Distribution and additive partitioning of diversity in freshwater mollusk communities in Southern Brazilian streams

Additive partitioning of species diversity is a promising approach for analyzing patterns of diversity in mollusk communities, especially their spatial distribution. Our aims were to assess the distribution of mollusk communities in Southern Brazilian streams, and to evaluate the partitioning of community diversity at different spatial scales. The study was carried out in the lower course of the Toropi River, one of the main tributaries of the Ibicuí River Basin, in Southern Brazil. Four microbasins were considered: Sertão da Mata, Ribeirão, Tororaipi and Chiniquá, and sampling were undertaken in autumn, April and May 2009. Six sites were sampled in each stream: two in 1st-order segments, two in 2nd-order segments, and two in 3rd-order segments. All species found and the community as a whole, exhibited a clumped distribution. However, the variance-to-mean ratios for the Drepanotrema kermatoides and Heleobia bertoniana were higher than those of other species, suggesting a higher degree of aggregation. The additive partitioning of the species richness showed that the observed richness at smallest scale (α=within streams) represented 20.7%, and among-streams (β1) represented 10.5% of the total richness. The richness and Shannon diversity index observed at the alpha scale, were higher than those observed at the first level of beta diversity scale (β1=among-streams). The interaction between passive dispersal, tolerance to changes in some environmental variables, abiotic factors, and clumped distribution might have determined the spatial distribution of the communities studied. The greatest variation at the larger scales of analysis, involving among-orders and among-microbasins (β2 and β3, respectively) components, was expected, considering that the increase in distance leads to greater differences in richness (higher beta diversity). In conclusion, our results showed that the clumped distribution influenced the partition of the diversity of the mollusk communities in the streams studied. Dispersal methods and tolerance to variations in abiotic factors also have important roles in determining high alpha diversity. The partitioning of diversity showed that to preserve limnetic mollusks, it is important to preserve local areas, i.e., streams. Accordingly, conservation of streams on a local scale will contribute to conservation of the entire basin and maintenance of regional diversity (gamma).

La partición aditiva de la diversidad de especies es un enfoque prometedor para el análisis de los patrones de diversidad en las comunidades de moluscos, especialmente su distribución espacial. Nuestros objetivos fueron evaluar la distribución de las comunidades de moluscos en los arroyos en el Sur de Brasil, y evaluar la partición de diversidad de la comunidad en diferentes escalas espaciales. El muestreo se llevó a cabo en cuatro cuencas del curso inferior del río Toropi, Brasil. Todas las especies encontradas, y también la comunidad en su conjunto mostraron una distribución agregada. La partición aditiva de la riqueza de especies mostró que la riqueza observada en menor escala (α=dentro de los arroyos) representó el 20.7%, y entre los arroyos (β1) representó el 10.5% de la riqueza total. La riqueza y diversidad de Shannon observadas en escala alfa (α=dentro de los arroyos) fueron mayores que las observadas en el primer nivel de escala de la diversidad beta (β1=entre los arroyos). La mayor variación en las grandes escalas de análisis, con la participación de los componentes entre- órdenes y entre-microcuencas (β2 y β3, respectivamente) fue la esperada, ya que el aumento de la distancia conduce a mayores diferencias de riqueza (mayor diversidad beta). En conclusión, nuestros resultados muestran que la dispersión agregada tuvo influencia en la partición de la diversidad de las comunidades de moluscos en los arroyos estudiados. Los métodos de dispersión y tolerancia a las variaciones de los factores abióticos también juegan un papel importante para determinar la diversidad alfa. Así, la conservación de los arroyos a nivel local contribuirá a la conservación de la cuenca y al mantenimiento de la diversidad regional (gamma).

Growth parameters and density variation of a queen conch, Strombus gigas (Neotaenioglossa: Strombidae), population from Xel-Ha park, a marine protected area

The queen conch, Strombus gigas, is a gastropod of commercial importance in the Caribbean. Population studies are based on size frequency analysis, using either length or weight parameters for the whole live organism. This contribution used mark-recapture data to estimate the von Bertalanffy equation parameters and population number variation within a non harvest population from a protected area, to clarify the biometric parameters that better suit for the whole population, or for the juvenile and adult fractions. Conchs from Xel- Ha Park were monthly sampled from November 2001 to August 2005. Every conch found was measured and marked with a numbered tag that identified month and locality; and monthly abundance was estimated with Jolly’s method. Length, lip thickness and weight increments were used to estimate the von Bertalanffy growth equation parameters with Appeldoorn’s subroutine of FISAT program. The population number varied through the study, with a minimum of 49 in April 2003 and maximum of 9 848 during June 2005. Conchs make only temporary use of Xel-Ha cove. Shell length gave the best fit for the juvenile fraction: L∞=251, K=0.3, C=0.8 Wp=0.3; and lip thickness for adults: L∞=47.78, K=0.17, C=0.1, Wp=0.86, while, the whole population was bet- ter represented by weight: L∞=3850, K=0.36, C=0.8, Wp=0.3. A maximum age of 19 years was estimated from the population. Natural mortality was 0.49/year for juveniles and 0.29/year for adults. There were two pulses of recruitment: fall-winter and summer. It is concluded that population studies from length frequency data, should be analyzed independently in two groups, shell for the juvenile fraction and lip thickness for the adult fraction, or if it is not possible to analyze the population fractions separately, weight should be used to avoid miss calculation of the age structure.

El caracol reina, Strombus gigas, es un gasterópodo de importancia comercial en el Caribe. Los estudios poblacionales se basan en el análisis de las fluctuaciones de las frecuencias de tallas, usando ya sea la longitud de la concha o el peso total de los organismos vivos. Este aporte usa datos de marcaje recaptura para estimar los parámetros de la ecuación de von Bertalanffy y variaciones en el número de la población, para una población sin captura dentro de un área protegida, para aclarar que parámetros se adaptan mejor para estudios de la población entera o para las fracciones de juveniles y adultos por separado. Se muestrearon mensualmente, caracoles del parque Xel-Ha, de Noviembre 2001 a Agosto 2005. Todas las conchas encontradas se se midieron y marcaron con una etiqueta numerada que identificó la fecha de muestréo y la localidad. Las variaciones en abundancia mensual se estimó con el método de Jolly. Se emplearon la longitud de la concha, el grosor de labio y el peso vivo de los animales para determinar los parámeros de la ecuación de crecimiento de von Bertalanffy, usando la subrutina de Appeldoorn del programa FISAT. La población varía a lo largo del estudio, con un mínimo de 49 organismos en abril 2003 y un máximo de 9 848 durante junio 2005. Los caracoles solo hacen uso temporal de la caleta de Xel-Ha. El mejor ajuste para juveniles se obtuvo con la longitud de la concha: L∞=251, K=0.3, C=0.8 Wp=0.3: mientras que para adultos se obtuvo con el grosor del labio: L∞=47.78, K=0.17, C=0.1, Wp=0.86; y la población total se ve mejor representada por el peso: L∞=3850, K=0.36, C=0.8, Wp=0.3. Se estimó una edad máxima para el total de la población de 19 años. Con mortalidad natural de 0.49 año-1 para juveniles y 0.29 año-1 para adultos. Hubieron dos pulsos de reclutamiento: otoño-invierno y verano. Se concluye que los estudios poblacionales realizados a partir de estructura de tallas, deben de analizar por separado dos grupos o fracciones de la población, usando el peso para juveniles y grosor del labio para adultos, de no ser posible analizar la población por separado, debe de emplearse el peso para evitar una subestimación en la estructura de edad.

Seasonal variation in body size and diet of the sea star Astropecten marginatus (Paxillosida, Astropectinidae) off coast of Paraná, Southern Brazil

The sea star Astropecten marginatus has a neotropical distribution and is a highly abundant and frequent species in shrimp trawling by-catchin many places along the Brazilian coast. This has caused its threat to extinction and in addition, its bio-ecological aspects are poorly known. Thus, the main objective of this study was to analyze the seasonal variations of population length structure and feeding habits of the sea stars A. marginatus inhabiting off state of Paraná, Southern Brazil. The analyzed specimens were collected in February (summer), April (fall), June (winter) and October (spring) of 2008 from shrimp by-catch trawling. In the laboratory, each individual had its length measured and then weighed on an analytical scale. Afterwards, the stomach contents of 10 individuals of each of two most frequent length classes were seasonally analyzed. The relative frequency and abundance for each prey category was determined and, then combined into an index of alimentary importance. A total of 994 individuals of A. marginatus were collected with length ranging from 7.0 to 56.2mm, but most individuals were in the 20.1-25mm length classes. Individuals larger than 40mm were only collected in the spring while a few recruits (<10mm) were found in fall and winter. The total weight of individuals ranged from 0.1 to 15.3g and the weight-length relationships showed a negative allometric growth (b<2.54). Regarding its food consumption, this sea star explored eleven food items, with cumaceans and mollusks as the most frequent items. High frequency of empty stomach was recorded at fall. Seasonal differences in the amount explored preys and ingested items as well as in the prey composition were also observed. Higher amount of explored prey categories and ingested items were recorded at winter-spring than summer-fall periods. Predominance in prey category changed from gastropods (summer and fall) to cumaceans (winter and spring). The importance of gastropods as main prey category at summer and fall should be carefully considered since it was coincidently observed with high frequency of empty stomach and low amount of ingested items. The observed seasonal differences in feeding behavior pattern were mainly associated to low prey availability and to changes in the sea star feeding rates, and probably reflected in some biological traits such as small body size of the population inhabiting waters off the Paraná coast, Southern Brazil.

La estrella de mar Astropecten marginatus presenta una distribución neotropical y debido a su abundancia es frecuente encontrarla como captura incidental durante actividades de pesca de arrastre; actividad por la cual se encuentra amenazada en muchos lugares a lo largo de la costa brasileña. En este estudio se analizaron las variaciones estacionales de la estructura de la población y se determinaron los principales componentes de la dieta de A. marginatus frente a la costa de Paraná, sur de Brasil. Las muestras analizadas provinieron de las capturas de la pesca de arrastre recogidas en febrero (verano), abril (otoño), junio (invierno) y octubre (primavera) 2008. De cada individuo se midió la longitud y se pesó, posteriormente se analizó el contenido estomacal de 10 organismos de cada una de las dos clases de talla más frecuentes por cada temporada. Se analizaron 994 ejemplares de A. marginatus, los cuales presentaron una longitud que varió entre 7.0-56.2mm, con mayor frecuencia de individuos entre 20.1-25mm. Los organismos mayores (>40mm) se encontraron solamente en la primavera, mientras aquellos con talla inferior a los 10mm se obtuvieron durante el otoño y el invierno. El peso de los individuos se mantuvo entre los 0.1-15.3g. La relación entre el peso y talla mostró un crecimiento alométrico negativo (b<2.54). En cuanto a la dieta, esta especie consumió un total de once presas, de las cuales los cumáceos y moluscos fueron los grupos más consumidos. Una mayor cantidad de presas exploradas se registró en el invierno-primavera de los períodos de verano-otoño. El predominio de la presa cambió de gasterópodos (verano y otoño) a cumáceos (invierno y primavera). Las diferencias estacionales en el patrón de alimentación podrían estar asociadas a una baja disponibilidad de presas y a los cambios en las tasas de alimentación, lo cual se ve reflejado en algunos rasgos biológicos, como el pequeño tamaño del cuerpo esta población.

Intertidal benthic macrofauna of rare rocky fragments in the Amazon region

Rock fragment fields are important habitat for biodiversity maintenance in coastal regions, particularly when located in protected areas dominated by soft sediments. Researches in this habitat have received surprisingly little attention on the Amazon Coast, despite rock fragments provide refuges, nursery grounds and food sources for a variety of benthic species. The present survey describes the mobile macroinvertebrate species composition and richness of the intertidal rocky fragments in Areuá Island within the “Mãe Grande de Curuçá” Marine Extractive Reserve (RESEX) on the Brazilian Amazon Coast. Samples were collected during the dry (August and November 2009) and rainy seasons (March and May 2010) on the upper and lower intertidal zone, using a 625cm² quadrat. At each season and intertidal zone, macroinvertebrate samples were collected along four transects (20m each) parallel to the waterline, and within each transect two quadrats were randomly sampled. Macroinvertebrates were identified, density determined, and biomass values obtained to characterize benthic diversity from the rocky fragments. The Jackknife procedure was used to estimate species richness from different intertidal zones during the dry and rainy seasons. Macrofaunal community comprised 85 taxa, with 17 “unique” taxa, 40 taxa were common to both intertidal zones and seasons, and 23 taxa have been recorded for the first time on the Brazilian Amazon Coast. Species richness was estimated at 106±9.7 taxa and results suggest that sampling effort was representative. Polychaeta was the most dominant in species number, followed by Malacostraca and Gastropoda. Regarding frequency of occurrence, Crustacean species Dynamenella tropica, Parhyale sp. and Petrolisthes armatus were the most frequent representing >75% of frequency of occurrence and 39 taxa were least frequent representing <5% of frequency of occurrence. Occurrence of crustaceans and polychaetes were particularly noteworthy in all intertidal zones and seasons, represented by 15 and 13 taxa, respectively. The most representative class in abundance and biomass was Malacostraca that represented more than half of all individuals sampled, and was dominated by Petrolisthes armatus. The latter was one of the most frequent, numerous and higher biomass species in the samples. In general, results indicated greater richness and biomass in the lower zone. Additionally, richness and density increase during the rainy season. Rock fragment fields in Areuá Island are rich in microhabitats and include a diverse array of species in a limited area. Our results underline the importance of rock fragment fields in Areuá Island for the maintenance of biodiversity in the Amazon Coast.

Los fragmentos rocosos comprenden un hábitat importante para el mantenimiento de la biodiversidad en las regiones costeras, particularmente cuando estos se encuentran en áreas protegidas dominadas por sedimentos blandos. A pesar de que los fragmentos rocosos proporcionan refugio, zonas de crianza y fuentes de alimento para una gran variedad de especies bentónicas, las investigaciones sobre este hábitat en la costa de la Amazonia han recibido poca atención. El presente estudio describe la composición de macroinvertebrados vágiles y la riqueza de especies en los fragmentos rocosos del intermareal de la isla Areuá en la Reserva Marina Extractiva (RESEX) “Mãe Grande de Curuçá”, en la costa brasileña de la Amazonia. Las muestras fueron recolectadas durante la estación seca (agosto y noviembre 2009) y de lluvias (marzo y mayo 2010) en dos zonas del intermareal (superior e inferior), con un cuadrante de 625cm². En cada zona del intermareal y por temporada se tomaron muestras de macroinvertebrados a lo largo de cuatro transectos (20m cada uno) dispuestos paralelamente a la línea de costa. Dos cuadrantes se muestrearon al azar dentro de cada transecto. Los macroinvertebrados recolectados fueron identificados y se determinó la densidad y la biomasa de organismos para caracterizar la diversidad bentónica de los fragmentos rocosos. La riqueza de especies de las dos zonas del intermareal durante las estaciones seca y de lluvias se estimó por el método de Jackknife. La comunidad de macroinvertebrados estuvo compuesta por 85 taxones, con 17 taxones “único”, 40 taxones fueron comunes para ambas zonas del intermareal y temporadas, y 23 taxones se reportaron por primera vez para la costa brasileña de la Amazonia. La riqueza de especies se estimó en 106±9.7 taxones, por lo que los resultados sugieren que el esfuerzo de muestreo fue representativo. La Clase Polychaeta dominó en número de especies, seguida por Malacostraca y Gasteropoda. Los crustaceos Dynamenella tropica, Parhyale sp. y Petrolisthes armatus fueron las más frecuentes, con una frecuencia de presencia >75% mientras que 39 taxones fueron los menos comunes, con una frecuencia de presencia <5%. La presencia de crustáceos y poliquetos fue particularmente notable en las dos zonas y temporadas, incluyeron 15 y 13 taxones, respectivamente. La Clase Malacostraca fue la más conspicua en términos de abundancia y biomasa, representó más de la mitad de todos los individuos recolectados, con dominio de Petrolisthes armatus. Esta especie fue una de las más numerosas, frecuentes y de mayor biomasa en las muestras. En general, los resultados indican que hay una mayor riqueza y biomasa en el intermareal inferior mientras que la riqueza y la densidad aumentan en la estación lluviosa. Los sectores con fragmentos rocosos en la isla Areuá son ricos en microhábitats e incluyen una gran variedad de especies en un área limitada. Nuestros resultados enfatizan la importancia de los sectores con fragmentos rocosos en la isla Areuá para el mantenimiento de la biodiversidad en la costa de la Amazonia.

Reproductive strategies of two Neotropical killifish, Austrolebias vandenbergi and Neofundulus ornatipinnis (Cyprinodontiformes: Rivulidae) in the Bolivian Gran Chaco

The dry Chaco, a semiarid thorn forest, is experiencing some of the highest deforestation rates globally, coupled with the fact that small-bodied fish are at the highest risk of extinction, the killifish inhabiting this region may be some of the most threatened taxa. Yet, aspects of ecology and life history for Neotropical killifishes in the Bolivian Gran Chaco region are completely lacking, and basic life-history data is of critical importance for the design and implementation of conservation measures. Collections were conducted during the early (January 2011) and late (March-April 2011) rainy season using an area-based sampler and dip net surveys. Fish standard length and body depth were measured as well as the number of oocytes per size class, mean oocyte diameter per size class, and total fecundity for the females of each species. A total of 490 specimens of rivulids were captured; Austrolebias vandenbergi: 85 females, 105 males and 39 juveniles, and N. ornatipinnis: 62 females, 113 males, 86 juveniles. Sexual size dimorphism, absolute fecundity, oocyte developmental stages, oocyte diameter, and population sex ratios were determined for each species. Both species exhibited sexual size dimorphism. Male A. vandenbergi exhibited longer standard length (mean±SD; males: 27.07±3.89mm, females: 23.6±2.02mm) and body depth (males: 8.9±1.7mm, females: 7.2±1.1mm) as compared to females. Male N. ornatipinnis had a similar pattern for both standard length (males: 26.0±7.1mm, females: 19.1±5.83mm) and body depth (males: 5.6±1.9mm, females: 4.7±1.0mm). Austrolebias vandenbergi had fewer and smaller oocytes per female (47±31.6) than N. ornatipinnis (206±131.2). There was a positive relationship between fecundity and female body size in both species. The presence of multiple developmental stages of oocytes (immature, maturing, and mature) suggest that both species of rivulids exhibit fractional spawning, a reproductive strategy that enhances reproductive success in these extreme habitats. Neofundulus ornatipinnis exhibited a higher mean oocyte diameter for all three developmental stages (immature, maturing, and mature) as compared to A. vandenbergi. Austrolebias vandenbergi exhibited an equal adult sex ratio (males:females, 1:1), but there was a slight female biased ratio for N. ornatipinnis (males:females, 1:1.8). These results provide fundamental and valuable information for ensuring rivulid conservation in tropical regions, and also improve the knowledge on the biology and ecology of these poorly known species. To our knowledge, this study represents the first contribution on the reproductive biology of two Neotropical annual rivulid fishes (Austrolebias vandenbergi and Neofundulus ornatipinnis) inhabiting semi-permanent and ephemeral ponds in the Gran Chaco of Southeastern Bolivia.

Información sobre la ecología e historia de vida de varias especies de rivulidos no ha sido estudiada, por lo tanto se analiza la biología reproductiva de dos especies neotropicales (Austrolebias vandenbergi y Neofundulus ornatipinnis) que habitan pozos semipermanentes y temporales en el Gran Chaco Boliviano. Las recolectas se realizaron al inicio y al final de la estación lluviosa. Dimorfismo sexual, fecundidad absoluta, diámetro de los ovocitos y proporción sexual fue determinada para cada especie de rivulido. Machos en las dos especies presentaron mayor tamaño de longitud estándar y altura del cuerpo cuando fue comparado con las hembras. Austrolebias vandenbergi tuvo menor fecundidad por hembra y huevos más pequeños que N. ornatipinnis, pero hembras en ambas especies presentaron una relación estrecha y positiva entre fecundidad y tamaño cuerpo. La presencia de varios estadios gonadales sugiere un desove fraccionado, lo cual es una estrategia reproductiva que promueve la viabilidad y sobrevivencia de estos peces en hábitats de extremas condiciones. La proporción sexual no varió entre machos y hembras de A. vandenbergi (1:1), pero en N. ornatipinnis la proporción sexual fue dominada por las hembras (1:1.8). Este estudio representa uno de los primeros que investiga aspectos de la biología reproductiva de A. vandenbergi y N. ornatipinnis, lo cual es importante para la conservación de rivulidos en regiones tropicales.

On the ecology of the cursorial spider Odo bruchi (Araneae: Zoridae) in a grassland natural reserve from central Argentina

The “Ernesto Tornquist” Provincial Park (ETPP) is located inside the Ventania system (Argentina) and was created to protect one of the last relicts of pampean grasslands. Even though many studies have looked at the vertebrate faunal diversity, biology, and conservation in this Park, few studies have been dedicated to arthropods. Among these, spiders have been used as ecological indicators to evaluate nature conservation status, nevertheless, basic information on their distribution and ecology is necessary for their use as indicator taxa in this region. Thus the goal of this study was to present the phenology and demography of the spider Odo bruchi, a cursorial spider present in the ETPP. For this, spiders were sampled bimonthly using pitfall traps between September 2009-2010 (first year), and March 2011-2012 (second year). A total of 10 traps were placed every 10m along a transect of 100m parallel to the longest axis of a grassland slope with native vegetation. Traps were filled with 1 500mL of ethylene glycol, that were examined and refilled every 60 day period. We collected a total of 799 specimens in two years. Juveniles were the most abundant reaching 47.8% of the total, while males corresponded to 27.8% and females 24.4%. We found significant differences in the mean abundance of O. bruchi: the abundance during spring-summer (Nov-Dec-Jan-Feb) was significantly higher than the other periods of the two years period. Moreover, we found an even abundance distribution throughout the year in the entire study. This work represents one of the first contributions to the ecology of this spider family in the area. Also, our results comprise relevant information to encourage future studies on this spider species as a bio-indicator of the conservation status of pampean grasslands.

El Parque Provincial “Ernesto Tornquist” (PPET) se encuentra dentro del sistema de Ventania (Argentina) y fue creado para proteger uno de los últimos relictos de pastizal pampeano. Aunque se han realizado varios estudios sobre la diversidad, ecología y conservación de la fauna en este Parque, la mayoría se enfocaron en vertebrados, y solo unos pocos estudios se dedicaron a los artrópodos. Las arañas son utilizadas como indicadores ecológicos para evaluar el estado de conservación de los ecosistemas. Cuando se utilizan especies individuales es necesario contar con excelente información básica sobre su distribución y ecología para la elección del taxón indicado. Es por esto que el objetivo de este estudio es presentar la fenología y demografía de Odo bruchi Mello-Leitão 1938 (Zoridae), una araña cursorial que se encuentra en el PPET. Las arañas se capturaron bimestralmente utilizando trampas de caída entre Septiembre 2009-2010 (primer año) y Marzo 2011-2012 (segundo año). Las trampas se colocaron cada de 10m en un transecto de 100m paralelo al el eje más largo de la pendiente del pastizal. Cargamos las trampas con 1 500mL de etilenglicol y las examinamos y recargamos cada 60 días. Recolectamos 799 individuos en dos años. Los jóvenes fueron los más abundantes con un 47.8% del total, mientras que los machos correspondieron al 27.8% y las hembras al 24.4%. Encontramos diferencias significativas en la abundancia media de O. bruchi: la abundancia en primavera-verano (nov-dic-ene-feb) fue significativamente mayor que el resto de los períodos en los dos años estudiados. A su vez, encontramos una distribución similar de la abundancia a lo largo del año en todo el estudio. Este trabajo representa una de las primeras contribuciones a la ecología de esta familia de arañas. Además, los resultados obtenidos comprenden información relevante para fomentar estudios futuros sobre esta especie de araña como un posible bio-indicador del estado de conservación de los pastizales pampeanos.

Characterization of the behavioral and vibrational signals in Euthyrhynchus floridanus (Hemiptera: Pentatomidae) during courtship and copulation

Euthyrhynchus floridanus (Linnaeus) (Hemiptera: Pentatomidae) is a neotropical species belonging to the family Pentatomidae with over 4 000 species described, and is distributed from Florida to Brazil. This study describes the sexual behavior and reported for the first time the production of substrate vibrations by males and females during copulatory behavior and mating. Courtship and copulatory behavior, as well as the diverse signals, were recorded with a phonographic cartridge connected to a video camera. Female vibrations were reproduced in the absence of females and the responses by males were recorded. At least three types of substrate vibrations were distinguished in males and one in females, and these signals were characterized by their low frequency, varying from 127 to 180Hz. The sounds of E. floridianus males were significantly different in frequency, duration and number of pulses, both in courtship and in copulation, for the purring and drumming sounds. The production of sounds in this species is associated principally with mechanical, stimulatory behavior during courtship and copulation. Patterns of behavior and their relation to substrate vibrations suggest that these signals are important for the males in the context of mate location and sexual selection.

Euthyrhynchus floridanus (Linnaeus) (Hemiptera: Pentatomidae) es una especie neotropical perteneciente a la familia Pentatomidae con más de 4 000 especies descritas, y se distribuye desde la Florida hasta Brasil. Este estudio describe el comportamiento sexual y reporta por primera vez la producción de vibraciones de sustrato por machos y hembras durante el comportamiento precopulatorio y la cópula. Se grabó tanto el comportamiento de cortejo y de cópula como las diversas señales producidas utilizando un cartucho fonográfico, conectado a una cámara de video. Posteriormente se reprodujo las vibraciones de las hembras en ausencia de estas y se registró las respuestas de los machos. Se distinguieron al menos tres vibraciones de sustrato distintas para los machos y una para las hembras, y se caracterizaron por ser señales de baja frecuencia que van desde los 127 hasta 180Hz. Las sonidos de los machos en E. floridianus fueron significativamente diferentes en la frecuencia, duración y número de pulsos tanto en el cortejo como en la cópula para los sonidos de ronroneo y tamborileo. La producción de sonidos en esta especie se asoció principalmente con comportamientos estimulatorios- mecánicos durante el cortejo y copula. Patrones de comportamiento y su relación con las vibraciones del sustrato sugiere que estas señales pueden ser importantes para los machos en el contexto de la localización de su compañera y la selección sexual.

Detection of morphometric differentiation in Sattar snowtrout, Schizothorax curvifrons (Cypriniformes: Cyprinidae) from Kashmir Himalaya using a truss network system

Schizothorax curvifrons is a morphometrically and meristically most variable and economically valuable promising fish food from Kashmir Valley. Since there is a lack of information on stock structure of wild populations on this species, this study was aimed to investigate the intraspecific variation of this important snowtrout. For this, two rivers and one lake in Kashmir Himalaya were sampled from January 2011 to October 2012. Fish body measurements were taken and morphometric characters using the truss network system was constructed. Altogether, 506 fish specimens were collected. Data were subjected to principal component analysis, discriminant function analysis and univariate analysis of variance. The first principal component explained 63.44% of total variation, while second and third components explained 8.34% and 5.31%, respectively. The step-wise discriminant function analysis retained two variables that significantly discriminated the populations. Using these variables 83.4% of the original specimens were classified into their correct groups and 81.1% of the cross-validated (leave one out procedure) specimens were classified into their correct groups. All of the total 31 transformed truss measurements exhibited highly significant (p<0.001) differences between the populations. This represents the first attempt on stock structure of S. curvifrons; therefore, this study will hopefully guide fisheries taxonomists about its current stock structure and would help in its management and conservation programme across Kashmir Himalaya area.

Schizothorax curvifrons es un alimento para peces, morfométricamente y merísticamente más variable y de mayor valor económico del Valle de Kashmir. Dado que existe una falta de información sobre la estructura de las poblaciones silvestres de esta especie, este estudio tuvo como objetivo investigar la variación intraespecífica de esta importante trucha de nieve. Para ello, se tomaron muestras de dos ríos y un lago en Kashmir Himalaya, de enero 2011 a octubre 2012. Con las mediciones de los peces se construyó una red truss. En total, se recolectaron 506 muestras de peces. Los datos se sometieron a análisis de componentes principales, análisis de función discriminante y el análisis univariante de la varianza. El primer componente principal explicó 63.44% de la variación total, mientras que los componentes segundo y tercero explicaron el 8.34% y 5.31%, respectivamente. El análisis discriminante por etapas, retuvo dos variables que discriminaron significativamente las poblaciones. El uso de estas variables de 83.4% de los especímenes originales se clasificaron en sus grupos correctos y 81.1% de la validación cruzada (deja fuera un procedimiento) especímenes fueron clasificados en sus grupos correctos. Todas las mediciones para entramados transformados, del total de 31, mostraron diferencias altamente significativas (p<0.001) entre las poblaciones. Esto representa el primer intento de obtener la estructura de la población de S. curvifrons, por lo tanto, este estudio espera orientar a los taxonomistas de peces acerca de la estructura de la población actual y ayudar en su manejo y poder establecer un programa de conservación en el área de Kashmir Himalaya.

Species and size composition of fishes in Barra de Navidad lagoon, Mexican central Pacific

Coastal lagoons are considered important nursery areas for many coastal fishes. Barra de Navidad coastal lagoon (3.76km²) is important for local economy as it supports tourism development and artisanal fisheries. However, the role of this lagoon in the dynamics of coastal fish populations is scarcely known. Thus, the objectives of this research were: to characterize the water of the lagoon and related weather conditions, to develop a systematic list of the ichthyofauna, and to estimate the proportion of juveniles in the total number of individuals captured of most abundant species. Water and fish samples were collected between March 2011 and February 2012. Physical and chemical variables were measured in rainy and dry seasons. Several fishing gears were used including a cast net, beach purse seine and gillnets of four different mesh sizes. Our results showed that the lagoon is most of the time euhaline (salinity 30-40ups), although it can be mixopolyhaline (salinity 18-30ups) during short periods. Chlorophyll and nutrients concentrations suggested eutrophication in the lagoon. Mean water temperature changed seasonally from 24.9°C (April, high tide) to 31.4°C (October, low tide). Considering ichthyofauna species, a total of 36 448 individuals of 92 species were collected, 31 of them adding up to 95% of the total of individuals caught. Dominant species were Anchoa spp. (44.6%), Diapterus peruvianus (10.5%), Eucinostomus currani (8.1%), Cetengraulis mysticetus (7.8%), Mugil curema (5.2%) and Opisthonema libertate (4.5%). The lagoon is an important juvenile habitat for 22 of the 31 most abundant species. These included several species of commercial importance such as snappers (Lutjanus argentiventris, L. colorado and L. novemfasciatus), snook (Centropomus nigrescens) and white mullet (Mugil curema). Other four species seem to use the lagoon mainly as adults. This paper is the first contribution on the composition of estuarine ichthyofauna in Jalisco State, and it also constitutes the more complete reference on the detailed size composition of a set of dominant species in a coastal lagoon in the central Mexican Pacific.

Las lagunas costeras son consideradas áreas de crianza importantes para muchas especies de peces costeros. La laguna costera Barra de Navidad (3.76km²) es importante para la economía local y soporta un desarrollo turístico y pesquerías artesanales. Sin embargo, el rol de esta laguna en la dinámica de las poblaciones de peces costeros es poco conocido. Los objetivos de la investigación fueron: caracterizar el agua de la laguna y las condiciones climáticas relacionadas, elaborar el elenco sistemático de la ictiofauna y estimar la proporción de juveniles en el total de individuos capturados de las especies más abundantes. Las operaciones de recolecta de peces se realizaron entre marzo 2011 y febrero 2012. Se utilizaron varios artes de pesca diferentes que incluyeron atarraya, chinchorro playero y redes de agalla con cuatro tamaños de malla diferentes. Se midieron las variables físicas y químicas en épocas de lluvias y de secas. La laguna es euhalina (salinidad 30-40 ups) la mayor parte del tiempo, aunque en determinados periodos cortos puede tener características mixopolihalinas (salinidad 18-30 ups). Las concentraciones de clorofila y nutrientes indican que la laguna está eutrofizada. La temperatura media del agua varió estacionalmente de 24.9°C (abril, pleamar) a 31.4°C (octubre, bajamar). Se recolectaron en total 36 448 individuos, pertenecientes a 92 especies, de las cuales 31 tienen una relevancia ecológica con base en el número de individuos capturados. Las especies dominantes fueron: Anchoa spp. (44.6%), Diapterus peruvianus (10.5%), Eucinostomus currani (8.1%), Cetengraulis mysticetus (7.8%), Mugil curema (5.2%) y Opisthonema libertate (4.5%). La laguna es un hábitat de juveniles importante para 22 de las 31 especies más abundantes. Estas incluyeron algunas especies de importancia comercial como los pargos (Lutjanus argentiventris, L. colorado y L. novemfasciatus), el robalo (Centropomus nigrescens) y la lisa (Mugil curema). Otras cuatro especies parecen utilizar la laguna principalmente como adultos. El presente trabajo es la primera contribución sobre la composición de la ictiofauna estuarina en el Estado de Jalisco y es también la referencia más completa hasta el momento sobre la composición por tallas del conjunto de especies dominantes en una laguna costera del Pacífico central mexicano.

Environmental heterogeneity and its relationship with diversity and abundance of the fish community in a coastal system of Gulf of Mexico

The coastal lagoons of Veracruz, Gulf of Mexico, include a great variety of biological resources. These resources, especially fish communities, have been barely described and that require more ecological studies. With this aim, this investigation analyzed the spatial and temporal variation of diversity, abundance and assemblages of the fish community and its relationship with physical-chemical parameters of the Chica-Grande coastal system. For this, eight defined sites were monthly sampled for water characteristics and fish community composition (10min hauls of 1 500m² a shrimp trawl net), between September 2005 and November 2006. The spatial-temporal variation of physical-chemical parameters, allowed the definition of two contrasting environments according to salinity, temperature, transparency, dissolved oxy-gen and depth gradients. A total of 1 947 fishes were collected for a total weight of 57.88kg. From these, 22 species, 20 genera and 14 families were identified; and four species were new records for the system. As it was detected for the physical-chemical conditions, the diversity of the fish community also showed a spatial gradient, with high values (H’=2.37, D=3.35, J’=0.82) in the brackish habitat, and low ones in freshwater environments. Fish abundance did not show such a marked gradient response, however, it was higher in the freshwater habitat. The highest diversity (H’=2.05) and species richness (D=2.99) was recorded during the North winds (“nortes”) months (November-February), while density and biomass were higher (0.034 ind./m², 1.42g/m²) during the rainy months (July-October). The Importance Value Index (IVI) defined six dominant species accounting for 77.8% of the fish abundance and 87.9% of total catch by weight. The Canonical Correspondence Analysis (CCA) showed that the fish-habitat relationship was explained by 68% of total variance for the two first axes, where salinity, transparency and temperature changes were the most important environmental variables in determining the fish community composition and distribution. In this study, spatial gradients of environmental variables explained the changes in fish species composition and abundance; while the temporal gradients, the fish community structure and its relationship with seasonal patterns of habitat use by the species during their life cycles.

Las lagunas costeras de Veracruz en el Golfo de México, incluyen gran variedad de recursos biológicos, por lo que requieren mayor conocimiento ecológico, especialmente para sus comunidades de peces. Esta investigación analizó la variación espacial y temporal de la diversidad, abundancia y asociaciones de la comunidad de peces y su relación con los parámetros físico-químicos del sistema lagunar Chica-Grande en Veracruz. Para esto, en ocho estaciones se muestrearon las características del agua y la composición de la comunidad de peces (lances de 10min con red de arrastre camaronera) entre septiembre 2005 y noviembre 2006. La variación espacio-temporal de los parámetros físico-químicos, permitió definir dos ambientes contrastantes de acuerdo con los gradientes de salinidad, temperatura, transparencia, oxígeno disuelto y profundidad. Se recolectaron un total de 1 947 peces con un peso de 57.88kg. De estos, se identificaron 22 especies, 20 géneros y 14 familias; y cuatro especies son nuevos registros para el sistema. Como se observó para las condiciones físico-químicas, la diversidad de la comunidad de peces también mostró un gradiente espacial, con valores altos (H’=2.37, D=3.35, J’=0.82) en el hábitat salobre y bajos en el ambiente más dulce. La abundancia de los peces no reflejó cambios marcados en el gradiente, no obstante, fue mayor en el hábitat más dulce. Durante los meses de “nortes” (Noviembre-Febrero) la diversidad (H’=2.05) y riqueza de especies (D=2.99) fue más alta, mientras que la densidad y biomasa fue mayor (0.034 ind./m², 1.42g/m²) durante los meses de lluvias (Julio-Octubre). El Índice de Valor de Importancia (IVI) definió 6 especies dominantes que representan el 77.8% de la abundancia numérica y el 87.9% de la captura total en peso. El Análisis de Correspondencia Canónica (ACC) mostró que la relación peces-hábitat fue explicada en un 68% de la varianza total para los primeros dos ejes, donde los cambios de salinidad, transparencia y temperatura fueron los factores ambientales que determinaron la composición y distribución de los peces en la comunidad. En este estudio, los gradientes espaciales de las variables ambientales permitieron explicar los cambios en la composición y abundancia de las especies, mientras que los temporales, la estructura comunitaria y su relación con los patrones estacionales de utilización de hábitats por las especies durante sus ciclos de vida.

Population ecology of Crocodylus acutus (Reptilia: Crocodylidae) in Palmasola lagoon, Oaxaca, Mexico

Abundance and population structure are important parameters to evaluate and compare the conservation status of a population over time in a given area. This study describes the population abundance and structure of Crocodylus acutus in Palmasola lagoon, Oaxaca. The field works consisted of night surveys during the new moon phase, between the 21:00 and 24:00h. These were conducted during the dry and wet seasons and counted the number of individuals to obtain population estimates. Recorded encounter rates ranged from 32 to 109.3ind./ km in 40 journeys deployed with an average time of 18 minutes browsing. The estimated population size using the Messel´s model ranged from 32.7 to 93 individuals. For both seasons, there was a marked dominance of subadults, followed by juveniles and to a lesser extent adult individuals, as well as undetermined individuals (i.e. unknown body/size/length), in both seasons. There was also a significant association with mangrove areas (26.1%) by juveniles; the subadults´s individual use of superficial water (22.7%) and mangrove areas (15.7%); meanwhile the adults were observed on superficial water (9.7%). This information contributes to our understanding of the population ecology of C. acutus in the Palmasola lagoon where the estimated population size seems to show higher values when compared to other reports in the country.

La abundancia y estructura poblacional son pará-metros importantes para evaluar y comparar el estatus de conservación de una población a través del tiempo en un área determinada. Este estudio describe la abundancia y estructura poblacional de Crocodylus acutus en la laguna Palmasola, Oaxaca. El trabajo consistió en recorridos nocturnos, entre las 21 y 24h, durante la fase de luna nueva para contabilizar el número de individuos y obtener estimaciones poblacionales. El tamaño poblacional estimado fluctuó de 32.7 a 93 individuos según el modelo utilizado. Las tasas de encuentro registradas fluctuaron de 32 a 109.3 ind/km lineal durante los 40 recorridos efectuados con un tiempo promedio de navegación de 18 minutos. Existió una marcada dominancia de la clase III (subadultos), seguido por la clase II y en menor proporción las clases IV y V, así como aquellos individuos en los que no se pudo determinar el tamaño corporal, en ambas épocas del año. Mientras tanto, los individuos juveniles (Clase II) se observaron en mayor proporción asociados al manglar que cubre las orillas del cuerpo de agua (26.1%), los individuos subadultos (Clase III) a menudo se observaron sobre el espejo de agua sin vegetación flotante (22.7%) y entre el manglar que cubre las orillas del cuerpo de agua (15.7%), mientras que los ejemplares adultos se observaron con mayor frecuencia sobre el espejo de agua sin vegetación flotante (9.7%). Con la presente información se contribuye al conocimiento de la ecología poblacional de C. acutus en la laguna Palmasola donde el tamaño poblacional estimado parece mostrar valores altos con respecto a lo reportado en otros estados de la República Mexicana.

Reproductive biology of Pleurodema guayapae (Anura: Leptodactylidae: Leiuperinae)

Pleurodema guayapae is a species that inhabits saline environments and semidesert zones from central Argentina. To date, the knowledge about the reproductive biology of this species is very poor, and our aim is to contribute to its knowledge with the description of some important reproductive aspects. For this, field work was undertaken in an area near to Patquía, La Rioja province. Sampling was undertaken during three summer periods (2006-2007; 2007-2008; 2008-2009) in Chamical-Patquía area, where we could find reproductively active populations. We observed and described breeding sites, type of clutch, process of foam nest construction, clutch and egg number and sizes, and hatching time and stage. Behaviour observations were performed from the time that males began to call until the pairs ended up the foam nests building, and layed the eggs. Additionally, one amplected pair was observed and filmed in the process of foam nest construction, and four amplectant pairs were collected and separatelly placed in plastic containers, for nests observations in the laboratory. Hatching time was based on three different foam nests of known age. We found that P. guayapae populations were acoustically active only after a rainfall. Its breeding sites were represented by ephemeral ponds of fresh water, product of rains. The males emitted their calls inside or outside these ponds. A detailed description of the foam nest construction process by both females and males was made. The clutches were in dome-shaped foam nest type of 6-9cm in diameter and 1-3cm in height, some of which were in communal nests. The nests had an average of 1 137 pigmented eggs. This species showed a short hatching time. Our results allow us to conclude that this species should be considered an extreme explosive breeder. Our results are discussed with others obtained for related species.

Pleurodema guayapae es una especie que habita en zonas semidesérticas y salinas del área central de Argentina. Los conocimientos actuales sobre la biología reproductiva de esta especie son muy pobres, por lo que nuestro objetivo fue contribuir a su conocimiento con la descripción de algunos aspectos reproductivos importantes. Para ello se realizaron tres campañas de muestreo durante los veranos (2006-2007, 2007-2008 y 2008-2009) en el área de Chamical-Patquía, provincia de La Rioja, donde se encontraron poblaciones reproductivamente activas. Se observaron y describieron los sitios reproductivos, tipo de puesta, proceso de construcción del nido de espuma, tamaño de la puesta y de los huevos, número de huevos por puesta y tiempo y estado de eclosión de la larva. Las observaciones de comportamiento se realizaron desde el momento en que los machos comenzaron a emitir los cantos hasta que la pareja en amplexo terminó de construir el nido de espuma con los huevos en su interior. Además, se observó y filmó una pareja en amplexo, en el proceso de construcción del nido de espuma y se recolectaron cuatro parejas en amplexo y se colocaron separadamente en recipientes plásticos para que sus puestas pudieran ser observadas en el laboratorio. El tiempo de eclosión se determinó en tres nidos de espuma de edad conocida. Se encontró que las poblaciones de P. guayapae solo estuvieron acústicamente activas luego de una lluvia torrencial. Los sitios de reproducción fueron charcas efímeras de agua de lluvia. Los machos emitieron sus cantos de advertencia desde adentro o fuera de esas charcas. Se realizó una descripción detallada del proceso de construcción del nido de espuma por parte de la hembra y el macho de P. guayapae. El tipo de la puesta en esta especie es un nido de espuma flotante con forma de domo de 6 a 9cm de diámetro y de 1 a 3cm de alto, algunos de los cuales estaban unidos entre sí formando puestas comunales. Los nidos de espuma poseen en promedio 1 137 huevos pigmentados. Esta especie mostró un tiempo de eclosión corto. Nuestros resultados nos permiten concluir que P. guayapae debe ser considerada como reproductor explosivo extremo. Nuestros resultados son discutidos con los obtenidos en otras especies afines.

Reproductive ecology of Geobatrachus walkeri (Anura: Strabomantidae)

Geobatrachus walkeri is a frog that belongs to a monotypic genus and is endemic to the Sierra Nevada de Santa Marta, Colombia. The species inhabits different microhabitats between 2 000 to 3 500m altitude, including the leaf litter of a pine plantation. To understand its reproductive ecology, we conducted eight frog samplings, covering the rainy and dry seasons, and two habitat types (secondary native forest and pine plantation) during 2010-2011. For this study, we also included data obtained from five previous similar samplings undertaken during 2008-2009. The pine leaf litter was the main microhabitat where frogs were found; we heard choruses of six-ten calling males during all sampled months, and observed the frogs having diurnal and nocturnal activity. Regardless of the year of study, the population consisted of neonates recruited several times of the year, a large number of juveniles with a wide range of body sizes, and fewer adults with a narrower range of body size. The histological analyses of the gonads showed that the size at maturity was near 18mm SVL for males and females, and those adult males and females were reproductive active during all sampling months, suggesting a continuous reproductive activity pattern. However, during the dry season, the seminiferous tubules showed a drastically diminished spermatic epithelium although containing abundant luminal spermatozoa, which suggest a reduction in the sperm production at the end of this season. Similarly, frogs of all age categories were significantly more abundant during the early dry season, whereas were significantly less abundant with the advancement of the dryness suggesting that the intensity of the dry season could temporally stop the activity and reproduction of this population.

Geobatrachus walkeri es una rana que pertenece a un género monotípico y es endémica de la Sierra Nevada de Santa Marta, Colombia. La especie habita en diferentes microhábitats entre los 2 000 y 3 500m de altitud, incluyendo la hojarasca de una plantación de pinos. Para entender su ecología reproductiva se realizaron ocho muestreos de individuos, que abarcaron las estaciones de lluvias y de sequía y dos tipos de hábitats (bosque secundario y plantación de pino) durante 2010-2011. También se incluyeron los datos de cinco muestreos similares obtenidos previamente durante el período 2008-2009. El principal microhábitat donde las ranas se encontraron fue la hoja-rasca de pino, allí escuchamos coros de seis-diez machos durante todos los meses muestreados, y observamos que las ranas tienen actividad diurna y nocturna. Sin importar el año de estudio, la población se compone de neonatos reclutados en varios meses del año, un gran número de juveniles con un amplio rango de tamaños corporales, y un menor número de adultos con un rango más reducido de tamaño corporal. Los análisis histológicos de las gónadas mostraron que el tamaño a la madurez se adquiere cerca de los 18mm LRC para machos y hembras, y que los machos y hembras adultos fueron reproductivos durante todo el muestreo, lo que sugiere un patrón continuo de actividad reproductiva. Sin embargo, durante la estación seca, los túbulos seminíferos presentan un epitelio espermático drásticamente disminuido, aunque contienen abundantes espermatozoides luminales, lo que sugiere una reducción en la producción de espermatozoides en el final de la estación seca. Del mismo modo, las ranas de todas las categorías de edad fueron significativamente más abundantes durante el inicio de la estación seca, mientras que fueron significativamente menos abundantes con el avance de la sequedad, lo que sugiere que una mayor intensidad de la temporada de sequía podría detener temporalmente la actividad y la reproducción en esta población.

Geographic data for Neotropical bats (Chiroptera)

The global effort to digitize biodiversity occurrence data from collections, museums and other institutions has stimulated the development of important tools to improve the knowledge and conservation of biodiversity. The Global Biodiversity Information Facility (GBIF) enables and opens access to biodiversity data of 321 million of records, from 379 host institutions. Neotropical bats are a highly diverse and specialized group, and the geographic information about them is increasing since few years ago, but there are a few reports about this topic. The aim of this study was to analyze the number of digital records in GBIF of Neotropical bats with distribution in 21 American countries, evaluating their nomenclatural and geographical consistence at scale of country. Moreover, we evaluated the gaps of information on 1° latitude x 1° longitude grids cells. There were over 1/2 million records, but 58% of them have no latitude and longitude data; and 52% full fit nomenclatural and geographic evaluation. We estimated that there are no records in 54% of the analyzed area; the principal gaps are in biodiversity hotspots like the Colombian and Brazilian Amazonia and Southern Venezuela. In conclusion, our study suggests that available data on GBIF have nomenclatural and geographic biases. GBIF data represent partially the bat species richness and the main gaps in information are in South America.

Los esfuerzos globales para digitalizar los datos de ocurrencia de la biodiversidad en colecciones, museos y otras instituciones han estimulado el desarrollo de herramientas para mejorar el conocimiento y conservación de la biodiversidad. La “Global Biodiversity Information Facility” GBIF permite el acceso a más de 321 millones de registros, alojados en 379 instituciones. Los murciélagos neotropicales son un grupo muy diverso y especializado y la información geográfica del grupo se ha incrementado desde hace unos años, pero son pocos los reportes acerca del tema. El objetivo de este estudio fue analizar el número de registros disponibles en GBIF de los murciélagos neotropicales de 21 países de América. Por lo tanto, se evaluó la consistencia del nombre científico y la calidad geográfica a escala de país. Además, se evaluaron vacíos de información sobre una grilla de 1° latitud y 1° longitud. Hubo cerca de 1/2 millón de registros, de los cuales el 58% no incluyeron coordenadas geográficas; el 52% pasaron las dos evaluaciones. Se estimó que el 54% del área geográfica analizada no tiene registros; los vacíos están en centros de biodiversidad como la Amazonía y la Patagonia. En conclusión nuestros resultados sugieren que los datos disponibles en GBIF tienen sesgos geográficos y en los nombres científicos. Los datos de GBIF representan parcialmente las riquezas de murciélagos, además los principales vacíos de información se encuentran en América del Sur.

Effects of landscape and vegetation structure on the diversity of phyllostomid bats (Chiroptera: Phyllostomidae) in Oaxaca, Mexico

The tropical forest fragmentation is known to affect the spatial structure of the landscape and habitat. These alterations can modify the attributes of bat assemblages, however, this phenomenon has been little studied and understood. In this work we evaluated the structure of landscape (i.e. composition and configuration) and vegetation, and its relationship with assemblage- and population-level characteristics of phyllostomid bats in a tropical rainforest of Southeastern Mexico. For this, we previously selected 12 sites located in continuous and fragmented forests, where bats were captured using mist nets during a two years sampling effort (144 nights). Bats relative abundance, species richness (diversity of order 0, 0D), Shannon diversity index (¹D) and Simpson index (²D) were evaluated in all sites, and their relationship with seven measures of landscape structure and seven measures of vegetation structure was described using a Hierarchical Partitioning Analysis. A total of 1 840 individuals of 29 species of phyllostomid bats were captured in this period. Differences in the assemblages were manifested only in the relative abundance and not in the richness of the species. The assemblages of fragmented forest exhibited greater variation in species composition and a greater abundance of frugivorous and nectarivorous bats in comparison with the assemblages of continuous forest. The landscape configuration was related to the assemblage- and population-level attributes, contrasting with previous studies where the composition was a key element. At habitat level, tree density and canopy cover determined the abundance of bats. Nectarivorous and frugivorous bats were mostly found in disturbed vegetation landscapes, primarily due to landscape configuration (e.g. edge density). This phenomenon could be a response to the availability of food in primary and intermediate successional stages, which are characterized by an abun-dance of food value.

La fragmentación de bisques tropicales altera la estructura especial del paisaje y del habitat . Estas alteraciones pueden modificar los atributos de las agregaciones de murciélagos, sin embargo este fenómeno ha sido poco estudiado y comprendido. Se evaluó la estructura del paisaje (i.e. composición y configuración) y vegetación, y sus relaciones con características a nivel de agregación (ensamble) y población de murciélagos filostómidos en una selva tropical del sureste de México. Se encontró que las modificaciones en las agregaciones solo se manifiestan en la abundancia relativa y no en la riqueza de especies. La configuración del paisaje fue un elemento relacionado con los atributos a nivel de ensamble y de población, contrastando con estudios previos donde la composición fue un elemento clave. A nivel de hábitat se encontró que la densidad arbórea y cobertura del dosel determinan la abundancia de murciélagos. Los murciélagos nectarívoros y frugívoros prefieren paisajes con vegetación alterada y están relacionados principalmente con la configuración del paisaje. Este fenómeno podría ser una respuesta a la disponibilidad de alimento en ambientes sucesionales primarios e intermedios, que se caracterizan por una alta proliferación de plantas con potencial alimenticio.

Nupela species (Naviculales: Bacillariophyceae) from Colombian lowland waters including N. acaciensis nov. sp. and N. catatumbensis nov. sp.

The genus Nupela comprises ca. 50 species that generally have a distribution restricted by bioclimatic frontiers. As part of an integrated analysis of the diatom flora of Colombia, in this study we focused our interest on the genus Nupela from lowland waters. Periphyton samples were collected from 150 sites of lotic water bodies in Colombia, taking into account hidrogeomorfological variability. In each sampling station, periphyton samples were obtained by scraping, and temperature, pH, dissolved oxygen and conductivity variables were measured. Samples were processed by both light microscopy (LM; Carl Zeiss Axio Scope.A1) and scanning electron microscopy (SEM; FEI-Quanta 450 and a Jeol JSM-6360 LV). The genus Nupela was found in 28 sites. Five taxa were identified, described and illustrated from tropical or subtropical environments: N. lesothensis, N. praecipua y N. subpallavicinii; these were new records for Colombia, and N. acaciensis and N. catatumbensis two new species for science. N. acaciensis is characterized by raphe branches of both valves equally long combined with cymbelloid symmetry, striae built by 2 transapically elongated areolae that delimit a longitudinal line at each hemivalve. N. catatumbensis is characterized by the presence of a well developed raphe in both valves; valves lanceolate with subcapitated to capitated ends and cymbelloid symmetry, striae built by 3-4 transapically elongated areolae, interestriae elevated as transapical ribs and internal proximal raphe ends hook-shaped. The genus Nupela was widely distributed in the studied basins but showed different distribution patterns: N. acaciensis and N. subpallavicini had a restricted distribution, while N. catatumbensis, N. lesothensis and N. praecipua had a wider distribution, and were collected in sites with significant variations in their ecomorphology, altitude, temperature, pH and electrolyte content.

El género Nupela comprende alrededor de 50 especies que tienen en general una distribución restringida por fronteras bioclimáticas. Como parte de un estudio integral de la flora diatomológica de Colombia, en este trabajo focalizamos nuestro interés en el género Nupela en cuerpos de agua de tierras bajas. Muestras de perifiton fueron recolectadas en 150 sitios en cuerpos de agua lóticos seleccionados por su variabilidad hidrogeomorfológica. En cada estación de muestreo se obtuvieron muestras por raspado de varios sustratos, y adicionalmente se registraron: temperatura, pH, oxígeno disuelto y conductividad. Las muestras fueron procesadas para su análisis con microscopio óptico (MO, Carl Zeiss Axio Scope. A1) y de barrido (MEB; FEI- Quanta 450 and a Jeol JSM-6360 LV). El género Nupela fue hallado en 28 sitios. Cinco especies fueron identificadas, descritas e ilustradas, tres de ellas: N. lesothensis, N. praecipua y N. subpallavicinii fueron descritas para ambientes tropicales y subtropicales y representan nuevas citas para Colombia. Además fueron descritas N. acaciensis y N. catatumbensis, dos especies nuevas para la ciencia. N. acaciensis se caracteriza por poseer rafe desarrollado en ambas valvas, simetría cymbelloide, estrías formadas por dos aréolas transapicalmente alargadas que definen una línea longitudinal en cada hemivalva. N. catatumbensis se caracteriza poseer rafe desarrollado en ambas valvas. Valvas lanceoladas con extremos subcapitados a capitados y simetría cymbelloide. Estrías formadas por 3-4 aréolas transapicalmente alargadas, interestrías elevadas a modo de costillas transapicales y extremos proximales internos del rafe en forma de gancho. El género Nupela estuvo ampliamente representado en el área de estudio, sin embargo, las especies mostraron diferentes patrones de distribución. N. acaciensis y N. subpallavicini estuvieron presentes en una única cuenca, mientras que N. catatumbensis, N. lesothensis y N. praecipua presentaron una distribución más amplia, y fueron recolectadas en sitios con variaciones significativas en ecomorfología, altitud, temperatura, pH y contenido electrolítico.

Ecogeography of the genus Sticta (lichenized Ascomycota: Lobariaceae) in Colombia

Colombia is a megadiverse country, but with a substantial gap in the taxonomic and ecological knowledge of fungi and lichens. Thus, the objective of the present study was an ecogeographical analysis of the Sticta species in Colombia. The data included macrodistribution (with respect to mountain ranges and life zones) and microhabitat preferences (light, substrate) and were obtained from field work and herbarium collection labels (completed by comparison with modern geographic and vegetation maps), for 103 species of Sticta currently recognized in Colombia (plus seven additional biotypes with different photobionts or reproductive mode). Using non-metric multidimensional scaling (NMS), correlations between ecogeographical variables and species were established, and ecotypes were delimited. Colombian species of Sticta showed distinct distribution patterns relative to altitude, mountain ranges, life zones, as well as light exposure and substrate, forming several distinct groups. Cyanobacterial species tend to have wider distribution ranges than green algal species. We concluded that the orogeny of the Northern Andes substantially affected speciation of the genus Sticta and its ecogeographical differentiation.

Colombia es un país megadiverso, pero con una ausencia significativa en el conocimiento de la taxonomía y ecología de hongos y líquenes. Por lo tanto, el objetivo del presente estudio era un análisis ecogeográfico de las especies de Sticta de Colombia. Los datos incluyeron la macrodistribución (con respeto a las cordilleras y zonas de vida) y preferencias de microhabitat (luz, sustrato) y fueron obtenidos mediante trabajo de campo y en el herbario (complemetados con mapas modernos de geografía y vegetación), para 103 especies actualmente reconocidas en Colombia (más siete biotipos con diferentes fotobiontes o modo de reproducción). Se elaboró un análisis de ordenación usando la técnica de escalamiento multidimensional no métrico (NMS), para establecer correlaciones entre variables ecogeográficas y las especies y para definir ecotipos. Las especies de Sticta en Colombia presentan patrones de distribución relativos a la altitud, las zonas de vida y la ubicación en las cordilleras, tanto como luz y sustrato, formando varios grupos distintos. Las especies con ciano-bionte tienen un rango de distribución más amplio que las especies con fotobionte verde. Concluimos que la orogenia de los Andes afectó significativamente la especiación del género Sticta y su diferenciación ecogeográfica.

Ontogeny of the sporangium, spore formation and cytochemistry in Colombian Lycopodials (Lycopodiaceae)

Studies on reproductive aspects of Lycopodiaceae are not very abundant in the scientific literature, and constitute essential information to support taxonomic and systematic relationships among the group. Here we present a detailed study of the ontogeny of sporangia and sporogenesis, and the chemical determination of several compounds generated during spore formation. The analyses were performed in 14 taxa of six genera of the family, Diphasiastrum, Diphasium, Huperzia (a genus which is treated here including Phlegmariurus), Lycopodiella, Lycopodium and Palhinhaea. Specimens were collected in three departments from the Colombian Andes between 1 454-3 677m altitude. Ontogeny was studied in small, 1cm long pieces of strobili and axis, which were fixed in glutaraldehyde or FAA, dehydrated in alcohol, embedded in LR White, sectioned in 0.2-0.5μm and stained with toluidine blue (TBO), a metachromatic dye that allows to detect both sporopollenin and lignin or its precursors, during these processes. For other studies, paraplast plus-embedded sections (3-5μm) were stained with safranin-fast green and alcian blue-hematoxylin. Chemical tests were also conducted in sections of fresh sporangia at different stages of maturity using alcian blue (mucopolysaccharides), Lugol solution (starch), Sudan III (lipids), phloroglucinol (lignin) and orcein (chromosomes). Sections were observed with photonic microscope equipped with differential interference contrast (DIC) and fluorescence microscopy (for spore and sporangium walls unstained). Strobili and sporangia were dehydrated with 2.2 dimethoxypropane, critical point dried and coated with gold for scanning electron microscopy (SEM). Our results indicated that the ontogeny of sporangia and sporogenesis were very similar to the previously observed in Huperzia brevifolia. Cutinisation occurs in early stages of development of sporangium cell walls, but in their final stages walls become lignified. As for the sporoderm development, the exospore is the first layer formed, composed by sporopollenin. The endospore deposits as a thin inner layer composed of cellulose, pectin and carboxylated polysaccharides. The perispore, if present, deposits at last. Mucopolysaccharides were found on the sporocyte coat and its abundance in sporangial cavity persists up to the immature tetrads stage, and then disappears. The lipids were abundant in the sporocytes, tetrads and spores, representing the main source of energy of the latter. In contrast, starch is not detected in the spores, but is abundant in premeiotic sporocytes and immature tetrads, developmental stages of high cellular metabolic activity. Intrinsic fluorescence corroborates the presence of lignin and cutin in the sporangium wall, while the sporopollenin is restricted to the exospore. The transfusion cells and the perispore are not always present. However, the processes of ontogeny and sporogenesis are extremely similar throughout the taxa studied, suggesting that they represent conservative family traits, nonspecific or generic.

Los estudios sobre aspectos reproductivos no son muy abundantes en la literatura científica sobre los taxones de Lycopodiaceae y constituyen información esencial para apoyar la taxonomía y relaciones sistemáticas en el grupo. Por lo tanto, se presenta aquí un análisis detallado de la ontogenia de los esporangios y esporogénesis, así como determinaciones químicas de varios compuestos generados durante la formación de las esporas. Los análisis se llevaron a cabo en 14 taxones de seis géneros de la familia: Diphasiastrum, Diphasium, Huperzia (un género que se trata aquí, incluyendo Phlegmariurus), Lycopodiella, Lycopodium y Palhinhaea. Las muestras fueron recolectadas en tres departamentos de los Andes de Colombia entre 1 454-3 677m de altitud. La ontogenia se estudió en trozos de estróbilos y ejes, de 1cm de largo, que se fijaron en glutaraldehido o FAA, se deshidrataron en alcohol, se incluyeron en LR White, se seccionaron en cortes de 0.2-0.5μm y se colorearon con azul de toluidina (TBO), un colorante metacromático que permite detectar tanto esporopolenina como lignina o sus precursores. Para estudios adicionales, secciones de 3-5μm de material incluido en paraplast plus se colorearon con safranina-verde rápido y azul alciánhematoxilina. Las pruebas químicas se llevaron a cabo en secciones de esporangios sin fijar en diferentes etapas de madurez utilizando azul alcián (mucopolisacáridos), solución de Lugol (almidón), Sudán III (lípidos), fluoroglucinol (lignina) y orceína (cromosomas). Las observaciones se efectuaron con microscopio fotónico equipado con contraste diferencial de interferencia (DIC) y microscopía de fluorescencia (para esporas y pared de los esporangios sin colorear). Para observaciones con microscopía electrónica de barrido (MEB), los estróbilos y esporangios se deshidrataron con 2,2 dimetoxipropano, se desecaron a punto crítico y se metalizaron con oro. Los resultados indican que la ontogenia de los esporangios y esporogénesis es muy similar a la observada previamente en Huperzia brevifolia. En las primeras etapas de desarrollo, las paredes celulares de la epidermis del esporangio se cutinizan y en las finales se lignifican. En el desarrollo del esporodermo, la primera capa que se forma es el exosporio, compuesto por esporopolenina. El endosporio es una capa interna delgada compuesta de celulosa, pectina y polisacáridos carboxilados. El perisporio, si está presente, es la última capa que se deposita. Los mucopolisacáridos se encontraron en la cubierta del esporocito, son abundantes en la cavidad esporangial hasta la etapa de tétradas inmaduras y luego desaparecen. Los lípidos son abundantes en esporocitos, tétradas y esporas, y representan la principal fuente de energía de estas. En contraste, el almidón no se detecta en las esporas pero es abundante en esporocitos premeióticos y tétradas inmaduras, ambos con gran actividad metabólica. La fluorescencia intrínseca corrobora la presencia de lignina y cutina en la pared del esporangio, mientras que la esporopolenina se limita al exosporio. Las células de transfusión y el perisporio no siempre están presentes. Sin embargo, los procesos de la ontogenia y esporogénesis son extremadamente similares en todos los taxones estudiados, lo que sugiere que representan rasgos típicos de familia, no específicos ni genéricos.

Logging impacts on forest structure and seedling dynamics in a Prioria copaifera (Fabaceae) dominated tropical rain forest (Talamanca, Costa Rica)

The factors that determine the existence of tropical forests dominated by a single species (monodominated forests) have been the subject of debate for a long time. It has been hypothesized that the low frequency of disturbances in monodominated forests and the tolerance to shade of the monodominant species are two important factors explaining the prolonged dominance of a single species. We determined the role of these two factors by examining the effects of logging activities on the floristic composition and seedling dynamics in a Prioria copaifera dominated forest in Southeastern Costa Rica. We determined the floristic composition for trees ≥2.5cm DBH and the associated recruitment, survival and mortality of tree canopy seedlings in two sites logged two (L-02) and 12 years (L-12) prior to sampling and an unlogged forest (ULF). Our results showed that L-02 stands had lower species richness (25 species) than the L-12 and ULF stands (49 and 46 species, respectively). As expected, we found significant logging effects on the canopy structure of the altered forests, particularly when comparing the L-02 and the ULF stands. Seedling density was higher in ULF (0.96 seedlings/m²) than in the L-02and L-12 stands (0.322 and 0.466 seedlings/m², respectively). However, seedling mortality was higher in the ULF stands (54%) than in the L-02 (26%) and L-12 (15%) stands. P. macroloba in L-02 was the only species with abundant regeneration under P. copaifera in L-02 stand, where it accounted for 35% of the seedlings. Despite the reduction in seedling abundance observed after logging, P. copaifera seems to maintain large seedling populations in these forests, suggesting that this species maintains its dominance after logging disturbances. Our findings challenge the hypothesis that the regeneration of monodominant species is not likely to occur under heavily disturbed canopy conditions. Rev. Biol. Trop. 62 (1): 347-357. Epub 2014 March 01.

La determinación de los factores responsables de la existencia de bosques tropicales dominados por una sola especie (bosques monodominados) ha sido motivo de debate por largo tiempo. Se ha propuesto que la baja frecuencia de alteraciones en esos bosques y la tolerancia a la sombra de las plántulas de la especie monodominante son dos de los factores que contribuyen a explicar la prolongada dominancia de una sola especie en estos bosques. Se estudió el rol de estos dos factores evaluando el efecto de la extracción de madera sobre la composición florística y la supervivencia y crecimiento de plántulas en un bosque dominado por Prioria copaifera en la región sureste de Costa Rica. Para ello se determinó la composición florística de los árboles con un diámetro a la altura de pecho (DAP) ≥2.5cm y el reclutamiento, supervivencia y mortalidad de las plántulas de especies arbóreas en sitios donde se extrajo madera dos (L-02) y doce años (L-12) antes de este estudio y un sitio del que nunca se ha extraído madera (ULF). Nuestros resultados muestran que los bosques L-02 tienen una riqueza de especies menor (25 especies) que los bosques L-12 y ULF (49 y 46 especies, respectivamente). Como era de esperar, la extracción de madera tuvo efectos significativos en la estructura del dosel del bosque, particularmente al comparar los bosques L-02 y ULF. La densidad de plántulas fue mayor en bosques ULF (0.96 plántulas/m²) que en L-02 y L-12 (0.322 and 0.466 plántulas/m², respectivamente). Sin embargo, la mortalidad de plántulas fue mayor en ULF (54%) que en L-02 (26%) y L-12 (15%). Pentachletra macroloba fue la única especie que mostró abundante regeneración bajo P. copaifera en parcelas L-02, representando el 35% las plántulas encontradas. A pesar de la reducción de la abundancia de plántulas observada después de la extracción de madera, P. copaifera parece capaz de mantener grandes poblaciones de plántulas en estos bosques. Estos resultados sugieren que P. copaifera puede mantener su dominancia después de las alteraciones causadas por la extracción de madera. Nuestros resultados no apoyan la hipótesis de que la regeneración de las especies monodominates es menos probable cuando el dosel del bosque sufre fuertes alteraciones.

Awn length variation and its effect on dispersal unit burial of Trachypogon spicatus (Poaceae)

Trachypogon spicatus, formerly known as Trachypogon plumosus, is a dominant grass in some savannas of Northern South America. Its dispersal unit, like many other species of the Andropogoneae tribe, bears a hygroscopic awn which facilitates its establishment in favorable microsites. Some authors have previously proposed that there is a positive correlation between awn length and dispersal unit burial, and that this relationship increases the probability of seed survival in the event of a fire, since soil acts as insulator. In this study we experimentally tested this relationship for T. spicatus. A total of 192 diaspores were placed in randomized blocks, in aluminum trays filled with soil under greenhouse conditions. Diaspores were sprayed with water daily for a month to guarantee awn movement; on the last day of the experiment, they were sprayed with red aerosol paint to determine burial depth. The effects of awn length, presence of caryopses, and presence of a pivot for the passive segment of the awn on diaspore burial were evaluated. Germination viability was tested using a tetrazolium salt test for 35 caryopses. No significant differences in diaspore burial were observed between diaspores with and without caryopses (F(2,126)= 0.034, p=0.853). A positive correlation between awn length and diaspore burial was observed only if the passive awn lacked a pivot (r(66)=0.394, p<0.05). Diaspores whose awns had a pivot point achieved significantly deeper burial distances than their counterparts (F(2,126)=7.063, p=0.005). Viability test found that 0% of caryopses tested were able to germinate; this is possibly due to the time difference between sampling and testing. We considered the presence or absence of caryopsis as an important factor, since previous studies have not yet considered it and the high production of sterile diaspores in grasses. These results suggest that the physical mechanism behind T. spicatus diaspore burial is awn torque. This would explain why our results partially support the hypothesis previously proposed by other authors regarding the effect of awn length upon dispersal unit burial, but would also account for the differences observed in burial depth between diaspores with an available pivot point for the passive awn and diaspores lacking thereof. Rev. Biol. Trop. 62 (1): 321-326. Epub 2014 March 01.

Trachypogon spicatus es una gramínea dominante de algunas sabanas del norte de Suramérica. Su unidad dispersante presenta una arista higroscópica la cual facilita su inserción en irregularidades del suelo, facilitando su ubicación en microhábitats favorables para su establecimiento. Igualmente, se ha sugerido que existe una relación positiva entre la longitud de la arista y la capacidad de entierro de la unidad dispersante. Esta relación incrementa la probabilidad de supervivencia de la semilla ante el fuego al ser el suelo aislante de las altas temperaturas. Se colocaron 192 diásporas de T. spicatus, en bloques aleatorios, en bandejas de sustrato bajo condiciones de invernadero. Luego, se sometieron a cambios de humedad para garantizar el movimiento de la arista y pintaron con aerosol rojo el último día del experimento para determinar la profundidad de entierro. Se evaluó el efecto de la presencia de cariópsis, la longitud de la arista y la presencia de un punto de apoyo para la arista sobre la profundidad de entierro de la diáspora. Se realizó una prueba de sal de Tetrazolio para probar la viabilidad de germinación de 35 cariópsis. No se observaron diferencias significativas en la profundidad de entierro entre diásporas provistas y desprovistas de cariópsis (F(2,126)=0.034, p=0.853). La longitud de la arista parece guardar una relación positiva con la profundidad de entierro únicamente para aquellas unidades dispersantes cuyas aristas no cuentan con un punto de apoyo (r(66)=0.394, p<0.05). Por otro lado, aquellas diásporas cuyas aristas contaban con un punto de apoyo lograron profundidades de entierro significativamente mayores (F(2,126)=7.063, p=0.005). La prueba de viabilidad determinó que 0% de las cariópsis analizadas eran capaces de germinar, esto posiblemente sea debido a la diferencia entre el tiempo de recolección y de prueba. Consideramos que el factor presencia/ausencia de cariópsis era importante ya que había sido ignorado en estudios previos y por la alta producción de diásporas estériles en las gramíneas. Los resultados sugieren que el mecanismo físico que opera sobre la capacidad de entierro de la unidad dispersante de T. spicatus es el torque. Esto explica por qué solo se apoyaron parcialmente las hipótesis propuestas previamente por otros autores, y justifica las diferencias observadas en cuanto a la profundidad de entierro entre unidades dispersantes cuyas aristas contaban o carecían de un punto de apoyo.

Terrestrial flora of Malpelo Island, Colombia, Eastern Tropical Pacific

Malpelo Island is located 380km off the mainland continental coast of Colombia, in the Pacific Ocean. Several geological, ecological, and zoological studies, both marine and terrestrial, have been conducted in this island. Despite some marginal comments on some publications, no single specific survey has been devoted to botany so far. In order to make a floristic inventory of the terrestrial flora of this island, three field trips were made in 2010 to collect vascular plants, mosses, and lichens, as well as data on their distribution within the island. We collected and identified 25 species of lichens, two species of vascular plants and one moss. Lichens were the most diverse group found, including records of four new genera (Endocarpon, Fuscidea, Lecanographa and Verrucaria) and 13 new species for Colombia. The high lichen richness on Malpelo might be explained by their efficient form of asexual reproduction (soredia and isidia), that may have facilitated their transport to the island by migrating birds or wind. Once on the island, it is possible that lichens persist by being chemically protected against herbivores. The great number of new generic and species records for Colombia is explained by the low number of studies in saxicolous lichens conducted so far in the country, particularly on coastal areas and remote islands. Only two species of vascular plants were collected, a grass, Paspalum sp., and a fern, Pityrogramma calomelanos, and both of them correspond to new determinations for Malpelo. A moss species previously reported but with no positive identification was collected and identified as Octoblepharum albidum. Other species previously reported, for example, some species of shrubs, were not observed. The low number of vascular plants is probably due to a combination of soil conditions and herbivory by land crabs. This study is the first complete inventory of the flora of Malpelo and is a starting and reference point for future comparisons among islands in the Eastern Tropical Pacific. Rev. Biol. Trop. 62 (1): 327-336. Epub 2014 March 01.

La isla Malpelo se encuentra en el Pacífico colombiano, a unos 380km de la costa continental. La Isla ha sido objeto de algunos estudios geológicos, ecológicos y faunísticos, tanto marinos como terrestres, pero ningún estudio estrictamente botánico. Con el fin de realizar un inventario de la flora terrestre de Malpelo, se realizaron tres salidas de campo durante el 2010, en las que se recolectaron plantas vasculares, musgos y líquenes, y se tomaron datos sobre su distribución en la Isla. El grupo más diverso correspondió a los líquenes, con 25 especies, incluidos cuatro nuevos géneros para Colombia, Endocarpon, Fuscidea, Lecanographa y Verrucaria, y 15 nuevos registros de especies para Colombia. La alta riqueza de especies de líquenes en la Isla puede deberse a la forma de reproducción asexual de estos organismos, que pudieron haber sido transportados hasta Malpelo por aves migratorias o por viento; además, pueden estar protegidos químicamente de la herbivoría por cangrejos terrestres. La gran cantidad de registros nuevos para Colombia se explica por la poca cantidad de trabajos en líquenes saxícolas en el país, sobre todo en zonas costeras e insulares. Solo se registraron dos especies de plantas vasculares, una gramínea, Paspalum sp., y un helecho, Pityrogramma calomelanos. También se recolectó una especie de musgo, Octoblepharum albidum. La escasez de plantas vasculares probablemente se deba a la combinación de condiciones de los suelos y a la herbivoría por cangrejos terrestres. El presente estudio es el primero en darle relevancia a la flora terrestre de Malpelo y constituye un punto de referencia y comparación para estudios semejantes en otras islas del Pacífico Oriental Tropical.

Forest biomass variation in Southernmost Brazil: the impact of Araucaria trees

A variety of environmental and biotic factors determine vegetation growth and affect plant biomass accumulation. From temperature to species composition, aboveground biomass storage in forest ecosystems is influenced by a number of variables and usually presents a high spatial variability. With this focus, the aim of the study was to evaluate the variables affecting live aboveground forest biomass (AGB) in Subtropical Moist Forests of Southern Brazil, and to analyze the spatial distribution of biomass estimates. Data from a forest inventory performed in the State of Rio Grande do Sul, Southern Brazil, was used in the present study. Thirty-eight 1-ha plots were sampled and all trees with DBH ≥9.5cm were included for biomass estimation. Values for aboveground biomass were obtained using published allometric equations. Environmental and biotic variables (elevation, rainfall, temperature, soils, stem density and species diversity) were obtained from the literature or calculated from the dataset. For the total dataset, mean AGB was 195.2Mg/ha. Estimates differed between Broadleaf and Mixed Coniferous-Broadleaf forests: mean AGB was lower in Broadleaf Forests (AGB BF=118.9Mg/ha) when compared to Mixed Forests (AGB MF=250.3Mg/ha). There was a high spatial and local variability in our dataset, even within forest types. This condition is normal in tropical forests and is usually attributed to the presence of large trees. The explanatory multiple regressions were influenced mainly by elevation and explained 50.7% of the variation in AGB. Stem density, diversity and organic matter also influenced biomass variation. The results from our study showed a positive relationship between aboveground biomass and elevation. Therefore, higher values of AGB are located at higher elevations and subjected to cooler temperaturas and wetter climate. There seems to be an important contribution of the coniferous species Araucaria angustifolia in Mixed Forest plots, as it presented significantly higher biomass than angiosperm species. In Brazil, this endangered species is part of a high diversity forest (Araucaria Forest) and has the potential for biomass storage. The results of the present study show the spatial and local variability in aboveground biomass in subtropical forests and highlight the importance of these ecosystems in global carbon stock, stimulating the improvement of future biomass estimates. Rev. Biol. Trop. 62 (1): 359-372. Epub 2014 March 01.

Una variedad de factores ambientales y bióticos determinan el crecimiento de la vegetación y afectan la acumulación de biomasa vegetal. Desde la temperatura hasta la composición de especies, en los ecosistemas forestales el almacenamiento de la biomasa aérea se ve influenciada por una serie de variables, razón por la cual generalmente presenta una alta variabilidad espacial. De acuerdo a esto, el objetivo del estudio es analizar las variables que afectan la biomasa área (en Inglés, aboveground forest biomass - AGB) en los bosques húmedos subtropicales del sur de Brasil y analizar su distribución espacial. Para el estudio se utilizaron los datos de un inventario forestal realizado en el estado de Rio Grande del Sur, sur de Brasil. Se evaluaron bosques de hoja ancha (Broadleaf forests) y bosques mixtos de hoja ancha y coníferas (Mixed Coniferous-Broadleaf forests). Además, se tomaron muestras de 38 parcelas de 1 ha y para la estimación de la biomasa se incluyeron todos los árboles con DAP ≥9.5cm. Los valores para la biomasa aérea se obtuvieron con ecuaciones alométricas publicadas. Las variables ambientales y bióticas (altitud, precipitación, temperatura, suelo, densidad de los troncos y diversidad de especies) se obtuvieron de la literatura o se han calculado a partir del conjunto de datos. Para el conjunto de datos, el AGB medio fue 195.2Mg/ha. Las estimaciones difieren entre los bosques de hoja ancha y los bosques mixtos de hoja ancha y coníferas: el AGB promedio fue menor en los bosques de hoja ancha (AGB BF=118.9Mg/ha) en comparación con los bosques mixtos (AGB MF=250.3Mg/ha). Hubo una alta variabilidad espacial y local en la base de datos, incluso dentro de los tipos de bosques. Esta condición es normal en los bosques tropicales y por lo general se atribuye a la presencia de grandes árboles. La regresión múltiple fue influenciada principalmente por la altitud y explicó 50.7% de la variación en AGB. La densidad, diversidad y materia orgánica también influyeron en la variación de biomasa. Los resultados mostraron una relación positiva entre la biomasa sobre el suelo y la altitud. Por lo tanto, los valores más altos de AGB se encuentran en altitudes mayores y se someten a temperaturas más bajas y un clima más húmedo. Parece que hay una importante contribución de las coníferas Araucaria angustifolia en las parcelas de bosques mixto, ya que tienen una biomasa significativamente mayor que las especies de angiospermas. En Brasil, esta especie en peligro de extinción es parte de un bosque de gran diversidad (Bosque de Araucaria) y tiene el potencial de almacenamiento de la biomasa. Los resultados del presente estudio muestran la variabilidad espacial y local de la biomasa aérea en los bosques subtropicales, destacan la importancia de estos ecosistemas en el almacenamiento global del carbono, y estimulan la mejora de futuras estimaciones de biomasa.

Antioxidant capacity and fatty acid composition of different parts of Adenocarpus complicatus (Fabaceae) from Turkey

Adenocarpus complicatus is distributed throughout the Anatolian peninsula and is widely used for human and animal nutrition. The purpose of this work was to study the antioxidant properties and fatty acid composition of different parts of this plant (fruits and mixed materials). The species was collected from Golyuzu village of the Seydisehir district near Konya province, Turkey. Fruit and mixed parts obtained from this species were ground and a 15g sample was used to prepare methanolic extracts. Powdered plant samples were extracted with 100mL methanol in a mechanical shaker. The obtained extracts were filtered and concentrated to dryness under reduced pressure and were subsequently stored at -20°C. Antioxidant components, namely total phenolic and flavonoid content, were detected for each extract using spectrophotometric methods. Antioxidant capacity was evaluated by various assays including phosphomolybdenum, DPPH free radical scavenging capacity, metal chelating activity, and ferric and cupric ion reducing power. The fatty acid profiles of plant parts were also determined by using gas chromatography. The total phenolic content of fruit (36.21mgGAE/g) was higher than that of mixed materials (13.79mgGAE/g). The methanolic extract of mixed material had higher amounts of flavonoid than fruit extract. The free radical scavenging activity of extracts was expressed as IC50 value (μg/mL) (amount required to inhibit DPPH radical formation by 50%). The lower IC50 value reflects better free radical scavenging action. The radical scavenging activity of the samples was compared with BHT, it showed the mixed material to be almost two times more potent than the fruit extract. However, BHT is an excellent free radical scavenger with an IC50 of 34.061μg/mL. The ferric and cupric reducing power potentials of the extracts were expressed as EC50 value (the effective concentration at which the absorbance was 0.5). Fruit extract exhibited strong ferric reducing power with an EC50 of 871.25μg/mL. The metal chelating activity of the extracts increased with concentration. Chelating effect was 83.60% for fruit extract at 1mg/mL concentration. Oil content of fruit and mixed parts were detected as 6.71 and 6.14%, respectively. A total of 32 fatty acids were found in the oil. Essential fatty acids (linoleic and α-linolenic acid) were identified as the most abundant fatty acids in the oil. These results demonstrated that this plant species can be considered as an alternative to synthetic antioxidants. Likewise, the oil obtained from the plant can be used as a source of essential fatty acids for food and pharmacological applications. Rev. Biol. Trop. 62 (1): 337-346. Epub 2014 March 01.

Adenocarpus complicatus se distribuye por toda la península de Anatolia y es ampliamente utilizado para la nutrición humana y animal. El propósito de este trabajo fue estudiar las propiedades antioxidantes y la composición de ácidos grasos de diferentes partes de la planta (frutos y partes mezcladas). Las especies fueron recolectadas en Golyuzu, Seydisehir, cerca de la provincia Konya en Turquía. Para preparar los extractos metanólicos se tomó una muestra de 15g de frutas y partes mezcladas de esta especie. Muestras de plantas en polvo se extrajeron con 100ml de metanol en un agitador mecánico. Los extractos obtenidos se filtraron y se concentraron a sequedad bajo presión reducida y posteriormente se almacenaron a -20°C. Para cada extracto, mediante métodos espectrofotométricos se detectaron los componentes antioxidantes, llamados contenido total de fenoles y flavonoides. La capacidad antioxidante se evaluó mediante diversos ensayos: fosfomolibdeno, capacidad de captación de radicales libres DPPH, actividad quelante de metales y poder reductor de iones férricos y cúpricos. También se determinaron los perfiles de ácidos grasos de partes de la planta mediante el uso de cromatografía de gases. El contenido fenólico total de la fruta (36.21mgGAE/g) fue mayor que la de los materiales mezclados (13.79mgGAE/g). El extracto metanólico de material mezclado tenía una mayor cantidad de flavonoides que el extracto de la fruta. La actividad captadora de radicales libres de los extractos se expresó como valor de IC50 (mg/ml) (cantidad necesaria para inhibir la formación de radicales DPPH en un 50%). El valor bajo de IC50 refleja mejor acción eliminadora de radicales libres. La actividad captadora de radicales de las muestras se comparó con BHT, se mostró que el material mezclado es casi dos veces más potente que el extracto de la fruta. Sin embargo, BHT es un excelente eliminador de radicales libres con una IC50 de 34.061μg/mL. El potencial de reducción férrico y cúprico de los extractos se expresó como valor de CE50 (la concentración efectiva a la que la absorbancia fue de 0.5). El extracto de la fruta exhibe fuerte poder reductor férrico con una EC50 de 871.25μg/mL. La actividad quelante de metales de los extractos aumentó con la concentración. El efecto quelante de extracto de fruta fue de 83.60% en una concentración de 1mg/ml. El contenido de aceite del fruto y partes mixtas fue 6.71 y 6.14%, respectivamente. Un total de 32 ácidos grasos fueron encontrados en el aceite. Los ácidos grasos esenciales (ácido linoleico y α-linolénico) fueron identificados como los ácidos grasos más abundantes en el aceite. Estos resultados demostraron que esta especie vegetal se puede considerar como una alternativa a los antioxidantes sintéticos. Del mismo modo, el aceite obtenido de la planta se puede utilizar como una fuente de ácidos grasos esenciales para alimentos y aplicaciones farmacológicas.

In vitro propagation of Cyathea atrovirens (Cyatheaceae): spore storage and sterilization conditions

Cyathea atrovirens occurs in a wide range of habitats in Brazil, Paraguay, Uruguay and Argentina. In the Brazilian State of Rio Grande do Sul, this commonly found species is a target of intense exploitation, because of its ornamental characteristics. The in vitro cultura is an important tool for propagation which may contribute toward the reduction of extractivism. However, exogenous contamination of spores is an obstacle for the success of aseptic long-term cultures. This study evaluated the influence of different sterilization methods combined with storage conditions on the contamination of the in vitro cultures and the gametophytic development of C. atrovirens, in order to establish an efficient propagation protocol. Spores were obtained from plants collected in Novo Hamburgo, State of Rio Grande do Sul, Brazil. In the first experiment, spores stored at 7oC were surface sterilized with 0.5, 0.8 and 2% of sodium hypochlorite (NaClO) for 15 minutes and sown in Meyers culture medium. The cultures were maintained in a growth room at 26±1ºC for a 12-h photoperiod and photon flux density of 100μmol/m²/s provided by cool white fluorescent light. Contamination was assessed at 60 days, and gametophytic development was scored at 30, 60, 120 and 130 days of in vitro culture, analyzing 300 individuals for each treatment. There was no significant difference in culture contamination among the different sodium hypochlorite concentrations tested, and all treatments allowed for the development of cordiform gametophytes at 130 days of culture. In the second experiment, spores stored at 7 and -20°C were divided into two groups. Half of the spores were surface sterilized with 2% of NaClO for 15 minutes and the other half was not sterilized. All spores were sown in Meyers medium supplemented with one of the following antibiotics: nystatin, Micostatin® and actidione. The culture conditions and the procedures used for evaluating contamination and gametophytic development were the same described for the first experiment. No contamination was observed in spores stored at -20°C and treated with NaClO and actidione. In all treatments, cordiform gametophytes presenting antheridia were observed at 120 days. The percentages of these gametophytes increased from 120 to 130 days and no significant differences were observed among treatments. Archegonia were observed on cordiform gametophytes at 130 days. The findings provide data relevant to in vitro propagation procedures of this species, which may increase the availability of plants for ornamental purposes, therefore contributing to the reduction of the exploitation of endangered tree ferns species. Rev. Biol. Trop. 62 (1): 299-308. Epub 2014 March 01.

Cyathea atrovirens (Langsd. & Fisch.) Domin (Cyatheaceae) se presenta en una amplia gama de hábitats en Brasil, Paraguay, Uruguay y Argentina. Debido a sus características ornamentales, la especie es objeto de intensa explotación. El cultivo in vitro es una herramienta importante para la propagación lo que puede contribuir a la reducción del impacto de las actividades extractivas. Sin embargo, la contaminación exógena de esporas es un obstáculo para el éxito de cultivos asépticos a largo plazo. Este estudio evaluó la influencia de diferentes métodos de esterilización en combinación con las condiciones de almacenamiento sobre la contaminación de los cultivos in vitro y el desarrollo gametofítico de C. atrovirens. En el primer experimento, las esporas almacenadas a 7°C se esterilizaron superficialmente con 0.5, 0.8 y 2% de hipoclorito de sodio (NaClO) durante 15 minutos y se sembraron en medio de cultivo de Meyer. Aunque no hubo diferencia en la contaminación de lós cultivos entre las concentraciones de hipoclorito de sodio de las diferentes pruebas, en el tratamiento con 2% NaClO se observó un mayor porcentaje de gametofitos cordiformes a los 130 días. En el segundo experimento, las esporas almacenadas a 7 y -20°C fueron divididas en dos grupos. La mitad de las esporas se esterilizaron con 2% de NaClO durante 15 minutos y la otra mitad no fue esterilizada. Todas las esporas se sembraron en medio de Meyer suplementado con uno de los siguientes antibióticos: nistatina, Micostatin® o actidiona. No se observó contaminación de las esporas almacenadas a -20°C y tratadas con NaClO y actidiona. En todos los tratamientos, se observaron gametofitos cordiformes con anteridios y arquegonios. Los resultados proporcionan datos relevantes para la propagación in vitro de C. atrovirens, que pueden aumentar la disponibilidad de las plantas para fines ornamentales, contribuyendo así a la reducción de la exploración de las especies de helechos arborescentes en peligro de extinción.

Reproductive success and genetic diversity of Psychotria hastisepala (Rubiaceae), in fragmented Atlantic forest, Southeastearn Brazil

The impacts of forest fragmentation on both reproductive biology and genetic diversity of native plant species is hardly understood, despite some studies have analyzed this current worldwide problem. Since this constitutes one of the main threats to seasonal semi-deciduous forests in Southeastern Brazil, we investigated the reproductive success and the genetic diversity of a distylous, understory shrub (Psychotria hastisepala) within this context of forest fragmentation. For this study, a set of seven forest fragments of sizes ranging from 4.1 to 168.7 hectares were chosen. The intervenient matrix comprised pastures (25-50%), monocultures (33-50%) and rural roads and buildings (14-28.5%). Overall, 91 plants (54 for the short-styled morph and 37 for the long-styled morph; mean of 6.5 plants per fragment) were investigated. To evaluate reproductive success, we quantified fruit and seed production under natural pollination; to evaluate genetic diversity and population structure, we employed ISSR markers on genomic DNA. Plants with the short-styled morph exhibited a significantly higher reproductive success than those with the long-styled morph; there was no association between seed production and size of the forest fragment. Levels of genetic diversity were positively associated with the number of plants per fragment; but they were not related to flower morph. AMOVA showed that about 65% of the overall genetic variation was attributed to the differences between plants within fragments. The results suggested that populations of P. hastisepala were susceptible to decline owing to forest fragmentation. Rev. Biol. Trop. 62 (1): 309-319. Epub 2014 March 01.

Los impactos de la fragmentación de los bosques tanto en la biología reproductiva como en la diversidad genética de las especies de plantas nativas apenas se entienden, a pesar de que algunos estudios han analizado este problema mundial. Dado que esto constituye una de las principales amenazas para los bosques semi-deciduos estacionales en el sureste de Brasil, se investigó el éxito reproductivo y la diversidad genética de un arbusto de sotobosque, Psychotria hastisepala, en un bosque fragmentado. Para este estudio, se seleccionaron siete fragmentos de tamaños que van desde 4.1 hasta 168.7 hectáreas. La matriz intervenida comprende pastos (25-50%), monocultivos (33-50%) y carreteras y edificios rurales (14-28.5%). En total, 91 plantas fueron investigadas (54 morfos florales brevistilo y 37 longistilo, con una media de 6.5 plantas por fragmento). Para evaluar el éxito reproductivo, se cuantificó la producción de frutos y semillas de plantas con polinización natural; para evaluar la diversidad genética y la estructura poblacional, se emplearon marcadores ISSR en el ADN genómico. Las plantas con morfo brevistilo exhibieron un éxito reproductivo significativamente más alto que las longistilo, no hubo asociación entre la producción de semillas y el tamaño del fragmento de bosque. Los niveles de diversidad genética se asociaron positivamente con el número de plantas por fragmento, pero que no estaban relacionados con los morfos florales. AMOVA mostró que alrededor del 65% de la variación genética en general se atribuyó a las diferencias entre plantas dentro de fragmentos. Los resultados sugieren que las poblaciones de P. hastisepala fueron susceptibles a disminuir debido a la fragmentación de los bosques.

Molecular techniques for cyanobacteria detection at Riogrande II and La Fe water reservoirs, Colombia

In lentic water bodies as reservoirs occur eutrophication processes, originated mainly from human activities (i.e. agriculture, animal exploitation). This influx of nutrients in aquatic ecosystems could promote blooms of potentially toxic cyanobacteria. The purpose of this work is to detect the presence of cyanobacteria strains in water samples, using molecular techniques to help in preventive management of reservoirs dedicated to water purification. We used two molecular techniques to detect genes implied with the synthesis of hepatotoxic microcystins from potentially toxic cyanobacteria strains, and to evaluate the molecular diversity of cyanobacteria in water samples from two high-mountain reservoirs used for purification of drinking water for the metropolitan area of Medellin, Colombia. Between 2010-2011 collections of 12 water samples were taken and DNA extraction together with PCR and DGGE analyses where carried out. We amplified 22 sequences between 250-300bp of the genes mcyA and mcyE, and these sequences were related with several strains and cyanobacteria genera accessions from NCBI-GenBank databases. Moreover, sequence amplifications of the 16S small ribosomal RNA subunit - 16S rRNA- between 400-800bp were also performed in order to use them for the DGGE technique. The amplification products of DGGE were set in polyacrilamide gel with posterior denaturing electrophoresis, and the scanned images of the gel bands were analysed with the software GelCompar II. For Riogrande II and La Fe reservoirs we found 35 and 30 different DGGE bands, respectively, as a measurement of molecular diversity in these artificial ecosystems. Here, we demonstrated the utility of two molecular techniques for the detection of genes associated with toxicity and molecular diversity of cyanobacteria in reservoirs destined for drinking water in urban centers. We recommend strongly following with periodically molecular biology studies in these ecosystems combined with limnological and ecological data, as new tools for management of plants of water purification and for the prevention of potentially public health concerns. Rev. Biol. Trop. 62 (1): 403-419. Epub 2014 March 01.

En embalses, la eutrofización es consecuencia de procesos naturales y de actividades humanas, lo cual puede facilitar la aparición de afloramientos de cianobacterias potencialmente tóxicas. En este trabajo, se utilizaron dos técnicas moleculares en la detección de genes presentes en cepas potencialmente tóxicas de cianobacterias y evaluaciones de diversidad molecular de cianobacterias en los embalses para potabilización de agua, Riogrande II y La Fe, Colombia. Entre 2010-2011, se tomaron 12 muestras de agua en ambos embalses y se realizaron extracciones de ADN para un análisis de marcadores moleculares mediante PCR y DGGE. Se amplificaron secuencias entre 250-300pb de los genes mcyA y mcyE, implicados en la toxicidad de cepas de cianobacterias. Asimismo, se amplificaron secuencias de la región 16S del ARN ribosomal (422pb), para la técnica DGGE. Se corrieron geles de poliacrilamida en gradientes de desnaturalización, se realizó agrupamiento genético (UPGMA), y se separaron por patrones de bandeo las muestras de cada embalse evaluado. Se demuestra la utilidad de las técnicas moleculares en estudios relacionados con la búsqueda de genes asociados con toxicidad y diversidad molecular de cianobacterias en muestras de agua provenientes de embalses de agua con fines de potabilización para centros urbanos.

Jorge León Arguedas (9 diciembre 1916 - 5 junio 2013)

La invalidez del Factor de Impacto como indicador del impacto de las revistas científicas latinoamericanas

The invalidity of the Impact Factor as indicator of the impact of Latin American scientific journals. Use of the Impact Factor is currently being discarded in industrialized countries where, to name one case, up to 40% of the articles published in Nature are never cited, despite the high Impact Factor of that journal. However, it is still used in Latin America to evaluate journals and authors, potentially influencing who are given positions and who receives funding. To find out how valid the Impact Factor is for Latin American research, I used the database BINABITROP to see how much of the relevant literature was used to measure impact. I found that the Science Citation Index (SCI) excluded 96% of the relevant literature when measuring the impact of biological articles about Costa Rica for the studied year (2011). Therefore, the impact of Latin American science is unknown and the Impact Factor should not be used to assess how often a journal, institution or author are cited. Rev. Biol. Trop. 62 (1): 9-13. Epub 2014 March 01.

El uso del Factor de Impacto está siendo descartado en los países industrializados donde, por citar un ejemplo, hasta un 40 % de los artículos aparecidos en Nature jamás son citados, pese al alto Factor de Impacto de esa revista. En América Latina se usa con frecuencia el Factor de Impacto para evaluar a los autores y a las revistas de la región, influyendo potencialmente sobre empleos y financiamiento. Para revisar si el Factor de Impacto es válido para la ciencia latinoamericana, usé la base de datos BINABITROP y hallé que el Science Citation Index (SCI) excluyó en 2011 el 96% de la literatura pertinente para medir el impacto de artículos biológicos sobre Costa Rica. El Factor de Impacto de la ciencia latinoamericana es desconocido y no indica cuán citados son una revista, institución o autor.