Revista de Biología Tropical

Filogenia de hongos roya (Uredinales) en la zona andina colombiana mediante el uso de secuencias del ADN ribosomal 28S

Phylogenetic analysis of rust fungi (Uredinales) from the Colombian Andean region using 28S ribosomal DNA sequences. Rust fungi (Uredinales, Basidiomycetes) are one of the most diverse and economically important plant-obligated parasites. Taxonomy of this group has been under revision during the last years using molecular techniques to define phylogenetic relationships. In this study we evaluated the phylogenetic affinities of a group of 40 rust fungi obtained from different plants in the Colombian Andean region using sequence analysis of the 28S ribosomal DNA, specifically D1/D2 domains. Comparisons were undertaken with sequences of rust fungi from around the world deposited in the GenBank database. An alignment of sequences was used to build a phylogenetic tree through Maximum parsimony analysis. Our results support the taxonomical validity of families Pucciniaceae, Phakopsoraceae, Phragmidiaceae, Pileolariaceae, Mikronegeriaceae, Coleosporiaceae and Cronartiaceae, while Pucciniosiraceae represents redundant taxa with Pucciniaceae. The analyses indicated that Uropyxidaceae, Raveneliaceae, Chaconiaceae and Pucciniastraceae correspond to poly-phyletic families. Melampsoraceae appear to be a basal taxon to the Uredinales. Information obtained in this study will be useful to incorporate a higher number of sequences from tropical rust fungi within global efforts to redefine the taxonomy of order Uredinales. Additionally, we propose to give priority to future phylogenetic studies of taxa: Gerwasia, Hemileia, Phragmidium, Prospodium, Puccinia and Uromyces, genera that include a high number of rust fungi from the tropics. Rev. Biol. Trop. 59 (2): 517-540. Epub 2011 June 01.

Los hongos roya (Uredinales, Basidiomycetes) representan uno de los grupos de fitoparásitos más diversos y con mayor importancia económica agrícola mundial. Su taxonomía se ha basado en el estudio de caracteres morfológicos, que resulta en muchos casos en la formación de taxones polifiléticos. Sin embargo, en los últimos años se han tratado de incorporar herramientas moleculares que conduzcan a la generación de sistemas de clasificación basados en afinidades evolutivas. Este trabajo pretendió aumentar la base del conocimiento sobre la uredobiota tropical, mediante el estudio de características morfológicas y filogenéticas de un grupo de royas de los Andes de Colombia. Para esto se secuenció parte de la región 28S del ADNr y se realizó un análisis de agrupamiento mediante Máxima parsimonia. Los resultados confirmaron la validez de las familias Pucciniaceae, Phakopsoraceae, Phragmidiaceae, Pileolariaceae, Mikronegeriaceae, Coleosporiaceae y Cronartiaceae, mientras que Pucciniosiraceae es un taxón redundante con Pucciniaceae. Por su parte, Uropyxidaceae, Raveneliaceae, Chaconiaceae y Pucciniastraceae se muestran como familias polifiléticas. Aparentemente Melampsoraceae se presenta como un taxón basal al grupo. La información que se deriva de este estudio se espera sea incorporada en los estudios mundiales que buscan redefinir el sistema taxonómico de los hongos roya.

Macrophytes in the upper Paraná river floodplain: checklist and comparison with other large South American wetlands

Neotropical aquatic ecosystems have a rich aquatic flora. In this report, we have isted the aquatic flora of various habitats of the upper Paraná River floodplain by compiling data rom literature and records of our own continuous collections conducted during the period 2007-2009. Our main purposes were to assess the macrophyte richness in the Paraná floodplain, to compare it with other South American wetlands and to assess whether the number of species recorded in South American inventories has already reached an asymptote. We recorded a total of 153 species of macrophytes in the Upper Paraná River floodplain, belonging to 100 genera and 47 families. In our comparative analysis, a clear floristic split from other South American wetlands was shown, except for the Pantanal, which is the closest wetland to the Paraná floodplain and, therefore, could be considered a floristic extension of the Pantanal. The species accumulation curve provides evidence that sampling efforts should be reinforced in order to compile a macrophyte flora census for South America. The high dissimilarity among South American wetlands, together with the lack of an asymptote in our species accumulation curve, indicates that the sampling effort needs to be increased to account for the actual species richness of macrophytes in this region. Rev. Biol. Trop. 59 (2): 541-556. Epub 2011 June 01.

Los ecosistemas acuáticos neotropicales tienen una rica flora acuática. En este informe, hemos hecho una lista de la flora acuática de diversos hábitats de la alta planicie de inundación del río Paraná mediante la compilación de datos de la literatura y los registros de nuestras colecciones propias realizadas durante el período 2007-2009. Nuestros principales objetivos fueron evaluar la riqueza de macrófitos en la llanura aluvial del Paraná, para compararlo con otros humedales de América del Sur y evaluar si el número de especies registradas en los inventarios suramericanos ya han alcanzado una asíntota. Se registraron un total de 153 especies de macrófitas en la llanura de inundación del Río Alto Paraná, pertenecientes a 100 géneros y 47 familias. En nuestro análisis comparativo, se mostró una clara división florística de otros humedales de América del Sur, con excepción del Pantanal, que es el más cercano a los humedales de la planicie de inundación del Paraná y, por tanto, podría considerarse una extensión florística del Pantanal. La curva de acumulación de especies demuestra que los esfuerzos de muestreo deben ser reforzados con el fin de elaborar un censo de la flora de acrófitos para América del Sur. La alta disimilitud entre los humedales de América del Sur, junto con la falta de una asíntota en nuestra curva de acumulación de especies, indica que el esfuerzo de muestreo debe ser mayor para dar cuenta de la riqueza real de las especies de acrófitos en esta región.

**Ultraestructura de la epidermis foliar de Zeugites (Poaceae: Panicoideae)**

Leaf epidermis ultrastructure of Zeugites (Poaceae: Panicoideae). The genus Zeugites comprises eleven species of neotropical grasses and it is principally distributed in Mexico, with some species extending to the Caribbean region, Central and South America. In this work, leaf epidermis ultrastructure of 11 species is described by the use of scanning electron microscopy. At least three specimens per species, that included herbarium and collected specimens, were used. An identification key and specific descriptions are included, in which the distinctive epidermal features are highlighted. The taxonomic valuable characters found were the following: presence or absence of prickles and macrohairs, intercostals short cells form and silica body form. Based on leaf epidermis characteristics, Zeugites species can be arranged into three groups: (1) species that lack prickles (Z. americana, Z. mexicana, Z. pringlei, Z. munroana and Z. sagittata); and lack macro hairs, with the exception of Z. pringlei; (2) species that have prickles (Z. latifolia and Z. smilacifolia); (3) species that have both, prickles and macrohairs (Z. capillaris, Z. hackelii, Z. pittieri and Z. sylvatica). The morphological features of leaf epidermis, support the relationship between the tribes Centotheceae and Paniceae. Rev. Biol. Trop. 59 (2): 557-568. Epub 2011 June 01.

El género Zeugites incluye once especies de pastos con distribución neotropical, en México, el Caribe, Centro y Sudamérica. En este trabajo se describe la epidermis foliar de las once especies, se utilizaron técnicas de microscopía electrónica de barrido y revisaron al menos tres especímenes de cada especie, algunas muestras proceden de ejemplares de herbario y otras fueron recolectadas por la primera autora. Se presenta una clave y descripciones para las especies del género, en las cuales se resaltan las características epidérmicas distintivas. Los caracteres que resultaron informativos, desde el punto de vista taxonómico fueron: la presencia o ausencia de aguijones y macropelos, la forma de las células cortas intercostales y la forma de los cuerpos de sílice. Con base en estas características, las especies de Zeugites se pueden separar en tres grupos: (1) especies que no presentan aguijones (Z. americana, Z. mexicana, Z. pringlei, Z. munroana y Z. sagittata) y que con excepción de Z. pringlei tampoco presentan macropelos; (2) especies que presentan sólo aguijones (Z. latifolia y Z. smilacifolia); y (3) especies que presentan aguijones y macropelos (Z. capillaris, Z. hackelii, Z pittieri y Z. sylvatica). Las características morfológicas de la epidermis foliar, sustentan la relación de las tribus Centotheceae y Paniceae.

**Phenotypic plasticity of Vaccinium meridionale (Ericaceae) in wild populations of mountain forests in Colombia**

Vaccinium meridionale is a promising crop for the Andean region of South America and is currently available only in the wild. Spontaneous populations of this plant are found across the Colombian mountains, but very few published records on this plant morphology are available. A zonification study of V. meridionale was conducted in four principal areas of a low mountain forest of Colombia (Provinces of Boyacá, Cundinamarca, Santander and Nariño) in 2007. A total of 20 populations and 100 plants of V. meridionale were individually characterized and surveyed, using a list of 26 characters of morphological variables (9 quantitative and 17 qualitative characters). Our results indicated that natural populations of V. meridionale might be found in the tropical forest under a highly heterogeneous climate and microclimate conditions, at different mountain regions between 2 357 and 3 168masl. The shrubs of V. meridionale exhibited a high level of intra-population variation in several quantitative (plant height, stem diameter) and qualitative (growth habit, ramification density, presence of anthocyanins in stems) morphological characters, suggesting an environmentally induced phenotypic plasticity. Plant height, stem diameter and foliar density were the most variable morphological traits, with coefficients of variation higher than 50%. However, several quantitative characters of its reproductive potential, such as berry dimensions, rachis length and number of flowers per inflorescence, resulted with low plasticity with coefficients of variation lower than 30.2%, indicating that these characters were genetically determined. The highest correlation coefficients (p<0.05) resulted to be between fruit length and fruit width (0.90), leaf length and leaf width (0.78), plant height and stem diameter (0.60), and inflorescence length and flowers number per inflorescence (0.57). The results suggest that an important genetic resource exists for this species in the wild. Low variation in fruit size, which constitutes a target trait for plant breeders, could be useful for selection of cultivars of V. meridionale. The results of this study could also be applied in conservation programs aimed to protect these diverse populations in the mountain forests of Colombia. Rev. Biol. Trop. 59 (2): 569-583. Epub 2011 June 01.

Vaccinium meridionale es una planta promisoria para la región Andina de Sudamérica y está disponible actualmente sólo en forma silvestre. Las poblaciones espontáneas de esta planta se encuentran en las montañas colombianas y existen muy pocos reportes publicados respecto a su morfología. Se realizó un estudio de zonificación de V. meridionale en cuatro áreas principales de un bosque de baja montaña de Colombia (Provincias de Boyacá, Cundinamarca, Santander y Nariño) en 2007. Un total de 20 poblaciones y 100 plantas de V. meridionale fueron individualmente caracterizadas usando una lista de 26 descriptores de variables morfológicas (9 caracteres cuantitativos y 17 caracteres cualitativos). Nuestros resultados indicaron que las poblaciones naturales de V. meridionale podrían ser encontradas en el bosque tropical bajo unas condiciones de clima y microclima muy heterogéneas, en regiones de montaña diferentes entre 2 357 y 3 168masl. Los arbustos de V. meridionale presentaron un nivel alto de la variación intrapoblacional en varios caracteres morfológicos cuantitativos (altura de planta, diámetro de tallo) y cualitativos (hábito de crecimiento, densidad de ramificación, presencia de antocianinas en tallos), sugiriendo una plasticidad fenotípica ambientalmente inducida. La altura de planta, el diámetro de tallo y la densidad foliar fueron los rasgos morfológicos más variables, con coeficientes de variación superior al 50%. Sin embargo, varios caracteres cuantitativos de su potencial reproductivo, como dimensiones de baya, longitud de raquis y número de flores por inflorescencia, presentaron plasticidad baja con coeficientes de la variación inferior al 30.2%, indicando que estos caracteres fueron genéticamente determinados. Los coeficientes de correlación más altos (p<0.05) fueron para longitud de fruto y ancho de fruto (0.90), longitud de hoja y ancho de hoja (0.78), altura de planta y diámetro de tallo (0.60), y longitud de inflorescencia y número de flores por inflorescencia (0.57). Los resultados sugieren que en condiciones naturales existe un recurso genético importante para esta especie. La poca variación en el tamaño de fruto, puede ser útil para la selección de cultivares de V. meridionale y se constituye un rasgo objetivo para fitomejoradores. Los resultados de este estudio también pueden ser aplicados en programas de conservación para proteger estas poblaciones diversas en los bosques de montaña de Colombia.

Composición química de los aceites esenciales de las hojas de Helicteres guazumifolia (Sterculiaceae), Piper tuberculatum (Piperaceae), Scoparia dulcis (Arecaceae) y Solanum subinerme (Solanaceae), recolectadas en Sucre, Venezuela

Chemical composition of essential oils from leaves of Helicteres guazumifolia (Sterculiaceae), Piper tuberculatum (Piperaceae), Scoparia dulcis (Arecaceae) and Solanum subinerme (Solanaceae) from Sucre, Venezuela. Essential oils, biosynthesized and accumulated in aromatic plants, have a wide range of applications in the pharmaceutical health, cosmetics, food and agricultural industry. This study aimed to analyze the secondary metabolites in some plant species in order to contribute to their chemotaxonomy. Leaves from Helicteres guazumifolia, Piper tuberculatum, Scoparia dulcis and Solanum subinerme were collected and their essential oils were obtained by means of hydro-distillation. The oil fraction was analyzed and identified by GC/MS. The extraction yields were of 0.004, 0.032, 0.016 and 0.005%, and the oil constituents of 88.00, 89.80, 87.50 and 89.47%, respectively. The principal oils found were: non-terpenoids volatile secondary metabolites (30.28%) in H. guazumifolia; sesquiterpenoids (20.82 and 26.09%) and oxigen derivated (52.19 and 25.18%) in P. tuberculatum and S. dulcis; and oxigen diterpenoids (39.67%) in S. subinerme. The diisobuthylphtalate (13.11 %) in H. guazumifolia, (-)-spathulenol (11.37%) in P. tuberculatum and trans-phytol (8.29 and 36.00%) in S. dulcis and S. subinerme, were the principal constituents in their respective essential oils. The diisooctylphtalate were the essential oil common to all species, but the volatile compounds such as trans-pinane, L-linalool, β-ionone, isophytol, neophytadiene, trans-phytol, dibutylphtalate and methyl hexadecanoate, were only detected in three of these essences. This suggests that these plants may require similar secondary metabolites for their ecological interactions, possibly due to common environmental factors. Rev. Biol. Trop. 59 (2): 585-595. Epub 2011 June 01.

Los aceites esenciales son biosintetizados por plantas aromáticas y pueden obtenerse de cualquier órgano de la misma, tienen gran aplicación en la industria farmacéutica, sanitaria, cosmética, agrícola y de alimentos. Los aceites esenciales de las hojas de las plantas Helicteres guazumifolia, Piper tuberculatum, Scoparia dulcis y Solanum subinerme fueron obtenidos mediante hidrodestilación con rendimientos de 0.004, 0.032, 0.016 y 0.005%, respectivamente. La CG/EM permitió identificar la mayoría de los constituyentes de estos aceites esenciales (88.00, 89.80, 87.50 y 89.47%, respectivamente), encontrándose en mayor proporción metabolitos no volátiles de estructura no terpenoidal en H. guazumifolia (30.28%), sesquiterpenoides oxigenados en P. tuberculatum (52.19%), sesquiterpenos en S. dulcis (26.09%) y derivados oxigenados de diterpenos en S. subinerme (39.67%). Los constituyentes mayoritarios fueron el diisobutilftalato (13.11%) en H. guazumifolia, (-)-espatulenol (11.37%) en P. tuberculatum y el trans-fitol (8.29 y 36.00%) para S. dulcis y S. subinerme, respectivamente. El diisooctilftalato fue el constituyente común en los aceites esenciales de todas las especies y los compuestos volátiles trans-pinano, L-linalool, β-ionona, isofitol, neofitadieno, trans-fitol, dibutilftalato y hexadecanoato de metilo, fueron detectados en tres de estas esencias. Esto sugiere que dichas plantas pueden requerir metabolitos secundarios similares para su interacción ecológica, posiblemente debido a factores ambientales comunes.

**Effect of sucrose and methyl jasmonate on biomass and anthocyanin production in cell suspension culture of Melastoma malabathricum (Melastomaceae)**

Melastoma malabathricum, belongs to the Melastomaceae family, is an important medicinal plant widely distributed from Madagascar to Australia, that is used in traditional remedies for the treatment of variousailments. Besides its medicinal properties, it has been identified as a potential source of anthocyanin production.The present study was carried out to investigate the effect of sucrose and methyl jasmonate and feeding time oncell biomass yield and anthocyanin production in cell suspension culture of M. malabathricum. Addition of differentconcentrations of sucrose into the cell culture of M. malabathricum influenced cell biomass and pigment accumulation. The addition of methyl jasmonate was found to have no effect on cell biomass but the presence of higher amount (12.5-50mg/L) had caused a reduction in anthocyanin production and accumulation. MS medium supplemented with 30g/L sucrose and 3.5 mg/L of MeJA added on cero day and 3rd day produced high fresh cell mass at the end of nine days of culture but did not support the production of anthocyanins. However, cells cultured in the medium supplemented with 45g/L sucrose without MeJA showed the highest pigment content (0.69±0.22Cv/g-FCM). The cells cultured in MS medium supplemented with 30 g/L sucrose with 3.5mg/L MeJA added on the 3rd and 6th day of culture, showed the lowest pigment content (0.37-0.40Cv/g-FCM). This study indicated that MeJA was not necessary but sucrose was needed for the enhancement of cell growth and anthocyanin production in M. malabathricum cell cultures. Rev. Biol. Trop. 59 (2): 597-606. Epub 2011 June 01.

elastoma malabathricum pertenece a la familia de las melastomáceas, es una planta medicinal importante ampliamente distribuida desde Madagascar hasta Australia, que se utiliza en remedios tradicionales para el tratamiento de diversas dolencias. Además de sus propiedades medicinales, se ha identificado como una fuente potencial de producción de antocianinas. En esta investigación se estudió el efecto de la sucrosa, el metil jasmonato y el tiempo de ingestión en la producción de biomasa de las células y la producción de antocianinas, en el cultivo de células en suspensión de M. malabathricum. La adición de diferentes concentraciones de sucrosa al cultivo de células de M. malabathricum influencia la biomasa de las células y la acumulación de pigmento. La adición de metil jasmonato no tuvo ningún efecto sobre la biomasa celular, pero la presencia de una cantidad más alta (12.5-50mg/L) causó una reducción en la producción y acumulación de antocianinas. El medio MS complementado con sucrosa 30g/L y 3.5mg/L de MeJA en el día cero y el tercer día produjo una gran masa de células frescas al final de los nueve días de cultivo pero no se pudo mantener la producción de antocianinas. Sin embargo, las células cultivadas en el medio complementado con 45g/L de sucrosa sin MeJA mostró el mayor contenido de pigmento (0.69±0.22cv/g-fcm). Las células cultivadas en el medio MS complementado con 30 g/L de sucrosa y con 3.5 mg/l MeJA en el tercer y sexto día de cultivo, mostró el menor contenido de pigmentos (0.37-0.40cv/g-fcm). Este estudio indicó que MeJA no era necesario pero la sucrosa sí se necesitaba para mejorar el crecimiento celular y la producción de antocianinas en cultivos de células de M. malabathricum.

**Genetic molecular analysis of Coffea arabica (Rubiaceae) hybrids using SRAP markers**

In Coffea arabica (arabica coffee), the phenotypic as well as genetic variability has been found low because of the narrow genetic basis and self fertile nature of the species. Because of high similarity in phenotypic appearance among the majority of arabica collections, selection of parental lines for inter-varietals hybridization and identification of resultant hybrids at an early stage of plant growth is difficult. DNA markers are known to be reliable in identifying closely related cultivars and hybrids. Sequence Related Amplified Polymorphism (SRAP) is a new molecular marker technology developed based on PCR. In this paper, sixty arabica-hybrid progenies belonging to six crosses were analyzed using 31 highly polymorphic SRAP markers. The analysis revealed seven types of SRAP marker profiles which are useful in discriminating the parents and hybrids. The number of bands amplified per primer pair ranges from 6.13 to 8.58 with average number of seven bands. Among six hybrid combinations, percentage of bands shared between hybrids and their parents ranged from 66.29% to 85.71% with polymorphic bands varied from 27.64% to 60.0%. Percentage of hybrid specific fragments obtained in various hybrid combinations ranged from 0.71% to 10.86% and ascribed to the consequence of meiotic recombination. Based on the similarity index calculation, it was observed that F1 hybrids share maximum number of bands with the female parent compared to male parent. The results obtained in the present study revealed the effectiveness of SRAP technique in cultivar identification and hybrid analysis in this coffee species. Rev. Biol. Trop. 59 (2): 607-617. Epub 2011 June 01.

En Coffea arabica (café arabica), el fenotipo y la variabilidad genética son bajos debido a la estrecha base genética y la autofecundación de la especie. Por su alta similitud fenotípica entre la mayoría de las colecciones de arábica, la selección de líneas parentales para hibridación entre variedades, y la identificación de los híbridos resultantes en una fase inicial de crecimiento, es difícil. Para la identificación de variedades estrechamente relacionadas y sus híbridos, los marcadores de ADN son confiables, pero los polimorfismos de amplificación de secuencias relacionadas (SRAP, por sus siglas en inglés) constituyen una nueva tecnología de marcadores moleculares basada en PCR. En este trabajo, sesenta progenies arábica híbridas, pertenecientes a seis cruces, fueron analizadas utilizando 31 marcadores altamente polimórficos. El análisis reveló siete tipos de perfiles de marcadores que son útiles en la discriminación de los progenitores y los híbridos. El número de bandas amplificadas por pares de cebadores estuvo entre 6.13 a 8.58 con un promedio de siete bandas. Entre las seis combinaciones de híbridos, el porcentaje de bandas compartidas entre híbridos y sus progenitores estuvo entre 66.29% y 85.71% con bandas polimórficas que variaron entre 27.64% y 60.0%. El porcentaje de fragmentos híbridos específicos obtenidos en diversas combinaciones híbridas varió entre 0.71% y 10.86% lo que se atribuye a la recombinación meiótica. Con base en el cálculo del índice de similitud, se observó que los híbridos F1 compartieron un número máximo de bandas con el progenitor femenino que con el masculino. Los resultados obtenidos en este estudio muestran la eficacia de la técnica de SRAP en la identificación de cultivos e híbridos de esta especie de café.

Biología pesquera de la langosta Panulirus gracilis en Playa Lagarto, Guanacaste, Costa Rica

Biology and fishery of the lobster Panulirus gracilis in Playa Lagarto, Guanacaste, Costa Rica. Panulirus gracilis is a high valuable lobster species with considerable captures along the tropical Pacific coast. In this study, I present some biological and fishery parameters described after a sample of 843 lobsters, landed in Playa Lagarto from November 2007 to October 2008. From landing records, a total of 74.9% of lobsters were below the minimum legal catch size (80mm CL). Carapace lengths were in the range of 42.8 and 143.6mm for males and 115 and 35.8mm for females. The size structure showed a wide overlapping of population segments, and a trend to increase with depth, where lung diving and “hooka” diving operations take place. Sex ratio was 1.36 M:H. The relationship between weight and LC revealed that females are heavier than males of the same size, and this difference was significant (p<0.05). The von Bertalanffy growth parameters for males and females respectively (K=0.45-0.38, LC∞=166.9-121.7) showed accelerated growth compared to other species. Males observed a higher growth rate than females. Furthermore, natural mortality (M), total mortality (Z) and fishing mortality (F) was higher in males (0.49-2.34-1.92) than in females (0.47-1.82-1.42). Recruitment was continuous for both sexes during the year, with an elevated intensity of 18.5% in July. Under the current fishing regime the population could be at risk of collapse, as indicated by the high exploitation rate (E) 0.80. Rev. Biol. Trop. 59 (2): 619-633. Epub 2011 June 01.

Los parámetros biológicos y pesqueros analizados se fundamentaron en una muestra de 843 langostas provenientes de la actividad pesquera realizada en Playa Lagarto entre noviembre del 2007 y octubre del 2008. Las longitudes cefalotoráxicas de los machos estuvo comprendida entre los 143.6 y 42.8 y 115 y 35.8mm para hembras. El 74.9% de las langostas en los desembarques estuvo por debajo de la talla mínima legal de captura (80 mm de LC). La estructura de tallas muestra un considerable solapamiento de segmentos poblacionales y el incremento de las tallas con la profundidad en donde operan las dos modalidades de pesca estudiadas: el buceo a pulmón y el buceo con compresor. La proporción de sexos obtenida fue de 1.36 M:H. La relación entre LC y peso reveló que las hembras pesan más que los machos de una misma talla y que esta diferencia fue significativa (p<0.05). Los parámetros de crecimiento de von Bertalanffy para machos y hembras respectivamente (K=0.45-0.38, LC∞=166.9-121.7) indican un crecimiento acelerado en comparación a otras especies. Los machos por su parte exhibieron una mayor tasa de crecimiento que las hembras. Además, la mortalidad natural (M), la mortalidad total (Z) y la mortalidad por pesca (F) fue más alta en machos (0.49-2.34-1.92) que en hembras (0.47-1.82-1.42). El reclutamiento para ambos sexos presentó un comportamiento continuó durante el año con un pulso de mayor intensidad en julio de 18.5%. El significativo porcentaje de langostas por debajo de la talla mínima legal permitida para la pesca evidencia fuerte presión ejercida sobre las tallas juveniles. Afirmación que es reforzada por el valor de la tasa de explotación (E) determinada de 0.80, que indica que bajo el actual régimen de pesca la población estaría en riesgo de colapso.

Insectos acuáticos y calidad del agua en la cuenca y embalse del río Peñas Blancas, Costa Rica

Aquatic insects and water quality in Peñas Blancas watershed and reservoir. The aquatic insects have been used to evaluate water quality of aquatic environments. The population of aquatic insects and the water quality of the area were characterized according to the natural and human alterations present in the study site. During the monthly-survey, pH, DO, temperature, water level, DBO, PO4 and NO3 were measured. Biological indexes (abundance, species richness and the BMWP-CR) were used to evaluate the water quality. No relation between environmental and aquatic insects was detected. Temporal and spatial differences attributed to the flow events (temporal) and the presence of Peñas Blancas reservoir (spatial). In the future, the investigations in Peñas Blancas watershed need to be focused on determining the real influence of the flows, sediment release and the possible water quality degradation because of agriculture activities. Rev. Biol. Trop. 59 (2): 635-654. Epub 2011 June 01.

La población de insectos acuáticos y la calidad del agua fueron caracterizadas tomando en cuenta las alteraciones humanas y naturales en el área de estudio. Durante los muestreos mensuales, el pH, OD, temperatura, nivel del agua, DBO, PO4 y NO3 fueron medidos. Los índices biológicos (abundancia, riqueza de especies y el BMWP-CR) se evaluaron para determinar la calidad del agua. No se detectaron relaciones entre las variables ambientales y los insectos acuáticos, pero las diferencias espaciales y temporales en la abundancia y riqueza fueron asociadas con las crecidas del río (temporal) y a la presencia del embalse Peñas Blancas (espacial). En el futuro las investigaciones en la cuenca Peñas Blancas deben de ser dirigidas a determinar la magnitud de la influencia de los caudales, liberación de sedimentos y la posible degradación de la calidad del agua por efluentes de aguas servidas que se lleguen a ubicar en la cuenca.

La pesquería de tiburones oceánicos-costeros en los litorales de Colima, Jalisco y Michoacán

Fishery of oceanic and coastal sharks in Colima, Jalisco and Michoacán. Shark fishery is one of the most important activities in the Mexican Pacific coast, nevertheless, there is few data available about the specific captures done by the fleet along the coast. This study describes fishery biology aspects of the shark species catched by the semi-industrial long-line fleet of Manzanillo. Monthly samplings were made on board of these vessels during an annual period from April 2006 to April 2007. Captured species composition (n=1 962 organisms) was represented by nine species. The one that sustains this fishery was Carcharhinus falciformis (88.12%), followed by Prionace glauca (8.21%). Low frequency species were represented by Sphyrna zygaena (1.78%), Alopias pelagicus (0.82%), Carcharhinus longimanus (0.45%). Furthermore, rare species were Alopias superciliosus (0.35%), Carcharhinus leucas (0.1%), Carcharhinus limbatus (0.1%) and Isurus oxyrinchus (0.05%). Fishery activity affected principally (60-92.70%) young males of C. falciformis, S. zygaena, C. longimanus and I. oxyrinchus; adult males (56-75%) of A. pelagicus, A. superciliosus, and C. limbatus; for P. glauca there were primarily female adults. For all the species found, females showed the bigger sizes when compared to males (with the exception of S. zygaena, that showed sexual dimorphism). Considering the lineal regressions made between precaudal length and total length, and, fork length and total length for C. falciformis, P. glauca, S. zygaena and A. pelagicus, the determination coefficients (r²) showed that both lengths can be useful to obtain the total length of fish with some damage or absence of its caudal fin. The estimated fecundity for C. falciformis was of 3-7 offspring/female of 30-45cm LT (average of 40.57+2.03cm LT); and for P. glauca 5-52offspring/female of 5-18.6cm LT (average of 11.61±0.21cm LT). In the case of C. longimanus only one female was captured with a total of eight embryos, with an average of 45cm LT each; for this reason we assumed that the fishery areas do not coincide with the nursery oness for this species. According to the information obtained, we concluded that C. falciformis has a concurrent cycle and P. glauca a consecutive biannual one. Rev. Biol. Trop. 59 (2): 655-667. Epub 2011 June 01.

La pesquería de tiburón es una de las más importantes en el Pacífico mexicano, en la actualidad no se cuentan con los datos de la composición específica de las capturas de las diferentes flotas. En el presente trabajo se describen aspectos biológicos-pesqueros de las especies de tiburón, capturadas por la flota palangrera de mediana altura del puerto de Manzanillo, en un periodo anual de abril 2006-abril 2007, los muestreos se realizaron mensualmente a bordo de estas embarcaciones. La composición de las capturas estuvo representada por nueve especies (n=1 962), de las cuales Carcharhinus falciformis (Bibron, 1839) (88.12%) sostiene esta pesquería y en segundo lugar Prionace glauca (Linnaeus, 1758) (8.21%). Las especies poco frecuentes fueron Sphyrna zygaena (Linnaeus, 1758) con (1.78%), Alopias pelagicus (Nakamura, 1935) (0.82%), Carcharhinus longimanus (Poey, 1861) (0.45%), Alopias superciliosus (Lowe, 1839) (0.35%), Carcharhinus leucas (Valenciennes, 1839) (0.1%), Carcharhinus limbatus (Valenciennes, 1839) (0.1%) é Isurus oxyrinchus (Rafinesque, 1810) (0.05%). La fecundidad estimada para C. falciformis fue de 3-7 crías/hembra con tallas de 30-45cm LT; 40.57+2.03cm LT y P. glauca con 5-52 crías/hembra, con tallas de 5-18.6cm LT; 11.61±0.21cm LT. Por lo tanto se asume que C. falciformis presenta un ciclo concurrente y P. glauca probablemente un ciclo bianual consecutivo.

**Reproductive biology of common snook Centropomus undecimalis (Perciformes: Centropomidae) in two tropical habitats**

In Southeastern Mexico, Centropomus undecimalis is an important fish species of sport and commercial fisheries for coastal and riverine communities. Fisheries along rivers and coasts depend on migratory habits of this species, and these movements are probably related to reproduction. In spite of its economic importance, few studies have been conducted focusing on its reproductive biology, and this research aims to analyze these habits. Samples (fork length, somatic and gonads weight, and macroscopic maturity stages) were obtained from organisms collected by fishermen from the largest fishing cooperatives along the coastal and riverine areas of Tabasco, from July 2006 to March 2008. Fish size ranged from 34 to 112cm fork length, with an average age of 6.42 years for males and 9.12 years for females. In riverine areas, fish sizes ranged from 30 to 85cm and the average age was 5.5 years for males and 6.6 years for females. Significant differences were recorded between lengths of males and females from the two areas (Kruskal-Wallis, p<0.05). The male:female ratio was 1:0.68 in the coast, and 1:0.16 in riverine areas. The length-weight relationship did not vary between both sexes among areas (ANCOVA, p>0.05). A curve for eviscerated weight was calculated for both sexes, for coastal fishes SW=0.0059(FL) 3.07, and the riverine ones SW=0.0086(FL) 2.98, with an isometric growth (b=3). The period of maximum reproduction was from July to August, with temperatures of 28 to 30°C. A significant correlation between the gonadosomatic index (GSI) and rainfall was recorded for samples of both males and females from coastal areas (r=0.63, r=0.70) whereas only one positive correlation was recorded for riverine females (r=0.57). The size at first maturity (L50) was estimated at 60cm and 80cm (FL), corresponding to 5.5 and 8.5 years of age, for males and females, respectively. An important proportion of mature females of eight years and older, suggests that these ages contribute significantly to the reproductive biomass. The results indicate that due to changes in the exploitation period, we recommend to protect populations of the common snook. Rev. Biol. Trop. 59 (2): 669-681. Epub 2011 June 01.

En este estudio, se analizó la biología reproductiva y poblacional del robalo blanco (Centropomus undecimalis). El material biológico se obtuvo en los desembarcos de la pesca artesanal de las cooperativas de mayor contribución en la zona costera y ribereña durante julio de 2006 a marzo de 2008. En la zona costera las tallas oscilaron entre 34 a 112cm (LF) y en la zona ribereña entre 30 a 85cm. Se encontraron diferencias significativas entre las longitudes de machos y hembras en ambas zonas de estudio (Kruskal-Wallis, p<0.05). La proporción machos:hembras fue 1:0.68 en la costa y 1:0.16 para la zona ribereña. La relación longitud-peso no difirió entre sexos en las dos zonas de estudio (ANCOVA, p>0.05). El periodo máximo reproductivo fue de julio a agosto. En la zona costera, se encontró una correlación significativa entre el iGS y precipitación pluvial para machos y hembras (r=0.63, r=0.70), en la zona ribereña solo se encontró un correlación positiva en las hembras (r=0.57). La talla de primera madurez (L50) se estimó a los 60cm para hembras y 80cm (LF) para machos correspondiendo a 5.5 y 8.5 años de edad respectivamente. Los resultados sugieren un cambio en el periodo de explotación para la conservación de las poblaciones del robalo blanco y su producción.

**Caracterización cariotípica en mitosis y meiosis del robalo blanco Centropomus undecimalis (Pisces: Centropomidae)**

Karyotypic characterization in mitosis and meiosis of the common snook Centropomus undecimalis (Pisces: Centropomidae). The common snook Centropomus undecimalis inhabits marine, brackish and freshwater habitats in the Western Central Atlantic Ocean, including the Gulf of Mexico. Common snook is an economically important fish in many localities, nevertheless the number of studies on its biology and genetics are still few. The present study attempts to establish the cytogenetic profiles of the specimens collected in Paraiso Municipality Tabasco, Mexico. Tissue of five females and eight male organisms were processed by conventional cytological techniques to obtain chromosome slides of high quality in order to assemble the karyotype. The results from the kidney tissue analysis showed that 85.1% of 288 mitosis had a 2n=48 chromosomes, and 52.8% of 104 meiosis exhibited the haploid number 1n=24. The diploid karyotype showed 48 monoarmed chromosomes of the telocentric (T) type. There was no chromosome heteromorphism between females and males. The diploid karyotype was very similar to that observed in the majority of marine fishes. Rev. Biol. Trop. 59 (2): 683-692. Epub 2011 June 01.

El robalo blanco Centropomus undecimalis, vive en hábitats marinos, salobres y dulceacuícolas en el océano Atlántico occidental, incluyendo el golfo de México. La especie, es económicamente importante en varias localidades, no obstante los estudios sobre su biología y genética son hasta el momento pocos. El presente estudio tiene como propósito, la caracterización citogenética de especímenes recolectados en el municipio de Paraíso, Tabasco, México. Cinco hembras y ocho machos fueron procesados por técnicas citológicas convencionales para la obtención de preparaciones cromosómicas de buena calidad para elaborar el cariotipo. Los resultados del análisis del tejido del riñón, mostraron que 85.1% de 288 mitosis tienen 2n=48 cromosomas y 52.8% de 104 meiosis exhiben el número haploide de 1n=24. El cariotipo diploide mostro 48 cromosomas monorrámeos de tipo telocéntrico (T). No se observó heteromorfismo cromosómico entre hembras y machos. El cariotipo diploide fue similar a los observados en la mayoría de peces marinos.

Ictiofauna de los humedales del río San Pedro, Balancán, Tabasco, México

Ichthyofauna from wetlands of San Pedro, Balancán, Tabasco, México. San Pedro River’s wetlands sustain trophic nets in the fluvial system, due to the high habitat availability, and space and temporal variations. In order to describe the relationship between environmental parameters and ichthyofauna, this study evaluated fish assemblages composition, distribution, abundance, density, biomass, richness species, diversity and equitability in the wetlands. Sampling considered three different sites and climatic seasons (dry, rainy and cold fronts). The physical and chemical parameters considered were dissolved oxygen, temperature, pH, water transparency and the depth. Fishes were caught with a shrimp net, after six minutes towings and were identified afterwards. A total of 1 049 organisms of 25 fish species were caught, two of which were exotic species: Oreochromis niloticus and Parachromis managuense. A total of 23 species were found at site I (with the highest density 0.23ind./m²), 17 at site II (0.23ind./m²) and 14 at site III (0.12ind./m²). The dry season had the highest species number with 21 species, followed by the rainy season with 17 species, and the cold season with five species. Similarly, the highest biomass (8.30g/m²) was found in dry season, followed by the rainy (2.16g/m²) and the cold seasons (0.03g/m²). Considering seasons, highest density was found during the dry (0.436ind./m²), followed by the rainy (0.213ind./m²) and the cold (0.023ind./m²) seasons. The dominant density species during the study period, according to the quadrants graphic of Olmstead-Tukey were: Petenia splendida, Vieja heterospila, Vieja synspila, Dorosoma petenense and Astyanax aeneus. There were significant differences in the species richness among sites. Temperature, depth and transparency showed differences among the seasons. The canonical correspondence analysis indicated that fish distribution was governed by environmental parameters during all seasons. In terms of fish abundance and composition, environmental parameters play an important role showing spatial and temporal differences in the ecosystem, this could be explained with the fact that most of young fishes have a movement behavior to the wetlands, searching refuge and feed during the dry season. Considering the diversity indexes variation, it may be concluded that San Pedro River’s wetlands correspond to a system where the ichthyofauna composition fluctuates spatial and seasonally. Rev. Biol. Trop. 59 (2): 693-708. Epub 2011 June 01.

Los humedales de San Pedro sostienen redes tróficas del sistema fluvial debido a la alta disponibilidad de hábitats y a sus variaciones espacio-temporales. En esta investigación se estudió la composición, densidad y biomasa de la ictiofauna de los humedales; se capturaron 1 049 organismos de 25 especies, dos son exóticas: Oreochromis niloticus y Parachromis managuense. Con 23 especies capturadas en el sitio I, 17 en el II y 14 en el III. En la época de secas se obtuvo mayor riqueza con 21 especies, lluvias con 17 y cinco en nortes. La mayor densidad se mostró en el sitio II (0.23ind./m²), seguido de los sitios I y III (0.12, 0.12ind./m²). La mayor biomasa fue en secas (8.30g/m²), seguida de lluvias (2.1g/m²) y por último nortes (0.01g/m²). La mayor densidad se mostró en secas (0.43ind./m²) y la mínima en nortes (0.023ind./m²). Las especies dominantes en densidad según el diagrama Olmstead-Tukey fueron: Petenia splendida, Vieja heterospila, Vieja synspila, Dorosoma petenense y Astyanax aeneus. Por lo tanto, existieron diferencias significativas en los parámetros ecológicos y ambientales. Al considerar la variación en la riqueza podemos concluir que los humedales del río San Pedro, es un sistema donde la composición de la ictiofauna responde a las fluctuaciones espaciales y temporales.

**Morfología de las especies de Hyphessobrycon (Characiformes: Characidae), grupo heterorhabdus, en Colombia**

Morphology of the species Hyphessobrycon, heterorhabdus group (Characiformes: Characidae) in Colombia. Hyphessobrycon is the most numerous and morphologically complex genus of Characidae, and includes 18 species reported for Colombia, from which thirteen belong to the heterorhabdus-group different methods have been proposed for species identification within this genus. This study used these species to undertake a morphogeometric analysis by the Box Truss and Thin Plate Splin (TPS) methods; 13 homologous landmarks type I and three type II were used. The result of cluster analysis indicated that these species are represented by two big groups: robust and thin. The uniform and non uniform components, and the principal warps (WP) and partial warps (Wparc), described the shape changes related to body depth, involving relative displacements of the appendicular skeleton and the cephalic region. All species were characterized by allometric growth with the exception of Hyphessobrycon mavro, who presented an isometry between the landmarks 6-7. Two new measures are proposed for species discrimination in the group (snout-supraoccipital spine distance and supraoccipital spine-pelvic fin). Rev. Biol. Trop. 59 (2): 709-725. Epub 2011 June 01.

El género Hyphessobrycon incluye dieciocho especies reportadas para Colombia de las cuales 13 son miembros del grupo heterorhabdus; con las mismas, se realizó un análisis morfogeométrico por medio del Método de Cerchas (Box Truss) y Láminas Delgadas (TPS). Se usaron 13 hitos homólogos tipo I y tres tipo II. El resultado del análisis cluster, llevado a cabo con cada una de las metodologías indicó que estas especies están representadas en dos grandes grupos: robustas y delgadas. Las deformaciones parciales, los componentes uniformes, no uniformes, Warps principales y Warps parciales describieron cambios de la forma relacionados con la profundidad del cuerpo e involucraron desplazamientos relativos del esqueleto apendicular y de la región cefálica. Todas las especies se caracterizan por presentar crecimiento alométrico excepto Hyphessobrycon mavro con isometría entre los hitos 6-7. Se plantean dos nuevas medidas discriminantes (hocico-supraoccipital y supraoccipital-aleta pélvica) para las especies del grupo.

**Diet, reproduction and population structure of the introduced Amazonian fish Cichla piquiti (Perciformes: Cichlidae) in the Cachoeira Dourada reservoir (Paranaíba River, central Brazil)**

The Blue Peacock Bass (Cichla piquiti), native to the Tocantins-Araguaia river basin of the Amazon system, was introduced into the basin of the Paranaíba River, Paraná River system. Cachoeira Dourada reservoir is one of a series of dams on the Paranaíba River in central Brazil, where this fish has become established. A study of its feeding spectrum, combined with information about its reproductive characteristics and population structure, would enable the current state of this species in the reservoir to be assessed and might provide useful data for the management of other species native to this habitat. This study showed that the peacock bass has no predators or natural competitors in the reservoir and that reproduces continuously, with high reproductive rates, and has a smaller median length at first maturity (L50) than other species of Cichla. Its successful establishment in habitats strongly affected by human activity should cause changes in the whole structure of the local fish communities. Nonetheless, in this reservoir, there appears to be some sharing of the functions of this species with native carnivorous fish, a situation that may be sustained by the presence of a wide variety of foraging fish. Rev. Biol. Trop. 59 (2): 727-741. Epub 2011 June 01.

El pez tucunaré (Cichla piquiti), nativo del sistema de la cuenca del rio Tocantins-Araguaia, fue introducido en la cuenca del río Paranaíba, parte del sistema del río Paraná. En este ecosistema trófico de planicie aluvial, las relaciones entre comunidades de peces están definidas por diferentes factores que pueden ser modificados debido a la represa del río, y da como resultado grandes cambios en la interacción biológica en éstos hábitats. La represa de Cachoeira Dourada forma parte de una serie de represas en el río Paranaíba en el Brasil central, donde el tucunaré se ha establecido. Una investigación sobre su espectro alimentario, combinado con información sobre sus características reproductivas y estructura poblacional, ha permitido evaluar el estado actual de esta especie y la obtención de datos útiles para el manejo de otras especies nativas en el mismo hábitat. Este estudio muestra que el tucunaré no tiene depredador o competidor natural en esta represa y se reproduce continuamente con tasas reproductivas muy altas, por lo tanto presenta una longitud media en su primera madurez (L50) más pequeña que otras especies de Cichla. El éxito de su establecimiento en estos hábitats fuertemente afectados por la actividad humana puede causar cambios en toda la estructura de la comunidad local. Sin embargo, en las represas parece que las funciones de estas especies son compartidas con las de los peces depredadores nativos, una situación que puede ser sustentada por la presencia de una larga variedad de peces forrajeros.

**Estructura y la ultraestructura del ovario de Cichlasoma urophthalmus (Perciformes: Cichlidae)**

Structure and ultrastructure of the ovary of Cichlasoma urophthalmus (Osteichthyes: Cichlidae). The study of the normal development, differentiation, structure and function of various components of developing follicles in the ovaries of numerous fish species have been a consistent focus of comparative reproduction. The structural and ultrastructural features of gonads from Cichlasoma urophthalmus have received scarce attention. In this work, we realized a descriptive study of female gonads of Cichlasoma urophthalmus. A total of 40 samples were collected in the Veracruz Alvarado Lagoon, Mexico in 2007-2008 period including the windy, dry and rainy seasons. Female gonads were extracted and a portion was fixed in 4% formaldehyde for treatment for routine histology hematoxylin and eosin (HE) and another part was processed for transmission electron microscopy (TEM). The gonads were fixed in 3% glutaraldehyde and 2% osmium tetroxide, followed by dehydrated in ethanol 50%, 70%, 80%, 95% and 100% for inclusion in Epon, thin sections were then prepared and were contrasted with lead citrate and uranyl acetate. The process of oocyte development can be divided into five distinct stages (formation of oocytes from oogonia, primary growth, lipid stage, vitellogenesis and maturation). In this work, we found that the primary growth stage is characterized by intense RNA synthesis and the differentiation of the vitelline envelope. Secondary growth starts with the accumulation of lipid droplets in the oocyte cytoplasm (lipid stage), which is then followed by massive uptake and processing of proteins into yolk platelets (vitellogenic stage). During the maturation stage, the lipid inclusions coalesce into a single oil droplet, and hydrolysis of the yolk platelets leads to the formation of a homogeneous mass of fluid yolk in mature eggs. In conclusion, further studies should elucidate structure and ultrastructural changes in the ovarian follicular components, in C. urophthalmus during different stages of oocyte growth. Rev. Biol. Trop. 59 (2): 743-750. Epub 2011 June 01.

Se realizó un estudio descriptivo de las gónadas femeninas de Cichlasoma urophthalmus. Las muestras fueron recolectadas en la Laguna de Alvarado Veracruz, México en el período 2007-2008 que incluyó las temporadas de Nortes, Secas y Lluvias. Se extrajeron las gónadas femeninas y una parte se fijó en formol al 4% para su tratamiento por técnica histológica de rutina hematoxilina y Eosina (H-E) y otra parte se procesó para microscopia electrónica de transmisión. Las gónadas se fijaron en glutaraldehído al 3% y OsO4 al 2%, se deshidrataron en etanol de 50 al 100% para ser incluidas en Epón. Se realizaron cortes finos y semifinos contrastados con citrato de plomo y acetato de uranilo. Los ovarios de C. urophthalmus son pareados presentan un desarrollo asincrónico con ovocitos previtelogénicos en estadio perinuclear tardío, asociados a las lamelas ovígeras y ovocitos vitelogénicos del VII estadio, éstos últimos presentan una zona radiada bien definida, con gránulos de vítelo lipídico y vesículas de vítelo proteico que se distribuyen en capas concéntricas, que rodean al núcleo. El presente estudio, permitió conocer más a fondo los cambios de la estructura y ultraestructura de los componentes de los folículos ováricos, en C. urophthalmus durante las diferentes etapas de crecimiento de los oocitos.

**Bacterial infection of mudfish Clarias gariepinus (Siluriformes: Clariidae) fingerlings in tropical nursery ponds**

Bacterial infection among the most common cultured mudfish Clarias gariepinus in Africa, has become a cause of concern, because it constitutes the largest economic loss in fish farms. In order to provide useful biological data of the pathogens for good management practices, samples were collected monthly between January 2008 and December 2009 in three monoculture nursery ponds, located in three different positions: upriver (A, grassland), mid-river (B, mixed forest and grassland) and downriver (C, rainforest) along 200km length of Cross River floodplains, Nigeria. A total of 720 fingerlings between 15.1 and 20.7g were analyzed to determine the degree of infection. The bacterial pathogens were taken from their external surfaces, and were isolated and identified by standard methods. The caudal fins of fingerlings from pond A had the highest bacterial load (5.8x10³cfu/g), while the least counts (1.2x103cfu/g) were identified on the head of fish from pond C, with Flexibacter columnaris as the major etiological agent. Pseudomonas fluorescens, Aeromonas hydrophila, Escherichia coli, Staphylococcus aureus and Micrococcus luteus were identified as co-isolates with P. fluorescens as dominant (0.7x10²cfu/mL) co-isolates in pond water. Clinical signs of five white spots with red periphery appeared on the external surface of infected fish. All the fish sampled, died after 4 to 9 days. There was no significant difference in the bacterial counts between different ponds, but the difference between fish organs/parts examined was significant. Fish from these ponds are therefore potentially dangerous to consumers and highly devalued, with the economic impact to producers. Preventive methods to avoid these infections are recommended. Rev. Biol. Trop. 59 (2): 751-759. Epub 2011 June 01.

Las infeccines bacterianas son comunes en el pez de cultivo Clarias gariepinus, el cual es el más cultivado en Africa y se han convertido en una causa de preocupación, ya que constituye la mayor pérdida económica en las granjas piscícolas. Se proporcionan datos biológicos de los agentes patógenos con el fin de proporcionar información útil para buenas prácticas de gestión en las granjas. Las muestras fueron recolectadas mensualmente entre Enero 2008 y Diciembre 2009 en tres viveros de estanques de monocultivo, situados en tres posiciones diferentes: río arriba (A, pastizales), mitad del río (B, bosque mixto y pastos) y aguas abajo (C, bosque) a lo largo de 200km de longitud en las llanuras de inundación del río Cross, Nigeria. Un total de 720 alevines de entre 15.1 y 20.7g fueron analizados para determinar el grado de infección. Los patógenos bacteriales fueron tomados de las superficies externas, y fueron aislados e identificados por métodos estándar. Las aletas caudales de los alevines del estanque A tuvieron la mayor carga bacteriana (5.8x10³cfu/g), mientras el menor conteo de bacterias (1.2x103cfu/g) fue identificado en la cabeza de los peces del estanque C, con Flexibacter columnaris como el agente etiológico más importante. Pseudomonas fluorescens, Aeromonas hydrophila, Escherichia coli, Staphylococcus aureus y Micrococcus luteus se identificaron como co-aislamientos con P. fluorescens, como dominantes (0.7x102cfu/mL) co-aislados en el agua del estanque. Los signos clínicos fueron cinco puntos blancos con la periferia roja y aparecieron en la superficie externa de los peces infectados. Todos los peces de la muestra, murieron después de 4 a 9 días. No hubo diferencia significativa en los recuentos bacterianos entre los diferentes estanques, pero la diferencia entre los órganos y las partes de los peces examinados fue significativa. Los peces de estos estanques son potencialmente peligrosos para los consumidores y con alta devaluación, con un impacto económico para los productores. Se recomiendan métodos de prevención para evitar estas infecciones

**Edad y crecimiento del híbrido de tilapia Oreochromis niloticus x Oreochromis aureus (Perciformes: Cichlidae) en la represa “Zimapán” Hidalgo, México**

Age and growth of the hybrid tilapia Oreochromis niloticus x Oreochromis aureus (Perciformes: Cichlidae) in the dam “Zimapan” Mexico. Studies on age and growth in fishes are essential to establish models on population dynamics. The previos issues were determined in this study by scale growth analyses. Between September 2003 and May 2004, 382 organisms were captured using gill and atarraya nets. Eight samples were developed every month a long this study. Standard length in centimeters (Le), total weight in grams (Pt), scale length in centimeters (Lesc) and growth rings were determined. The size and weight ranged from 38 to 232mm (Le) and 8.7 to 311.9g (Pt), respectively. The growth rings analyses reveal four age groups, being the sec-ond group the most representative with 34.3% of the total sampled. The scale ring analyses showed two growth rings, one develops between November-January and the other between April-May, in good correlation with low temperature and gonad development, respectively. The growth parameters were established as: L∞=281.1mm, W∞=877.1g, K=0.33 and T0=0.88year -1. The growth curves based on length and weight were described by using the von Bertalanffy model: Le =28.11[1-e-0.33(t+0.88)] and Pt =877.17[1-e-0.33(t+0.88)]³. Finally, it is concluded that commercial catches in this dam are between a year and year and half-old when exploited. Rev. Biol. Trop. 59 (2): 761-770. Epub 2011 June 01.

La edad y crecimiento de la tilapia Oreochromis niloticus x Oreochromis aureus fueron determinados por medio de la lectura de escamas. Un total de 382 individuos fueron capturados mediante el uso de redes agalleras y atarrayas. Ocho recolectas mensuales se llevaron a cabo entre septiembre 2003-mayo 2004; se registraron los datos de longitud estándar en cm. (Le), el peso total en g (Pt) y se obtuvieron muestras de escamas para registrar el largo de la escama en mm. (Lesc) y el número de anillos de crecimiento formados. Las tallas y pesos de recolecta variaron entre 38 a 232mm (Le) y de 8.7 a 311.9g de peso total (Pt) respectivamente. El recuento de los anillos anuales en escamas, permitió establecer cuatro grupos de edad, siendo el grupo de edad 2 el más representativo, con un 34.3% de la población muestreada. El cálculo de los incrementos marginales del crecimiento mensual de las escamas, sugirió la formación de dos anillos, uno de ellos se forma en los meses de noviembre-enero y otro en los meses de abril-mayo, los cuales coinciden con la época de bajas temperaturas y de madurez gonádica respectivamente. Los parámetros de crecimiento quedaron establecidos en: L∞=281.1mm, W∞=877.1g, K=0.33 y T0=0.88/año. Las curvas de crecimiento en longitud y peso se describieron mediante las ecuaciones de von Bertalanffy: Le=28.11 [1- e-0.33(t+0.88)] y Pt=877.17 [1-e-0.33(t+0.88)]³. Finalmente, se concluyó que los peces que se explotan en la represa mediante captura comercial presentan entre un año y año y medio de edad.

Patrones de crecimiento postnatal en ocho especies de garzas (Ciconiiformes: Ardeidae)

Postnatal growth patterns in eight species of herons and egrets (Ciconiiformes: Ardeidae). Avian postnatal growth has received considerable attention and its ecological implications have been deeply analyzed. In this current paper, I describe the patterns of culmen and tarsus growth, as well as of weight gain patterns in eight species of herons and egrets (Aves: Ardeidae) found in the Birama Swamp in Eastern Cuba. Between 1998 and 2006, 714 nestlings of the following species were measured every two days: Butorides virescens, Bubulcus ibis, Egretta thula, E. tricolor, E. caerulea, E. rufescens, Ardea alba and Nycticorax nycticorax. Logistic and Gompertz equations were adjusted to data using non-lineal regression models with adult values as the asymptote. For each species, the following were determined and recorded: growth rate, age at inflexion, instantaneous growth rates at each age interval, and time taken to reach 90% of adult size. Reported hatchling sizes were similar in other localities, with a variation coefficient ranging between 10-19%. At hatch, each species exhibited differing sizes relative to adult values. In all cases, Gompertz equations were best fitted to explain more variance and lesser residuals. Rates of weight change and tarsus growth were alometrically related to the log of adult weight. Two main growth processes were identified: a physical extension in dimensions of each measure ment reflecting inter-specific morphometric differences, and a lineal increase of the growth period from Green Heron to Great Egret. The Black-crowned Night Heron, Cattle Egret and Reddish Egret exhibited some unique measurement characteristics in comparison to the remaining members of the family. All results support the hypothesis that hypermorphosis, as the main evolutionary process in the microevolution of Ardeidae, is caused by a delayed final moment of growth. Rev. Biol. Trop. 59 (2): 771-787. Epub 2011 June 01.

El crecimiento en aves forma parte de las estrategias reproductivas y su implicación ecológica ha sido profundamente debatida. En este trabajo se describe el crecimiento del pico, peso y tarso de ocho garzas (Aves: Ardeidae) en la ciénaga de Birama, Cuba. Para ello, entre 1998-2006, se midieron en días alternos un total de 714 pichones de Butorides virescens, Bubulcus ibis, Egretta thula, E. tricolor, E. caerulea, E. rufescens, Ardea alba y Nycticorax nycticorax, durante sus dos primeras semanas de vida. Se hicieron ajustes a las curvas Logística y de Gompertz y se usó regresiones no lineales y valores adultos como asíntotas, además se determinaron las variables que describenel crecimiento. El tamaño de los pichones al eclosionar fue similar al encontrado en otras localidades, con CV entre 10-19% y diferencias relativas al tamaño adulto. Las ecuaciones de Gompertz tuvieron menos residuos en todos los casos. Entonces, se identificaron dos procesos fundamentales de extensión en el crecimiento de cada estructura: uno físico y otro de duración, entre B. virescens y E. alba. Nycticorax, B. ibis y E. rufescens mostraron variaciones que los diferenciaron del resto. Los resultados apoyan la hipótesis de la microevolución de Ardeidae por hipermorfosis, por un retardo en el momento final del crecimiento.

**Sex determination in Turdus amaurochalinus (Passeriformes: Muscicapidae): morphometrical analysis supported by CHD gene**

Sex determination is important for conservation and population studies, particularly for reproduction programs of threatened species and behavioural ecology. Turdus amaurochalinus, Creamy-bellied Thrush, only exhibits sexual dimorphism during the breeding season, when males are considered to show intense yellow bills, and females and immature males show dark brown bills. The objectives of this study were: 1) to determine the sex of individuals using genetic techniques, and 2) to test the hypothesis that sex dimorphism can be detected by morphometry. This study was carried out at Parque Nacional da Restinga de Jurubatiba, a preserved area located on the North coast of Rio de Janeiro State. The birds were captured using ornithological nets, singly marked with metal rings, weighed, measured and had blood samples collected before being released. The sex of 42 T. amaurochalinus individuals was determined using the CHD gene marker. A total of 20 males and 22 females were identified from June to August, with peak capture frequency in June. Turdus amaurochalinus females and males differed significantly in morphometrical measures. The most important traits to distinguish males from females were wing length (Student t-test=4.34, df=40, p=0.0001) and weight (Student t-test=2.08,df=40, p=0.044): females were heavier and had significantly shorter wing length than males. Females and males were correctly classified in 86% and 75% of cases, respectively, using Discriminant Analysis. The molecular analysis was the most secure method for sex determination in the studied species. Rev. Biol. Trop. 59 (2): 789- 794. Epub 2011 June 01.

La determinación del sexo es importante para la conservación y los estudios poblacionales. Turdus amaurochalinus no presenta aparente dimorfismo sexual. El objetivo de este estudio fue determinar el sexo a través de una técnica genética, mediante el uso del marcador del gen CHD y se puso a prueba la hipótesis de que el dimorfismo sexual puede ser detectado por morfometría. Este estudio se llevó a cabo en el Parque Nacional da Restinga de Jurubatiba, una zona protegida situada en la costa norte de Río de Janeiro. Las aves fueron capturadas con redes de niebla, los individuos se marcaron con anillos de metal, se pesaron, medieron y se les tomó una muestra de sangre antes de ser liberados. Un total de 20 machos y 22 hembras fueron identificados en el área de estudio desde junio hasta agosto, con la frecuencia máxima de captura en junio. La prueba de t-student fue usada para evaluar si hembras y machos se diferencian considerablemente en relación a medidas morfométricas. Los rasgos más importantes para distinguir machos de hembras fueron la longitud del ala y el peso: las hembras eran más pesadas y tenían longitud de ala considerablemente más corta que los machos. Hembras y machos fueron correctamente clasificados en un 86% y 75% de casos respectivamente, donde se usó un análisis discriminante. El análisis molecular es el método más seguro para la determinación sexual en la especie estudiada.

**Caracterización molecular de poblaciones venezolanas de Sigmodon hirsutus (Rodentia: Cricetidae)**

Molecular characterization of Sigmodon hirsutus (Rodentia: Cricetidae) populations in Venezuela. Recent phylogenetic studies based on cytochrome b gene sequence, have determined that the species historically known as Sigmodon hispidus (Rodentia) from South America comprises a species S. hirsutus of paraphyletic origin. The aim of this study was to test the hypothesis that populations from Venezuela, represent the sensu strict form, ancestral haplotypes, and monophyletic subspecies. For this, 12 individual sequences from three localities of different biogeographic regions in Venezuela were evaluated and sequenced based on cyto b. Additionally, the sequences were used to develop a cladistic analysis and genetic distance calculations, and to compare this information with two individual sequences of Sigmodon specimens available in Genbank. Phylogenetic analyses show that the three populations of S. hirsutus of Venezuela form an ancestral and monophyletic subclade supported by high bootstrap values and significant genetic distance between subclade within the S. hirsutus. Besides, the existence of two lineages suggests two subspecies, S. hirsutus hirsutus from Venezuela, and S. hirsutus mexicanus from Mexico-Central America, but, both species need formal description. Rev. Biol. Trop. 59 (2): 795-807. Epub 2011 June 01.

Recientes estudios filogenéticos basados en la secuencia del gen del citocromo b, han determinado que la especie conocida históricamente como Sigmodon hispidus (Rodentia) en Suramérica incluye una especie S. hirsutus de origen parafilético. El objetivo de este estudio fue probar la hipótesis de que las poblaciones de Venezuela, representan la forma sensu estricto, los haplotipos ancestrales y una subespecie monofilética. La metodología consistió en un análisis cladístico y cálculos de distancia genética, a partir de secuencias de citocromo b en 12 individuos de tres localidades en Venezuela que pertenecen a diferentes regiones biogeográficas, y a su vez compararlas con las dos secuencias disponibles en Genbank de especies del género Sigmodon. Los análisis filogenéticos indican que las tres poblaciones de S. hirustus de Venezuela forman un subclado ancestral y monofilético con el apoyo de valores de bootstrap altos y con significativa distancia genética, entre subclados dentro de S. hirsutus. La existencia de dos subclados dentro de S. hirsutus sugiere dos subespecies, S. hirsutus hirsutus en Venezuela y S. hirsutus mexicanus en México y Centroamérica. Sin embargo, ambas subespecies necesitan una descripción formal.

Interpretación fitosociológica de la vegetación de las lomas del desierto peruano

A phytosociological interpretation of vegetation from sandy hills of the Peruvian desert. The vegetation of the sandy hills (“lomas”) constitutes the main originality of the Peruvian and Chilean desert with a high number of endemics that shapes the vicarious associations. in this work, a phytosociological view of sandy environments of the Peruvian coastal desert is presented. According to the Braun-Blanquet method, we have made up 32 phytosociological inventories and added 138 ones from others authors. in each inventory, we have analyzed its floristic composition and ecological parameters, as altitude, soil and geomorphology. All releves were synthesized in a table to deduce the different associations, higher phytosociological units, and the distribution of its flora along the Peruvian coast and the Andean Cordillera. Using the Shannon-Wiener diversity index, the diversity of this flora is discussed making a comparison with historical data about the use of the territory with livestock during pre-inca and inca cultures, and Spanish invasion. As a result, two associations from Southern Peru -Nolanetum scaposo-spathulatae and Palauetum camanensis-weberbaueri-, two alliances -Nolanion humifusae from central Peru, and Nolanion spathulatae from the Southern Peru- and a new order -Tetragonio crystallinae- Plantaginetalia limensis- are described. In Nolanetum scaposo-spathulatae, Dictyophragnus englerianus, Leptoglossis lomana, Nolana scaposa, N. spathulata, Palaua velutina and Tetragonia vestita are the main characteristics, while in Palauetum camanensis-weberbaueri association N. scaposa and P. velutina are replaced by Palaua camanensis and P. weberbaueri. Nolanion humifusae alliance integrates species as Geranium limae, Hymenocallis amancaes, Nolana humifusa, N. latipes, Palaua rhombifolia or Villanova oppositifolia. Likewise, Cistanthe weberbaueri, Cryptantha parviflora, Hoffmannseggia miranda, Lupinus mollendoensis, Nolana confinis, N. pallidula, N. scaposa, N. spathulata, Palaua camanensis, P. velutina, P. weberbaueri, Tetragonia vestita and Weberbauerella brongniartioides are the characteristic species of Nolanion spathulatae alliance. The Tetragonio crystallinae-Plantaginetalia limensis order presents characteristic plants don´t linked with eutrophic soils, as Calandrinia alba, Cryptantha limensis, Dyschoriste repens, Monnina macrostachya, Oxalis lomana, Palaua malvifolia, Pectocarya lateriflora, Plantago limensis or Tetragonia crystallina, with a distribution that claps the geographical area of the new alliances. On the other hand, the vegetation of the desert ravines is discussed in the context of the coastal river plant communities and its disturbance by the dunes. After the application of the Shannon-Wiener diversity index on the synthetic table columns, we can deduce that an increase in Andean and European ruderal species is linked to an intensive livestock activity. The transhumance between the Andes and the coast from pre-inca times until now, produces the plant dispersion of high Andean plants toward the coast; the Spanish colonization was the origin of the presence of European plants in the “lomas” vegetation of Peru. Rev. Biol. Trop. 59 (2): 809-828. Epub 2011 June 01.

La vegetación de las lomas, causada sobre todo por las precipitaciones debidas a la influencia de la corriente fría de Humboldt, constituye la mayor originalidad del desierto peruano y chileno, con un alto número de endemismos que forman asociaciones geovicarias. En este trabajo, presentamos un estudio fitosociológico sobre la vegetación de los medios arenosos de las lomas del desierto costero peruano. De acuerdo con el método de Braun-Blanquet, hemos levantado 32 inventarios fitosociológicos a los que hemos añadido 138 procedentes de la bibliografía. En cada inventario, hemos analizado la composición florística y distintos parámetros ecológicos, como la altitud, el suelo y la geomorfología. Todos los inventarios fueron sintetizados en una tabla para deducir las asociaciones, las unidades fitosociológicas superiores y el origen de su flora. Como resultado, describimos dos nuevas asociaciones del sur del Perú -Nolanetum scaposo-spathulatae y Palauetum camanensis- weberbaueri, dos alianzas -Nolanion humifusae, del centro del Perú, y Nolanion spathulatae del sur del Perú-, y un nuevo orden -Tetragonio crystallinae-Plantaginetalia limensis-. También se presenta la vegetación de las quebradas en el contexto de las comunidades de riberas de la costa y su alteración por las dunas. Después de la aplicación del índice de Shannon-Wiener sobre las columnas de la tabla sintética, podemos deducir que el aumento de especies ruderales andinas y europeas en la costa central del Perú se ha visto favorecido por una actividad ganadera intensiva. La trashumancia entre los Andes y la costa, desde tiempos preincaicos hasta la actualidad, ha producido la dispersión zoócora de plantas altoandinas hacia la costa; la presencia de plantas europeas tuvo su origen en la colonización española de la costa del Perú.

Identificación de las prioridades de conservación de la biodiversidad marina y costera en Costa Rica

Identification of Marine and Coastal biodiversity conservation priorities in Costa Rica. Costa Rica is recognized as one of the most diverse countries in species and ecosystems, in their terrestrial realm as well as in the marine. Besides this relevance, the country presents a delay on conservation and management of marine and coastal biodiversity, with respect to terrestrial. For 2006, the marine protected surface was 5 208.8km², with 331.5km of coastline, in 20 protected areas. The country has made progress on the conservation priority sites identification for terrestrial and freshwater biodiversity, with few efforts on marine planning. This research presents the analysis and results of the gap identification process, formarine and coastal biodiversity conservation in the protected areas system of Costa Rica. The analysis was built with the spatial information available on the presence and distribution of coastal and marine biodiversity, the establishment of the conservation goals and a threat analysis over the ecological integrity of this biodiversity. The selection of high-priority sites was carried out using spatial optimization techniques and the superposition over the current shape of marine protected areas, in order to identify representation gaps. A total of 19 076km² of conservation gaps were indentified, with 1 323km² in the Caribbean and 17 753km² in the Pacific. Recommendations are aimed at planning and strengthening the marine protected areas system, using the gaps identified as a framework. It is expected that the results of this study would be the scientific base needed for planning and sustainable use of marine biodiversity in the country. Rev. Biol. Trop. 59 (2): 829-842. Epub 2011 June 01.

Costa Rica es un país reconocido por su alta diversidad de especies y ecosistemas, tanto en sus ambientes terrestres como marinos. A pesar de esta importancia, presenta un rezago en la conservación y manejo de la biodiversidad marina y costera, con respecto a la terrestre. Para el año 2006, la superficie marina protegida era de 5 208.8km² y 331.5km de línea costera, en 20 áreas silvestres protegidas. El país ha logrado importantes avances en la selección de sitios prioritarios para la conservación de la biodiversidad terrestre y de aguas continentales, aunque pocos esfuerzos se han realizado hasta el momento en la planificación marina. En este trabajo se muestra el análisis y resultados de un proceso de identificación de vacíos en la representatividad de la biodiversidad marina y costera en el sistema de áreas protegidas de Costa Rica. El estudio se construyó a partir de la información espacial disponible sobre la presencia y distribución de la biodiversidad marina y costera, el establecimiento de metas de conservación y el análisis de amenazas sobre la integridad ecológica de la biodiversidad. Posteriormente, se llevó a cabo la selección de sitios prioritarios mediante técnicas de optimización espacial, y la sobreposición con la actual capa de áreas marinas protegidas, para finalmente identificar los vacíos en la representatividad. En total, se identificaron 19 076km² de vacíos de conservación, 1 323km² en el Caribe y 17 753km² en el Pacífico. Se plantean recomendaciones dirigidas hacia la ampliación y fortalecimiento del sistema de áreas marinas protegidas del país, en el cual se usan los vacíos identificados como marco de referencia. Se espera que los resultados presentes sean parte de la base científica necesaria para la planificación de la conservación y uso sostenible de la biodiversidad marina en el país.

Distribución y densidad de dos especies de holoturoideos en la isla de Cubagua, Venezuela

Distribution and density of two holothurian species in Cubagua Island, Venezuela. Holothurian populations in the Caribbean have been significantly depleted in some areas, and others are still in danger to satisfy international markets. In Venezuela, this marine resource has been illegally exploited since the early 1990s. To contribute with their management and protection, this work analyzed the distribution, abundance and population structure of two commercial holothurians Isostichopus badionotus and Holothuria mexicana in Cubagua Island shores. A total of 52 stations were studied around the island during the year 2008. Surveys included visits to each station, for which a band transect of 50m² with four replicates were carried out. The results show that I. badionotus has a higher distribution on the East coast of the island, and is found over Thalassia testudinum beds or bivalve molluscs aggregations, with an average density of 0.011ind/m², C.I. 95%=0.005-0.017, n=122, and a general abundance estimated in 117ind/ha. H. mexicana has been practically depleted (0.001 ind/m2 C.I. 95%=0.0002-0.0013, 7.7 ind/ha, n=8). We recommend the maintenance of the total ban adopted in 1997 to assure the protection of these species, mainly because no previous data supported the start of the fishery, and also, because the current densities are still very low when compared to other areas in Venezuela and the Caribbean. These are animals easy to catch, susceptible to overfishing, and with a very low recovery rate; thus, more control is required from the local authorities. Rev. Biol. Trop. 59 (2): 843-852. Epub 2011 June 01.

En algunas zonas del Caribe, poblaciones enteras de holoturias han sido agotadas. En Venezuela, éste recurso ha sido explotado ilegalmente desde inicios de 1990. Por esta razón, se planteó estimar la distribución, abundancia y estructura poblacional de las holoturias comerciales Isostichopus badionotus y Holothuria mexicana en la isla Cubagua. Para ello, durante el año 2008, se realizaron cuatro transectas bandas de 50m² cada una en 52 estaciones ubicadas alrededor de la isla. Entre los resultados obtenidos destacan: I. badionotus presenta mayor distribución en el lado este de la isla, sobre fondos de Thalassia testudinum o bancos de moluscos bivalvos; con una densidad promedio de 0.011±0.022ind/m² (n=122), y una abundancia general estimada en 117ind/ha. Se identificaron cinco posibles zonas de crianza para esta última especie. H. mexicana ha sido prácticamente agotada (0.001±0.002ind/m², 7.7ind/ ha, n=8). Se recomienda mantener la veda total implantada en 1997, principalmente por no tener conocimiento de las densidades previas al inicio de la pesquería; por considerar que la densidad actual sigue siendo muy baja en comparación con otras zonas de Venezuela, y por ser animales de fácil captura, rápidamente sobreexplotables y de recuperación lenta.

Influencia de las macrófitas sobre la estructura poblacional de rotíferos y microscrustáceos en un plano de inundación tropical

The influence of macrophytes on rotifer and microcrustacean assemblage in a tropical floodplain. Most studies on zooplankton ecology have been conducted in open waters. However, it has been considered of great importance to extend such studies to other habitats, such as those generated of macrophytes. We studied the spatial and temporal variation of the microcrustacean and rotifer assemblage structures associated with macrophytes, and compare them with the variation exhibited in open waters. Integrated samples were collected for zooplankton and phytoplankton biomass using a Schindler bottle, in four open water sites and four other sites covered by macrophytes in the floodplain complex of Ayapel (Córdoba, Colombia) during different limnimetric levels. The significant differences in the structure were evaluated using Kruskal & Wallis and discriminant analyses, and the similarity among sampling sites was evaluated using Bray & Curtis analysis. Zooplanktonic richness was favored by macrophytes. However, we did not find a constant spatial pattern for density, and only particular trends apparently conditionated by flood pulses. The presence of Eichhornia azurea (Pontederiaceae) contributed in a significant way with an increase in the diversity and density of benthic taxa. The density of some zooplanktonic groups was related with environmental conditions and phytoplanktonic biomass. Rev. Biol. Trop. 59 (2): 853-870. Epub 2011 June 01.

La mayoría de estudios ecológicos del zooplancton se han realizado en aguas abiertas. No obstante, es importante ampliar la exploración hacia hábitats como el de las macrófitas. En este estudio se evaluó la variación espacio-temporal de la estructura del ensamble de rotíferos y microcrustáceos asociados a macrófitas y se comparó con la variación de su estructura en aguas abiertas, para lo cual se tomaron muestras integradas de zooplancton y biomasa de fitoplancton usando una botella Schindler de 5L en cuatro sitios de aguas abiertas y en cuatro sitios cubiertos por macrófitas durante diferentes niveles limnimétricos en el complejo cenagoso de Ayapel (Córdoba, Colombia). Las diferencias significativas de la estructura se evaluaron mediante Kruskal & Wallis y discriminantes; y la similitud entre sitios de muestreo mediante Bray & Curtis. Las macrófitas favorecieron la riqueza zooplanctónica; sin embargo, no hubo un patrón espacial constante en la densidad, pero sí tendencias particulares condicionadas por el pulso de inundación. La presencia de Eichhornia azurea (Pontederiaceae) contribuyó significativamente a la mayor diversidad y densidad de taxones bentónicos y sólo la densidad de algunos taxones y grupos del zooplancton se relacionó con las condiciones ambientales y la biomasa de fitoplancton.

Monitoreo de la ictiofauna usando grupos taxonómicos superiores en el Parque Nacional Cabo Pulmo, México

Ichthyofauna monitoring using higher taxa in Cabo Pulmo National Park, México. The uses of biological indicators allow to save time, resources and staff efforts when monitoring programs are conducted. The reef fishes are among the species with biggest potential as indicators since they are conspicuous, easy to identify in the field and have ecological and economical importance. The objective of this study was to evaluate the usefulness of higher taxa to predict fish ecological indices in Cabo Pulmo reef. We generated multiple stepwise regression equations with species abundance data grouped at genera and family levels as factors, and using ecological indices (H´, J´, Δ*) as dependent variables. To test the efficiency of the models, the expected indexes were compared with those observed in the field during independent test surveys. Results showed that all models were highly significant, and the best fit occurred at genus level to H´, while those used for Δ*, based on family data level, were less precise. The proportion of variables required to apply prediction models of any ecological index never exceeded 41% of the total taxa (genera or families). In conclusion, the use of regression methods to determine higher taxa indicators is adequate and represents a good potential to be used in monitoring programs. In addition, the use of genera and families as indicators provide logistic benefits as training for monitors is less intense and expensive. Finally, the use of expected-observed comparisons to measure the quality of the evaluations can be useful for managers in order to interpret and communicate results of the scientific endeavors to the society, so they in turn can participate and help to improve and facilitate long-term monitoring at Cabo Pulmo National Park. Rev. Biol. Trop. 59 (2): 871-885. Epub 2011 June 01.

El uso de indicadores biológicos es una herramienta útil para la descripción de las comunidades y permite ahorrar recursos en programas de monitoreo. Con el fin de evaluar el potencial bioindicador de grupos taxonómicos superiores en el Parque Nacional Cabo Pulmo, México, se construyeron modelos de regresión múltiple por pasos con valores de abundancia agrupados a nivel género y familia como predictores, mediante el uso de variables dependientes, los índices ecológicos de diversidad (H’), equidad (J’) y distintividad taxonómica (Δ*). Posteriormente se compararon los resultados de los modelos contra los valores de los índices ecológicos observados en un muestreo independiente. Los resultados mostraron que todos los modelos fueron altamente significativos; los valores más altos del coeficiente de determinación se obtuvieron en las regresiones aplicadas a H’, mientras que las usadas por Δ* fueron las menos precisas. Los resultados sugieren que los modelos predictivos aquí generados son susceptibles de ser aplicados en un programa de monitoreo. Este estudio sugiere la implementación de un programa de monitoreo a largo plazo basado en bioindicadores de la estructura comunitaria de peces en el Parque Nacional Cabo Pulmo, el cual combine la precisión con la facilidad de obtención de datos.

**Population parameters of the Pacific flagfin mojarra Eucinostomus currani (Perciformes: Gerreidae) captured by shrimp trawling fishery in the Gulf of California**

Shrimp trawling fishery in the Gulf of California captures a wide variety of non-target species of fish, crustaceans, and mollusks that are relatively unknown. The Pacific flagfin mojarra Eucinostomus currani is a frequently found species in these catches, nevertheless, nothing is currently known about its population dynamics. To contribute to the knowledge on this fish species, we studied the size structure, growth, mortality, and the recruitment pattern during the 2004-2005 seasons. A total of 6 078 mojarra were captured from 350 samples, with minimum and maximum lengths of 4.5cm and a maximum of 21.0cm. The average total length of the four major cohorts was 11.4, 13.7, 15.6 and 18.0cm, corresponding to ages 0.9, 1.2, 1.6 and 2.2 years, respectively, being the most abundant the 1.2 year-old group. The instant growth coefficient indicated moderate growth rates (K S=0.81/year, K E=0.85/year), corresponding to individuals living between 3.5 to 3.7 years. The estimated asymptotic lengths was L∞=21.8cm. In general, the population could be considered healthy: natural mortality (M=1.53/year); total mortality (Z=2.73 /year); condition factor (K=0.01072); fishery mortality (F=1.2/ year) and exploitation rate (E=0.43/year). The maximum reproduction period almost coincided with the closed season for shrimp fishing (March to August), thus we concluded that survival of the species is ensured because reproduction is indirectly protected. Rev. Biol. Trop. 59 (2): 887-897. Epub 2011 June 01.

La pesquería de camarón del Golfo de California captura una amplia variedad de especies incidentales, relativamente no conocidas que incluye peces, crustáceos y moluscos. La mojarra bandera del Pacífico Eucinostomus currani es frecuentemente encontrada en las capturas del camarón y no hay información sobre su dinámica poblacional. La estructura de tallas, crecimiento, mortalidad y patrón de reclutamiento fueron determinados durante la temporada 2004-2005. De manera que se recolectaron 6 078 organismos de esta especie en 350 muestras, las tallas mínima y máxima fueron 4.5cm y 21.0cm. La talla media de las cuatro cohortes presentes fueron 11.4, 13.7, 15.6 y 18.0cm, correspondiendo a edades de 0.9, 1.2, 1.6 y 2.2 años. El coeficiente instantáneo de crecimiento indica un crecimiento moderado (KS=0.81/año, KE=0.85/año), con una longevidad de 3.5 años. La longitud asintótica estimada fue L∞=21.8cm. En general, la población se mostró saludable, con una mortalidad natural (M=1.53/año); factor de condición (K=0.01072); mortalidad total (Z=2.73 /año); mortalidad por pesca (F=1.2/año) y tasa de explotación (E=0.43/año). El periodo de máxima reproducción coincide con la temporada de veda de la pesca de camarón (marzo a agosto). Concluimos que la sobrevivencia de la especie se encuentra indirectamente protegida.

Air pollution in a tropical city: the relationship between wind direction and lichen bio-indicators in San José, Costa Rica

Lichens are good bio-indicators of air pollution, but in most tropical countries there are few studies on the subject; however, in the city of San José, Costa Rica, the relationship between air pollution and lichens has been studied for decades. In this article we evaluate the hypothesis that air pollution is lower where the wind enters the urban area (Northeast) and higher where it exits San José (Southwest). We identified the urban parks with a minimum area of approximately 5 000m² and randomly selected a sample of 40 parks located along the passage of wind through the city. To measure lichen coverage, we applied a previously validated 10 x 20cm template with 50 random points to five trees per park (1.5m above ground, to the side with most lichens). Our results (years 2008 and 2009) fully agree with the generally accepted view that lichens reflect air pollution carried by circulating air masses. The practical implication is that the air enters the city relatively clean by the semi-rural and economically middle class area of Coronado, and leaves through the developed neighborhoods of Escazú and Santa Ana with a significant amount of pollutants. In the dry season, the live lichen coverage of this tropical city was lower than in the May to December rainy season, a pattern that contrasts with temperate habitats; but regardless of the season, pollution follows the pattern of wind movement through the city. Rev.Biol. Trop. 59 (2): 899-905. Epub 2011 June 01.

Los líquenes constituyen un buen bioindicador para estudiar la “salud de la atmósfera”, pero en los países tropicales hay pocos estudios sobre el tema, aunque para la ciudad de San José existen algunos estudios sobre la relación entre tráfico vehicular y contaminación atmosférica. En este artículo evaluamos la hipótesis de que la contaminación atmosférica es menor en las áreas por donde ingresan los vientos a la zona urbana de San José (noreste) y mayor a su salida (suroeste), para las épocas seca y lluviosa. Para obtener parques urbanos con tamaño suficiente para albergar varios árboles con líquenes, se identificaron los parques con un área aproximada mínima de 5 000m². Seleccionamos aleatoriamente una muestra de 40 parques ubicados a lo largo del paso del viento por la ciudad. Para medir el porcentaje de cobertura, en cada parque aplicamos a cinco árboles una plantilla de 10 x 20cm con 50 puntos al azar, a 1.5m sobre el suelo y del lado con mayor cobertura de líquenes. Nuestros resultados coinciden con la opinión generalmente aceptada de que los líquenes reflejan la contaminación transportada por la circulación de masas de aire. La consecuencia práctica es que el aire entra en la ciudad relativamente limpia por el área semi-rural de clase media de Coronado, y llega a los barrios desarrollados de Escazú y Santa Ana con una cantidad importante de contaminantes. En la época seca la cobertura de líquenes vivos fue menor que en la estación lluviosa (que va de mayo a diciembre), pero independientemente de la época, la contaminación sigue el patrón de viento de la ciudad.

**Abundancia relativa y uso de microhábitat de la rana Geobatrachus walkeri (Anura: Strabomantidae) en dos hábitats en Sierra Nevada de Santa Marta, Colombia**

Relative abundance and microhabitat use by the frog Geobatrachus walkeri (Anura:Strabomantidae) in two habitats of Sierra Nevada de Santa Marta, Colombia. Geobatrachus walkeri belongs to a monotypic frog genus endemic to the San Lorenzo area, Sierra Nevada de Santa Marta, Colombia. This species has been categorized as endangered because of its small distribution area and the decline in the extent and quality of its habitat. It inhabits two forest types with different composition and structure, the native secondary forest and a pine plantation (dominated by Pinus patula). To compare the relative abundance and microhabitat use of this species in these habitat types, 30 quadrants/environment were distributed randomly. The individual number, microhabitat use and other aspects of its natural history were registered using visual encounter surveys in both sites, including non-sampled areas in the quadrants. The relative abundance of frogs was significantly different between habitats and among seasons. The highest abundance of G. walkeri relative to the total area was found in the pine plantation, being 2.3 times higher than in the natural forest. More frogs were significantly found during the rainy season; nevertheless, active individuals were also found during the dry season. Significant differences were found in the microhabitat use with respect to the forest type and season. The most frequently microhabitat used in the two forest types was the pine leaf-litter; besides, in the native forest, the microhabitat occupied more frequently presented medium and large size stones. Geobatrachus walkeri is a successful species in pine plantations, associated permanently to its leaf-litter environment where it seems to develop its entire life cycle. The clear modifications in the soils and water, derived from the introduction of the pine plantation in this area, seem not to have negatively affected the conservation and successful maintenance of this species. Rev. Biol. Trop. 59 (2): 907-920. Epub 2011 June 01.

La rana Geobatrachus walkeri pertenece a un género monotípico y endémico del área de San Lorenzo, Sierra Nevada de Santa Marta, Colombia. La especie habita en el bosque secundario natural y en una plantación de pino (dominada por Pinus patula). Para comparar la abundancia relativa y el uso del microhábitat en estos dos hábitat y durante los períodos de máxima y mínima precipitación, se distribuyeron aleatoriamente 30 cuadrantes en cada bosque sobre los que se registraron el número de individuos y los microhábitats ocupados. Además se reconocieron otros aspectos de la historia natural mediante muestreo por encuentros casuales (VES), se incluye en los dos hábitats áreas no muestreadas por los cuadrantes. La mayor abundancia de ranas se obtuvo en la plantación de pino y durante la época de lluvias. El microhábitat más usado fue la hojarasca de pino. Geobatrachus walkeri es una especie exitosa en las plantaciones de pino, asociada permanentemente a su hojarasca en donde parece desarrollar todo su ciclo de vida. Las claras modificaciones derivadas de la introducción de las plantaciones de pino en el suelo y el agua, parecen no haber afectado la supervivencia y mantenimiento exitoso de esta especie categorizada como en peligro de extinción.

**Phenology, seed dispersal and difficulties in natural recruitment of the canopy tree Pachira quinata (Malvaceae)**

Life history and recruitment information of tropical trees in natural populations is scarce even for important commercial species. This study focused on a widely exploited Neotropical canopy species, Pachiraquinata (Malvaceae), at the southernmost, wettest limit of its natural distribution, in the Colombian Amazonia. We studied phenological patterns, seed production and natural densities; assessed the importance of seed dispersal and density-dependent effects on recruitment, using field experiments. At this seasonal forest P. quinata was overrepresented by large adult trees and had very low recruitment caused by the combination of low fruit production, high seed predation and very high seedling mortality under continuous canopies mostly due to damping off pathogens. There was no evidence of negative distance or density effects on recruitment, but a clear requirement of canopy gaps for seedling survival and growth, where pathogen incidence was drastically reduced. In spite of the strong dependence on light for survival of seedlings, seeds germinated readily in the dark. At the study site, the population of P. quinata appeared to be declining, likely because recruitment depended on the rare combination of large gap formation with the presence of reproductive trees nearby. The recruitment biology of this species makes it very vulnerable to any type of logging in natural populations. Rev. Biol. Trop. 59 (2): 921-933. Epub 2011 June 01

Información acerca de la historia de vida y reclutamiento de poblaciones naturales de árboles tropicales es escasa, incluso para especies de alto interés comercial. Este estudio se centró en una especie de dosel altamente explotada, Pachira quinata (Malvaceae), en la zona más húmeda de su distribución geográfica, en la Amazoní a colombiana. Estudiamos sus patrones fenológicos, producción de semillas y densidades naturales, además de la importancia de la dispersión de semillas y efectos denso-dependientes en el reclutamiento natural, todo lo anterior se logró con el uso de experimentos y observaciones en el campo. En este bosque estacional, la población de P. quinata estaba dominada por grandes árboles adultos y el reclutamiento era extremadamente bajo, como consecuencia de la baja producción de frutos, alta depredación de semillas y muy alta mortalidad de plántulas bajo el bosque por infección de patógenos. No encontramos evidencia de efectos de distancia al árbol parental o densidad de semillas en el reclutamiento, pero si hallamos un evidente requerimiento de claros de luz para la supervivencia y el crecimiento de plántulas, donde la mortalidad por patógenos se reduce drásticamente. Sin embargo, a pesar de la dependencia de la luz para la supervivencia, las semillas germinan en la oscuridad. En la zona de estudio, la población de P. quinata parece estar en claro declive, probablemente porque el reclutamiento depende de la coincidencia de la formación de grandes claros con la presencia cercana de árboles reproductivos. Los requerimientos de reclutamiento de esta especie la hacen muy vulnerable a cualquier actividad extractiva de árboles adultos en poblaciones naturales.

Diversidad alfa y beta de la comunidad de reptiles en el complejo cenagoso de Zapatosa, Colombia

Alfa and beta diversity of reptilian assemblages in Zapatosa wetland complex, Colombia. Diversity is a property of community that can described, characterized, and understood according to the functioning of ecosystems. To study the richness and local abundance and species replacement between habitats around the Zapatosa’s wetland complex (El Cesar Department), I carried out four field trips between November of 2006 and October of 2007. A total of 640 sampling hours/man analyzed five habitat types chasmophyte forest, dry forest, riparian forest, palm-grove and tree-lined savanna; with the exception of the palm-grove sampled at its 75%, the others were sampled up to their 80%. I found 847 reptiles that were distributed in 48 species. The group with the highest number of species was Colubridae with 14, followed by Gekkonidae with five. Five endemic species and eight with some conservation threat grade at a national level a re reported. The riparian forest was the richest and most abundant habitat with 34 species and 196 individuals. For each habitat, Colubridae had the highest number of species, followed by the families Polychrotidae, Gekkonidae and Teiidae, in that order. The reptile species composition was not different between the tree-lined savanna and the chasmophyte forest, but differed among the tree-lined savanna and the riparian forest, palm-grove and dry forest habitats. The most important differences in the species composition among almost all the habitats were influenced by the species Anolis tropidogaster and Gonatodes albogularis, and the higher occurrence of Stenocercus erythrogaster in the chasmophyte forest. The species replacement had an average value of 50%; the biggest amounts of shared species were the lizards, while the snake Leptodeira septentrionalis was the only one present in all habitat types. The forest grows-among-rocks showed the biggest complementarity and number of unique species compared to the other habitats. The wetland complex provides two thirds of the reptile´s species reported until now for the Caribbean region, and more than 80% of those reported for the El Cesar department. This wetland complex seems to behave as a center for low land species concentration as it hosts a high proportion of species from those places. Rev. Biol. Trop. 59 (2): 935-968. Epub 2011

La diversidad es una propiedad de las comunidades, permite describir, caracterizar y entender el funcionamiento de los ecosistemas. Para estudiar la riqueza, abundancia y el recambio de especies de reptiles entre hábitats circundantes al complejo cenagoso de Zapatosa, se realizaron cuatro salidas de campo (noviembre de 2006 y octubre de 2007). Se invirtieron 640h/hombre de muestreo repartido en cinco tipos de hábitat: bosque casmófito, bosque seco, bosque de ribera, palmar y sabana arbolada. Se encontraron 847 individuos de 48 especies, la familia más rica fue Colubridae, se registraron cinco especies endémicas y ocho con algún grado de amenaza en conservación a nivel nacional. El hábitat más diverso fue el bosque de ribera. La representatividad del muestreo en total y para cada hábitat fue superior al 80%, con excepción del palmar (<75%). La composición de especies fue diferente entre la sabana arbolada y los hábitats bosque de ribera, palmar y bosque seco. El recambio promedio de especies fue del 50%. El bosque casmófito mostró la mayor complementariedad y número de especies únicas. El complejo cenagoso presentó 2/3 de los reptiles registrados hasta hoy para la región Caribe y más del 80% de los encontrados para el departamento del Cesar.

Traffic noise affects forest bird species in a protected tropical forest

The construction of roads near protected forest areas alters ecosystem function by creating habitat fragmentation and through several direct and indirect negative effects such as increased pollution, animal mortality through collisions, disturbance caused by excessive noise and wind turbulence. Noise in particular may have strong negative effects on animal groups such as frogs and birds, that rely on sound for communication as it can negatively interfere with vocalizations used for territorial defense or courtship. Thus, birds are expected to be less abundant close to the road where noise levels are high. In this study, we examined the effects of road traffic noise levels on forest bird species in a protected tropical forest in Costa Rica. Data collection was conducted in a forest segment of the Carara National Park adjacent to the Coastal Highway. We carried out 120 ten minute bird surveys and measured road noise levels 192 times from the 19th to the 23rd of April and from the 21st to the 28th of November, 2008. To maximize bird detection for the species richness estimates we operated six 12m standard mist nets simultaneously with the surveys. The overall mist-netting effort was 240net/h. In addition, we estimated traffic volumes by tallying the number of vehicles passing by the edge of the park using 24 one hour counts throughout the study. We found that the relative abundance of birds and bird species richness decreased significantly with the increasing traffic noise in the dry and wet season. Noise decreased significantly and in a logarithmic way with distance from the road in both seasons. However, noise levels at any given distance were significantly higher in the dry compared to the wet season. Our results suggest that noise might be an important factor influencing road bird avoidance as measured by species richness and relative abundance. Since the protected forest in question is located in a national park subjected to tourist visitation, these results have conservation as well as management implications. A decrease in bird species richness and bird abundance due to intrusive road noise could negatively affect the use of trails by visitors. Alternatives for noise attenuation in the affected forest area include the enforcement of speed limits and the planting of live barriers. Rev. Biol. Trop. 59 (2): 969-980. Epub 2011 June 01.

Las carreteras cerca de bosques alteran la función del ecosistema por fragmentación del hábitat y tienen otros efectos negativos como contaminación, mortalidad de animales y ruido excesivo; sobre todo en animales como ranas y aves que dependen del sonido para comunicarse. Se espera menos abundancia de aves cerca de la carretera donde el ruido es alto. Este estudio evalúa los efectos del ruido por carretera sobre las aves en un bosque tropical de Costa Rica. También realizamos censos de aves y medimos el ruido del 19 al 23 de abril y del 21 al 28 de noviembre 2008. Además, utilizamos redes de niebla para maximizar la detección de aves en la estimación de riqueza de especies. La abundancia de aves así como la riqueza de especies decrecieron significativamente con el incremento del ruido tanto en la estación seca como en la lluviosa. El ruido disminuyó en forma logarítmica con el aumento en la distancia a la carretera y fue más alto durante la estación seca. Nuestros resultados sugieren que las aves tienden generalmente a evitar el ruido del tráfico y tienen implicaciones en la conservación y manejo del área protegida