Revista de Biología Tropical

Common polymorphisms and cardiovascular factors in patients with myocardial infarction of Costa Rica

Eight common polymorphisms of known myocardial infarction (MI)risk factors (factor V Leiden (FVL), factor V HR2 (FVHR2),factor II 20210G>A (FII),factor VII IVS7 (FVII IVS7),factor VII Arg353Gln (FVII), factor XIII Val34Leu (FXIII),Methylenetetrahydrofolate reductase C677T (MTHFR), Angiotensin Converting Enzyme (ACE))and environmental risk factors were analyzed in a MI patients of Costa Rica.This case-control study included 186 MI subjects,95 of them <45 years and 201 age and sex matched controls.With the use of PCR method the polymorphisms were detected and through interviews additional information was collected.Hypercholesterolemia and smoking were associated with a significant risk in younger patients.High fibrinogen level was an important risk factor and interaction with smoking was detected.Mainly,the genotype 34LeuLeu of FXIII showed significant protective effect,(OR 0.32,95%CI 0.13-0.80)while the other polymorphisms showed no significant difference between the cases and the controls.Carriers of FVII (OR 2.75,95%CI 1.07-7.02)and FXIII (OR 4.20,95%CI 2.03-8.67)polymorphisms showed interaction with fibrinogen in the sta- tistical analysis.It was concluded that there was an important interaction between the common risk factors and the polymorphisms (FVII;FXIII)in the development of MI.This is one of the first reports in a Latin-American population dealing with these molecular markers and MI.Rev.Biol.Trop.54(1):1-11.Epub 2006 Mar 31.

Se estudiaron ocho polimorfismos comunes asociados como factores de riesgo para el infarto al miocardio (IM):factor V Leiden (FVL),factor VHR2 (FVHR2), factor II 20210G>A (FII),factor VII IVS7 (FVII IVS7), factor VIIArg353Gln (FVII),factor XIIIVal34Leu (FXIII), metilentetrahidrofolato reductase C677T (MTHFR), enzima convertidora de la angiotensina (ACE) y factores ambientales de riesgo,en pacientes costarricenses.Este es un estudio de casos y controles,donde participan 186 pacientes,95 de ellos con edades <45 años y 201 sujetos controles.Se utilizó la técnica de reacción en cadena de la polimerasa (PCR)y por medio de entrevistas personales se recolectó información epidemiológica adicional.Se encontró que la hipercolesterolemia y el fumado estan asociados como factores de riesgo en los pacientes jóvenes.Niveles elevados del fibrinógeno fueron detectados como un factor de riesgo importante y se observo interacción entre fumado y estos valores aumentados de fibrinógeno. El genotipo 34LeuLeu del FXIII presentó un efecto protector significante mientras que los otros polimorfimos estudiados no mostraron diferencia estadísticamente significativa entre los casos y controles. Los polimorfismos del FVII y FXIII demostraron interación con el fibrinógeno,según el análisis estadístico aplicado. Se evidencia, la interación entre factores de riesgo común y ciertos polimorfismos (FVII;FXIII)en la patogénesis del IM.Este es uno de los primeros informes sobre estos marcadores moleculares y su asociación con IM en una población latinoamericana.

Characterization of a Bacillus thuringiensis strain collection isolated from diverse Costa Rican natural ecosystems

Costa Rican natural ecosystems are among the most diverse in the world. For this reason, we isolated strains of the entomopathogenic bacteria Bacillus thuringiensis (Bt ) to determine their diversity, distribution and abundance. A total of 146 Bt strains were obtained from environmental samples collected from diverse natural ecosystems and life zones of Costa Rica. We recovered Bt strains from 71%, 63%, 61% and 54% of soil samples, fresh leaves, other substrates and leaf litter respectively. Bt was isolated in 65%of the samples collected in the humid tropical forest in national parks (Braulio Carrillo, Gandoca Manzanillo, Sierpe, Hitoy Cerere, and Cahuita), and in 59% of the samples collected in the dry tropical forest (Parque Nacional Marino las Baulas, Palo Verde and Santa Rosa). In the very humid tropical forest (Tortuguero) Bt was isolated in 75% of the samples and in the very humid tropical forest transition perhumid (Carara)it was found in 69% of the samples. The strains exhibit a diverse number, size and morphology of parasporal inclusion bodies: irregular (47%),oval (20%), bipyramidal (3%), bipyramidal and cubic (1%), bipyramidal, oval and irregular (5%) and bipyramidal, oval and cubic crystals (2%). Strains isolated from Braulio Carrillo, Tortuguero and Cahuita, presented predominantly irregular crystals. On the other hand, more than 60% of the isolates from Térraba-Sierpe and Hitoy-Cerere had medium oval crystals. Strains from Gandoca-Manzanillo, Palo Verde and Carara presented mainly combinations of oval and irregular crystals. Nevertheless, the greatest diversity in crystal morphology was observed in those from Santa Rosa, Llanos del Río Medio Queso and Parque Marino las Baulas. Protein analyses of the crystal-spore preparations showed ä -endotoxin with diverse electrophoretic patterns, with molecular weights in the range of 20 to 160 kDa. Fifty six percent of the strains amplified with the cry2 primer, 54% with vip3, 20% with cry1, 9% with cry3-cry7 and 8% with cry8. The cry 11 and cyt genes were found in 8% and 7% of the strains, respectively. When analyzed with specific primers for the cry1 subfamily, 13 different genetic profiles were obtained. In addition, twenty-four strains did not amplify with any of the primers used, suggesting they contain novel cry genes. The diversity of Bt genes found in this collection indicates it could have great potential for the control of different species of insect pests. The toxicological characterization of the strains by bioassays against important insect pests will provide useful information about their potential use for the formulation of biological insecticides and their respective cry and vip genes for the transformation of crops to confer resistance to insects. Rev. Biol. Trop. 54(1):13-27.Epub 2006 Mar 31.

Como los ecosistemas naturales de Costa Rica figuran entre los más diversos del mundo, se propuso aislar la bacteria entomopatógena Bacillus thuringiensis (Bt ) con el fin de conformar una colección de cepas y caracterizarlas molecularmente. Se obtuvieron 146 cepas a partir de muestras ambientales de diversas áreas protegidas, que incluían 9 de las 12 zonas de vida de Costa Rica. Se recobraron cepas del 71%, 63%, 61%y 54% de las muestras de suelo, hojas frescas, otros sustratos y hojarasca respectivamente. Se aisló Bt del 65% de las muestras del bosque tropical húmedo, un 59% de las muestras del bosque tropical seco. Del bosque tropical muy húmedo se aisló Bt del 75% de las muestras y finalmente del bosque tropical muy húmedo transición perhúmedo se encontró en el 69% de las muestras. Las cepas se caracterizaron según la morfología de los cuerpos paraesporales de inclusión, el peso molecular de las ä -endotoxinas y de genes cry,cyt y vip que contenían. Las cepas exhibieron cristales de diferente morfología, tamaño y número: irregulares, ovales, bipiramidales, cúbicos o mezclas de uno u otro. No se encontró correlación al comparar la forma de los cristales con el sitio de origen de la cepa. El análisis proteico de las mezclas de esporas y cristales mostró que las cepas contenían ä -endotoxinas de 20 a 160 kDa.El 66 por ciento de las cepas amplificaron con los imprimadores específicos para el gen cry2,54% con vip3, 20% con el cry1, 9% con el cry3-cry7 y 8% con el gen cry8. Los genes cry11 y cyt se encontraron en el 8%y 7% de las cepas respectivamente. Veinticuato cepas no amplificaron con los imprimadores utilizados por lo que podrían contener genes novedosos. Las cepas que contenían el gen cry1 se amplificaron posteriormente con imprimadores específicos para la subfamilia de dicho gen, obteniéndose 13 perfiles diferentes. En síntesis, la diversidad genética de las cepas sugiere que la colección tiene un gran potencial para el control de diferentes especies de insectos de importancia económica en la agricultura y en salud pública. El análisis toxicológico de las cepas mediante bioensayos con insectos plaga proveerá información muy útil acerca del uso potencial de estas cepas para la formulación de bioinsecticida. Asimismo, lo genes cry y vip podrían utilizarse para, mediante ingeniería genética, conferir resistencia a los cultivos.

Genes that encode botulism neurotoxins A,B,E and F in Neotropical bee honey identified with the Polymerase Chain Reaction

Honey can be used for the treatment of wounds, sores and skin burns, but it might be contaminated with Clostridium botulinum spores. In order to evaluate Costa Rican raw honey samples, the detection of neurotoxin gene sequences (corresponding to the bacterium) C. botulinum A, B, E and F was done with the polymerase chain reaction. A total of 64 raw honey samples, coming from different Costa Rican sites were analyzed. Reference C. botulinum strains type A (ATCC 19397), type B (ATCC 7949), type E (ATCC 17786) and type F (ATCC 25764) were used as templates for testing the effectivity of the method. The process consisted in culturing the honey samples in prereduced triptose-peptone-glucose-yeast extract media (TGPY)for 5 days. After this, the bacteria lysate obtained was used for PCR. The amplicons,product of the reaction, were visualized using agarose gel 2%. From the 64 honey samples analyzed, none produced positive results in the PCR, since no amplicons were obtained. Even though, all the reference C. botulinum strains used as controls were visualized and showed the effectivity of the extraction method and of the PCR used. The results obtained show promising therapeutic uses for honey from Costa Rica, but further evaluations shall be done in order to be sure of the safety of the product. Rev. Biol. Trop. 54(1): 29-34. Epub 2006 Mar 31.

La miel de abeja es un producto que podría ser utilizado en el tratamiento de heridas, abrasiones y quemaduras de piel; no obstante, podría estar contaminada con esporas de C. botulinum. Con el fin de evaluar muestras de miel de origen costarricense, se detectó las secuencias de genes productores de neurotoxina correspondientes a C. botulinum tipos A, B, E y F utilizando la técnica de PCR (reacción de polimerasa en cadena). 64 diferentes muestras de miel, provenientes de diversos sitios costarricenses, fueron analizadas. Con el fin de evaluar la efectividad del método, se utilizó cepas de referencia tipos A (ATCC 19397), B (ATCC 7949),E (ATCC 17786)y F (ATCC 25764). El procedimiento consistió en cultivar las muestras de miel en caldo triptona peptona glucosa levadura prerreducido, por cinco días. Luego de esto, se obtuvo un lisado bacteriano, el cual fue utilizado para la técnica de PCR. Los amplicones producto de la reacción fueron visualizados utilizando geles de azarosa al 2%.De las 64 muestras de miel analizadas, ninguna produjo resultados positivos en el PCR. No obstante, todas las cepas de referencia usadas como controles produjeron bandas, que demuestran la efectividad del método de extracción utilizado y de la técnica en sí. Los resultados obtenidos demuestran la ausencia de contaminación por C.botulinum de la miel de abeja de origen costarricense, no obstante,deben realizarse evaluaciones adicionales para garantizar la seguridad del producto.

Caraterización citogenética del pez tropical de agua dulce Parachromis managuensis (Pisces:Cichlidae)

Citogenetic characterization of the tropical freshwater fish Parachromis managuensis (Pisces: Cichlidae). To describe the cytogenetics of the jaguar cichlid fish Parachromis managuensis, we collected eight males and 13 females in Villahermosa, Tabasco, México. The specimens were processed with standard cytogenetic techniques (slightly modified), and high quality fields of chromosomes in mitosis and meiosis were obtained; 14 of these fields were analyzed by meristics and statistics methods. The specimens presented a diploid modal number of 2n=48 chromosomes, which is similar to the number reported for others Central American cichlids; five pairs were submetacentric-metacentrics(biarmed)and 19 were subtelocentric-telocentric (uni-armed),giving a fundamental number (NF)of 58.The haploid number was confirmed by counting meiotic fields in metaphase I. There was not evidence of heteromorphism: sexual chromosomes were not identifiable. Rev. Biol. Trop. 54 (1): 35-42. Epub 2006 Mar 31.

Para contribuir con el ordenamiento de las especies de la familia Cichlidae, se realizó el estudio citogenético de la mojarra pinta Parachromis managuensis. Fueron utilizados veintiún organismos, ocho machos y trece hembras,colectados en Villahermosa, Tabasco, México. Los especímenes se procesaron por técnicas citogenéticas convencionales (con ligeras modificaciones). Se obtuvieron campos mitóticos y meióticos de buena calidad, de los que fueron seleccionados catorce cariotipos para ser analizados merística y estadísticamente. Los especímenes presentaron número modal diploide de 2n=48 cromosomas, similar al reportado para otros cíclidos neotropicales. Cinco pares fueron cromosomas metacéntricos-submetacéntricos (birrámeos) y 19 pares cromosomas subtelocéntricos-telocéntricos (monorrámeos),con número fundamental (NF) de 58 brazos.El número haploide se ratificó por conteo de campos meióticos en metafase I. Los campos mitóticos observados y los cariotipos de machos y hembras no presentaron evidencias heteromórficas para identificar cromosomas sexuales.

Flora bacteriana cloacal y nasal de Lepidochelys olivacea (Testudines: Cheloniidae) en el pacífico norte de Costa Rica

Cloacal and nasal bacterial flora of Lepidochelys olivacea (Testudines: Cheloniidae) from the North Pacific coast of Costa Rica.The aerobic cloacal and nasal bacterial flora of 45 apparently healthy female olive ridley sea turtles (Lepidochelys olivacea )was studied at Nancite nesting beach,in Santa Rosa National Park (Costa Rican North Pacific)during July and August 2002.Bacterial samples were obtained by inserting sterile swabs directly into the cloaca and the nasal cavities of the turtles.Ninety-nine aerobic bacterial isolates, including 10 Gram-negative and 5 Gram-positive bacteria, were recovered.The most common bacteria cultured were Aeromonas spp. (13/45) and Citrobacter freundi (6/45)from cloacal samples and Bacillus spp.(32/45), Staphylococcus aureus (6/45)and Corynebacterium spp.(5/45)from nasal ducts.The results of the present study showed that the aerobic bacterial flora of nesting female olive ridleys was composed of several potential human and animal microbe pathogens.Rev.Biol.Trop.54(1):43-48.Epub 2006 Mar 31.

Con el objetivo de determinar la flora normal aerobia, cloacal y nasal de la tortuga lora (Lepidochelys olivacea ), entre los meses de julio y agosto del 2002,se colectaron muestras bacteriológicas de 45 quelonios aparentemente sanos,durante el desove en Playa Nancite,Parque Nacional Santa Rosa, Costa Rica, a través del uso de hisopos estériles que se introdujeron en la cloaca y en uno de los conductos nasales. De las muestras recolectadas se obtuvieron e identificaron un total de 99 aislamientos, incluyendo 10 grupos de Gram-negativos y 5 de Gram-positivos. De cada tortuga se obtuvo un promedio de 0.7 bacterias de la cloaca y 1.4 de las cavidades nasales. Las bacterias más frecuente halladas fueron Aeromonas spp.(13/45) y Citrobacter freundi (6/45) en la cloaca, y Bacillus spp. (32/45),Staphylococcus aureus (6/45)y Corynebacterium spp.(5/45)en las cavidades nasales. En este investigación, la flora microbiana de las tortugas lora resultó constituida por microorganismos potencialmente patógenos para el ser humano y las tortugas.

Distribution of bacteria and fungi in the earthworm Libyodrillus violaceous (Annelida: Oligochaeta), a native earthworm from Nigeria

Earthworms are soil invertebrates that play a key role in recycling organic matter in soils.In Nigeria, earthworms include Libyodrillus violaceous. Aerobic and anaerobic bacterial counts, as well as fungal counts of viable microorganisms in soils and gut sections, were made on twenty L. violaceous collected from different sites on the campus of the University of Agriculture, Abeokuta, Nigeria. The samples were collected between April and November, 2002. Numbers of microorganisms were higher in castings and gut sections than in uningested soil samples. The guts and their contents also had higher moisture and total nitrogen contents than the uningested soils. Bacteria and fungi isolated from the samples were identified by standard microbiological procedures on the bases of their morphological and biochemical characteristics. Isolated bacteria were identified as Staphylococcus, Bacillus spp., Pseudomonas aeruginosa, Streptococcus mutans, Clostridium, Spirocheata spp., Azotobacter spp., Micrococcus lylae, Acinetobacter spp., Halobacterium for bacteria. Yeast isolates were identified as Candida spp., Zygosaccharomyces spp., Pichia spp., and Saccharomyces spp while molds were identified as, Aspergillus spp., Pytium spp., Penicillium spp., Fusarium spp and Rhizopus spp. Of the five locations examined, the refuse dump area had the highest numbers of both aerobic and anaerobic organisms, followed by the arboretum while the cultivated land area recorded the lowest counts. The higher numbers of microorganisms observed in the gut sections and casts of the earthworms examined in this work reinforce the general concept that the gut and casts of earthworms show higher microbial diversity and activity than the surrounding soil. Rev. Biol. Trop. 54 (1): 49-58. Epub 2006 Mar 31.

Microbial degradation of palm (Elaeis guineensis )biodiesel

The kinetics of biodegradation of palm-derived fatty methyl and ethyl esters (Elaeis guineensis biodiesel) by a wild-type aerobic bacterial population was measured at 20 °C, as the rate of oxygen uptake by a manometric technique. The methyl and ethyl biodiesels were obtained by potassium-hydroxide catalysed transesterification of palm oil, respectively. The bacterial flora included the genera Bacillus, Proteus, Pseudomonas, Citrobacter and Enterobacter. The rate of oxygen uptake for palm biodiesel is similar to the quantity observed in the biodegradation of 1.0 mM solutions of simple substrates such as carbohydrates or amino acids.Palm methyl or ethyl biodiesel is subjected to facile aerobic biodegradation by wild-type bacteria commonly present in natural open environments. This result should lessen any environmental concern for its use as alternative fuel, solvent or lubricant. Rev. Biol. Trop. 54(1): 59-63.Epub 2006 Mar 31.

La cinética de la biodegradación de los ésteres metílicos y etílicos derivados de palma (biodiesel) por una población silvestre de bacterias aeróbicas fue medida a 20 °C, como medición manométrica del consumo de oxígeno. Los ésteres metílicos y etílicos se obtuvieron por transesterificación del aceite de palma con metanol y etanol,respectivamente. La flora bacteriana incluyó a los géneros Bacillus, Proteus, Pseudomonas, Citrobacter y Enterobacter. Las velocidades de consumo de oxígeno para las muestras de biodiesel fueron similares a lo observado en la biodegradación de disoluciones 1.0 mM de sustratos sencillos solubles en agua, tales como carbohidratos, aminoácidos y albúmina de huevo.

Establishment of Desmoncus orthacanthos Martius (Arecaceae): effect of inoculation with arbuscular mycorrhizae

Inoculation with arbuscular mycorrhizal (AM) fungi has often promoted increased growth of plants but very little work has been done in the tropics to evaluate the effects of inoculation on the establishment and development of seedlings in forests. Desmoncus orthacanthos Martius is a scandent palm present both in early and late succession, and consequently can be used in restoration processes. A test was conducted to determine the effect of AM on the establishment of Desmoncus orthacanthos in tropical forest in the Yucatan Peninsula, Mexico. Thirty inoculated and 30 non-inoculated seedlings were introduced in two sites of different successional age, a mature forest and an eight-year old abandoned cornfield (acahual).Survival and growth parameters were evaluated after 12 months. Leaf area and phosphorus, but not height, were greater in inoculated than non-inoculated plants in the forest but not in the acahual. However, mycorrhizae had a clear effect on plant survival in both sites, with a threefold increase in survival of inoculated compared with non-inoculated plants bassed on an odds ratio. The results suggest that inoculation will be important to increase the establishment of this commercially important palm. Rev. Biol. Trop. 54(1): 65-72. Epub 2006 Mar 31.

La inoculación con hongos micorrizógenos arbusculares (AM)promueve un incremento en el crecimiento de las plantas, sin embargo poco trabajo se ha realizado en los trópicos para evaluar el efecto de la inoculación en el proceso de establecimiento de plántulas. Desmoncus orthacanthos Martius es una palmera trepadora que se distribuye tanto en etapas tempranas y tardías de la sucesión, por lo tanto puede ser empleada en procesos de restauración. Se realizó una prueba de establecimiento de D. orthacanthos en una selva tropical de la península de Yucatán, México. Treinta plántulas inoculadas y 30 no inoculadas se establecieron en dos sitios con diferentes etapas sucesionales: selva madura y un campo abandonado de maíz (acahual). Después de 12 meses el valor de área foliar y contenido de fósforo fue mayor en el tratamiento con micorrizas en la selva pero no en el acahual, sin embargo, el tratamiento con micorrizas mostró un claro efecto en la supervivencia de las palmeras en ambos sitios con un incremento tres veces mayor en la probabilidad de supervivencia de palmeras inoculadas comparadas con las no inoculadas de acuerdo al análisis de razón de disparidad (odds ratio). La inoculación podría ser importante para incrementar el establecimiento de esta palmera.

A Comparison of Sap Flow Measurements and Potometry in Two Tropical Lowland Tree Species with Contrasting Wood Properties

We evaluated the performance of the Heat Dissipation Technique (HDT) to measure sap flow in whole trees by comparison with potometric water uptake. Two tropical lowland species, Ochroma lagopus (balsa), a pioneer species with light wood and Hyeronima alchorneoides (pilón), a late-successional species with hard wood were examined. Diurnal courses of sap flow measured with the HDT showed good agreement with potometry. At the low sap flow rates (below 1 Kg h-1) occurring during nocturnal recharge HDT consistently underestimated sap flow rates. This resulted in the failure of the current version of the HDT to measure nocturnal water uptake, an important component of the water budget of at least one of the two species examined. Rev. Biol. Trop. 54(1): 73-81. Epub 2006 Mar 31.

El alga marina Sargassum (Sargassaceae): una alternativa tropical para la alimentación de ganado caprino

The seaweed Sargassum (Sargassaceae) as tropical alternative for goats feeding. The nutritive value of seaweed (Sargassum spp.) was studied in Baja California Sur, Mexico. Twenty female Nubian goats (43-weeks old) were randomly distributed into two groups of 10 goats each and were housed in individual pens. One group was fed with a control diet and the other with a diet supplemented with 25% of Sargassum spp. Feed and water intake were recorded daily and individually for 60 days. The weight of each goat was recorded every 15 days. The nutritional content of Sargassum spp. was 89% dry mater, 8% crude protein, 31% ash, 2% ether extract, and 39% carbohydrates. Fiber fractions, minerals, vitamins, fatty acids, and antinutritional factors were also determined. There were no significant differences in body weight (8.6 kg control and 9 kg experimental), feed intake (1.3 kg control and 1.6 kg experimental), and feed conversion rate (11.1 control and 12.6 experimental). Water consumption was greater in the goats that ate the Sargassum diet (5.3 l). From these results,Sargassum spp.can be considered as an alternative feedstuff for goats. Rev. Biol. Trop. 54 (1): 83-92.Epub 2006 Mar 31.

Se estudió el valor nutricional de varias algas del género Sargassum. Veinte cabras hembras (Nubia) en crecimiento (43 semanas)se distribuyeron aleatoriamente en dos grupos de 10 cabras y se alojaron en corraletas individuales. Un grupo fue alimentado con una dieta testigo elaborada con insumos regionales y el otro con una dieta que incluyó el 25% de Sargassum spp. Durante 60 días se midieron diariamente y en forma individual, el alimento y agua consumidos, el peso corporal se cuantificó cada 15 días. La composición química proximal de Sargassum fue de: 89% materia seca, 7.7% proteína, 31% cenizas, 2% extracto etéreo y 39% de carbohidratos. También se determinaron las fracciones de fibra, minerales, vitaminas, ácidos grasos y factores antinutricios. No se encontraron diferencias significativas en el peso corporal (8.6 kg grupo control y 9 kg experimental), alimento consumido (1.31 kg grupo control y 1.6 experimental)y tasa de conversión alimenticia (11.1 grupo control y 12.6 experimental) entre los tratamientos. El consumo de agua fue mayor en el grupo alimentado con la dieta que incluyó Sargassum spp (5.1 l). De los resultados se deduce que las algas marinas de este género pueden ser utilizadas como un forraje alternativo de mediana calidad para el ganado caprino.

Helminth Parasites of Clarias gariepinus (Clariidae) in Lekki Lagoon, Lagos, Nigeria

A total of 360 randomly selected specimens of Clarias gariepinus (Clariidae) recovered from Lekki Lagoon were examined for intestinal helminth parasites. Parasite prevalence and worm burden were low; 17 (4.72%) of the specimens examined were infected with gastrointestinal helminths. The helminth worms recovered include, three cestodes Polyonchobothrium clarias, S tocksia pujehuni and Wenyonia acuminata and a nematode, Paracamallanus cyathopharynx. There was no statistically significant difference in the infection of the male and female Clarias gariepinus; the infection rates in male and female samples were 5.75% and 3.76% respectively. Parasite prevalence was related to the length and weight of the specimens. The fish samples were observed to show negative allometric growth and smaller samples recorded higher helminth infection. Rev.Biol. Trop. 54(1): 93-99. Epub 2006 Mar 31.

Non-colonial coral macro-borers as indicators of coral reef status in the south Pacific of Costa Rica

Coral reef status was surveyed in three south Pacific coral reefs of Costa Rica, one in Caño Island and two in Golfo Dulce, and the density, richness and distribution of non-colonial macro borers (>1 mm)was determined in dead and live coral fragments from these reefs. Based upon traditional indicators of degradation such as high particulate suspended matter and low live coral cover, the reefs at Caño Island are in better condition than those at Golfo Dulce. Reef degradation in Golfo Dulce is mainly due to high loads of terrestrial sediments as a consequence of watersheds deforestation. In this study, 36 coral boring species are reported for the eastern Pacific. At the family level, there is high endemism (10%) and greater affinity with the Indo-Pacific (34%), as compared with the eastern Atlantic and Mediterranean (29%) and western Atlantic and Caribbean (27%). The dominant non-colonial macro boring families at the study reefs are mytilid bivalves, eunicid polychaetes and aspidosiphonid sipunculans, with the bivalves considered the main internal bioeroders due to their greater body size and abundances. The level of mortality of the coral colonies and the general level of reef degradation influenced the composition of non-colonial macro-borers. Diversity and total macro-borer density, especially aspidosiphonid density, is higher in corals with greates dead than live cover. In the healthiest coral colonies (less than 50% of partial mortality), mytilids domination, macro-borer diversity and total density, is higher in Golfo Dulce, where reefs are more degraded. In the most affected coral colonies (more than 50% dead), macro-borers total density, especially aspidosiphonids density, is higher, of the healthiest reef of this study, Platanillo. Bivalve relative abundance increases and sipunculan relative abundance decreases with increasing site degradation. In conclusion bioeroder variables can also be used as reef health indicators. Rev. Biol. Trop. 54 (1): 101-115. Epub 2006 Mar 31.

Se diagnosticó el estado de salud de tres arrecifes del Pacífico sur de Costa Rica, uno en Isla del Caño y dos en Golfo Dulce, y se determinó la densidad, la riqueza y la distribución de los macroperforadores no coloniales (>1 mm) en fragmentos de coral vivos y muertos. Basándose en los indicadores tradicionales de degradación como alta materia particulada en suspensión y baja cobertura de coral, los arrecifes de Isla del Caño están en mejor condición que los de Golfo Dulce. La degradación en Golfo Dulce se debe principalmente a la gran cantidad de sedimentos terrestres generados por la deforestación de las cuencas de los ríos. En total se han reportado 36 especies de macroperforadores de coral, incluyendo este estudio, para el Pacífico oriental. A nivel de familia hay algo de endemismo (10%), y una mayor afinidad con el Indo-Pacífico (34%) que con el Atlántico oriental y el Mediterráneo (29%) y el Atlántico occidental y el Caribe (27%). Las familias de macroperforadores no coloniales más dominantes en los arrecifes estudiados son los bivalvos mitílidos, los poliquetos eunícidos y los sipuncúlidos aspidosifónidos. Los bivalvos son considerados los principales bioerosionadores internos debido a su gran tamaño y abundancia. El grado de mortalidad de las colonias coralinas y el nivel general de degradación arrecifal están relacionados con la composición de los macroperforadores no coloniales. La diversidad y la densidad total de macroperforadores, especialmente la densidad de aspidosifónidos es mayor en corales con una superficie muerta mayor que la viva. En colonias de coral con una superficie viva de más de 50%, la dominancia de mitílidos, la diversidad de los macroperforadores y la densidad total, son mayores en los arrecifes de Golfo Dulce que están más degradados. En colonias con más del 50% de mortalidad, la densidad total de macro-perforadores, especialmente aspidosifónidos, es mayor en el arrecife Platanillo de Isla del Caño, el arrecife más saludable de este estudio. La abundancia relativa de los bivalvos aumenta y la de los sipuncúlidos disminuye conforme aumenta la degradación arrecifal. En conclusión, la bioerosión interna se puede utilizar como un indicador de salud arrecifal.

Dynamics and ecology of an Indo-Pacific conch,Conomurex persicus (Mollusca: Gastropoda) in southeastern Turkey

Conomurex persicus, one of the tropical conchs, has been introduced to one of the subtropical regions, the northeastern Mediterranean Sea, and invaded sandy bottoms between 1 and 10 m deep. Population dynamics were studied from specimens collected with a standard dredge (60 x 15 cm mouth opening, 0.5 x 0.5 cm eye opening of net). Samples of C. persicus were collected monthly along the 5 and 10 m depth contours off Erdemli, Mersin, Turkey, in February and May 2000. Intra-annual density depended on salinity levels, while inter-annual density was correlated with bottom water temperature. Specimens underwent spring emergences and winter burial and sheltering (disappearance). Emergence took place in March when temperatures rose and the disappearance occurred in October-November when temperatures dropped. Adults live at 10 m, juveniles are recruited at a 5 m depth. Recruitment began in April and continued for the next 6 months. In contrast to shell width or shell lip thickness, shell length was not a convenient index for estimation of growth parameters. Annual production and mortality were calculated to be 7.86 g m-2 and 3.80 g m-2, respectively, in April-November. Rev. Biol. Trop. 54 (1): 117-129. Epub 2006 Mar 31.

El gastrópodo tropical Conomurex persicurs, ha sido introducido a una región subtropical, el noreste del Mar Mediterráneo, y ha invadido los fondos arenosos en un rango de profundidad de 1 a 10 m. Se estudiarion las dinámicas poblacionales a partir de especímenes recolectados mediante un dragado estándard (60 x 15 cm de apertura de entrada y 0.5 x 0.5 cm de tramado). Muestras de C. persicus fueron recolectadas mensualmente a produndidades de 5 y 10 m en las cercanías de Erdemil, Mersin, Turkey, en los meses de febrero y mayo del año 2000. La densidad dentro de un mismo año depende de los niveles de salinidad, mientras que al comparar años distintos está correlacionada con la temperatura del agua.

Diversity and abundance of littoral cladocerans and copepods in nine Ecuadorian highland lakes

The diversity and abundance of littoral cladocerans and copepods were studied in nine lakes at Reserva Ecológica Cayambe-Coca (Páramo de Guamaní), Ecuador. Six samples were taken in the littoral zone of each lake using a 500 µm mesh plankton conic net. One species of cladocerans (Ephemeroporus acanthoides) is reported for the first time in Ecuador. The diversity (H) and evenness (E) of the lakes were determined and correlated with PCA axes based on their environmental variables. The principal parameters that distinguished these lakes were altitude and pH, an unexpected finding considering that the altitudinal range was very small. Lake size is of secondary importance for this group of lakes. None of the environmental axes correlated with H or E; nevertheless, a larger than expected species richness was found in a small oligotrophic lake with a high level of DO. Based on our results, we hypothesize that altitude and pH are important factors determining the zooplankton diversity (directly or indirectly) in highland lakes. Rev. Biol. Trop. 54 (1): 131-137. Epub 2006 Mar 31.

La diversidad y abundancia de cladóceros y copépodos de la zona litoral de nueve lagos fue estudiada en la Reserva Ecológica Cayambe-Coca (Páramo de Guamaní), Ecuador. Seis muestras fueron tomadas en la zona litoral de cada lago utilizando una red conica para plancton de 500 µm de apertura. Una especie de cladócero (Ephemeroporus acanthoides ) es informada por primera vez en Ecuador. La diversidad (H) y equitatividad (E) fueron determinadas y correlacionadas con los ejes del PCA basado en variables ambientales de los lagos. Los principales parámetros que distinguen estos lagos fueron la altitud y el pH, hallazgo inesperado dado el estrecho ámbito altitudinal. El tamaño parece ser secundario en importancia para este grupo de lagos. No se encontró una correlación significativa entre ninguno de los ejes ambientales y los indices H o E; sin embargo, la riqueza de especies fue mayor en un pequeño lago oligotrófico con altos niveles de DO.

Aquatic Coleoptera and Heteroptera inhabiting waterbodies from Berisso, Buenos Aires province, Argentina

Coleoptera and Heteroptera associated with aquatic environments were studied at Berisso, near Río de La Plata estuary (Buenos Aires Province, Argentina). Four waterbodies were characterized and compared: artificial pond, shallow pool, stream and artificial channel. Sampling was done twice a month, with a round sieve, for 12 months (April 1999 to April 2000). Sampling was quantified using a discrete unit of time (one hour/worker).Where floating vegetation was present, four 25 cm diameter samples were extracted and placed in a Berlese-Tullgren funnel for 48 hours. Temperature, pH and conductivity were measured. Specimens were preserved in 70° ethanol. Similarities in taxonomic composition among sampling stations were quantified using Jaccards index based on a presence/absence matrix for the insect fauna of each sampling station. A total of 68 species belonging to 8 families of Coleoptera and 11 families of Heteroptera were collected. The highest number of species (41)was recorded in the shallow pool (stream 34 species; artificial pond 29; artificial channel 25). The highest specific diversity values were observed during spring in all sampling stations. The highest frequency of Coleoptera was shown by Helochares talarum Fernández and Suphisellus nigrinus (Aubé)(?). In the Heteroptera it was shown by Lipostemmata humeralis Berg, Lipogomphus lacuniferus Berg and Rheumatobates bonariensis (Berg). The most abundant species were not necessarily the most frequent ones. Coleoptera is the most important group in species richness. Each environment had a taxocoenosis of Coleoptera and Heteroptera with inherent characteristics. Rev. Biol. Trop. 54 (1): 139-148. Epub 2006 Mar 31.

Influence of land crabs Gecarcinus quadratus (Gecarcinidae) on distributions of organic carbon and roots in a Costa Rican rain forest

In Costa Ricas Corcovado National Park,the fossorial land crab, Gecarcinus quadratus (Gecarcinidae), densely populates (1-6 m-2) a region of forest extending from the Parks Pacific coastline inland to ca.600 m. Throughout this coastal forest (crabzone), crabs selectively forage for fallen leaves and relocate them to subterranean burrow chambers. Comparisons between surface soils (0 -15 cm) sampled from the crabzone and forest lying immediately inland that is naturally devoid of crabs (crabless zone) suggest that crabzone top soils contained less organic carbon and fewer fine and very fine roots. In contrast, soils sampled from 70 -100 cm depths in the crabzone contained twice the carbon of the crabless zone during the dry season but similar values during the wet season. Two years of experimental crab exclusion from 25 m² replicates established in the crabzone resulted in 16% more organic carbon content in surface soils relative to baseline conditions (n.s.) and 22% more carbon than final control values (P <0.05).Excavations of burrow chambers, with an average (±SD) depth of 48 ±12 cm, indicated localized, subterranean pockets of elevated (+60 %) organic carbon and increased densities of fine and very fine roots relative to same-depth samples from the crabzone unassociated with burrows chambers. Rev. Biol. Trop. 54 (1): 149-161. Epub 2006 Mar 31.

El cangrejo Gecarcinus quadratus (Gecarcinidae) habita madrigueras terrestres y afecta el retorno de carbón orgánico a los suelos de los bosques lluviosos al reducir la acumulación de hojarasca y alterar su proceso de descomposición. En el Parque Nacional Corcovado en Costa Rica, G. quadratus vive en altas densidades (de 1-6 cangrejos m-2) en una franja boscosa que se extiende desde la costa del Océano Pacífico hasta 600 m tierra adentro. En esta región de bosque costero (zona cangrejera), los cangrejos buscan alimento selectivamente en la hojarasca, trasladando lo que recolectan a sus cuevas de más de 1 m de profundidad. Comparaciones entre la superficie de los suelos de la zona cangrejera y los de la región inmediata pero más lejana a la costa y sin cangrejos (zona no-cangrejera), revelan que la capa superficial del suelo (a 10 cm) en la zona cangrejera contiene 39% menos carbono orgánico, 72% menos raíces finas y 50% menos raíces muy finas. Estos resultados contrastan con muestreos similares realizados en ambas zonas en suelos de 75-100 cm de profundidad, donde se encontraron similares concentraciones de carbono orgánico, pero la zona cangrejera tenía el doble de raíces finas y más del cuádruple de raíces muy finas que en la zona no-cangrejera. Encierros experimentales de 25 m² realizados durante 2 a no revelaron ningún efecto de manipulación en los perfiles verticales de carbono orgánico. Sin embargo, los suelos superficiales de los encierros presentaron 18 ± 8% más carbono que los valores de control. En contraste, excavaciones en los agujeros de los cangrejos de un promedio (± SD) de profundidad de 48 ± 12 centímetros revelaron concentraciones subterráneas elevadas (+60%) de carbono orgánico con densidades elevadas de raíces finas (+1500%) y de raíces muy finas (+200%), en relación con muestras tomadas a la misma profundidad en la zona cangrejera (pero no asociadas a cuevas de cangrejos).

Estado de conservación de los peces de la familia Goodeidae (Cyprinodontiformes) en la mesa central de México

Conservation status of Goodeidae familiy fishes (Cyprinodontiformes) from the Mexican Central Plateau. To establish the conservation status and threats for Goodeidae fishes in the high plateau of Mexico, I assessed limnological descriptions,and the reduction in range and in number of localities where they are found, in 53 localities (58.8% of historically reported localities). This assessment included the comparison of current collections with historical records. A principal component analysis of limnological variables showed that most remnant Goodeid species inhabit localities characterised by low environmental degradation: few appear to have a high tolerance to environmental degradation. Overall, 65% of species suffered a reduction in number of localities where they are found. Almost all species face some conservation threat,considering the criteria and categories established by the International Union for the Conservation of Nature (IUCN). Data suggest that one species is extinct (Allotoca catarinae), one more is extinct in the wild (Skiffia francesae), eight are critically endangered (Allodontichthys hubbsi, Allotoca goslinei, Allotoca regalis, Allotoca zacapuensi, Ameca splendens, Characodon audax,Hubbsina turneri,and Zoogoneticus tequila), eleven are endangered, eight can be regarded as vulnerable, four are "near threatened" and only two appear to under "least concern". Habitat loss, introduction of exotic fish, and being species with restricted physiographic range or ecologically specialised, are the main factors leading to the threat of extinction of the Goodeidae family. Recovery actions are needed for the conservation of this fish group. Rev. Biol.Trop. 54(1): 163-177. Epub 2006 Mar 31.

Se estableció el estado de conservación y se identificaron los riesgos que presentan los peces de la familia Goodeidae en la Mesa Central de México. Para ello se evaluó la disminución en el número de localidades y el área de distribución, y se incorporó una descripción limnológica en 53 localidades. Esta evaluación incluyó una comparación de las colecciones actuales con registros históricos de la distribución de la familia. Un análisis de componentes principales de las variables limnológicas indicó que la mayoría de las especies de goodeidos habitan localidades caracterizadas por tener poca degradación ambiental, y sólo pocas especies parecen tener elevada tolerancia a dicho estado de contaminación. Los resultados de la disminución histórica de localidades y del área de distribución sugieren que el estado de conservación de las especies (de acuerdo con los criterios de la IUCN) es el siguiente: una especie está extinta (Allotoca catarinae), una especie está extinta en la naturaleza (Skiffia francesae, ya que existen ejemplares en cautiverio, ocho están en peligro crítico (Allotoca goslinei, Allotoca regalis, Allotoca zacapuensis, Allodontichthys hubbsi, Ameca splendens, Characodon audax, Hubbsina turneri y Zoogoneticus tequila, once están en peligro, ocho se consideran como vulnerables, cuatro se pueden considerar en riesgo próximo y sólo dos parecen no enfrentar ningún riesgo. En conclusión, la pérdida de hábitat, la introducción de especies exóticas de peces, el ámbito geográfico restringido y la especialización ecológica de las especies son los principales factores de riesgo para las especies estudiadas de la familia Goodeidae. La supervivencia de este grupo requiere acciones para su conservación.

Efecto de la pluviosidad y el brillo solar sobre la producción y características del semen en el pez Brycon henni (Pisces:Characidae)

Effect of pluviosity and sun shine on sperm production and seminal characteristics of the fish Brycon henni (Pisces:Characidae). In Colombia the fish Brycon henni is a protected endemic species. It inhabits water bodies in coffee producing areas (700-1900 ma.s.l.; 4º3556 N -74º0451 W; 18-28°C). Insufficient knowledge of its basic biology and behavior prevent the commercial culture of this promising fish. We studied the production and sperm physiology of captive males. Along a year 20 samples were taken from each of 10 males. The sample was obtained by abdominal cefalo-caudal massage and transported to the laboratory at 4°C. Except for September and October (maximum rainfall),sperm was always obtained in at least 50% of the males. Color, osmolality and pH were similar in all the samples. Volume, concentration, viability, motility and activation time were variable: sunshine had a positive effect on volume (Spearman p<0.05) and on sperm concentration (Spearman p<0.05) while pluviosity had a negative effect on volume and viability. The proportion of ions (Na,K,Mg,Ca)was constant along the year; Na being 10-fold higher than K and 100-fold higher than Mg and Ca; however the absolute concentration of all ions was slightly higher in April and in July (with no apparent relation with the other variables analyzed).Rev.Biol.Trop.54(1):179-187. Epub 2006 Mar 31.

El pez Brycon henni es una especie endémica protegida por la legislación colombiana, que habita cuerpos de agua de zonas cafeteras (700-1900 m. s. n. m),comprendidas entre los 4º3556 N y 74º0451 W, con temperaturas que oscilan entre los 18 y los 28ºC. A pesar de las características promisorias de esta especie, su reproducción en cautiverio a nivel comercial no ha sido posible por falta de conocimientos básicos de su biología y comportamiento. El objetivo del presente trabajo fue caracterizar la producción y la fisiología espermática de machos en cautiverio. A lo largo de un año se tomaron 20 muestras de cada uno de 10 ejemplares. El semen se obtuvo mediante masaje abdominal cráneo-caudal y se transportó a 4ºC para su análisis en el laboratorio. Con excepción de septiembre y octubre que fueron los meses más lluviosos, siempre se obtuvo semen de al menos el 50% de los animales. El color, la osmolalidad y el pH fueron similares en todas las muestras a lo largo del año. El volumen, la concentración, la viabilidad, la movilidad y el tiempo de activación fueron variables: El efecto del brillo solar fue positivo sobre el volumen (Spearman p<0.05) y sobre la concentración espermática (Spearman p<0.05), mientras que la pluviosidad tuvo un efecto negativo sobre el volumen y la viabilidad. La proporción entre los iones (Na, K, Mg, Ca) se mantuvo constante durante todo el año: el sodio fue el mayor, seguido por el potasio, y por el magnesio y el calcio, 10 y 100 veces menos, respectivamente; sin embargo la concentración absoluta de estos iones aumentó durante los meses de abril y julio sin una relación aparente con las otras variables analizadas.

Peces ligados a Thalassia testudinum en el arrecife Lobos, Veracruz, México: diversidad y abundancia

Ichthyofauna associated to Thalassia testudinum at Lobos Reef, Veracruz, Mexico: diversity and abundance. The diversity and abundance of ichthyofauna associated with Thalassia testudinum in the Lobos coral reef, Veracruz, Mexico, were studied in September and October 2002. Thirty six visual censuses in four sample sites were made using a 50 x 2 m transect belt. On each census, fish species, abundance and size were recorded. Leaf size and cover of T. testudinum were estimated. The similarity of fish groups was calculated with the Gower coefficient. The most abundant coral reef fishes were: Scarus iseri, Halichoeres bivittatus, Sparisoma radians, Stegastes adustus and Stegastes leucostictus. The highest density (0.04078 ind/m²) and biomass (0.72408 g/m²) of fish species were recorded in site II, where leaf size was greater (30.8 cm). The analysis of variance showed significant differences between sites in leaf size (F=18.30856; p=0.00001) and cover (H=33.8119; p=0.00001). These differences suggest a relationship between fish diversity and abundance, and T. testudinum leaf size and cover. The Gower similarity index produced two groups of fishes; one of them (site II) showed the highest abundance. In this reef, the fishes associated to sea grasses seem to reflect the characteristics of T. testudinum. Rev. Biol. Trop. 54 (1): 189-194. Epub 2006 Mar 31.

El presente trabajo aporta información sobre diversidad y abundancia de la comunidad de peces, ligada a la zona de Thalassia testudinum en el arrecife Lobos, Veracruz, México. Para esto, en septiembre y octubre de 2002, fueron escogidas cuatro estaciones de muestreo y en cada una, se realizaron nueve censos visuales de peces utilizando bandas de 50 x 2 m. Durante los censos se identificaron las especies de peces, además de calcular su abundancia y talla. También se estimó la talla y la cobertura de T. testudinum por estación, con el fin de relacionarla con la diversidad y la abundancia ictiológica. Las especies de peces más relevantes por su abundancia fueron: Scarus iseri, Halichoeres bivittatus, Sparisoma radians, Stegastes adustus y Stegastes leucostictus. La mayor densidad (0.04078 ind/m²) y biomasa ictiológica (0.72408 g/m²) se presentaron en la estación II, donde la talla de los pastos marinos (30.8 cm) fue mayor. El análisis de varianza para la talla de las hojas de T. testudinum indica diferencias significativas (F=18.30856; p=0.00001) entre estaciones, al igual que para la cobertura (H=33.8119;p=0.00001). Estas diferencias sugieren una relación con la abundancia ictiológica, especialmente con la talla de las hojas de T. testudinum. El análisis de similitud de Gower, muestra la formación de dos grupos de peces, donde la estación II se diferencia del resto por su mayor riqueza y abundancia. La comunidad de peces ligada a T. testudinum parece variar en función de las características de los pastos marinos.

Composición por tallas y ciclo reproductivo de Pseudupeneus grandisquamis (Pisces: Mullidae) en el Pacífico central Mexicano

Size composition and reproductive cycle of Pseudupeneus grandisquamis (Pisces: Mullidae) in the Central Mexican Pacific. From June 1995 to December 1998 we used shrimp trawl nets to capture 492 Pseudupeneus grandisquamis in soft-bottom grounds off the central Mexican Pacific (Jalisco and Colima). The ength-weight ratio indicates allometric growth (p =0.0035 L3.46 y r² =0.97). The total sex ratio was 1:1.15 (females: males). Mean total length was 153.8 mm (range 77-236 mm). A progression in length was found: the highest means were observed at the end of 1996 and during 1997. The mean length of females (162 mm) was longer than in males (150 mm). Four gonadic maturity stages were observed in both sexes; in females the most frequently stage was stage IV (mature gonads, 48.6%), while in males it was stage III (gonads in maturation, 45.0 %). Seven microscopic oocyte development stages were identified. Oocyte development seems to be asynchronous. The mature testicle showed sperm inside the lobular lumen and in the duct. The highest values of the gonadosomatic index, as well as the largest percentages of individuals with mature gonads (at macroscopic and microscopic levels), were observed during winter and summer, suggesting that this species has two reproduction peaks by year. The length at which 50% of the individuals show gonads in maturation (L50) was 183 mm for the females and 181 mm for the males. Rev. Biol. Trop. 54 (1): 195-207. Epub 2006 Mar 31.

De junio de 1995 a diciembre de 1998 se realizaron muestreos mensuales y se colectaron en total 492 Pseudupeneus grandisquamis utilizando redes de arrastre sobre fondos blandos en el Pacífico central mexicano (Jalisco y Colima). La relación talla-peso indica que el crecimiento es alométrico (p = 0.0035 L3.46 y r² =0.97). La proporción sexual fue de 1:1.15 (hembras:machos). La talla total promedio fue de 153.8 mm. Se observó una progresión en las tallas de los organismos, esto es, las tallas máximas promedios se capturaron a finales de 1996 y durante 1997. La talla promedio de las hembras (162 mm) fue mayor a la de los machos (150 mm). En ambos sexos se observaron los primeros cuatro estadios de madurez gonádica; el estadio mas frecuente en las hembras fue el IV (gónadas maduras, 48.6 %) y en los machos fue el III (gónadas en maduración, 45.0%). Se identificaron siete etapas microscópicas de desarrollo de los ovocitos, para los cuales se registró un desarrollo de tipo asincrónico. Los testículos maduros presentaron espermatozoides dentro del lumen lobular y en el conducto. Los valores máximos del índice gonadosomático, así como los mayores porcentajes de individuos con gónadas maduras (a nivel macroscópico y microscópico), fueron observados en invierno y verano, sugiriendo que esta especie tiene dos picos de reproducción por año. La longitud en la que el 50% de los individuos presento gónadas en maduración (L50)fue de 183 mm para las hembras y 181 mm para los machos.

Una nueva especie de pez del género Hemibrycon (Characiformes:Characidae)

Una nueva especie de pez del género Hemibrycon (Characiformes: Characidae). Hemibrycon pautensis (Characiformes, Characidae), a new fish species from Paute River, eastern Ecuador is described. Diagnostic characteristics: eight to nine branched rays in the dorsal fin (vs.six to seven), and 27 -28 in the anal fin (vs.16 -26, except in H. dariensis which presents 22 -27, in H. metae 26 -31 and H. jabonero 23 -28); a no occurrence of dorsal pharyngeal plate (vs. occurrence); a cartilaginous and divided-in-two basihial (vs. an osseous base and a cartilaginous upper part). Hemibrycon pautensis resembles H. metae by its oblique external edge of the pelvic fins. They can be distinguished by the position of the pectoral fins in relation to the snout (38.24-41.6% in H. pautensis vs. 21. 21-25.87) and by the position of the pectoral fins in relation to the origin of the dorsal fin (20.95-24.30 in Hemibrycon pautensis vs. 35. 89-42.63), and by the number of proximate radials in the pectoral girdle (five in Hemibrycon pautensis vs. three to four). In addition, the geographic distribution of H. metae is restricted to the upper part of the Meta River in Colombia and can be distinguished of H. boquiae by: the number of scales between the lateral-line and the origin of the dorsal fin (eight in H. pautensis vs. 5-7); the distance between the snout and the pelvic fins (38.00-42.90% in H. pautensis vs. 42.9-46.19%); the pelvic fins length (13.77-17.96% in H. pautensis vs. 10.72-13.21%); and the snout length (21.34-27.88 in H.pautensis vs.26.92-33.66%).Rev.Biol.Trop.54(1):209-217.Epub 2006 Mar 31.

Se describe Hemibrycon pautensis (Characiformes: Characidae), una especie nueva de pez del río Paute al oriente de Ecuador. El nuevo taxón se distingue de las demás especies por las siguientes caracteristicas: ocho a nueve radios ramificados enaleta dorsal (vs. seis a siete), y 27 -28 en la aleta anal (vs.16 -26, excepto en H. dariensis la cual presenta 22 -27, en H. metae 26 -31 y H. jabonero 23 -28); no presenta placa faringea dorsal (vs. presenta); basihial dividido en dos y cartilaginoso (vs. óseo y cartilaginoso en la parte superior). Hemibrycon pautensis es parecida a H. metae es parecida a H. metae por el borde externo de las aletas pélvicas oblicuo. Se distinguen por la posición de las aletas pectorales con relación al extremo del hocico (38.24- 41.6 en H. pautensis vs. 21.21-25.87) y por la posición de las aletas pectorales con relación al origen de la aleta dorsal (20.95-24.30 en Hemibrycon pautensis vs. 35.89-42.63), y por el número de radiales proximales en la cintura pectoral (cinco en Hemibrycon pautensis vs. tres a cuatro). Además, la distribución geográfica de H. metae está restringida a la cuenca alta del río Meta en Colombia. Se distingue de H. boquiae por el número de escamas entre la línea lateral y el origen de la aleta dorsal (ocho en H. pautensis vs. 5-7), por la distancia entre el hocico y el origen de las aletas pélvicas (38.00-42.90% en H. pautensis vs.42.9-46.19%), por la longitud de las aletas pélvicas (13.77-17.96% en H. pautensis vs. 10.72-13.21%), y por la longitud del hocico (21.34-27.88 en H. pautensis vs. 26.92-33.66%).

Diversidad,historia natural y conservación de los mamíferos de San Vito de Coto Brus, Costa Rica

Diversity, natural history and conservation of mammals from San Vito de Coto Brus, Costa Rica. Although Costa Rica has been biologically well studied,few areas have complete mammal inventories, which are essential for ecological studies and conservation. The San Vito region is considered among the most important for scientific research in the country because of the presence of the Wilson Botanical Garden and Las Cruces. However, the knowledge of its mammalian fauna is incomplete. We extensively studied the mammals of San Vito, compiled a checklist, and evaluated its composition, relative abundance, habitat distribution, and conservation status. We recorded 105 species, representing 85 genera, 29 families, and 10 orders. Non-volant mammals represented 62 species, 59 genera, 23 families, and 9 orders. Bats belonged to 6 families, 26 genera and 43 species. The extensive deforestation and hunting have caused the extinction of seven species, but the region still supports, surprisingly, a relatively high number of species, most of which are rare. Few species are common and abundant. Species richness was higher in forest, and forest fragments; fewer species were found in coffee plantations,induced grasslands, and secondary vegetation. Around 21% (13 species) are included in the IUCN red book. Three species are considered endangered (Saimiri oerstedii, Tapirus bairdii, and Sylvilagus dicei), and two threatened (Myrmecophaga trydactila and Caluromys derbianus), of which two (T. bairdii and M. trydactila) are locally extinct. The other species in IUCN are either of low risk (i. e. Chironectes minimus ) or data deficient (Lontra longicaudis). Additionally, 24 species (39%) are included in CITES. Rev. Biol. Trop. 54(1): 219-240. Epub 2006 Mar 31.

Aunque Costa Rica ha sido biológicamente bien estudiada, pocas áreas tiene inventarios de mamíferos completos y actualizados,lo que es para llevar a cabo estudios ecológicos y de conservación. La región de San Vito es considerada entre las mas importantes para la investigación científica en el país, debido a la presencia del Jardín Botánico Wilson y la Estación Biológica Las Cruces. Sin embargo, el conocimiento de la mastofauna es incompleto. Por lo tanto se evaluó intensamente los mamíferos de San Vito, y se compiló una lista de especies, con una evaluación de su composición, abundancia relativa, distribución en los habitats, y su estado de conservación. Se registraron 105 especies, que representaron a 85 géneros, 29 familias y 10 órdenes. Los mamíferos no voladores representaron 62 especies, 59 géneros, 23 familias y 9 órdenes. Los murciélagos pertenecieron a 6 familias, 26 géneros y 43 especies. La extensa deforestación y cacería son factores que han causado la extinción local de 7especies, pero la región todavía mantiene un número relativamente alto de su diversidad original, incluyendo a especie raras. Pocas especies fueron comunes o abundantes. La riqueza de especies fue alta en el bosque y los fragmentos de bosque, y más baja en las plantaciones de café, pastizales inducidos y vegetación secundaria. Alrededor del 21% (13) de las espcies estan incluidad en el libro rojo de la UICN. Tres especies (Saimiri oerstedii, Tapirus bairdii y Sylvilagus dicei ) son consideradas en peligro y dos (Myrmecophaga trydactila y Caluromys derbianus ) como amenazadas:de estas, dos especies (T. bairdii and M. trydactila ) se encuentran localmente extintas. Las otras especies son consideradas de bajo riesgo (i. e. Chironectes minimus) o con poca información (i. e. Lontra longicaudis ). Adicionalmente, 24 especies (39%) están incluidas en CITES.